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1. CAPAS SUPERCIFICIALES
1.1 CÁPSULA Y CAPAS MUCILAGINOSAS
Según su grado de asociación con la pared: integrales o periféricas, y su consistencia y límites
externos: rígidas o flexibles :
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1.1.2 FUNCIONES Y PROPIEDADES GENERALES CONFERIDOS POR LA CÁPSULA:
Interacción con el medio ambiente
• Mejora la difusión de nutrientes Está cargada negativamente
• Protege contra la desecación
• Protección ante macrófagos y protozoos
• Protege contra agentes antibacterianos
• Constituyen el antígeno capsular K (Junto a O, somático, en estructuras de la pared, y H, en los
flagelos, realizan una respuesta inmune por parte del hospedador). Las bacterias tienen tres
antígenos principales:
• K: es el más externo y da lugar a anticuerpos frente a él (anticuerpos protectores)
• Antigeno somatico
• Antigeno H. Solo en las bacterias que tienen flagelos.
• Adhesinas: adhesión de las bacterias a diferentes superficie, muertas o vivas.Podemos fabricar
vacunas a partir de él,
• Fimbriadas o no fimbriadas.
• Formación de biopelículas o biofilmes,
• Son importantes como factor de virulencia
Las colonias son muy mucosas y elásticas formando hilos cuando contienen capsulas, y en las
colonias se genera una capa de gran tamaño formada por la capsula.
BIOFILMES
Es una comunidad microbiana sésil caracterizada porque las células están unidas irreversiblemente
a un sustrato, o interfase, o unas a otras, embebidas en una matriz polimérica extracelular que ellas
mismas han producido y presentan un fenotipo alterado en cuanto la velocidad de crecimiento y la
transcripción de genes (respecto al estado planctónico) (Donle y Costerton, 2002). Fleming et al.
(2016) completan la definición: un biofilme es una forma emergente de vida bacteriana en la que la
vida comunal es completamente diferentes de la de las bacterias que viven como células libres.
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Los organismos se pueden encontrar unidos a la superficie de manera inmovilizada. A este estado se
le llama estado sésil y en los biofilmes, las bacterias se encuentran en este estado. El otro estado
posible es flotando y se llama estado planctónico
La capsula actúa como adhesina para formar los biofilmes y sirve de captación de nuevas bacterias.
Nota: las arqueas gram-negativas no tienen pared por lo que la capa S interacciona con la
membrana citoplasmática.
1.2.1 FUNCIONES
Implicada en interacciones con el medio ambiente, fagos, bacterias, etc.
● En Arqueas hay muchas connotaciones de la capa S a nivel estructural, donde pueden
realizar incluso las funciones de pared celular (forma y rigidez) y en ambientes muy salinos
protegen a las arqueas (osmoprotección) en haloarqueas
● En Bacterias: papel protector
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● Tamiz molecular protector frente a antibacterianos
● Protección frente a fluctuaciones iónicas, de pH, etc
● En algunas patógenas, protección frente a fagocitosis: factor de virulencia Capa S con forma
de paraguas con función de pared en Arqueas 🡪 sin pared celular
1.3 VAINA
Tubos a base de heteropolimeros de proteínas, lípidos o polisacáridos que unen a varias células
que forman cadenas
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Formas de vida
2. PARED CELULAR
La mayor parte de los procariotas posee una pared celular (P.C.) rígida rodeando al protoplasto en
contacto íntimo con la MC.
Diana de la bala mágica: estructura o proceso metabólico que está en el organismo patógeno y que
no está presente en nuestras células, y en la cual se puede actuar sí que tenga efectos tóxicos en
nosotros. El punto en el que podemos atacar a la bacteria sin que nos afecte. En quimioterapia son
compuestos antimicrobianos que matan microorganismos pero no son tóxicos para nostoros, tiene
acción selectiva para las bacterias. No nos pueden atacar a nosotros porque no tenemos pared
celular
EN BACTERIAS:
Gram positivas
● Peptidoglucano (antígeno O)
● Matriz aniónica de polímeros azucarados
Gram negativas
● Peptidoglicano
● Espacio periplásmico
● Membrana externa: lipopolisacáridos y
proteínas
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IMAGEN QUE NO ESTÁ EN LAS DIAPOSITIVAS PERO SÍ EN SUS DIAPOS DE CLASE
3.PEPTIDOGLICANO
• PARTE GLUCÍDICA:
Disacárido: N-acetil glucosamina unido por enlace
beta (1-4) a N-acetil murámico (N acetil glucosamina
que reacciona con un ácido láctico formando un
enlace éster). Tiene la misma estructura que NAG más
un grupo láctico unido al C3.
Muy resistente a enzimas. Lisozima puede romper los peptidoglucanos por el enlaces beta de los
disacáridos. Es una enzima que está en la primera linea de defense del organismo, también la
encontramos en las lágrimas. (Estafilococcus es resistente a la acción de esta enzima porque tiene
modificaciones de la diana de la lisozima 🡪 resistente a las lárimas).
• PARTE PEPTÍDICA:
Tetrapéptido (4 Aa): formado por aminoácidos D (no suelen encontrarse en la naturaleza) y L
intercalados entre sí. Generalmente en la tercera posición se coloca un aminoácido dibásico (ácido
mesodiaminopimenico), el cual es importante para el entrecruzamiento entre tetrapéptidos
adyacentes.
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Estructura global: Las distintas cadenas polisacarídicas, con sus
respectivos tetrapéptidos, se unen por medio de puentes
peptídicos, entre un aminoácido de una cadena (p. ej., el nº 3,
con el meso-DAP del ejemplo) y otro aminoácido de una cadena
adyacente (la D-ala terminal). El entrecruzamiento se puede dar
de manera directa o con la necesidad de péptidos. Suele darse
entre el aminoácido 3 y el 4 de la cadena adyacente.
Recordatorio:
Gram +:
● Peptidoglicano más grueso y con más capas de peptidoglicano
● Poros más pequeños y más compactos
● Enlaces peptídicos y más abundantes que interconectan las capas
Gram -:
● Menos peptidoglicano
● Pocas capas
● Menos enlaces peptídicos
● Más laxa
● Huecos más grandes.
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La tinción se basa en los siguientes pasos:
1. Tinción con violeta cristal de todas las bacterias (purpura de bromocresol) 🡪 tinción
homogénea (1min)
2. Adición de un mordiente (yodo) (3 min) 🡪 hace más fuerte la union del colorante a los
compuestos de la célula.
3. Tratamiento diferenciador (20 seg) 🡪 Hay bacterias que reaccionan de manera diferentes
(algunas pierden el color) Mezcla de alcohol acetona (intenta extraer el tinte violeta)
En este momento tendremos:
○ Gram + 🡪 lilas 🡪 porque los poros al ser pequeños y achicarse más, no sale el
colorante.
○ Gram - 🡪 incoloras
4. Tinción con safranina (rojo) o fucsina (rosa) para observar a las Gram- (que son las que han
perdido el colorante) (1-2 min)
○ Gram + 🡪 Lilas
○ Gram - 🡪 De rosa a rojo
5.GRAM NEGATIVAS
Las distintas cadenas se unen por enlaces peptídicos directos entre el grupo ε-NH2 del
m-DAP (3) de una cadena con el – COOH de la D-ala (4) de otra cadena.
Forma una malla floja con poros: el 50% carece de unión entre tetrapéptidos, hay NAM
sin tetrapéptido.
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A nivel del acetilmurámico lleva unido un tetrapéptido.
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5.3.1 LÁMINA EXTERNA
Polisacáridos:
• Menos permeable a las moléculas hidrofóbicas (tiene cadenas polisacarídicas muy
hidrofóbicas (muy negativas) 🡪 más resistente a antibióticos.
• Antígeno somático O en bacterias Gram negativo
• Factor de virulencia en bacterias patógenas
• Unión a cationes divalentes como Mg ++ y Zn ++(homeostasis catiónica) 🡪 regula la
concentración de estos cationes en la célula según las necesidades de la célula. Mantiene la
estructura de la membrana externa.
Si añadimos EDTA 🡪 desorganizamos la membrana externa porque secuestra los cationes.
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5.3.2 LÁMINA INTERNA (de la membrana externa)
Lipoproteína de Braum (PB)
Parte proteica (7,2 kDa) en forma de alfa hélice que atraviesa el espacio periplásmico
unida a uno de cada 3 (aprox.) PG por enlace peptídico (covalente) por su extremo C.
Unión a lípidos de membrana externa por su extremo NH.
Su síntesis es muy costosa por lo que su presencia en gran cantidad nos indica su crucial
importancia.
Porinas: barril-b, se disponen en trímeros atravesando la membrana externa, con canales interiores
que atraviesan la membrana. Permiten el paso de sustancias según su tamaño, dejando pasar solo
las que se encuentran por debajo de un determinado tamaño (<500-700 Da): azúcares, alcoholes
etc. En enterobacterias: protección frente a sales biliares.
• Propiedades de superficie:
– Grado de humedad 🡪 lo regula
– Adhesividad: OMPs: factores de virulencia
– Carga eléctrica negativa
– Interacción con hospedador (Ag O, OMPs)
– Adsorción de fagos
– Punto de anclaje del anillo L del cuerpo basal de los flagelos
– Lugar (LPS) donde se fijan las proteínas del sistema del Complemento (MAC) 🡪 complejo de
ataque a la membrana (conduce a la lisis de las bacterias).
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ESPACIO PERIPLASMICO
Es la region comprendida entre las dos unidades de membrana (externa y la interna/citoplasmática)
Existe prácticamente en gram negativas. En gram positivas es un espacio virtual más que un espacio
real porque prácticamente no existe.
6. GRAM POSITIVAS
La amplia mayoría de NAM presentan tetrapéptidos, y casi todos los tetrapéptidos se encuentran
unidos (participan en enlaces interpeptidicos)
Entrecruzamientos entre cadenas del mismo nivel y entre un nivel y el inmediato superior o inferior.
Red tridimensional gruesa, con poros pequeños, más compacta que Gram-. No presenta
permeabilidad.
Enlaces beta muy compactos que le aportan rigidez. Condiciona la forma celular (protoplasto
aislado es esférico)
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Los puentes de pentaglicina de la imagen de la derecho hace que los sthaphylococcus aureus sean
resistentes a la glicocola (inhibidor del crecimiento de las bacterias porque inhibe la síntesis de la
pared celular). Necesita mucho aporte de glicocola 🡪 se aprovecha para crear medios selectivos a
los sthaphylococcus (solo crean estos y no otras bacterias).
● • Gran rigidez 🡪 aguanta las fuerzas osmóticas del protoplasto (5-15 atm). Rigidez viene de:
● El enlace β(1-4) es muy compacto. La alternancia de NAM y NAG 🡪 uno de los polisacáridos más
● El grado de entrecruzamiento
Estos poseen carga muy negativa, por lo que constituyen el antígeno O (antígeno somático)
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6.4 FUNCIONES DE LOS POLIMEROS DE LA MATRIZ DE LA PARED CELULAR DE GRAM
POSITIVA
● Homeostasis catiónica: suministran carga negativa para la unión de cationes divalentes
(calcio y magnesio) 🡪 en actividades enzimaticas de crecimiento y division de la pared celular.
● Antígeno somático O (AT)
● Receptores específicos para los bacteriófagos, PAM, etc.
● Adhesinas: unión a superficies inertes y vivas
● Regulación de las autolisinas 🡪 enzimas que regulan el crecimiento celular.
● Receptores en la conjugación (LT) 🡪 mecanismo de transcripción horizontal de genes entre la
célula donadora y la célula receptora 🡪 require un contacto intimo y directo entre ambas
celulas para que pase el AND.
● Regulan la localización del divisoma
II. Decoloración con alcohol-HCl 🡪 quita la fucsina de los que no sean alcohol resistentes.
III. Tinción con azul de metileno 🡪 para teñir las que han perdido la fucsina por el
alcohol-clorhídrico usamos este colorante.
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Estos cultivos adquieren tonalidad cérea y aspecto turbio.
La capa de AG está recubierta por una capa formada por ac. Micólicos,
lípidos libres, glicolípidos y peptidoglicolípidos (cera D) y proteínas
estructurados a modo de doble capa formando la MICOMEMBRANA
Son bacterias muy resistentes a los antibióticos, y se debe cambiar periódicamente de antibiótico.
Pueden entrar en los macrófagos y no presentar síntomas durante largos periodos de tiempo.
Crecimiento en cordón: debido a ciertos lípidos pertenecientes a la micomembrana.
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8. PAREDES DE LAS ARQUEAS
Como ya hemos nombrado anteriormente, las arqueas cuentan con una apred totalmente
diferente a la descrita en bacterias. Realmente tienen una gran variedad de composiciones,
pero todas se caracterizan por no tener un PG autétntico:Tiene pared ttoalmente diferente
CURIOSIDAD: Las arqueas cuyo género comienza por el prefijo metano- son arqueas metanógenas, pues
producen metano en su metabolismo. El resto del nombre del género hace referencia a su forma (ej:
metanosarcina - forma paquete cúbicos). Por otro lado, aquellas arqueas que comiencen por halo- hacen
referencia a halófilas extremas, que viven en ambientes con altas concentraciones salinas.
Sin embargo, recordemos que el PG conformaba una especie de saco que rodeaba a toda la
bacteria. Por lo tanto, este saco debe “abrirse” de algún modo controlado para incorporar
nuevo material. Otro problema al que se tiene que enfrentar la célula es que debe producir
estructuras que se encuentran en el exterior, necesitando un aporte de energía. Sin emabrgo,
el ATP no puede atravesar la membrana, por lo que no puede participar directamente en la
síntesis externa del PG. De esta manera, el crecimiento de la pared celular se divide en una
fase citoplasmática y en otra extracitoplasmática.
Tras esto, se produce la transferencia de la NAG desde el UDP-NAG que había sido
trnasportado a la membrana hasta el lípido I, formándose por glucosilación el lípido II
(Bactoprenol-P-P-NAM(-pp) -NAG). Para formar este lípido II se debe producir el enlace β-1,4
entre el NAM y la NAG. La energía necesaria para la formación de este enlace es donada por la
hidrólisis del UDP a UMP.
Es importante saber que muchas de las autolisinas que participan en este proceso son del
tipo PBPs (Penicilin Bindin Protein), pues son proteínas dianas de la penicilina (antibiótico
también llamado β-lactámico). Las PBPs como hemos dicho, catalizan reacciones de
transpeptidación. A este dominio catalítico se pueden unir las penicilinas porque estas
presentan analogía estructural con las D-Ala D-Ala del pentapétido. Al unirse, estos
anitibióticos inhiben las reacciones de transpeptidación e incluso de transglucosilación:
detienen la síntesis del PG.
Recordemos que los
antibióticos que afectaban a
la pared celular se
denominaban balas mágicas.
Estos antibióticos tienen una
gran importancia médica,
pues no resultan son toxicas
para humanos porque
nuestras células no cuentan
con pared celular. Los
anitbióticos que afectan a la
síntesis del PG (reflejados en
rojo en la imagen) sólo
pueden ejercer su acción cuando la célula está en crecimiento (cuando se sintetiza nuevo PG).
- Fostatidil-etanolamina
- Fostatidil-glicerol
- Cardiolipina (difosfatidil-glicerol)
10.1.2 EN ARQUEAS
En arqueas, los lípidos de membrana difieren a los de bacterias. Se trata de éteres del
glicerol y fitanol (alcohol derivado del isopreno). Una molécula de fitanol (20 C) está
compuesto por 4 moléculas de isopreno (5 C). Por lo tanto, tanto bacterias como en
eucariotas coinciden en los tipos de lípidos, mientras que en arqueas son éteres (no ésteres).
Proteínas periféricas o epiproteínas: Son proteínas que establecen uniones lábiles con el
lado citoplasmático de la membrana, pudiendo establecer a veces incluso contactos
transitorios o pudiendo unirse a los componentes del citoesqueleto. Suelen actuar como
receptores (glucoproteínas) que detectan cambios en el medio ambiente.
La membrana citoplasmática actúa como una barrera selectiva que permite mantener la
constancia del medio interno. Actúa controlando de forma selectiva la entrada de nutrientes y
la salida de productos de desecho y demás secreciones.
11. TRANSPORTE DE SOLUTOS (NUTRIENTES) A TRAVÉS DE LA MEMBRANA
Transporte activo: las bacterias suelen vivir en soluciones diluidas de nutrientes, por lo
que la concentración de los mismos suele ser mayor en el interior celular (no pueden
entrar pasivamente). Además, la membrana celular es impermeable para moléculas
hidrofílicas (ác. orgánicos, azúcares, aa, o macromoléculas), por lo que necesitan ser
transportadas en contra de gradiente mediante un gasto de energía (ATP) y permeasas
(proteínas integrales específicas e inducibles). Distinguimos:
Normalmente los nutrientes/solutos suelen ser transportados al interior de la célula por más de un
mecanismo. De esta manera, si alguno de los sistemas de transporte falla, el nutriente puede seguir
entrando en el entorno celular gracias a los otros sistemas de transporte que sigan funcionando
correctamente.
En todos los tipos de transporte activo vistos hasta el momento, la energía necesaria para la
movilización de los solutos se obtenía a partir de la disipación de un gradiente electroquímico.
Sin embargo, en este caso la energía proviene de la hidrólisis de ATP.
Sideróforos
El Fe es un elemento que suele estar en bajas concentraciones por su baja solubilidad
cuando se encuentra solo (Fe3+). En nuestro organismo, el Fe suele estar unido a proteínas
transportadoras, haciendo que las concentraciones puedan ser mayores.
Las bacterias, que necesitan el Fe para diversas funciones (ej: transportadores de electrones,
citocromos, proteínas sulfoférricas…), cuanto entran a un organismo encuentran un ambiente
con unas concentraciones muy bajas de Fe libre. Por ello, han desarrollado unas moléculas
conocidas como sideróforos, capaces de captar tanto el Fe libre como el unido a proteínas.
Ej: La Micobacterium tuberculosis es una bacteria ácido-alcohol resistente capaz de generar un sideróforo
conocido como micobactina (capta tanto Fe3+ libre como unido a transferrina). Estas M. tuberculosis cuando son
ingeridas por un macrófago pueden interferir en el proceso de fusión del fagosoma en el que se encuentran con el
lisosoma primario. De esta manera quedan en estado de latencia en el interior de la célula hospedadora (obtienen
Fe gracias a la micobactina) y pueden generar tuberculosis mucho tiempo después de la primera infección.
11.3 TRANSPORTE ACOPLADO A TRANSLOCACIÓN DE GRUPOS
Este mecanismo también se denomina fosfotransferencia de azúcares o PTS porque
funciona como una cadena que transporta fosfato de alta energía desde el PEP hasta el
azúcar a transportar.
En este mecanismo de transporte actúan 3 proteínas: Hpr (rica en Hys) y E-I son dos
proteínas citoplasmáticas e inespecíficas, por lo que podrán ser usadas por cualquier azúcar.
Por otro lado, la enzima E-II es una proteína de membrana, específica e inducible, por lo que
deberá haber un tipo de E-II para cada azúcar que se quiera transportar. E-II está compuesto
por 3 subunidades o dominios:
- E-II A: citoplasmático
- E-II B: dominio periférico, ligado al lado citoplasmático de la membrana celular gracias a
que se encuentra unido al dominio E-II C.
- E-II C: dominio insertado en la MC.
Cuando una proteína va a ser secretada de la célula, cuenta con un péptido señal de unos
20-30 aa. En el proceso de exportación, hay enzima conocido como peptidasa señal,
encargada de escindir el péptido señal de la secuencia de la proteína cuando esta va a ser
secretada. Hay dos rutas principales de exportación de proteínas:
Además, las bacterias también cuentan con sistemas específicos desde T1SS hasta T7SS.
Inyectisomas: complejo multiproteico que actúa como sistema de secreción con gasto
de energía. Contiene una serie de proteínas autoensambladas que le permiten anclarse
a la membrana de la bacteria y generan una estructura a modo de canal interno por
donde pasan las proteínas efectoras hacia la célula hospedadora. Por tanto, aparecen
en bacterias patógenas y, en algunos casos pueden inyectar moléculas distintas a
proteínas, como fragmentos de ADN en el caso de Agrobacterium.
Mesosomas: su función no está claramente definida por lo que algunos autores creen
que pueden ser artefactos. Sin embargo, mantienen relación con el proceso de división
celular al colocarse en el tabique de división o con la secreción de determinadas
enzimas. Además, en ellos se puede anclar el cromosoma bacteriano.
Cromatóforos: son estructuras muy heterogéneas relacionadas con la fotosíntesis de
bacterias púrpuras. Se forman cuando se ilumina la bacteria y sobre ellos se colocan
tanto pigmentos antena como centros de reacción. Generalmente permanecen
anclados a la membrana, pero en algunos casos se pueden separar completamente
formando esferas.
Otras invaginaciones: membranas intracitoplasmáticas MIC.
13. CITOPLASMA
Por otro lado, tenemos la proteína Cherry que se aisló del coral Z y tiene una fluorescencia roja
y una estructura en forma de barril beta, formado por láminas beta.
Se trata de una molécula de ADN circular covalentemente cerrada (ccc) formado por un único
cromosoma y otros elementos genéticos como plásmidos, ADN saltarines o fagos. No contiene
una membrana que lo separe del citoplasma y solo contiene un origen de replicación.
Normalmente el ADN se encuentra en la región central del citoplasma y está formado por 60%
ADN, 30% ARN y 10% proteínas.
En cuanto a los plásmidos también son estructuras circulares covalentemente cerradas, aunque
existen bastantes excepciones.
- Girasa o topoisomerasa II: relajante. Está relacionada con las quinolonas que son
antimicrobianos que se utilizan en infecciones urinarias y actúan a nivel de esta enzima.
- Topoisomerasa I: superenrollante. Una de ellas enrolla y la otra desenrolla,
estableciéndose un equilibrio manteniendo óptimamente compactado el cromosoma.
A pesar de no ser homólogas a las histonas sus funciones sí son homólogas y son:
A pesar de que en bacterias existe un único origen de replicación en algunas arqueas se han
encontrado varios. Esto se debe a que en los mecanismos de transcripción y traducción del
genoma hay fuertes semejanzas entre archaea y eukarya, una de ellas es la multiplicidad de
orígenes de replicación. Además de la gran similitud de la ARN-polimerasa entre ambos.
Gracias a esto, la idea de que un archaea fue el ancestro que engulló bacterias para dar lugar a
las células eucarioticas cada vez está más asentada. Esta archaea proporcionó el material
genético del núcleo, es decir, la célula hospedadora original en la que se introdujeron
cianobacterias fue un archaea.
Con respecto a bacterias, presentan una replicación semiconservativa donde a partir de su único
origen de replicación oriC se origina la burbuja de replicación, gracias a las dos horquillas que
avanzan en sentido opuesto hasta encontrarse y completar la replicación del cromosoma. Una
vez se encuentran ambas horquillas los cromosomas hijos se separan.
Existen plásmidos que se replican siguiendo un modelo denominado modelo en sigma o circulo
rodante, también aparece en algunos virus lo que nos sugiere el posible origen viral de los
plásmidos. Por lo que el mecanismo en theta no es el único que existe.
16. PLÁSMIDOS
Los plásmidos son información genética fuera del cromosoma con capacidad para replicarse
autónomamente bajo el control estricto del cromosoma, por lo tanto, se consideran
extracromosómicos y autorreplicativos. La mayoría son de ADN de cadena doble circular
covalentemente cerrada o ccc pero existen algunas excepciones. Su tamaño es muy variado,
desde miniplásmidos hasta megaplásmidos.
Una característica muy especial es que algunos
pueden integrarse o pueden tener dos vidas, una
independiente del cromosoma y otra integrada en
él. Llega un momento en el que el plásmido deja
de ser independiente y se integra en determinados
lugares del cromosoma formando el episoma.
Además, los plásmidos pueden clasificarse según el número de copias que contengan:
- Bajo número de copias: están muy sometidos al control de replicación, tienen un control
muy estricto.
- Alto número de copias: escapan del control de replicación, este control es más relajado.
Existen otros plásmidos que se pueden mover de una célula donadora a una receptora mediante
la conjugación, que es el único proceso considerado como un proceso de sexualidad en bacterias
pues es la transmisión de ADN de una célula donadora a una receptora mediante contacto
estrecho entre ambas células. Es necesario este contacto físico estrecho entre ambas células
para que se produzca este proceso. Los plásmidos que utilizan este sistema de conjugación se
denominan conjugativos. Dentro de este tipo tenemos los plásmidos movilizables que
necesitan de un plásmido conjugativo para transferirse.
Por otro lado, los plásmidos también pueden ser promiscuos que hace referencia a un plásmido
que puede estar en muchas bacterias alejadas filogenéticamente. Si no es promiscuo solo puede
estar en una especie o en un género de bacterias.
Los plásmidos suelen llevar una serie de genes que codifican para una serie de propiedades
fenotípicas que pueden presentar ventajas selectivas en determinados ambientes:
Son entidades genéticas no autorreplicantes que forman parte del genoma, y se transponen o
saltan de un lugar a otro del genoma. No son necesarios puesto que la información que codifican
no es imprescindible para la célula, pero dan lugar a genes que se activan e inactivan debido a
la actividad de estos elementos. Además, aportan plasticidad genética. Existen varios tipos:
- Secuencias de inserción: son los más elementales y sencillos. También se les denomina
ADN egoísta pues no codifican para ningún gen y su única misión es saltar de un lado para otro
del genoma, teniendo unas consecuencias. Están formados por repeticiones invertidas de ADN
que flanquean al gen de la transposasa que codifica la transposición o salto de un lugar a otro
del genoma. Son de pequeño tamaño, en torno a 700pb y se integran en elementos genéticos
con una corta secuencia de ADN que reconoce esta enzima que se inserta en ese lugar y pega lo
que ha cortado. No hay ningún otro factor o carácter que codifique la secuencia de inserción.
- Transposones (Tn): son más complejos. Están rodeados de repeticiones invertidas que
pueden sencillas o secuencias de inserción como IS50L e IS50R. Entre las dos repeticiones
invertidas existen una serie de genes que confieren una serie de propiedades fenotípicas. El TN5
tiene genes para la resistencia a vancomicina, estreptomicina y bleomicina por lo que codifica
características fenotípicas a diferencia de las secuencias de inserción. Esto es lo que codifica la
resistencia a estos antibióticos puesto que le confiere una resistencia a las bacterias.
- Islas genómicas: mayor grado de complejidad. Son grandes trozos de ADN de hasta
500 kb flanqueados por copias directa de una secuencia corta no invertida. Se insertan cerca de
ciertos genes por los que tienen predilección, como los del ARNt. Portan genes para la
integración y se transmiten en bloques por conjugación, pudiendo conferir un fenotipo
adaptativo. Pueden parecer transposones atípicos.
17.1 CÓMO ES UNA ISLA GENÓMICA
Las islas genómicas están formadas por un gen de la integrasa que codifica la interacción de la
isla en un lugar determinado del genoma, genes que confieren una ventaja adaptativa y, en
ocsaiones, secuencias de inserción. Todo ello flanqueado por repeticiones directas.
No es una tarea fácil y se hace con ayuda de instrumentos bioinformáticos que barren los
genomas de dos cepas muy similares que presenten una discordancia entre ellas. Como por
ejemplo, repeticiones directas donde en un caso no hay nada entre ellas y en el otro tenemos
integrasas, transposasas, secuencias de inserción, etc.
17.1.1 TIPOS DE ISLAS GENÓMICAS SEGÚN LAS VENTAJAS ADAPTATIVAS QUE CONFIEREN
Las islas de estos patógenos animales codifican para toxinas, adhesinas y sistemas de secreción
que les permiten unirse al hospedador y el paso de moléculas efectoras del citoplasma de la
bacteria al hospedador donde realizan su función, facilitando la vida a la bacteria.
- Isla de patogenicidad en plantas: entre las bacterias que las contienen encontramos
Erwinia y Xanthomonas.
Son sistemas que tiene la bacteria para defenderse de la entrada de ADN ajeno. Le permiten
reconocer los ADN propios de los extraños, destruyéndolos o recombinándolos.
Esto tiene gran relevancia en el campo de la ingeniería genética y la biología molecular pues son
herramientas indispensables para poder trabajar con los genomas, cortando trozos de ADN de
interés e introduciéndolos en otros organismos para generar seres vivos modificados
genéticamente.
En este apartado se hace referencia a las diferencias entre procariotas y eucariotas y entre
bacterias y archaeas. Hay características de las archaeas que los asemejan más a eucariotas que
a bacterias, estas hacen referencia a la organización y expresión del genoma, por tanto, hoy en
día hay una corriente de evidencias de que la célula inicial que albergó los eventos de simbiosis
podía ser una archaea muy primitiva.
- Los genes bacterianos están agrupados en operones que son unidades transcripcionales
sometidas a un mismo control, se transcriben a la vez bajo el control de un promotor.
- La composición y arquitectura del ribosoma se asemeja más entre archaeas y eucarias: Los
ribosomas de eucariotas son 80S y los de archaeas y bacterias son 70S por lo que se podría
pensar que estos dos últimos son más semejantes, pero cuando se estudian a fondo se ve que
tienen importantes diferencias en cuanto a composición y estructura, por ejemplo, el codón
inicial en bacterias es la formilmetionina mientras que en archaeas y eucariotas es la metionina.
Por tanto, se puede afirmar que el ribosoma eucariótico es una quimera puesto que tiene partes
eucarióticas propias y partes bacterianas y arqueanas.
- PROMOTOR:
El promotor es una secuencia de 35-40 bases que contiene secuencias consenso reconocidas
por el factor sigma de la ARN-polimerasa facilitando su unión al gen que se va a transcribir. Las
secuencias consenso son muy parecidas en todos los promotores de todos los genes y aparecen
en las posiciones -10 (Caja TATA) y -35.
- ARN-POLIMERASA:
La ARN-polimerasa es una enzima formada por diversas subunidades y factores ente los que
destaca el factor sigma que se une al promotor facilitando la transcripción. En el caso de
bacterias es mucho más sencilla que en eucaria y archaeas. Esto es otra evidencia de la similitud
entre eucaria y archaea puesto que se asemejan mucho en cuanto a los mecanismos de
traducción y transcripción.
En esta imagen apreciamos las similitudes
estructurales con respecto a la ARN-
polimerasa de eucaria y arqueas.
Todo esto son evidencias que apoyan la hipótesis de que un ancestro archaea primitivo podría
haber sido el que realizó la endosimbiosis y, por tanto, aportaría la mayor parte del núcleo de
eucariotas. Esta hipótesis también se apoya en el hecho de que en la replicación del cromosoma
bacteriano solo hay un punto de iniciación de replicación desde donde se forma una doble
horquilla que avanza en sentido contrario. En cambio, en arqueas en algunas se han encontrado
varios orígenes de replicación como en cromosomas eucariotas.
Son estructuras del interior del citoplasma que presentan algunos procariotas y tienen función
de reserva energética o de nutrientes. Se pueden dividir según su origen:
Son acúmulos de polifosfato osmóticamente inerte que pueden llegar a ser fuente de energía
en sustitución del ATP.
Hay una serie de gránulos citoplasmáticos bastante relevantes en las bacterias, aunque no
siempre aparecen todos en todas ellas y son bastante importantes para las células que los
contienen.
Las bacterias que las contienen suelen ser fotosintéticas acuáticas que les sirve
para desplazarse en un gradiente de luz en el ambiente acuático y colocarse en
el lugar donde la llegada de luz sea la óptima para ellos. No todos utilizan el
mismo tipo de luz o con la misma longitud de onda, por tanto, es importante
colocarse dentro de un gradiente vertical en la posición donde está la luz que
ellos pueden utilizar.
- Magnetosomas: orgánulos que actúan como sensores del campo magnético terrestre.
Están rodeados de una membrana similar a la citoplasmática y en su interior encontramos
productores de óxido magnético de hierro y una proteína que sintetiza la magnetita.
Los contienen las bacterias magnetotácticas que tienen generalmente morfología bacilar y los
magnetosomas se disponen generalmente formando hileras que siguen el eje mayor de la célula
o eje longitudinal lo que les permite orientar a la bacteria siguiendo el campo magnético
terrestre. Gracias a esta capacidad provoca que se hundan en los fondos de los ambientes
acuáticos donde encuentran las condiciones óptimas para vivir.
Finalmente, el amonio es oxidado hasta nitrógeno molecular que es inerte y sale al exterior.
- Flagelos: estructura muy peculiar que contiene los elementos de un motor fabricado
por los procariotas hace miles de millones de años.
- Pelos: fimbrias de tipo IV que les permite moverse a sacudidas puesto que se extienden
y se retraen.
- Deslizamiento por secreción de moco: en un polo secretan cintas de moco que les
impulsa permitiendo que se muevan en el sentido contrario a la secreción.
- Deslizamiento por trinquete: sigue el mismo sistema que utilizan los tanques de guerra
para moverse.
Existen otros movimientos como la movilidad que impulsan las vacuolas de gas porque mueven
las bacterias en un gradiente y la orientación por magnetosomas aunque la profesora no lo
considera movilidad.
Para moverse en el interior utiliza el sistema de polimerización de la actina celular y crea colas
de actina a modo de colas de cometa. La polimerización de la actina en esas colas es lo que va
empujando a esta bacteria, moviéndose de una célula a otra, invadiendo las células del epitelio
intestinal y, finalmente pasa a la sangre.
Este mecanismo de movimiento intracelular no solo lo realiza esta bacteria, lo realizan otros
patógenos celulares.
Tricos significa pelo. Las bacterias según sus patrones de flagelación pueden ser:
- Inserción lateral
Son bacterias muy potentes, y se piensa que están cubiertas de envueltas externas. Los flagelos
presentan un engrosamiento o capuchón al final del filamento para conseguir una mayor
protección del ambiente del estómago y así evitar que se desorganice.
El flagelo es una de las estructuras procarióticas más complejas. Tiene los componentes básicos
de un motor (como los que fabricamos los humanos). Consta de varias subestructuras, con unas
20 proteínas. La proteína mayoritaria es la flagelina.
Tiene tres partes principales:
En Gram + y - el flagelo es similar, pero cambia el aparato de inserción o cuerpo basal, por la
diferencia entre las envueltas de los dos tipos de células.
En Gram - hay un sistema de inserción a la membrana externa, otro que interacciona con el PG,
y otro con la membrana citoplasmática. En Gram + solo hay anclaje a la membrana citoplásmica.
Filamento:
El filamento está formado por una única proteína llamada flagelina (salvo en el extremo distal
que hay otra). Es una proteína globular que se dispone en filas paralelas al eje que dejan un
hueco en el centro. Ese hueco se prolonga a través del gancho y continúa por el aparato de
inserción del cuerpo basal.
El filamento está formado por unidades de flagelina que dan lugar a una estructura cilíndrica
hueca (con un canal interior de 20 A) con 11 hileras o fibrillas. Se encuentra unido al gancho en
su parte inferior.
El filamento es muy rígido, de forma que durante el movimiento del flagelo solo se producen
pequeñas deformaciones y no cambian los parámetros ni la longitud de la hélice.
Codo:
Cuerpo basal:
El cuerpo basal ancla el flagelo a la célula y contiene los componentes necesarios para que se
mueva, como el motor rotatorio y el conmutador que cambia el sentido de giro. También alberga
el aparato para la secreción y el ensamblaje correcto de la mayor parte del flagelo. Se continúa
con el canal que atraviesa el codo.
A la derecha vemos una imagen del cuerpo basal a ME. Nos recuerda en estructura al
inyectisoma, pero no inyecta nada. El sistema de secreción de proteínas es tipo III, pero en este
caso no se utiliza para inyectar moléculas en el hospedador, sino para exportar las proteínas que
forman el filamento hacia el ápice donde se ensamblan.
Hay una serie de anillos de proteína que se anclan a estructuras de la célula; se llaman L, P, SM
y el anillo C. El anillo L se asocia con la membrana externa de lipopolisacáridos, el P se asocia con
la pared celular de peptidoglicano, el MS se inserta en la membrana plasmática, y el anillo C se
une a la membrana plasmática por debajo de esta. Las Gram positivas solo presentan los anillos
MS y C.
Vemos el estator (fijo) que tiene en su interior un rotor. El rotor gira ya que a través del estator
se disipa el gradiente de protones (entran desde el exterior de la célula) y sufre un cambio
conformacional, que se transmite al rotor, que es la parte móvil.
Las proteínas MotA y MotB se encuentran a ambos lados de la membrana plasmática y son
aquellas a través de las que se disipa el gradiente de protones, suministrando la energía
necesaria al motor para que el rotor se mueva y pase el movimiento del cilindro que atraviesa
la estructura al gancho, y de ahí al filamento.
También tiene un conmutador de giro, que le permite girar contrarreloj y a favor de las agujas
del reloj. Hay una regulación compleja del giro que se da por metilaciones de las proteínas
Por defecto el rotor gira en contra de las agujas del reloj (CAR) y todos los
flagelos se amontonan en la misma dirección, dispuestos en forma de
manojo. Se producen carreras en línea recta.
El movimiento de los flagelos permite a las bacterias realizar taxias, que son movimientos de la
célula dirigidos hacia un estímulo o en contra de este (si la perjudica). Es por tanto un
movimiento en respuesta a un estímulo.
Se trata de un
mecanismo complejo
que funciona con
enzimas metilasas. Se
percibe este gradiente
y se transmite la señal
hasta las proteínas del
motor flagelar, lo que
determina el
alejamiento o el
acercamiento según el
estímulo.
Este movimiento no es
muy eficiente ya que
no realizan un
movimiento directo
hacia el estímulo
Las bacterias móviles por flagelos son muy rápidas. Se mueven a 12000 rpm y pueden
desplazarse a una velocidad punta de 60 veces su tamaño corporal
Son propios (y casi exclusivos) de Gram –. Son de naturaleza proteica, hechas de pilina; pero en
vez de crecer por el extremo distal o ápice, crecen por la base.
Son apéndices filamentosos más largos, gruesos (de 10 nm) y flexibles que las fimbrias. Son
menos numerosos (puede haber de 1 a 10 por bacteria). Están codificados por genes en
plásmidos (porque la conjugación no es un proceso fundamental para la vida de la bacteria) y su
función es permitir el contacto entre una célula donadora y otra receptora en la conjugación.
Son huecos y presentan un canal central. Algunos de ellos son usados como receptores por
ciertos fagos.
A través de los pelos sexuales (reconocen receptores en la célula receptora para formar parejas
adecuadas) se establece contacto entre las dos células, y se va despolimerizando la pilina para
acercarlas hasta tomar estrecho contacto físico (No se pasa ADN por el interior del pelo). El
contacto íntimo es necesario para transferir el plásmido.
En algunas arqueas existen unos apéndices filamentosos con forma de gancho como el de los
piratas. El filamento tiene un alambre de púas y acaba en el gancho, que actúa como adhesivo
para establecer contacto con sustratos (vivos o inertes) y anclarse. Su singular es hamus.
22.1.5 PROSTECAS
Las prostecas son prolongaciones semirrígidas del citoplasma (materia viva) que emergen del
cuerpo de la célula y están rodeadas por las mismas envueltas que esta (membrana y pared).
Son de menor diámetro que el cuerpo de la célula.
Hay bacterias que solo producen la prosteca cuando el medio es muy pobre o tienen carencia
de algún nutriente. Se ha visto que se da presencia de permeasas y sistemas de captación de
nutrientes muy eficaces.
Vamos a ver las formas de diferenciación de la célula procariota, que son formas de células
diferentes a la habitual que desarrolla la bacteria cuando está en un medio adecuado. Muchas
son formas de criptobiosis
Criptobiosis: Estado con suspensión de los procesos metabólicos, en el que algunos seres vivos
entran cuando las condiciones medioambientales llegan a ser extremas. Un organismo en
estado criptobiótico puede vivir indefinidamente hasta que las condiciones sean habitables de
nuevo.
Criptobiosis significa vida escondida. Son estados para permanecer vivos pero metabólicamente
inactivos hasta que las condiciones del medio se restablecen (en situaciones desfavorables o
falta de nutrientes). Podríamos pensar como ejemplo la hibernación de los osos.
Las mixobacterias tienen un ciclo de vida en el que se alterna vida vegetativa con vida normal.
Hacen un ciclo celular normal pero si en un momento dado hay una bajada de nutrientes (por
ejemplo de N) en un medio sólido, la bacteria migra a unos focos y forman elevaciones en el
terreno llamados cuerpos fructificantes. Es un movimiento social de miles de células en un
medio con falta de nutrientes que confluyen para formar dicha estructura.
En esos cuerpos se forman las mixosporas (Tienen tallo y lóbulos, y en los lóbulos están las
mixosporas), que son células que forman unas cubiertas más compactas para poder resistir a
ambientes desfavorables.
Hay otras formas de diferenciación metabólica como los heteroquistes, que son
células especializadas en la fijación de nitrógeno en cianobacterias filamentosas. Lo
almacenan como gránulos de cianoficina. Se ve en el dibujo de la derecha, con
gránulos refringentes.
23.1. ENDOSPORAS
Es una estructura muy resistente al calor (Por eso son criterio de esterilización
de naves espaciales). Son las formas de vida más resistentes. Pueden
sobrevivir largos periodos en ausencia de nutrientes y es resistente a varios
estreses ambientales.
Epulopiscium (una bacteria gigante, que se ve casi a simple vista) se aisló en el intestino de un
pez. Metanobacterium por esporas en el intestino de cobayas.
o Terminales
o Subterminales
o Centrales
o Laterales
Las esporas son mucho más refringentes (más densas y deshidratadas que la célula madre) en
contraste con el citoplasma de la célula madre, en tinción normal. Se distinguen bien en el
microscopio de contraste de fase.
Presentan SASP, que son pequeñas proteínas ácido solubles, y factores que determinan la alta
resistencia a la resistencia ultravioleta (protegen el ADN de mutaciones por radiación). También
se acumula 3-PG en la espora y es fuente de energía en la germinación.
Estructura:
El protoplasto no tiene ARNm, pero tiene inmovilizados todos los componentes necesarios para
la transcripción y traducción (ARNt, ARN Pol, ribosomas, cromosoma…) en la red de dipicolinato
cálcico, para cuando tenga que germinar poder empezar a sintetizar proteínas sin tener que
crear todos los elementos necesarios para la síntesis. No hay enzimas biosintéticos ni materiales
propios de metabolismo activo como aa, dNTPs, cofactores…
Es muy deshidratado y compactado. Forma un gel con un 10-30% agua. Presenta gran cantidad
SASP, que se unen al ADN y lo protegen de la radiación UV.
Los iones de Ca+ unen moléculas de ácido dipicolínico, formando de esta manera una red.
El calcio de la red de dipicolinato entra en la
célula atraído por este compuesto (actúa como
agente quelante) desde la corteza. Como la
corteza está formada por PG modificado, que
mantiene sus cargas neutralizadas con calcio, al
ser este atraído hacia el dipicolinato, se produce una expansión por repulsión de cargas (de
cargas negativas del PG que ya no tiene cationes) con los componentes de la corteza, lo que
aumenta la presión sobre el protoplasto y hace que salga agua. (Se hincha la corteza y reduce el
espacio del protoplasto)
Fase 1: Formación del filamento axial. La célula acaba de dividirse. Las dos copias del
cromosoma (que tiene la célula por su ciclo celular) se alinean longitudinalmente siguiendo el
eje mayor de la célula y forman el llamado filamento axial. Se forman dos esbozos de tabique de
separación, uno en cada polo, rodeados de invaginaciones de membrana plasmática.
En algunas bacterias, en ese punto se empiezan a dar dos procesos importantes para la
biotecnología: formación de antibióticos peptídicos y de enzimas extracelulares o exoenzimas
despolimerizantes (amilasas, proteasas…). Se produce de forma paralela al proceso de
esporulación. Los antibióticos y exoenzimas no son necesarios para la esporulación pero
favorecen la supervivencia de la endospora.
Fase 2: Etapa de formación del septo. De los dos primordios de tabique, solo uno de ellos se
completa y da lugar a la preespora; el otro se degenera. Se puede formar en diferentes zonas de
la célula y rodea a una copia del cromosoma. La otra copia queda en la célula madre. Se siguen
produciendo antibióticos y enzimas, entre ellas una de las más importantes para la germinación:
La alanina-deshidrogenasa
Hay algunas bacterias que forman dos esporas, de manera que no se produce el aborto de la
otra invaginación, pero esto en bacillus no ocurre.
Fase 3: Englobamiento de la preespora por la célula madre. Al final, la célula madre cubre con
su membrana a la espora, dejándola con dos membranas (una interna y otra externa) con
polaridad opuesta. Entre ellas hay capas de PG o similar que van a dar lugar a otras envueltas de
la espora.
La célula madre dirige los procesos para que se forme la espora madura. Sintetiza todos los
factores y proteínas necesarias para que madure. (Deshidratación de protoplasto y formación
de envueltas)
Fase 4: Formación de corteza y exosporio (si existe). Se sintetiza el dicolinato, que atrae el calcio
y cationes (Cuando pone ADP se refiere a ácido dicolínico) de la corteza, produciendo su
acumulación. Aumenta la refractibilidad de la espora, ya que pierde agua y aumenta su densidad
Hay síntesis de la toxina cry o Bt, también de interés biotecnológico (se usa como bioinsecticida)
Fase 7: Lisis de las envueltas de la célula madre. La espora queda libre fuera del esporangio,
con todas sus capas y cubiertas
Hasta la fase cuarta o quinta, puede seguir siendo reversible si se aportan nutrientes. A partir
de 6, se hace irreversible. Después de la última fase, la espora puede entrar en un periodo
germinativo, cuando la presencia de nutrientes vuelva a ser la adecuada en el medio.
- Resistencia a los rayos UV: Se da la absorción de radiación UV por las cubiertas, el DPC,
la deshidratación del protoplasto. Las proteínas SASP tienen gran importancia en la
protección del ADN
En la imagen vemos la
estructura de los dímeros de pirimidina. Si son muy abundantes la célula muere porque no
permiten la replicación del ADN. En menor número dan lugar a mutaciones de genes. Debajo
vemos el fotoproducto de la espora, que puede volver a la normalidad con la liasa
La especie más conocida que los produce es Bacillus thuringiensis, pero hay otras como B.
popiliae.
La toxina activada interacciona con receptores de las células intestinales. Se agregan varias
unidades de toxina y forman poros en la membrana de estas células, lo que cambia el tránsito
de agua y electrolitos y lleva a la muerte celular
23.2 DIFERENCIACIÓN EN STREPTOMYCES
Hay otros tipos de criptobiosis no tan extremas. Por ejemplo, las esporas de Streptomyces
(Bacterias Gram + del grupo de las actinobacterias), forman un micelio de sustrato ramificado
cenocítico cuando hay limitación de nutrientes. Las células se arrugan formando filamentos
ramificados.
Inicialmente forman un micelio incluido en el sustrato o micelio vegetativo; y cuando hay una
limitación de nutrientes en el sustrato, se forma un micelio aéreo, en el que se producen
exosporas.
En los extremos de las hifas aéreas, las células se diferencian en cadenas de esporas inmóviles
(conidiosporas). Las células más pequeñas van a reforzar las cubiertas y se van a formar esporas.
Su nivel de diferenciación es menor que el de las endosporas. Tiene casi el mismo PG, pero no
hay cubierta ni corteza. Tiene unas envueltas proteicas muy hidrofóbicas que le dan resistencia
a calor y desecación. Son células de reposo (metabólicamente inactivas)
Resisten más al calor y a la desecación que las células vegetativas, pero menos que las
endosporas.
A la izquierda de la
imagen tenemos
colonias de una
especie de
Streptomyces
(Coelicolor: Color de
cielo). A veces se
puede confundir con
colonias de hongos,
por su aspecto
aterciopelado, que le
da el micelio aéreo;
pero son más
pequeñas que las
colonias de hongos.
Debajo vemos el micelio vegetativo o del sustrato abajo, y por encima el micelio aéreo. En el
extremo del micelio aéreo se va a producir un reforzamiento de las envueltas de las células y la
formación de cadenas de esporas como las de la imagen de la derecha. Vemos además la red de
proteínas hidrofóbicas que envuelve a las esporas de Streptomyces.
Algunos se pueden confundir con hongos, pero al microscopio no existe esta duda, porque en
este último caso las hifas son mucho más grandes. Las esporas pueden volver a formar la
estructura vegetativa.
Las cianobacterias son fotótrofas y tienen el mismo sistema de fotosíntesis que las plantas con
tilacoides (Con PSI y PSII. En este último se produce la fotolisis del agua con liberación de
oxígeno). Los heteroquistes no tienen ficobilisomas ni PSII para que no se forme oxígeno, como
forma de defensa contra este.