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Burbuja de

transcripción
Elementos que intervienen

❖ DNA
❖ RNA pol
❖ rNTPs Requiere de proteínas adicionales para
su “asociación” con el promotor
❖ Factores de transcripción

Eucariontes 3 RNA pol

Procariontes 1 RNA pol

Las RNA polimerasas


Se une directamente al PROMOTOR
e inicia la transcripción
Funciones de la RNA polimerasa

1. Buscar el promotor en el DNA

2. Desenredar un trecho corto de la hélice de DNA

3. Seleccionar el rNTP correcto y catalizar la formación del


enlace fosfodiester

4. Detectar las señales de terminación

5. Interactuar con factores de transcripción


RNA polimerasa de la E. coli

Sigma Factors of E. coli


SIGMA FACTOR PROMOTERS RECOGNIZED

σ70 most genes

σ32 genes induced by heat shock

σ28 genes for stationary phase and stress response

σ28 genes involved in motility and chemotaxis

σ54 genes for nitrogen metabolism


RNA polimerasa de las eucariontes

➢ Poseen 2 subunidades grandes y muchas subunidades pequeñas

➢ No poseen una subunidad similar al factor s


Etapas de la transcripción
Iniciación

Promotores procarióticos

Promotores eucarióticos
Elongación

Se inicia tras la formación del primer


enlace fosfodiester

Primer nucleótido del transcrito de RNA


La RNA pol carece de
actividad nucleásica

No corrige la cadena
naciente de polinucleótidos

La fidelidad de la
transcripción es mucho más
baja que la de la replicación

Razón de error de la síntesis de RNA

1 error/ 104 - 105 nucleótidos


Terminación
En procariontes
Secuencia palindrómica
Señales de terminación en eucariontes

Factores de terminación que se unen al


RNA pol I DNA río abajo

Secuencia específica de corte y


RNA pol II poliadenilación

RNA pol III Después de sintetizar una serie de Us


- Eucarióticos 28S, 18S, 5.8S, 5S
rRNAs
- Procarióticos 23S, 16S, 5S

tRNAs
Productos de la
ncRNA
transcripción
snRNAs
snoRNAs

miRNAs
siRNAs

mRNAs
Circular RNAs (circRNAs) are produced from precursor mRNA
(pre-mRNA) back-splicing of thousands of genes in eukaryotes.
Although circRNAs are generally expressed at low levels, recent
findings have shed new light on their cell type-specific and tissue-
specific expression and on the regulation of their biogenesis.
rRNAs

• Distribución repetitiva (tandem)

• Transcritos a alta velocidad

• Existen 7 copias de genes de rRNAs en bacterias


“Árbol de Navidad” y 200 en humanos (genoma haploide)
rRNAs procarióticos

Operón
grupo de genes que está bajo
el control de un promotor.
rRNAs eucariontes
A recent study demonstrated that small nucleolar
RNA 24 (SNORNA24), a box H/ACA snoRNA, was
overexpressed in lung tumors.
snoRNAU50 is also altered and involved in the
development of prostate and breast cancer.
tRNAs

intrón
Remoción de “intrón”:
mediado por una endonucleasa y
posterior acción de una ligasa
A
mRNAs

Procesamiento del mRNA

Procariontes No hay modificación

Eucariontes Procesamientos en etapas


mRNAs

proteínas
Modificaciones del transcrito primario

1.- Una estructura denominada “casquete" se une


al nucleótido del extremo 5'

2.- Esplicing

3.- Adición de una cola poli-A al extremo 3'


Inserción del
casquete 5’ al RNA

• Protege al transcrito de la degradación

• Ayuda en la exportación

• Rol en el inicio de la traducción


Premio Nobel en Fisiología - Medicina (1993)

“Por su descubrimiento de la escisión de genes”


Esplicing del hnRNA

Eliminación de intrones

Richard J. Roberts Phillip A. Sharp

Secuencias no traducibles

Secuencias que “permanecen” en


el mRNA maduro
Espliceosoma

snoRNAs: the most abundant group of


intron-encoded ncRNAs

Autoesplicing
Predicting how splicing errors impact disease risk
August 30, 2018
Cold Spring Harbor Laboratory
Splicing removes interrupting segments called introns from the raw,
unedited RNA copy of a gene. There are over 200,000 introns in the
human genome, and if they are spliced out imprecisely, cells will
generate faulty proteins. The results can be life-threatening: about 14%
of the single-letter mutations that have been linked to human diseases
are thought to occur within the DNA sequences that flag intron
positions in the genome.
Retinitis Pigmentosa 38 — variation caused by the MERTK
defective gene - Seyone Chithrananda 2019
Retinal dystrophies are inherited genetic diseases that cause
severe loss in vision over time, as a result of loss of function in
the retina.
For many genetic diseases like RP, there’s been a lot of
promising research about how mutations affecting the splicing
process have been seen to perhaps be a cause for the disease.
According to a paper in Nature, nearly 38% of autosomal
dominant (1 copy of a mutant gene and 1 healthy one from two
parents) forms of RP showed mutations impacting splicing.
These mutations affected genes coding for spliceosome factors,
which are crucial to the process of splicing.

A patient with Hutchinson-Gilford progeria


Seyone Chithrananda 2019
However, for many rare diseases that are known to be likely
caused by mutations affecting splicing such as Hutchinson-
Gilford progeria, it’s unlikely that a drug will be available anytime
soon, due to a lack of data. Few people with forms of progeria
are even likely to pass the age of 13 years old. These children
won’t likely make it to high school.
Esplicing alternativo
Exitrons (exonic introns) are produced
through alternative splicing and have
characteristics of both introns and exons,
but are described as retained introns.
TRANS-SPLICING El Trans- splicing es una forma especial
de procesamiento de ARN en eucariotas donde los exones de dos transcritos de ARN
primarios diferentes se unen de extremo a extremo y se ligan. Mientras que el splicing
“normal” (cis-splicing) se procesa una sola molécula, el trans-splicing genera un solo
transcrito de ARN a partir de múltiples pre-ARNm separados. El trans-splicing puede
ser el mecanismo detrás de ciertas fusiones transcripcionales oncogénica (Li H, et al.
2008, Rickman D.S. et al. 2009).
•En células humanas, aprox. 40-60% de los genes exhiben esplicing alternativo

•Ejemplos de genes que presentan esplicing alternativo: tejido-specífico,


regulación del desarrollo y respuesta hormonal

•El esplicing alternativo es un mecanismo principal para incrementar el proteoma


Adición de la cola de poli-A al extremo 3’

1.- Ayuda a la exportación del mRNA maduro desde el núcleo

2.- Afecta la estabilidad de algunos mRNAs en el citoplasma

3.- Sirve como señal de reconocimiento para el ribosoma


Inserción de la cola
de poli-A al mRNA

Endonucleasa
secuencia consenso
AAUAA
(10 - 30 nucleótidos
antes del corte)

Poli-A polimerasa
adiciona 100 - 200 A
Las imágenes y fotografías contenidas en este ppt fueron obtenidas de libros o en internet,
con el único propósito de generar esta presentación para uso netamente académico

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