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ENZIMAS
ENZIMAS
• Las enzimas catalizadores de las reacciones
químicas en los seres vivos. Sustancias que, sin
consumirse en una reacción, aumentan notablemente
su velocidad.
Sin enzima
Con enzima
• La Ea de la hidrólisis de la
urea baja de 30 a 11 kcal/mol
con la acción de las enzimas,
acelerando la reacción 1014
E+S • El aumento de temperatura
necesario para producir la
reacción no catalizada seria
de 529ºC
E+P
Tiempo de la reacción
ENZIMAS
Las enzimas se unen a los reactivos
(sustratos) reduciendo la energía de
activación
Sustrato
Sitio activo
Enzima - Catalizador
Tanto la enzima como el catalizador aceleran la
velocidad de una reacción química.
Una enzima puede transformar 1000 moléculas
de sustrato/ segundo
Las enzimas tienen 3 propiedades que los
catalizadores NO tienen
– Especificidad por el sustrato
– Se inactivan por desnaturalización
– Pueden ser reguladas
Las enzimas cumplen su papel catalítico gracias
a:
• Fijación estereoquímicamente complementaria
del substrato
• Transformación catalítica del mismo
Grupos
Número Enzyme Commission:
químicos
Enzyme EC 2.7.1.1 Enzimas
Comission Subgrupo
Grupo
EC 1.x Oxidorreductasas
EC 2.x Transferasas
EC 3.x Hidrolasas
EC 4.x Liasas
EC 5.x Isomerasas
EC 6.x Ligasas
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Catalizan reacciones de oxidorreducción, en que átomos de
oxigeno ó hidrogeno son trasladados entre moléculas:
AH2 + B A + BH2
Dador Aceptor
Nombre común:
Glucosa oxidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 1: Oxidorreductasas
Nomenclatura del subgrupo en oxidorreductasas:
EC 1.1.x - Deshidrogenasas
EC 1.2.x - Oxidasas
EC 1.3.x - Peroxidasas
EC 1.4.x - Oxigenasas
EC 1.5.x - Hidroxilasas
EC 1.6.x - Reductasas
etc.
Aplicaciones: Ensayos de diagnostico clínico (glucosa oxidasa y colesterol
oxidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 2: Transferasas
Catalizan reacciones de transferencia de átomos ó
grupo de átomos entre moléculas:
A-X + B A + B-X
A-B A+B
Ejemplo
Nombre sistemático:
Histidina amonio-liasa (EC
4.3.1.3)
Nombre común:
Histidasa
Clasificación y nomenclatura
Grupo 5: Isomerasas
Catalizan reacciones de isomerización moleculares
A B
Ejemplo:
Glucosa isomerasa (EC
5.3.1.5)
Clasificación y nomenclatura
Grupo 6: Ligasas
Catalizan la unión de dos grupos químicos a expensas
de la hidrólisis de un nucleótido trifosfato (ATP, GTP, etc.).
Nombre sistémico:
G-L-glutamilo-L-
cisteina:glicina ligase
PROPIEDADES DE LAS ENZIMAS
• pH
• Temperatura
• Cofactores
Efecto del pH sobre la actividad enzimática
Efecto del pH sobre la actividad enzimática
Las enzimas poseen grupos
químicos ionizables
(carboxilos -COOH; amino
-NH2; tiol -SH; imidazol, )
APOENZIMA
El NAD es una coenzima aceptora de H
Sustrato
oxidado
Algunas enzimas requieren metales para mejorar su
actividad
CINÉTICA ENZIMÁTICA
1. La cinética enzimática estudia la velocidad de las reacciones
catalizadas por enzimas. Estos estudios proporcionan
información directa acerca del mecanismo de la reacción catalítica
y de la especifidad del enzima. No es necesario purificar o aislar
la enzima.
2. La medida se realiza siempre en las condiciones óptimas de pH,
temperatura, presencia de cofactores, y se utilizan concentraciones
saturantes de sustrato.
3. En estas condiciones, la velocidad de reacción observada es la
velocidad máxima (Vmax). La velocidad puede determinarse bien
midiendo la aparición de los productos o la desaparición de los
reactivos.
Complejo enzima-sustrato
La cinética es el estudio de las velocidades de reacción y los
principios que permiten comprender como suceden las
reacciones.
Michaelis y Menten (1913) realizaron estudios de
comportamiento enzimático, con un extracto de levaduras ricas
en invertasa, enzima que cataliza la hidrólisis de la sacarosa.
Cuando la concentración de la enzima se mantuvo constante y
se hizo variar la cantidad de sustrato, lo que se observó fue una
relación hiperbólica entre la velocidad y la concentración del
sustrato:
k1 k3
E+S ES P+E
k2
Baja
concentración
de sustrato
ALTA
concentración
de sustrato
SATURACION
Una cinética hiperbólica implica un proceso saturante:
k+1 k+2
E+S ES E+P
k-1
Ecuación cinética de Michaelis-Menten
Vo= Vmax[S]
Km + [S]
0.24 cálculo del valor asintótico
Vmax
0.2
Velocidad inicial (Vo)
0.16
Vmax/2
0.12
0.08
0.04
0
0 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10
Vmax/2
La Km es la concentración de sustrato
donde se obtiene la mitad de la Vmax
Vmax
Vmax/2
1/Vmax
1 K m 1 1
-1/Km
v V mx s V mx
Número o Índice de Recambio
Velocidad a la cuál las moléculas de S se
convierten en producto por molécula de E,
cuando funciona a su Vmáx
kcat = Vmáx / [E]
E+I EI
ES + I ESI
0.07
1/v
0.06
0.05
0.04
0.03
1/Vmax
0.02
-1/Km 0.01
1/s
0.00
-0.3 -0.2 -0.1 0.0 0.1 0.2 0.3 0.4 0.5 0.6
-1/(Km
Ácido Fólico y Sulfanilamida
La sulfanilamida es un análogo estructural del
ácido p - aminobenzoico (PABA)
PABA es el punto de partida para la síntesis de
ácido fólico en las bacterias
El ácido fólico es una vitamina esencial para la
proliferación (división) bacteriana
Sulfanilamida se usa en el tratamiento algunas
infecciones
Inhibición NO competitiva
Inhibidor No Competitivo
Se une a un lugar diferente del sitio activo
la enzima
Se une a la enzima libre y también al
complejo enzima-sustrato
Por acción del inhibidor disminuye la V máx
pero el valor de Km no se altera
Inhibición acompetitiva
Inhibidor Acompetitivo
Se une a un lugar diferente del sitio activo
de la enzima
Se une sólo al complejo enzima-sustrato
Los efectos que tiene: disminuye el valor
de Km y también el de Vmáx
Inhibidor Acompetitivo
El inhibidor Acompetitivo se une a la enzima en un sitio
diferente del sitio activo
Inhibición Irreversible
- Los inhibidores irreversibles reaccionan con un grupo
químico de la enzima, modificándola covalentemente
2. Organofosfóricos
3. Ligandos de metales
4. Metales pesados
Efectos de los inhibidores sobre
constantes cinéticas
* ALOSTERISMO
MODIFICACIONES
SOBRE LA ENZIMA
EXISTENTE
a) FOSFORILACIÓN
*REGULACIÓN COVALENTE
b) PROTEÓLISIS
ISOENZIMAS
MODIFICACIONES
PARA CAMBIAR LA * SÍNTESIS b) SÍNTESIS DE LA PROTEÍNA
CANTIDAD DE EN EL RIBOSOMA
ENZIMA
SUSTRATO
SITIO CATALITICO
ENZIMA
SITIO REGULADOR
Ligando o efector o regulador
alostérico
SUSTRATO
SITIO CATALITICO
ENZIMA
Sitio Regulador
Ligando o efector o regulador
alostérico + o -
+ Sitio alostérico
(es específico)
Actividad enzimática
Ligando o
Regulador o Efector
alostérico
(específico) - Sitio alostérico
(es específico)
Actividad enzimática
LAS ENZIMAS REGULADAS ALOSTÉRICAMENTE NO SIGUEN LA CINÉTICA
DE MICHAELIS-MENTEN
Conforme se le une su sustrato
está en estado “relajado”
LA TRANSICIÓN DE T a R
VELOCIDAD
SUSTRATO
TRANSICIÓN DEL ESTADO T AL R EN LA HEMOGLOBINA
Eventos en la transición alostérica
Efector Unión a la enzima Inducción de
Alostérico (Sitio alostérico) Cambio conformacional
+ ó -
Transmisión a través
De la enzima hasta
El Sitio catalítico
E
A+B C
REGULACIÓN POR FEEDBACK (RETROALIMENTACIÓN )
ENZIMA FOSFOENZIMA O
DEFOSFORILADA ENZIMA FOSFORILADA
MODIFICACIÓN EJEMPLO DE
PROTEÍNA
MODIFICADA
Fosforilación Piruvato cinasa
Acetilación Histonas
Miristilación Src
ADP-ribosilación RNA polimerasa
Farnesilación Ras Trombina
γ-Carboxilación Fibrinógeno
Sulfatación Ciclina
Ubiquitinación
Las cinasas o fosforilasas toman el Pi del ATP, al que hidrolizan
en ADP+Pi y este Pi es transferido a la enzima que es sustrato de la cinasa
ATP ADP+ Pi
CINASA o Pi
Sitio de fosforilación
FOSFORILAS
ENZIMA
DEFOSFORILADA
A Pi
ENZIMA FOSFORILADA
Pi
ACTIVA FOSFATASA INACTIVA
COOH
COO-
+ NH2
PROCESAMIENTO
COOH
PRECURSOR
(INACTIVO) O FORMA MADURA
PROTEÍNA INMADURA (ACTIVA)
ZIMÓGENO
ISOFORMAS O ISOENZIMAS O ISOZIMAS
•Por eso, las isoenzimas son otras formas de expresar una actividad
enzimática regulada
Agricultura
Rhyzobium
Medicina
Transaminasas
Industria
Farmacéutica
Penicilina
RESUMEN
Las enzimas son proteínas que catalizan las
reacciones biológicas
Presentan especificidad por su sustrato