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Tercer parcial
Editorial Pandemial
Disclaimer
El siguiente es un material de estudio generado de manera exclusiva para acompañar la
materia de Biomoléculas en las carreras de la Facultad de Agronomía, Universidad de
Buenos Aires, considerando la falta de acceso a material bibliográfico durante la Pandemia
COVID-19. Para su confección se utilizaron textos disciplinarios de uso universitario.
No copyright
Colophon
Este documento fue compaginado con la ayuda de KOMA-Script y LATEX por medio de la
clase kaobook.
Publisher
Primera edición compilada en Abril 2021 por la Editorial Pandemialde Biomoleculas
Índice general
1.Aminoácidos y Proteínas .................................................................................................................................. 5
1.1. Introducción ......................................................................................................................................... 5
1.2. Clasificación funcional de las proteínas ........................................................................................... 5
1.3. Aminoácidos......................................................................................................................................... 4
1.3.1. Aminoácidos codificables ............................................................................................................. 6
1.3.2. Punto isoeléctrico .......................................................................................................................... 8
1.3.3. Aminoácidos proteicos no codificables .................................................................................... 11
1.4. Unión peptídica: Proteínas ................................................................................................................ 13
1.4.1. Clasificación estructural de las proteínas ................................................................................. 13
1.5. Estructura tridimensional de las proteínas ..................................................................................... 16
1.5.1. Estructura Primaria ..................................................................................................................... 16
1.5.2. Estructura Secundaria................................................................................................................. 18
1.5.3. Estructura Terciaria ..................................................................................................................... 22
1.5.4. Estructura Cuaternaria ............................................................................................................... 33
1.6. Desnaturalización de las proteínas .................................................................................................. 35
1.7. Citoesqueleto ...................................................................................................................................... 37
1.8. Lecturas complementarias ................................................................................................................ 45
1.9. Músculo y contracción muscular ..................................................................................................... 52
1.9.1. Lecturas complementarias ......................................................................................................... 57
2. Nucleótidos y Ácidos nucleicos .................................................................................................................... 60
2.1. Introducción ....................................................................................................................................... 60
2.2. Funciones Biológicas de los Nucleótidos. ....................................................................................... 65
2.2.1. Portadores de energía ................................................................................................................. 65
2.2.2. Mensajeros Químicos secundarios ............................................................................................ 65
2.2.3. Transportadores de móleculas específicas ............................................................................... 66
2.3. Ácidos Nucleicos................................................................................................................................ 70
2.3.1. ARN .............................................................................................................................................. 71
2.3.2. ADN .............................................................................................................................................. 76
2.4. Cromatina, nucleosomas, cromosomas ........................................................................................... 81
2.5. Resumen de Replicación, Transcripción y Traducción desde las Biomoléculas ......................... 82
3. Membrana y mecanismos de transporte ....................................................................................................... 86
3.1. Introducción............................................................................................................................................. 86
3.2. Lípidos de membrana ............................................................................................................................. 87
3.3. Proteínas ................................................................................................................................................... 91
3.3.1. Proteínas integrales transmembrana .......................................................................................... 93
3.3.2. Proteínas integrales ancladas ...................................................................................................... 95
3.3.3. Proteínas periféricas...................................................................................................................... 96
3.4. Hidratos de Carbono componentes de la membrana .......................................................................... 97
3.5. Transporte a través de la Membrana ................................................................................................... 102
3.5.1. Transportes pasivos .................................................................................................................... 103
3.5.2. Transporte Activo........................................................................................................................ 107
3.5.2.1. Proteínas carrier cotransportadoras............................................................................. 108
3.5.2.2. Bombas dependientes de ATP ..................................................................................... 109
3.6. Bioenergética 112
3.6.1. Ejemplos de Acoplamiento quimiosmótico: fase lumínica de la fotosíntesis .................... 117
3.6.2. Acoplamiento quimiosmótico en la Respiración Celular...................................................... 123
Aminoácidos y Proteínas 1
1.1. Introducción
Los aminoácidos son biomoléculas bifuncionales, como su nombre lo indica, ya que contienen
un grupo amino (-NH2) básico y un grupo carboxilo (-COOH) ácido. Su valor como monómeros
para formar los biopolímeros llamados PROTEÍNAS se debe a que pueden asociarse entre sí en
cadenas largas por formación de enlaces amida entre el grupo amino de un aminoácido con el
grupo carboxilo de otro aminoácido. Estos enlaces amida se llaman enlaces peptídicos.
Las cadenas de las proteínas se biosintetizan en las células durante la traducción a partir de la
información contenida en los genes que las codifican.
Las proteínas intervienen en casi todos los procesos que tienen lugar a nivel celular exhibiendo una
interminable cantidad de funciones diferentes. Las proteínas son también muy variadas habiendo
miles de proteínas diferentes en una misma célula.
Las proteínas de los diferentes seres vivos desde bacterias hasta plantas y mamíferos están formadas
por los mismos 20 aminoácidos unidos en secuencias lineales características.
1. Enzimas:
Actúan como catalizadores de las reacciones biológicas, es decir, que no afectan el equilibrio
de la reacción sino que actúan únicamente disminuyendo la energía de activación. Son
usualmente específicas en su acción. Por ejemplo, vimos que la amilasa cataliza la hidrólisis
1 Aminoácidos y Proteínas 2
Las lipoproteínas son complejos macromoleculares compuestos por proteínas y lípidos que
transportan las grasas por todo el organismo. Son esféricas, hidrosolubles, formadas por un
núcleo de lípidos no polares (colesterol esterificado y triglicéridos) cubiertos con una capa
externa polar formada por apoproteínas, fosfolípidos y colesterol libre.
Las apolipoproteínas de las lipoproteínas tienen, entre otras funciones, la de la estabilización
de las moléculas de lípidos como triglicéridos, fosfolípidos, colesterol en un entorno acuoso
como es la sangre. Actúan como una especie de detergente y también sirven como indicadores
del tipo de lipoproteína de que se trata. Los receptores de lipoproteínas de la célula pueden
así identificar a los diferentes tipos de lipoproteínas y dirigir y controlar su metabolismo.
Las más conocidas son la LDL y HDL. La función de las lipoproteínas de baja densidad
(LDL) es transportar colesterol desde el hígado hacia otros tejidos. Cuando hay un exceso de
colesterol, estas moléculas se depositan en la capa íntima arterial donde son retenidas, allí se
oxidan. Las LDL oxidadas son moléculas que favorecen los procesos inflamatorios y atraen a
los macrofagos que captan las LDL oxidadas y se transforman en células espumosas, que son
la base de la placa ateroesclerótica. Las lipoproteínas de alta densidad (HDL) transportan el
colesterol desde los tejidos del cuerpo al hígado, para su excreción.
8. Protección inmune:
Las inmunoglobulinas (anticuerpos) son glicoproteínas del tipo gammaglobulina. Los
anticuerpos circulantes son producidos por linfocitos B que responden específicamente a
un antígeno que puede ser un fragmento de proteína de la cápside viral, por ejemplo. Los
anticuerpos contribuyen a la inmunidad de tres formas distintas: pueden impedir que los
patógenos entren en las células o las dañen al unirse a ellas (neutralización); pueden estimular
la eliminación de un patógeno por los macrófagos y otras células revistiendo al patógeno
(opsonización) y pueden desencadenar la destrucción directa del patógeno estimulando otras
respuestas inmunes como la vía del complemento (lisis).
1 Aminoácidos y Proteínas 4
9. Toxinas:
Un ejemplo es la ricina, una de las toxinas más potentes conocidas que se extrae de las semillas
del ricino (Ricinus communis) y es una fitotoxina con actividad citotóxica. Su estructura consta
de dos cadenas polipeptídicas: una con propiedades de lectina (cadena B) que le permite
fijarse a glicolípidos y glicoproteínas presentes en la superficie de la membrana celular y otra
capaz de inhibir la síntesis de proteínas a nivel de los ribosomas (cadena A).
1.3. Aminoácidos
Existen 20 aminoácidos proteicos codificables que son aquellos que se incorporan a las cadenas
de proteína durante la traducción. Todos ellos son a-aminoácidos, lo que significa que el grupo
amino se encuentra unido al carbono vecino al carboxilo (carbono a). Estos aminoácidos difieren
entre sí en la cadena lateral (grupo R), que varía en su estructura, tamaño y carga eléctrica. A estos
aminoácidos se les asignó un código de 3 letras que es el que vamos a usar.
A excepción del aminoácido glicina (Gly) en donde el carbono a está unido a dos hidrógenos, los
aminoácidos son quirales y pertenecen a la serie L.
1 Aminoácidos y Proteínas 5
Los aminoácidos proteicos no codificables son aquellos que se biosintetizan a partir de los
aminoácidos proteicos codificables una vez que los mismos se han incorporado a la cadena proteica,
es decir, con posterioridad al proceso de traducción. Veremos sus estructuras más adelante.
Los aminoácidos no proteicos no forman parte de las proteínas por lo que ejercen su rol biológico
independientemente. Se pueden dividir en 3 grupos:
Importante: tengan en cuenta que un grupo carboxilo se desprotona y existe como anión a un pH
fisiológico de 7,3 mientras que un grupo amino se protona y existe como catión amonio. Por este
motivo, los aminoácidos existen en solución acuosa en forma de un ion dipolar o zwitterion.
Clasificación estructural
R no polar
R polar sin carga
R polar con carga
Observen que las fórmulas de los aminoácidos que se muestran a continuación son las predominantes
a pH fisiológico y las estructuras se representan como fórmulas de Fischer en cuanto a la ubicación
de los sustituyentes del carbono quiral.
Nueve de estos aminoácidos son esenciales, es decir, que no pueden ser sintetizados por los seres
humanos por lo que deben adquirirse con la dieta. Estos son los marcados con asterisco en las
siguientes figuras.
R no polar
1 Aminoácidos y Proteínas 7
La cisteína puede oxidarse fácilmente para dar una cistina que posee un puente disulfuro, es decir,
una unión covalente S-S. Los puentes disulfuro son muy hidrofóbicos y son fundamentales para la
formación de la estructura tridimensional de muchas proteínas.
La prolina tiene una estructura cíclica que determina un grupo amino secundario que mantiene al
aminoácido en una forma rígida que reduce la flexibilidad estructural de la región del péptido que
la contiene.
Este grupo de aminoácidos es mucho más hidrofílico por la capacidad de los grupos funcionales de
sus R de formar puentes de hidrógeno.
Los aminoácidos más hidrofílicos son aquellos cuyos grupos R tienen carga neta a pH fisiológico. El
aspartato y el glutamato son los dos aminoácidos que tienen carga neta negativa a pH fisiológico.
La lisina y la arginina están cargadas positivamente a pH fisiológico mientras que la histidina, que
posee un grupo imidazol, puede encontrarse cargada positivamente o no cargada a pH fisiológico.
Por este motivo, la histidina facilita numerosas reacciones enzimáticas actuando tanto de donor
como de aceptor de protones. Observen que sólo uno de los nitrógenos del anillo de la histidina es
básico ya que el otro tiene su par electrónico comprometido en la aromaticidad del ciclo.
Para un aminoácido neutro como la alanina se pueden plantear los siguientes equilibrios:
1 Aminoácidos y Proteínas 9
Por lo que podemos ver la siguiente curva de titulación en dos etapas, cada una correspondiente a
una de las reacciones anteriores.
Vemos que a pH muy ácido el aminoácido se encuentra totalmente protonado. Al aumentar el pH,
se llega a un valor en el que la concentración de la forma catiónica y del zwitterion son iguales, este
valor corresponde al pKa del carboxilo. Alrededor de este pH tenemos una solución amortiguada
ya que, al aumentar los equivalentes de base, no se modifica sustancialmente el pH de la solución.
Al aumentar los equivalentes de base, tenemos un cambio brusco de pH en la solución y llegamos
a tener un predominio de la especie neutra, ese es el punto isoeléctrico. Desde este momento
comenzamos una nueva curva de disociación de un ácido, en este caso, el amonio, que se analiza en
forma similar.
Resumiendo:
En el caso de la lisina, para llegar a la especie de carga neta cero es necesario que la misma pierda no
solo el protón del ácido carboxílico, el que se pierde a pH muy ácido (pH 2,2), sino el de uno de los
grupos amonio. Por ser estos ácidos débiles, la concentración de base deberá ser alta para que esto
suceda y el pI es 9,74. No está claro por qué es el grupo amino en a al carboxilo el que se pierde.
Para el glutamato, en cambio, basta con perder solo uno de los protones de un carboxilo para llegar
a la especie neutra y esto sucede a pH bajo, siendo el pI 3,22. En este caso, se deduce que se pierde
el protón del carboxilo del carbono 1, que es más ácido por el efecto atractor de electrones del
nitrógeno que determina que este protón esté más disponible que el del carboxilo del carbono 5.
Estas diferencias de pI pueden aprovecharse para separar los aminoácidos (así como péptidos y
proteínas) utilizando una técnica conocida como electroforesis. En su versión más simple, una
mezcla de aminoácidos se coloca en el centro de una tira de papel o gel que se hunde en un buffer
acuoso a un pH dado y dos electrodos se conectan en los extremos de la tira. Cuando se aplica un
potencial eléctrico, los componentes con carga negativa migran lentamente al electrodo positivo
mientras que los componentes de cargas positivas, lo hacen hacia el electrodo negativo.
1 Aminoácidos y Proteínas 11
Hidroxilación
La 4-hidroxiprolina es un componente fundamental de las glicoproteínas de las paredes
celulares de las plantas, como las extensinas, ya que las cadenas de hidratos de carbono se
unen a la proteína por enlaces O-glicosídicos a este hidroxilo. Tanto la 4-hidroxiprolina como
la 5-hidroxilisina son muy abundantes en el colágeno, proteína del tejido conectivo de los
animales, donde también pueden ser puntos de glicosilación.
1. Metilación
La metilación del grupo amino en C-5 de la lisina de las histonas (proteínas asociadas a ADN
en el nucleosoma) incrementa el radio efectivo de la carga positiva, alterando la interacción
con el ADN y, como consecuencia, la expresión de los genes.
2. Carboxilación
El y-carboxiglutamato se encuentra presente en importantes proteínas relacionadas con el
proceso de coagulación, como la protrombina y está asociado a la interacción de las mismas
con iones Ca2+. En esta modificación del glutamato participa la vitamina K como cofactor
enzimático.
1 Aminoácidos y Proteínas 12
La acetilación en el grupo amino del C-5 (o €-) de las lisinas de las histonas también se
relaciona con la expresión de los genes.
1. Fosforilación
La fosforilación es una modificación postraduccional muy común. Se puede dar en los 3
aminoácidos que poseen un grupo hidroxilo en el grupo R, que son comúnmente fosforilados
por las quinasas en la señalización celular.
1 Aminoácidos y Proteínas 13
La reacción de dos aminoácidos para dar un dipéptido se produce por reacción entre el grupo
carboxilo de un aminoácido y el grupo amino del otro para dar un enlace amida con pérdida de
agua. En los organismos vivos estos enlaces se forman en el ribosoma durante la traducción. En el
laboratorio, no es posible realizar la reacción en forma directa en fase acuosa ya que se obtendría
sólo la sal de amonio correspondiente.
Para formular péptidos resulta conveniente escribir el grupo amino terminal hacia la izquierda y el
grupo carboxilo terminal hacia la derecha.
La longitud de la cadena peptídica es muy variable. Existen pequeños péptidos que tienen gran
importancia biológica, entre ellos, hormonas, toxinas, antibióticos.
Por ejemplo, la oxitocina (9 aminoácidos) estimula las contracciones del útero en el parto. La
a-amanitina es un péptido no ribosomal cíclico de ocho aminoácidos. Es una de las toxinas más
letales, se encuentra en varias especies de hongos, actúa como inhibidor de la ARN polimerasa II.
Muchas proteínas contienen solamente aminoácidos en su estructura, por lo cual se las considera
proteínas simples. En cambio, otras están asociadas a otros componentes y se conocen como
proteínas conjugadas. La parte proteica se conoce como apoproteína, mientras que la no proteica
se conoce como cofactor, si el cofactor está unido covalentemente a la cadena proteica, se lo conoce
como grupo prostético, y en caso de estar unido solo por interacciones intermoleculares, se llama
coenzima. Estos grupos generalmente tienen un rol determinante en la función biológica de la
proteína.
1 Aminoácidos y Proteínas 14
Proteínas simples
La mayoría de las albúminas, como la seroalbúmina, la lactoalbúmina y las albúminas vegetales son
proteínas simples, en cambio, la ovoalbúmina es una fosfoglicoproteína. Son proteínas globulares,
solubles en agua. Las globulinas también se encuentran tanto en vegetales como en animales y la
mayoría son proteínas simples. Son insolubles en agua pero solubles en soluciones salinas. Junto
con la albúmina y el fibrinógeno, son las proteínas que se encuentran en mayor proporción en la
sangre. En los vegetales, las globulinas se encuentran como sustancias de reserva en las semillas.
Las glutelinas y las prolaminas son proteínas exclusivas de los vegetales, en particular, de ciertos
cereales, trigo, cebada, centeno y avena. Son las proteínas constituyentes del gluten que representa
el 80-90 % del total de las proteínas del trigo. El gluten es apreciado por sus cualidades viscoelásticas
únicas que aportan elasticidad a la masa de harina. Sin embargo, presenta bajo valor nutricional
debido a deficiencias en aminoácidos esenciales. El gluten de trigo está formado por las proteínas
llamadas gluteninas (del grupo de las glutelinas) y gliadinas (del grupo de las prolaminas) (90 %),
lípidos (8 %) y carbohidratos (2 %). La gliadina es la fracción del gluten tóxica para las personas
celíacas. Los análogos tóxicos en otros cereales son las hordeínas en la cebada, las secalinas en el
centeno y las aveninas en la avena.
Proteínas conjugadas
2. Hemoproteínas: importante grupo de proteínas que tienen hemo como cofactor, en realidad
son metaloproteínas. El hemo está formado por un ion hierro asociado a un anillo de porfirina.
Ejemplos son la hemoglobina, mioglobina, citocromo c, etc.
1 Aminoácidos y Proteínas 15
3. Lipoproteínas (ya se han visto la LDL y HDL como ejemplos al principio del capítulo).
4. Flavoproteínas: contienen un nucleótido derivado de la vitamina B2, la flavina adenina
dinucleótido (FAD) o flavina mononucleótido (FMN). Actúan como enzimas en reacciones
de óxido-reducción. Un ejemplo es la succinato deshidrogenasa, que se encuentra en la
membrana interna mitocondrial e interviene en el ciclo de Krebs y en la cadena de transporte
de electrones.
5. Glicoproteínas: ya se han mencionado en el tema anterior (hidratos de carbono) las glico-
proteínas de la cara externa de la membrana plasmática y las inmunoproteínas, como la
y-globulina.
6. Fosfoproteínas: proteínas que son fosforiladas con posterioridad a la traducción en ciertos
aminoácidos, como serina, treonina. La fosforilación puede ser en diferentes posiciones
en la misma proteína teniendo distintos efectos sobre su acción biológica. Además, hay
muchas proteínas que son fosforiladas en varias posiciones. Ejemplos son la vitelina, principal
componente de la membrana vitelínica que rodea la yema de huevo, y la caseína, principal
proteína de la leche.
1 Aminoácidos y Proteínas 16
Niveles de organización:
Algunas proteínas están formadas por una sola cadena peptídica mientras que otras están formadas
por dos o más cadenas asociadas entre sí por enlaces no covalentes o covalentes. La composición
en aminoácidos de la cadena también es muy variable y la secuencia en que se encuentran unidos
determina su estructura tridimensional y, en consecuencia, su función biológica, como se verá más
adelante.
Se puede aproximar el número de aminoácidos en una proteína dividiendo el peso molecular por
110. Si bien el promedio de peso molecular de los 20 aminoácidos es 138, los aminoácidos de menor
peso molecular predominan.
Es una estructura rígida, ya que es un híbrido de resonancia entre dos estructuras, una de ellas
implica la presencia de un doble enlace C=N.
Entonces, la configuración de los enlaces C=N es trans, a excepción de la prolina que puede ser cis o
trans.
1 Aminoácidos y Proteínas 18
Describe el arreglo espacial localizado de los átomos que forman la cadena en un sector de la misma,
sin tener en cuenta las cadenas laterales (R), ni sus interacciones con otros segmentos.
Este tipo de estructura se adopta gracias a la formación de enlaces puente de hidrógeno entre los
grupos carbonilo (-CO-) y amino (-NH-) de los carbonos involucrados en los enlaces peptídicos
de aminoácidos cercanos en la cadena.
Hay sólo unas pocas estructuras secundarias muy estables que se encuentran ampliamente dis-
tribuidas en las proteínas. Las más importantes son la a-hélice y la lámina β. Otras estructuras
comunes son los giros β y la hélice del colágeno.
α-Hélice
La cadena polipeptídica se encuentra enroscada alrededor de un eje central longitudinal y los
grupos R se encuentran hacia el exterior de la misma. Del total de aminoácidos presentes en las
proteínas, un cuarto se encuentra formando parte de estas estructuras.
Esta estructura se encuentra estabilizada por formación de enlaces hidrógeno entre el hidrógeno
unido al nitrógeno de una unión peptídica y el átomo de oxígeno electronegativo del cuarto
aminoácido hacia el extremo N-terminal. Cada vuelta de la a-hélice está estabilizada por formación
de 3 o 4 puentes de hidrógeno.
No cualquier polipéptido dará hélices estables. Cada aminoácido tiene una propensión característica
a formar α-hélices, por ejemplo, la Ala tiene la mayor tendencia. Además, es importante la
posición de un aminoácido respecto a los vecinos (ver figura). No habrá varios aminoácidos con R
con la misma carga contiguos y los residuos de Asn, Ser, Thr y Cys que son voluminosos tampoco
tienden a estar contiguos. La Pro no suele aparecer en esta estructura debido a su rigidez ya que el
nitrógeno de la unión glicosídica no tiene hidrógeno. Por otra parte, la Gli es demasiado flexible.
Por último, cada unión peptídica genera un pequeño dipolo producto de la separación de cargas
que se explicó antes (ver estructuras de resonancia), esto determina la existencia de un dipolo en el
segmento de la hélice, que aumenta al aumentar la longitud de la cadena. Hay que tener en cuenta
que los 3 o 4 aminoácidos que se encuentran en los extremos no están completamente
1 Aminoácidos y Proteínas 19
estabilizados por enlaces hidrógeno. Por esto, en general se encuentran varios aminoácidos ácidos
en el extremo amino terminal que estabilizan la carga positiva de este dipolo y viceversa en el
extremo C-terminal.
Lámina β
Se trata de una conformación más extendida de la cadena peptídica en forma de zig-zag. Estas
cadenas pueden disponerse una al lado de la otra formando pliegues estabilizados por formación
de puentes de hidrógeno entre segmentos adyacentes de la cadena peptídica. En general, estos
segmentos están cercanos en la cadena, pero pueden estar más alejados o en cadenas diferentes.
Los grupos R de aminoácidos vecinos salen hacia lados opuestos de la estructura dando un patrón
alternado. Las cadenas sucesivas pueden estar paralelas o antiparalelas, es decir, que los extremos
N- y C-terminales pueden quedar para el mismo lado o para lados opuestos.
Cuando el número de láminas que interactúan de este modo es grande, como veremos en el caso de
la fibroína de la seda, los grupos R de los aminoácidos deben ser pequeños (Gli, Ala).
1 Aminoácidos y Proteínas 20
Esta figura muestra que, en la disposición antiparalela, un aminoácido forma 2 enlaces hidrógeno
con el mismo aminoácido de la cadena vecina, en cambio en la disposición paralela, los puentes de
hidrógeno se forman con dos aminoácidos consecutivos de la cadena opuesta.
La presencia de varias láminas β genera una cierta torsión levógira, producto de la repulsión entre
el oxígeno del carbonilo y los grupos R. Este efecto se conoce como alabeo.
1 Aminoácidos y Proteínas 21
Giros β
En las proteínas globulares con estructuras plegadas compactas (ver más adelante), aproximada-
mente un tercio del total de aminoácidos está formando giros β, en los que la cadena peptídica
cambia de dirección. Es decir, que los giros β conectan segmentos sucesivos de las proteínas con
estructura de α-hélices o plegamientos β, siendo particularmente comunes en la conexión de
láminas β antiparalelas. Se trata de estructuras en las que la cadena da un giro de 180º que involucra
generalmente 4 aminoácidos y están estabilizados por formación de un puente de hidrógeno entre
el carboxilo del primer aminoácido y el hidrógeno del grupo amino del cuarto aminoácido. Gly
y Pro están frecuentemente en estas estructuras, la Gly debido a su flexibilidad y la Pro por la
estabilidad de la configuración cis del enlace peptídico.
En las proteínas globulares (ver más adelante) los giros β se encuentran en la superficie de la
proteína y los aminoácidos centrales pueden formar enlaces hidrógeno con el agua.
Está definida por las interacciones entre los grupos R. Estas interacciones, que pueden darse entre
residuos alejados en la secuencia de la cadena, pueden ser no covalentes o covalentes.
Interacciones no covalentes
1 Aminoácidos y Proteínas 23
Interacciones covalentes
Por medio de estas interacciones, la proteína define su estructura tridimensional, que puede
comprender diferentes tipos de estructuras secundarias separadas por secuencias sin ordenamientos
definidos o giros β.
La estructura globular tiene forma de ovillo, es soluble, y es típica de enzimas, globulinas, albúminas,
hormonas y toxinas. La estructura fibrosa se caracteriza por dar a la proteína forma de filamento y
ser insoluble; ejemplos de proteínas fibrosas son la alfa o la beta-queratina y el colágeno.
Proteínas globulares
La siguiente figura muestra un esquema de una proteína globular en la que se resaltan las principales
características estructurales.
Es importante tener en cuenta que las moléculas de agua unidas a la superficie son parte
fundamental de la estructura terciaria.
1 Aminoácidos y Proteínas 25
Enzimas
Son proteínas que actúan como catalizador para una reacción biológica. Hay ejemplos en los que
pueden acelerar la reacción en un factor de más de 1017, lo que modifica el tiempo de la reacción de
millones de años a milisegundos.
Son muy específicas en su acción. Funcionan por una vía que comprende la formación inicial de un
complejo enzima-sustrato, E . S, una conversión química multietapa de la enzima unida al sustrato
en la enzima unida al producto E . P y la liberación final del producto a partir del complejo.
7. Geometría. La enzima puede ajustar su forma para mantener al sustrato, otros reactivos y
varios sitios catalíticos con la geometría precisa necesaria para la reacción.
8. La envoltura alrededor del sustrato puede crear microambientes especializados que protegen
al sustrato del medio acuoso y pueden cambiar drásticamente el comportamiento ácido-base
de los residuos del sitio activo.
9. Disminuye la energía de los estados de transición de los pasos de la reacción.
1 Aminoácidos y Proteínas 26
Ejemplo: Proteínquinasa, enzima que modifica un sustrato mediante fosforilación. De ese modo,
los sustratos son generalmente activados. La fosforilación consiste en transferir un grupo fosfato
desde el ATP a un sustrato específico, en este caso el hidroxilo de una unidad de Ser. Todas las
quinasas necesitan un ion metálico divalente como el Mg2+ para transferir el grupo fosfato.
1 Aminoácidos y Proteínas 27
Ejemplos:
Estructura cross-linked. Es tan pequeña que carece de centro hidrofóbico o de un gran número de
elementos de estructura secundaria. Está estabilizada por la conexión (cross-link) entre las diferentes
regiones mediante enlaces covalentes.
a) α-Hélice y láminas β antiparalelas. El ion de zinc (verde) está coordinado por dos His y dos Cis.
b) Proteína (azul) conteniendo tres dedos de zinc (verde), complejados con ADN (naranja).
Estructura α-asa-α
Receptor de Ca2+, gracias a cuatro sitios de unión de alta afinidad, de forma reversible. Se asocia a
proteínas diferentes y en su estado de unión a Ca2+ modula sus actividades.
1 Aminoácidos y Proteínas 28
Dominios α / β:
a) Piruvato quinasa. Cada hebra de una hoja beta se conecta a la otra por una alfa hélice. Las hojas β
es hidrofóbicas, que forman un barril β, se encuentran aisladas del solvente por las a hélices.
Predomina para una dada condición la conformación termodinámicamente más estable llamada
PROTEÍNA NATIVA, que viene determinada por su secuencia de aminoácidos y es única. Está
estabilizada por muchísimas interacciones individualmente débiles.
Paradoja de Levinthal
“Debido a los grados de libertad de una cadena polipeptídica, encontrar el estado nativo de una proteína
mediante búsqueda aleatoria entre todas las conformaciones posibles llevaría muchísimo tiempo, mientras que
las proteínas se pliegan en nanosegundos”.
El estado en glóbulo fundido se corresponde con una serie de intermediarios en los que el colapso
hidrofóbico ya ha tenido lugar, pero no se han establecido todas las interacciones entre aminoácidos.
Posteriormente, el glóbulo ha de franquear unas barreras de activación, transformándose en una
serie de intermediarios hasta alcanzar el estado nativo.
1 Aminoácidos y Proteínas 30
El proceso de plegamiento está fuertemente influido por el medio acuoso. Los aminoácidos se
distribuyen asimétricamente, de forma que algunas interacciones se dan en el núcleo y otras en la
superficie.
Parámetros termodinámicos del plegamiento para algunas proteínas globulares a 25ºC en solución
acuosa:
Todas las proteínas poseen una única estructura tridimensional característica que se conoce
como proteína nativa.
Esta estructura tridimensional está determinada por las secuencias de aminoácidos.
La función de una proteína depende de su estructura tridimensional.
La estructura tridimensional de las proteínas está estabilizada por interacciones débiles y
puentes disulfuro.
El estudio de una gran variedad de proteínas permitió reconocer algunos patrones estructurales
comunes (superestructuras secundarias).
1 Aminoácidos y Proteínas 31
Proteínas fibrosas
Son estructurales o motoras. Presentan un solo tipo de estructura secundaria y tienen menor
diversidad en los aminoácidos que las constituyen, entre los que predominan aquellos con R
hidrofóbicos, tanto en el interior como en la superficie, lo que las hace insolubles en agua. Estas
superficies hidrofóbicas están enterradas en gran parte debido a que un gran número de polipéptidos
están empacados dando complejos supramoleculares muy elaborados. Además, son muy resistentes
y/o flexibles.
Las proteínas estructurales pueden estar involucradas en procesos dinámicos. Por ejemplo, actina,
tubulina (que se estudiarán más adelante); otras están diseñadas para permanecer toda la vida del
organismo como la fibroína, las queratinas, las proteínas de la cubierta de un virus. Otros ejemplos
de proteínas estructurales son los más de cien componentes proteicos del ribosoma que estabilizan
el plegamiento del ARN ribosomal.
a-Queratinas
Estas proteínas que se encuentran únicamente en mamíferos han evolucionado para dar fuerza
a las estructuras que forman. Constituyen casi todo el peso seco del cabello, lana, uñas, garras,
plumas, cuernos, pezuñas y gran parte de la capa externa de la piel. Son parte de una familia de
proteínas más amplia llamadas filamentos intermedios, que se encuentran en el citoesqueleto de
las células animales. Son ricas en aminoácidos hidrofóbicos como Ala, Val, Leu, Ileu, Met, Phe. El
entrecruzamiento por formación de puentes disulfuro estabilizan la estructura cuaternaria. En los
cuernos de los rinocerontes, aproximadamente el 18 % de los residuos de las cadenas de a-queratina
son Cis involucradas en la formación de estas uniones covalentes.
β -Queratinas
Cadenas peptídicas con estructura de láminas β. Se conoce como fibroína de la seda y constituye
además las telas de araña, parte de escamas, plumas de aves, etc. Los filamentos son suaves y
flexibles debido a que las láminas se mantienen juntas por interacciones intermoleculares y no
por enlaces covalentes. Estas son los enlaces hidrógeno entre los enlaces peptídicos de las láminas
sucesivas e interacciones dipolares. La seda no se estira debido a que las láminas β ya están muy
extendidas, pero es muy flexible.
1 Aminoácidos y Proteínas 32
Colágeno
Las fibras de colágeno son altamente resistentes. Se encuentran en el tejido conectivo, como en
tendones, cartílagos, la materia orgánica de los huesos, la córnea. Tiene una estructura secundaria
única, una hélice levógira dada por el tipo de aminoácidos que lo constituyen. Tres cadenas
peptídicas forman, a su vez, una estructura de superhélice dextrógira. Las fibras de colágeno se
encuentran unidas entre sí por diferentes tipos de uniones covalentes, que le confieren resistencia a
las fibras, y en algunos casos los aminoácidos que tienen hidroxilos en las cadenas laterales pueden
estar glicosiladas.
Dominios
Módulos estructurales y funcionales con igual o diferente tipo de estructura terciaria dentro de un
mismo polipéptido, estables de manera independiente, y que puede moverse como una entidad
única con respecto al resto de la proteína.
Ejemplos:
Las proteínas estudiadas hasta el momento tienen una sola cadena polipeptídica. Además, existen
proteínas cuya estructura se forma por ensamblado de varias cadenas polipeptídicas asociadas por
interacciones no covalentes o covalentes entre grupos R.
Existen muchos ejemplos muy diferentes, pueden ser dímeros (como vimos al principio del
capítulo, la ricina), trímeros, tetrámeros, multímeros.
Algunos ejemplos:
1 Aminoácidos y Proteínas 34
Las proteínas multiméricas con subunidades idénticas siguen patrones de simetría definidos.
Ejemplos de esto son las proteínas de la cápside viral.
Hay proteínas muy complejas formadas por un número importante de unidades de diferentes tipos,
como la ATPasa, otra proteína integral de membrana, cuyo funcionamiento se verá en detalle más
adelante:
1 Aminoácidos y Proteínas 35
Las proteínas evolucionaron para funcionar en un ambiente determinado en las células. Cambios
en las condiciones del entorno producen variaciones grandes o pequeñas en sus estructuras. Una
pérdida en la estructura tridimensional suficiente como para no poder ejercer su función se conoce
como desnaturalización. Entonces, la desnaturalización se produce por pérdida de la estructura
tridimensional, sin afectar la estructura primaria de la misma.
Desnaturalización irreversible
Agentes físicos:
1. Calor: produce un aumento de la energía cinética. Pérdida estructura terciaria y/o cuaternaria
que afecta la actividad de enzimas. La aplicación de calor afecta la estabilidad de las
interacciones no covalentes. Disminución de solubilidad, provoca floculación de proteína.
Ejemplos: Proteínas de la clara de huevo. Las proteínas pueden también verse afectadas por el
frío.
2. Fuerzas mecánicas: por ejemplo, en el amasado del pan se rompen interacciones
intermoleculares (puentes disulfuro) entre proteínas del gluten y se forman nuevas
interacciones pero con las moléculas más extendidas.
3. Presión: en principio, en una proteína, la formación de puentes hidrógeno, la ruptura de
interacciones hidrofóbicas y la ruptura de interacciones iónicas van acompañadas de una
disminución de volumen, es decir que están favorecidas por un aumento de presión.
Las altas presiones pueden provocar la desnaturalización de proteínas, la disociación de
subunidades de estructuras poliméricas y la gelificación de proteínas, como las del músculo,
huevo y soja. Las uniones covalentes se modifican poco.
Agentes físicos:
1. Alcoholes: Deshidratación por interacción por puentes de hidrógeno con las capas de
hidratación de la proteína.
3. Metales pesados: Se forman las sales de Hg2+, Pb2+, Ag+ Tl+, Cd2+ y otros metales pesados.
1 Aminoácidos y Proteínas 37
1.7. Citoesqueleto
El interior de la célula eucariota no es una masa amorfa y gelatinosa donde están diseminados al
azar el núcleo y el resto de los orgánulos. Por el contrario, posee una organización interna establecida
por una serie de filamentos proteicos que forman un entramado dinámico y se extienden a través del
citoplasma (aunque también los hay intranucleares). A esta matriz proteica fibrosa se la denomina
citoesqueleto. Su función es particularmente importante en las células animales, en las que no existe
una pared celular que dé consistencia a las células. Sin el citoesqueleto la célula se rompería, puesto
que la membrana es básicamente una lámina de grasa. La palabra citoesqueleto puede llevar a
engaño, puesto que no es una estructura inerte que funciona únicamente como andamiaje para dar
soporte a la célula y a sus diferentes estructuras. El citoesqueleto es una estructura muy cambiante,
es decir, a pesar de su nombre, el citoesqueleto no se debe pensar sólo como los “huesos” de las
células, sino también como sus “músculos”. Así, es vital para que las células se puedan mover, para
establecer la forma celular, para la disposición adecuada de los orgánulos, para la comunicación
entre ellos, para los procesos de endocitosis y exocitosis, para la división celular (tanto meiosis,
como mitosis), para resistir presiones mecánicas y reaccionar frente a deformaciones, entre otras
muchas funciones más.
Esquema de la distribución celular de los tres principales componentes del citoesqueleto de una
célula animal. Los filamentos de actina se disponen sobre todo en las proximidades de la membrana,
los microtúbulos adoptan una disposición radial partiendo desde el centrosoma, mientras que
los filamentos intermedios se anclan a complejos de unión de la membrana plasmática y también
aparecen en el interior del núcleo. Hay que tener en cuenta que estas distribuciones pueden variar
según el tipo celular, y es muy diferente en las células vegetales.
1 Aminoácidos y Proteínas 38
Células animales en las que los microtúbulos se muestran en verde, los microfilamentos en rojo y
los núcleos en azul.
Los filamentos estructurales son complejos poliméricos, que varían en tamaño y rigidez y están
formados por un gran número de cadenas proteicas.
positivo, lo que significa que son filamentos polarizados. Esto se debe a la disposición
ordenada de las unidades de actina G en el filamento que se ensamblan manteniendo la misma
orientación. En el extremo positivo ocurre la polimerización, agregando nuevas unidades
de actina G, mientras que en el extremo negativo, la despolimerización (pérdida de actina
G) es más frecuente. El aumento y la disminución en la longitud del microfilamento es
por polimerización y despolimerización, respectivamente. Los filamentos de actina pueden
ensamblarse y desmontarse rápidamente, y esta propiedad les permite jugar un papel
importante en la movilidad celular (ver Lectura Complementaria 2, pág. 46), como el rastreo
de un glóbulo blanco en su sistema inmunológico.
1 Aminoácidos y Proteínas 40
Filamentos intermedios: son los responsables de mantener la integridad celular puesto que
funcionan a modo de cables intracelulares que se sujetan a complejos de unión, como los
desmosomas y los hemidesmosas, lo que permite la cohesión entre células contiguas y por
tanto la cohesión celular. Son especialistas en resistir tensiones mecánicas y deformaciones
celulares. Al contrario que los otros componentes del citoesqueleto, los filamentos intermedios
son polímeros formados por unidades pertenecientes a varias familias de proteínas, entre las
que se encuentran las queratinas, las vicentinas, etcétera (ver Lectura Complementaria 3, pág.
47). Son flexibles y resistentes, dos características importantes para resistir la tensión mecánica.
Se estima que pueden estirarse aproximadamente entre el 250 y el 350 % de la longitud de
reposo, porque los monómeros pueden deslizarse sobre los demás. Los filamentos intermedios
son menos dinámicos que los filamentos de actina o los microtúbulos (ver abajo), pero también
pueden ser despolimerizados y polimerizados nuevamente en algunas circunstancias, como
durante el movimiento celular, la división celular y cuando las fuerzas mecánicas de las células
cambian de dirección. Comúnmente trabajan en tándem con microtúbulos, proporcionando
resistencia y soporte para las estructuras frágiles de tubulina. Tienen un diámetro externo de
aproximadamente 10 nm.
Los microtúbulos, como los filamentos de actina, son estructuras dinámicas: pueden crecer y
contraerse rápidamente mediante la adición o eliminación de las unidades de tubulina. Al
igual que los filamentos de actina, los microtúbulos tienen direccionalidad, lo que significa
que tienen dos extremos que son estructuralmente diferentes entre sí: un extremo crece más
rápidamente y se llama el extremo positivo, mientras que el otro extremo se conoce como el
extremo negativo. En las células, los extremos negativos de los microtúbulos están anclados
en estructuras llamadas centros de organización de microtúbulos (MTOC). El MTOC primario
en una célula animal se denomina centrosoma y, por lo general, se encuentra adyacente al
núcleo (ver Lectura Complementaria 8, pág. 49).
Los microtúbulos tienden a crecer desde el centrosoma hacia la membrana plasmática. En las
células que no se dividen, las redes de microtúbulos se irradian desde el centrosoma para
proporcionar la organización básica del citoplasma, incluido el posicionamiento de orgánulos.
Tanto los filamentos de actina como los microtúbulos necesitan la ayuda de unas proteínas
denominadas motoras para llevar a cabo sus funciones, que se comportan como los motores capaces
de crear movimiento, cualquiera que éste sea. Estas proteínas arrastran cargas siguiendo la senda
de los filamentos de actina o de los microtúbulos.
Las proteínas motoras mueven moléculas, vesículas, e incluso organelas (ver Lectura
Complementaria 9, pág. 50) alrededor de la célula. Hay tres grupos principales, todas ellas
utilizan de manera eficiente por el trifosfato de adenosina (ATP) como “combustible”:
Miosinas: estas son proteínas motoras de los filamentos de actina y se mueven hacia el extremo
positivo del mismo. Pueden formar filamentos, y son las responsables de la contracción celular.
Estas proteínas poseen una estructura molecular con dos dominios globulares y un dominio de
cola. Los dominios globulares se unen a ATP y lo hidrolizan, generan el movimiento e interactúan
directamente con los filamentos estructurales. La hidrólisis de ATP en la parte globular conduce a
cambios conformacionales de estas proteínas, permitiendo su movimiento a lo largo del filamento
(ver Lectura Complementaria 9, pág. 50).
Aunque no son homólogas, la miosina y la kinesina comparten una organización estructural similar,
con dominios de cabeza globular y dominios de cola alargados. La cabeza que se une al citoesqueleto,
contiene el sitio de enlace de ATP y produce la fuerza. El dominio de la cola es responsable de
enlazar la carga específica. La dineina tiene su dominio de enlace de ATP en el medio, con dominios
de enlace de carga y de enlace de microtúbulos que emergen como proyecciones. La fuerza se genera
en el dominio central y actúa para rotar una proyección en relación con la otra.
1 Aminoácidos y Proteínas 43
Citoesqueleto en plantas:
Esquema que muestra el tráfico de organelas asociado a las fibras de actina (rojo) y miosina XI.
La direccionalidad de las microfibrillas de celulosa en la pared celular está dada por los microtúbulos
del citoesqueleto que se encuentran en la cara interna de la membrana celular.
1 Aminoácidos y Proteínas 44
Lectura complementaria 1
Movimiento celular:
Las células no nadan, se arrastran a través de los tejidos, como lo hacen, por ejemplo, las células
embrionarias durante el desarrollo, las amebas cuando se mueven, los linfocitos cuando se dirigen
hacia los tejidos dañados y el cono de crecimiento de las neuronas cuando buscan sus objetivos. Para
el movimiento de la célula, se requieren varios pasos: producción y extensión de las protuberancias
citoplásmicas, adhesión de estas protuberancias a algunos elementos del entorno y arrastre el
resto de la celda hacia estos puntos de anclaje. Las protuberancias celulares se conocen como
podia, lamelipodios cuando son similares a una lámina, filopodios cuando son delgados y largos,
y lobopodios cuando son gruesos y tubulares. Se sabe que es la polimerización de la actina
lo que empuja la membrana plasmática hacia afuera y forma las protuberancias. Cuando estas
protuberancias hacen contacto físico con un elemento extracelular, ya sea moléculas de matriz
extracelular u otra célula, las proteínas de adhesión ubicadas en la membrana plasmática establecen
puntos de anclaje. Una vez que la célula hace un contacto de adhesión, los filamentos de actina
intracelular, junto con la proteína motora miosina, ayudan a mover todo el contenido intracelular
hacia los puntos de anclaje
1 Aminoácidos y Proteínas 46
Lectura complementaria 2
(A) En una célula, la motilidad se inicia por un saliente dependiente de la actina del borde anterior
de la célula, que se compone de estructuras similares a brazos llamadas lamellipodia y filopodia.
Estas estructuras sobresalientes contienen filamentos de actina, con extremos de púas alargados
orientados hacia la membrana plasmática.
(B) Durante la extensión del brazo celular, la membrana plasmática se adhiere a la superficie en el
borde anterior.
(C) A continuación, el núcleo y el cuerpo celular son empujados hacia adelante a través de las
fuerzas de contracción intracelular mediadas por las fibras de estrés.
(D) Luego, las fibras de retracción tiran de la parte posterior de la celda hacia adelante.
1 Aminoácidos y Proteínas 47
Lectura complementaria 3
Los filamentos intermedios se dividen en cuatro familias: a) filamentos de queratina en las células
epiteliales, b) vimentina y otros filamentos relacionados en las células del tejido conjuntivo, células
musculares y neuronas, c) neurofilamentos en las neuronas y d) filamentos formadores de la lámina
nuclear. La familia de queratinas es la más diversa, por lo que diferentes epitelios expresan diferentes
filamentos de queratina. También hay diferentes tipos de queratina en el cabello, las plumas y las
uñas. Además, los filamentos de queratina se componen de diferentes combinaciones de monómeros
de queratina. La epidermolisis bullosa simplex es una patología causada por la mutación genética que
afecta a los filamentos de queratina. Da lugar a lesiones con ampollas en la piel y en las capas de
la mucosa debido a la débil resistencia de la piel al estrés mecánico, porque las células no están
fuertemente unidas entre sí. Esta es una de las 75 patologías humanas asociadas a alteraciones en
los filamentos intermedios. También hay miopatías, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de
Parkinson, cataratas oculares, etcétera.
Lectura complementaria 4
Enfermedad de Alzheimer:
Los microtúbulos encontrados en las células nerviosas están asociados a proteínas denominadas tau.
En células sanas, estas proteínas están unidas al exterior de los microtúbulos. Además de regularlos,
aumentan, tanto la estabilidad, como la rigidez de los microtúbulos, pero reducen su flexibilidad.
En la enfermedad de Alzheimer y en otras demencias, se pierden los microtúbulos de los axones
neuronales y hay un aumento en los filamentos enredados no organizados por la proteína tau.
Lectura complementaria 5
Los flagelos son estructuras largas, como pelos, que se extienden desde la superficie celular y
se usan para mover una célula completa, como un espermatozoide. Si una célula tiene flagelos,
generalmente tiene uno o solo algunos. Los cilios son similares, pero son más cortos y generalmente
aparecen en grandes números en la superficie de la célula. Cuando las células con cilios móviles
forman tejidos, el movimiento de éstos ayuda a mover los materiales a través de la superficie del
tejido. Por ejemplo, los cilios de las células del sistema respiratorio superior ayudan a mover el
polvo y las partículas hacia las fosas nasales.
A pesar de su diferencia en longitud y número, los flagelos y los cilios comparten un patrón
estructural común. En la mayoría de los flagelos y cilios móviles, hay 9 pares de microtúbulos
dispuestos en un círculo, junto con otros dos microtúbulos en el centro del anillo. Esta disposición
se llama una matriz 9 + 2.
Estructura del cilio y del flagelo: Son extensiones de la célula y limitadas por la membrana plasmática.
Tienen microtúbulos que van a lo largo del cilio o del flagelo.
1 Aminoácidos y Proteínas 49
Lectura complementaria 6
Lectura complementaria 8
Un centríolo es un cilindro de nueve tripletes de microtúbulos, unidos por proteínas de apoyo. Los
centríolos son mejor conocidos por su papel en los centrosomas, estructuras que actúan como centros
de organización de microtúbulos en células animales. Un centrosoma consiste en dos centríolos
orientados en ángulo recto entre sí, rodeados por una masa proteica de "material pericentriolar",
que proporciona sitios de anclaje para microtúbulos.
Imagen de un centrosoma. El centrosoma contiene dos centriolos colocados en ángulos rectos entre
sí.
1 Aminoácidos y Proteínas 50
Lectura complementaria 9
En esta figura, la dineína desliza una organela hacia el extremo negativo de un microtúbulo. La
kinesina desliza un microtúbulo hacia el extremo positivo de un microtúbulo.
Los desmosomas son estructuras celulares que mantienen adheridas a células vecinas. Estructural-
mente dicha unión está mediada por cadherinas a sus filamentos intermedios (queratina). En el
interior de las células actúan como lugares de anclaje para los filamentos intermedios en forma de
cuerda, los cuales forman una red estructural en el citoplasma proporcionando una cierta rigidez.
Mediante estas uniones los filamentos intermedios de las células adyacentes están indirectamente
conectados formando una red continua que se extiende a todo el tejido.
La estructura general de los desmosomas consta de una placa citoplasmática densa, compuesta
por un complejo proteico de anclaje intracelular que es el responsable de la unión de los elementos
citoesqueléticos a las proteínas de unión transmembrana. Los desmosomas generan una barrera
entre citoplasmas con las células vecinas; permiten además que exista cierto movimiento en común
entre las células adyacentes que están unidas mediante ellos. Los desmosomas tienen mucha
importancia en el sistema inmunitario innato, pues permite establecer uniones muy resistentes
evitando la separación de las células epiteliales por acción mecánica o por presión. Así la piel se ha
convertido en una barrera mecánica de protección.
1 Aminoácidos y Proteínas 51
Los hemidesmosomas son estructuras de unión celular que conectan las células epiteliales a la
membrana basal. Son especialmente importantes en los tejidos sometidos a tensión mecánica.
Aunque guardan algunas similitudes con los desmosomas, su función es diferente. El desmosoma
une una célula con la vecina, mientras que el hemidesmosona une la célula con la matriz extracelular
(relacione con el ejemplo de fibroblastos en la teórica).
SARCÓMERO
Cuando las células musculares se ven bajo el microscopio, se puede observar que contienen un
patrón de rayas (estrías). Este patrón está formado por una serie de unidades básicas llamadas
sarcómeros, constituidos por filamentos proteicos del citoesqueleto dispuestos en un patrón apilado
a lo largo del tejido muscular. Puede haber miles de sarcómeros dentro de una sola célula muscular.
Un sarcómero individual contiene muchos filamentos de actina paralelos (filamento delgado) y
miosina (filamento grueso). La interacción entre las proteínas miosina y actina es el núcleo de
nuestra comprensión actual del acortamiento del sarcómero.
Vista de un músculo de la pantorrilla de un ratón bajo un microscopio. Los sarcómeros están teñidos
de verde y aparecen como rayas horizontales apiladas de longitudes similares. (Barra de escala
blanca = 25 micras).
La región donde se superponen los filamentos gruesos y delgados tiene un aspecto denso, debido a
que hay poco espacio entre los mismos. Esta zona es muy importante para la contracción muscular, ya
que es el sitio donde comienza el movimiento del filamento. Los filamentos delgados, anclados en sus
extremos por los discos Z, no se extienden completamente hacia la región central, que solo contiene
filamentos gruesos, anclados en sus bases en un punto llamado la línea M. Una miofibrilla está
compuesta por muchos sarcómeros dispuestos longitudinalmente. Así, las miofibrillas y las células
musculares se contraen a medida que los sarcómeros se contraen (ver Lectura Complementaria 2,
pág. 58).
1 Aminoácidos y Proteínas 53
Actina y Calcio
A lo largo de su estructura, los filamentos de actina poseen sitios de unión a las cabezas de miosina
que en reposo están cubiertos por otra proteína: la tropomiosina. Ambos forman un complejo que
está estabilizado por la troponina, que a su vez tiene 3 dominios: dominio C (que se une al Ca2+
liberado del retículo sarcoplásmico), dominio T (que se une a la tropomiosina) y dominio I (que se
une a la actina).
Cuando la señal nerviosa ha llegado al músculo y éste ha liberado Ca2+, el ión se une a la troponina
C, lo que causa un cambio conformacional que retrae la tropomiosina, exponiendo los sitios de
unión de la actina. Entonces, la actina está lista para el proceso.
Miosina y ATP
Las moléculas de miosina se unen formando filamentos gruesos, dejando expuestas sus cabezas
hacia la parte externa del filamento (ver Lectura Complementaria 3, pág. 58). Estas cabezas poseen
actividad de ATPasa, por lo que aquí se unirá el ATP liberado de las mitocondrias y entrarán en
contacto con los sitios activos de la actina (a esta unión se la denomina “puente cruzado”).
La cabeza de miosina recibe una molécula de ATP y la escinde en ADP y Pi, y, sin liberar estos
productos, se mantiene erguida. Las cabezas de miosina en este estado se unen con avidez a los
sitios activos de la actina. Entonces se libera ADP y Pi y ocurre otro cambio conformacional para
retraer las cabezas de miosina arrastrando consigo el filamento de actina y acortando el sarcómero.
Hasta aquí, el músculo está contraído y no se relajará a menos que una nueva molécula de ATP se
una y permita que la cabeza de miosina vuelva a estar erguida. Esto se repite a lo largo de todos los
filamentos y cabezas, permitiendo que, por repetidos movimientos, se termine acortando todo el
sarcómero.
1 Aminoácidos y Proteínas 55
Contracción del músculo esquelético. (a) El sitio activo de la actina se expone cuando el calcio se une a
la troponina. (b) La cabeza de la miosina es atraída por la actina, y la miosina se une a la actina
en su sitio de unión, formando el puente cruzado. (c) Durante el golpe de potencia, se libera el
fosfato generado en el ciclo de contracción anterior. Esto hace que la cabeza de miosina gire hacia el
centro del sarcómero, después de lo cual, se liberan el ADP y el fosfato adjuntos. (d) Una nueva
molécula de ATP se adhiere a la cabeza de miosina, haciendo que el puente cruzado se desprenda.
(e) La cabeza de miosina hidroliza ATP a ADP y fosfato, lo que devuelve la miosina a la posición
amartillada.
La secuencia de eventos que resultan en la contracción de una fibra muscular individual comienza
con una señal, el neurotransmisor, ACh (Acetilcolina), de la neurona motora que inerva esa fibra.
La membrana local de la fibra se despolarizará a medida que entren iones de sodio cargados
positivamente (Na+), lo que desencadenará un potencial de acción que se extenderá al resto de la
membrana, que se despolarizará, incluyendo los túbulos-T (ver Lectura Complementaria 4, pág.
59). Esto desencadena la liberación de iones de calcio (Ca2+) del almacenamiento en el retículo
sarcoplásmico (RS) por medio de canales dependientes de voltaje que posee su membrana (ver
Lectura Complementaria 5, pág. 59). El Ca2+ entonces inicia la contracción, que es sostenida por
ATP. Mientras los iones Ca2+ permanezcan en el sarcoplasma (citoplasma de célula muscular) para
unirse a la troponina, lo que mantiene los sitios de unión a la actina "sin protección", y siempre
que haya ATP disponible para impulsar el ciclo del puente cruzado y la tracción de las cadenas de
actina por la miosina, la célula muscular continuará acortándose hasta un límite anatómico.
1 Aminoácidos y Proteínas 56
El rigor mortis que se produce inicialmente en los cadáveres consiste en una rigidez muscular
temporal causada por la ausencia de ATP, necesario para que la miosina se libere de la actina. Sin
él, todo el músculo permanece rígido y contraído, al menos hasta que la propia desnaturalización
de las proteínas destruya las estructuras y se pierda la contracción.
Lectura complementaria 1
Lectura complementaria 2
Una analogía para los filamentos deslizantes en un evento de acortamiento del sarcómero:
Imaginá que estás parado entre dos estanterías grandes cargadas de libros. Estas estanterías grandes
están separadas por varios metros y están colocadas sobre rieles para que se puedan mover
fácilmente. Se te asigna la tarea de juntar las dos estanterías, pero estás limitado a usar solo tus
brazos y dos cuerdas. De pie, centrados entre las estanterías, tirás de las dos cuerdas, una por brazo,
que se atan firmemente a cada estantería. De forma repetitiva, tirás cada cuerda hacia vos, la sujetas
y luego tiras de nuevo. Finalmente, a medida que avanzás a lo largo de la cuerda, las estanterías
se mueven juntas y se acercan a ti. En este ejemplo, tus brazos son similares a las moléculas de
miosina, las cuerdas son los filamentos de actina y los estantes para libros son los discos z a los que
se sujeta la actina, que forman los extremos laterales de un sarcómero. De manera similar a como te
mantendrías centrado entre los estantes, los filamentos de miosina permanecen centrados durante
la contracción muscular normal.
Lectura complementaria 3
1 Aminoácidos y Proteínas 59
Lectura complementaria 4
Lectura complementaria 5
En este grupo de biomoléculas volvemos a encontrar la presencia de monómeros (en este caso, los
nucleótidos) que pueden cumplir ciertas funciones en forma individual, también como dímeros, o
bien combinarse para originar polímeros (los ácidos nucleicos: ARN y ADN).
Entre las funciones que veremos para los nucleótidos (solos o como dímeros) se incluyen: portadores
de energía, cofactores enzimáticos, transportadores de moléculas y mensajeros químicos. Por su
parte, los polímeros ARN y ADN son las biomoléculas encargadas del almacenamiento, transmisión
y expresión de la información genética.
Los nucleótidos son biomoléculas constituidas por tres tipos de componentes: bases nitrogenadas,
azúcares, y grupos fosfato. Nos centraremos primero en las bases nitrogenadas porque son, en el
contexto de esta materia, el elemento nuevo que aparece en estas estructuras.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 61
Las bases nitrogenadas presentan las siguientes propiedades físico-químicas: -Carácter débilmente
básico (a pH intracelular los grupos básicos aparecen mayoritariamente en forma desprotonada,
por lo que carecen de carga eléctrica significativa).
Además de las 5 bases más comunes ya mostradas, existen algunas otras. Esto incluye bases
modificadas (a partir de las bases ya mencionadas), que pueden aparecer en pequeñas cantidades
en ARN o ADN:
También hay otras bases nitrogenadas, con diferente estructura, que pueden cumplir funciones de
metabolitos secundarios:
Si a una base nitrogenada se une un azúcar, la estructura que resulta es un NUCLEÓSIDO. Los
azúcares que forman parte de los nucleósidos son aldopentosas cicladas en forma furanósica: ribosa
y desoxirribosa.
Nótese que los átomos de las bases eran numerados del 1 al 9, y en el caso de los azúcares, se utilizan
1' a 5'.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 62
La forma en que se unen ambos componentes para originar el nucleósido, es mediante una unión
β-N-glicosídica. Esto significa que el carbono 1‘ de la pentosa, de carácter anomérico β, se une a un
átomo de nitrógeno de la base (el N 1 de las bases pirimidínicas o el N 9 de las bases purínicas). Los
nucleósidos formados se nombran como se muestra en la siguiente figura:
Si se tiene en cuenta que es posible la libre rotación alrededor del enlace glicosídico, se observa
que existen dos posibles conformaciones (o dos extremos opuestos en ese giro de 360º). Estas se
distinguen como conformación anti y conformación syn:
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 63
Otra cuestión a tener en cuenta en la estructura de los nucleósidos es que el azúcar puede adoptar
diferentes conformaciones. Tratándose de ciclos furanósicos, se observa una conformación de tipo
sobre, donde el C que queda por fuera del plano es el C-2‘o el C-3‘. Adicionalmente, este C que
sobresale puede estar orientado en el mismo sentido que el C-5‘ o en sentido opuesto. De esta
situación surgen 4 variantes:
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 64
En caso de sumarse más grupos fosfatos para obtener nucleótidos di- o trifosfatados, se produce la
reacción entre dos grupos de ácido fosfórico, por lo que se origina una unión de tipo anhidro entre
los grupos fosfato. Nótese que en el próximo ejemplo la sigla ADP que nombra al nucleótido hace
referencia a la base y a la cantidad de fosfatos presentes.
Los nucleótidos tienen mayor solubilidad en agua que los nucleósidos (por el aporte de grupos
hidrofílicos de los grupos fosfato). Además, poseen fuerte carácter ácido y a pH fisiológico poseen
carga negativa (esto será de gran importancia en la estructura de los ácidos nucleicos). Al igual que
las bases nitrogenadas y los nucleósidos, absorben al UV (250-270 nm).
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 65
Probablemente, el ATP sea el ejemplo mejor conocido de nucleótidos que actúan en forma aislada
(es decir, sin polimerizar). Su función es la de almacenar y aportar energía para muchas de las
reacciones biológicas que tienen lugar en toda célula.
El aporte de energía del ATP se realiza a través de la hidrólisis de la unión anhidro entre el 2do y
el 3er fosfato (originando ADP y un grupo fosfato inorgánico libre, y liberando gran cantidad de
energía). Diversos procesos que requieren aporte de energía llevan a la reacción opuesta, fosforilando
ADP para volver a obtener ATP.
Un mensajero químico es una molécula que actúa permitiendo la comunicación entre células. La
célula receptora de la señal generará una respuesta acorde al estímulo recibido. Los mensajeros
químicos primarios actúan en el exterior de las células, interactuando con receptores de la cara
externa de las membranas plasmáticas. Los mensajeros secundarios actúan en el interior celular,
desencadenando una determinada respuesta. Algunos de los mensajeros secundarios más usuales
son nucleótidos, como el 3‘5‘-AMP cíclico o 3‘5‘-GMP cíclico. El nombre hace referencia a que el
fosfato forma dos uniones éster con dos grupos OH del azúcar, generando una estructura cíclica.
El 3‘5‘-AMP cíclico (cAMP) se origina a partir de una molécula de ATP por acción de la enzima
adenilato ciclasa (localizada en la membrana), luego de que una hormona que actúa como mensajero
primario sea reconocida por un receptor proteico de la membrana. A su vez, el cAMP formado
produce la activación de una enzima contribuyendo a la respuesta inducida por la hormona por
parte de la célula blanco.
Un ejemplo de respuesta inducida por hormonas y mediada por AMPc es el caso del efecto de
la adrenalina y el glucagón sobre células del hígado. El efecto del mensajero secundario es la
activación de enzimas del tipo quinasas (permitiendo que las unidades reguladoras desbloqueen a
las unidades catalíticas que van a fosforilar a su sustrato).
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 66
Algunos nucleótidos tienen como función transportar componentes que serán utilizados en la
síntesis de biomoléculas complejas, por ejemplo, polisacáridos o lípidos de membrana. Un ejemplo
muy importante es la síntesis de oligosacáridos y polisacáridos, donde cada nuevo monómero que
se suma mediante una unión glicosídica es transportado a su sitio de síntesis por un nucleótido
difosfatado específico. El monosacárido transportado está unido al segundo grupo fosfato del
nucleótido mediante un enlace O-glicosídico; este enlace se romperá para que el nucleótido “done”
al monosacárido para la síntesis que está ocurriendo, donde una enzima catalizará la formación
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 67
En el caso de la síntesis de lípidos, podemos ver actuar distintos nucleótidos transportadores. Por
un lado, la Coenzima A (CoA), con una estructura compleja que incluye un nucleótido difosfatado
(ADP), se encarga entre otros roles de transportar los grupos acilo (en ese caso, se la denomina
acetil-CoA) que permiten la elongación de las cadenas carbonadas de los ácidos grasos. La presencia
de un grupo tiol (-SH) permite que los acetilos se transporten mediante la formación de un tioéster.
Otros ejemplos de transportadores que aportan componentes para la síntesis de distintos tipos de
lípidos son el CDP-diacilglicerol y el CDP-colina.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 68
Las oxidorreductasas son enzimas que catalizan la transferencia de electrones desde una molécula
donante (el agente reductor o la molécula oxidada) a otra aceptora (el agente oxidante o la molécula
reducida). Estas enzimas suelen estar asociadas a coenzimas que también cambian su estado
de oxidación en contrapartida a lo que le sucede al sustrato. De este modo, tenemos los pares
NADH/NAD+, NADPH/NADP+, FAD/FADH2 o FMN/FMNH2. En cuanto a su estructura, estas
moléculas son dinucleótidos unidos a través de sus grupos fosfato (es decir, mediante uniones
anhidro), donde aparecen bases nitrogenadas que ya conocemos y otras diferentes (nicotinamida,
flavina). Las reacciones de oxidación y reducción tienen lugar específicamente en las bases, que
presentan así una forma oxidada y una forma reducida (que puede además corresponderse con una
forma cargada y otra sin carga).
A continuación, se muestra el caso del FAD/FADH2, donde la base que reacciona es la flavina (se
reduce en el ciclo de Krebs y se oxida en la cadena respiratoria).
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 69
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 70
Los dos tipos de ácidos nucleicos que existen son ácido ribonucleico o ARN y ácido
desoxiribonucleico o ADN (siendo ese el orden en el que surgieron, en términos evolutivos). Los
ácidos nucleicos son polímeros lineales de nucleótidos unidos por enlaces diéster fosfato, en los
cuales el fosfato de un monómero se une a un –OH de la pentosa del nucleótido vecino. De este
modo, en cualquier cadena de ácidos nucleicos se da una asimetría o polaridad que permite
distinguir dos extremos diferentes: un extremo 5‘que corresponde al nucleótido que presenta libre
el grupo fosfato unido al C5‘ de su azúcar, y un extremo 3‘ que tiene libre el –OH de esa posición
de su azúcar (ver figura a continuación con el ejemplo de las cuatro bases del ADN). La función
biológica de estos polímeros es la de almacenar, transmitir y expresar la información genética en
todos los organismos.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 71
2.3.1. ARN
Existen tres tipos principales de este ácido nucleico, con algunas diferencias estructurales relaciona-
das con las funciones que cumplen.
ARNm (mensajero)
Los otros dos tipos de ARN mencionados son necesarios para que se complete el proceso de
traducción: así como el ARNm trae la información, el ARN ribosomal (ARNr) forma, junto
con proteínas, los complejos donde tiene lugar la síntesis de proteínas: ribosomas, y los ARN
de transferencia (ARNt) aportan de modo específico los aminoácidos correspondientes.
Los ARNt y ARNr también son monocatenarios pero presentan mayor complejidad
estructural, con niveles secundario y terciario de estructura que se alcanzan mediante
plegamientos de la misma hebra sobre sí misma gracias a la presencia de segmentos
autocomplementarios (ver debajo COMPLEMENTARIEDAD DE BASES).
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 72
p
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 73
ARNt
El ARNt tiene una forma de trébol que le permite unirse y transportar el aminoácido
(en su extremo 3‘), interactuar con el ribosoma, por un lado, y con el ARNm por otro,
esto último gracias a la complementariedad entre codón y anticodón (secuencias de 3
bases complementarias y antiparalelas en ARNm y ARNt, respectivamente). En los ARNt
aparecen algunas bases diferentes y también modificaciones de las bases más comunes.
ARNr
El ARN ribosomal se combina con distintas proteínas generando las dos subunidades que
forman el ribosoma.
Además de los 3 tipos principales, existen otras moléculas de ARN no codificante con
funciones de regulación (ARNi) o con actividad catalítica (ribozimas). Veremos acá una
función del ARN de interferencia o ARNi.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 75
Cabe destacar que esta situación corresponde a las condiciones de pH fisiológico (cercano
a un pH neutro o algo menor), ya que cambios en el pH del medio generan protonación
o desprotonación de los grupos afectando esa capacidad de formar puentes de H entre
las bases. De este modo, un cambio de pH puede actuar como agente desnaturalizante
desestabilizando la estructura secundaria y terciaria de los ácidos nucleicos.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 76
2.3.2. ADN
Desde el punto de vista evolutivo, se considera que inicialmente sólo existía el ARN, con la
posibilidad de almacenar información, autorreplicarse, transmitirse y traducirse a proteínas.
Posteriormente el ADN habría surgido a partir del ARN, como una especialización para la
función de almacenamiento, replicación y transmisión de información. Este paso implica
dos modificaciones estructurales clave que son el remplazo de ribosa por 2‘desoxirribosa
y el reemplazo de uracilo por timina. La estructura primaria del ADN consiste en su
secuencia de bases, dada por las uniones diéster fosfato entre nucleótidos. Las cadenas de
ADN pueden tener millones de nucleótidos de longitud.
La estructura secundaria del ADN implica la unión de dos hebras (de ahí que se diga
que el ADN es dicatenario, a diferencia del ARN) antiparalelas y complementarias que
se acomodan generando una hélice. Es decir, son las interacciones entre pares de bases
complementarias de las hebras las que estabilizan principalmente la estructura de la
molécula de ADN. Por otro lado, también contribuyen a esa estabilidad las interacciones
hidróbicas que tienen al mantener “apiladas” a las bases, que quedan ubicadas hacia el
interior de la hélice, tendiendo a desplazar el agua y generando un entorno más hidrofóbico,
en comparación con el exterior de la hélice (donde predominan los grupos fosfato y los
azúcares). El carácter dinámico de la hélice de ADN está dado por las rotaciones sobre los
enlaces glicosídicos y del esqueleto pentosa-fosfato. Se puede curvar o superenrollar.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 77
La formación de puentes de hidrógeno requiere que los átomos implicados se sitúen sobre
una línea recta. Esto se cumple sólo cuando los dos enlaces N-glicosídicos de los nucleótidos
complementarios forman un ángulo con la línea imaginaria que une los C1’ de ambas
pentosas, inferior a 90º. La distancia del par de bases G-C y A-T y el ángulo de inclinación
de los 2 pares de bases es prácticamente la misma. Esto determina una doble hélice regular
con formación de surcos. A nivel de estructura terciaria, la hélice de ADN puede adquirir
distintos tipos (determinado principalmente a través de la secuencia primaria), donde el
más común y de mayor importancia biológica es el ADN B.
La presencia del OH en 2‘ puede favorecer una reacción por ataque nucleofílico que provoca
la ruptura de las cadenas. Se produce una transesterificación del enlace 3‘,5‘fosfodiéster (a
fosfato 2‘,3‘cíclico). Esta reacción ocurre especialmente en condiciones alcalinas, y se estima
que es 3000 millones de veces más probable en ARN que en ADN (gracias, justamente, a la
ausencia del grupo OH en esa posición).
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 81
En las células eucarióticas, el ADN se combina con proteínas para formar la cromatina
y acomodarse en el núcleo celular. Las proteínas de condensación más comunes son las
histonas, moléculas pequeñas ricas en lisina y arginina (cargas positivas a pH fisiológico),
que interactúan con los grupos fosfato del ADN (cargas negativas). En la formación de los
nucleosomas, la cadena se enrolla en sentido levógiro 1 3/4 vueltas de ADN (aprox. 146
pares de bases), alrededor de un núcleo formado por cuatro tipos de histonas (H2A, H2B,
H3 y H4). Las histonas tipo H1 quedan fuera del nucleosoma.
Las histonas H2A y H2B forman un dímero. Dos H3 y dos H4 forman un tetrámero. Dos
dímeros H2AH2B y un tetrámero H3-H4 forman un octámero con forma de disco aplanado.
Sobre el octámero se enrolla el ADN. Quedan sitios cubiertos en la cara interna, y otros
descubiertos y accesibles a diferentes modificaciones químicas hacia el exterior. El grado
de enrollamiento influye sobre la actividad de los genes. Es regulado por el agregado o la
remoción de grupos acetilo, metilo y grupos fosfato en las colas de las histonas, que se
proyectan hacia fuera de los nucleosomas.
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 82
El Código Genético
El código genético es el conjunto de reglas que define cómo se traduce una secuencia de
nucleótidos o bases en el ARN a una secuencia de aminoácidos en una proteína. Este código
es común en todos los seres vivos (aunque hay pequeñas variaciones), lo cual demuestra
que ha tenido un origen único. En la Tabla se indican las distintas combinaciones de bases
que corresponden a cada secuencia de 3 bases en el ARNm (codones) y los respectivos
2 Nucleótidos y Ácidos nucleicos 84
aminoácidos (o en algunos casos, señal de stop). Existe al menos un ARNt para cada
aminoácido (con el anticodón complementario al codón que lo codifica).
3 Membrana y mecanismos de transporte 86
Los lípidos definen las propiedades físicas de las membranas. La longitud y el grado de
saturación de sus ácidos grasos regulan la fluidez y el grosor de la membrana, y su
distribución desigual es responsable de la asimetría de estas. En la membrana plasmática
las cabezas hidrofílicas cargadas de estos lípidos contribuyen a crear un gradiente
eléctrico entre la cara externa y la interna, y por tanto a modular el potencial eléctrico.
Mediante interacciones electroquímicas modulan la actividad de las proteínas de
membrana y en algunos casos dan lugar a la formación de mensajeros secundarios que
migran a compartimentos intracelulares y desencadenan respuestas celulares.
Los principales lípidos de membrana poseen carácter anfipático y corresponden a los
lípidos compuestos.
Los esfingolípidos son más abundantes en las membranas plasmáticas que en la de las
organelas.
Los fosfolípidos interactúan entre sí y con otras moléculas de las membranas mediante
interacciones de dipolos transitorios (colas hidrofóbicas) y mediante interacciones de
dipolos permanentes y electrostáticas, manteniendo libertad en sus movimientos.
Los fosfolípidos pueden rotar sobre su eje, subir y bajar, desplazarse lateralmente,
flexionar las colas no polares. Estos movimientos están termodinámicamente
favorecidos. Los fosfolípidos pueden incluso pasar de una capa a la otra de la bicapa
(enzimas flipasas). Este último movimiento requiere un gasto energético y son menos
probables. La libertad de movimientos explica la capacidad de autoreparación de la
membrana.
Esteroles
El colesterol es el esterol más importante de las células animales y el tercer tipo de lípido
más abundante en la membrana plasmática (hasta el 25 % del total de lípidos), mientras
que aparece en pequeñas proporciones (1-2%) en las membranas de ciertas organelas
3 Membrana y mecanismos de transporte 90
celulares (retículo endoplasmático, mitocondrias y lisosomas). Los esteroles (colesterol,
sitosterol, ergosterol, stigmasterol) son esenciales para la integridad y funcionamiento de
las membranas eucariotas y sirven para modular la rigidez, la fluidez y la permeabilidad
de la bicapa.
Los esteroles son hidrofóbicos y se intercalan entre los fosfolípidos. Su grupo hidroxilo
polar está en contacto con la solución acuosa, cerca de los grupos de las cabezas polares
de los fosfolípidos, el núcleo de cuatro anillos (ciclopentanoperhidrofenantreno)
interactúa con los restos acilos (colas hidrofóbicas). El efecto neto de un esterol en la
fluidez de la membrana varía, dependiendo de la composición lipídica. El colesterol
restringe el movimiento al azar de las cabezas polares, que son las más cercanas a las
superficies externas de la bicapa, pero separa y dispersa sus colas hidrofóbicas, causando
que la doble capa llegue a ser más fluida. Interrumpen interacciones entre las colas no
polares aumentando la fluidez, lo cual evita un mayor endurecimiento a bajas
temperaturas, pero a altas temperaturas interfieren con el movimiento de flexión de las
colas, disminuyendo la fluidez.
Hoja de
Raíz de
Tipo de lípido
cebada
cebada Arabidopsis espinaca
Fosfolípidos 26 44 47 64
Esteroles 57 35 38 7
Esteroles glicosilados 7 - 5 -
Esteroles de glicósidos
- - 3 13
acilados
Glicolípidos 9 16 7 14
3.3. Proteínas
Mientras que los lípidos son los elementos estructurales fundamentales de las
membranas, las proteínas son responsables de llevar a cabo funciones específicas. La
mayoría de las membranas plasmáticas poseen aproximadamente 50% de lípidos y 50%
de proteínas en peso, con porciones de carbohidratos (glucolípidos y glucoproteínas)
correspondientes al 5 - 10% de la masa de la membrana. Dado que las proteínas son
mucho más grandes que los lípidos, este porcentaje corresponde alrededor de una
molécula de proteína por cada 50 a 100 moléculas de lípidos.
Las proteínas de las membranas se pueden clasificar considerando diferentes criterios.
Respecto a su función se pueden mencionar proteínas receptoras de señales, de
reconocimiento, enzimas (proteínas que cumplen funciones catalíticas de membrana,
3 Membrana y mecanismos de transporte 92
aceleradoras de procesos bioquímicos), proteínas de adhesión a otras células
(conectoras), canales, bombas, transportadoras (relacionadas al transporte de moléculas
pequeñas e iones), y en algunos casos se encuadran en más de un tipo.
Las proteínas se intercalan en la bicapa lipídica y existen dos tipos de proteínas según su
disposición:
Proteínas integrales. Atraviesan o penetran la bicapa tomando contacto con la parte
hidrofóbica de la membrana y las Proteínas periféricas que no interactúan con el núcleo
hidrofóbico de la bicapa.
La proteína posee tres dominios, uno extracelular hidrofóbico que posee 16 cadenas de
oligosacáridos, este sector se encarga de mediar la interacción del eritrocito con otras
células, un dominio intracelular hidrofóbico con estructura α hélice, ya descripto, y un
dominio hidrofílico citosólico rico en aminoácidos cargados negativamente (glutamato y
aspartato) que contacta con el citoesqueleto.
Los aminoácidos que componen estas proteínas son diversos y el carácter polar o no
polar de estos se relaciona con su ubicación en la membrana. En contacto con las colas
hidrofóbicas de los lípidos se ubican aminoácidos no polares o hidrofóbicos y próximos a
las cabezas polares de los fosfolípidos aminoácidos ácidos y básicos con carga.
Cuando se realizan cortes transversales de la proteína, a nivel de la superficie de la
membrana o en la parte media de esta, pueden observarse diferencias importantes en los
tipos de aminoácidos presentes.
En color rojo se observan los Aas catiónicos a nivel de la superficie de la membrana. En
amarillo los Aas hidrofóbicos no polares próximos al retinal, y hacia la parte media de la
membrana.
3 Membrana y mecanismos de transporte 95
En la cara endoplasmática:
Actina (componente del citoesqueleto) tanto en células animales como vegetales. Es una
de las proteínas más abundantes entre los eucariotas y se encuentra presente en todo el
citoplasma, en dos formas: como monómeros globulares denominados actina G y como
polímeros filamentosos denominados actina F (formada por monómeros de actina G). La
actina F se denomina también microfilamento del citoesqueleto. (Ya descripta en la
unidad temática proteínas)
En la cara exoplasmática:
Matriz extracelular
Proteoglicanos
b) Virus, como el de influenza, que invaden las células animales y, en un primer paso,
interactúan con glicoproteínas de membrana.
En los vegetales las membranas plasmáticas producen plasmodesmos que atraviesan las
paredes celulares y constituyen canales de comunicación entre las células vecinas. Esto
determina que casi todas las células de una planta comparten una membrana plasmática
continua.
Otra característica de las membranas vegetales es la presencia de cantidades
significativas de glicósidos de esteroles y de glicósidos de esteroles esterificados con
ácidos grasos.
Entre las principales funciones biológicas que posee la membrana plasmática se destaca
el transporte de sustancias a través de esta.
3 Membrana y mecanismos de transporte 102
Las moléculas o iones pueden movilizarse a través de la membrana a favor del gradiente
electroquímico o en contra de este. Si lo hacen a favor, las moléculas pasan de la zona
donde se encuentran en mayor proporción hacia la más diluida, por ende, es un proceso
espontáneo de difusión. Cuando las moléculas o iones se mueven en contragradiente se
requiere un gasto energético y el proceso no es espontáneo. Dependiendo el sentido en el
que se mueven las moléculas el transporte podrá ser pasivo o activo.
Transporte pasivo: comprende todos los procesos que transportan moléculas o iones a
través de la membrana a favor de su gradiente electroquímico (utilizan la energía
potencial del gradiente electroquímico) liberando energía.
Energía potencial: es la energía capaz de realizar trabajo dentro de un sistema
Transporte activo: comprende todos los procesos que transportan moléculas o iones a
través de la membrana en contra de su gradiente electroquímico, requiriendo energía.
3 Membrana y mecanismos de transporte 103
Difusión es un proceso espontáneo, sin gasto de energía. Por ejemplo, las moléculas de
un perfume se mueven espontáneamente desde la zona de mayor concentración (frasco)
hasta la zona de menor concentración (extremo de una habitación) las moléculas migran
o difunden hasta que se equilibran las concentraciones, y se anula el gradiente
electroquímico.
Hay dos tipos de Difusión: Difusión simple y Difusión facilitada (esta última es
asistida por proteínas de membrana).
Gases (O2, N2, CO2) moléculas pequeñas sin carga. Las moléculas
atraviesan la bicapa lipídica sin necesidad de transportadores
proteicos, a favor de su gradiente electroquímico. Los gradientes de
concentración transmembrana de cada molécula, que compone una
mezcla, son independientes entre sí y se pueden establecer diferentes
velocidades de difusión
Iones y metabolitos
hidrofílicos atraviesan la
membrana a favor de su
gradiente electroquímico
utilizando proteínas
integrales de la membrana
sin tocar su interior
hidrofóbico (colas no
polares de los fosfolípidos).
Estos iones o moléculas
polares son rechazados por
el interior hidrofóbico de la membrana por ello son necesarias las proteínas para
transportarlos.
Canales o Porinas
Son proteínas con cierta especificidad que permiten el pasaje de un lado al otro lado de
la membrana a favor del gradiente electroquímico. La especificidad del poro depende de
los restos aminoacilo (tipos de aminoácidos que se encuentran en el interior del poro).
Por ejemplo, el agua lo hace a través de acuaporinas; y los iones a través de canales
catiónicos o aniónicos. Son poros hidrofílicos que no cambian su conformación.
Las figuras muestran la disposición de las seis hélices y la ubicación central del poro.
Canales iónicos
Los canales iónicos son proteínas integrales transmembrana y se encuentran en todas las
células.
-una compuerta: se encuentran presentes solo en canales activables. O sea que se abren o
cierran mediante cambios conformacionales inducidos por un estímulo determinado
(eléctricos, mecánicos o químicos).
-Filtro: determina la especificidad del ion a transportar (en casos determinado por ciertos
aminoácidos)
3 Membrana y mecanismos de transporte 106
Tipos de canales
Otros canales son regulados por neurotransmisores, estas sustancias pueden excitar o
inhibir la respuesta, por ejemplo, acetilcolina (Na+), glutamato (cationes), glicina
(aniones) y GABAA (aniones).
3 Membrana y mecanismos de transporte 107
Son más específicas que los canales, modifican su conformación al fijar al sitio activo la
molécula a transportar, para liberarla del lado opuesto de la membrana. Se encargan del
transporte de moléculas polares a favor del gradiente electroquímico (por ejemplo,
glucosa y aminoácidos hacia el interior de la vacuola). Algunas sustancias polares
transportadas son: aminoácidos, monosacáridos, disacáridos, nucleótidos.
Estas proteínas carrier son proteínas integrales de membrana que incluyen varios
segmentos α hélice separados por estructuras al azar. Las proteínas carrier GUT son
específicas para el transporte de glucosa, galactosa y fructosa. Existen 14 tipos diferentes.
Se tratan de cadenas polipeptídicas pequeñas hidrofóbicas, que constan de 12 α-hélices
transmembrana separadas por asas (estructura al azar, hidrofílicas). Tienen alto grado de
especificidad.
Las proteínas cotransportadoras utilizan Fuerza Ion Motriz. Los iones más involucrados
consisten en H+ o Na+. El movimiento a favor de gradiente de estos iones impulsa el
movimiento contragradiente de otros iones o moléculas.
Facilitan el transporte de iones NH4+, NO3, H2PO4-, K+, SO4-2 y Cl-, así como de moléculas
pequeñas polares en contra de sus gradientes electroquímicos. Transportan azúcares,
aminoácidos y bases purínicas y pirimidínicas. Dependiendo el sentido de movimiento
de los moléculas o iones involucrados, se presentan dos tipos de proteínas
cotransportadoras:
-Simporte: donde los iones que migran a favor del gradiente (FPM) se mueven en igual
dirección que las moléculas transportadas en contra del gradiente electroquímico.
-Antiporte: en este caso los iones (FPM) que se mueven a favor de su gradiente
electroquímico aportan la energía necesaria para movilizar iones o moléculas en contra
de su gradiente electroquímico. Las moléculas y iones involucrados se mueven en
sentido o direcciones opuestas.
Son complejos proteicos oligoméricos, algunos de estructura simple y otros muy complejos
altamente específicos para transportar iones en contra de sus gradientes electroquímicos. Las
bombas son las encargadas de generar los gradientes electroquímicos transmembrana, y para
hacerlo requieren energía como el ATP. De ahí el nombre que reciben: ATP-asas.
ATPasas tipo F, A y V: Estas ATPasas se caracterizan por ser proteínas de gran tamaño y
estructuras semejantes formadas por un elevado número de polipéptidos. Tienen dos
componentes fundamentales: una "base" hidrofóbica, que atraviesa la membrana y que está
formado por un haz de 9 a 13 cadenas polipeptídicas, y una “cabeza” asociada mediante un
"tallo" a la base. Esta cabeza tiene una estructura del tipo α3β3, y se puede separar
fácilmente de la base. La hidrólisis del ATP ocurre en la cabeza.
Las ATPasas F: (de eubacterias, mitocondrias y cloroplastos) y las ATPasas A (de arqueas)
funcionan normalmente en la dirección de la síntesis de ATP. Es decir, emplean la energía
que se libera en el pasaje de H+ (o, más raramente, Na+) a favor de su potencial
electroquímico, para sintetizar ATP. Son bombas funcionando “al revés” o sea son
ATPsintasas.
ATPasas del tipo ABC (ATP Binding Cassette): Es un grupo de complejos proteicos que
sufren cambios conformacionales durante el proceso de transporte, pero no se fosforilan
durante el mismo (a diferencia de las ATPasas de tipo P). Pueden actuar exportando solutos
3 Membrana y mecanismos de transporte 110
hacia el exterior del citoplasma, o importando solutos
En el primer caso (exportación), presentes en todos los organismos, la unidad básica es un
único polipéptido que posee dos dominios funcionales: un dominio transmembrana y uno
citoplásmico en el cual reside la actividad ATPasa. Las ATPasas ABC de importación están
restringidas a procariotas.
Na+ /K+ ATPasa, la “bomba de sodio” de las membranas citoplásmicas de las células
animales. Es la responsable de la creación y mantenimiento del potencial de membrana de
las células de animales, y de la creación del gradiente de iones Na+ cuya entrada al interior de
la célula se emplea en los procesos de cotransporte. De hecho, en una célula en reposo la
mayor parte del ATP es empleado precisamente por esta proteína.
El diagrama anterior muestra los pasos que se suceden para el movimiento de ambos tipos
de iones. Salen de la célula tres iones Na+ e ingresan dos iones K+ al citosol por cada ciclo
catalítico. En ambos casos estos iones se mueven en contra de su potencial electroquímico. Es
un transporte electrogénico: la cara interior de la membrana se vuelve negativa respecto al
exterior. La fosforilación de un resto aspartato de la proteína genera un cambio de
conformación, que se revierte al desfosforilarse.
Desde la luz intestinal a través de las microvellosidades ingresa a la célula epitelial del
intestino glucosa (mediante un mecanismo de simporte, transporte activo). En este caso se
utiliza fuerza sodio motriz ya que son los iones sodio los que están en movimiento a favor de
su gradiente electroquímico. De esta manera en la célula epitelial se incrementa el contenido
de glucosa que sale de la célula hacia el torrente sanguíneo mediante un sistema de uniporte
(a favor del gradiente electroquímico, transporte pasivo, difusión facilitada). Entre la sangre
y la célula epitelial se intercambian Na+ / K+ mediante una bomba de sodio/potasio
(transporte activo que consume ATP).
3 Membrana y mecanismos de transporte 111
Velocidad de transporte
Las ATPasas sufren muchos cambios conformacionales, la velocidad con que las moléculas o
iones pasan a través de ellas es baja (102 por segundo).
Los canales son muy rápidos (106 - 108 por segundo), dado que no presentan cambios
conformacionales significativos durante el transporte.
La abundancia de los distintos complejos proteicos parece ser inversamente proporcional a la
velocidad con que se desempeñan. La proporción de bombas que generan la FPM necesaria
para el funcionamiento de las proteínas cotransportadoras, es en general muy alta
comparada con la cantidad de canales.
3 Membrana y mecanismos de transporte 112
3.6. Bioenergética
Los seres vivos y las células que los forman son sistemas abiertos que intercambian
materia y energía con el entorno. Son, además, sistemas capaces de convertir un tipo de
energía en otro con una gran eficiencia. La bioenergética se enfoca centralmente en las
transformaciones energéticas que se dan en los sistemas vivos. Este tipo de
transformación, llamada también transducción, involucra casi siempre un flujo de
electrones desde una molécula con mayor hacia otra con menor potencial electroquímico.
-Exergónicos: procesos o reacciones que llevan al sistema desde un valor mayor a uno
menor de G (ΔG negativo), liberando energía. Ocurren espontáneamente.
-Endergónicos: procesos o reacciones que llevan al sistema desde un valor menor a uno
mayor de G (ΔG positivo), por lo cual requieren un aporte de energía dado que no
ocurren espontáneamente.
Los procesos endergónicos tienen lugar en rutas metabólicas en las que se libera energía
cuando hay electrones que pasan desde niveles superiores a inferiores de energía
potencial. Es decir, a lo largo de esa cadena los electrones van pasando a través de
moléculas que tienen mayor a menor capacidad de realizar un trabajo (de mayor a
menor energía potencial), pero también mayor a menor capacidad para ser reducidas
(potencial de redox). Estas cadenas de transporte de electrones suceden en ciertas
membranas biológicas (tilacoide, interna de mitocondrias y plasmática de
microorganismos).
De acuerdo a su origen, la energía que originalmente motoriza todo el proceso puede ser:
La FPM constituye una reserva de energía potencial que puede ser utilizada para:
ATP sintasas
Subunidad a
Subunidade
sc
Son pocas membranas las que cumplen las condiciones para que se lleve a cabo el
acoplamiento quimiosmótico:
1) Membrana tilacoide
3) Membrana tilacoide
CH3O ( )n H
O
Plastoquinona
Tanto PSI como el PSII son complejos multiproteicos formados por un centro de reacción
fotoquímica y un complejo antena (o complejo cosechador de luz, Lhc por sus siglas en
inglés), que incluye asociaciones proteína-pigmento. Ambas clases de fotosistemas se
diferencian entre sí por el tipo y número de componentes proteicos y por la molécula de
clorofila especial de su centro de reacción.
3 Membrana y mecanismos de transporte 121
-Fotosistema II (PSII)
-Plastoquinona (PQ)
-Citocromo b6f (Cytb6f)
-Plastocianina (PC)
-Fotosistema I (PSI)
-Ferredoxina (Fdx)
-Ferredoxina-NADP+ reductasa (FNR)
En las membranas bacterianas podemos encontrar los tres usos diferentes de la fuerza
protón motriz. En un caso, el movimiento de protones a favor de su gradiente permite
que funcionen mecanismos de cotransporte, por ejemplo, el ingreso de lactosa o la
eliminación del exceso de sodio o calcio. En segundo lugar, la activación de la ATP
sintasa para la producción de ATP, en un proceso similar a los que vimos en la
fotofosforilación y la fosforilación oxidativa. Por último, la activación de un mecanismo
rotatorio que permite el movimiento flagelar.
Las ATP sintasas bacterianas presentan una estructura algo más sencilla que las que
describimos para mitocondrias y cloroplastos, y difieren en la cantidad de cada una de
las subunidades que se asocian para originar las fracciones F0 y F1. Por otro lado, en
algunos grupos de bacterias estas estructuras son capaces (generalmente en condiciones
anaerobias) de funcionar en “modo reverso” como ATPasas, es decir, hidrolizando ATP
y utilizando la energía obtenida para traslocar protones contra gradiente fuera del
citoplasma. Esta capacidad las diferencia de las ATP sintasas eucariotas y de otros
grupos de bacterias, donde la capacidad hidrolítica se encuentra inhibida por distintos
mecanismos. Por último, algunas bacterias pueden utilizar fuerza Na+ motriz para
activar sus ATP sintasas.