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TRADUCCION Y REGULACIÓN

DE LA EXPRESIÓN GENETICA
Oscar Nolasco Cárdenas MSc.
oscarnol@hotmail.com
Biología Celular y Molecular
06/11/2017
Índice o tabla de contenidos
tRNA

Ribosomas

Traducción en Procariotes

Traducción en eucariotes

Inhibidores de Síntesis de Proteínas

Mutaciones en las proteínas


tRNA
tRNA estructura primaria
Secuencia lineal de 60 a 95
nucleótidos de longitud
( Comúnmente 76).
tRNA estructura secundaria
La estructura de hoja de trébol
muestra los brazos y los bucles
o loops.
tRNA estructura terciaria
Nueve enlaces de hidrogeno
entre las bases en los bucles de
simple cadena y el plegamiento
de la estructura secundaria en
una estructura en forma de L
con el anticodon y el brazo
aceptor del aminoácido en los
extremos opuestos de la
molécula.

Caracteristicas del tRNA


1. Brazo o tallo aceptor 7-bp apareadas del 5'-terminal con 3'-terminal. Puede contener apareamientos no tipo Watson-Crick.
2. CCA cola Secuencia 3' terminal. En procariotes el CCA es transcrita, y en eucariotes CCA es adicionada post transcripcional.
3. El brazo D tallo de 4 bp que termina en un bucle o loop que contiene dihidrouridina.
4. El Brazo del anticodon tallo de 5 bp apareadas y contiene el loop del anticodon.
5. El Brazo TΨC tallo de 5 bp apareadas que contiene la secuencia TΨC donde Ψ es una pseudouridina.
6. Un brazo variable, tRNAs de clase 1 contiene 3 a 5 bases y tRNA de clase 2 contiene 13 a 21 bases formando un tallo de 5 bases
apareadas
7. Las bases que han sido modificadas por metilación se encuentran fuera del anticodon. La primera base del anticodon algunas
veces es modificada a Inosina (derivado de adenina) o pseudouridina (derivado de uracilo)
RIBOSOMAS

El mRNA es decodificado en los ribosomas


rRNA es el principal componente de los ribosomas
El inicio de la traduccion involucra el apareamiento del mRNA y el rRNA.
Shine-Delgarno (SD) es una secuencia que se presenta en muchos
transcriptos de procariotes que consta de 3-9 bases del mRNA los que se
complementan con el 3’terminal del 16S rRNA

En transcriptos mRNA de eucariotes la secuencia que facilita la


union inicial del mRNA a la subunidad pequeña ribosomal es la
secuencia Kozak ACCATGG o (GCC)RCCATGG

lac I P O lac Z lac Y lac A


AUG AUG AUG AUG

5’
SD AUG AUG SD AUG
Codon interno de Met
Codon de inicio antecedido Codon de inicio antecedido
sin sitio
del sitio Shine-Dalgarno del sitio Shine-Dalgarno
Shine-Dalgarno

mRNA de eucariote
5’ cap AUG AUG

El codon de inicio AUG es unico


posterior al 5’ cap
Traducción Procariotes

La subunidad menor inicia la búsqueda del


sitio de iniciación:
En Procariotes
IF1 previene el enlace prematuro del
aatRNA al sitio A
IF2 facilita la unión del formilmetionina a la
posición P de la subunidad menor
ribosomal
IF3 previene el enlace prematuro de la
subunidad mayor
Traducción Eucariotes
Activación del aminoacil-
tRNA
Terminación
Variaciones del código estándar
Inhibidores de Síntesis de Proteínas
Actuando sólo en bacterias
Tetraciclina. Bloquea la unión del aminoacil-ARNt al sitio A del ribosoma
Estreptomicina impide iniciación de la traducción elongación de la cadena y causa error de codificación
Cloranfenicol, bloquea la reacción peptidil transferasa en los ribosomas
Eritromicina se une al canal de salida de los ribosomas e inhibe la elongación de la cadena peptídica
Rifampicina Se une a ARN polimerasa (impide la síntesis de ARN)
Actuando sobre las bacterias y eucariotas
Puromicina provoca la liberación prematura de cadenas de polipéptidos nacientes por su adición al extremo
de la cadena en crecimiento
Actinomicina D se une al ADN impide el movimiento de la ARN polimerasa (impide la síntesis de ARN)
Actuando en los eucariotas, pero no las bacterias
Cicloheximida bloquea la reacción de translocación en los ribosomas
Anisomicina bloquea la reacción peptidil transferasa en los ribosomas
a-Amanitina bloquea la síntesis de mRNA mediante la unión preferentemente a la ARN polimerasa II
Mutaciones en las Proteínas

Las mutaciones en el ADN pueden tener diversos efectos sobre las proteínas al cambiar la
codificación y pueden ser:
Mutaciones conservativas
• Mutación silenciosa:Tripletes que codifican para el mismo aminoácido: AGG(arg)→CGG(arg)
• Mutación con sentido o neutra:Tripletes que codifican para aminoácidos equivalentes distintos.
AAA(lys)→AGA(arg). Ambos son aminoácidos básicos
Mutaciones no conservativas
• Mutación cambio de sentido: aparece un nuevo triplete que codifica para un aminoácido de
distinto tipo. La proteína pierde su función si afecta su sitio catalitico
• Mutación sin sentido: Aparece un triplete de terminación o stop: CAG(gln)→UAG(stop)
• Mutación con cambio de marco de lectura (inserción, deleción, duplicación inversión y
transposición) cambian el marco de lectura y la posición del codon stop

Silenciosa Con Sentido Sin Sentido Readthrough


Referencia:
Alberts B, Johnson A, Lewis J, et al.
Molecular Biology of the Cell. 5th edition.
New York: Garland Science; 2008.
Chapter 6. From RNA to protein
Regulación de
la Expresión
genética
Contenido

Diferencias en la expresión

Etapas en la expresión controladas en


eucariotes

Proteínas regulatorias

Regulación de la expresión en procariotes:


OPERONES

Regulación en genes eucariotes


Diferencias en la expresión

expresión linfocitosd eproteínasd en e uro na s

expresión de proteínas de neuronas

expresión linfocitos deproteínasdeneuronas

expresión de proteínas de linfocito


Una célula puede
cambiar la expresión de
sus genes en respuesta
a un estimulo externo

En un organismo
multicelular, las
células se diferencian
por el tipo de proteínas
que sintetizan a pesar
de contener el mismo
DNA
Etapas en la expresión controladas en eucariotes

La expresión de los genes puede ser regulada en muchos pasos en la vía :


DNA a RNA a Proteínas
Proteínas regulatorias
El inicio de la transcripción es el punto principal de
regulación que es modulado por:
REPRESORES
ACTIVADORES

El activador puede ejercer


una activación alosterica de
la RNA polimerasa
Proteínas que curvan el
DNA pueden facilitar la
interacción entre distantes
proteínas reguladoras que
se unen al DNA
• Secuencias cortas
en el ADN son
componentes
fundamentales en
el switch genético
• Durante los pasos de regulación de la transcripción los patrones de enlaces de
hidrogeno y grupos aceptores son las características mas importante en el
reconocimiento de genes por las proteínas regulatorias además de la
secuencia de nucleótidos y la geometría de la doble hélice.

Las proteínas regulatorias, contienen un motivo estructural que puede leer las
secuencias de DNA:
El motivo hélice torsión hélice es uno de los motivos mas comunes que se
encuentran en proteínas que se unen al DNA como son las proteínas homeoticas
de Drosophila, represor lambda, represor triptófano y CAP

El motivo Dedos de Zinc es un motivo que utiliza una o mas moléculas de Zinc
El motivo Cierre de leucina
Motivos de hoja B también pueden reconocer DNA
Regulación de la expresión genética:
Transcripción del gen
Regulación negativa La Regulación positiva La unión
unión de un represor inhibe de un activador facilita la
la transcripción transcripción
Regulación de la expresión en procariotes: OPERONES

Un operón es un grupo (cluster) de genes funcionalmente


relacionados que se encuentran coordinadamente regulados

Contiene:
Genes Estructurales: codifican a enzimas
Genes Regulatorios: codifican represores o
activadores de la expresión
Sitios de regulación: Promotores, operadores
El operon trp es regulado en parte
por un apo-represor
El operon trp es también regulado por atenuación
La actividad del ribosoma
determina la estructura
secundaria del RNA lider

Alta concentración
de triptófano,
provoca la
terminación de la
transcripción

Baja
concentración de
triptófano,
mantiene la
transcripción
Control positivo: Proteína activadora de
catabolitos (CAP) o proteína
receptora de cAMP (CRP)
En presencia de glucosa, [cAMP] es
cerca de 10-7 M
En ausencia de glucosa, [cAMP] se
incrementa cerca de 10-4 M
Es un dimero que se une a cAMP
• Las bacterias
suelen
intercambiar
sus
subunidades
de la RNA
polimerasa
para regular
su expresión
Regulación de la expresión en eucariotes
I. Nucleosomas y sus modificadores

II. Mas reguladores y regiones reguladoras mas


extensas:
Exacerbadores (Enhancers) Los enhancer se
presentan en una variedad de posiciones
respecto a los genes

Elementos aislantes o limtantes (Insulator)


ACTIVACION TRANSCRIPCIONAL

• Los activadores actúan indirectamente reclutando


complejos modificadores de la cromatina y las HAT que
ayudan a la maquinaria transcripcional unirse al
promotor o iniciar la transcripción
• Los activadores actuan directamente con
los mediadores y factores de la
maquinaria transcripcional
En S. cerevisiae se
presenta un orden de
eventos para el inicio de
transcripción, sin embargo
este orden difiere en
algunos genes donde la
modificación de histonas
ocurre primero, seguida
del reclutamiento de la
polimerasa y luego la
remodelación de la
cromatina
• REPRESIÓN TRANSCRIPCIONAL:
• El 8 % de la
capacidad
codante del
genoma de
mamíferos esta
dedicada a los
reguladores de la
transcripción de
genes.
• Cada gen es
regulado por un
conjunto de
genes
reguladores, cada
proteína es
regulada por otro
set de proteínas
• Existen diversas
vías de regulación
de moléculas
proteicas
• Estrategias de
memoria celular
• Circuitos
transcripcionales
permiten a la célula
mantener un orden
lógico
• La importancia de la
combinación del
control genético en el
desarrollo de un
organismo
Mecanismo de silenciamiento
• La metilación en el DNA esta asociada al
silenciamiento en genes de células animales
fenómeno llamado imprinting
Mecanismos epigeneticos aseguran que los patrones de
expresión pueden ser transmitidos a las células hijas
• Las alteraciones
en la estructura
de la cromatina
pueden ser
heredadas
• Control Post trancripcional
Fuentes de información

Alberts, B. , Johnson, A., Lewis J, et al. Molecular Biology of


the Cell. 5th edition. New York: Garland Science; 2008.
Chapter 7. Control of gene expression