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Replicación
Biología Molecular
Grado en Medicina
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Dra. Estrella Núñez Delicado - Tlf: (+34) 968 278869
Tema 10: Replicación, Biología Molecular
Universidad Católica San Antonio
Dra. Estrella Núñez Delicado 968
de Murcia - Tlf: (+34) - Tlf:27 88 968
(+34) 00 info@ucam.edu - www.ucam.edu
278869 - enunez@pdi.ucam.edu
DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
1956 Crick y Gamow proponen el “Dogma Central de la Biología”
La transcriptasa inversa:
• Enzima esencial en los retrovirus (genoma
de RNA)
• Utilizando como molde el RNA sintetiza el
DNA complementario (cDNA)
• Su descubrimiento modificó el “dogma
central de la biología” propuesto por Crick y
Gamow
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Tema 10: Replicación, Biología Molecular
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DOGMA CENTRAL DE LA BIOLOGÍA
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REPLICACIÓN
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REPLICACIÓN
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Carácter semiconservativo
Sencillo conceptualmente
Complejo su mecanismo Proceso Semiconservativo:
Las dos hebras del ADN
progenitor sirven de molde para
la síntesis de sus respectivas
hebras complementarias.
Cada molécula hija de ADN está
formada por una hebra
progenitora y otra hija, recién
sintetizada.
El mecanismo se repite en
sucesivas generaciones de
células.
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Experimento de Meselson y Stahl (1958)
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-1958:
Este experimento es importante por que fue la 1ª vez en que se usó
la técnica de sedimentación en gradiente de cloruro de cesio y que se
usaron isótopos de N15 en el ADN (habitual N14).
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Replicación bidireccional
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Replicación bidireccional En la burbuja de replicación tenemos
dos direcciones de avance marcadas
por la ADN polimerasa. Una hebra
que se sintetice de forma continua y
otra discontinua, sucede de esta
forma en los dos extremos.
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Requerimientos para la
síntesis de ADN
Para fabricar una cadena de adn complementaria necesitamos:
Sustratos: Se utilizan los 4 desoxinucleótidos-trifosfato (dATP, dGTP,
dCTP y dTTP. De cada uno se incorpora solamente dNMP. Se une monofosfato y se
libera pirofosfato
Cofactores: Ión metálico divalente asociado a los dNTP y a la
polimerasa (Mn2+ y Mg2+ in vitro y Mg2+ in vivo).
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Mecanismo de reacción
La polimerasa solamente fabrica cadenas de adn en
direccion 5’-3’. Por lo tanto, lee cadenas molde en dirección
3’-5’ ( los enlaces fosfodiéster).
pirofosfatasa
2 Pi
ADN polimerasa
Mecanismo : el extremo 3’ libre de la cadena de ADN en formación mediante su grupo hidroxilo provoca
un ataque nucleofílico sobre el enlace éster del extremo 5’ del dNTP que tiene que unirse a la cadena
liberando un pirofosfato, que por la acción de la pirofosfatasa se convierte en 2 fosfatos inorgánicos.
La polimerasa solo fabrica cadenas de ADN en dirección 5’ “Lehninger
-> 3’. PorPrincipios
lo tantodelee
Bioquímica",
cadenas4ª molde
ed. en
Nelson, D.L. y Cox, M.M. Omega. 2006
dirección 3’ -> 5’.
Más importante y necesita un extremo 3’ libre la cadena libre de ADN en formación porque mediante su grupo 14
hidroxilo provoca un ataque nucleofilico sobre el enlace éster del extremo 5’ de dNTP Temaque tiene que
10: Replicación, unirse
Biología a la
Molecular
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cadena, liberando un pirofosfato que por la acción de la pirofosfatasa se convertirá en dos fosforos inorgánicos.
Mecanismo de reacción
3’ 3’ 3’
5’
5’ 5’
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Mecanismo de reacción
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Mecanismo autocorrector
Actividad autocorrectora de la DNA polimerasa (corrección de pruebas “proofreading”)
Un error a la hora de copiar ADN se traspasa a la descendencia, y por eso, tiene actividad autocorrectora.
Si no es correcto, elimina el
núcleótido desapareado,
hidroliza el enlace fosfoéster que
acaba de formar y libera el
nucleótido.
Actividad 3’ exonucleasa
( el ultimo nucleótido que se coloca es en el extremo 3’)
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Aunque la reacción de síntesis es universal son distintas las ADN
polimerasas que existen y tienen distintas funciones. ADN
polimerasa I de procariotas fue la 1ª que se descubrió en 1958.
Pero en procariotas hay hasta 5.
La ADN polimerasa III de procariotas lleva a cabo la mayor parte
de la replicación, la II no está clara su función (papel reparador), y
la I es la que se encarga de eliminar los fragmentos de Okazaki, ya
que es la única polimerasa que tiene actividad 5’ exonucleasa, y la
presenta en otro centro activo diferente (3 centros activos).
ADN polimerasa I de E.coli
Está formada por una sola cadena polipeptídica.
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ADN polimerasa I de E.coli
Algunas DNA polimerasas tienen también actividad exonucleasa 5’ 3’
(DNA pol I de E. Coli) Permite eliminar los cebadores
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ADN polimerasas de procariotas
Para iniciar la elongación la primasa reconoce el cebador para que la polimerasa actúe
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ADN polimerasas de eucariotas
• Distintas de las procariotas
• Se han descrito más de 5 distintas alfa, beta, gamma, delta, epsilon
• DNA -pol: reparación de daños y errores
• DNA -pol sintetiza el ADN mitocondrial y activ. 3’ exonucleasa
• Ninguna tiene actividqd 5’ exonucleasa. Eliminación cebadores 2 nucleasas
independientes
ninguna puede retirar los fragmentos de Okazaki Elongación de la hebra
Procesividad de las DNA Pol: Nº de nucleótidos adicionados antes de disociarse del molde
Es la responsable de la alta velocidad
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En eucariotas hay 5 tipos: alfa, beta , ganma, delta y Dra. Estrella Núñez Delicado - Tlf: (+34) 968 278869 - enunez@pdi.ucam.edu
épsilon.
Delta y epsilon son las responsables de la mayor parte de la
elongación de las cadenas, cuando las enzimas
correspondientes eliminan los cebadores de la hebra
retardada RNasas, el hueco que queda es cubierto también
por delta y epsilon polimerasas.
Abrazadera deslizante β
β cargada en el DNA PCNA
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Abrazadera deslizante
Abrazadera deslizante
(β): une la DNA pol al
DNA
Cargador de la
abrazadera (complejo γ)
de bacterias
Una vez abierta la hebra helicasa y polimerasa pueden asociarse y comenzar la síntesis
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Elongación de la cadena
Encabezando la horquilla de replicación debe ir desenrollándose la
doble hélice (delante de la polimerasa).
Conforme se van sintetizando las nuevas hebras se debe ir recuperando
el enrollamiento mediante proteínas especializadas.
Replisoma: complejo multiproteico formado por proteínas
especializadas en desenrollar el ADN, las ADN polimerasas y el resto de
proteínas implicadas en la replicación, que viaja asociado a la horquilla.
Helicasas, ADN polimerasas y prot implicadas en la replicación.
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Proteínas que actúan en la horquilla de replicación
Eliminación del cebador de RNA Pol I RNase H, FEN1 (Pol δ rellena el hueco)
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Holoenzima Pol III Tema 10: Replicación, Biología Molecular
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Helicasas
se une a la hebra retardada 5’ -> 3’
Se unen al ADN una vez abierto en el
origen.
Actúan propagando la separación de las
dos hebras.
Requieren la hidrólisis simultánea de ATP.
Son hexámeros en forma de anillo que
rodean una de las hebras de ADN. (la que va en dirección 5’-3’)
El avance de las horquillas de replicación
está liderado por una helicasa y le siguen
el resto de componentes del replisoma.
La otra cadena es
la continua que va
de 3’ a 5’ ya que
en este sentido
puede actuar la
ADN polimerasa.
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Proteínas ligantes de ADN
monocatenario (SSB)
Una vez separadas las hebras por la helicasa, las proteínas SSB (single
strans binding proteins) impiden el reemparejamiento de las hebras.
Proteínas SSB en procariotas.
Proteína de replicación A (RPA) en eucariotas.
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Topoisomenrasas
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Topoisomenrasas
Topoisomerasas tipo I
La topoisomerasa para mantener
cortada la cadena se une por
una tirosina al enlace de cadena
5’ que acaba de cortar, para que
la otra hebra gire.
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Topoisomenrasas
Topoisomerasas de tipo II
(DNA girasa en E. Coli)
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Primasa
Une los primeros nucleótidos de la nueva cadena en formación (ARN).
Es una ARN polimerasa dirigida por la hebra de ADN.
En procariotas es una proteína independiente que forma parte del
primosoma (complejo proteico asociado a la horquilla formado por
primasa y helicasa).
En eucariotas la actividad primasa reside en una de las subunidades de
la ADN polimerasa (distinta de la que posee el centro activo de la
actividad polimerasa). Esta proteína se llama ADN pol /prim.
procariotas
eucariotas
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Asimetría en la replicación de las hebras
Las hebras son antiparalelas y la ADN polimerasa
actúa de forma continua en dirección 5’-3’.
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Asimetría en la replicación de las hebras
Movimiento de la
horquilla de replicación
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Asimetría en la replicación de las hebras
La hebra adelantada se sintetiza de forma continua y requiere 1 sólo RNA cebador
cebador
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Asimetría en la replicación de las hebras
Movimiento de la
horquilla de replicación
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Maduración de los fragmentos de Okazaki
En eucariotas:
• RNase H o FEN1 eliminan el cebador
• Pol rellena el hueco
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Reacción ADN ligasa
DNA polimerasa de
la cadena
adelantada
3’
5’
BUCLE
SSB unidas
al DNA
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Coordinación de la replicación de las hebras
adelantada y retrasada en la horquilla de
replicación: modelo del “trombón” (E.Coli)
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Coordinación de la replicación de las hebras
adelantada y retrasada en la horquilla de
replicación: modelo del “trombón” (E.Coli)
La abrazadera se
carga sobre la
cadena atrasada que
tiene un cebador
nuevo
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Coordinación de la replicación de las hebras
adelantada y retrasada en la horquilla de
replicación: modelo del “trombón” (E.Coli)
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REPLISOMA
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REPLISOMA
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REPLISOMA
Topoisomerasa
Doble hélice de ADN
Helicasa
Primosoma
Proteína de unión a la
ARN cebador
hebra sencilla SSB
Molde de la
Molde de la cadena cadena retardada
conductora
ADN polimerasa I
ADN nuevo de la
hebra conductora Fragmento de ADN ligasa
Okazaki
ADN polimerasa
ADN nuevo de la
hebra retardada
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Terminación de la replicación
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Telómeros y telomerasa
PREMIOS NOBEL DE FISIOLOGÍA O MEDICINA 2009
http://masalladelabioinformatica.wordpress.com/tag/telomerasa/ 50
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Telómeros y telomerasa
Telómeros: regiones
terminales de los
cromosomas eucariotas,
formados por ADN
repetitivo no codificante.
La telomerasa es una
ribonucleoproteína que, al
tener RNA en su estructura,
no necesita una plantilla de
DNA exógena y puede
replicar los extremos
monocatenarios de los
cromosomas 51
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Replicación de los telómeros
Representación esquemática de la replicación de un cromosoma eucariótico
5’ 3’
3’ 5’
Retardada Conductora R C R C R C
avance de las horquillas
Conductora Retardada C R C R C R
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
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Replicación de los telómeros
El problema de la replicación de los cromosomas lineales: las
cadenas nuevas quedan más cortas en 5’ que su molde.
3’ 5’
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
Todos los cebadores intermedios son eliminados por las nucleasas (FEN1 y RNasa H1) y
sustituidos mediante la elongación del fragmento de Okazaki adyacente. Los cebadores
de los extremos 5’ de las hebras nuevas también pueden ser eliminados, pero no
sustituidos; por ello, las hebras nuevas quedan más cortas en 5’ que su molde:
3’
|||||||||||||||||||
5’
3’ 5’
5’ 3’
3’ 5’
5’ 3’
prematuro
Salud
Enfermedad
Edad
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Telomerasa y cáncer
La telomerasa está presente en casi todas las células que proliferan, especialmente
en las tumorales (proliferación indefinida de los tumores).
Inhibición de la actividad telomerasa como principio de terapia antitumoral.
Telomerasa: diana terapéutica.
En fases tardías del progreso tumoral aumenta la actividad telomerasa, con el fin de favorecer
el crecimiento del tumosr e impedir la muerte celular.
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Telomerasa y cáncer
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Telomerasa
La telomerasa es una enzima tipo ADN polimerasa que utiliza como molde
ARN: es una transcriptasa inversa con características especiales.
Es una ribonucleoproteína formada por 2 componentes:
1. Componente ribonucleico (ARN de la telomerasa, TR o TER):
Tamaño variable (146 – 1544 nt).
Secuencia característica para cada especie (9 – 28 nt)
complementaria a la secuencia telomérica respectiva.
Ejemplo: Telomerasa humana, su hTR tiene 450 nt con una
secuencia rica en C (5’-CCCUAA-3’), complementaria y
antiparalela a la hebra rica en G de la repetición telomérica (5’-
TTAGGG-3’).
2. Componente proteico (contiene la actividad enzimática de la
telomerasa, TRT o TERT): Para sintetizar el ADN telomérico no utiliza
un ARN cebador sintetizado a tal fin, sino que elonga el extremo 3’
precedente utilizando como molde la parte TR de la propia
telomerasa.
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Telomerasa
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Telomerasa
Primera fase (A): La telomerasa alarga el saliente 3’
telómero humano 3’
RNA
DNA —AATCCCAATCCC (5’) hTR 5’ telomerasa
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGG (3’) C humana
UAC A AUCCCAAUC U U AC
repeticiones teloméricas
proteína
saliente 3’ (12-16 nt)
hTRT
C
—AATCCCAATCCC UA CAAUCCCAAUC U U AC A3) translocación
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG
La telomerasa se desliza sobre el
nuevos nucleótidos incorporados saliente 3’ previamente elongado,
por la telomerasa conservando la complementariedad
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Telomerasa
5
C
—AATCCCAATCCC UA CAAUCCCAAUC U U AC A3) translocación
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG
La telomerasa se desliza sobre el
nuevos nucleótidos incorporados saliente 3’ previamente elongado,
por la telomerasa conservando la complementariedad
3’ gracias a la repetición de secuencias
5’
C
—AATCCCAATCCC UA CAAUCCCAAUC U U AC
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG A4) segunda elongación
dNTPs De nuevo, la
telomerasa elonga el saliente 3’, por
3’ el mismo mecanismo de la etapa A2
5’
C
—AATCCCAATCCC UA CAAUCCCAAUC U U AC
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG A5,6...)
sucesivas translocaciones
nuevos nucleótidos incorporados y elongaciones
por la telomerasa
—AATCCCAATCCC
—TTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAGGGTTAG
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Telomerasa
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REPLICACIÓN eucariotas
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Replicación del ADN mitocondrial
Hebra L: Unica región no codificante del DNA mitocondrial: región de control. Contiene el
hebra ligera Lazo D origen de replicación de la hebra H.
(mayor
contenido en El genoma mitocondrial está
bases formado por varias copias
pirimidínicas). de un único cromosoma
situado en la matriz
mitocondrial.
Es bicatenario
Circular
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Replicación del ADN nuclear,
mitocondrial y procariótico
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