BIOENERGÉTICA Y METABOLISMO

 Las células y los organismos vivos necesitan realizar trabajo para permanecer vivos,
crecer y reproducirse.
 Aprovechar la energía y canalizarla en trabajo biológico
 Variedad de transducciones de energía

“Transformación de los combustibles químicos en calor y que con la respiración es ESENCIAL

para la VIDA”

*Dependiendo el tipo de organismo así será la fuente energética que se estará obteniendo.
Una similitud en la obtención de energía entre animales y humanos es que ambos son a
partir de compuestos de carbono sintetizados por otros organismos.

En el caso de las plantas, estas son las que fabrican los compuestos de carbono y su fuente
energética principal es de la luz

Ciclo del carbono y oxígeno entre los organismos vivos

- Los autótrofos y heterótrofos: ciclo interdependiente (Ambos dependemos uno de

los otros)
- Autótrofos consumen CO2 para construir moléculas
orgánicas, generando algunos oxígeno y agua. (A
partir de la luz va provocar la excitación de ciertos
compuestos especialmente al nivel de los
cloroplastos y el CO2 que forma los convierte en
compuestos orgánicos más complejos: celulosa,
almidón, etc.)
- Heterótrofos utilizan los productos orgánicos como
nutrientes y devuelven CO2
o Oxidaciones que producen CO2 consumen
oxígeno, convirtiéndolo en agua

*Cuando se habla de oxidaciones se está cambiando un estado redox en el átomo, en este

caso del carbono

Ciclo constante de C, O y agua entre los autos y heterótrofos, con la energía solar como
fuerza motriz

Transformación del N a partir del ciclo del Nitrógeno en la biósfera. (No todos los
compuestos del nitrógeno son utilizables por todos los organismos)

Metabolismo

Actividad celular altamente coordinada en la que sistemas multienzimáticos trabajan en

conjunto para:

1. Obtener energía química (Mediante la energía solar o por la degradación de

algunos nutrientes energéticos obtenidos del ambiente)
2. Convertir nutrientes en moléculas propias (Una vez desquebrajado todos los
nutrientes, las moléculas que se necesitan para funciones celulares se sintetizan)
3. Polimerizar precursores monoméricos en macromoléculas (Funciones especializadas
dependiendo el tejido en el que se encuentren)
 4. Sintetizar y degradar biomoléculas necesarias para funciones celulares específicas

Es la suma de todas las

transformaciones químicas
llevadas a cabo en la célula.

Ocurre a través de un conjunto

de reacciones catalizadas por
enzimas que constituyen las vías
o rutas metabólicas.

Los metabolitos son generados

durante las reacciones
enzimáticas que convierten al
precursor en productos.

*Entre las reacciones del

metabolismo puede haber reacciones o transporte de compuesto entre un espacio de un
organelo u otro.

*También, en la ruta de las pentosas fosfato, hay interconverción de grupos o compuestos

de carbono, ya sea de 1,2,3… para formar otros compuestos metabólicos.

Metabolismo intermediario: actividades combinadas de todas las vías metabólicas que

interconvierten precursores, metabolitos y productos de bajo peso molecular (<1,000).
(Monómeros o dímeros)

Catabolismo (reacciones catabólicas): Fase degradativa del metabolismo en la cual las

moléculas orgánicas (CHON, Proteínas, grasas) son convertidas en productos más
pequeños y simples (CO2 , ácido láctico, NH3 ).

Implica rotura de compuestos que fueron sintetizados.

*Los precursores del catabolismo son: carbohidratos, grasas y proteínas. Al momento de

degradarse se oxidan y dejan como producto: CO2, H20, NH3.

En el proceso se libera energía, la cual es conservada en forma de ATP, en acarreadores

de electrones reducidos (NADH, NADPH Y FADH2), y el resto se pierde en calor.
Anabolismo (reacciones anabólicas): Fase de biosíntesis de moléculas complejas (lípidos,
polisacáridos, proteínas y ácidos nucleicos) a partir de precursores simples.

Responsable de la síntesis de todos los componentes necesarios para la conservación,

crecimiento y reproducción celular.

*En los embriones en crecimiento está más activo el anabolismo. También hay catabolismo
para la eliminación de algunas células y producir los órganos que se requieren.

*En las células cancerosas la división celular va estar más acelerada.

*Los precursores del anabolismo son: aminoácidos, azucares, ácidos grasos (sencillos) y
bases nitrogenadas.

*Se requiere energía para formar compuesto más grandes y más complejos, a partir de
compuestos más pequeños.

El proceso requiere de energía, generalmente en forma de ATP y

de poder reductor de NADH, NADPH y FADH2 (creación del
potencial de membrana).

(Señal de frenar la quema de alimentos)

(Señal de aumentar la quema de alimentos)

Principales características del anabolismo y catabolismo

 Catabolismo
o Degradativo, oxidativo
o Genere energía, produce ATP
o Los productos finales e intermediarios son
materias primas del anabolismo
o Genera desechos que se excretan al
entorno (El CO2 se combina con amonio
para sintetizar UREA)
o “LISIS” (Rompimientos)
o Convergente (no necesariamente)
 Anabolismo
o Sintético, reductivo
o Utiliza energía, consume ATP
o Los productos finales son materias primas
de catabolismo
o “GENESIS”
o Divergente (no necesariamente)

Rutas metabólicas

Secuencia ordenada de reacciones dirigidas enzimáticamente en la cual el producto de

una reacción es el sustrato de la siguiente. (Hay reacciones que pueden ser reversibles)

Abarca productos intermedios, productos finales y características de las enzimas relevantes.

*Hay rutas metabólicas lineales o ramificadas

*Diseño de rutas metabólicas

 - Catabolismo convergente: a partir de múltiples precursores complejos, por medio
de diferentes reacciones se liberan compuestos más pequeños. Estos compuestos
en un determinado momento van a llegar a converger en un determinado
metabolito (Acetil coenzima A)
- Anabolismo divergente: a partir de un determinado compuesto se sintetizan
múltiples compuestos. (El precursor del colesterol es el acetil coenzima A)
- Rutas metabólicas cíclicas: un precursor se va a regenerar continuamente. (A pesar
de introducir 2 átomos, estos mismos están saliendo)

Distribución de actividades

 Rutas anabólicas se llevan a cabo en citosol celular.

o Excepción: ciclo de la urea. (La mayoría se lleva a cabo en la mitocondria)
 Rutas catabólicas se llevan a cabo en mitocondria celular.
o Excepción: glucólisis. (citosol)

 Las rutas metabólicas se localizan en varios compartimientos

 Se pueden encontrar conjuntos separados de metabolitos → funcionamientos
simultáneos de rutas opuestas en mismo espacio físico
 Compartimentación a nivel molecular (complejos multienzimáticos), control cinético
por la [S], [intermediarios]
 Forma de especialización tisular

*Un compuesto multienzimatico es un conjunto de reacciones catalizadas por distintas

enzimas en un determinado espacio físico o en un mismo espacio físico

¿Por qué hay tantas reacciones distintas en una célula?

- Poca especificidad celular, un

enzima puede romper o
formar unos pocos enlaces
covalentes de una sola vez.

- Controlar el consumo y la
producción de energía
(termodinámicamente no es
posible sintetizar metabolitos
en un solo paso)

- La eficiencia de la
transferencia de energía en
cada paso nunca es 100%
Bioenergética

Vida y Energía

 El mantenimiento de la vida depende de la capacidad de realizar trabajo.

 Los organismos son capaces de llevar a cabo transducciones energéticas
obedeciendo las leyes de termodinámica que rigen el universo.
 Conversión de combustibles en energía química utilizada para síntesis o formación
de gradientes eléctricos.

Es el estudio cuantitativo de las transducciones de energía (cambios) de las células vivas y

de la naturaleza.

Función de los procesos químicos que fundamentan dichas transducciones

- Describe la transferencia y utilización de energía en los sistemas biológicos

Se ocupa de los estados de energía inicial y final de los componentes de la reacción, no

de los mecanismos de reacción o de cuánto tiempo tarda en ocurrir un cambio químico

- Dado que los cambios de energía miden la factibilidad energética de una reacción
-> predicen si una reacción puede ocurrir o no

+ -

*La bioenergética utiliza entonces unas ideas de la termodinámica -> energía libre

Las transducciones biológicas de energía obedecen las mismas leyes físicas que gobiernan
todos los demás procesos en la naturaleza.

Uso de energía: química / lumínica

¿Cuáles son los principios de la termodinámica que aplican a bioquímica?

1. Conservación de la energía: la cantidad total de energía del universo permanece

constante; la energía NO puede ser creada ni destruida.
2. El universo tiende al desorden: en todos los procesos naturales aumenta la entropía
del universo.
Entropía en sistemas biológicos

Los organismos y la termodinámica

 Las células vivas u organismos son sistemas abiertos (intercambian materia o

energía)
 Nunca están en equilibrio con el medio ambiente (Ej, Temperatura)
 Las constantes transacciones con el medio ambiente les permite crear orden y
complejidad dentro de ellas, sin violar la segunda ley de la termodinámica

Parámetros termodinámicos que describen los cambios de energía que ocurren en una
reacción química:

- Energía libre de Gibbs (G)

- Entalpía (H)
- Entropía (S)

 Energía libre de Gibbs (G): cantidad de energía disponible para realizar un trabajo
durante una reacción a temperatura (T) y presión (P) constantes.
Reacción exergónica: “liberación de energía”; ΔG (-).
Reacción endergónica: “requiere de energía”; ΔG (+).
o Unidades = Joules/mole o calories/mole
o (1 cal = 4.184 J)

 Entalpía (H): Es el contenido de calor del sistema reactante, refleja el número y tipo
de enlaces químicos en los reactantes y en los productos.
Reacción exotérmica: “libera calor”; ΔH es negativa (-).
Reacción endotérmica: “toma calor”; ΔH es positiva (+).
o Unidades = Joules/mole o calories/mole

*No es útil para realizar trabajo

 Entropía (S): Es una expresión cuantitativa del desorden, aleatoriedad o

desorganización de un sistema.
 o Cuando los productos de una reacción son menos complejos y más
desordenados que los reactantes, se dice que la reacción gana entropía y
ΔS es positiva (+).
o Cuando los productos son más complejos y organizados que los reactantes,
se pierde entropía y ΔS es negativa (-).
 Joules/mole·Kelvin

*Del estado sólido al estado líquido hay una ganancia de entropía

*Del estado líquido al estado gaseoso hay una ganancia de entropía

* Viceversa hay perdida

En condiciones de sistemas biológicos T y P constantes la relación entre los tres parámetros

y sus cambios se representa por medio de la siguiente ecuación:

 ΔG = ΔH - TΔS

*Unidades y constantes

Las células precisan fuentes de energía libre, son isotérmicos y a presión constantes, pero si
requieren energía libre, que permite predecir la dirección de las reacciones

Hacia el equilibrio

El cambio de energía libre estándar está directamente relacionado a la constante de

equilibrio de una reacción:

A + B  C +D A + B  C +D

Keq= [C] [D] / [A] [B]

*Si en una determinada reacción la concentración de los productos es más alta que la de
los reactivos, la constante seria mayor a 1, por lo que estaría a favor de los productos
La composición de un sistema de reacción tiende a cambiar hasta llegar al equilibrio
(constante) … las [ ] reactantes y productos ya no cambian

Bajo condiciones estándares

Cuando el sistema no está en equilibrio, la tendencia a alcanzarlo es una fuerza muy fuerte,
cuya magnitud puede expresarse como el cambio de energía libre para la reacción: ΔG

Bajo condiciones estándar, se le llama ΔG°

T= 298°K (25°C),

[R y P]₀= 1M,

P de gases= 1 atm (101.3 kPa)

pH=0 ([H+]=1)

¿Las condiciones estándar son las presentes en los seres vivos? NO

En condiciones bioquímicas

Las constantes físicas basadas en condiciones bioquímicas utilizan constantes definidas

como: constantes estándar transformadas (ΔG’° y K’eq).

ΔG’° es una constante característica de cada relación, como lo es su K’eq.

La relación entre estas constantes, para sistemas bioquímicos es: ΔG’° = -RT ln K’eq

Condiciones bioquímicas:

pH= 7.0 [H2O]= 55.5M

To = 298 K

R = 8.315 J/(mol*K) -----> (0.008315 kJ/mol*K)

A cambios relativamente pequeños de ΔG’° corresponden grandes cambios de K’eq

 *Si la contante de equilibrio es mayor a uno la reacción es exergónica.

ΔG, ΔG′, ΔG′°

 ΔG: es la diferencia entre el contenido de energía libre de los productos y el

contenido de energía libre de los reactivos en un sistema de reacción *
 ΔG°: es la diferencia entre el contenido de energía libre de los productos y el
contenido de energía libre de los reactivos bajo condiciones estándares
 ΔG’°: es la diferencia entre el contenido de energía libre de los productos y el
contenido de energía libre de los reactivos bajo condiciones celulares estándares o
estándares bioquímicas

¿Relación entre ΔG y ΔG°’?

- El ΔG°’ es una constante: tiene un valor característico, fijo, para una reacción
determinada
- Pero la variación de energía libre real, ΔG, es función de las concentraciones de
[reactivos] y [productos] y de la T durante la reacción
o Que no tienen por qué coincidir necesariamente con las condiciones
estándar definidas

El cambio real de energía libre (ΔG) depende de las concentraciones de los reactantes y
productos y de la temperatura del sistema al momento de que está ocurriendo la reacción:

ΔG = ΔG’°+ RT ln [C][D] / [A][B]

Cuando la reacción está al equilibrio ΔG = 0 y ya no puede realizarse más trabajo la

ecuación se convierte en:

ΔG’° = - RT ln [C]eq [D]eq / [A]eq [B]eq

ΔG’°= -RT ln K’eq

La condición más importante que afecta al cambio de energía libre en las células es la
concentración de los sustratos y los productos de una reacción:

Que es igual a decir:

De donde Q es igual a la relación de acción de masas

Calcular el cambio de energía libre estándar de la reacción catalizada por la enzima

fosfoglucomutasa.

Glucosa 1-fosfato ↔ Glucosa 6-fosfato

El análisis químico muestra que ya sea que se empiece la reacción con 20 mM de glucosa
6-fosfato (pero sin glucosa 1-fosfato) o bien 20 mM de glucosa1-fosfato (pero sin glucosa 6
fosfato) la mezcla al equilibrio final tendrá una concentración de glucosa 1-fosfato de 1mM,
y de glucosa 6-fosfato será 19mM. Todo esto a 25°C y pH 7.0

Keq = [Glu-6-P] / [Glue-1-P]

Keq = 19Mm / 1Mm = 19

ΔG’°= -RT ln K’eq ------> -(8.315J/mol K)(298k) ln(19) = -7.3KJ/mol

(Es exergónica y va hacia los productos)

Acoplamiento (ΔG′₀ es aditivo)

Una reacción endergónica puede acoplarse a una exergónica a través de un intermediario

común que permite transferencia de energía de una a otra.

Ej.

(1) Glucosa + Pi →Glucosa-6-P + H2O ΔG’°= 13.8 kJ/mol (endergónica)

(2) ATP + H2O →ADP + Pi ΔG’° = -30.5 kJ/mol (exergónica)

ATP+ glucosa →ADP + glucosa-6-P ΔG’° = -16.7 kJ/mol

Las K´eq en reacciones acopladas son multiplicativas

K´eq1= [glu-6-P] / [glucosa] [Pi] K´eq2= [ADP] [Pi] / [ATP]

K´ eq3 = K´ eq1 * K´ eq2

Los organismos transforman la energía libre en ATP y otros compuestos altamente

energéticos que proveen energía para realizar trabajo biológico.

Algunas transformaciones químicas son demasiado lentas (energías de activación

demasiado elevadas).

 ATP: moneda de intercambio energético celular: enlaza el anabolismo y

catabolismo
o Es un donador de varios grupos metabólicos que genera energía mediante
la ruptura hidrolítica del enlace fosfoanhídrido.
 ADP, Pi, AMP, PPi

El cambio de energía libre para la hidrólisis de ATP tiene un valor alto y negativo

Base química:

1. Hidrólisis: separa cargas, elimina repulsión

2. Estabilización por resonancia
3. Solvatación e hidratación

Cambios de energía libre generados según el enlace fosfoanhídrido roto

La energía libre real que se

está liberando
intracelularmente dependerá
de la concentración de cada
uno de los metabolitos que
está presente en la célula.
Los nucleósidos difosfato y trifosfato en solución
acuosa y en los sitios activos de los enzimas
existen como complejos con magnesio,
apantalla las cargas negativas e influye sobre la
conformación de los grupos fosfato.

El Mg forma complejos con el ATP y el ADP. Este

tiene 2 cargas positivas que pueden apantallar
parcialmente las cargas negativas del ATP e
influye en la formación de los grupos fosfato
presentes en las moléculas.

Podemos calcular ∆G para la hidrólisis del ATP. Energía libre de hidrólisis REAL de ATP en las
condiciones IC:

Las concentraciones de estos en diferente en compartimientos celulares, el ∆Gp varía

también entre células, así como puede variar de un momento a otro, según condiciones
metabólicas o energéticas.

Calcular el cambio de energía libre de la hidrólisis de ATP dentro de un eritrocito humano.

En eritrocitos humanos las concentraciones de ATP, ADP y Pi son: 2.25, 0.25 y 1.65 mM. Asumir
por simplicidad un pH de 7, y temperatura de corporal de 37°C.

ΔG′₀ = -30.5KJ/mol

ΔG = ΔG′₀ + RT ln Q

Q = (ADP) (Pi) / (ATP) --------> Q= (0.00025)(0.00165) / (0.00225) = 0.000183

ΔG = -30.5 KJ/mol + (0.000183 KJ/mol K)(310) ln(0.000183)

ΔG = -52.67

¡El cambio real de energía libre es mayor, en el eritrocito humano que el cambio de energía
libre estándar!
Transferencias de grupo

A. Transferencia de grupo fosforilo (no por hidrólisis)

B. Producción de ATP por transferencia de grupo fosforilo, pirofosforilo y adenilato
(AMP)
C. Transferencia del grupo nucleotidilo

 “Enlace fosfato rico en energía” FALSO

o La energía libre liberada no procede de la hidrólisis de los compuestos
fosfatos que se rompen, si no que los productos de la reacción tienen un
contenido de energía libre menor que los reactivos
 “Compuesto fosfato de alta energía”

A Transferencia de grupos fosforilo

La hidrólisis de ATP solo libera calor.

Se forma un compuesto fosforilado como un

intermedio transitorio

La capacidad de un compuesto fosforilado para

transferir su grupo fosforilo se llama potencial de
transferencia de grupo fosforilo.

 < ATP (fosfoésteres) → compuestos de baja

energía
 >ATP (fosfoanhídros) → compuestos de
alta energía

Los potenciales de transferencia de grupo son una

medida de la energía libre que se requiere para
formar el compuesto fosforilado.

Compuestos de alta energía >25 kJ/mol

Compuestos de baja energía <25 kJ/mol

B Producción de ATP por transferencia de grupo fosforilo

Una molécula anhidra de alta energía le transfiere un grupo fosforilo al ADP y forma ATP
(reacciones catabólicas).

Un compuesto con alto potencial de transferencia puede donar su grupo fosforilo a un

compuesto que sea menos rico en energía.

Cualquier compuesto fosforilado puede sintetizarse acoplando la síntesis a la rotura de otro

compuesto fosforilado con una energía libre de hidrólisis más negativa
La fosforilación a nivel de sustrato permite la transferencia de grupo fosforilo de una
molécula de alta energía a una de baja energía (ADP)

Fosfágenos. Moléculas de almacenamiento de fosfato. Son fosfoamidas ricas en energía y

tienen mayores potenciales de transferencia de grupo que el ATP

C Transferencia del grupo nucleotidilo

La transferencia de grupos fosfato permite energizar la molécula que va a ser modificada.

“La cargan”

¿El cambio real de energía libre depende de las concentraciones de reactivos y

productos? VERDADERO

En condiciones estándar, la temperatura es: 25°C o 298 K

En una reacción al equilibrio, el ∆G = 0 VERDADERO

El valor alto y negativo del ∆G del ATP, es debido a: Hidrolisis: separa cargas, elimina
repulsión. Y Estabilización por resonancia, solvatación e hidratación.