TEMA 11.

PRODUCTOS NATURALES MARINOS

Y
SU FUNCIÓN BIOLÓGICA

11.1. Transferencia de metabolitos en ecosistemas marinos

11.2. Biogénesis: Coenzimas

11.3. Biogénesis: Oxigenasas. Haloperoxidasas

 11.1. TRANSFERENCIA DE METABOLITOS EN ECOSISTEMAS MARINOS

¿Qué especie ha producido originalmente un determinado metabolito?

Océano: ecosistema complejo donde los organismos se encuentran en dependencia mutua

Grandes productores
Simbiosis
de metabolitos 2arios Formas de transporte Asociación
Cadena alimenticia
11.1. TRANSFERENCIA DE METABOLITOS EN ECOSISTEMAS MARINOS

FUGU (Japón)

pufferfish

tetrodotoxina
 11.1. TRANSFERENCIA DE METABOLITOS EN ECOSISTEMAS MARINOS

FUGU (Japón)

Pseudomonas sp. pufferfish

Shewanella algae tetrodotoxina triggerfish

bacterias - algas - cefalópodos - peces

Hapalochlaena maculosa ocean sunfish

 11.1. TRANSFERENCIA DE METABOLITOS EN ECOSISTEMAS MARINOS

algas - opistobranquios

Lyngbya majuscula Stylocheilus longicauda

(cianobacteria, blue-green algae) (molusco)
 11.1. TRANSFERENCIA DE METABOLITOS EN ECOSISTEMAS MARINOS

Modificación química de metabolitos secundarios a formas menos tóxicas

Laurencia okamurai laurinterol aplysin Aplysia californica

Laurencia sp. (liebre de mar)

Sarcophyton sp. Ovula ovum

sarcophytoxide 7,8-deoxysarcophytoxide
11.2. BIOGÉNESIS

¿Cómo se construyen los metabolitos secundarios?

tetrodotoxina sarcophytoxide 7,8-deoxysarcophytoxide

Principales rutas biosintéticas de los metabolitos secundarios

COOH

H3C OH O

O O O H3C OH HO P
HO OH O O
O
OH HO OH HO OH OH
ácido siquímico ácido malónico ácido mevalónico 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
Principales rutas biosintéticas de los metabolitos secundarios

Policétidos
11.2. BIOGÉNESIS

¿Qué herramientas son utilizadas para construir los metabolitos 2arios?

Enzimas

serina hidrolasa
TEMA 9.4. Transformaciones biológicas

Reacción de HIDRÓLISIS
vía ataque nucleófilo enzimático

Secuencia de la reacción de hidrólisis de un éster

por una serina hidrolasa. (Fersht, 1985)
11.2. BIOGÉNESIS

¿Qué herramientas son utilizadas para construir los metabolitos 2arios?

Enzimas Cofactores

Zn2+ Mg2+

HOOC NH2
NH2

N
N

S
N N
O

SAM
serina hidrolasa OH OH
11.2. BIOGÉNESIS

Apoenzima (inactiva) + cofactor holoenzima (activa)

Iones esenciales Grupos prostéticos

(K+, Ca2+, Zn2+, Fe3+) (unión covalente)

Coenzimas
(compuestos orgánicos)

Coenzimas
• Reactivos de transferencia de grupos
• Específicas para los grupos químicos que aceptan y donan
• Se deben regenerar ya que sufren cambios químicos
• Muchas vitaminas son precursoras de coenzimas
A continuación, se detallarán las estructuras, funciones y mecanismos de acción
H H O

NH2
Me NH2

O N
O Me
O N
OH O O N
P
O NH2 P P
O OH OH N O O O N N
O O O O
N
P N N OH OH
N
O O OH OH
N N
O
O N O
H FAD
(coenzima de flavina)
OH O O
P
O O
NADPH
(coenzima de nicotinamida)
NH2
HOOC NH2
NH2
N
O O Me Me O O N
N
HS P P N
N N O O O N N
H H O S
O O N
OH N
O

O OH
Coenzima A
O P O OH OH

O SAM (S-adenosilmetionina)
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

NADPH (dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato)

Centro reactivo

H H O Reacciones de reducción

NH2 O HO H

N
O O R R´ R R´
O
P
O NH2
O OH OH
O
N
P N

O O
N N
O
Su vitamina precursora es la niacina o vitamina B3
OH O O
Fueron las primeras coenzimas que se conocieron
P
NADPH O O
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
NADPH (dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato) Reacciones de reducción

H+

Centro reactivo

NADPH
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
NADPH (dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato) Reacciones de reducción

H+

Centro reactivo

NADPH NADP+
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
NADPH (dinucleótido de nicotinamida y adenina fosfato) Reacciones de reducción

Proceso global

oxidación reducción

[NADPH] > [NADP+] transferencia de hidruro

(H-)
TEMA 9.4. Transformaciones biológicas
Reacción de REDUCCIÓN por hidruro nucleofílico H –

Secuencia de reacción para la reducción de un

compuesto carbonílico por una deshidrogenasa.
(Fersht, 1985)
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

FAD (dinucleótido de flavina y adenina)

HO H O
Reacciones de oxidación

R R´ R R´

Alcanos alquenos

Me NH2

Me
N
OH O O N

P P
N O O O N
N
O
O O
N OH OH
N
OH OH
Centro reactivo FAD
O N O
H

Su vitamina precursora es la riboflavina o vitamina B2

11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
FAD (dinucleótido de flavina y adenina) Reacciones de oxidación

Centro reactivo
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
FAD (dinucleótido de flavina y adenina) Reacciones de oxidación

Centro reactivo
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
FAD (dinucleótido de flavina y adenina) Reacciones de oxidación

Proceso global

oxidación reducción
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

Coenzima A (CoA, HS-CoA)

Reacciones de transferencia del grupo acilo R R-CO-CH3

NH2

N
O O Me Me O O N

HS P P
N N O O O N N
H H O O O
OH

Centro reactivo O OH

O P O
Grupo –SH Coenzima A
O

Su vitamina precursora es el Ácido pantoténico o vitamina B5

11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

Coenzima A (CoA, HS-CoA)

Reacciones de transferencia del grupo acilo R R-CO-CH3

NH2

N
O O Me Me O O N

HS P P
N N O O O N N
H H O O O
OH

Centro reactivo O OH

O P O
Grupo –SH Coenzima A
O

1. Grupo acilo se une de manera covalente al –SH formando tioéster

11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

Coenzima A (CoA, HS-CoA)

Reacciones de transferencia del grupo acilo R R-CO-CH3

NH2

N
O O Me Me O O N

S P P
N N O O O N N
H H O
O O
O OH

O OH

O P O
Acetilcoenzima A
O

1. Grupo acilo se une de manera covalente al –SH formando tioéster

O O

2. Reacción de acilación H3C SCoA H3C Nu

Nu-
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

S-adenosilmetionina (SAM)

Reacciones de transferencia del grupo metilo

HOOC NH2
NH2
Centro reactivo
N
N

S
N N
O

OH OH

S-adenosilmetionina

Formada a partir de la reacción del ATP y la metionina

11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

S-adenosilmetionina (SAM)

Reacciones de transferencia del grupo metilo

Formación de grupos

-O-CH3

-C aromático-CH3

Centro reactivo
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

S-adenosilmetionina (SAM)

Reacciones de transferencia del grupo metilo

Formación de grupos

-O-CH3

-C aromático-CH3

Centro reactivo
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS

S-adenosilmetionina (SAM)

Reacciones de transferencia del grupo metilo

Formación de grupos

-O-CH3

-C aromático-CH3

Centro reactivo

-N-CH3
11.2. BIOGÉNESIS: COENZIMAS
En la siguiente tabla se muestran las coenzimas más comunes, junto con los tipos de
reacciones en las que participan y su fuente vitamínica

• NADPH / NADP+ (coenzimas de nicotinamida)

• FAD / FADH2 (coenzimas de flavina)
• Coenzima A (CoA)
• S-Adenosilmetionina (SAM)
11.3. BIOGÉNESIS: GRUPOS PROSTÉTICOS
Oxigenasas, citocromo P450

Reacciones de oxidación (inserción de un átomo de oxígeno)

R-H + O2 + 2H+ R-O-H + H2O + 2e-
P450 es una superfamilia de proteínas

Contienen el grupo hemo

R R

R N R

N Fe3+ N

R N R

R R

Sulfolobus tokodaii P450. J.Inorg.Biochem. 2004, 98, 1194

TEMA 9.4. Transformaciones biológicas

Reacción de OXIDACIÓN

Secuencia de reacción para la oxidación de un

compuesto orgánico RH por citocromo P450.
(Ullrich, 1972; Schlichting, 2000)
 11.3. BIOGÉNESIS: GRUPOS PROSTÉTICOS
Haloperoxidasas

Reacciones de incorporación de un halógeno (reacción de halogenación)

Familia de proteínas R-H + HX + H2O2 R-X + 2H2O

Se conocen 2 tipos de haloperoxidasas marinas

• Vanadium bromoperoxidasas (V)
• Hemo haloperoxidasas (Fe)

T. Teruya, S. Nakagawa, T. Koyama, S. Gao, Q. Wang, C. Chen

H. Arimoto, M. Kita, D. Uemura JACS, 2009, 131, 1410.
Aislada de la esponja Terpios hoshinota Tetrahedron 2004, 60, 6989 University of Texas
Propiedades citotóxicas Nagoya University