Tema 6: Metabolismo, introducción

Todas las células y todos los organismos vivos necesitan llevar a cabo diferentes
trabajos biológicos que conllevan un gasto de energía (movimientos celulares,
transporte de moléculas en contra de gradiente…)
Organismos autótrofos obtienen energía de la luz y la fotosíntesis
Heterótrofos utilizan compuestos con elevada energía potencial para producir energía

1. Metabolismo
Metabolismo: conjunto de reacciones químicas por las que los ssvv obtienen la energía
para llevar a cabo ese trabajo biológico o sintetizar macromoléculas.
El metabolismo está organizado en rutas vías metabólicas, que son reacciones
enzimáticas consecutivas que generan productos específicos.
Se puede subdividir en 2 categorías:
 Catabolismo: conjunto de reacciones en las que se degrada y se libera energía.
Se degradan los nutrientes con elevado contenido energético (carbohidratos,
grasas, proteínas) y se obtienen productos con menor contenido energético (co2,
h20, nh3)
 Anabolismo: conjunto de reacciones en las que se realiza una biosíntesis y
requiere energía. Se sintetizan moléculas precursoras (aa, azucares, a.grasos,
bases nitrogenadas) y dan lugar a macromoléculas celulares (proteínas,
polisacáridos, lípidos, y a.nucleicos)
La relación entre ambas es que el catabolismo da energía al anabolismo.

1.1Características comunes a todos los tipos de metabolismo

  Divisa energética común: la moneda energética común en todos los
metabolismos: ATP
 Pocos tipos de reacciones: redox, hidratación, deshidratación, fosforilación.
 Numero limitado de intermediarios que se repiten (acetil CoA), hay metabolitos
intermediarios comunes a todos.
 Comparten mecanismos de regulación mediante enzimas alostéricas y por
modificación covalente por fosforilación.

1.2Características de las rutas metabólicas

Son rutas bioquímicas que son secuenciadas por reacciones enzimáticas
 Son irreversibles: al menos uno de los pasos debe darse por enzimas distintas en
dirección anabólica y catabólica. Así se puede regular haciendo que se degrade o
sintetice más o menos. Ej: la degradación de la glucosa: glucolisis, y la síntesis
es la glucogénesis. Estas 2 tienen lugar en el citosol y comparten 7 reacc las
cuales son reversibles. Pero otras 3 diferentes, tiene lugar con diferentes
enzimas, gracias a esto podemos controlar de modo diferente cada una.
 Contienen una etapa limitante: termodinámicamente muy favorable. Etapa
limitante. La velocidad es + lenta en esta etapa, por lo que la va a limitar.
 Están reguladas: control de la velocidad de la etapa limitante por enzimas
reguladoras.
 Localización específica en la célula: mantenimiento de diferentes
concentraciones de metabolitos en distintos comportamientos celulares.

1.2.1Regulación en rutas metabólicas

Necesarias para:
 Adaptar la velocidad de cada vía a las necesidades de la célula
  Evitar que las rutas de síntesis y degradación se produzcan al unísono. No se
puede necesitar y tener en exceso una proteína.
Mecanismos que sigue:
 Regulación por cambios en la cantidad de enzima:
o Síntesis
o Degradación
 Regulación de eficiencia catalítica:
o Unión de ligandos:
 Covalente (fosforilación)
 No covalente: enzimas alostéricas

2. Termodinámica
El catabolismo y el anabolismo están relacionado (a nivel energético) ya que el
catabolismo es el que aporta la energía necesaria para las reacciones llevadas a
cabo en rutas anabólicas
La biomecánica: estudia las transformaciones energéticas que curren en los seres
vivos.
Energía libre de Gibbs: es la cantidad de energía de un sistema para realizar un
trabajo útil.

Condiciones biológicas:
 Tª = 25ºC
 P = 1atm
 [Reactivos] y [Productos] = 1M
 pH = 7
En una ruta metabólica nos vamos a encontrar reacciones exergónicas y endergónicas,
pero como el incremento de energía total es la suma de energías libres de cada ruta, solo
nos importa la energía libre total, no la de cada ruta. Entonces las reacciones
exergónicas espontaneas se acoplan a reacciones endergónicas para que estas tengan
lugar
Glucosa→ Glucosa 6P ∆Gº= 18.6 (ambas relacionadas y como ejemplo de antes)
ATP→ ADP+Pi ∆Gº= -30.5
Expresan el sentido en el que ocurre la reacción y el punto de equilibrio.
2.1La oxidación de compuestos reducidos produce energía
En el metabolismo vamos a oxidar compuestos
reducidos hacia compuestos oxidados. Esto es así
porque los comp reducidos tienen un elevado contenido
de energía libre, por tanto, al oxidarlos desprenden
mucha energía que es almacenada. Vamos a degradar esos compuestos reducidos
(oxidarlos) hacia CO2 y H20. Así vamos a almacenar la energía útil desprendida en
forma de energía química inherente a los enlaces covalentes de los grupos fosfato de los
nucleótidos trifosfato.
compuestos ricos en energía, ATP.
En el catabolismo se van a degradar los comp produciendo mucho ATP, el cual vamos a
emplear en el anabolismo y el trabajo biológico. Cada vez que hidrolizamos el ATP (se
quita un fosfato), disminuye la cantidad de cargas (al haber un P menos, hay menos
cargas – y por tanto es + estable): al ser más estable desprende más energía

Otros compuestos ricos en energía

2.1.1Modos de síntesis de ATP hay 2 modos

1. Fosforilación a nivel de sustrato: se transfiere un fosfato y la propia reacción
genera ATP
2. Fosforilación oxidativa es la mayor fuente de ATP
2.1.2 Oxidorreducción biológica
El flujo de electrones en las reacciones de oxidorreducción es responsable,
directa o indirectamente, de todo el trabajo realizado por los organismos vivos.
Como la batería para arrancar el motor del coche que, en nuestro caso, la batería
seria la comida.
La cadena de transporte electrónico necesita si o si oxígeno (aceptor de e-) La fuente de
electrones en los organismos vivos:
 Organismos fotosintéticos: es una especie química excitada por la luz.
 Organismos no fotosintéticos: compuestos reducidos, alimentos.
Las reacciones de óxido-reducción se basan en que hay dos compuestos, uno que se
reduce (gana e-) y es el oxidante; y otro que se oxida (pierde e-) y es el reductor.
 Potencial de reducción (E): la tendencia que tiene un reductor para ceder
electrones. Los electrones van desde niveles bajos de Eº a niveles más altos
de Eº
∆Eº = Eº (aceptor e-) – Eº (donador e-)
El flujo de electrones produce una energía libre (G) capaz e realizar un
trabajo útil. ∆G y ∆Eº son proporcionales.

Cuando los electrones van de niveles bajos de Eº a niveles más altos, el

incremento de Eº va a ser positivo, por lo que la G va a ser negativa, lo que
significa que va a ser una reacción espontánea.
En la degradación de grasas lo que hacemos es oxidar esa molécula para
producir moléculas de CO2 y H2O, ya que, a los compuestos principales
de las grasas, H y C, les añadimos O2, oxidación.

2.1.3 Transportadores de electrones hay varios tipos

Coenzimas hidrosolubles: tenemos el NAD+ y NADP+ (coenzimas de enzimas

deshidrogenasas) se unen mediante enlaces no covalentes a la enzima. Y el FMN y
FAD son grupos prostéticos que se unen fuertemente a Flavoproteínas.
Quinonas: transporte en medio no acuoso (membranas), los principales son la
ubiquinona, el CoQ, el Q y la plastoquinona.
N
Citocromos: Proteínas con grupo prostético hemo o
Proteínas ferro sulfuradas: Proteínas con Fe asociado a átomos de S.
Átomos con capacidad de ceder electrones.

En una ruta metabólica se oxida una molécula de glucosa que transfiere sus
electores a una molécula aceptora final. Este proceso no es directo, los
electrones van pasando de una molécula a otra de forma que todos los
carbonos de la glucosa pierden todos sus electrones posibles hasta que se
 llega al CO2. Estos electrones son captados por moléculas que se van
reduciendo.
2.1.3Principales coenzimas transportadoras de electrones
Las proteínas transportadoras de e- son
 NAD+ y NADP+: son cofactores móviles y generan NADH+. El NAD
y NADH están principalmente en las reacc catabólicas (oxidaciones) y
el NAD+ y NADP+ en las anabólicas. En el citosol se encuentra en
mayor cantidad el NAD+ que NADH que se comporta como dado en el
catabolismo, Además también hay mas NADPH que NADP debido
esto se comporta cediendo e- durante el anabolismo
 FAD y FMN son capaces de captar y ceder e-. Pueden captar un primer
e- y quedar como una semiquinona y después captar un segundo e- y
quedar totalmente reducido. Por tanto, el NAD cede los 2 e- a la vez,
pero estos solo pueden hacerlo de uno en uno y el citocromo C igual
(uno en uno)

3.Visión general del

metabolismo

N
o

Separamos el metabolismo en etapas:

 Digestión y degradación de macromoléculas: degradamos las proteínas en aa, los
polisacáridos en glucosa y otros azucares y las grasas en a. grasos y glicerol.
Esto se lleva a cabo mediante la hidrólisis enzimática. En esta etapa se
encuentran rutas metabólicas muy importantes como la degradación del
glucógeno o glucogenólisis
  Degradación todos los monómeros los degradamos a comp + oxidados y
finalmente van a quedar intermediarios como el acetilCoA. En esta etapa se
pueden destacar varias rutas metabólicas: glucolisis y degradación de los
a.grasos (beta oxidación)
 Degradamos la acetilCoA en el ciclo de Krebs todos los e- que se general se
pasan a la cadena de transporte electrónico para producir ATP, lo cual es una de
las principales finalidades del catabolismo. En cambio, en las anteriores etapas,
el objetivo principal es la degradación de las mol complejas a otras + sencillas
4Localización del metabolismo
En las células eucariotas, la existencia de diferentes orgánulos y compartimientos
intracelulares permite la distribución espacial de las diferentes rutas metabólicas.
 Citosol: glucolisis, gluconeogénesis, síntesis de a.grasos y fermentaciones
 Mitocondria: ciclo de Krebs, fosforilación oxidativa
 Ribosoma: síntesis de proteínas
 Retículo endoplasmático liso: síntesis de lípidos
 Retículo endoplasmático rugoso: síntesis y maduración de proteínas