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Docente:
ENRIQUE GUZMÁN LEZAMA
Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Los Aminoácidos
Definición Biológica:
Los aminoácidos son las unidades estructurales para la formación de las
proteínas. Las características estructurales de los aminoácidos permite la unión
entre ellos por medio de los enlaces peptídicos para formar grandes cadenas que
constituyen las proteínas. Las proteínas son las moléculas más abundantes y de
muy diversas funciones que existen en los seres vivos. Virtualmente, cada proceso
de vida depende de esta clase de moléculas. Por ejemplo, las enzimas y las
hormonas polipeptídicas dirigen y regulan el metabolismo en el cuerpo.
Las proteínas contráctiles permiten el
movimiento de los músculos. En los
huesos, las proteínas de colágeno
forman la estructura y el soporte sobre
la cual se depositan los cristales de
fosfato de calcio. En la sangre, las
proteínas tales como la hemoglobina y
la albúmina transportan las moléculas
esenciales para la vida y en donde las
inmunoglobulinas combaten todo tipo
de infección por bacterias o virus. 2
Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Los Aminoácidos
Definición Química:
Los aminoácidos o también llamados -aminoácidos son estructuras
bifuncionales que están constituidas por un átomo de carbono central llamado
carbono-alfa () unido a un grupo amino, un ácido carboxílico, un hidrógeno y un
grupo R que es característico de cada aminoácido. El grupo R generalmente es
llamado la cadena lateral o resto aminoacídico. El carbono es quiral ya
que está unido a cuatro grupos diferentes y los dos enantiómeros que presenta son
llamados isómeros L y D.
Los aminoácidos son generalmente
estructuras polares y tienen un alto
momento dipolar, son solubles en
agua pero insolubles en solventes
orgánicos, son sustancias
cristalinas con un relativo alto
punto de fusión y además son
anfipróticos, es decir, pueden
reaccionar como ácidos o como Isómero - L Isómero - D
bases dependiendo de las
circunstancias. 3
Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Existen L-aminoácidos
dextrorrotatorios y otros L-
aminoácidos que son
levorrotatorios.
El pH de la solución puede
afectar la actividad óptica
de un aminoácido.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Aminoácidos Esenciales:
Llamados así porque los seres humanos no podemos biosintetizarlos y debemos
obtenerlos como parte de nuestra dieta. Las proteínas que aportan todos los
aminoácidos esenciales en las proporciones correctas para la nutrición humana se
llaman proteínas completas, por ejemplo la carne de res, el pescado, la leche y los
huevos.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
En soluciones ácidas:
En soluciones básicas:
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
El punto isoeléctrico
(pI) es el pH al que
el aminoácido se
encuentra en
equilibrio entre las Forma Zwitterión Ambos grupos
desprotonados
dos formas, como el
Concentración
zwitterión dipolar
Ambos grupos
con una carga neta protonados
de cero.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
El pH controla la carga
de la glicina: catiónica
por debajo de pH = 2.3;
aniónica por encima de
pH = 9.6 y zwitteriónica
entre pH = 2.3 y 9.6. El
pH isoeléctrico es 6.0.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Electroforesis de Aminoácidos
• Una mezcla de aminoácidos se puede separar por medio de la
electroforesis en base a sus valores de pI. En general, la electroforesis es
un método de laboratorio en el que se utiliza una corriente eléctrica
controlada con la finalidad de separar biomoleculas según su tamaño y
carga eléctrica a través de un papel o una matriz gelatinosa.
• Cuando una mezcla de aminoácidos que a un determinado pH están
ionizados y con carga neta son colocados en un campo eléctrico,
experimentan una fuerza de atracción hacia el polo que posee carga
opuesta, dejando transcurrir cierto tiempo las moléculas cargadas
positivamente se desplazaran hacia el cátodo (el polo negativo) y aquellas
cargadas negativamente se desplazaran hacia el ánodo (el polo positivo).
Electroforesis de Aminoácidos
Representación
simplificada de la
separación
electroforética de
la alanina, lisina y
ácido aspártico a
pH = 6.
La lisina catiónica
es atraída hacia el
cátodo, el ácido
aspártico aniónico
es atraído hacia el
ánodo y la alanina
se encuentra en su
punto isoeléctrico,
por lo que no se
mueve
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Carga +1
pH < pKa pH > pKa
Grupo
(forma ácida) (forma básica)
pKa = 9.1
Ácido 0 -1
Básico +1 0 pKa = 2.3
Carga 0
pKa = 9.7
Cátodo Anodo
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
El Enlace Peptídico
Los aminoácidos se unen mediante “enlaces amida secundaria”, entre las
funciones α-carboxilo y α -amino de los aminoácidos adyacentes. Estos enlaces
se llaman enlaces peptídicos
Reacción de
formación del
Aminoácido 1 Aminoácido 2
enlace peptídico
Dipéptido
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
El enlace peptídico es un
enlace muy fuerte que tiene
carácter de un doble enlace y
no permite el giro
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Péptidos:
Los péptidos se estructuran
siempre con el grupo amino
terminal a la izquierda y el
grupo carboxilo terminal a
la derecha.
Se nombran desde el
extremo N-terminal al C-
terminal, usando la
terminación il, excepto para
el último aminoácido.
Péptidos:
Por ejemplo, la hormona humana bradiquinina (inhibe la inflamación de los
tejidos) es un nonapéptido con un grupo -NH3+ en el extremo N terminal y un
grupo -COO- libre en el extremo C terminal.
Nterm-Arginine-Proline-Proline-Glycine-Phenylalanine-Serine-Proline-Phenylalanine-Arginine-Cterm
Nterm-Arg-Pro-Pro-Gly-Phe-Ser-Pro-Phe-Arg-Cterm
Nterm-RPPGFSPFR-Cterm
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Electroforesis de Péptidos
El proceso de separación La mezcla de los
de una mezcla de péptidos se coloca
a lo largo del papel
péptidos se puede
realizar con
electroforesis.
La muestra se coloca a lo
largo del borde de un
Ánodo
papel en contacto con
una solución buffer. Al Cátodo
aplicar una diferencia de
potencial se logrará
separar a los péptidos de
acuerdo a la carga que Migración de los péptidos
cada uno de ellos tenga al
valor de pH de trabajo.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
En el analizador de
aminoácidos, el
hidrolizado pasa a través
de una columna de
intercambio iónico. La
solución que emerge de la
columna se trata con
ninhidrina y su
absorbancia se registra en
función del tiempo. Cada
aminoácido se identifica
por el tiempo de retención
necesario para pasar a
través de la columna.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Composición de la bradiquinina
Utilización de un analizador de aminoácidos para determinar la composición de
la bradiquinina humana. Los picos de la bradiquinina para la Pro, Arg y Phe son
más grandes que los de la mezcla equimolecular estándar, ya que la bradiquinina
tiene tres residuos Pro, dos residuos Arg y dos residuos Phe
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Este ordenamiento puede hacer que se alineen muchas moléculas de péptidos unas
al lado de las otras, dando lugar a una lámina bidimensional.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Estructura de la seda: las fibras utilizadas para fabricar un tejido de cera o una tela de
araña están constituidas por la proteína fibroína. (a) la fibroína consiste en capas de
hojas β antiparalelas ricas en residuos de Ala (color púrpura) y Gly (color amarillo).
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
α-hélice
β-laminar
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Estructura Cuaternaria
En la estructura cuaternaria se
incluye la asociación de dos o más
cadenas polipeptídicas de la proteína
activa.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Estructura Cuaternaria
Estructura Cuaternaria de la
desoxihemoglobina.
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
CLASIFICACIÓN ◼FIBROSA
Por la forma que
DE LAS ◼GLOBULAR
PROTEINAS adopta
◼ENZIMAS
◼PROTEÍNAS DE
TRANSPORTE
◼CONTRÁCTILES Y
Por su función MOTORAS
Biológica ◼DE DEFENSA
◼REGULADORAS
◼NUTRIENTES
◼HORMONAS
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Desnaturalización de proteínas
“Proceso generalmente irreversible mediante el cuál la proteína pierde
su estructura 2º, 3º y 4º, careciendo de importancia biológica”
• Agentes:
Físicos: Químicos:
Calor solventes orgánicos
Radiaciones soluciones ácidas
Grandes presiones soluciones básicas
soluciones salinas
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Aminoácidos, Péptidos y Proteínas
Desnaturalización y Renaturalización
Estado nativo,
catalíticamente
Renaturalización de la
activo. ribonucleasa desplegada y
desnaturalizada:
Adición de úrea y
mercaptoetanol
Se añade úrea para desnaturalizar
la nucleasa y mercaptoetanol
(HO-CH2CH2-SH) para reducirla y
Estado desplegado;
romper así los enlaces disulfuro,
inactivo. Enlaces
disulfuro reducidos
lo que da lugar a ocho residuos
para dar residuos de
Cys.
de cisteína.
La renaturalización implica la
Eliminación de la
úrea y del
restauración de los enlaces
mercaptoetanol disulfuro correctos.
Estado nativo,
catalíticamente
activo. Enlaces
disulfuro reformados
correctamente
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