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UNIVERSIDAD NACIONAL DE TRUJILLO

Genoma humano
Prof. María Leticia Amésquita Cárdenas
Genética Médica
Dpto. Morfología Humana
¿GENOMA ?
Totalidad genes contenido en cada célula de una persona almacenada en el ADN.
Definición adecuada= “Conjunto de genes de un organismo”

Instrucciones
especializadas a la célula. 4 bases distintas
Resultado organismo
estructurado

Organizados
Cada célula 46 en doble hélice
cromosomas en
núcleo

N° genes= 30,000 a 3% del total del


120,000 Organizados genoma = Genes
cromosomas.
ORGANIZACIÓN DEL GENOMA
GENOMA NUCLEAR
Aparece en dos formas:
Cromatina ( interfase)
Cromosomas (división) 22 + X + Y 41% eucromatina= CG

Cantidad Cantidad
Cromoso Cromoso
de DNA de DNA
ma ma
(Mb) (Mb)
1 279 13 118
2 251 14 107
3 221 15 100
4 197 16 104
5 198 17 88
6 176 18 86
7 163 19 72
8 148 20 66
Regiones
9 140 21 45 cromosómicas
10 143 22 48 cromosomas:
Ricos genes
11 1448 X 163 Pobres genes Heterocromatina constitutiva:
12 142 Y 51 13,14,15,21,22
1,9,16,Y
GENES DE COPIA ÚNICA

Codifican para una única proteína


Se encuentran en una única posición del genoma (un individuo= 2
copias)
El producto puede ser una proteína o un ARN
Gen= 1°región reguladora y 2°región estructural
1° Controlan transcripción
2° Transcriben exclusivamente: ARNt, ARNr, ARN pequeños o
ARNm → Proteína.
DNA REPETITIVO
Secuencias de DNA aparecen copias múltiples, o DNA repetitivo=
30 -50% del total del genoma humano
Secuencias repetidas= son idéntica o casi idéntica

• Distribución: entre ADN copia


• Distribución: regiones concretas única)
cromosoma. • Origen evolutivo: translocaciones
• Origen evolutivo: por error en • Número repetición: centenas o
replicación o recombinación miles (moderadamente repetido)
• Número repetición: cientos de • Relevancia aplicación: mini y
miles (altamente repetitivo). microsatélites en identificación y
estudio de familias
DNA repetitivo codificante
• Tamaño alrededor 10% genoma
• Aparece en forma de ‘‘familias de genes’’, miembros se caracterizan por :
Homología, al haberse originado por: Duplicaciones y variaciones de un gen
ancestral
TIPOS:
1. Agrupado: 2. Dispersos:
a. Familias génicas clásicas conservadas, Familias multigénicas con
con genes repetidos tándem (contiguos) genes dispersos.
• Alto grado de homología • Familias numero pequeño
• Todas repeticiones se expresan Ej. de repeticiones
Histonas, ARN
• Ubican por todo genoma
b. Familias multigénicas con genes agrupados
( no contiguos) • A veces cromosomas
• Ubicación especifica (no centrómero, distintos
telómero) • Son casi todos funcionales
• Poca homología Ej. Aldolasa. Actina, ferritina
• Variantes pseudogenes, genes
truncados y fragmentos Ej. Globinas,
HLA
DNA REPETITIVO CODIFICANTE AGRUPADO
a) Familias génicas clásicas
Secuencias repetidas → codifican mismo RNA o proteína → sintetiza con rapidez y
gran cantidad.
Ejemplos: Genes de histonas y RNA ribosómico.

• Organizados en quintetos GENES DE HISTONAS


forma racimos en tándem
• Transcritos por ARN pol II
• No intrones
• No señales Poli A
• Ricas G-C

• Igual longitud que región codificadora


• Rica en A-T
• Elevada polimorfismo nt y de longitud
GENES rRNA:
 Unidad transcripcional de 45 S (18, 5.8 y28 S)
 200 repeticiones tándem
 Localizado en: Cromosomas

 Unidad 5S: 200 – 300 genes 1p41-42


 Genes rRNA 16 S y Genes RNA 23 S: ribosoma mitocondrial
 Justificación de repeticiones en tándem genes ARNr es por demanda
ribosomas para síntesis proteica
GENES tRNA
497 GENES -- 49 familias
61 codones - 49 tRNA
Codones: AU(U/C)
UA(U/C 46 ARNt
AA (U/C)

Loci: todos cromosomas


(excepto 22 y Y)

- C6 residen 280 (4Mb)

- C1 residen genes tRNA Asn y Glu

- C7 tRNA Cys (0.5 Mb)


snRNA
 SnRNA ricos en uridina: U3
 RNA espliceosómico
- 44 genes snRNA U6
- 16 genessnRNA U1 locus RNU1 en 1p36.1
-Genes  snRNA U2 locus de 6.1kb RNU2 17q21-22 (6 /+
30 repeticiones)
b) Familias multigénicas de genes agrupados
• Situados sitios específicos del genoma (no telómero ni
centrómero)
• Poca homología
• Poseen genes de copias defectuosas: pseudogenes

GENES DE LAS GLOBINAS


16p13.3

11p15.5
GENES HLA
Grupo génico compuesto

Localización: 6p21.3
Función: Antígenos y factores de complemento
6 genes
expresados

4 seudogenes

Ej. De gen no relacionado ubicado entre


genes clase III
Gen CY21A2= 21 hidroxilasa esteroidea

El CY21A2 al encontrarse entre RCCX (quimeras


CYP21P / CYP21 y TNXA / TNXB) difícil de estudiar
molecularmente.
Familias multigénicas: poseen seudogenes, genes truncados y fragmentos
génicos

• Seudogenes no procesado en un grupo génico


¿Por qué no procesados? Exones, intrones, regiones promotoras
Porque defectuosas? Secuencia de codones de termino inapropiado exones
Pueden originarse por:
• Duplicaciones: alteran regiones codificantes o reguladores No funcional
• Inserciones de secuencia de ADN complementario
Transcripto (sin sec. Promotoras)
transcriptasa inversa
ADNc
• Inserciones de codones terminales
• Genes truncados y fragmento de genes internos en un
grupo génico Ej. Genes de Cadena pesada HLA I
mRNA HLA I

Ejm. ARNm de HLA I - 6 genes


6p21.3 - Ψ 4 seudogenes
- Copias génicas
parciales

Origen:
• Duplicaciones
• Entrecruzamiento desigual  fragmentos
DNA repetitivo codificante disperso: familias
multigénicas de genes dispersos
Están dispersos genoma, incluso cromosomas distintos.
Genes codifican proteínas con funciones de: Enzimáticas, Reguladoras, de almacenamiento,
Estructurales, etc.
Por ejemplo: Familia de aldolasa

Familia Número
Localización
Génicas de Organización
Cromosómica
dispersas copias
Aldolasa 5 3 genes funcionales y 2 Cinco cromosomas
seudogenes distintos
Deshidrogensa de 2 Gen que contiene 1 Xp22,4q22-q23
piruvato intron
Retrogen expresado

PAX 9 9 son funcionales Muchos


cromosomas
DNA repetitivo no codificante
Su tamaño= 30- 40% del DNA genómico total
A. DNA altamente repetitivo y agrupado:
DNA satélite
Unidades de pequeño tamaño (entre 2 y 50 pb) repetidas en tándem
DNA satélite tiene un origen alta tasa de repetición
Inactivo desde punto vista transcripcional
• Heterocromatina centromérica
• Unidades repetidas sitio enlace de
proteína CENP-B
DNA moderadamente repetitivo y
disperso
Repetición tánden de número variables = VNTR
a) DNA minisatélite
Muy polimórficos 102 - 103

1. DNA minisatelite hipervariable:


• Presente proximidades telómero
(otros lugares)
• Secuencias cortas: 9-64pb repetidas
en tándem
• Secuencia común GGGCAGGAXG,
Señal para recombinación
• Identificación de individuos: huella de
ADN (“fingerprint”)
• No transcriben, excepto MUC1 en 1p
codifica proteína polimórfica
2. DNA minisatélite telomérico

• Terminal telómeros:10-15 Kb
• Secuencia repetida: 5’ TTAGGG 3’
repetida 2000 a 10000 veces
• Su longitud varía con la edad
de la célula
Espermatozoide tiene 15 Kb
Célula somática 1,2 Kb
Linfocitos en cultivo:
normales 47  7.7 pb ˂ año
S. Down 133  5.5 pb ˂ año
b. DNA Microsatélite: repeticiones de secuencias simples
(RSS)
 Muy polimorfico. Localizados x todo el genoma (60Mb)
 Unidades repetitivas: de 2,3 ó 4 (<10) n
Comunes: (CA)n/(TG)n (1 x 36kb) AT/TA (1 x 50kb) AG/CT (1 x 125kb)
Raras: CG/GC (1 x 10Mb)
 Origen: deslizamiento de replicación
 Raro aparece secuencias codificantes, excepto trinucleotidos en
alteraciones hereditarias
CTG exón 1 de FMR1  S. X frágil
CTG extremo 3’ de gen  distrofia miotónica
CAG gen Huntington S. Corea de Huntington (informa sec. poliglutamina)
 Repeticiones mononucleótidos: A y T raras G y C ejemplo (SNP)

Ejemplos – repetición 2 pb : GTGTGTGTGT


repetición 3 pb : CAGCAGCAGCAGCAG

...TCCAGACAAGGTGGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTTTCTCCAGTGAGATTTA…
B) Repeticiones dispersas: LINE y SINE
a. LINES: Long interspersed nuclear elements : 1- a 5-kb
• L1 o L1H 6.4 Kb
• Localizados en bandas G , 20,000 a 40,000 Copias
• Origen: ARN transcriptasa inversa ADN integra al genoma
6.1kb

Promotor corta

• Existen 3 familias: LINE-1, LINE-2, LINE-3


• Implicado en: mutaciones, recombinación anormales tanto
intra como intercromosómicos
• L1 C 22 transloca X gen Factor VIII Coagulación→Hemofilia
b. SINES: Short interspersed nuclear elements
• No codifican a proteínas
• No son autónomas
Familia Alu 150 Mb (5% del genoma humano) 750000 copias
•Sitio de restricción 5’AGCT 3’ para enzima Alu I (Artrhrobacter lacteus)

• Existen de secuencias de 300 pb las + habituales


• Localizados en las banda R ricas en GC y genes
• Estas secuencias se originaron por retrotranscripción
•ARN 7SL Transcriptasa inversaADN se integra al genoma ARN: partícula
señal ( participa en la síntesis de proteínas)
GENOMA MITOCONDRIAL
• ADN Bicatenario circular: 16569 pb (0,5% genoma).
•Asa D triple hélice
•Dos cadenas de pb diferentes: Cadena pesada H: rica en G
Cadena ligera L: rica en C
•Posee poco ADN repetitivo, no intrones (93% codificante)
• Expuesto a radicales libres (por Fosforilación oxidativa) y sistemas
de reparación son menos eficientes

> frecuencia de Mutaciones


• Genoma mitocondrial → exclusivo de genoma materno
GENES MITOCONDRIALES:

37 genes: 28 en la cadena H
9 en la cadena L
24 codifican ARN:
2 ARNr: 1 ARNr 23S
1 ARNr 16S
22 ARNt

13 genes para polipeptidos:


Complejo I deshidrogenasa = 7 subunidades ND1- ND6
Complejo citocromo b-C1 = 1 subunidad Promotores transcripción en Asa
D: H y L (opuesta)
Complejo citocromo oxidasa= 3 subunidades COI-COIII
Resultado transcritos multigénicos
Complejo ATP-asa = 2 subunidades ATP-asa 6 y 8
Genes de subunidades de ATP-asa: 6 y 8 de se
superponen y traducen en diferente marco de lectura

8366-8569

8527-9204
Cadena H en
común
MODIFICACIONES DEL CODIGO GENÉTICO
Código genético: 60 codones de sentido 8 ARNt = 4 codones difieren 3 base
14 ARNt = 2 codones idénticos = 1°
4 codones de termino (3 en núcleo) base y 3° base comparten Pu/Pi
UAA, UAG, AGA , AGG
Significado Significado Organelo u organismo
Codón
común alternativo
AGA
Arg Alto Algunas mitocondrias animales
AGG
AUA Ile Met Mitocondria
CGG Arg Trp Mitocondria de plantas
CUA Leu Tre Mitocondria de levaduras
AUU Ile
GUG Val Inicio Algunos procariotas
UUG Leu
UAA
Alto Glu Algunos protozoarios
UAG
UGA Alto Trp Mitocondria, micoplasma
Bibliografía
Gracias
1. Stracham. Genética Humana
2. Turnphenny. Elementos Genética Médica
3. Herraréz. Biología molecular e ingeniería genética

La alegría de ver y entender es el más perfecto don de la naturaleza


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Albert Einstein

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