Angelina Plasencia - 2023

METABOLISMO
Quimica II (clase 1)

Química biológica o Bioquímica: ciencia que procura explicar los procesos vitales a nivel molecular.
Bioquímica descriptiva: estudio de los constituyentes (química I; más estática)
Bioquímica dinámica: transformaciones de los constituyentes (química II)

El metabolismo o metabolismo intermedio es el conjunto de reacciones químicas que tienen lugar

en el seno de los tejidos. Comprende procesos de naturaleza muy variada, dirigidos a cumplir los
siguientes fines:
1) obtener energía a partir de los alimentos para procesos vitales.
2) sintetizar los componentes del organismo (ej: glóbulos rojos).
3) degradar los compuestos en otros más simples, utilizables como precursores.

Las vías metabólicas son una serie de reacciones secuenciales que transforman los compuestos,
catalizadas por enzimas que promueven esta reacción.

compuesto precursor compuestos intermediario producto final

ej: de la glucosa que tenemos en sangre, sufre una serie de transformaciones para ser glucógeno.

Tipos de vías metabólicas:

Secuencia lineal: el sustrato inicial es convertido en un producto que sirve de sustrato a otra enzima
en la reacción siguiente y así sucesivamente hasta el producto final.

Vía con ramificaciones: donde B, producto de A, tiene dos vías alternativas, por ende va a haber dos
productos finales. Da lugar a dos vías distintas que van a dar dos productos distintos. (ej: en la
biosíntesis de bases púricas, donde de un precursor podemos obtener o adenina o guanina)

Secuencia de reacciones reversibles: las transformaciones pueden recorrer por el mismo camino en
ambos sentidos. El sentido va a depender de la concentración de los intermediarios o productos. Son
catalizados en ambas direcciones por la misma enzima. Posible gracias a mecanismos de regulación.

Reversibilidad con un desvío: cuando una o más de las reacciones de la vía son prácticamente
irreversibles, el camino de vuelta debe realizar desvíos. No se da en toda la vía, en el desvío hay un
intermediario distinto. (ej: gluconeogénesis)

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Ciclos metabólicos: serie ordenada de reacciones que termina regenerando el compuesto inicial.
Sintetiza el mismo precursor pero sale producto. (ej: ciclo de krebs)
Ciclos interconectados: dos o más ciclos comparten un intermediario, hay productos liberados.
Secuencia en cascada: reacciones de activación enzimática, se obtiene una amplificación progresiva
de la respuesta (ej: la coagulación de la sangre) (ej: enteroquinasa rompe al tripsinógeno que da
tripsina, a su vez rompe la quimotripsina que da tripsinógeno que da tripsina)

Clasificación de acuerdo a su finalidad:

Vías catabólicas: la molécula de sustrato inicial es reducida a compuestos más simples. Comprenden
reacciones oxidativas y su resultante exergónica es exergónica (libera energía en forma de ATP o
NADH/ espontánea) (ej: glucógeno, su degradación da glucosa)
Vías anabólicas: forman nuevos enlaces químicos y productos finales más complejos que los
iniciales. Comprenden reacciones endergónicas (gasto de energía que proviene del ATP)
(ej: biosíntesis de un ácido graso desde un compuesto simple)
Vías anfibólicas: pueden funcionar como catabólicas o anabólicas según sus necesidades.

REGULACIÓN DE LAS VÍAS METABÓLICAS: (por enzimas involucradas)

1. Concentración de sustrato: cuando la [S] es baja, la AE es proporcional a la [S]. En
condiciones fisiológicas la [S] se encuentra por debajo de Km.
2. Enzimas reguladoras: Suele ser la primera E de una vía metabólica o serie de reacciones.
Aumentan o disminuyen su actividad en respuesta a señales. Regula el resto, si no está
activada no ocurre la reacción.
3. Modificación covalente: la actividad enzimática se modifica por la acción o sustracción de
grupos unidos covalentemente. (ej: una de las principales modificaciones es la fosforilación
de enzimas, modificación postraduccional)
4. Enzimas alostéricas: Un agente modificador de la actividad se une en otro sitio que no es el
catalítico, modificando la actividad de la E.
Se los llama moduladores o efectores alostéricos. Pueden ser activadores o inhibidores. Son
reversibles. Tienen más de una subunidad. Obtiene una curva sigmoidea.
Permiten la regulación por retroalimentación.
Heterotópico (otra molécula) u homotrópico (mismo sustrato)
5. Regulación de la cantidad de E: la cantidad de E depende de la velocidad de síntesis y
degradación. Si los dos procesos se mantienen son constitutivas. Si en algunas circunstancias
se puede activar la síntesis, son inducibles.

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 6. Compartimentalización: El conjunto de enzimas que componen una vía metabólica suelen
encontrarse en un mismo compartimento u organela. Sin embargo, podemos tener
diferentes enzimas con distintas actividades enzimáticas; una en el citoplasma y otra en la
mitocondria, para que se separe la regulación.

BIOENERGÉTICA
Las actividades de los seres vivientes requieren continuo aporte de energía.
La síntesis de componentes celulares (ej: glóbulos rojos), el transporte activo de solutos a través de
membranas contra gradientes de concentración, la contracción muscular, el movimiento de cilias y
flagelos, sólo puede llevarse a cabo si el suministro de energía es el necesario.
La energía proviene de los alimentos que ingerimos en la dieta, la digestión de estos es una etapa pre
metabólica; seres quimiotrofos, es decir necesitamos ingerir un compuesto químico para sacarle la
energía.
La contraposición son los seres autótrofos, sacan la energía del sol mediante la fotosíntesis (con esa
energía pueden acoplar la construcción de bloques más grandes, es decir de CO2 mas H2O se
obtiene glucosa, no dependen de ingerir alimentos como fuente de energía). Nosotros luego
ingerimos estos compuestos autótrofos.

Adenosina 5´- trifosfato: ATP es el principal intermediario de alto contenido energético.

Compuesto trifosforado, tiene ribosa en vez de desoxirribosa, bases nitrogenadas adenina y tres
fosfatos con carga negativa.
Esta carga negativa funciona como un “resorte comprimido"; rompe enlaces (exergónica) entre el 2 y
3; y 1 y 2, los hidrolizan y liberan energía que se acopla a la síntesis o a una reacción endergónica.
Reservorio y transportador de energía.
Ej. de donde se usa ATP: la bomba de Na/K, ADN ligasa, Topoisomerasa II, etc.

OBTENCIÓN DE ATP EN METABOLISMO AERÓBICO (en presencia de oxígeno)

1. Vías catabólicas en las cuales los sustratos se van a oxidar. Si hablamos de sustrato va a estar
involucrada una enzima, y en estas vías metabólicas es muy importante que esté involucrada una
deshidrogenasa. Sustrato que viene por diferentes medios, sufre la acciones de diferentes
deshidrogenasas y lo oxidan.
2. Los electrones e hidrógenos que le sacaron al sustrato van a ser captados por coenzimas, NAD o
FAD, en consecuencia se reducen y transportan los electrones hacia la cadena de transporte
electrónico, esto ocurre en la mitocondria.
3. Finalmente, el oxígeno va a reducirse por esos electrones de un sustrato que “comimos”
4. La energía que se va dando por el transporte electrónico se va a acoplar a la síntesis del ATP por
fosforilación oxidativa.

Reacciones de combustión: usan un oxidante y un combustible dando como producto CO2, H2O y
calor.

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REACCIONES REDOX
-Modifican los sustratos para la obtencion de energia
-Transferencia de e-
La oxidación implica la pérdida total o parcial de electrones (cede), mientras que la reducción implica
la ganancia de electrones (toma).
Toda reacción en la cual un elemento se oxida, simultáneamente hay otro que se reduce.
La capacidad de una sustancia o elemento para oxidar a otra/o y, por lo tanto, para reducirse,
depende de su validez por aceptar electrones que se expresa por el potencial de reducción.
Potencial de reducción (E) es su tendencia a ganar electrones frente a otro elemento, ion o
compuesto.
(ej: si tenemos Zn y Cu; el Zn le cede al Cu porque tiene un mayor potencial de reducción, mayor
afinidad por los electrones)

CADENA RESPIRATORIA:
-Transportadores intermedios entre el NADH y el oxígeno.
-Son pasos intermedios por diferentes moléculas que tienen un potencial de reducción cada vez
mayor hasta llegar al final que es el oxígeno, el aceptor final de los electrones, produciendo agua. Se
encuentra en la membrana interna de las mitocondrias, estos aceptores están dispuestos
ordenadamente según un gradiente de potencial de reducción creciente y asociados íntimamente a
las enzimas que catalizan transferencias.
-Comprende 4 complejos enzimáticos: I, II, III, IV.

MITOCONDRIA:
Organela de doble capa.
-Membrana externa: que rodea a la organela, formada por 30-40% de lípidos, 60-70% proteínas,
contiene pocas enzimas, porinas (canales) que permiten el pasaje de diversas sustancias y tiene una
permeabilidad alta
-Espacio Intermembrana
-Membrana interna: compuesta por 80% proteínas, ácidos grasos insaturados, como una
particularidad presenta la cardiolipina (lípido) y crestas (invaginaciones para una mayor superficie).
Se encuentran insertadas proteínas transmembrana que llevan a cabo el transporte de e-,
fosforilación oxidativa, deshidrogenasas y transportadores de moléculas grandes. Posee una
permeabilidad muy selectiva, solo compuestos polares pequeños. Todos los compuestos más
grandes van a necesitar transportadores.
-Matriz: Se encuentran las enzimas del ciclo de krebs y de oxidación de ácidos grasos. También
contiene el ADN mitocondrial, ribosomas, etc.

PASOS
1. A través de las vías catabólicas los sustratos, que vienen de la dieta, van a ser oxidados por
deshidrogenasas.
2. Los equivalentes de reducción liberados son captados por NAD o FAD NADH /FADH2

Las deshidrogenasas catalizan reacciones en las cuales el sustrato cede electrones y H+ a una
coenzima. La suma de los electrones y H +, se llama equivalente de reducción. Van a tener diferentes
coenzimas: NAD (Nicotinamida adenina dinucleótido), NADP y FAD (flavina adenina dinucleótido).

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(Coenzimas: porciones no proteicas, termoestables, indispensables para la acción de la enzima)

NAD (Nicotinamida adenina dinucleótido):

-2 nucleótidos unidos entre sí por medio del puente fosfodiéster.
-Nicotinamida: deriva de la piridina, del ácido nicotínico; es una vitamina del grupo B. Esta porción
grande es quien recibe los electrones y H +.
-Unida a ribosa-5´-P.
-Adenina unida a ribosa-5´-P.
-Involucrado en deshidrogenasas en la matriz mitocondrial, donde recibe los electrones y los lleva a
la cadena respiratoria.

NADP (Nicotinamida adenina dinucleótido fosfato):

-Nicotinamida: capta los electrones y H+. Difiere del NAD, en que se usa en reacciones en el citosol
las cuales reciben los electrones de un sustrato y se los cede a otro sustrato para reducirlos, pero no
para la cadena respiratoria.

FAD (flavina adenina dinucleótido):

-2 nucleótidos
-Contiene un núcleo isoaloxazina + ribitol (producto de reducción de la ribosa, con 5 C) =
componentes de la riboflavina (parte del complejo de vitamina B).
-El que recibe los electrones y protones es el núcleo isoaloxazina.

ej: ciclo de krebs: en el paso donde el malato se oxida a oxalacetato, tenemos una enzima
deshidrogenasa la cual le quita el equivalente de reducción al malato se lo cede el NAD y se
transforma en NADH. La coenzima viaja a la cadena respiratoria, ya que está dentro de la matriz
mitocondrial, deja los electrones y vuelve a participar de esa etapa.

3. De todas las reacción de redox que implican deshidrogenasas, quitan los equivalentes de
reducción y los guardan en unas coenzimas que van a la cadena respiratoria.
El NADH/FADH2 cede los electrones a la cadena de transporte electrónico, que reduce O2 H20

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Complejos:
COMPLEJO I - NADH UBIQUINONA REDUCTASA
-Recibe los equivalentes de reduccion del NADH
-Es el más grande, tiene 45 cadenas polipeptídicas
-NADH se acerca a este complejo, donde se encuentra con un aceptor de electrones con mayor
potencial de reducción que le quita esos electrones y los transfiere al complejo siguiente.
Los componentes de este complejo que captan y ceden e- son:
1. Flavina mononucleótido (núcleo isoaloxazina + ribitol + un fosfato) recibe los electrones y los cede
a
2. Centro ferrosulfurados: se encuentran en varios componentes de la cadena respiratoria, formados
por hierro unido a azufre. Toman los electrones y los cede a la Coenzima Q que tiene un potencial de
reducción mayor.
-Podemos encontrar: (estructura)
-Fe unido a 4Cys (cisteínas con azufre)
-2Fe unidos a 4Cys + 2S
-4Fe unidos a 4Cys y 4S (+ complejo)

COMPLEJO II - SUCCINATO UBIQUINONA REDUCTASA

-Uno de los más pequeños, tiene solo 4 cadenas polipeptídicas de las cuales una está unida a FAD y
una con 3 centros ferrosulfurados.
-Los elementos que transportan los electrones son: FAD y los centros ferrosulfurados.
-Contiene una deshidrogenasa: succinato deshidrogenasa (del ciclo de krebs)
La succinato deshidrogenasa le quitan los e- al succinato, se los cede al FAD quien los lleva a los
centros ferrosulfurados y los dirige a la Coenzima Q.

Otras deshidrogenasas flavoproteínas de mitocondria.

Realizan diferentes reacciones redox y el FAD va a poder ceder sus equivalentes de reducción a la
ubiquinona. Sin embargo, estas deshidrogenasas no forman parte de la cadena respiratoria.

Glicerol-3-P deshidrogenasa: cara exterior de la membrana interna. Transfiere los e- directamente a

ubiquinona.
Acil-CoA: primer paso de b-oxidación de ácidos grasos. Pasa los e- a través de otras flavopt a
ubiquinona.

UBIQUINONA O COENZIMA Q
-Llega al complejo III para ceder los electrones.
-Es una benzoquinona que está compuesta por 10 isoprenos. Como es apolar puede estar en la
bicapa de la membrana interna.
-Recibe dos e- de NADH o FADH2 y los transfiere al complejo III.
-Se puede encontrar en diferentes estados:
-Cuando está completamente oxidada: como benzoquinona
-Cuando está completamente reducida: tomo 2 e- y 2 H+

COMPLEJO III - UBIQUINONA - CITOCROMO C REDUCTASA

-Contiene 11 cadenas polipeptídicas

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-Los elementos que transportan los e- son: citocromo c1, citocromo b (presenta dos grupos hemo:
b566 y b562) y la proteína ferrosulfurada de Rieske (2Fe2S)
-Reciben los electrones y los ceden al citocromo c.

Citocromo
-Son proteínas que contienen el grupo hemo. A diferencia de la hemoglobina, el Fe puede cambiar su
estado de oxidación.
-Se denominan a. b y c de acuerdo a su espectro de absorción.
-El potencial de reducción depende de la estructura del hemo y de su entorno.

CICLO Q
-Mecanismo por el cual los e- que venían del NAD o FAD llegaron a la coenzima Q, van a pasar al
citocromo del complejo III y de este al citocromo c.
-2 ciclos simultáneos que involucran dos ubiquinonas o coenzima Q.
1. Tenemos una ubiquinona completamente reducida (con 2e- y 2H+), esta llega al complejo III y cede
uno de los electrones al centro FeS de la proteína de Rieske (aceptor). Luego este centro lo pasa al
citocromo c1 (aceptor), y de acá pasa al citocromo c. Sale del complejo III y sigue su camino.
El problema que se da es que los citocromo pueden tomar de a un electrón por vez, ocurre lo
siguiente:
2. La ubiquinona cede los 2 e- y también libera los 2H+ al espacio intermembrana, un electrón es
captado y el otro lo cede al citocromo b566, quien lo pasa al citocromo b562. Luego es tomado por la
ubiquinona.
Una segunda coenzima Q llega y hace lo mismo que la primera pero ese electrón que cedió al
citocromo b, no lo toma ella sino que lo toma la primera. La primera coenzima Q tenía un e- ahora
capta el segundo e-, por lo cual tomó dos electrones y dos H + de la matriz y vuelve a estar como
coenzima reducida.
Así se obtiene el pasaje de a un electrón por vez en los citocromos.

Citocromo c
- proteínas con el grupo hemo, contiene hierro y puede cambiar el estado de oxidación
- no es una proteína integral, es periférica
- tiene cargas positivas por eso se une a los fosfolípidos de la membrana
- cede el electrón al complejo IV.

COMPLEJO IV - CITOCROMO C OXIDASA

-Aceptor final de los electrones, con mayor potencial de reducción
-Contiene 13 cadenas polipeptídicas
-Elementos que transportan e-: citocromo a, citocromo a3 y dos centro de cobre que están próximos
a los citocromos.
-Los electrones los recibe uno de los centros de cobre, los cede al citocromo a y estos al citocromo
a3, que también tiene cobre. En esta instancia es donde se incorpora oxígeno y va a ir recibiendo de
a uno los electrones para luego tomar dos H+ y salir como agua. Esta formación de agua tiene la
particularidad de tener muy fijo al oxígeno para que no se liberen esos intermediarios que se llaman
especias reactivas de oxígeno.

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Existen inhibidores del transporte de e-, como algunos anestésicos que van a ir bloqueando los
complejos. Ej: si uno bloquea el complejo III van a quedar los anteriores reducidos y los siguientes
oxidados.

4. Esta energía se emplea para sintetizar ATP por fosforilación oxidativa, impulsa el paso de un
gradiente potencial para producir ATP

Gradiente de concentración: distribución no homogénea de partículas (protones)

Ponemos en un vaso una gota de colorante, si no hay membrana que impide la difusión, el sistema es
inestable entonces va a dispersarse hasta estar en una distribución homogénea, que forma lo
estable.

En conclusión, lo que logramos con el transporte de electrones es una difusion asimétrica de un

compuesto que va a estar frenado por una membrana sumamente impermeable. Entonces cuando
nosotros queramos llegar a ese estado de equilibrio los H+ difunden al estado donde se encuentran
menos concentrados a través de un poro que va a usar esa energía para sintetizar ATP. (ATP sintasa)

Gradiente electroquímico: acumulación de H+ en el espacio intermembrana (ocurre en el complejo I,

III, IV).
Cada vez que pasa un electrón de un compuesto con menor potencial a uno de mayor, se libera un
poquito de energía que hace que se bombeen H+ al espacio intermembrana. Se van acumulando,
haciendo que se genere un gradiente, también se vuelve más ácido; esta acumulación se llama
fuerza protón-motriz.

ATP sintasa:
-compuesto enzimático que tiene dos partículas:
F0:
-contiene: 10 a 14 c (forman el poro por donde pasan los protones), 2b (vástago que une a y delta) y
1 a.

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F1:
-contiene la actividad catalítica para la producción de ATP
-formada por 9 subunidades: 3 alfa, 3 beta (sitio catalítico), 1 gamma, 1 delta, 1 epsilon

-Cuando los H+ se acumularon en el espacio intermembrana, pasan por c, quien hace un movimiento
rotatorio, que se transmite a epsilon y gamma, quienes lo transmiten a las subunidades beta. Las
beta hacen el enlace entre ADP y fosfato.
El pasaje tiene como objetivo acumular protones en el espacio intermembrana para que después
vuelvan a la matriz y se use esa energía para sintetizar ATP.
Cada beta esta en una conformación distinta:
-Abierta: entra el ADP + fosfato
-Laxa: se forma el ATP
-Cerrada: El ATP es retenido

TRANSPORTE DE ATP - ADP

Se produce a través de transportadores, porque el ATP se usa habitualmente en el citoplasma pero se
produce en la mitocondria. Entonces el ATP debe salir al citoplasma, ADP debe entrar.
-Nucleótido adenina translocasa: contratransporta las dos moléculas. Gasta mucho gradiente
electroquímico
-Fosfato translocasa: entra el fosfato a la mitocondria para que se pueda formar el ATP. Posee carga
negativa, entonces usa esa diferencia de carga a favor de gradiente.

Rendimiento global
-3 ATP por cada NADH y 2 ATP por cada FADH2
-10 H+ se trasloca por el transporte de 2 e-
-3 H+ se requieren para generar cada ATP

Control respiratorio
-Todos los procesos anteriores están interconectados entre sí.
-A medida que se va gastando el ATP, va aumentando la cantidad de ADP, es quien manda en este
ciclo. Si hay ADP hay formación de ATP, el cual a la vez consume parte del gradiente electroquímico.
-Sin embargo si no hay una demanda grande de ATP, ese ciclo no sucede y no hay transporte de e-
para no acumular de más H+, para que no se sature el sistema.

Conmutadores de Hidrógenos
-Son quienes hacen que los equivalentes de reducción que se producen en el citosol puedan ser
aprovechados en la cadena de electrones.

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-Hay reacciones en el citoplasma que oxidan sustratos, no pueden pasar el NADH a la mitocondria,
no se podría llevar a cabo la reacción. Para eso existen los conmutadores; donde en vez de entrar el
NADH, los electrones pasan a un compuesto que tenga un transportador y así los electrones pasan el
interior de la mitocondria.

-Uno de los conmutadores es glicerofosfato, en el cual tuvimos una reacción donde se formó NADH,
al no poder entrar a la mitocondria, pasa los equivalentes de reducción a la bihidrohiacetona fosfato.
Esta luego se reduce a glicerol-3-P, este compuesto no entra en la matriz sino que directamente tiene
una deshidrogenasa en la membrana. Saca los equivalentes de reducción, se los da a FAD y se dirige
al complejo II.
-El otro conmutador que si tiene transportadores es aspartato - malato. En el cual vamos a tener una
reacción que generó NADH, este reduce al oxalacetato malato y este SI entra a la mitocondria
llevando los equivalentes de reducción. El malato se oxida de nuevo y el oxalacetato puede salir.

Fosforilación a Nivel de sustrato. (otro tipo de formación de ATP)

-No hay participación de la cadena respiratoria
-Se da cuando en una vía metabólica, se genera un metabolito de alta energía, lo rompemos y la
energía liberada la acoplamos a la síntesis de ATP

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