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10.3.1. Alcaloides
10.3.2. Péptidos
“Nature has an enormous, almost incomprehensive, capacity for diversity and adaptation”
Daisuke Uemura (Nagoya University), Tetrahedron, 2004, 60, 6969
Metabolitos primarios (carbohidratos, aminoácidos, ácidos grasos, nucleótidos)
2. Son universales. Sus rutas metabólicas son comunes a todos los organismos
Clasificación
OH
OCH3
HO
O
H3C
O H
N quinina
limoneno vanilina
Principales rutas biosintéticas de
los metabolitos secundarios
COOH H3C OH O
HO P
O O
O
OH
HO OH Policétidos 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
OH
ácido siquímico
O O O O H3C OH
HO OH H3C SCoA HO OH
ácido malónico acetil coenzima A ácido mevalónico
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
Terpenos: Familia de compuestos (aprox 30000) cuyo esqueleto carbonado está constituido
por unidades de isopreno
cola cola
CH3
H2C C C CH2 =
H
isopreno cabeza
(2-metil-1,3-butadieno) cabeza
dos unidades de isopreno unidas cabeza-cola
(pueden tener dobles enlaces)
• Clasificación de Terpenos
Clase Unidades de isopreno Número de átomos de carbono
Monoterpeno 2 10
Sesquiterpeno 3 15
Diterpeno 4 20
Sesterpeno 5 25
Triterpeno 6 30
Tetraterpeno 8 40
• Características
Compuestos relativamente volátiles
Responsables de la esencia, del olor de las plantas, frutas (aceites esenciales)
Usados en perfumes, desodorantes, alimentos por sus sabores y olores agradables
H
citronelal limoneno
• En el medio marino
Aislados fundamentalmente en algas aunque también en esponjas, cnidarios
Estructuras novedosas: halógenos (Cl, Br), isocianuro (R-NC)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
NO
isopreno
mirceno
OPP
COOH H3C OH O
HO P
O O
O
OH
HO OH Policétidos 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
OH
ácido siquímico
O O O O H3C OH
HO OH H3C SCoA HO OH
ácido malónico acetil coenzima A ácido mevalónico
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
Biosíntesis de terpenos
O H3C OH
OOC
H3C SCoA OH
acetil coenzima A mevalonato
TERPENOS
OPP
2. Ruta del MEP
pirofosfato de isopentenilo
COOH
O H3C OH O
Ácido pirúvico HO P
O O
O
OH
HOOC 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato
OP (MEP)
OH
Ácido 3-fosfoglicérico
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
Biosíntesis del geraniol
ETAPA 1
ETAPA 2
H2O
OH OPP
Geraniol
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
Biosíntesis del farnesol
ETAPA 1
ETAPA 2
H2O
OH OPP
Geraniol OPP
Pirofosfato de isopentenilo
H2O
OH OPP
Farnesol
Clasifica los siguientes productos naturales e identifica las unidades de isopreno presentes
a) OAc unidades de
Nombre Nº carbonos
isopreno
Monoterpeno 2 10
O
O Sesquiterpeno 3 15
O
O
sesterterpeno Diterpeno 4 20
Fasciospongia cavernosa Sesterpeno 5 25
Triterpeno 6 30
Tetraterpeno 8 40
b) c) d)
Cl
OHC
Cl
OHC
Cl Cl H H
Axisonitrile-1
Axinella cannabina (sponge) Dictyotadial
Dictyota crenulata (brown algae)
e)
Scualene
(shark liver oil)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
unidades de
Nombre Nº carbonos MONOTERPENOS (C10)
isopreno
Monoterpeno 2 10
Sesquiterpeno 3 15
O
OH
Diterpeno 4 20
Sesterpeno 5 25
H
Triterpeno 6 30 Citral
(lemon grass)
Tetraterpeno 8 40
α-Phellandrene Menthol
(eucaliptus) (peppermint)
Cl Cl
Br
Br
OH
Br Cl
OH
Plocamium cartilagineum (red algae) HO
Cl Cl
Cl Cl H
Sesterpeno 5 25
Triterpeno 6 30
Tetraterpeno 8 40
H
OH
α-Selinene COOH
H OH (celery) O
OH Abscisic acid
(plant hormone)
HO Br
H
∆9(12)-capnellane HO
elatol H
Laurencia sp. (red algae)
H
CN
furodysinin Axisonitrile-1
Dysidea herbacea (sponge) Axinella cannabina (sponge)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
unidades de
Nombre Nº carbonos DITERPENOS (C20)
isopreno
Monoterpeno 2 10
Sesquiterpeno 3 15
Diterpeno 4 20 Cembrene
(pine)
Sesterpeno 5 25
Triterpeno 6 30
Tetraterpeno 8 40
OH
Vitamina A
(mammalian tissue and fish oil)
NC
H
H
OHC
H H
CN OHC
HO H
O H
NC
H NC
HO O
HO
Manoalide
Luffariella variabilis (sponge)
OAc
O
O
O
O
sesterterpeno
Fasciospongia cavernosa
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
unidades de
Nombre Nº carbonos TRITERPENOS (C30)
isopreno
OH
H
Monoterpeno 2 10
O
OAc
Sesquiterpeno 3 15 O
Diterpeno 4 20 O OH
O
Sesterpeno 5 25 H H
Triterpeno 6 30
Br
Tetraterpeno 8 40 thyrsiferyl 23-acetate
Laurencia sp. (red algae)
Scualene
(shark liver oil)
TETRATERPENOS (C40)
β-Carotene
(carrot)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
C D CH3
A B CH3 H
H H
anillo esteroide
HO colesterol
escualeno
BIOSÍNTESIS DEL COLESTEROL: Konrad Bloch y Feodor Lynen, Premio Nobel en Fisiología y Medicina en 1964
CH3
CH3
H3C SCoA
HO lanosterol
acetil coenzima A escualeno
H3C CH3
COLESTEROL
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
OH
CH3
CH3
CH3 H
H H
H
O testosterona
HO vitamina D3
OH
CH3
H H
HO estradiol
H H
H O
HO
O
HO 5α,8α-Epidioxysterol O 5α,8α-Epidioxycholest-6-en-3β-ol
O Sinularia sp. (soft coral) Diadema setosum (erizo de mar)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
Carotenos son pigmentos naturales
Colorean el mundo (flores, plantas, frutas, insectos, animales, algas)
una unión cola-cola entre dos unidades C20
Estructuralmente presentan
un sistema de dobles enlaces conjugados
Tetraterpenos C40
β-caroteno (zanahoria)
licopeno (tomates)
10.1. TERPENOS, ESTEROIDES Y CAROTENOIDES
OH
HO
zeaxantina (maiz)
OH
HO O OH mytiloxantin (carotenoide)
Mytilus edulis (mejillon atlantico)
OH
O
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Compuestos fenólicos: Familia de compuestos (aprox. 10000) que contienen un anillo de fenol
OH C1 C2 C3
OH OH OH
fenol
HO
OH O O
lignanos cumarinas
Funciones:
Protección frente a herbívoros o patógenos,
Alelopatía (inhibición del crecimiento de especies vecinas),
Atracción de especies para polinizar,
Absorción de radiación UV, …
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
OH OH OH
OCH3 Cl OCH3
Cl
2,5-diclorofenol (saltamontes)
O H vanilina
eugenol (clavo, nuez moscada)
OH
MeO C15H31
Br
OH
(+)-curcufenol HO
OMe Didiscus flavus (esponja)
hierridin B
Phormidium ectocarpi Br
O
OH
OAc
HO OH
alquilfenol
HO Haminoea callidegenita (molusco) OH urceolatin
polysiphonia urceolata (alga roja)
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
HO
OH
lignanos
HO
OH
OH O
O O
H3CO O O
OCH3
O O
O
HO sesamin (sesamo)
pinoresinol (sesamo, aceite de oliva)
No confundir con lignina, la sustancia orgánica más abundante en plantas después de la celulosa.
Esta posee una estructura polimérica compleja, formada por unidades de compuestos fenólicos.
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Presencia común en plantas superiores pero NO en ALGAS
OMe
OH
HO
OH
HO
sauriol A
OMe
MeO
MeO
O
justicidin B O
O
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Presencia común en plantas superiores pero NO en ALGAS
OMe
OH
HO
OH
HO
sauriol A
OMe
MeO
MeO
O
justicidin B O
O
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Presencia común en plantas superiores pero NO en ALGAS
OMe
OH
HO
OH
HO
sauriol A
OMe
MeO
MeO
O
justicidin B O
O
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Presencia común en plantas superiores pero NO en ALGAS
OMe
OH
HO
OH
MeO
MeO
O
justicidin B O
O
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
HO
HO O O O O O
COOCH3 COOCH2CH3
HO HO
MeO O O
HO O O HO O O osthole
cumarinas
Axinella corrugata (esponja)
Principales rutas biosintéticas de
los metabolitos secundarios
COOH H3C OH O
HO P
O O
O
OH
HO OH Policétidos 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
OH
ácido siquímico
O O O O H3C OH
HO OH H3C SCoA HO OH
ácido malónico acetil coenzima A ácido mevalónico
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Biosíntesis de fenoles
C1 C2
1. Ruta del ácido siquímico
OH OH
NH2
COOH COOH C3
HO O O
HO OH
OH cumarinas
OH R
ácido siquímico R=H, fenilalanina
R=OH, tirosina
HO
OH
lignanos
10.2.1. COMPUESTOS FENÓLICOS: FENOLES, LIGNANOS Y CUMARINAS
Biosíntesis de fenoles
OH
ácido orselinico
O O O O O O O
3
SCoA HO SCoA SEnz
OH O
Nº unidades
ensambladas
HO OH
2,4,6-trihidroxiacetofenona
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Familia de compuestos estructuralmente muy diversa
Biosíntesis: ruta del ácido malónico
Amplio espectro de propiedades biológicas, farmacológicas
Macrólidos: OH O
HO
O
zearalenone
Poliéteres:
HO
CHO
H
H O
O H H
O H O
O H
O O H
O
H O O H
H O
H H H O
H H
Brevetoxina B
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Aislados de organismos terrestres y marinos (dinoflagelados, esponjas, briozoos, tunicados)
Característica estructural: anillo macrocíclico de lactona de 12-16 miembros
Muchos poseen propiedades antibióticas
OH O
HO
O
O
zearalenone
HO OH
O
OH
NMe2 O
HO
O O
O
O
H
O O OMe
HN
OH
OH O
O latrunculin A
eritromicina A S
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Aislados de organismos terrestres y marinos (dinoflagelados, esponjas, briozoos, tunicados)
Característica estructural: anillo macrocíclico de lactona de 12-16 miembros
Muchos poseen propiedades antibióticas
OH O
HO
O
O
zearalenone
HO OH
O
OH
NMe2 O
HO
O O
O
O
O O H
OMe
HN
OH
OH O
eritromicina A O latrunculin A
S
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biotoxinas marinas
“ladder-shaped polyethers”
Biosintetizados por dinoflagelados
HO
CHO
H
H O
O H H
O H O
O H
O O H
O
H O O H
H O
H H H O
H H
Brevetoxina B
O OH
H H
O O
HO
O O O
OH H
O O
OH H
OH
Ácido okadaico
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
¿Qué clase de producto natural es la Halicondrina B?
H H H H
O O
O
H
O H
H O O
O
HO O O O
H H H H H
O
H O O
HO O
O
HO O
Halicondrina B
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
¿Qué clase de producto natural es la Halicondrina B?
H H H H
O O
O
H
O H
H O O
O
HO O O O
H H H H H
O
H O O
HO O
O
HO O
poliéter
Halicondrina B
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
¿Qué clase de producto natural es la Halicondrina B? lactona
H H H H
O O
O
H
O H
H O O
O
HO O O O
H H H H H
O
H O O
HO O
O
HO O
poliéter
Halicondrina B
“Nature has an enormous, almost incomprehensive, capacity for diversity and adaptation”
Daisuke Uemura (Nagoya University), Tetrahedron, 2004, 60, 6969
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
¿Qué clase de producto natural es la Halicondrina B? lactona
H H H H
O O
O
H
O H
H O O
O
HO O O O
H H H H H
O
H O O
HO O
O
HO O
poliéter
Halicondrina B
COOH H3C OH O
HO P
O O
O
OH
HO OH Policétidos 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
OH
ácido siquímico
O O O O H3C OH
HO OH H3C SCoA HO OH
ácido malónico acetil coenzima A ácido mevalónico
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis policétidos
O O O O O O
MACRÓLIDOS
n
SCoA HO SCoA SEnz
n-1 POLIÉTERES
acetil coenzima A malonil-CoA poli-β-ceto ester
Nº unidades Ciclación
ensambladas Oxidación
Reducción
Alquilación
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis zearalenone
O O O
8
SCoA HO SCoA
Nº unidades
ensambladas
OH O
HO
O
zearalenone
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis zearalenone
O O O
O O
O
8
SCoA HO SCoA O
O
O
acetil coenzima A malonil-CoA
O O
Nº unidades
ensambladas
OH O
O SEnz
O OHO
O
HO O
O O
zearalenone
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis zearalenone
O O O
O O
O
8
SCoA HO SCoA O
O
O
acetil coenzima A malonil-CoA
O O
Nº unidades
ensambladas
OH O
O SEnz
O OHO
O
HO O
O O
zearalenone
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis zearalenone
O O O
O O reducción
O
deshidratación
8
SCoA HO SCoA O
O
O
acetil coenzima A malonil-CoA
O O
Nº unidades
ensambladas
OH O
O SEnz
O OHO
O
HO O
O O
zearalenone
10.2.2. POLICÉTIDOS: MACRÓLIDOS Y POLIÉTERES
Biosíntesis zearalenone
O O O
O O reducción
O
deshidratación
8
SCoA HO SCoA O
O
O
acetil coenzima A malonil-CoA
O O
Nº unidades
ensambladas
lactonización
OH O
O SEnz
O OHO
O
HO O
O O
ciclación
zearalenone aromatización
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
Alcaloides: compuestos (aprox. 15000) que poseen un nitrógeno heterocíclico
Poseen propiedades básicas debido al nitrógeno en su estructura
Biosintetizados a partir de diferentes aminoácidos (lisina, ornitina, tirosina, triptófano…)
O O
H2 N
OH H2N OH
NH2 NH2
lisina ornitina
O O
OH OH
NH2 HN NH2
HO
tirosina triptofano
COOH H3C OH O
HO P
O O
O
OH
HO OH Policétidos 2C-metil-D-eritritol 4-fosfato (MEP)
OH
ácido siquímico
O O O O H3C OH
HO OH H3C SCoA HO OH
ácido malónico acetil coenzima A ácido mevalónico
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
H
N O
H2N OH
N
H
NH2
tropano ornitina pirrolidina
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
H
N O
H2N OH
N
H
NH2
tropano ornitina pirrolidina
Br Br
HO
OH
Br N
Br
N CH3
nicotina
O O Br
Br
N
Br N
H
Br
Br
HO Br
N
OH
NH
Polycitone A H 2N Ageladine A
OH (Polysitor sp., tunicate) (Agelas nakamurai, marine sponge)
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
H
N O
H2N OH
N
H
NH2
tropano ornitina pirrolidina
H 3C H 3C
N N
OH OH
O O
atropina hyoscyamine
O O
(Atropa belladonna) (marine Actinomycetes)
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
O
OH
N
NH2
HO
tirosina isoquinolina
HO HO
OMe
NH
MeO HO Me
O H O
OAc S
H O
N Me H
CH3 N Me
HO morfina
N
H3CO
O
O OH
Ecteinascidin 743
O (Ecteinaascidia turbinata, tunicate)
H
H
N
CH3
HO codeína
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
O
OH
N
NH2
HO
tirosina isoquinolina
HO OSO3Na
N O
O NaO3SO
OH
N
H
Schulzeine A OSO3Na
(Penares schulzei, sponge)
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
O
OH
N
NH2
N N
H
indol N triptofano quinolina
H
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
O
OH
N
NH2
N N
H
indol N triptofano quinolina
H
OOC
NH
N
H
Martefragin A
N Martensia fragilis (red alga)
H
O N
N
H N
O O
H Br N N Br
H H
Strychnine Hamacanthin B
(Strychnos nux-vomica) Hamacantha sp. (marine sponge)
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
TIPO DE ALCALOIDE PRECURSOR BIOSINTÉTICO TIPO DE ALCALOIDE
O
OH
N
NH2
N
H N
indol N triptofano quinolina
H
MeO O
HO
N
O
HO N H 3C
Quinine
OH
N (Cinchone tree)
Aaptoline A
Aaptos suberitoides (sponge)
10.3.1. COMPUESTOS NITROGENADOS. ALCALOIDES
Br
Br
N
N
NH2
N H N
N N
H
H 2N
zarzissine
Anchinoe paupertas (sponge) N
N O
(-)-Dibromophakellin
N
Phakellia flabellata (marine sponge)
OH
N
H
N
HO
NH2
styelsamine D clavepictine B
Eusynstyela latericius (ascidia) Clavelina picta (ascidia)
10.3.2. COMPUESTOS NITROGENADOS. PÉPTIDOS
Formados por la unión de aminoácidos mediante un enlace peptídico (–CONH-)
Carácter ácido-base: Biomoléculas anfóteras (COOH, NH2)
Biosíntesis: A partir de los diferentes aminoácidos alifáticos y aromáticos
O O
H2N H2 N
OH OH
R1 R2
H2O
O R2
N terminal C terminal
H2N OH
N
H
R1 O
Enlace peptídico
O N
H H
N N N
N N S
O O O OMe O
Dolastatina 10
(Dolabella auricularia)
GCCSDPRCAWRC*
α-Conotoxina ImI
(Conus imperialis)
10.3.2. COMPUESTOS NITROGENADOS. PÉPTIDOS
Péptidos de origen marino
Aplidina
(Aplidium albicans)
Depsipéptido: Péptido en el que 1 o más de los enlaces amida están reemplazados por enlace éster
O O
R R
R N R O
H