QUÍMICA ENZIMÁTICA

NOMENCLATURA

2
 Nomenclatura de los enzimas

a. Un código de clasificación de 4 cifras

1er término: Clase
2o término: Subclase
3er término: Sub-subclase
4o término: Número serial.

b. Un nombre sistemático consta de dos partes

La primera nombra al sustrato
La segunda indica el tipo de reacción que cataliza
terminada en asa

c. Un nombre recomendado

Ej. La enzima que cataliza la fosforilación de la glucosas

D-glucosa + ATP D-glucosa-6-fosfato+ ADP

Código: EC 2.7.1.2.

Clase 2:Es una reacción de transferencia.

Subclase 7: El grupo transferido es un fosfato
Sub-subclase: Un –OH es el aceptor
Número serial 2: Denota al enzima( El enzima que cataliza la
transferencia de un fosfato del ATP al –OH unido en posción
6 de la D-glucosa.

Nombre sistemático: ATP: D-glucosa fosfotransferasa.

Nombre recomendado: Hexoquinasa o Glucoquinasa.

 Clasificación de los enzimas

Clase 1: Oxido reductasa. Catalizan reacciones de oxido reducción

Ej. La alcohol :NAD oxidoreductasa cataliza la oxidación de un
alcohol a aldehido
H O

R C O H + NAD+ R C H + NADH+ H+

Clase 2: Transferasa. Catalizan en las cuales un grupo que

contiene C,N,P o S se transfieren de un sustrato a otro.

2.1 Transaminasa: Transfieren grupos aminos desde un aminoácido

a un cetoácido aceptor
Ej. Aminotrasferasa
Ac. L-glutámico + Ac. Pirúvico  Ac a-cetoglutárico + L-alanina.

2.2. Quinasas: Catalizan reacciones donde se transfiere un grupo

fosfato desde el ATP o nucleósido trifosfato agrupos aceptores
alcohol o amino
Ej. Glucoquinasa
ATP + D-Glucosa  ADP + D-Glucosa-6-Fosfato

2.3 Glucosiltransferasas: Catalizan reacciones de transferencia

de grupos glucosilos activado a un glucógeno iniciador.

UDP-Glucosa + Glucógeno iniciador  Glucógeno prolongado + UDP

 

 
 Clasificación de los enzimas

Clase 3: Hidrolasas. Catalizan reacciones donde el grupo dador se

transfiere al agua, la reacción implica rotura hidrolítica de enlaces
C-O, C-N, O-P, C-S
Ej. Rotura del enlace peptídico(Peptidasa)
O O

R1 C NH R2 + H2O R1 C OH+ N R2
H
2

Clase 4: Liasas. Catalizan reacciones de ruptura de dobles enlaces

o formación de dobles enlaces eliminando grupos
4.1 Descarboxilasas: Eliminan los elementos del CO 2 de un  y -
cetoácidos
Ej. Piruvato descarboxilasa
O O O

CH3 C C 0- + H+ CH3 C H + CO2

Piruvato Acetaldehido

4.2 Deshidratasas: Eliminan los elementos de agua en una

reacción de deshidratación.
Ej Citrato deshidratasa.
Citrato  cis-Acanitato + H2O
 Clasificación de los enzimas
Clase 5: Isomerasas. Catalizan arreglos moleculares.

5.1 Epimerasas o racemasas. Catalizan inversión en carbonos

asimétricos
CH2OH CH2OH

C=O C=O

H-C-OH H-C-OH
Epimerasa
H-C-OH HO-C-H

CH2OP CH2OP

D-Ribulosa 5 Fosfato D-Xilulosa 5 Fosfato

5.2 Mutasas: Catalizan la transferencia intramolecular de un

grupo tal como el fosforilo
Ej. Fosfoglicerato mutasa.
2-Fosfoglicerato  3-fosfoglicerato

Clase 6. Ligasas. Catalizan reacciones de formación de enlaces

entre dos moléculas de sustrato a expensas de la hidrólisis de un
enlace fosfato de alta energía
Ej. Piruvato carboxilasa
 
HCO3- + Piruvato + ATP  Oxalacetato + ADP + Pi
NOMENCLATURA DE LAS ENZIMAS:

Nomenclatura: el nombre aplicado a las enzimas derivan del sustrato

sobre el que actúan, al que se añade la terminación “asa”. Así, las
carbohidrasas actúa sobre los carbohidratos; las fosfatasas sobre los
fosfatos, etc. Se diferencian además diversos nombres especiales
instituidos por la tradición con la pepsina, tripsina, pancreatina, etc.
Cada enzima es designada por:
1. Nombre recomendado: Corto y apropiado para su uso general.
2. Número asistemático identifica la reacción que cataliza.
3. Número. Se emplea cuando se necesita la identificación inequívoca de
la enzima.
Propiedades de las coenzimas
Las coenzimas presentan dos propiedades básicas:
Especificidad: la actividad enzimática es especifica ya que una
determinada enzima tan solo cataliza un determinado tipo de
transformación (especificidad de acción) de un determinado sustrato
(especificidad de sustrato). Ej.: la sacarasa solamente cataliza la hidrólisis
de la sacarosa. Esto se debe a que la unión entre enzima y sustrato se
produce según el modelo de Fischer, llave - cerradura. Mas
recientemente el modelo de ajuste inducido por Kohsland compara esta
unión existente entre una mano y un guante: la enzima gracias a su
naturaleza proteica puede adaptarse a la forma del sustrato. Así mismo, la
mayoría de las reacciones catalizadas por enzimas son reversibles,
aunque algunas son irreversibles.
• Eficacia: la gran eficacia de la acción enzimática se manifiesta en la elevada velocidad
de reacción que se consigue incluso a concentraciones enzimáticas bajas, ello es
debido a que tras la fijación enzima sustrato las cadenas laterales de los aminoácidos
del centro activo crean las condiciones fisicoquímicas necesarias para la transformación
del sustrato en producto. Estas son:
La correcta posición en que la enzima coloca el sustrato
El aumento de concentración de las moléculas de sustrato en el centro catalítico
La inducción de cambios energéticos que ayuda al sustrato a alcanzar el estado de
transición. Tras la catálisis de una molécula de sustrato la enzima se desprende
inalterada y puede actuar de nuevo, de este modo, una pequeña cantidad de enzimas
puede catalizar la transformación de una gran cantidad de sustrato.
Ambas propiedades se justifican por el papel de los diferentes tipos funcionales de
aminoácidos existentes en la enzima.
Estos aminoácidos son aminoácidos estructurales (AE), son los que mantienen la
estructura tridimensional del enzima.
Aminoácidos de unión o fijación (AU) son los que facilitan la formación del complejo
enzima- sustrato.
Aminoácidos catalíticos (AC) son los responsables directos de la catálisis.
Estos dos últimos constituyen lo que se llama el centro activo de la proteína.
FACTORES:
 LOS FACTORES QUE INFLUYEN DE
MANERA MÁS DIRECTA SOBRE LA
ACTIVIDAD DE UN ENZIMA SON:

Temperat
PH
ura Cofactore
s
Factores que modifican la velocidad de reacción enzimática
a) Temperatura
b) pH
c) concentración del sustrato
d) concentración de la enzima.
actividad enzimática puede ser alterada por factores físicos o químicos y por ello todas
las ázimas actúan dentro de un intervalo óptimo de temperatura y pH fuera del cual su
actividad disminuye.
Temperatura: A temperaturas elevadas las enzimas se desnaturalizan. Debido a que se
rompen los enlaces débiles que mantienen la estructura terciaria, secundaria, y, por tanto,
pierde su conformación y no puede actuar.
A temperaturas bajas no existe la Energía cinética suficiente para formar el complejo
enzima sustrato, por lo que tampoco pueden actuar.
pH: Las enzimas actúan dentro de un intervalo optimo de pH. Fuera de este no actúan o lo
hacen muy lentamente. Se debe a que el pH del medio es el responsable de que los grupos
funcionales de los radicales aminoácidos de la cadena polipeptídica que forman la enzima
posean carga neutra o estén cargados (+) o (-). Las interacciones entre estos grupos son
fundamentales para mantener la estructura tridimensional de la enzima y per lo tanto,
hacer posible su función. El cambio de pH modifica las cargas eléctricas de estos grupos
funcionales y puede legar a producir un cambio en su conformación que si es muy grande
pude provocar su desnaturalización.
PH

TEMPERATURA

COFACTORES
INHIBIDORES DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Determinadas sustancias se comportan como inhibidores enzimáticos porque disminuyen e
incluso anulan la velocidad de la reacción catalizada. Los inhibidores son de dos tipos:
* Irreversibles (venenos): son compuestos que se unen de forma permanente
(irreversiblemente) a determinados grupos del centro activo de un enzima y anulan su
capacidad catalítica.
* Reversibles: la unión de la enzima y el inhibidor es temporal. Impide el normal
funcionamiento de la enzima, solo mientras dura. A su vez estos inhibidores pueden ser de
dos tipos:
Inhibidores competitivos: se unen a la enzima en su centro activo. Al estar ocupado el
centro activo, la enzima no puede actuar.
Inhibidores no competitivos: se unen a la enzima por un lugar distinto al centro activo y
provocan cambios en este que le impiden ejercer su acción sobre el sustrato.

ING. CARLOS FLORES MURILLO.MGTR

INHIBIDORES DE LA ACTIVIDAD ENZIMÁTICA
Ciertas sustancias se comportan como inhibidores enzimáticos porque disminuyen e
incluso anulan la velocidad de la reacción catalizada. Los inhibidores son de dos tipos:
* Irreversibles (venenos): son compuestos que se unen de forma permanente
(irreversiblemente) a determinados grupos del centro activo de un enzima y anulan su
capacidad catalítica.
* Reversibles: la unión de la enzima y el inhibidor es temporal. Impide el normal
funcionamiento de la enzima, solo mientras dura. A su vez estos inhibidores pueden
ser de dos tipos:
Inhibidores competitivos: se unen a la enzima en su centro activo. Al estar ocupado el
centro activo, la enzima no puede actuar.
Inhibidores no competitivos: se unen a la enzima por un lugar distinto al centro activo
y provocan cambios en este que le impiden ejercer su acción sobre el sustrato.
ALOSTERISMO: Existen algunas enzimas capaces de adoptar al menos dos configuraciones
diferentes y estables, una inactiva y otra activa. El paso de una a otra suele estar incluido por la
unión de ciertas moléculas llamadas, ligandos, a determinados lugares de la superficie enzimática
(distintos del centro activo) que se les conoce como centros reguladores. Estos enzimas reciben el
nombre de enzimas alostéricos y desempeñan un papel fundamental en los sistemas de señalización
y comunicación celulares, así como en la regulación de la actividad catalítica en las reacciones del
metabolismo.
CLASIFICACIÓN:
05

16
CLASIFICACIÓN DE LAS ENZIMAS
Generalmente las enzimas se denominan con el nombre del sustrato sobre el
que actúan, al que se añade a veces el nombre de la función que desempeña
seguido del sufijo -ASA . Ej.: la sacarasa hidroliza la sacarosa; la amilasa
hidroliza el almidón; la lactato des hidrogenas a que cataliza la oxidación (des
hidrogenación) del ácido láctico.
Existe igualmente un código de 4 cifras que indica la clase, subclase,
subdivisión de la subclase y por último la cifra específica de cada enzima,
respectivamente. Ej.: el número EC2732 corresponde al enzima ATP - Creatin
fosfotransferasa.

1) Óxido - reductasas: Catalizan reacciones Redox de los sustratos

encaminadas generalmente a obtener energía de los carburantes
metabólicos.
•Tipos de Oxirreductasas
• Las deshidrogenasas, que tienen como coenzimas a los nucleótidos
FAD, FMN, NAD y NADP.
• Reductasas: Fijan y ganan hidrógenos
• Oxidasas: Usan el oxígeno para que otro elemento aporte gane H,
es decir se oxidan perdiendo H
• Oxigenasas:Se encargan de oxigenar, es decir transferir oxígeno.
• Catalasas o peroxidasas: Reducen el H2O2 hasta H20 y O2

ING. CARLOS FLORES MURILLO.MGTR

2) Transferasas: Es una enzima que cataliza la transferencia de
un grupo funcional, por ejemplo un metilo o un grupo fosfato, de
una molécula donadora a otra aceptora. Por ejemplo, una
reacción de transferencia es la siguiente:
A–X + B → A + B–X
En el ejemplo, A es el donador y B es el aceptor; el donador es,
a menudo, un coenzima.
Las mas importantes son las quinasas
3) Hidrolasas: catalizan reacciones de hidrólisis de enlaces
éster (lipasas, fosfatasas); de enlaces glucosídicos (sacarasas,
amilasas) y de enlaces peptídos (tripsina, pepsina, etc).Todas
las enzimas digestivas son hidrolíticas.Sub clases esterasas,
glucosidasas, peptidasas, proteasa, fosfatasas
4)Liasas: Son enzimas de la clase IV que llevan a cabo
reacciones bioquímicas en las que se eliminan grupos mediante
la escisión de un enlace, generalmente entre dos átomos de
carbono, entre carbono y oxígeno, entre carbono y nitrógeno o
entre carbono y azufre, para formar un doble enlace. Subclases
Descarboxilasas, aldolasas, cetolasas, hidratasas,
deshidratasas

ING. CARLOS FLORES MURILLO.MGTR

5) isomerasas: catalizan reacciones de isomerización que
producen reordenaciones dentro de la molécula o transferencia
de radicales de una parte a otra de la molécula. Subclases
Racemasas, epimerasas, mutasas

6) Ligasas o sintetasas:En bioquímica, ligasa (del latín lig(āre)

“juntar”, “unir”) son aquellas enzimas que catalizan la unión de
dos moléculas a partir de la formación de enlaces covalentes
acompañado por la hidrolisis del ATP

ING. CARLOS FLORES MURILLO.MGTR

 Clasificación de las Enzimas

1 Oxidorreductasas 2 Transferasas 3 Hidrolasas

Actúan sobre muchos Transfieren grupos

grupos químicos para funcionales entre Agregan agua a una
agregar o remover moléculas donantes y ligadura hidrolizándola
átomos de hidrogeno. receptoras.

Las quinasas son

transferasas especializadas
que regulan el
metabolismo transfiriendo
fosfatos desde el ATP a
otras moléculas
 Clasificación de las Enzimas

4 Liasas 5 Isomerasas 6 Ligasas

Agregan agua, Permiten la unión de

amoniaco o dióxido Transforman ciertas dos moléculas con la
de carbono sustancias en sus degradación del ATP
actuando sobre las isomerasas. que provee la energía
dobles ligaduras o necesaria para que la
los remueven para reacción tenga lugar
producir enlaces
dobles.
1. Oxidorreductasas
Catalizan oxidación de un sustrato con la reducción
simultanea de otro sustrato o coenzima.
+B A+

Alcohol + → Aldehído + NADH + Alcohol deshidrogenasa

2. Transferasas
Transfieren un grupo diferente del hidrogeno de un
sustrato a otro.
Por ejemplo: Carbonos, grupos aldehídos, cetónicos,
ácidos, etc.

A-R + B → A + B-R

Hexosa + ATP → Hexosa - 6 – fosfato + ADP

Hexocinasa (ATP – hexosa - 6 – fosfato – transferasa)
3. Hidrolasas
Hidroliza esteres, éteres, enlaces peptídicos, enlaces
glucosídicos, adicionando agua para romper el enlace.
-Realiza hidrolisis de polímeros obteniendo
monómeros.
-Todas las enzimas digestivas son hidrolasas.

Acetil colina esterasa (Acetil colina hidrolasa)

4. Liasas
Remueven grupos de sustratos o rompen enlaces por
mecanismo diferentes a la hidrólisis.

Fructosa -1,6 difosfato→ Gliceraldehido -3- fosfato + dihidroxiacetona – fosfato Aldolasa

5. Isomerasas
Producen isómeros ópticos, geométricos o
posicionales de sustratos.
Ejemplo: racemasas, epimerasas, cis-trans
isomerasas.

Gliceraldehido -3- fosfato → Dihidroxiacetona – fosfato Triosa fosfato isomerasa

6. Ligasas
Unen dos sustratos, generalmente con la hidrolisis
simultanea de ATP.
Sintetasas: son enzimas ATP- dependientes que
catalizando reacciones de biosíntesis.
Sintasas: son enzimas que catalizan reacciones de
biosíntesis, pero no requieren ATP directamente.

Malonil CoA + ADP + Pi Acetil CoA carboxilasa

RESUMEN
PROPIEDADES-
FUNCIONES:
• ”Las enzimas son capaces de
reconocer y seleccionar el sustrato
para transformarlo en el producto
deseado.”
• Como propuso el químico sueco Jöns
Jakob Berzelius en 1823, las enzimas son
catalizadores típicos: son capaces de
acelerar la velocidad de reacción sin ser
consumidas en el proceso.
PROPIEDADES
GENERALES:
 Tienen solubilidad en el agua.

 Su actividad depende en ciertos

casos del pH medio.

 Son capaces de precipitarse por el

alcohol.

 La temperatura es un factor clave,

podríamos decir que es el principal
cuando se trata de las acciones
enzimáticas.
Basan su constitución en dos partes
fundamentales: una parte proteica
“apoenzima” y un grupo activo
llamado “coenzima”.
Gran eficiencia, es decir, las
enzimas son capaces de transformar
un gran número de moléculas en un
tiempo corto.
COMO TODO VERDADERO
CATALIZADOR, LAS ENZIMAS MUESTRAN
LAS SIGUIENTES PROPIEDADES:

•1. Están •3. No tienen •6. Poseen un

presentes en efecto sobre la elevado grado de
pequeñas termodinámica especificidad de
sustrato.
cantidades. de la reacción.

7. Funcionan en
•2. No sufren •4.Tiene gran soluciones acuosas,
alteraciones poder catalítico. condiciones suaves
irreversibles en de pH y
el curso de la temperatura.
reacción.
•5. Son
catalizadores en las 8. La mayoría
reacciones de las enzimas
químicas de los son proteínas.
sistemas
biológicos.
FUNCIONES:
 Las enzimas son
proteínas que
catalizan todas
las reacciones
bioquímicas. Las enzimas
pueden actuar
Disminuyen la sobre un
energía de substrato o un
Funciones activación de grupo de
de las una reacción. substratos.

enzimas
Las enzimas Aceleran la
promueven la velocidad de una
oxidación de la reacción.
glucosa.

Crean rutas Participan en la

metabólicas. respiración
celular.
LAS ENZIMAS TAMBIÉN
PARTICIPAN EN DISTINTOS
ÁMBITOS
o Muchos de
los medicamentos que tenemos
a nuestro alcance se obtienen o
formulan a partir de enzimas.

o El sector de alimentos emplean

enzimas para mejorar sabores,
mejorar los valores
nutricionales de los alimentos
o reducir los efectos
alergénicos.

o En la industria textil, se
emplean para el tratamiento
de fibras y telas.
Acetil-CoA: colina O- (Nombre
acetiltransferasa sistemático)

Colina (Nombre
recomendado)
acetiltransferasa

[E.C. 2.3.1.6] (Número)

 Enzimas

Los enzimas son los catalizadores de las reacciones

biológicas.

Características:

1. Alto poder catalítico, las enzimas aceleran las

reacciones multiplicando su velocidad por un millón de
veces.

2. Especificidad. Altamente específicas tanto la reacción

que catalizan como en la selección de las sustancias
reaccionantes (sustratos).
Enzimas proteolíticas

H O H O H O H O

N C C N C C + H2 O N C C + +
H3 N C C

H R1 H R2 H R1 R2

Tripsina Trombina
H O H O
H O H O
N C C N C C
N C C N C C
H H R2
H H
Lisina
o Arginina Glicina
Arginina
 Enzimas

Naturaleza química de las enzimas

1. Casi todas las enzimas son proteínas salvo un pequeño

grupo de moléculas de RNA catalítico.

2. Su actividad catalítica depende de la integridad de su

conformación proteica nativa.

3. Algunas enzimas requieren para ser activas de

componente químicos como:

 Moléculas que se unen de forma débil a la proteína.

 Cofactores: iones inorgánicos como Fe +2, Mg+2,

Mn+2 , Zn+2.
 Coenzimas: complejos orgánicos o metalorgánicos.

 Moléculas que se unen covalentemente, denominados grupo

protéticos.

4. El enzima completo catalíticamente activo junto con su

coenzima y/o iones metálicos se denomina Holoenzima. Se
denomina apoenzima o apoproteína a la parte proteica de
la enzima.
 Centro activo

Es la región del enzima que se une al sustrato y contiene los

residuos que participan directamente en la producción y ruptura
de en laces.
• Estos residuos se denominan grupos catalíticos.

• El centro activo supone una porción relativamente

pequeña del volumen total del enzima.

• El centro activo es una entidad tridimensional.

• Los sustratos se unen a los enzimas por numerosas

fuerzas débiles.

• Los centros activos son hoyos o hendiduras.

• La especificidad del enlace depende de la posición

exacta de los átomos del centro activo. Un sustrato
debe tener una forma adecuada para introducirse en
el centro.

Molécula del sustrato

Centro activo
 Modelos de interacción enzima-sustrato

Modelo de la llave y la cerradura:

El centro activo del enzima por si mismo es complementario a
la forma del sutrato.

Complejo
+ Enzima-
sustrato
Enzima

Modelo del ajuste inducido:

El centro activo tiene una forma complementaria a la del
sustrato solamente después de unirse a él.

Sustrato

+ Complejo
Enzima-
sustrato
Enzima
 Cinética enzimática
La conversión de reactivos en productos en cualquier reacción
química está acompañada de un cambio energético.

En el estado inicial, la energía libre es muy baja.

En el estado de transición, el contenido energético es

máximo.

Energía de activación, es la diferencia de energía entre el

estado inicial de los reactivos y el estado de transición
 Cinética enzimática

Las velocidades de reacción pueden aumentarse:

Incrementando la temperatura

Disminuirse la energía de activación añadiendo

catalizadores

Las enzimas al ser un catalizador disminuye la energía de

activación de la reacción para que de esta manera la
velocidad de la reacción sea más rápida.
 Cinética enzimática

La cinética es el estudio de la velocidad de cambio entre el estado

inicial de los reactivos y su estado final productos.

La velocidad inicial de una reacción catalizada por un enzima

depende de la concentración de sustrato.

Si se representa las velocidades iniciales obtenidas a varias

concentraciones de sustrato, manteniendo constante la
concentración de enzima, se obtiene una hipérbola rectangular.

La velocidad máxima (Vmax) es la velocidad de la reacción cuando

todos los centros asequibles están saturados.
 Ecuación de Michaelis y Menten

La forma hiperbólica de esta curva que expresa la relación entre

[S] y Vo se puede expresar algebraicamente mediante la ecuación
de Michaelis -Menten.

Vo=Velocidad inicial.
Vmax [S] Vmax= Velocidad máxima.
Vo = Km= Constante de Michaelis.
Km + [S] [S]= Concentración de sustrato.
De la ecuación de Mihaelis-Menten emerge una relación numérica
importatnte en el caso especial en que Vo=1/2 Vmax

Vmax [S]
Vmax/2=
Km + [S]

Al dividir por Vmax:

[S]
1/2=
Km + [S]

Despejando Km obtenemos:

Km + [S] = 2 [S]

Km=[S] Cuando Vo=1/2 Vmax

La Km nos da información acerca de la afinidad del enzima por el

sustrato
A mayor Km menor afinidad de la enzima por el
sustrato

A menor Km mayor afinidad.

Forma lineal de la ecuación de Michaelis-Menten
Doble reciproca

1 Km 1
= +
Vo Vmax[S] Vmax

La representación gráfica de 1/V frente a 1/[S] enominda

representación de Lineweaver-Burk es una línea recta con

Una ordenada en el origen igual a 1/Vmax

Una pendiente de Km/Vmax y la intersección con el

eje x es -1/KM
 Factores que afectan la actividad de los enzimas
pH:

Intervalo de pH en que su actividad es máxima  pH óptimo, a

valores superiores o inferiores de pH su actividad disminuye.
Reflejo del ambiente celular

Temperatura: La temperatura donde la actividad del enzima es

máxima se le denomina Tempeartura óptima,

10 30 50 70
ºC
Factores que afectan la actividad de los enzimas

Inhibidores

La inhibición de la actividad ezimática por móleculas

espeíficas es importante porque constituye el principal
mecanismo de control en los sistemas biológicos.

Inhibición irreversible: El inhibidor queda

covalentementeo no, unido al enzima o ligado fuertemente a
él que su disociación es muy lenta.

Inhibición reversible: Se caracteriza por la rápida

disociación del complejo Enzima-sustrato.
 Inhibiciones reversibles

Inhibición competitiva:

El inhibidor (competitivo) se une al centro fijador del sustrato

compitiendo con éste por el enzimas. concentraciones crecientes
del sustrato desplazanal inhibidor.

Con inhibidor competitivo

1/v

La Vmax no
varía en
presencia del 1/Vmax Sin inhibidor
competitivo
inhibidor del inhibidor
competitivo presencia
La Km aumenta en

1/[S]

-1/Km -1/Kmap
 Inhibiciones reversibles
Inhibición no copetitiva:

El inhibidor (no competitivo) se fija en un centro diferente el

centro de fijación del sustrato. Esta inhibición no es
contrarrestada mediante concentraciones crecientes de
sustrato.

Con inhibidor no competitivo

1/v

La Vmax
disminuye en
presencia del
1/Vmaxap
inhibidor no Sin inhibidor
competitivo

1/Vmax
competitivo
1/[S]
inhibidor no
presencia del
La Km no varía en -1/Km
 Inhibiciones reversibles
Inhibición acompetitiva:

El inhibidor se fija a un sitio diferente al del sutrato, fijandose

sólo al complejo enzima –sustrato y nunca al enzima solo.

Con inhibidor acompetitivo

1/v
La Vmax
disminuye
en presencia del 1/Vmaxap
inhibidor
acompetitivo Sin
inhibidor
1/Vmax
acompetitivo
inhibidor
presencia del 1/[S]
La Km aumenta en -1/Kmap -1/Km
Regulación de la actividad enzimática, 1
 Regulación de la actividad enzimática

k+2e0 s Vmax s
v= =
Km + s Km + s
I. Sobre e0: Regulación de la concentración enzimática

II. Sobre Km y k+2: Regulación de la actividad intrínseca

de la enzima

1. Regulación alostérica
2. Regulación por modificación covalente
Regulación alostérica

Procesos a nivel celular; regulación de ajuste fino

de la actividad enzimática, a través de efectos de
retroalimentación (negativa o positiva)

Regulación por modificación covalente

Procesos a nivel supracelular (orgánico); regulación

a gran escala de actividades enzimáticas, a través de
modificación covalente de enzimas, provocadas por
señales (transducción de señales)
 Retroalimentación negativa en vías metabólicas, 1

Síntesis de Isoleucina

Thr a-cetobutirato Ile

Treonina
desaminasa

El producto final de la ruta, Isoleucina, inhibe a la primera

enzima de la misma, Treonina desaminasa
 Retroalimentación negativa en vías metabólicas

Síntesis de pirimidinas

ATP
+

Asp + CP Carbamil aspartato CTP

ATCasa

El producto final de la vía, CTP (citidin trifosfato) inhibe a la

primera enzima de la ruta metabólica, Aspartato transcarbamilasa

Al mismo tiempo, dicha enzima puede ser activada por ATP

 Rutas metabólicas controladas por retroalimentación

Ruta Enzima Inhibidor

Glicolisis Fosfofructokinasa ATP

Neoglucogénesis FBP fosfatasa AMP
Bios. Ács. Grasos AcetilCoA carboxilasa AcilCoA
Bios. Colesterol HMGCoA reductasa Colesterol
Bios. Purinas PRPP sintetasa AMP,GMP,IMP
En el estudio de las enzimas controladas por realimentación
negativa, se comprobaron una serie de regularidades en las mismas:

1. Primer paso de una ruta metabólica o punto de ramificación

2. Enzimas de naturaleza compleja: subunidades; la enzima puede
desensibilizarse a sus inhibidores por diversos métodos.
3. Los inhibidores se comportan como competitivos (elevan el valor
de la Km aparente, pero sin embargo no son análogos estructurales
del substrato

Estas últimas características lleva al concepto de alosterismo:

Una acción sobre la actividad enzimática que se desarrolla
fuera del Centro Activo (Jacob y Monod, 1960)
 Centro Centro Centro
Centro
activo alostérico activo
alostérico

s i s

Cuando el inhibidor ocupa

el centro alostérico, tiene
En ausencia de inhibidor, lugar un cambio conformacional
el substrato se fija normal- en el centro activo que impide la
mente al centro activo fijación del substrato

Inhibición alostérica
 Otra característica importante de las enzimas alostéricas
es que presentan cinéticas anómalas, normalmente
cinéticas sigmoides:

La presencia de una
sigmoide implica
la existencia de
cooperatividad en la
fijación del substrato

s
 La cooperatividad (positiva) consiste en que la fijación de una
molécula de substrato favorece la fijación del siguiente, y así
hasta ocuparse toda la molécula

s + s s + s s + s s
1 2
s 3
s s
En términos de Km veríamos que Km1 > Km2 > Km3

Existe también cooperatividad negativa, cuando la fijación de

una molécula de substrato dificulta la fijación del siguiente.
El comportamiento cooperativo implica:

1. Que hay más de un sitio de fijación de substrato

por molécula de enzima (estr.cuaternaria)

2. Que hay interacciones entre los sitios de fijación

Un sistema alostérico clásico es la Hemoglobina:

1. La fijación de su “substrato”, O2, es de tipo sigmoide

2. La fijación del “substrato” puede inhibirse por efectores

(H+, CO2, 2,3-BPG) que no actúan sobre el “Centro Ac-
tivo” (grupo hemo)

3. Las subunidades, por separado, presentan cinética

michaeliana en la fijación de O2
Mioglobina

Hemoglobina
 (Efecto Bohr)

pH 7.0
pH 7.4

pH 6.6
0
0.1 mM
1 mM
 (+ Activador)

V+

(sin efectores)
V0

(+ Inhibidor)

V-
Los efectores alostéricos operan sobre el grado de
cooperatividad del sistema:

- Los inhibidores alostéricos aumentan el grado de

cooperatividad

- Los activadores alostéricos disminuyen el grado de

cooperatividad; a concentraciones elevadas de activador,
la cinética pasa a ser michaeliana, y deja de ser sigmoide.
 Ecuación de Hill
h > 1, cooperatividad positiva

h = 1, no hay cooperatividad

h < 1, cooperatividad negativa

Obsérvese que para h=1, esta ecuación se reduce a una forma

normalizada de la ecuación de Michaelis-Menten:
 Modelo MWC
Forma R

s s s s s s s
s s s

i i i
i i i i i i i

Forma T
a: Concentración normalizada de substrato, s/Km

L: Constante alostérica: a mayor valor de L, mayor

grado de cooperatividad (positiva)

n: Número de sitios de fijación de substrato

Mecanismo de regulación de la actividad enzimática.

1. Cambios en la concentarción del enzima

Enzima
(proteína)

Velocidad Velocidad
de de síntesis
degradació
n
Aminoácidos
libres

2. Compartimentación
Mecanismo de regulación de la actividad enzimática.
3. Afectado la eficacia catalítica del enzima:
a. Regulación alostérica

b. Modificación covalente reversible

Fosforilación/defosforilación Separación subunidades
 Enzimas regulatorias
Las vías metabólicas están compuestas por grupos
coordinados de enzimas que realizan específicamente un
proceso metabólico. En general, de las muchas enzimas
que los componen, sólo algunas están reguladas. Las
enzimas regulatorias catalizan reacciones que limitan la
velocidad de todo el proceso o son un paso cometido, es
decir que luego de traspuesto el proceso llegará hasta el
final.
Las enzimas regulatorias frecuentemente están
en o cerca de las etapas iniciales de un camino
metabólico o en una ramificación. La lógica
operacional es conservar energía, de modo
que las reacciones biosintéticas no serán
activas a menos que realmente se necesite el
metabolito producto de ese camino
 Regulación de la actividad enzimática
• El camino de la biosíntesis
Catabólico
de un compuesto es
diferente de aquel que E1 E2 E3
conduce a su degradación A B C D

• Esta separación asegura anabólico 

que los procesos son
Catabólico
termodinámicamente
E2
favorables en ambas E1 E3
direcciones A B C D

• Permite la regulación E4
recíproca anabólico 
Ejemplo:
glucólisis DG<<0 DG<<0

DG<<0 DG<<0

DG<<0 DG<<0
Ejemplo:
Síntesis de
guaninas

Varios pasos
LAS 2 FORMAS PRINCIPALES DE REGULACIÓN:

1) control de la cantidad de enzima (gruesa) o de los sustratos

presentes (fina)

2) alteración de la eficiencia catalítica (fina)

Mecanismos:

1.compartimentación
2.cantidad de enzima
3.concentración de sustrato
4.inhibición reversible por productos
5.regulación alostérica
6.unión a proteínas
7.modificación covalente
8.escisión proteolítica
1.Compartimentación:
fotorespiración
1.Compartimentación:
Ciclo del glioxilato
1.Compartimentación:
Metabolismo de AG
 2. CAMBIOS EN LA CANTIDAD DE
ENZIMA

• Sistemas constitutivos

• Sistemas adaptativos: inducibles (el S provoca la síntesis) o represibles

(el producto final inhibe la síntesis)
Cambios en la cantidad de enzima: operones

Control positivo: el producto del gen regulador (o su interacción con una

proteína) activa la expresión de los genes.

Control negativo: el producto del gen regulador (o su interacción con una

proteína) reprime o impide la expresión de los genes.
Operon Lac
Inductor

5´-augguacaaccugcauggauccguacaac augguacaaccugcauggauccguacaac

Regulador Promotor Operador -----------------genes----------------------

1. La polimerasa lee el gen regulador, transcribe el ARN y se sintetiza la prot. represora

2. La proteina represora bloquea a la polimerasa
3. Al ingresar inductor, se une al represor (SU 34 kDa x 4)y lo libera de su unión al gen
operador
4. La polimerasa avanza al inicio de la transcripción y transcribe a los genes: ß-
galactosidasa, galactósido permeasa y tiogalactósido transacetilasa
TCACNCCAC
H
Ceramida

Fosfocolina
http://www.cumc.columbia.edu/publications/in-vivo/Vol1_Iss6_mar25_02/regulation.html
3. Cambios en la concentración de sustrato
Figura 2
4. Inhibición reversible por productos u otros
metabolitos
Retroinhibición
 5. Regulación alostérica

Fosfofructokinasa
 6. Unión a proteínas

Calmodulina
Proteína reguladora de la Glucokinasa

GK PR
7. Modificación covalente

1. Fosforilación
2. Reducción de –SH
3. Acilación
4. Adición de nucleótidos
Fosforilación: glucógeno sintetasa, glucógeno
fosforilasa, PEP carboxilasa, etc. etc. Se da en varios
aminoácidos.

-OH + ATP  P + ADP

Prot-OH + ATP  Prot-O-PO3- + ADP

Fosfotreonina Fosfoserina Fosfotirosina
P-arginina

P-histidina

P-lisina
Reducción de –SH
 Glutamato
Glutationilación
Cisteina

g-Glutamilcisteína

Glicina

Glutation
 Glut PO
Nitroso
glutatión

Ác, sulfénico

glutationilación

En plantas: GaPDH, TPI, aldolasa

En animales: GaPDH, piruvato kinasa, ICDH, a-KGDHetc.
Glu + NH3+ + ATP  Gln + ADP + Pi
 8. Escisión proteolítica

1 122 13 6 201 245 Q UIM O TRIPSINÓ G ENO

(inactivo)
S -S S -S

Tripsina

A rg
1 24 5
S -S S -S

¶ Q uim otripsina
2 péptidos
Leu Ile Tyr A la
1 14 6 149 245
S -S S -S
Tripsina

Val-(Asp)4-Lys-Ile

enteropeptidasa

Val- (Asp)4 - Lys Ile7

+
 CONCLUSIÓN:
Las enzimas son catalizadores específicos, cada
enzima cataliza un sólo tipo de reacción, la
sustancia donde actúa la enzima se llama
sustrato o pequeños grupos del mismo.
Es importante porque aceleran la velocidad a la
que los procesos y reacciones metabólicas se
producen en los organismos vivos. Son vitales
para la vida y sirven a una amplia gama de
funciones importantes en el cuerpo, tales como
ayudar en la digestión y en el metabolismo.