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Módulo # 1: BQ-215-Teoría-20-Medicina.

Contenidos: Agua e Iones; Proteínas, Estructura y Función; Colágeno;


Cofactores y Enzimas.

Introducción:

OJO: a los Estudiantes:


Bienvenidos a la Bioquímica, que es el Estudio de la Vida a nivel Molecular. A
medida que se vayan adentrando en esta Disciplina excitante y dinámica,
descubrirán muchas cosas nuevas y maravillosas. Por ejemplo:
1- Que el Agua en su sencillez química, es el complejo medio que permitió la
evolución de la Vida; 2- Que existen diferentes tipos de interacciones que
estabilizan las estructuras moleculares; 3- Que las Proteínas, mono-méricas o poli-
méricas, sencillas o complejas, son de lo más primordial para el desempeño celular;
4- Que las Enzimas son los bio-catalizadores específicos, sin los cuales, las
reacciones que proporcionan energía para impulsar las diferentes vías
Metabólicas No ocurrirían, conduciendo a la muerte celular; 5- etc.; 6-etc.
Entusiasmo, Interés, Disciplina, Responsabilidad y Compromiso, son los pilares
que soportarán Su buen Desempeño en este Curso, que, esperamos, llene Sus
Máximas expectativas y les proporcione las Herramientas Básicas para
comprender los cambios que ocurren a nivel Molecular en el estado de Salud y en
las Enfermedades….
Suerte….

OJO: la Vida como la conocemos, transcurre en soluciones acuosas. La Vida se


originó en el Agua, de hecho, hasta hace muy poco tiempo, los organismos acuáticos
invadieron los ambientes terrestres, pero aún, así, cargan consigo su propio océano,
pues la composición de sus fluidos intra-celulares y extra-celulares es muy similar
al Agua de los mares primitivos. El Agua es tan familiar para los seres vivos, que
nosotros los humanos, generalmente la consideramos como un fluido muy simple. Sin
embargo, las Propiedades Físicas y Químicas del Agua son de hecho, muy
particulares y tienen profundos significados para la Biología, Bioquímica,
Fisiología, etc.
Las Propiedades del Agua son muy importantes para el funcionamiento celular, y
están directamente relacionadas, con las Propiedades de las bio-moléculas y, por
lo tanto, con el Metabolismo celular.
Las Estructuras de las macro-moléculas que conforman a los seres vivos resultan
de las interacciones con el medio acuoso que las contiene. La combinación de las
propiedades del Agua es la responsable de las asociaciones, intra e inter-
moleculares, que se establecen con las diferentes macro-moléculas e iones, esta
característica es peculiar del Agua. Ninguna otra sustancia se asemeja al Agua en
cuanto a esto se refiere. Por lo tanto, No es de sorprenderse, que el Agua sea la
sustancia más abundante en los sistemas biológicos. De hecho, más del 60% de la
masa corporal de los seres vivos es Agua.

OJO: No se debe olvidar que el Agua, a pesar de ser una molécula vital, por si misma,
carece de vida, una paradoja muy interesante.

El Estudio de las Propiedades y Funciones del Agua es fundamental para la


Bioquímica por las siguientes razones:

1- Casi todas las bio-moléculas adoptan sus formas y, por lo tanto, ejercen sus
funciones, en respuesta a las Propiedades Físicas y Químicas del Agua. Eso deben
Recordarlo!!!

2- El Agua es el medio en el que ocurren, la mayoría de las reacciones Bioquímicas.


Los Sustratos y Productos de las reacciones metabólicas, los Nutrientes y los
Productos de desecho, dependen del Agua para su transporte hacia el interior y
exterior celular. Eso deben Recordarlo!!!

3- El Agua participa en muchas reacciones químicas que son esenciales para la


vida. Frecuentemente los componentes iónicos del Agua, los iones H+ e OH-, son
reactivos. De hecho, la reactividad de muchos grupos funcionales de las bio-
moléculas, dependen de la concentración de estos iones en los alrededores de sus
átomos.

4- La oxidación del Agua para formar oxígeno molecular, O2, es la reacción


fundamental de la fotosíntesis, en donde la energía del sol es almacenada
químicamente para soportar la vida.

OJO: el Programa Analítico de este Curso, se desarrolló en base a Objetivos


Específicos, también se pudo haber hecho en base a Competencias. Uno u otro,
funcionan.

Todos los Objetivos les han sido desarrollados, porque Ustedes son “Expertos” en
Cuestionarios!! Las Figuras que los acompañan ayudan a mejorarlos.
Nosotros estamos convencidos, que “Una Figura, dice más que Mil Palabras”!!

OJO: por qué los “colorcitos”? Para llamarles la Atención, y hacerlos más
atractivos.
Discusión de los Objetivos Específicos:
OJO: las Preguntas del Examen se harán en base a los: “Eso deben Recordarlo!!!”

1- Explicar la naturaleza polar de la Molécula de Agua y su relación con las


Propiedades Fisico-Químicas de la misma.
La naturaleza polar de la molécula de Agua se debe a que los átomos que la forman,
un Oxígeno y 2 Hidrógenos, H2O, tienen las electro-negatividades diferentes, con
valores de 3,5 y 2,1, respectivamente. Esta diferencia en la electro-negatividad
provoca que haya una distribución desigual de cargas, en cada enlace covalente
O-H en la molécula de Agua. Como se presenta en la siguiente Figura.
Eso deben Recordarlo!!!

La desigualdad de cargas se explica porque el átomo de Oxígeno, debido a su 


electro-negatividad, tiende a atraer hacia su esfera de influencia a los electrones de
los átomos de H de los enlaces covalentes. Como esto concentra a los electrones
cerca del átomo de Oxígeno, por eso se dice, que éste tiene una carga negativa
parcial, -. Como los átomos de H quedan “desnudos” o deficientes de carga, se dice
que ellos tienen, una carga positiva parcial, +. Eso deben Recordarlo!!!

La distribución desigual de la densidad de carga se mantiene a lo largo del enlace


O-H, y es la responsable del momento di-polar permanente de la molécula de Agua
y, de la formación de los 2 enlaces covalentes polares que se comportan como
parcialmente iónicos debido a la polaridad electrónica que se presenta. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: con el Agua se habla de un momento di-polar permanente porque las cargas
No se anulan mutuamente como ocurre con la molécula de CO2!! Eso deben
Recordarlo!!!
Por qué en la molécula de CO2, las cargas se anulan??
OJO: como ya se planteó, la polaridad del Agua depende de la distribución desigual
de las cargas, esto influye en la geometría de la molécula. La geometría en forma
de V, en la molécula de Agua, mantiene a los átomos separados con un ángulo entre
los 4 enlaces covalentes O-H es de 104,5o, como se presenta en las siguientes
Figuras.
La forma en V depende de la distribución electrónica especial que presentan los
átomos. Los electrones de la capa externa ocupan 4 orbitales híbridos sp3, que son
los responsables de la geometría de la molécula.

OJO: algunas propiedades Fisico-Químicas del Agua se deben, precisamente, a la


forma angulada y a los enlaces inter-moleculares que ésta pueda establecer. Los
enlaces que forma el Agua con otras moléculas de Agua y con muchas otras
moléculas se conocen como “puentes de Hidrógeno”. Eso deben Recordarlo!!!
En las siguientes Figuras se presentan estos enlaces.

Cada puente de Hidrógeno se debe a la atracción electrostática natural que hay


entre el extremo de un dipolo, - y el otro dipolo, +. Eso deben Recordarlo!!!

Aunque los puentes de Hidrógeno son interacciones débiles, el hecho de que


alrededor de cada molécula de Agua, sea líquida o sólida, se dispongan otras cuatro
moléculas también unidas por puentes de Hidrógeno, permite que se forme una
estructura de tipo reticular, responsable en gran parte, de su comportamiento
“anómalo” y de la peculiaridad de sus propiedades Fisico-Químicas.
Estructura reticular del Agua.

2- Explicar la relación que existe entre las siguientes constantes bio-físicas del Agua
o propiedades Coligativas, Capacidad Calorífica, Calor de Vaporización y
Constante di-Eléctrica y las funciones biológicas o fisiológicas que realiza esta
molécula.

OJO: la relación que existe entre las constantes bio-físicas del Agua, son derivadas
de su capacidad de formación de puentes de Hidrógeno y que hacen del Agua, un
medio único para el desarrollo de los procesos vitales. Eso deben Recordarlo!!!
La Capacidad Calorífica, también conocida como Capacidad Térmica o calor
específico, es la cantidad de calor necesaria para elevar en 1° Celcius, la
temperatura de 1 gramo de Agua, de 14,5 a 15,5 ° Celcius. Para esto, el Agua
absorbe grandes cantidades de calor que se utiliza para romper los puentes de
Hidrógeno, por esto la temperatura aumenta muy lentamente. Eso deben
Recordarlo!!!
Calor de Vaporización: es la cantidad de calor necesaria para superar las fuerzas
de atracción entre las moléculas de Agua y transformarla al estado gaseoso. Para
que el Agua se evapore, se deben romper los puentes de Hidrógeno y
posteriormente dotar a esas moléculas de la energía cinética suficiente para pasar
de la fase líquida a la gaseosa. El calor de vaporización del Agua es mayor que el
de otros líquidos, posee un valor de 540 Calorías por gramo-1. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: como se muestra en la Figura anterior, se requiere una gran cantidad de calor
para transformar al Agua del estado líquido al gaseoso. Como ya se planteó, deben
romperse muchos puentes de Hidrógeno para que las moléculas de Agua se
disocien y permitir el cambio del estado líquido al gaseoso. Eso deben
Recordarlo!!!

Constante di-Eléctrica: es una medida de la capacidad de un sistema para separar


partículas con cargas opuestas, q+ y q-, contrarrestando sus fuerzas de atracción
mutuas. La fuerza de atracción F, entre 2 partículas (q+ y q-), separadas por una
distancia r en un medio, está dada por la Ley de Coulom.

La constante di-eléctrica es un valor que resulta de la naturaleza di-polar de una


sustancia y permite, en el caso del Agua, que ésta, establezca interacciones más
fuertes con otras sustancias polares o No, para disolverlas. El valor de la constante
di-eléctrica del Agua es  cercano a 80, (78,5). Eso deben Recordarlo!!!

3- Explicar las funciones biológicas y fisiológicas del Agua:


a- Regulador de la temperatura corporal; b- Disolvente de sustancias iónicas y
polares; c- Fase dispersante de moléculas anfi-páticas; d- Reactivo químico; e-
Componente estructural de las macro-moléculas; e- etc.

a- Regulador de la Temperatura:
La función de la Termo-Regulación del Agua es consecuencia de su  Capacidad
Calorífica y Calor de Vaporización que estabilizan la temperatura corporal en 37 
0,5° Celsius. Por la  capacidad calorífica, la temperatura del Agua  lentamente a
medida que va liberando calor al enfriarse. Esta propiedad permite al citoplasma
acuoso, servir de protección para las macro-moléculas, ante los cambios bruscos
de temperatura. Eso deben Recordarlo!!!

Debido al  calor de vaporización, se puede disipar una enorme cantidad de calor,


mediante la vaporización de pequeñas cantidades de Agua. Esto permite mantener
la temperatura interna normal a pesar de los cambios que haya en el medio
ambiente. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: después de lo planteado se puede Concluir que: el  valor de la capacidad


calorífica y del calor de vaporización, contribuyen al mantenimiento de la
temperatura corporal en condiciones casi constantes. Eso deben Recordarlo!!!

b- Disolvente de Sustancias Iónicas y Polares:


Por ser una molécula di-polar, el Agua es un gran medio disolvente de compuestos
iónicos, como el NaCl de la Sal común o de mesa, y de moléculas hidrofílicas como
los Glúcidos, de los cuales, la Sacarosa o Azúcar de mesa, son ejemplos.
Las moléculas de Agua, al ser polares,  las fuerzas de atracción que mantienen
unidos a los iones de Na+ y Cl- lo que favorece su disolución. A esta propiedad del
Agua se le llama Solvatación iónica. Eso deben Recordarlo!!!
Esto se presenta en las siguientes Figuras.

Las moléculas hidrofílicas como la Sacarosa con muchos grupos OH, establecen
con el Agua puentes de Hidrógeno lo que favorece su disolución. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: con las sustancias iónicas se  las fuerzas de atracción, porque los dipolos
del Agua, se orientan para establecer una interacción electrostática más fuerte que
la que mantenían entre sí, los iones con cargas opuestas y se los separa. A esta
separación se le llama disolución. Eso deben Recordarlo!!!

Como Resumen: con las moléculas hidrofílicas la disolución es consecuencia de


los puentes de Hidrógeno que se establecen. Con las sustancias iónicas se
establecen interacciónes electrostáticas. Eso deben Recordarlo!!!

c- Fase dispersante de moléculas anfi-páticas:


Las moléculas anfi-páticas, también llamadas “esquizofrénicos moleculares”, por
poseer 2 extremos o colas, uno polar y el otro apolar o hidrofóbico. Con estas
sustancias, la fracción polar interacciona con el Agua y la apolar se aleja del Agua
para interaccionar entre ellas. El resultado es que se logra una dispersión que
reorienta a las moléculas en una bi-capa que es la base estructural de las
membranas biológicas, y de las micelas, en el proceso de la digestión de los lípidos.
Eso deben !!!
OJO: esto se presenta en las siguientes Figuras.

d- Reactivo químico:
El Agua es esencial para las enzimas de la clase Hidrolasa que catalizan reacciones
de hidrólisis con incorporación de la molécula de Agua en los productos. Eso deben
Recordarlo!!!
Como se presenta en la siguiente Figura, la molécula de Agua se incorpora en
ambos productos.

OJO: el Agua es quizá, la molécula más importante en las actividades del hombre,
y también la más versátil, ya que como reactivo químico funciona como ácido, base,
ligando, agente oxidante y agente reductor. Eso deben Recordarlo!!!

e- Componente estructural de las macro-Moléculas:


El Agua establece puentes de hidrógeno con macro-moléculas como las proteínas
que se dispersan en las soluciones acuosas. El Agua de imbibición contribuye a la
estabilización de éstas y otras bio-moléculas. Eso deben Recordarlo!!!

4- Comprender la importancia Fisiológica de mantener el Equilibrio Hídrico del


Organismo y su relación con la Homeostasis Celular.
El Equilibrio Hídrico del Organismo se mantiene por el aporte exógeno diario, la
interacción del Agua con los componentes iónicos y moleculares de los diferentes
compartimientos, el proceso de la reabsorción tubular renal y el control de las
pérdidas diarias. Todo esto contribuye a mantener la llamada Homeostasis Celular.
Eso deben Recordarlo!!!
5- Mencionar los compartimientos en los cuales se distribuye el Agua en el
organismo:
El Agua en el organismo se distribuye en 2 compartimientos conocidos como,
Líquido Intra-Celular, LIC y Líquido Extra-Celular LEC. El LEC a su vez se sub-divide
en Líquido Intersticial, LIS y Líquido Intra-Vascular o plasma, LIV. El LIC y el LIS
están separados por la membrana Celular. Por otro parte, el LIS y el LIV están
separados por la pared capilar. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: el intercambio de sustancias entre estos espacios es esencial para la vida.


Nutrientes como el O2 o la Glucosa, son transportados a las células por la sangre
vía el LIS; los productos de desecho del metabolismo celular, como el CO2 o la Urea,
difunden al espacio Intersticial y son removidos por la sangre y excretados por los
pulmones y los riñones. Eso deben Recordarlo!!!
Existen además otros tres pequeños espacios con Agua: El primero es el Agua
contenida en el tejido conectivo, cartílago y tendones. El segundo es el Agua unida a
la matriz del hueso. El tercero, conocido como espacio trans-celular, está compuesto
por las secreciones digestivas, sudor, líquido céfalo-raquídeo y los fluidos pleurales,
sinoviales e intra-oculares, etc.

6- Calcular el porcentaje de Agua en cada uno de los diferentes compartimientos,


dado el porcentaje total de Agua en el organismo y el peso corporal de un individuo.
Para un individuo adulto del género masculino el porcentaje total de Agua es de
aproximadamente un 60% de su peso corporal. Para el género femenino es de
aproximadamente, un 10% menos. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: este porcentaje puede variar según la edad, el sexo y el grado de obesidad del
individuo. Del 60% al LIC le corresponde un 40% y al LEC un 20%, distribuido así:
LIS 15% y LIV 5%. Eso deben Recordarlo!!!

Del Agua corporal total, el músculo contiene 50%, la piel 20%, la sangre 10% y los
otros órganos o sistemas el 20% restante. OJO: Deben Recordar solo las
proporciones relativas.
Si el peso corporal de un individuo es, por ejemplo, 70 Kg, el porcentaje total de
Agua en el organismo es de 42 Litros. Como la densidad del Agua es de 1, los Kg
se pueden equiparar con los Litros.
OJO: el cálculo se puede hacer por Regla de tres, como se explica abajo.
Si 70 Kg corresponden al 100% del Agua
X Kg _____________ el 60 %
60 x 70/100 = 42 Litros.

OJO: también se puede hacer directamente multiplicando 70 x 0,6 = 42 Litros.

Para calcular el volumen en Litros en cada compartimiento se procede así:


Para el LEC 70 x 0,2 = 14 Litros. Para el LIC 70 x 0,4 = 28 Litros.

Si se suma 14 + 28 = 42 Litros, el total del Agua corporal.

Para el LIS: 70 x 0,15 = 10, 5 Litros. Para el LIV 70 x 0,05 = 3,5 Litros.
Si se suma 10, 5 + 3,5 = 14 Litros, el total del Agua en el LEC.

7- Comparar las características de estos compartimientos en cuanto a su


composición general.
La composición general en iones y solutos orgánicos es característica de cada
compartimiento y se mantiene por la presencia de la membrana celular y de la pared
capilar. Cada compartimiento es una entidad individual, pero estrechamente
relacionada, tanto que una alteración en un compartimiento repercute en los otros,
esto es tiene una gran repercusión Clínica.
Lo anterior nos lleva a plantear que: el mantenimiento de un volumen relativamente
constante, y de una composición estable de los líquidos corporales, es esencial
para la homeostasis** celular. Tanto que, algunos de los problemas más comunes
e importantes que aparecen en Clínica, se deben a fallas en los sistemas de control
que mantienen la constancia de los líquidos corporales.

**-Homeostasis: control y estabilidad del medio interno. Walter Bradfor Cannon,


1929. Claude. Bernard, 1859.

OJO: los iones constituyen el 95% de los solutos** del Agua corporal. Eso deben
Recordarlo!!!
Como se presenta en las Figuras anteriores. En el LIEC el Na+ es el catión más
importante, el Cl- y el HCO3- son los aniones mayoritarios. En el LIC, lo es el K+. Eso
deben Recordarlo!!!

Las proteínas plasmáticas, restringidas al LIV, constituyen también una fracción


importante de los aniones plasmáticos. Eso deben Recordarlo!!!
**- Recordar que solutos es por partículas o sólidos.
OJO: la concentración iónica en el LIS difiere de la concentración plasmática, o
LIV, debido a los efectos del llamado equilibrio de Gibbs-Donnan.
La pared capilar es permeable a todos los solutos presentes, con excepción de las
proteínas aniónicas. Por lo tanto, la concentración de los aniones que difunden
como el Cl-, será mayor en el LIS que está libre de proteínas. Eso deben
Recordarlo!!!
La electro-neutralidad se mantiene en ambos lados de la membrana de estos
compartimientos, pero la Osmolaridad será mayor en el LIV que contiene a las
proteínas. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: en el LIC la concentración de proteínas es , especialmente como enzimas; el


Potasio es el catión más abundante con un 98%, esto es importante para la
trasmisión de los impulsos nerviosos. Eso deben Recordarlo!!!

En el LIV, uno de los componentes del LEC, la proteína más abundante es la


albúmina y el catión predominante es el Sodio con un 95%. Las concentraciones
del Potasio y Sodio son mantenidas por la llamada “Bomba de Na+ y K+”, que es un
transportador del tipo anti-portador. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: el líquido que queda atrapado en el intersticio regresa al LIV a través de la


circulación linfática. El LIS es un ultra-filtrado de plasma libre de proteínas. Eso
deben Recordarlo!!!

En la siguiente Figura se muestra el principio que sustenta el Equilibrio de Gibbs-


Donnan. Los iones que pueden difundir a través de la membrana y los Proteinatos
que No la atraviesan. El Equilibrio Gibbs-Donnan, es la relación que se establece
entre los iones que pueden atravesar las membrana, llamados difusibles, y los que
No difusibles. Las composiciones en el Equilibrio se ven determinadas tanto por las
concentraciones de los iones como por sus cargas.

8- Explicar el mecanismo biofísico que gobierna el movimiento del Agua entre estos
compartimientos.
El mecanismo que gobierna el movimiento del Agua se conoce como Osmosis. La
Osmosis es un movimiento de difusión simple, es decir, sin "gasto de energía", a
través de las membranas para equilibrar la relación de Solutos/Solvente. Eso deben
Recordarlo!!!
OJO: como se plantea en la Figura anterior, la Osmosis del Agua, es un fenómeno
biológico importante para el metabolismo celular de los seres vivos. Eso deben
Recordarlo!!!
OJO: el Agua que tiene la capacidad de movimiento es aquella que tiene potencial
químico, la que está libre, es decir, que No está interaccionando con iones o
proteínas. El Agua se mueve siguiendo la Ley de Acción de Masas, es decir, del
compartimiento con menor concentración al de mayor concentración. En los seres
vivos, el movimiento del Agua a través de la membrana celular puede producir que
algunas células se arruguen por una pérdida excesiva de Agua, o bien que se
hinchen, posiblemente hasta reventar, por un  también excesivo en el contenido
celular de Agua. Para evitar estas dos situaciones, de consecuencias desastrosas
para las células, éstas poseen mecanismos para expulsar el Agua o los iones
mediante un transporte que requiere gasto de energía.

9- Mencionar las funciones generales de los Iones plasmáticos.


a- Mantenimiento de la Osmolaridad del plasma; b- Contribución a la Volemia; c-
Mantenimiento de la Electro-Neutralidad; d- Mantenimiento del pH sanguíneo. Eso
deben Recordarlo!!!

10- Definir los conceptos de Osmolaridad, electro-Neutralidad y Volemia.


a- Osmolaridad: es la medida de la concentración de todas las partículas*
Osmóticamente activas** contenidas en un litro de solución.
OJO: *- como ya se les planteó, el término partícula se refiere a los sólidos o
solutos.
**-partículas Osmóticamente activas**, significa que ejercen presión.

La Osmolaridad es expresada en mili-Osmoles de soluto por litro de solvente. Eso


deben Recordarlo!!!

Osmolaridad =  [Cationes] +  [Aniones] +  [Solutos Orgánicos].


 [148,9] +  [133,2] +  [15,0] = 297,1 mOsm/L.

OJO:  = a sumatoria. El intervalo de la Osmolaridad es de 285 a 310 mOsm/L. El


valor de la Osmolaridad contribuye a conocer la condición hídrica de un individuo.
Eso deben Recordarlo!!!

b- Electro-Neutralidad: es el resultado de tener exactamente el mismo número de


cargas eléctricas positivas y negativas en una solución. La Electro-Neutralidad se
expresa en las unidades de mEq/L. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: en el plasma, la  [Cationes] mEq/L =  [Aniones] es decir, es eléctricamente-


neutro.
Volemia: es el Volumen total en Litros de sangre circulante de un individuo.
La sangre humana normal se halla constituida básicamente por una porción líquida
llamada plasma que representa el 55% del total y otra porción celular constituida por
eritrocitos, que forman el 43,5%, y en menor medida por plaquetas y glóbulos blancos
o leucocitos, que representan el 1% y el 0,5%, respectivamente. Estos porcentajes
pueden variar de una persona a otra según la edad, el sexo y otros factores.
OJO: el plasma consiste en una solución acuosa de color amarillento que contiene
solutos o partículas orgánicas como las proteínas, los alfa-Aminoácidos, la
Glucosa, los ácidos grasos, etc., y solutos iónicos o electrólitos,
predominantemente los iones de Sodio, Na+ y Cloruro, Cl-.

11- Calcular la Osmolaridad del plasma, dada la concentración en mMoles/L, de


todos los solutos o partículas disueltos.
Considerando la concentración de todos los solutos o partículas disueltos en el
plasma, la Osmolaridad plasmática, es el Resultado de la sumatoria de los Cationes
(+) más la sumatoria de los Aniones (-); más la sumatoria de los solutos o partículas
orgánicas, en mMoles/L.
 [148,9] +  [133,2] +  [15,0] = 297,1 mOsm/L.

OJO: si bien la concentración de todos los solutos o partículas disueltos en el


plasma, está expresada en mMoles/L, la unidad utilizada para expresar la
Osmolaridad plasmática es mOsm/L. Eso deben Recordarlo!!!

12- Memorizar el intervalo normal de la Osmolaridad del plasma, en el hombre.


El intervalo normal de Osmolaridad del plasma es de 285 a 310 mOsm/L. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: una cosa es la Osmolaridad plasmática considerando a todos los solutos o


partículas disueltos, y otra es el intervalo normal de Osmolaridad del plasma. Son
valores relacionados pero No iguales. Eso deben Recordarlo!!!

13- Relacionar la Osmolaridad del plasma con la Volemia, considerando Patologías


o situaciones en las cuales la Osmolaridad del plasma está fuera del intervalo
normal.

OJO: si el valor de la Osmolaridad plasmática es menor de 285 mOsm/L se tiene


una condición de hipo-Osmolaridad por sobre-hidratación, ya sea por una excesiva
ingesta diaria de Agua, la llamada “Potomanía”, o por una alteración sistémica,
como por ejemplo, en la ”disminución de la capacidad residual Cardíaca”. En ambas
alteraciones, se presenta Edema!! El Tratamiento busca  la excreción de Agua, lo
que se logra con Diuréticos!!
Si el valor de la Osmolaridad plasmática es mayor de 310 mOsm/L se tiene una
condición de hiper-Osmolaridad por des-hidratación, ya sea por una  en la ingesta
diaria, o por una pérdida excesiva como por ejemplo, en la Diabetes Mellitus o en
las Diarreas Agudas. El Tratamiento se basa en la re-hidratación y la reposición de
los electrólitos perdidos.
Consideraciones Clínicas:
El volumen del LIC depende de la Osmolaridad del LEC y por lo tanto, principalmente, de la
concentración de Sodio, la llamada Natremia.
La hiper-Osmolaridad del LEC conlleva a un movimiento del Agua del LIC hacia el LEC, lo
que resulta en una des-hidratación del LIC. Por el contrario, una hipo-Osmolaridad, tendrá
el efecto inverso, es decir, movimiento del Agua del LEC hacia el LIS y luego al LIC.

OJO: el volumen del LIC  en los casos de retención hídrica y  en los casos de
depleción hídrica. Esto demuestra la importancia de la Homeostasis hídrica en
todos los organismos, es decir, que la ingesta diaria de Agua, iguale a las pérdidas.
Eso deben Recordarlo!!!

14- Calcular la Osmolaridad Estimada del plasma, considerando las


concentraciones del Na+ en mMoles/L o mEq/L, y de la Glucosa y Urea en mMoles/L
o mg/dL.

OJO: se le conoce como Osmolaridad Estimada, porque solo considera a uno de los
iones del LEC, el Na+ y a 2 de los solutos Orgánicos, Glucosa y Urea.
Osmolaridad Estimada = [Na+] + [Glucosa] + [Urea] = mOsm/L. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: si la concentración de solutos orgánicos, se expresa en mMoles/L, el valor


expresado se coloca en la fórmula anterior directamente. Sin embargo, si se expresa
en mg/dL, primero se deberá dividir entre 18 para la Glucosa y 6 para la Urea. Estos
factores que corresponden a la décima parte del PM de estos solutos, permiten
pasar de mg/dL a mMoles/L. Eso deben Recordarlo!!!

15- Demostrar la Electro-Neutralidad del plasma, utilizando la concentración en


mEq/L, de todos los solutos presentes.
Como se muestra en el siguiente Cuadro, la sumatoria , de los Cationes (+), en
mEq/L, más la sumatoria , de los Aniones (-) en mEq/L, considerando los valores
presentados, es de 150 mEq/L, lo cual demuestra que el plasma es, eléctricamente-
neutro!! Eso deben Recordarlo!!!
OJO: nuevamente, las unidades que se utilizan en el cálculo de la Osmolaridad
Estimada del plasma, se expresan en mMoles/L y las de la electro-neutralidad, se
expresan en mEq/L. Eso deben Recordarlo!!!
Cuadro # 1: Concentración normal de Electrolitos.
LIS
Plasma

[mg/dL] [mEq/L] [mEq/L]

Cationes

Sodio 326,0 142,5 144,0

Potasio 16,0 4,0 4,0

Calcio 10,0 2,5 2,5

Magnesio 2,5 1,5 1,5

Cationes Totales 354,5 150,0 152,0

Aniones
[mEq/L] [mEq/L]
Cloruro 362,0 103,0 114,0

Bicarbonato 60,0 25,0 30,0

Fosfatos 3,5 2,0 2,0

Sulfatos 1,5 1,0 1,0

Acidos Orgánicos 15,0 5,0 5,0

Proteinatos 7000,0 14,0 0,0

Aniones Totales 7442,0 150,0 152,0

16- Relacionar la Electro-Neutralidad del plasma, con la estabilidad de las proteínas


plasmáticas y el efecto de Donnan.
Como ya se planteó, en el plasma existe electro-neutralidad. A esta electro-
neutralidad, como aparece en el Cuadro anterior, contribuyen también las
proteínas que al pH del plasma, 7,4, se comportan como poli-Aniones, y se les llama
proteinatos. Los proteinatos poseen una determinada concentración en mEq/L,
que en el Cuadro anterior se presenta como de 14 mEq/L. Otros Autores consideran
16 mEq/L.

OJO: los proteinatos No atraviesan la membrana semi-permeable de los capilares,


por su tamaño y carga. Eso deben Recordarlo!!!
Sin embargo, atraen H2O e iones con carga contraria, como los Cationes y repelen
el exceso de Aniones, de forma que, en el equilibrio, la sumatoria , de las
concentraciones iónicas, a cada lado de la membrana son iguales, la  [Aniones] =
 [Cationes]. Esto es, el plasma es eléctricamente-neutro.
Sin embargo, la concentración de partículas o solutos a ambos lados de la
membrana es desigual, por eso se establece un gradiente osmótico hacia el
compartimiento que contiene las proteínas. El gradiente osmótico se refiere al
movimiento del H2O hacia las proteínas. Esta es la base del llamado efecto de Gibbs-
Donnan. Eso deben Recordarlo!!!

El H2O interacciona con las proteínas y las solvata**, las interacciones que se
establecen son los conocidos puentes de Hidrógeno e interacciones
electrostáticas o puentes salinos. Eso deben Recordarlo!!!
La solvatación contribuye a la estabilidad de las proteínas plasmáticas. Eso deben
Recordarlo!!!

**- como se presenta en las Figuras anteriores, Solvatar no es disolver, es el


proceso por el cual una partícula o soluto, se rodea de H2O, con lo que se evita que
interaccione con otras partículas de su misma naturaleza y flocule o precipite. Por
eso es qué, se dice, que la solvatación contribuye a la estabilidad de las partículas.
OJO: en la siguiente Figura se muestra el efecto que ejercen las proteínas sobre el
H2O cuando están separadas por una membrana semi-permeable. El H2O tiende a
moverse hacia el compartimiento que contiene las proteínas. Este efecto osmótico
es esencial para el funcionamiento celular. Eso deben Recordarlo!!!

En la siguiente Figura se muestra el efecto que ejercen las proteínas sobre los iones
que se encuentran a ambos lados de la membrana de los capilares. Al inicio solo
hay en un compartimiento, proteinatos e iones K+ que actúan como contra-iones.
En el equilibrio, el movimiento de los iones K+ hacia los proteinatos, crea una
desigualdad de cargas que es la responsable del gradiente osmótico que mueve al
H2O hacia el otro compartimiento.
OJO: se denomina presión Coloido-Osmótica o presión Oncótica, al efecto
osmótico que ejercen las proteínas y que es el resultado de la:
1- Presión oncótica, que sólo depende del número de partículas proteicas. Eso
deben Recordarlo!!!

2- Presión ejercida por el H2O de hidratación o de imbibición. Eso deben


Recordarlo!!!

3- Presión ejercida por el exceso de iones debido al efecto Donnan. Eso deben
Recordarlo!!!

Consideraciones Clínicas:
La mayor parte del H2O en el sistema circulatorio está retenida en el mismo, por el efecto
osmótico que ejercen las proteínas. Cuando por cualquier circunstancia patológica o no, 
la concentración de las proteínas en el plasma, el H2O tiende a fluir libremente hacia los
tejidos, provocando una hinchazón o edema. Esto se muestra en las siguientes Figuras.

Estructura Proteica:
17- Escribir la estructura general de un L--amino-ácido, L--aa.
Como se presenta en las siguientes Figuras, la configuración** absoluta de un -
aa viene determinada por el C. El -aa es de la serie L cuando el grupo funcional
Amino se ubica a la izquierda del C. Eso deben Recordarlo!!!
**- el término configuración se refiere a la distribución espacial de los grupos
funcionales de una molécula.

18- Explicar la importancia biológica de la configuración absoluta de un L--aa.


OJO: este Objetivo no se ha resuelto porque constituye un “nudo Gordiano” a nivel
biológico.

OJO: las Preguntas que faltan corresponden al Taller de: Estructuras de Alfa-
Amino-Acidos.

25- Definir el concepto de Proteoma.


Proteoma es el “mapa”, o el conjunto total de las proteínas que se expresan en un
determinado tipo celular de un determinado tejido, en un tiempo específico de su
desarrollo, el cual puede ser afectado por condiciones ambientales o de salud. Eso
deben Recordarlo!!!
El Proteoma constituye la representación funcional del Genoma y a diferencia de
éste, No es estático, es sumamente dinámico, por las funciones que ejercen las
proteínas y las interacciones que se establecen entre las diferentes proteínas, que
finalmente, son las responsables, de las respuestas específicas que presentan las
células ante determinados estímulos o etapas del desarrollo.

26- Mencionar algunas funciones biológicas de las proteínas.


Transporte, Albúmina, Hemoglobina; Catálisis, las enzimas; Estructural, el
Colágeno; Movimiento, la Actina y Miosina; Defensa, las Inmunoglobulinas;
Comunicación, algunos Receptores; Regulación del Metabolismo, algunas
Hormonas; Información las núcleo-Proteínas; etc. Eso deben Recordarlo!!!
27- Relacionar el cambio de la estructura normal de una proteína con la pérdida de
su función y la generación de enfermedades moleculares.
Enfermedad Proteína alterada
Fibrosis Quística Transportador de los iones Cloruro.
Ehlers-Danlos Colágeno.
Anemia Falciforme, Talasemias Hemoglobina.
hiper-Colesterolemia Familiar Receptor de LDL.
Creutzfeldt-Jakob Priones.

28- Definir los cinco niveles de organización estructural de las Proteínas: 1º, 2 º, 3
º, 4 º y 5 º.
a- Estructura Primaria:
La estructura primaria es la forma de organización más básica de las proteínas.
Eso deben Recordarlo!!!
Está determinada por la secuencia de -aa de la cadena poli-peptídica, es decir, el
número de -aa presentes, la clase o tipo de -aa y el orden en que éstos se unen
por medio de enlaces peptídicos. Eso deben Recordarlo!!!
También involucra la posición de los puentes diSulfuro, S-S, si existe alguno. Los
puentes S-S le confieren a la estructura de la proteína una mayor estabilidad
limitando su deformación. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: como se presenta en la Figura anterior, la secuencia de -aa de una cadena


poli-peptídica viene determinada por la información que se está leyendo del mRNA
por los Ribosomas. Por cada Ribosoma que se une al mRNA, se forma una cadena
poli-peptídica. Por eso le llamamos a está molécula, un “puta molde”!!
Los niveles de organización estructural más elevados en una proteína, son
determinados por la estructura primaria. Cada proteína tiene una secuencia única
determinada por las secuencias nucleotídicas del gen o genes que codifican para
ella. Eso deben Recordarlo!!!
Las cadenas laterales de los -aa se extienden a partir de la cadena principal. Por
convención, coincidiendo con el sentido de la síntesis en el Retículo Endoplásmico
Rugoso, el orden de escritura es siempre desde el grupo Amino-terminal hasta el
Carboxilo-terminal. Esto se presenta en la siguiente Figura. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la estructura primaria es importante porque muchas enfermedades


genéticas, son consecuencia de la síntesis de proteínas con secuencias alteradas
que causan un plegamiento inadecuado y la pérdida o deterioro de la función. Eso
deben Recordarlo!!!

OJO: nuevamente, como se muestra en la siguiente Figura, los niveles de


organización estructural más elevados en las proteínas son determinados por la
estructura primaria.

OJO: en la estructura terciaria dice, sub-unidad proteica y en la cuaternaria dice,


proteína compuesta por 4 sub-unidades.

b- Estructura Secundaria:
La estructura secundaria es la disposición o plegamiento espacial que resulta de
las interacciones que se establecen por puentes de Hidrógeno, entre los
componentes del enlace peptídico de -aa cercanos en la cadena poli-peptídica.

OJO: de estas interacciones resultan los llamados “motivos estructurales”. Los


motivos u ordenamientos estructurales característicos de la estructura secundaria
son la hélice  y la lámina  u hoja plegada . Eso deben Recordarlo!!!
La hélice  y la hoja plegada , corresponden a las llamadas estructuras regulares
o repetitivas. Eso deben Recordarlo!!!
También existen estructuras irregulares o No repetitivas. En la Figura anterior se
presentan como “asas o loops”.

OJO: como se presenta en la Figura anterior, la hélice  es el ordenamiento en


espiral con giro hacia la derecha debido a los puentes de Hidrógeno, intra-
catenarios que se establecen. La hélice  está estrechamente empaquetada, de
forma que No hay casi espacio libre dentro de la misma. Por esa razón, todas las
cadenas laterales de los -aa están dispuestas hacia el exterior de la hélice para
evitar los impedimentos estéricos.

OJO: los -aa Ala, Gln, Leu y Met, se encuentran frecuentemente formando parte
de las hélices , mientras que la Pro, Gly, Tyr y Ser, No. Eso deben Recordarlo!!!

De hecho, la Pro se considera un terminador de la hélice ya que, a diferencia de


todos los demás -aa, su C y N, No tienen libertad de giro, y al estar integrados en
un anillo, interfieren en la formación de puentes de Hidrógeno. Eso deben
Recordarlo!!!
Los -aa muy polares y cargados, como la Lys y el Glu, también desestabilizan la
hélice porque los puentes de Hidrógeno pierden importancia frente a las
interacciones electrostáticas, también llamadas puentes salinos, que son
interacciones de atracción repulsión. Eso deben Recordarlo!!!

Por este motivo, la estructura en hélice  es la que predomina a valores de pH en


los que los grupos ionizables de las cadenas laterales de los -aa, No están
cargados. En caso contrario, adoptan la conformación al azar, que es uno de los
ordenamientos irregulares o No repetitivos.

OJO: la lámina  u hoja plegada , es el ordenamiento espacial que resulta del


estiramiento al máximo que permiten los enlaces covalentes de la cadena poli-
peptídica. Los -aa que se encuentran, frecuentemente, formando parte de este
ordenamiento espacial son la Val, Ile, Leu, Phe, Tyr, Trp, que son los -aa de cadena
ramificada y los aromáticos, respectivamente, etc. Eso deben Recordarlo!!!
Son desestabilizadores, el Glu, Asp, Pro, Lys, Ser, etc. Eso deben Recordarlo!!!
Como se presenta en las siguientes Figuras, la lámina  u hoja plegada , es un
ordenamiento espacial simple formado por dos o más cadenas poli-peptídicas que
corren en el mismo sentido o, en direcciones opuestas. Es decir, una disposición
paralela o anti-paralela, estabilizada por puentes de Hidrógeno.
OJO: cuando se ilustra la estructura de las proteínas, las láminas  suelen
visualizarse como flechas anchas para las disposiciones paralelas o anti-paralelas.
Esto se les presenta en la tercera de las siguientes Figuras.

OJO: como ya se planteó, la lámina  u hoja plegada , al igual que la hélice , es


estabilizada por puentes de Hidrógeno intra e inter-catenarios, éstos cuales le
confieren una gran estabilidad. Eso deben Recordarlo!!!

La hélice  y la hoja plegada , corresponden a las llamadas estructuras regulares


o repetitivas. Eso deben Recordarlo!!!

Las estructuras irregulares o No repetitivas son ordenamientos diferentes, pero No


menos importantes, que la hélice  o la lámina  u hoja plegada . Uno de estos
ordenamientos son los llamados giros . También existen los ordenamientos al
azar, “asas o loops”.

OJO: los giros  son secuencias cortas, con un ordenamiento espacial


característico que impone un brusco giro de 180 grados, a la cadena de un poli-
péptido. Los giros  permiten la comunicación entre una hélice  y una lámina ; o
entre 2 láminas , como se muestra en la Figura de la izquierda. Eso deben
Recordarlo!!!

La estabilización de estos ordenamientos es al igual que en los anteriores, por


medio de puentes de Hidrógeno. Eso deben Recordarlo!!!
En este caso, se establece solo un puente de Hidrógeno, que se les muestra en color
verde.
OJO: los residuos de Pro y Gly, que no se encuentran en los ordenamientos de tipo
hélice  y la lámina , aparecen con frecuencia en este tipo de ordenamiento. Esto
se presenta en la siguiente Figura. Eso deben Recordarlo!!!

Los ordenamientos al azar corresponden a aquellas disposiciones que existen


dentro de una proteína, en donde No existen interacciones de suficiente
consideración como para que se pueda distinguir un nivel de organización
estructural superior a la estructura primaria.

c- Estructura Terciaria:
La estructura terciaria es la disposición espacial final que resulta del plegamiento
completo en tres dimensiones de la cadena poli-peptídica.
OJO: a esta disposición espacial final se le conoce como Conformación. Eso deben
Recordarlo!!!

El nivel terciario de organización estructural es el máximo que se alcanza para las


proteínas monoméricas o con una sola cadena poli-peptídica. Son ejemplos de
proteínas monoméricas, la Albúmina y la Mio-Globina!! Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la estructura terciaria se organiza de manera tal que los -aa apolares se
ubican hacia el interior de la molécula, y los polares hacia el exterior, enfrentando al
medio acuoso.
La estructura terciaria se estabiliza por las interacciones hidrofóbicas y por las
fuerzas de van der Waals, hacia el interior. Hacia el exterior por los llamados
puentes salinos o interacciones electrostáticas, y los puentes disulfuro, S-S. Eso
deben Recordarlo!!!
OJO: como ya se planteó, los puentes S-S le confieren a la estructura de la proteína,
una mayor estabilidad limitando su deformación. Eso deben Recordarlo!!

Y los puentes de Hidrógeno?? Éstos se establecieron en la estructura secundaria.


Eso deben Recordarlo!!!

La Conformación de una proteína está determinada por: 1- los impedimentos o


repulsiones estéricas entre las cadenas laterales de los grupos funcionales; 2- las
características del enlace peptídico; 3- las interacciones que la estabilizan.
OJO: el plegamiento espacial determinará si la forma de la proteína será globular
o fibrilar.

Diferencias entre las proteínas Globulares y Fibrilares.

Diferencias Globulares Fibrilares


Forma Esferoidal, de ovillo, casi esférica. Longitudinal, alargada.
Cadena poli-Peptídica Plegada. Estirada.
Solubilidad Solubles. Insolubles.
Función Metabólica, unen moléculas, Estructural, estática.
dinámica.
Ejemplos Mioglobina, Hemoglobina, Colágeno, Queratina,
Insulina, etc, Lana, etc.
OJO: deben Recordar las Funciones y Ejemplos!!!

d- Estructura Cuaternaria:
Este nivel de organización solo está presente, si en la proteína hay más de una
cadena poli-Peptídica o sub-Unidad. Eso deben Recordarlo!!!
Los dímeros, trímeros y tetrámeros, son ejemplos de este nivel de organización.

OJO: la estructura cuaternaria es un nivel superior de organización que resulta de


la asociación de varias cadenas poli-peptídicas o sub-unidades. Eso deben
Recordarlo!!!

Dichas sub-Unidades se asocian entre sí, mediante interacciones No covalentes.


Las letras A, B, C, son un recurso para que las recuerden, y se refieren a los puentes
de Hidrógeno, los puentes salinos y las interacciones hidrofóbicas,
respectivamente. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: la Hemoglobina es una proteína tetramérica que se utiliza como ejemplo de
proteína con estructura cuaternaria. Eso deben Recordarlo!!!
Para el caso de una proteína constituida por dos monó-meros, se habla de un
dímero. Si los monó-meros constituyentes son iguales se dice que es un homo-
dímero. Si son diferentes entonces se tiene a hetero-dímero.
Como la molécula de Hemoglobina está formada por 2 sub-unidades α y 2 sub-
unidades β, α-2; β-2. Ella es un ejemplo de un hetero-dímero.

e- Estructura Quinaria:
La Estructura Quinaria: este es el máximo nivel de organización estructural y se
presenta fundamentalme en aquellas proteínas que tienen actividad catalítica, es
decir, en las enzimas. Las enzimas que presentan este nivel son las que tienen más
de un dominio catalítico y más de un dominio regulador. Se suele representar esta
situación así: C2 R2. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: también se habla de nivel quinario cuando se da la asociación de proteínas


con otras proteínas, o con otros tipos de bio-moléculas para formar asociaciones
supra-moleculares con carácter permanente. Eso deben Recordarlo!!!
Como ejemplo de asociaciones supra-moleculares, se tiene el caso del Colágeno,
proteína que se asocia con otras proteínas, y con los Glicosa-Amino-Glicanos,
moléculas de naturaleza no proteica, para formar a los Proteo-Glicanos. Eso deben
Recordarlo!!!
La Fibrina es otra proteína que forma asociaciones supra-moleculares. Eso deben
Recordarlo!!!
Los monómeros de Fibrina se unen mediante enlaces covalentes para formar la malla
tridimensional. Como se presenta en la siguiente Figura.

29- Explicar la naturaleza química del enlace peptídico.


El enlace peptídico es una interacción covalente que se forma entre el grupo
Carbonilo de un -aa y el grupo Amino de otro -aa con liberación de una molécula
de H2O. Eso deben Recordarlo!!!
30- Explicar las siguientes características del enlace peptídico:
Carácter parcial de doble enlace; Rotación restringida; Planaridad; configuración
trans; Libre rotación alrededor del Carbono-.

a- Carácter parcial de doble enlace:


Como la longitud del enlace peptídico, 1,32 Ao, es menor que la un enlace simple C-
N, 1,49 Ao y, mayor que la de un doble enlace C=N, 1,27 Ao, se dice que tiene carácter
parcial de doble enlace, de un 40 a 60%.
OJO: el enlace peptídico puede considerarse un híbrido de resonancia, es decir,
que los electrones se deslocalizan, como se presenta en la siguiente Figura.

b- Rotación restringida:
El carácter parcial de doble enlace le imprime rigidez al giro e impone una rotación
restringida de los átomos que componen el peptídico, C=N. Eso deben
Recordarlo!!!

c- Planaridad:
La Rotación restringida y la estabilización por resonancia, obliga a que los 4
átomos que forman el enlace peptídico, C, N, O e H; más los 2 carbonos que se
encuentran en posición  con respecto a este enlace, No puedan girar unos con
respecto a otros, y adopten una geometría planar, como se presenta en la siguiente
Figura.

Así, la cadena poli-Peptídica está constituida por una serie de planos sucesivos
separados por grupos metilenos sustituidos, CH=, o metenilos. Esto se presenta en
la Figura anterior.
OJO: esto impone restricciones importantes al número posible de conformaciones
que puede adoptar una proteína.

d- Configuración trans: Un enlace peptídico plano, puede adoptar 2 posibles


configuraciones llamadas, trans y cis. En la configuración trans, los 2 átomos de
carbono  están en lados opuestos del enlace peptídico. En la configuración cis,
estos átomos están del mismo lado.
OJO: casi todos los enlaces peptídicos en las proteínas son trans. Eso deben
Recordarlo!!!
El predominio de la forma trans se explica, porque es la configuración que presenta
menos repulsiones estéricas y electrostáticas, entre las cadenas laterales de los
grupos funcionales unidos al carbono-. Siendo energéticamente la más favorable.

Las configuraciones cis más comunes son las que presentan el patrón X-Prolina.
Eso deben Recordarlo!!!
Siendo X cualquier residuo aminoacídico. Esto se da porque el átomo de Nitrógeno
del grupo Imino de la Prolina limita las diferencias entre las configuraciones trans
y cis.
Alrededor del 6% de los residuos de Prolina analizados por cristalografía de rayos X
se encuentran en una configuración cis.

e- Libre rotación alrededor del Carbono-:


Los enlaces que se establecen entre los átomos del plano, Carbono o Nitrógeno, y
los Carbonos- de los -amino-ácidos, -aa, tienen carácter de enlace simples y
permiten cierto grado o libertad de giro. Eso deben Recordarlo!!!
Esa libertad de rotación alrededor de 2 enlaces de cada -aa, permite a las
proteínas plegarse de formas muy diversas. El giro que pueda realizar cada uno de
estos enlaces, dependerá en gran medida, de los grupos funcionales de las cadenas
laterales y las posibles interacciones que se establezcan entre ellos, y con el medio
en el que se encuentre la proteína.

OJO: los ángulos de giro se conocen como “fi”, si es entre el N y el C-, y “psi”,  si
es entre el Carbono del grupo Carbonilo y el C-. Son estos ángulos de giro, son los
que determinan la estructura tridimensional o “conformación nativa” de una
proteína. La conformación nativa es directamente responsable de la función que
ejerza la proteína. Eso deben Recordarlo!!!

El 75 % de las posibles combinaciones  y  están excluidas por impedimentos


estéricos locales, por tal razón, una proteína solo se plegará para adoptar la
conformación nativa que cumpla con los siguientes requisitos: 1- la de mayor
estabilidad; 2- la termodinámicamente más favorable; 3- la de menor impedimento
estérico; 4- la de menores repulsiones electrostáticas.

OJO: como el enlace peptídico No tiene carga, los requisitos anteriores permiten a la
cadena, o cadenas poli-peptídicas, formar estructuras globulares únicas, y
fuertemente empaquetadas.

31- Comprender el significado de los términos Amino Terminal, N-terminal y


Carboxilo Terminal, C-terminal, en relación con la estructura 1ª de una proteína.
Los términos N-terminal y C-terminal, se utilizan para designar a los únicos grupos
funcionales que No forman parte del enlace peptídico en una proteína. Eso deben
Recordarlo!!!

H3N+___________________________________COO-

32- Explicar la formación del puente de di-Sulfuro, S-S, en una proteína como parte
de su estructura 1ª.
Los puentes S-S se establecen entre los grupos funcionales sulfhidrilos o tioles, de
2 -aa Cisteína que se encuentran cercanos en la secuencia de una proteína. Eso
deben Recordarlo!!!
Esta es una reacción de oxidación y es catalizada por la enzima di-Sulfuro-
Isomerasa. Al -aa resultante se le conoce como Cistina.
Cisteína-SH + Cisteína-SH + Ascorbato  Cys-S-S-Cys + des-Hidro-
Ascorbato enzima: di-Sulfuro-Isomerasa.

OJO: el cofactor de la enzima di-Sulfuro-Isomerasa es la Vitamina C reducida o


Ascorbato. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: como ya se planteó, los puentes S-S le confieren a la estructura de las
proteínas una mayor estabilidad, limitando su deformación. Son también
importantes en el ensamblaje de las proteínas que serán, secretadas al medio extra-
celular, como el Colágeno!! Eso deben Recordarlo!!!
Existen también sus excepciones como es el caso de la Insulina, una proteína que
es intra- celular y presenta 3 puentes S-S.

33- Describir la formación y estabilidad de los siguientes ordenamientos, como parte


de la estructura 2ª de una proteína: hélice  y la lámina  u hoja plegada ; giro ,
giros inversos tipo I y II.
Como se planteó en el Objetivo # 28, la hélice  y la lámina  u hoja plegada , son
los motivos u ordenamientos espaciales regulares o repetitivos característicos, de
la estructura secundaria de una proteína. Se forman por las interacciones que se
establecen entre los grupos funcionales de -aa cercanos en la secuencia de las
proteínas.
Los giros  y los giros inversos tipo I y II, son ejemplos de ordenamientos
espaciales irregulares o No repetitivos. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la estabilización de estos ordenamientos espaciales, sean del tipo repetitivo


o No repetitivos, se da por puentes de Hidrógeno. Eso deben Recordarlo!!!

34- Explicar la importancia de la formación de una hélice  en un dominio trans-


membranal de una proteína.
Como ya se planteó, en el ordenamiento en hélice- predominan los -aa
hidrofóbicos, esto favorece las interacciones hidrofóbicas con los componentes
lipídicos de las membranas, confiriendo tal estabilidad, que se dice que la proteína
está “anclada” a la membrana.
OJO: a estas proteínas se les conoce como trans-membranales o integrales de
membrana. Eso deben Recordarlo!!!

En la siguiente Figura se presentan diferentes tipos de dominios trans-


membranales y se puede observar el típico ordenamientosespacial en hélice-.

35- Definir los conceptos de estructura Súper Secundaria o Motivo, y Dominio


proteico.
Las estructuras súper secundarias pueden definirse como, combinaciones de
hélices- y láminas  u hojas plegadas , conectadas a través de giros que también
se les llaman asas o lazos. Ya se les presentó como, “asas o loops”.
Estos plegamientos se estabilizan a través del mismo tipo de interacciones que
mantienen a la estructura terciaria. A saber, las interacciones hidrofóbicas, los
puentes salinos o interacciones electrostáticas, y los puentes disulfuro, S-S. Eso
deben Recordarlo!!!

OJO: algunas veces se utiliza el término “motivo”, “motif” en inglés, para describir a
estas estructuras súper secundarias. Eso deben Recordarlo!!!
Estas estructuras pueden ser relativamente simples, como dos hélices- unidas por
un giro, así, hélice-giro-hélice; dos láminas  unidas por un giro, así, -giro-; dos
láminas  unidas a una hélice-; etc.
También existen estructuras más complejas, como el motivo llamado de “Llave
Griega” o el Barril-. Estas estructuras se presentan en la última página.

OJO: algunas proteínas No presentan estructuras súper secundarias. Eso deben


Recordarlo!!!
En la siguiente Figura se presenta la llamada “mano EF”, que es el “motivo” que
permite la unión a los iones de Calcio, en muchas proteínas que unen a este ión.
La Calmodulina es una de estas proteínas.

La “mano EF”, es otro ejemplo de hélice-giro-hélice. También se le considera un


Dominio porque ejerce una función. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: para los Curiosos: se le llamó “mano EF” porque al estudiar a la par-Albúmina,
una proteína estructuralmente relacionada con la Calmodulina y la Troponina C, se
descubrió, que cuando las hélices E y F de esa proteína, unían a los iones de Calcio,
adoptaban una disposición similar a los dedos índice y pulgar de la mano derecha,
satisfechos!!
Dominios:
Los dominios proteicos son unidades estructurales compactas y estables, dentro
de una proteína. Están formadas por segmentos de una cadena poli-peptídica que
se pliegan de forma independiente, con una estructura y función distinguible de otras
regiones de la proteína y son estabilizadas, por las mismas interacciones de la
estructura terciaria. Un dominio algunas veces está formado por motivos, pero otras
veces, No contiene ninguno. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: los dominios pueden ser tan pequeños como con 25 -aa o tan grandes como
con 500 -aa. Los dominios más pequeños son los llamados “dedos de Zn2+”. Eso
deben Recordarlo!!!

OJO: los dedos de Zn2+ contribuyen a estabilizar la estructura de las proteínas y,


sobre todo, interaccionar específicamente con el DNA y los RNA. Los -aa típicos
en los dedos de Zn2+ son la Cisteína y la Histidina. Eso deben Recordarlo!!!

Hasta un 3% de nuestro genoma se dedica a la codificación de estos dedos de zinc.

Tarea # 1: a- investigar el nombre del científico que descubrió la existencia de los


dedos de Zn2+, en numerosas proteínas de organismos eucariotas; b- investigar el
año en que lo hizo

La estructura terciaria de muchas proteínas está formada por varios dominios.


En la siguiente Figura se presenta el ordenamiento de una proteína en varios
dominios.

Funciones de los Dominios:


b- Interaccionar con un ligando de bajo peso molecular; b- atravesar la membrana
plasmática; c- contener el sitio catalítico; d- interaccionar con el DNA; e- proveer
una superficie para interaccionar específicamente, con otras proteínas; f- etc. Eso
deben Recordarlo!!!
OJO: en algunos casos, cada dominio de una proteína es codificado por un exón
separado en el gen que codifica a la proteína. Por eso es qué éstos, presentan cierta
autonomía en sus funciones.

36- Describir la formación de algunas estructuras súper secundarias tales como: la


“mano EF”, como ejemplo de hélice-giro-hélice; -giro-; -- y la “Llave Griega”.

OJO: con lo ya planteado en el Objetivo # 35, consideramos que es suficiente!!

37- Explicar la naturaleza bio-física de las interaccionar químicas que estabilizan


la estructura 3ª de una proteína.
Estas son las interacciones químicas débiles No covalentes, a las que llamamos,
A, B, C. Además, están los puentes S-S y por las fuerzas de van der Waals. Eso
deben Recordarlo!!!
Las letras A, B, C, son el recurso para que las recuerden, y se refieren a los puentes
de Hidrógeno, los puentes salinos y las interacciones hidrofóbicas,
respectivamente. Eso deben Recordarlo!!!

38- Describir las interacciones inter-moleculares que mantienen la estabilidad de


la estructura 4ª de una proteína.
Las interacciones que mantienen unidas a las distintas cadenas poli-peptídicas
son, en líneas generales, las mismas que estabilizan a la estructura 3ª. Las más
abundantes son A, B, C. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: como un caso especial a Recordar, tenemos a las inmuno-Globulinas,


proteínas en las que, la estructura 4ª se mantiene mediante puentes S-S.

39- Explicar el orden de complejidad estructural de los complejos multi-


enzimáticos.
En los complejos multi-enzimáticos el orden de complejidad estructural es el 5o En
los ordenamientos de las sub-unidades existen dominio Catalíticos y Reguladores,
C2 R2.
Como ejemplo, se tiene el caso del complejo multi-enzimático de la Piruvato-DH.
Eso deben Recordarlo!!!

OJO: en el caso del Colágeno, proteína en la que No existen estos tipos de dominios,
C2 R2, se les considera de nivel 5o, por las asociaciones supra-moleculares, que
establecen las fibras del Colágeno con otros componentes proteicos y no proteicos,
de la matriz extra-celular. Eso deben Recordarlo!!!

Colágeno:
Intoducción:
La palabra Colágeno proviene de la raíz griega "Kolla" que significa gelatina, goma.
Tradicionalmente se ha usado al Colágeno para fabricar pegamentos y colas, de ahí su
nombre. Cuando una solución de Colágeno se hierve, la viscosidad de la solución
disminuye y surge una proteína con una estructura arrollada al azar a la que se llama
Gelatina!!
Existen hasta 29 tipos de moléculas de Colágeno diferentes, codificados por hasta
41 genes, distribuidos en 14 cromosomas; siendo el Colágeno de tipo I el más
abundante. Éste contiene una larga hebra de triple hélice que termina en los
llamados Telo-Péptidos, que son pequeños segmentos que ya no tienen estructura
super-helicoidal.

La principal función del Colágeno es formar un armazón que sirve de sostén a los
tejidos y que resiste las fuerzas de tensión mecánica o estiramientos. Actúa como
las barras de acero que refuerzan al hormigón en las construcciones.
La organización de las moléculas de Colágeno en estructuras macro-moleculares
tridimensionales es variada. Pueden formar: 1- fibras paralelas para resistir
tensiones uni-direccionales y están presentes en todo tipo de tejido conectivo* en
particular, los tendones, los ligamentos y las fascias**; 2- fibras orientadas en forma
de malla para soportar tensiones que puedan venir de todas las direcciones, como
ocurre en el hueso, en el cartílago y en el tejido conectivo; 3- en la piel están
organizadas como cestos de mimbre, lo que permite la oposición a las tracciones
ejercidas desde múltiples direcciones; 4- en el tejido óseo adulto y en la córnea, se
disponen en láminas delgadas y superpuestas, paralelas entre sí, mientras las fibras
forman ángulo recto con las de las capas adyacentes.
*- El tejido conectivo tiene funciones especiales, tales como: protección, sostén,
relleno, defensa y metabólicas. Las fibras de Colágeno son las más abundantes y
gruesas del tejido conectivo.

**- La Fascia es la envoltura del tejido conectivo que realiza un número importante
de funciones, incluyendo la envoltura y el aislamiento de uno o más músculos.

El Colágeno es sintetizado por los fibro-blastos, osteo-blastos, odonto-blastos,


condro-blastos y las células musculares lisas. Los fibro-blastos, son las principales
células productoras de las fibras de Colágeno y las fibras elásticas.

El Colágeno de tipo I está codificado por los genes COL1A1 y COL1A2, que se
encuentran en los cromosomas 17 y 7 respectivamente.

El Colágeno es una proteína fibrosa insoluble que se caracteriza por contener


grandes cantidades de una secuencia muy particular o atípica, Gly-X-Y que se
repite en las tres cadenas con giro a la izquierda, que forman una triple hélice con
giro a la derecha. Cada cadena cadena tiene más de 1400 -aminoácidos de los
cuales uno de cada tres es una Glicina. A intervalos regulares, ocupando las
posiciones X y Y, se encuentran los -aa Prolina y la OH-Prolina. La OH-Prolina
resulta de la hidroxilación de la Prolina. Estos -aa son poco frecuentes en otras
proteínas. La presencia de estos -aa tan particulares o atípicos, favorece el
enrollamiento de las tres cadenas, una, alrededor de la otra, formando una fibra muy
resistente, con giro a la derecha. Otro de los -aa hidroxilados es la Lisina. Las OH-
Lisinas sufren reacciones adicionales de glicosilación.
OJO: las reacciones de hidroxilación y glicosilación, son determinantes para la
estructura tri-dimensional final de la molécula de Colágeno. Como ya se planteó, el
Colágeno se encuentra en todos los tejidos en los que sirve de armazón,
protección, sostén, relleno, etc. Su importancia se corresponde con su elevado ,
porcentaje; por ejemplo, supone el 4% del hígado, el 10% de los pulmones, el 50%
del cartílago y el 70% de la piel, etc.
Cerca de 40 genes codifican para las diferentes moléculas de Colágeno y de las
enzimas involucradas en su síntesis. Por eso se les considera una Familia de
moléculas estrechamente relacionadas, pero genéticamente distintas.
Se han reportado cerca de 278 mutaciones diferentes encontradas en los genes que
codifican para los Colágeno tipos I, II, III, IX, X, y XI, de 317 pacientes No
relacionados. La mayor parte de las mutaciones fueron de una sola base, bien por
intercambio de un codón de un aminoácido crítico, o bien por un empalme anormal del
RNA.
Las mutaciones que se dan en estos 6 tipos de Colágeno, ocasionan un amplio
espectro de enfermedades del hueso, cartílago y vasos sanguíneos, incluyendo la
Osteo-génesis Imperfecta, una amplia variedad de cóndro-displasias, el síndrome de
Ehlers-Danlos tipos IV, VI y VII; y ocasionalmente, tipos raros de osteo-porosis, osteo-
artritis y aneurisma familiar.

La siguiente Información busca presentar otros usos del Colágeno. El Colágeno se


utiliza en Cirugía Cosmética, en la llamada Terapia de Sustitución de Colágeno,
procedimiento que consiste en inyectar sub-cutáneamente Colágeno natural o
sintético, en las áreas en las que se quiere que desaparezcan arrugas, cicatrices u
otras imperfecciones de la piel.
También se está utilizando como soporte en cultivos de células cartilaginosas, para
implantar posteriormente a pacientes que han sufrido lesiones, con una nueva
tecnología denominada ingeniería de tejidos.

Objetivos Específicos:

40- Mencionar las características más sobresalientes del Colágeno.


a- es una proteína fibrilar a fibrosa; b- es una proteína estructural, con una secuencia
repetitiva atípica, Gly-X-Y; c- como presenta residuos glucídicos es una Glico-
proteína o hetero-proteína; d- No contiene al -aa cisteína en el interior de las
cadenas, por tanto, No establece puentes di-Sulfuro; e- es la proteína más
abundante en los mamíferos, con un 25 a 30 % del peso total de las proteínas tisulares;
f- es el componente mayoritario del tejido conectivo; g- es el principal componente
fibroso de la piel, huesos, tendones, ligamentos, cartílago, vasos sanguíneos y
dientes; h- los residuos de OH-Prolina e OH-Lisina, son esenciales para su función;
i- Pueden organizarse formando fibras, mallas o uniones entre moléculas; j- son
muy variados, se han descrito hasta 28 tipos designados por números romanos.

OJO: cuando se tienen tantas características como con el Colágeno, se debe


Recordar al menos un 1/3 de la Información.

41- Mencionar los % de distribución de los diferentes tipos de Colágeno en los


tejidos.
Distribución porcentual del Colágeno en algunos tejidos y órganos.
Piel 70 %; cornea 68 %, cartílago 50 %; hueso 23 %; aorta 12–24 %; pulmón 10 %;
hígado 4 %.
OJO: se deben Recordar las proporciones relativas, No los valores anteriores!!

OJO: se va a explicar la síntesis del Colágeno tipo I, porque como ya se planteó, es


el más abundante. Se abordarán, las modificaciones post-Tradución, las
modificaciones extra-celulares que sufre; la organización estructural en fibrillas y
fibras, el desfase en cuartos, la mineralización y las Colágeno-patías. Con esta
Información se podrán responder Todos los Objetivos Específicos planteados!!

Síntesis del Colágeno tipo I:


La síntesis del Colágeno se inicia en el Retículo endoplásmico. El Colágeno es
síntetizado en forma de un precursor de alto peso molecular llamado pre-pro-
Colágeno. Eso deben Recordarlo!!!
Este precursor presenta hacia el extremo Amino-terminal, N-t, una secuencia
amino-ácidica llamada Péptido de extensión. El pre-pro-Colágeno es un hetero-
trímero constituido por 2 cadenas 1 (I) y una cadena 2 (II), codificadas por los
genes COL1A1 y COL1A2, que se encuentran en los cromosomas 17 y 7,
respectivamente.
OJO: como se presenta en la Figura anterior, el pre-pro-Colágeno el Retículo
Endoplámico Rugoso, RER pierde el Péptido de extensión y se transforma en el
pro-Colágeno.
pre-pro-Colágeno + H2O  pro-Colágeno + Péptido de Extensión
OJO: las reacciones No serán objeto de Evaluación!!

En el RELiso y Golgi, el pro-Colágeno sufre modificaciones post-Traducción por


diferentes enzimas. Las modificaciones incluyen la OH-ción de residuos específicos
de Prolina y Lisina, la Glicosilación de los residuos de la OH-Lisina y la
Fosforilacion de algunos residuos de Serina. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: mientras que la Glicosilación ocurre en el extremo Carboxilo-terminal, la


Fosforilacion ocurre en el extremo Amino-terminal de los pro-Péptidos. Eso deben
Recordarlo!!!
Las 3 cadenas  se ensamblan mediante puentes di-Sulfuro para formar al pro-
Péptido de Colágeno tipo I que se caracteriza por tener largas extensiones N y C-
terminales. Esto se presenta en la Figura anterior.

OJO: la composición amino-ácidica del Colágeno tipo I es única o atípica, cerca del
33 % está constituida por residuos de Glicina, es decir, que cada tercer residuo, se
repite este -aa en la triada Gly-X-Y. En este trí-Péptido X y Y, son los otros residuos
de -aa con preponderancia de la Prolina e OH-Prolina, con un 10 al 20 %. El
Colágeno es una de las pocas proteínas que contiene OH-Lisina. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: las peculiaridades de la estructura primaria del Colágeno hacen posible su


particular estructura secundaria, en la cual, cada cadena adopta un ordenamiento
espacial en hélice llamado, hélice del Colágeno. Esta hélice tiene un giro a la
izquierda. Eso deben Recordarlo!!!
El giro a la izquierda es favorecido por el contenido de Prolina e OH-Prolina, estos
-aa presentan en la cadena lateral al grupo funcional Imino, el cual imprime, una
rigidez a las ordenaciones espaciales, lo que favorece se dispongan en hélices con
giro a la izquierda. Eso deben Recordarlo!!!

Estructura Primaria y Secundaria del Colágeno tipo I:

42- Explicar la importancia o función del contenido de Glicina en las moléculas de


tropo-Colágeno, en las cuales se repite la triada Gly-X-Y, en su estructura primaria.
La Glicina por su tamaño tan pequeño, debido a que su grupo funcional es un átomo
de Hidrógeno, favorece que el contacto entre las cadenas que forman al Colágeno,
sea más estrecho o más fuerte. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: un -aa con una cadena lateral mayor que el Hidrógeno de la Glicina, impediría
que las cadenas adyacentes interaccionarán para formar la súper conformación de
triple hélice con giro a la derecha característica de la molécula del Colágeno. Eso
deben Recordarlo!!!

42- Explicar la importancia del contenido de Prolina e OH-Prolina, en la síntesis de


la molécula de tropo-Colágeno.
Como ya se planteó, el contenido de los -aa Prolina e OH-Prolina, en la estructura
primaria del Colágeno, con su grupo funcional Imino en la cadena lateral, favorece
el ordenamiento espacial en una hélice extendida con giro a la izquierda. Eso deben
Recordarlo!!!
OJO: como deben Recordar, la hélice  por el contrario, es muy compacta!! Al igual
que la hélice , la hélice del Colágeno adopta una estructura espacial cilíndrica.

OJO: la estabilidad térmica de la triple hélice con giro hacia la derecha está
relacionada con el contenido en la misma de la OH-Prolina. A mayor contenido de
este -aa, mayor será la estabilidad al calor de la triple hélice. Eso deben
Recordarlo!!!

44- Explicar las funciones bioquímicas de todas las enzimas y cofactores que
intervienen en la síntesis del pro-Colágeno.
Las enzimas que participan en las reacciones de post-Traducción son: la Prolil-OH-
asa y la Lisil-OH-asa; UDP-Glucosil y UDP-Galactosil-Transferasas y las
Quinasas**. Eso deben Recordarlo!!!
La Prolil-OH-asa y la Lisil-OH-asa son oxigenasas de función mixta, y utilizan al O2
molecular para la reacción de Hidroxilación, también ocurre una reacción de des-
Carboxilación oxidativa del -Ceto-Glutarato a Succinato. Estas son enzimas ferro-
dependientes.
**- Las Quinasas son enzimas que transfieren grupos Fosfato o Fosforilo.

OJO: las siguientes reacciones No serán objeto de Evaluación!!

Solo deben Recordar al Cofactor de esas enzimas que es el Ascorbato, la forma


activa de la vitamina C!!

a- Reacción de la Prolil-OH-asa:
Prolina + O2 + Ascorbato + -Ceto-Glutarato + Fe2+  OH-Pro +
Succinato + deshidro-Ascorbato + Fe3+ + CO2 Enzima: Prolil-OH-asa.

b- Reacción de la Lisil-OH-asa:
Lisina + O2 + H2O Ascorbato + -Ceto-Glutarato + Fe2+  OH-Lys +
Succinato + deshidro-Ascorbato + Fe3+ + CO2 Enzima: Lisil-OH-asa.
c- Función de la Vitamina C o Ascorbato:
El Ascorbato actúa como cofactor de las enzimas anteriores y su función es anti-
oxidante, al favorecer la reducción del ión Fe3+, que se oxida en el sitio catalítico de
estas enzimas. El ión Fe3+, es transformado en el Fe2+ con participación del
Ascorbato. En la reacción se oxida al deshidro-Ascorbato y debe ser aportado
nuevamente.
Fe3+ + Ascorbato  Fe2+ + deshidro-Ascorbato
OJO: los estados carenciales de vitamina C provocan una hidroxilación deficiente.
Este es el principal defecto bioquímico en el Escorbuto. Eso deben Recordarlo!!!

d- UDP-Glucosa + OH-Lys  OH-Lys-Glucosa + UDP


Enzima: UDP-Glucosil-Transferasa.

e- UDP-Galactosa + OH-Lys  OH-Lys-Galactosa + UDP


Enzima: UDP-Galactosil-Transferasa.

f- Serina + ATP  Serina-O-P + ADP


Enzimas: Seril-Quinasas.

Tarea # 1:
a- Investigar el nombre del científico galardonado con el premio Nobel por sus
Estudios sobre las funciones de la Vitamina C; b- En qué año se otorgó el premio?

OJO: al aparato de Golgi llegan las 3 cadenas pro-, Hidroxiladas, Glicosiladas y


Fosforiladas. La triple hélice con giro a la derecha del pro-Colágeno, es liberada
desde el aparato de Golgi al espacio extra-celular, en forma de vesículas secretoras
por el mecanismo de exocitosis. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: la triple hélice con giro a la derecha, está formada por hélices individuales con
giro a la izquierda. Después de que se ha formada la triple hélice, No ocurren más
modificaciones a nivel intracelular.

Estructura Terciaria del Colágeno:


En el pro-Colágeno, las 3 cadenas están unidas entre sí por puentes de Hidrógeno
entre los grupos Amino y Carboxilo de los residuos de Glicina y por puentes de
Hidrógeno con las cadenas laterales de la OH-Prolina. También se establecen
puentes de Hidrógeno inter-catenarios. Además de los puentes de Hidrógeno, se
establecen también interacciones hidro-fóbicas y electrostáticas o puentes
salinos.
OJO: nuevamente tenemos a las interacciones A, B, C, estabilizando!!! Eso deben
Recordarlo!!!

Como ya se planteó, y se presenta en la siguiente Figura, el pro-Colágeno, es


liberado al espacio extra-celular, por el mecanismo de exocitosis. Cuando pierde
sus fracciones pro-peptídicas o Telo-péptidos, en reacciones catalizadas por las
enzimas pro-Colágeno-Amino-Proteinasa y pro-Colágeno-Carboxi-Proteinasa, se
transforma en el tropo-Colágeno que representa el nivel terciario de organización
estructural. Deben Recordar que estas reacciones ocurren en el espacio extra-
celular.

OJO: las reacciones No serán objeto de Evaluación!! Solo deben Recordar a las
Enzimas!!
pro-Colágeno + H2O  tropo-Colágeno + Telo-péptidos
Enzimas: pro-Colágeno-Amino y Carboxi-Proteinasas.

45- Explicar la naturaleza bioquímica de los puentes cruzados en la molécula de


tropo-Colágeno, puentes intra-tropo-Colágeno.
Bioquímicamente, los puentes cruzados son enlaces covalentes tipo Aldol y
provienen de la transformación en dos etapas, de algunos de los residuos OH-
Lisina. La primera reacción es catalizada por la Lisil-Oxidasa o Lisil-Amino-Oxidasa,
una enzima dependiente de los iones de Cobre y que cataliza una reacción de des-
Aminación Oxidativa. Esta es enzima diferente de la Lisil-OH-asa, que es intra-
celular. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: las reacciones No serán objeto de Evaluación!!

OH-Lisina + Cu  Al-Lisina + NH3 Enzima: Lisil-Oxidasa.

La Al-Lisina es un -aa que posee en el carbono  un grupo Aldehído. Es la segunda


estructura de la siguiente Figura. Después de la des-Aminación, el grupo Metileno,
CH2, ha sido reducido hasta, CHO.

La segunda etapa es espontánea** y consiste en la reacción entre la Al-Lisina con


otras Al-Lisinas o, OH-Lisinas No modificadas. Como ya se planteó, al producto de
estas reacciones se les conoce como puentes cruzados, que son enlaces
covalentes. OJO: los puentes cruzados son productos de condensación Aldólica.

Al-Lisina + Al-Lisina  Enlaces Aldol o puentes cruzados. Reacción


Espontánea.
**- etapa espontánea significa sin la participación de una enzima!!! Eso deben
Recordarlo!!!

Otro tipo de puentes cruzados son las llamadas bases de Schiff. Las bases de Schiff
se forman por la reacción de una Al-Lisina con una Lisina.
Al-Lisina + Lisina  bases de Schiff . Reacción Espontánea.

OJO: los puentes cruzados y las bases de Schiff, son enlaces muy fuertes. Su
función es darle estabilidad a la Estructura Cuaternaria del Colágeno y son los
principales contribuyentes de la gran fuerza tensora de esa molécula!! Eso deben
Recordarlo!!!

Estructura Cuaternaria del Colágeno:


Las moléculas de tropo-Colágeno, dirigidas por los residuos glicosilados de la OH-
Lisina, se ensamblan espontáneamente, para formar a las fibrillas de Colágeno.
Eso deben Recordarlo!!!
Para que se formen las fibrillas se requieren varias etapas que dependen de la
presencia de enzimas específicas sintetizadas y secretadas por los fibroblastos al
espacio extra-celular.

OJO: parte de la información ya presentada, se volverá a repetir!!

Las etapas principales son:


a- remoción de los telo-Péptidos de las moléculas de pro-Colágeno por acción de
las enzimas pro-Colágeno-Amino y Carboxi-Proteinasas ya presentadas. Eso
deben Recordarlo!!!
Con esta reacción se eliminan los extremos globosos, resultando la molécula de
tropo-Colágeno, de menor peso molecular. Esto se muestra en las siguientes
Figuras.

b- Formación de las Fibrillas: las triples hélices del tropo-Colágeno se ensamblan


en fibrillas, momento en el que pueden participar otras proteínas del tejido conectivo
como la Laminina, Fibrilina, Fibronectina, Elastina, Integrina, etc.

OJO: para la formación de las fibrillas es esencial la transformación de algunos de


los residuos de OH-Lisina, una reacción catalizada por la enzima Lisil-Oxidasa. Eso
deben Recordarlo!!!
Como ya se planteó, a los Aldehídos reactivos productos de esa reacción, se les
conoce como Al-Lisina. Las Al-Lisinas forman los puentes cruzados y las bases de
Schiff. Eso deben Recordarlo!!!
Estos son enlaces covalentes fuertes que estabilizan a las fibrillas, que se disponen
paralelas entre sí, pero desplazadas en aproximadamente 1/4 de su longitud. Estos
enlaces o interacciones, son las responsables de la gran “fuerza tensora” de las
moléculas de Colágeno. Lo planteado aquí y anteriormente, se presenta en las
siguientes Figuras.
Las fibrillas se ensamblan para terminar formando a las fibras del Colágeno con
desfase en 1/4.

La resistencia a la tracción, o la fuerza tensora de las fibrillas, va a depender del


número de puentes cruzados que se establezcan entre las moléculas de Colágeno
paralelas entre sí. Estas interacciones son inter-tropo-Colágeno. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: si se inhibe a la enzima Lisil-Oxidasa, Cu-dependiente, la resistencia a la


tracción de las fibrillas disminuye drásticamente y ocurren alteraciones graves en
la estructura de los tejidos conectivos. Eso deben Recordarlo!!!

c- Desfase en Cuartos: como consecuencia de la polimerización del Colágeno


desfasada en 1/4, quedan espacios a largo de la fibrilla en formación, entre los
extremos Amino y Carboxi terminales, de las sucesivas moléculas de Colágeno.
Estos espacios son los que le dan el aspecto de bandas a las fibras del Colágeno
cómo se puede observar en las Figuras anteriores.

46- Explicar la importancia de los residuos glicosilados de la OH-Lisina, en la


formación de la fibra del Colágeno.
OJO: se ha sugerido, que los residuos glicosilados de la OH-Lisina, favorecen el
ensamblaje espontáneo de las moléculas de tropo-Colágeno con desfase en 1/4,
para formar las fibrillas de Colágeno. Eso deben Recordarlo!!!

47- Explicar la importancia del desfase en cuartos en las fibras del Colágeno
durante la biogénesis del tejido óseo.
Las fibrillas de Colágeno se organizan con un patrón llamado de desfase en 1/4,
que es esencial para el depósito de mineral de OH-Apatita en los huesos. Eso deben
Recordarlo!!!

48- Explicar la función que cumplen los puentes cruzados en las fibras del
Colágeno.
Como ya se planteó, estas interacciones son las responsables de la gran fuerza
tensora, y resistencia a la tracción, de las moléculas de Colágeno. Eso deben
Recordarlo!!!

Estructura Quinaria del Colágeno:


Si bien con la molécula Colágeno No se aplica estrictamente este concepto, ya que
como se explicó en Clases, para que haya este nivel, debe existir más de un dominio
Catalítico y Regulador, se utiliza para resaltar las interacciones de las fibras del
Colágeno con muchos otros componentes proteicos y No proteicos, de la matriz
extra-celular, para formar estructuras supra-moleculares estabilizadas por
puentes salinos. Eso deben Recordarlo!!!

49- Explicar la naturaleza biofísica de la asociación de las fibras del Colágeno con
los componentes de la matriz extra-celular.
Como ya se planteó, la asociación de las fibras del Colágeno con los componentes
proteicos y No proteicos de la matriz extra-celular, es por interacciones
electrostáticas o puentes salinos. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: las fibras del Colágeno interaccionan con los Glicosa-Amino-Glicanos,
GAG**, que son derivados glucídicos para formar a los Proteo-Glicanos. Eso
deben Recordarlo!!!
**- son ejemplos de GAG que interaccionan con el Colágeno, el Hialuronato, los
Condroitina-Sulfato, Queratan-Sulfato, etc.
OJO: los Proteo-Glicanos son componentes esenciales para la organización
estructural y funcional de la matriz extra-celular.

OJO: las fibras del Colágeno también reaccionan con otros tipos de Colágenos
como el tipo XII el cuál No forma fibrillas, esto contribuye a asociar a las fibras de
Colágeno entre sí, formando manojos paralelos de fibrillas, y las asocia a otros
elementos de la matriz extra-celular, como las proteínas Laminina, Fibrilina,
Fibronectina, Elastina, Integrina, etc.

50- Discutir la importancia de la síntesis del Colágeno en el proceso de


cicatrización de heridas.
El Colágeno es esencial en el proceso de cicatrización de las heridas, porque es el
componente estructural mayoritario de la piel y de la pared de los vasos
sanguíneos. Cuando por algún trauma, a nivel de la dermis o de los vasos
sanguíneos, el Colágeno que se expone, favorece la activación de algunos Factores
de la Coagulación sanguínea para detener el sangrado, primer paso en el proceso
de la cicatrización de las heridas. Los fibro-blastos sintetizan más Colágeno que
fortalecerá el tapón hemostático formado por las Plaquetas, Fibrina y Fibronectina.

51- Presentar algunos de los 28 tipos de Colágeno, su ubicación tisular y el


porcentaje de glicosilación.
Como ya se ha planteado, la glicosilación Colágeno ocurre sobre los residuos de
OH-Lisina.
OJO: de la siguiente información, solo deben Recordar la expresión tisular y si el %
de glicosilación es  o bajo!!
Serán evaluados, en forma de Pareo o Comparación!!

Tipo I- expresión tisular: hueso, tendón, dermis, dentina, córnea, ligamentos. Es


el más abundante de los tipos de Colágeno. Bajo % de glicosilación**.
**- Bajo es un % < 5%.
Las fibrillas están agrupadas de tal manera, que otorgan a estos tejidos, su
capacidad de estiramiento con resistencia y flexibilidad. Este es el tipo de Colágeno
con el que se elabora la gelatina que conocemos.

Tipo II- expresión tisular: cartílago hialino, humor vítreo del ojo, en el núcleo
pulposo de los discos inter-vertebrales, etc. Su % de glicosilación es de un 10 %.
Tiene como función, otorgar resistencia a los tejidos, en los momentos en que se
realiza una presión intermitente.
Es el tipo de Colágeno que se utiliza en el tratamiento de osteo-artritis y la artritis
reumatoide. También en estética es utilizado para tratar la celulitis, las arrugas,
además de los signos de la edad.

Tipo III- expresión tisular: tejido conjuntivo laxo, paredes de los vasos sanguíneos,
paredes intestinales, útero, hígado, piel, pulmón, en el estroma o tejido conjuntivo
de varias glándulas, etc. Bajo % de glicosilación.
Su principal función se relaciona, con el sostén de los tejidos que se expanden.

Tipo IV- expresión tisular: forma la membrana o lámina basal que subyace a los
epitelios, presente también, en el cristalino o lente del ojo, forma parte del sistema
de filtrado en los vasos capilares y en los grupos de vasos sanguíneos, dentro del riñón.
Alto % de glicosilación.
Es un Colágeno que No polimeriza en fibrillas, sino que forma un fieltro de
moléculas orientadas al azar, asociadas a Proteo-Glicanos y con las proteínas
estructurales Laminina y Fibronectina. Su función principal es la de sostén y
filtración.

52- Colágeno-patías:
Escorbuto, Osteo-génesis imperfecta; síndrome de Ehlers-Danlos tipos IV, VI y VII,
enfermedad de Menkes, etc.
OJO: se conocen algunos los detalles moleculares de los defectos que pueden
producirse en la síntesis del Colágeno y en las enfermedades asociadas.
Serán evaluados, en forma de Pareo o Comparación!!

Escorbuto:
a- Éste se produce por una deficiencia en el aporte dietético de la Vitamina C o
Ascorbato. Esta deficiencia provoca una , en la síntesis de la OH-Prolina e OH-
Lisina, debido a que las enzimas Prolil y Lisil-OH-asas, requieren del Ascorbato
como cofactor para la regeneración del ión Fe2+, el cual, al ocurrir la OH-ción se oxida
a ión Fe3+. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: como ya se ha planteado, la OH-Prolina contribuye a estabilizar la triple hélice


del Colágeno. La triple hélice con una cantidad insuficiente de OH-Prolinas pierde
estabilidad térmica. es menos estable a la temperatura corporal. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: de las manifestaciones Clínicas del Escorbuto, solo se Evaluará lo que está
en “colorcito”: afectación de las encías, sobre todo en personas con dientes, que
comprenden hinchazón, friabilidad, hemorragias, infecciones secundarias y
aflojamiento de los dientes, cicatrización ineficiente de las heridas y reapertura de
las recientemente cicatrizadas, fragilidad capilar , lo que resulta en una
predisposición a los episodios hemorrágicos, particularmente en la piel, supresión del
crecimiento óseo ordenado en los niños**.
**- En los niños, el Escorbuto es a veces llamado, enfermedad de Barlow, nombre
debido al médico británico Thomas Barlow que fue quien la describió. Los síntomas
son: rigidez meníngea, agresividad, anorexia, supuraciones, gastro-enteritis,
hemorragias múltiples y muerte súbita.

b- Osteo-génesis Imperfecta, OI:


La OI es un grupo de al menos, cuatro enfermedades distinguibles por criterios
Clínicos, Genéticos y Bioquímicos. Que se caracterizan por fracturas múltiples que
dan lugar a deformaciones óseas.
OJO: de la OI, se debe Recordar: el tipo de Colágeno que se afecta; el -aa que se
sustituye y los Manifestaciones Clínicas.

El Colágeno que se afecta es el tipo I. Las variantes de esta enfermedad resultan de


mutaciones que conducen a cadenas (I) modificadas, lo que impide la formación
normal de la triple hélice, con la consecuente fragilidad ósea, responsable de las
fracturas múltiples. Eso deben Recordarlo!!!

Otras formas de esta enfermedad, son el resultado de mutaciones puntuales que


conducen a la sustitución de algunas de las Glicinas de la triada Gly-X-Y, por algún
otro -aa. Ya que la función de la Glicina es favorecer el acercamiento de las 3
cadenas para formar una triple hélice con giro a la derecha. Estas sustituciones
provocan desestabilizaciones que se manifiestan en la fragilidad ósea.

Síndrome de Ehlers-Danlos:
El síndrome de Ehlers-Danlos es un grupo de al menos, 10 enfermedades, que son
distinguibles por criterios Clínicos, Genéticos y Bioquímicos. Todas tienen en
común, los síntomas de debilidad estructural en el tejido conectivo.

OJO: se debe Recordar: el tipo de Colágeno que se afecta, el -aa que se sustituye
y las Manifestaciones Clínicas.

Síndrome de Ehlers-Danlos tipo IV:


Este síndrome es causado por defectos en la estructura primaria del Colágeno del
tipo III, que es particularmente abundante en la piel, arterias y órganos huecos. Es
el resultado de una mutación puntual que conduce a la sustitución de algunos de
los residuos de Glicina, esto provoca la alteración de la triple hélice y resulta en
una secreción ineficiente del Colágeno al espacio extra-celular, una  de la
estabilidad térmica y una formación anormal de las fibrillas del Colágeno del tipo
III.
Entre las características se cuenta una piel fina y transparente, a través de la cual se
ven fácilmente las venas, morados marcados y, a veces, una apariencia de
envejecimiento en las manos y en la piel.
OJO: las Manifestaciones Clínicas surgen por la predisposición a una ruptura
arterial, la perforación intestinal, o la ruptura del útero durante el embarazo o el
parto. Eso deben Recordarlo!!!

Síndrome de Ehlers-Danlos tipo VI:


OJO: se debe Recordar: la enzima deficiente, los tipos de Colágeno que se afectan,
la alteración de la fuerza tensora y las Manifestaciones Clínicas.

En este Síndrome existe una deficiencia en la enzima Lisil-OHasa. El resultado es


la síntesis alterada de los Colágenos tipos I y III. Esto conlleva a una piel con un
menor contenido de OH-Lisina, por lo que se afecta el entre-cruzamiento entre las
fibrillas de Colágeno. Esto  la fuerza tensora del Colágeno.
Las Manifestaciones Clínicas una marcada hiper-extensibilidad de la piel e hiper-
movilidad de las articulaciones, cicatrización deficiente y deformidades músculo-
esqueléticas. Eso deben Recordarlo!!!

Síndrome de Ehlers-Danlos tipo VII:


OJO: se debe Recordar: la enzima deficiente y las Manifestaciones Clínicas.
Una variante de esta enfermedad es el resultado de la deficiencia de la enzima pro-
Colágeno-Amino-Proteinasa. Lo que conlleva a la eliminación incompleta del telo-
Péptido Amino terminal de las cadenas de pro-Colágeno.
Como manifestaciones clínicas, se tiene que la piel se magulla fácilmente por la
laxitud de los ligamentos y es hiper-extensible; hay dislocación de las principales
articulaciones como las de la cadera y las rodillas. Eso deben Recordarlo!!!

Enfermedad de Menkes o Síndrome del cabello acerado:


OJO: se debe Recordar: el patrón genético con que se hereda, la enzima deficiente,
el ión, cuyo transporte se afecta!!
Menkes disease and Occipital Horn Syndrome are related disorders of copper
transport that involve abnormal neuro-development, connective tissue problems,
and often premature death. The gene responsible for these conditions on the X
chromosome which encodes a highly evolutionarily conserved, copper-transporting-
ATPase.
Síndrome de Marfan:
OJO: se debe Recordar: la proteína deficiente.
Este Síndrome se debe a una mutación del gen FBN1 que codifica para la proteína
estructural Fibrilina-1. Es un desorden que se hereda con patrón autosómico
dominante. Afecta al tejido conectivo, sobre todo a los sistemas músculo esquelético,
cardiovascular y a los ojos. Esto se debe a que Fibrilina-1 polimeriza para formar
miofibrillas, que se asocian en fibras elásticas, que le confieren a la piel, ligamentos, y
vasos sanguíneos, la capacidad de estirarse.
Los pacientes muestran una complexión asténica, con estatura alta, largos brazos y
manos y dedos como los de una araña. La musculatura está pobremente desarrollada,
con poca grasa sub-cutánea y una gran laxitud de las articulaciones y ligamentos.
Cutis Laxa:
OJO: se debe Recordar: la proteína deficiente.
La enfermedad se debe a un defecto de la enzima Lisil-Oxidasa, una enzima
dependiente de los iones de cobre y que también cataliza, las reacciones de entre-
cruzamiento de la proteína Elastina.
Es una enfermedad muy rara, sea adquirida o congénita. En ella, la degeneración de
las fibras elásticas de la piel hace que ésta quede suelta y pendulante. fectación
hereditaria o adquirida del tejido conectivo. Se caracteriza por una piel arrugada,
abundante y flácida, que ha perdido su elasticidad, y se asocia con anomalías
esqueléticas o del desarrollo y, en algunos casos, con una afectación sistémica grave.
La mayoría de los casos de CL son hereditarios. Su prevalencia al nacimiento se estima
en 1/1.000.000

Consideraciones Clínicas:
OJO: esta Información No se Evaluará.
Al aumentar la edad, el Colágeno presenta mayor número de entre-cruzamientos
por enlaces covalentes entre las cadenas. Estos enlaces o puentes se forman por la
enzima Lisil-Oxidasa.
El mayor número de entre-cruzamientos provoca que el Colágeno sea cada vez
menos elástico y más quebradizo. Como consecuencia, los huesos y los tendones
de los “viejos”, pueden romperse con mayor facilidad y la piel pierde gran parte de
su elasticidad.
Esto también afecta al cristalino del ojo, formado por un tipo especial de Colágeno
transparente, que conforme aumenta el número de estos enlaces con la edad, va
perdiendo transparencia, llegando a perderla totalmente, apareciendo las Cataratas.
Muchos procesos que asociamos con el envejecimiento son consecuencias de este
sencillo proceso de entre-cruzamiento que sigue a lo largo de la vida!

Síntesis y Procesamiento de la Molécula de Colágeno, intra y extra-celular.


Cofactores:
86- Definir los conceptos de cofactores enzimáticos, coenzimas, cofactores
metálicos, metalo-coenzimas, grupos prostéticos, Apo-enzima y Holo-enzima.

a- Cofactores enzimáticos: por lo general, moléculas de naturaleza orgánica No


proteica, y de baja masa molecular. Son necesarios para la acción catalítica de
algunas enzimas. Participan en el proceso de catálisis como intermediarios en la
transferencia de Equivalentes Reductores, desde un donador hasta un aceptor, y
en la transferencia de grupos funcionales. Los cofactores enzimáticos son termo
estables a diferencia de las enzimas. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: algunos cofactores son de naturaleza iónica.

b- Co-Enzimas: son unos de los tipos de cofactores enzimáticos que se


caracterizan porque se unen débilmente a las enzimas. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: a diferencia de las enzimas, las coenzimas se modifican durante la reacción


química y deben ser regeneradas. La principal función de las co-enzimas es actuar
como intermediarios metabólicos. No son responsables de la especificidad de las
enzimas. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: muchas co-enzimas son las formas funcionales de las vitaminas Hidro-
solubles. Son ejemplos de co-enzimas: la Co-enzima-A, CoA-SH, el NAD+, NADP+,
la Vitamina C o Ascorbato, etc. Eso deben Recordarlo!!!

En la CoA-SH y el NAD+, el nucleótido de Adenosina forma parte de su estructura.


Esto se presenta en las siguientes Figuras, respectivamente.
En la siguiente Figura se presenta la forma oxidada y reducida del NAD+.

c- Cofactores Metálicos: son los iones de algunos metales, por lo general de


transición, que participan en el proceso de catálisis de algunas enzimas. Son
ejemplos de iones metálicos: el Fe2+, Cu2+, Zn2+, Co2+, Mo4+, Ca2+, Mn2+, Mg2+, K+,
entre otros. Todos son Cationes!!! Eso deben Recordarlo!!!

OJO: los iones metálicos se requieren sólo en pequeñas cantidades, por lo que se
consideran como elementos esenciales en trazas o micronutrientes.
A las enzimas que requieren de iones metálicos se les conoce como metalo-
enzimas. Eso deben Recordarlo!!!

d- Grupos prostéticos: son moléculas orgánicas que forman parte de la estructura


de algunas enzimas, a las que se unen fuertemente, por enlaces covalentes. Eso
deben Recordarlo!!!

OJO: los grupos prostéticos, al igual que las Co-Enzimas, deben regresar a su
forma original durante cada evento catalítico, de lo contrario, la Apo-enzima** No
continuará siendo catalíticamente activa.
**- La Apo-enzima corresponde a la fracción proteica de la enzima, como se verá
más adelante.
Las proteínas con grupo prostético reciben el nombre de hetero-proteínas o
proteínas conjugadas. Eso deben Recordarlo!!!

Son ejemplos de grupos prostéticos, la FMN, el FAD, el Piridoxal-Fosfato, PL-P, la


Biotina, la Tiamina-Piro-Fosfato, TPP, la Lipo-Amida, el grupo Hemo, etc. Eso
deben Recordarlo!!!
e- Como ya se planteó, la Apoenzima: es la fracción proteica de una Holo-Enzima.
Eso deben Recordarlo!!!

f- Holo-Enzima: es una proteína con función catalítica, que está formada por una
fracción proteica llamada Apoenzima y una fracción No proteica llamada Cofactor.
Eso deben Recordarlo!!!

OJO: El cofactor como ya se planteó, es una molécula orgánica compleja, si está


unida fuertemente, es el grupo prostético. Si es débilmente, es la coenzima. Pueden
ser también, iones metálicos.

OJO: como ya se planteó, todas las holo-Enzimas con grupo prostético son hetero-
proteínas, o proteínas conjugadas. Eso deben Recordarlo!!!

87- Explicar la función biológica de las Vitaminas como precursoras de co-


Enzimas.
Las formas co-enzimáticas de las Vitaminas, participan catalíticamente en
múltiples procesos metabólicos, como se verá a continuación.
Las Vitaminas son sustancias orgánicas imprescindibles para la vida. La mayoría
de las cuales, No pueden ser sintetizadas por las células, razón por la cual, deben
ser ingeridas a través de alimentos. Se requieren en pequeñas cantidades, para el
mantenimiento de las funciones metabólicas.

OJO: como se plantea en la siguiente Figura, las Vitaminas No constituyen una


fuente de energía, es decir, No son “combustibles metabólicos”, sin embargo, sin
ellas, las células No serían capaces de aprovechar los elementos energéticos
suministrados por la alimentación. Eso deben Recordarlo!!!
Por la función que realizan, como precursoras de la mayoría de los cofactores
enzimáticos, la carencia o deficiencia, de alguna de ellas, puede afectar de forma
considerable el metabolismo intermediario.

88- Explicar la función general que cumplen los cofactores enzimáticos en el


proceso de catálisis.
Como ya se planteó, los cofactores enzimáticos actúan favoreciendo el proceso de
catálisis de algunas enzimas, ya sea: a- aceptando o donando equivalentes
reductores; b- aceptando temporalmente un grupo funcional, para que éste pueda
ser transferido.
OJO: al No ser catalíticamente activos, a los cofactores se les llama también, co-
Sustratos. Eso deben Recordarlo!!!
Después del proceso de la catálisis, algunos cofactores son liberados y se requiere
de una segunda reacción independiente para regenerarlos. Otros cofactores en
cambio se unen fuertemente a la enzima y continúan asociados a ella durante y
después de la reacción.
OJO: nuevamente, a los primeros se les llama co-Enzimas y a los segundos grupos
prostéticos. Eso deben Recordarlo!!!

89- Clasificar a los cofactores enzimáticos como co-enzimas, cofactores metálicos,


o metalo-co-enzimas.
Como ya se planteó en el objetivo anterior, una co-enzima, es un cofactor que se
une débilmente a una enzima y después del proceso de catálisis es liberado y debe
ser regenerado.
OJO: las co-enzimas se unen a la enzima por las interacciones A, B y C, que son las
débiles!! Eso deben Recordarlo!!!

Un cofactor metálico, es un ión asociado a una enzima y necesario para el proceso


catalítico. Eso deben Recordarlo!!!
Una metalo-co-enzima, es una molécula orgánica que tiene asociado un ión
metálico. Es el ión, el que, en el proceso de catálisis, pasa de un estado reducido a
uno oxidado, o a la inversa, y debe ser regenerado.
OJO: el grupo Hemo es un ejemplo de una metalo-co-enzima. Eso deben
Recordarlo!!!

90- Definir el concepto de Equivalente Reductor.


El Equivalente Reductor es una especie química que es donada o aceptada, durante
el proceso de catálisis.
OJO: son ejemplos de equivalentes reductores: los electrones, los átomos de
Hidrógeno y el ión Hidruro. Eso deben Recordarlo!!!

91- Describir la naturaleza física o química, de los siguientes Equivalentes


Reductores: átomo o radical de hidrógeno, ión hidruro, electrón.
El átomo o radical de hidrógeno es el elemento químico con un electrón y un
protón; el ión hidruro es un átomo de hidrógeno con 2 electrones y un protón; los
electrones son las partículas subatómicas cargadas negativamente. Eso deben
Recordarlo!!!
92- Mencionar la especie química transferida por los siguientes Cofactores en
reacciones de Oxidación-Reducción: NADH; NADPH; Lipo-Amida; Glutatión, G-SH;
Ubiquinona; Ascorbato; Biopterina, Folato; FADH2; FMNH2 y el grupo Hemo.

Cofactores Especie Química Transferida


NADH y NADPH: ión Hidruro, H-
Lipo-Amida: H-
Glutatión: H-
Ubiquinona: átomos de Hidrógeno H
Ascorbato: H
Biopterina: H
Folato: H
FADH2: H- o H
FMNH2: H- o H
Grupo Hemo: electrones, e-.

Esta información será evaluada en forma de Pareo, o preguntas de Comparación!!

93- Describir las características estructurales y la función, de cada uno de los


Cofactores anteriores en los estados oxidado y reducido.
OJO: ya se ha presentado la estructura de algunos de los cofactores, para que vean
que son moléculas de naturaleza orgánica no proteica. La función de esos
cofactores es la transferencia de equivalentes reductores, como se explicó en el
Objetivo # 90.

94- Explicar las funciones catalíticas de los Cofactores Metálicos.


Los cofactores metálicos actúan como:
a- centros catalíticos primarios; b- ácidos de Lewis al ser electró-filos; c-
transferidores de electrones; d- contribuyentes de la estabilidad estructural de las
enzimas; e- favorecedores de la unión del sustrato al sitio catalítico; f-
estabilizadores de cargas en el estado de transición, etc.

OJO: la información anterior se evaluará en una Pregunta de Escogencia!!

95- Mencionar la función bioquímica, es decir, el tipo de reacción en el que


participan los siguientes Cofactores de transferencia de grupos:
a- Tiamina-Piro-Fosfato, TPP; b- Co-enzima-A, CoA-SH; c- Fosfato de Piridoxal, PL-
P; d- Biocitina; e- Lipo-Amida; f- Nucleósidos tri-Fosfato, ATP y GTP; g-
Nucleósidos di-Fosfato, UDP y CDP; h- Folato; i- Cobalamina; j- S-Adenosil-
Metionina, SAM.
OJO: de la función bioquímica de esos cofactores, solo se evaluará, el tipo de
reacción en el que participan y el grupo transferido. En un Pareo!!

a- Tiamina-Piro-Fosfato, TPP:

La TPP es la forma activada de la vitamina B-1, el Carbono en rosado que se


presenta en la Figura anterior, en el anillo de Tiazolio, es la parte reactiva de la
molécula.
OJO: la TPP participa en reacciones de des-Carboxilación, como en los complejos
multi-enzimáticos de la Piruvato-DesHidrogenasa y la alfa-Ceto-Glutarato-
DesHidrogenasa. Eso deben Recordarlo!!!

El complejo multi-enzimático de la Piruvato-DesHidrogenasa, PDH, se muestra en


la siguiente Figura.
OJO: la TPP, también es cofactor de la enzima trans-Cetolasa de la vía de las
Pentosas-Fosfato. Eso deben Recordarlo!!!

b- Co-enzima-A, CoA-SH:
La CoA-SH forma parte del Acido Pantoténico o vitamina B-5; participa en
reacciones de transferencia de grupos Acilo, R-C=O, para formar tio-ésteres. Eso
deben Recordarlo!!!

OJO: como, se presenta en la Figura anterior, la CoA-SH es, junto con la TPP y la
Lipo-Amida; uno de los 5 cofactores de la PDH, allí acepta a un grupo Acilo, para
convertirse en Acetil-CoA, un metabolito esencial en el Metabolismo
intermediario!! Eso deben Recordarlo!!!
c- Fosfato de Piridoxal:
El PL-P, es la forma activada de la Piridoxina o vitamina-B-6, participa en
reacciones de transferencia de grupos Amino. Eso deben Recordarlo!!!

Es el cofactor de la Glucógeno-Fosforilasa, enzima que se Estudiará en este Curso,


y también de las enzimas Amino-Transferasas o trans-Aminasas, que se Estudiarán
en BQ-2.

d- Biocitina:
La Biocitina, es la forma activada de la vitamina-B-8 o Biotina, se forma por la unión
de la Biotina a un residuo específico del α-aa Lisina, en las enzimas que lo utilizan
como cofactor, como se presenta en la siguiente Figura.

OJO: la Biocitina a diferencia de la vitamina K, participa como el cofactor típico, en


las reacciones de Carboxilación, catalizadas por enzimas Carboxilasas. Eso deben
Recordarlo!!! En este Curso se Estudiará a la Piruvato-Carboxilasa.

e- Lipo-Amida:
Se forma por la unión covalente de un derivado órgano-sulfurado del ácido octanoico,
a un residuo específico del α-aa Lisina.
Es la forma activada del Lipoato. Participa en reacciones de Acilación, al igual que
la CoA-SH. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: la Lipo-Amida, es el único cofactor con función dual, es decir, que participa
en reacciones de Oxidación-Reducción y de Transferencia de Grupos. Eso deben
Recordarlo!!!
En la Figura anterior se presenta reduciendo al cofactor NAD+, como ocurre en la
des-Carboxilación Oxidativa del Piruvato. En la reacción, pasa al estado oxidado
que es el activo para aceptar al Hidroxi-Etilo, que se forma por la des-Carboxilación
del Piruvato.

f- Nucleósidos tri-Fosfato, ATP y GTP:


Participan en reacciones de Fosforilación, piro-Fosforilación y Núcleo-tidilación.
Eso deben Recordarlo!!!

OJO: el ATP y GTP son los derivados núcleo-tídicos, de las bases nitrogenadas
purínicas, Adenina o Guanina.

g- Nucleósidos di-Fosfato, UDP y CDP:


El UDP participa en reacciones de Glicosilación, para formar a la UDP-Glucosa. Eso
deben Recordarlo!!!

Son los derivados núcleo-tídicos, de las bases nitrogenadas pirimidínicas, Uridina


y Citidina.

OJO: la UDP-Glucosa, es el metabolito activado de la Glucosa, se Estudiará en este


Curso en la Síntesis del Glucógeno.

h- Folato o vitamina-B-9:
El Folato en su forma activada, el tetra-Hidro-Folato, H4F, participa en reacciones
de Alquilación. Eso deben Recordarlo!!!
Es el cofactor de enzimas que catalizan reacciones de transferencia de Unidades-
Mono-Carbonadas, que se Estudiarán en BQ-2.

OJO: No es lo mismo, reacciones de Alquilación que de Acilación!!

i- CobalAmina:
La Cobalamina, es la forma activa de la vitamina B-12. Participa en reacciones de
Alquilación. Eso deben Recordarlo!!!
Es el cofactor de 2 enzimas que catalizan reacciones de transferencia de Unidades
-Mono-Carbonadas, que se Estudiarán en BQ-2.

OJO: No es lo mismo, reacciones de Alquilación que de Acilación!!

j- S-Adenosil-Metionina, SAM:
La S-AM, participa en reacciones de Metilación. Eso deben Recordarlo!!!
Es el “Agente Metilante” por excelencia en el Metabolismo intermediario. Se
Estudiará en BQ-2.

OJO: las reacciones de Metilación son ejemplos de reacciones de Alquilación.


La SAM, es un derivado núcleo-tídico de la base nitrogenada purínica, Adenina.
Como se muestra en la siguiente Figura, se forma a partir del -aa Metionina y el
ATP.
96- Relacionar la deficiencia de las siguientes vitaminas, con las respectivas
Enfermedades Carenciales o Avitaminosis:
Tiamina o vitamina B-1; Ribo-Flavina o vitamina B-2; Niacina o vitamina B-3; Acido
Pantoténico o vitamina B-5; Piridoxina o vitamina B-6; Ácido Fólico; Ascorbato o
vitamina C; Biotina; Cobalamina o vitamina B-12.
La carencia o deficiencia de alguna de estas vitaminas, puede afectar de forma
considerable al metabolismo, deteniendo los procesos de reproducción y
crecimiento, o aumentando la susceptibilidad a las infecciones. A estas
deficiencias se les conoce como “Enfermedades Carenciales o Avitaminosis”.

OJO: esta Información será Evaluada en forma de Pareo!!

Síndromes por Deficiencias Vitamínicas:


vitamina Deficiente Síndrome Síntomas/Signos
B-1 Beri-beri Pérdida del apetito, constipación, náuseas, Lesión cerebral,
nerviosa y cardiaca. Encefalopatía o psicosis de Wernicke-
Korsakoff.
B-2 Lesiones cutáneas, como queilosis o estomatitis angular,
glositis, dermatitis, queratitis, retraso en el crecimiento,
perturbaciones oculares y oro-genitales.
B-3 Pelagra Glositis superficial, dermatitis, diarrea, demencia.
Enfermedad de las
3 “d”.
B-5 No descrito en
Humanos*
B-6 Dermatitis, irritabilidad nerviosa, depresión, neuro-patía
periférica, convulsiones y coma, Anemia Sidero-Blástica.
Acido Fólico B-c Anemia megalo-blástica y macro-cítica,  homo-Cisteína y
con esto, el Riesgo de la Enfermedad Cardio-vascular,
homo-Cisteinuria.
Vitamina C Escorbuto Debilidad muscular, hemorragias**, edema, dificultad
para cicatrizar, osteo-porosis, anemia, inmuno-deficiencia,
etc.
Biotina, vit B-8 Rara*** Lesiones cutáneas, anemia, depresión, alucinaciones,
dolores musculares, desordenes inmunológicos en niños
con deficiencias severas de las enzimas Carboxilasas.
B-12 Anemia megalo-blástica y macro-cítica, desordenes
neurológicos, homo-Cisteinuria, aciduria Metil-Malónica.
*- El Acido Pantoténico, Pantetonato o vitamina B-5, es la forma vitamínica que
contiene a la Co-A-SH, que como ya se explicó, participa en la transferencia de
grupos Acilo, R-C=O.
Su nombre deriva del griego pantothen, que significa “de todas partes”, pues hay
pequeñas cantidades de ácido pantoténico en casi todos los alimentos, es por eso, que
su deficiencia es, excepcionalmente rara en los humanos.

**- Involucra, sangramiento de las encías, fragilidad capilar, hemorragias sub-


cutáneas o petequias, etc.
***- La deficiencia de esta vitamina es rara porque es sintetizada por enzimas de la
flora bacteriana intestinal.

OJO: sin embargo, el consumo de huevos crudos puede provocarla, debido a que la
proteína Avidina que se encuentra en la clara, se une fuertemente a este cofactor,
 su disponibilidad. Eso deben Recordarlo!!!

Tarea # 2. a- Investigar el nombre de los científicos que recibieron el premio nobel,


por sus Trabajos con la vitamina C; b- Investigar el año en el que recibieron los
premios; c- De los científicos, cuál fue, el que la nombró Ascorbato, o ácido
Ascórbico?

Resumen:

Enzimas:
Introducción:
Las enzimas están en el centro de cada proceso bioquímico. Actuando en las vías
metabólicas en secuencias organizadas, catalizan cientos de reacciones
consecutivas mediante las cuales, se degradan nutrientes, se conserva y
transforma la energía química, y se sintetizan las macro-moléculas a partir de
precursores sencillos.
A través de la acción de las enzimas reguladoras las vías metabólicas están
altamente coordinadas, proporcionando una armoniosa influencia recíproca entre
la multitud de actividades diferentes que son necesarias para la vida.

Con la excepción de un pequeño grupo de moléculas de RNA catalítico, las


llamadas Ribo-zimas, todas las enzimas son proteínas. Como ya se planteó, su
actividad catalítica depende de la integridad de su conformación proteica nativa. Si
se desnaturaliza o se disocia en sus sub-unidades, se pierde la actividad catalítica.
Así, las ya estudiadas, estructuras primarias, secundarias, terciarias y
cuaternarias de las enzimas, son esenciales para sus actividades catalíticas.
Las enzimas son moléculas con una  especificidad y actúan catalizando
reacciones termodinámicamente posibles, en donde unas moléculas denominadas
Sustratos, son transformadas en moléculas diferentes denominadas Productos a
una gran velocidad!!
Sin embargo, se debe aclarar, que las enzimas No alteran el valor de la ΔG real de
las reacciones, Ni la constante de equilibrio. Las enzimas  la energía de
activación, por ello son bio-catalizadores.
En las reacciones catalizadas por las enzimas, las concentraciones del Sustrato y
del Producto son cientos, o miles de veces, más grandes que la concentración de
la enzima. Consecuentemente, cada enzima cataliza la conversión en Producto de
muchas moléculas de Sustrato. La transformación del Sustrato en Producto
involucra la formación de un “Estado de Transición” y éste, ocurre más fácilmente
en un sitio de unión específico en la estructura de la enzima. Este sitio, el “sitio
catalítico”, ha sido formado evolutivamente para proveer la unión específica de alta
afinidad por el Sustrato y un medio ambiente que favorece los eventos catalíticos.
Entre la unión del Sustrato a la enzima, la aparición del Producto, una serie de
eventos complejos deben sucederse. Se debe formar un complejo Enzima-
Sustrato, ES; este complejo debe pasar a un “Estado de Transición” energizado,
ES*. El ES* avanza a un complejo Enzima-Producto, EP. Este último, es finalmente
competente para disociarse en Producto y Enzima libre. La serie de eventos puede
indicarse así:
E +S<——>ES<——>ES*<——>EP<——>E+P.

La cinética de reacciones simples como la anterior, fue caracterizada por primera


vez en 1913 por Leonor Michaelis y Maud Menten. Los conceptos que respaldan su
análisis sobre la cinética enzimática continúan aportando, para entender el
metabolismo, y para el desarrollo y uso Clínico, de Fármacos diseñados para alterar
selectivamente, constantes de proporciones, e interferir con el progreso de los
procesos de enfermedad.
La ecuación de Michaelis-Melten, es una descripción cuantitativa de la relación
existente, entre una reacción catalizada por una enzima [V1], la concentración del
Sustrato [S] y dos constantes o parámetros cinéticos, la Vmáx y KM.
El modelo cinético de Michaelis-Menten describe la Velocidad de muchas
reacciones enzimáticas. Aunque solo es válido cuando la [S] >> [E], y para
condiciones de “Estado Estacionario”, o sea que la [ES] es constante. Este modelo
ayudó mucho al desarrollo de la cinética de las enzimas gracias a su simplicidad y
aplicabilidad. Sin embargo, No explica las propiedades cinéticas de otras muchas
enzimas. Éstas presentan un comportamiento cinético “sigmoidal”, diferente del
hiperbólico, típico del modelo de Michaelis-Menten. A estas enzimas se les conoce
como “Enzimas Alostéricas”, y tienen además del sitio catalítico, un sitio regulador.

Las enzimas Alostéricas, catalizan reacciones claves para el flujo de una vía
metabólica, razón por la cual, son controladas por diferentes mecanismos; unos de
acción rápida y otros de acción lenta.
Los mecanismos de acción rápida son reversibles y son los que regulan
fisiológicamente a cada momento la actividad enzimática. Estos mecanismos
incluyen, la regulación Alostérica; la regulación por Modificación Covalente
Reversible, mejor conocida, como reacciones de Fosforilación-des-Fosforilación;
y por proteínas de control como la Calmodulina. etc., etc.
Los mecanismos de acción lenta controlan la cantidad y proporción de la síntesis
de las enzimas, con respuesta de horas, días o aún semanas, éstos incluyen; la
regulación de la expresión de los genes, mejor conocido como Inducción-
Represión; la degradación enzimática dependiente o No, de la proteína Ubiquitina
y las modificaciones covalentes irreversibles de pro-enzimas o precursores
proteicos inactivos a las formas activadas.
Otro mecanismo para regular la actividad enzimática es secuestrar a las enzimas
en compartimientos en donde el acceso de sus sustratos es limitado. Por ejemplo,
la proteólisis de proteínas celulares por las enzimas responsables de su
degradación se controla secuestrando a estas enzimas dentro de los lisosomas;
también, manteniendo al sustrato en el citosol y a la enzima en las mitocondrias,
etc.
La cinética enzimática estudia la Velocidad de las reacciones catalizadas por las
enzimas. Estos estudios proporcionan información directa acerca del mecanismo
de la reacción catalizada y de la especificidad de la enzima.
106- Definir el término enzima en relación con su función bioquímica y su
naturaleza química.
Las enzimas son moléculas de naturaleza, generalmente proteica, que catalizan
reacciones químicas, siempre que sean termodinámicamente favorables. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: las enzimas permiten que una reacción química que es energéticamente
posible, pero que transcurre a una velocidad muy baja, sea cinéticamente
favorecida, es decir, que transcurra a mayor velocidad de lo ocurriría, sin su
presencia. En estas reacciones, las enzimas actúan sobre unas moléculas
denominadas Sustratos, las cuales son transforman en moléculas diferentes
denominadas Productos. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: casi todos los procesos celulares requieren de enzimas para que transcurran
a unas tasas significativas. A las reacciones catalizadas por enzimas se las
denominan reacciones enzimáticas.
Las enzimas son bio-catalizadores!! Eso deben Recordarlo!!!

107- Comparar las características de los catalizadores químicos con las enzimas.
La acción de los catalizadores consiste en:
1-  la Energía de activación, Ea**, esto lo hacen tanto los catalizadores químicos
como las enzimas. Sin embargo, las enzimas son catalizadores especialmente
eficaces, ya que  la Ea aún más que los catalizadores químicos. Eso deben
Recordarlo!!!

**- La Energía de activación, es la que se debe suministrar al Sustrato, para que la


reacción transcurra y se forme el Producto. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: por ejemplo, la descomposición del agua oxigenada, H2O2 para producir H2O
y O2, puede ocurrir sin catalizador, con un catalizador químico como el Platino, o
con una enzima específica, la Catalasa. Las respectivas Ea para cada proceso son
18, 12 y 6 Kcal/mol, respectivamente. Así, se puede calcular que el Platino acelera
la reacción 20000 veces, mientras que la Catalasa la acelera 370000 veces. Casi, 20
veces más!!

2- Para la acción de los catalizadores químicos se requiere de temperaturas y


presiones , las enzimas actúan a temperaturas relativamente bajas y a la presión
de 1 atmósfera!! Eso deben Recordarlo!!!

3- Las enzimas se requieren en cantidades mínimas comparadas con los


catalizadores químicos. Eso deben Recordarlo!!!

4- Las enzimas tienen mayor especificad por el Sustrato que los catalizadores
químicos. Eso deben Recordarlo!!!

5- Las enzimas tienen la capacidad de ser reguladas lo que No ocurre con los
catalizadores químicos!! Eso deben Recordarlo!!!

108- Mencionar las características estructurales y funcionales más importantes de


las enzimas.
Estructuralmente hablando, las enzimas pueden ser Simples o Compuestas. Son
simples, si solo están formadas por -aa. A las enzimas compuestas también se les
conoce como Conjugadas o hetero-Proteínas. Estas enzimas requieren para su
actividad catalítica, de moléculas orgánicas accesorias de naturaleza No proteica
llamadas Cofactores. Para estas enzimas, a la fracción proteica se le conoce como
Apo-enzima y al conjunto de la Apo-enzima y el Cofactor, se le conoce Holo-
enzima. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: funcionalmente, como ya se planteó, las enzimas  las velocidades de las


reacciones que catalizan al tener  especificidades de Sustrato y Producto; su
actividad está sujeta a regulación, ya sea para  o . Algunas catalizan reacciones
cercanas al equilibrio, en donde las reacciones directa e inversa, son catalizadas
por la misma enzima. Otras catalizan reacciones alejadas del equilibrio, que son
uni-direccionales. Finalmente, las enzimas interconvierten diferentes formas de
Energía.

109- Explicar las funciones termodinámicas de las enzimas.


Las enzimas como bio-catalizadores, actúan para que una reacción química que sea
termodinámicamente favorable, pero que sin la enzima, transcurre a una velocidad
muy , proceda a una mayor velocidad.
Para ello, las enzimas  la energía de Activación del “Estado de Transición”, ES*,
de la reacción catalizada como se presenta en la siguiente Figura.

OJO: por todo lo anterior, las enzimas funcionan para que el Equilibrio se alcance
más rápidamente. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: las enzimas solo aceleran las reacciones que catalizan, por que como ya se
planteó,  la energía de Activación del ES*. Sin embargo, No alteran el valor de la
energía libre real de las reacciones, la llamada ΔG real, Ni la constante de
equilibrio; valores que son los mismos para las reacciones catalizadas, como para
las No catalizadas. Eso deben Recordarlo!!!

110- Describir las características más importantes del “sitio catalítico”.


Son características del sitio catalítico:
a- es una hendidura, cavidad o bolsillo en la conformación de la enzima; b- lo
componen un número reducido de residuos de -aa, alejados en la secuencia de
la enzima; c- presenta la distribución tri-dimensional apropiada para la interacción
con el Sustrato; d- la interacción con el Sustrato se da a través de fuerzas o enlaces
débiles, las llamadas A, B, C; e- la unión del Sustrato provoca la salida de Agua.
Eso deben Recordarlo!!!

OJO: en la siguiente Figura se presenta, la complementariedad que existe entre la


forma del Sustrato y la del sitio catalítico, todo lo cual favorece el proceso de la
catálisis.
OJO: en la siguiente Figura se presentan, los pocos residuos de -aa, que forman
al sitio catalítico, y lo alejados que están en la secuencia de la enzima. Debido al
ordenamiento espacial que se da en los niveles secundarios y terciarios, los grupos
funcionales de los -aa, presentados en rojo, quedan lo suficientemente cerca para
poder interaccionar con el Sustrato.

OJO: esa es la “triada catalítica” típica, de las llamadas “Proteasas de Serina”,


enzimas de la Clase Hidrolasa, como la Quimo-tripsina, Trombina, etc.

111- Describir los Modelos que intentan explicar la especificidad del sitio catalítico.
La especificidad enzimática se debe a la estructura tridimensional del sitio
catalítico. Existen 2 modelos para explicar cómo se produce la unión del Sustrato
al sitio catalítico. El Modelo de Llave-Cerradura y el de Encaje, acople, ajuste,
Inducido. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: el Modelo Llave-Cerradura, fue propuesto por Emil Fisher en 1894, y supone
que la estructura del Sustrato y la del sitio catalítico son exactamente
complementarias, de la misma forma que una Llave encaja, acopla, ajusta, en una
Cerradura. Este modelo es válido en muchos casos, pero No siempre es correcto.

En la Figura anterior se presenta lo planteado, y el ejemplo de una reacción ya


terminada con sus Productos, la Glucosa y el ATP.
Al inicio era, Glucosa-6-P + H2O  Glucosa + Pi
ADP + Pi  ATP

OJO: si se produjera un acoplamiento “Llave-Cerradura”, muchas veces el complejo


E-S sería tan estable que la reacción No ocurriría. Es por eso, que este Modelo, es
muy restrictivo. Eso deben Recordarlo!!!
Por este modelo actúan muchos venenos metabólicos, como los Compuestos Organo-
Fosforados, el Cianuro, etc.

OJO: el Modelo del Encaje Inducido fue propuesto en 1958, por Daniel Koshland,
64 años después!!
Este modelo supone que, el sitio catalítico adopta la conformación correcta solo en
presencia del Sustrato. La unión del Sustrato al sitio catalítico, desencadena un
cambio conformacional en la enzima, que conduce a la formación del Producto.
Sería algo semejante a la introducción de una mano en un guante. La mano, que es
el Sustrato, hace que el guante, que es el sitio catalítico, se acople mejor cuando
éste, se introduce en él. Es por eso, que el Modelo del Encaje Inducido, es muy
versátil y flexible. Eso deben Recordarlo!!!

En la siguiente Figura se presenta, el Modelo del Encaje Inducido.

112- Clasificar a las enzimas atendiendo al tipo de reacción que catalizan,


presentando ejemplos representativos.
Para nombrar a una enzima de forma Tradicional, se emplea un término que alude
al Sustrato o al Producto, y al tipo de reacción catalizada. A este término se le añade
la terminación “asa”.
OJO: siempre hay excepciones a estas Reglas de Nomenclatura, como con las
enzimas Tripsina, Pepsina, Trombina, etc.

OJO: la siguiente Información, No será objeto de Evaluación, es solo para que


amplíen sus Fronteras del Conocimiento!!!
Las enzimas también tienen un Nombre Sistemático que consta de 3 componentes:
a- el sustrato principal; b- el tipo de reacción catalizada; c- la terminación “asa”.
Además de los nombres tradicionales y sistemáticos, existe para cada enzima un
Código Numérico, que comienza con las letras EC, Enzyme Commission, seguidas
de cuatro números separados por puntos. El primer número indica la Clase a la cual
pertenece la enzima; el segundo se refiere a distintas sub-Clases dentro de cada grupo;
el tercero y el cuarto se refieren a los grupos químicos específicos que intervienen en la
reacción.
Así como ejemplo, la enzima Gluco-quinasa, se define como EC 2.7.1.2. El número
2 indica que es una Transferasa, el 7 que es una Fosfo-Transferasa, el 1 indica que
el aceptor es un grupo OH, y el último 2 indica que es un OH de la D-Glucosa el que
acepta al grupo Fosfato.

OJO: según el tipo de reacción que catalizan, las enzimas se Clasifican en 6 Clases:
Esta Información será objeto de Evaluación, en forma de Pareo!!

1- Oxido-Reductasas: catalizan reacciones de oxidación-reducción con pérdida y


ganancia de equivalentes reductores.
Ejemplos: Deshidrogenasas, DH y Reductasas. Eso deben Recordarlo!!!

Para la Lactato-DH el EC es 1.1.3.4.


2- Transferasas: catalizan reacciones de transferencia de Grupos funcionales entre
moléculas.
Ejemplos: Quinasas, Trans-Aminasas, etc. Las Quinasas Transfieren grupos
Fosfato y las Trans-Aminasas grupos Amino. Eso deben Recordarlo!!!

3- Hidrolasas: catalizan reacciones de Hidrólisis.


Ejemplos: Fosfatasas, Esterasas, Peptidasas, etc. Eso deben Recordarlo!!!

4- Liasas: catalizan reacciones de adición de H2O a dobles enlaces, de pérdida de


H2O, con formación de dobles enlaces, formación de enlaces, C-C; C-N; C-O, etc.
Ejemplos: Sintasas, Hidratasas, des-Hidratasas, des-Carboxilasas, etc. Eso deben
Recordarlo!!!

5- Isomerasas: catalizan reacciones de transformación de un isómero en otro.


Ejemplos: Isomerasas, Mutasas, Epimerasas, etc. Eso deben Recordarlo!!!

6- Ligasas: catalizan reacciones de unión de moléculas o de un grupo funcional,


en otra molécula, utilizando la energía de hidrólisis del ATP.
Ejemplos: Sintetasas, Carboxilasas, etc. Eso deben Recordarlo!!!
113- Mencionar los parámetros celulares que afectan la velocidad de una reacción
catalizada enzimáticamente.
Estos parámetros son los siguientes: a- la concentración de Enzima; b-
concentración de Sustrato; c- disponibilidad de Cofactores; d- pH; e-Temperatura;
f- presencia de Inhibidores; g- fuerza Iónica, etc. Eso deben Recordarlo!!!

114- Describir el tipo de respuesta cinética de una enzima de Michaelis-Menten, M-


M, cuando se grafica la Velocidad inicial vs la concentración de Sustrato.
La respuesta cinética de una enzima ”Michaeliana”, al graficar la Vi vs S es una
“Hipérbola Rectangular”. Eso deben Recordarlo!!!

115- Explicar el concepto de “Estado Estacionario”, en la derivación de la ecuación


de Michaelis-Menten.
En cinética enzimática el concepto de “Estado Estacionario” se aplica a las
concentraciones de los intermediarios de reacción unidos a la enzima. Se basa en
el principio de que la concentración del complejo ES, permanece aproximadamente
constante en el tiempo. Esto es así porque la K-1 < K2.
A la K2, también se le conoce como constante de Catálisis!! Así, en el Estado
Estacionario, la constante de disociación del complejo ES, K-1, es menor que la
constante de Catálisis.
Como la mayor parte del complejo ES procede hacia la formación del Producto,
como se presenta en la siguiente Figura, No se puede establecer el “cuasi” equilibrio
de M-M, entre E, S y ES. Por el contrario, se establece el “cuasi” Estado Estacionario
de Briggs-Haldane, B-H, en el que la concentración del complejo ES No cambia en
un periodo de la reacción, llamado por esto, periodo de Estado Estacionario.

OJO: en el Estado Estacionario, las concentraciones de los intermediarios de


reacción unidos a la enzima, y las Velocidades en todos los pasos son iguales; lo
que varía, es el valor de las constantes de reacción!!

La cinética del Estado Estacionario es importante, para la comprensión del


metabolismo, ya que mide la actividad catalítica de una enzima, en las condiciones
del Estado Estacionario de las células.

OJO: el concepto del “cuasi” equilibrio de reacción, fue la premisa de la que partieron
M-M. El concepto del Estado Estacionario, fue esbozado 12 años después en 1925
por B-H!! De todo lo planteado, Eso es lo Eso deben Recordarlo!!!

116- Interpretar el significado de los parámetros cinéticos de la ecuación de


Michaelis-Menten: Velocidad inicial, Velocidad máxima, Vmáx y la constante de M-
M, KM.
La Vi, es la Velocidad que se alcanza antes de que la concentración del Sustrato 
significativamente, por el  en la concentración del Producto.
OJO: para la Vi, la reacción es de orden 1, es decir, la Velocidad de la reacción, es
directamente proporcional a la concentración del Sustrato. Eso deben
Recordarlo!!!
La Vmáx, es el valor límite de Velocidad que se alcanza cuando todos los sitios
catalíticos disponibles de una enzima, han unido a una molécula de Sustrato.

OJO: para la Vmáx, la reacción es de orden 0, es decir, Velocidad de la reacción, es


constante e independiente de la concentración del Sustrato. Para ese valor se
plantea, que la enzima se ha saturado por el Sustrato!! Eso deben Recordarlo!!!

La KM es el parámetro cinético cuyo valor, representa una medida de la Afinidad que


tiene una Enzima por su Sustrato. Esta es una definición conceptual. Eso deben
Recordarlo!!!
Como se presenta en la Figura anterior, la KM y el Sustrato, comparten las mismas
unidades, mM/L.
Existe una definición Operacional que plantea, que el valor de la KM, corresponde a
la concentración de Sustrato a la cual se alcanza la mitad de la Vmáx. Eso deben
Recordarlo!!!
Así, al valor de la KM, la enzima está saturada al 50% por el Sustrato!! Como se
presenta en la siguiente Figura.

117- Relacionar el valor de la KM, con la afinidad que tiene una enzima por un
sustrato.
Entre el valor de la KM y el concepto de afinidad, existe una relación inversa, es decir,
enzimas con valores de la KM , tienen una  afinidad por su Sustrato y viceversa!!
Eso deben Recordarlo!!!
118- Aplicar la ecuación de Lineweaver-Burk, en la determinación de los valores de
los parámetros cinéticos, KM y Vmáx.
La ecuación de Lineweaver-Burk se obtiene de una transformación matemática de
la ecuación de Michaelis-Menten, en donde se dividen la Velocidad y la
concentración de Sustrato por sus recíprocos. Por eso también se le conoce como
la ecuación de los “Dobles Recíprocos”.
OJO: deben Recordar la ecuación: 1/V = KM/Vmáx x 1/S + 1/Vmáx.

Esta ecuación fue derivada por Hans Lineweaver y Dean Burk.


OJO: la siguiente Figura, presenta la representación Gráfica de la ecuación de
Lineweaver-Burk o de los “Dobles Recíprocos”.
El término KM/Vmáx corresponde a la pendiente de la recta; -1/ KM corresponde al
intercepto con la abscisa o “X”; 1/Vmáx corresponde al intercepto con la ordenada o
“Y”. Eso deben Recordarlo!!!

119- Mencionar las características estructurales más importantes de una enzima


alostérica.
Las enzimas alostéricas: a- Generalmente, presentan un nivel cuaternario de
complejidad estructural; b- son oligo-méricas**; c- además del sitio catalítico,
presentan un sitio regulador o alostérico; d- al sitio alostérico se unen Ligandos
conocidos como “efectores” o moduladores; e- la unión de los efectores provoca
cambios conformacionales en las enzimas que  o  sus actividades; f- presentan
una cinética sigmoidal; g- catalizan reacciones generadoras de flujo, que son los
llamados “commitment steps”. Eso deben Recordarlo!!!

**- OJO: el término oligo-méricas significa que presentan varias subunidades


iguales o diferentes.

120- Explicar la función de las enzimas alostéricas en términos de la concentración


del Sustrato y los cambios conformacionales que sufren las moléculas proteicas.
Debido a la respuesta cinética sigmoidal de estas enzimas, la unión de un efector
alostérico positivo al sitio regulador, provoca un cambio conformacional, que
conduce a un aumento en la actividad enzimática, que se traduce en un aumento
de la velocidad de la reacción a concentraciones bajas de Sustrato. Lo contrario
ocurre si el efector alostérico es negativo.
Esto se presenta en la siguiente Figura, para la enzima Aspartato-trans-
Carbamilasa, en donde el ATP actúa como efector alostérico positivo, y el CTP como
efector alostérico negativo.

OJO: como con la molécula de la Hemo-globina y sus Ligandos, dependiendo del


efector que se una, la curva se mueve a la derecha o la izquierda. Si se desplaza a
la derecha, la enzima presenta menos Afinidad por el Sustrato, esto es porque el
valor de la KM es mayor. Lo contrario ocurre hacia la izquierda. Eso deben
Recordarlo!!!
121- Describir la respuesta cinética de una enzima alostérica cuando se grafica Vi
versus la concentración de Sustrato.
La respuesta cinética, es una curva sigmoidal, como la que se presenta en la
siguiente Figura. Eso deben Recordarlo!!!

122- Distinguir la diferencia entre el sitio catalítico y el sitio alostérico o regulador.


Como ya se Explicó, el sitio catalítico está formado por unos pocos residuos de -
aa, cuyos grupos funcionales son los responsables de interaccionar con el Sustrato
para su transformación. El sitio alostérico también está formado por residuos de -
aa, que se encuentran separados de los que forman el sitio catalítico, pero en
estrecha comunicación. Con los grupos funcionales de esos residuos
interaccionan Ligandos conocidos como “efectores alostéricos”. La unión del
efector alostérico se da reversiblemente y provoca cambios conformacionales que
 o  la eficacia catalítica. Si la eficacia , se les conoce como efectores positivos;
si la eficacia , se les conoce como efectores negativos!! Eso deben Recordarlo!!!

123- Clasificar los tipos de efectores alostéricos, en relación con el cambio en la


Velocidad de catálisis.
Como se planteó en la Pregunta anterior, hay 2 tipos de efectores alostéricos,
dependiendo de cómo afecten la Velocidad de la catálisis. Positivos (+) si  la
Velocidad, y negativos (-) si la !! Eso deben Recordarlo!!!

OJO: este comportamiento se presenta en la siguiente Figura.

La gráfica central presenta el comportamiento de la enzima sin que se haya unido


efector alguno. La de la izquierda muestra el comportamiento cuando se une un
efector (+), y la de la derecha, cuando se une un efector (-).

124- Explicar los mecanismos cinéticos a través de los cuales los efectores
alostéricos modulan la Velocidad del proceso de catálisis.
Los efectores alostéricos, modulan la Velocidad del proceso de catálisis, afectando
el valor de los parámetros cinéticos de la KM o el de la Vmáx. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: por su acción, al unirse a las enzimas, los efectores alostéricos (+), provocan una
 en el valor de la KM “aparente”**. La acción sobre la Vmáx es de . Eso deben
Recordarlo!!!
Los efectores alostéricos (-), por el contrario, provocan un  en el valor de la KM
“aparente”. La acción sobre la Vmáx es de . Eso deben Recordarlo!!!

**- el término aparente significa que el cambio en el valor de la KM es consecuencia de la


unión del efector.

OJO: una enzima alostérica puede perder su respuesta a los efectores, sin afectar su
actividad catalítica. A este proceso se le conoce como desensibilización de la enzima. En
estas condiciones, la enzima se comporta de acuerdo a la cinética descrita por Michaelis-
Menten. Como se presenta en la siguiente Figura, se pasa de una cinética sigmoidal a la
hiperbólica típica de Michaelis-Menten.
OJO: los colorcitos es para que No se equivoquen de gráficas!!

125- Explicar los conceptos de efecto alostérico homo-trópico y hetero-trópico.


Se conoce como efecto alostérico homo-trópico cuando la respuesta de la enzima se
debe a la unión del Sustrato tanto al sitio catalítico como al alostérico. Eso deben
Recordarlo!!!
OJO: el Sustrato hace todo!! Es un Chapulin C….

Cuando la respuesta se debe a la unión del Sustrato al sitio catalítico y del efector al
sitio alostérico, al efecto se le conoce como hetero-trópico. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: el Sustrato en su sitio y el efector en el suyo!!

126- Interpretar el significado de los parámetros cinéticos de la ecuación de Hill:


La ecuación de Hill, Vi = Vmáx Sn/K + Sn, se utiliza para describir cuantitativamente
el grado de cooperatividad de las enzimas alostéricas, ya que ellas no cumplen con
el modelo de Michaelis-Menten.
Vi = velocidad instantánea; Vmáx = velocidad máxima; K = constante de equilibrio y n =
coeficiente de Hill.

OJO: de todo lo planteado en esta Pregunta, solo les debe interesar el significado
del coeficiente de Hill. Los demás parámetros son similares a los que se presentan
en la ecuación de M-M.
El coeficiente de Hill (n) indica cuántos de los sitios de unión del Sustrato en una
enzima afectan la afinidad de la unión del Sustrato en el resto de los sitios de unión.
El coeficiente de Hill puede tomar valores mayores o menores que 1:

N < 1: indica cooperatividad negativa. Eso deben Recordarlo!!!

N = 1: No se presenta cooperatividad. Eso deben Recordarlo!!!


N > 1: indica cooperatividad positiva. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la siguiente Información solo busca ampliar el Concepto. No será Evaluada!!


La cooperatividad es un fenómeno bastante común y puede llegar a ser crucial en la
regulación de la respuesta enzimática a cambios en la concentración del Sustrato.
La cooperatividad positiva hace que la enzima sea mucho más sensible a la
concentración del Sustrato, con lo que su actividad puede llegar a variar en gran
medida, aunque se mueva en rangos muy estrechos de concentración de Sustrato.
Por el contrario, la cooperatividad negativa hace que la enzima sea insensible a
cambios en la concentración del Sustrato.

127- Distinguir la diferencia cinética que existe, entre una enzima Michaeliana y una
alostérica.
La diferencia cinética se basa en la presencia o no de cooperatividad. Las enzimas
Michaelianas, No presentan cooperatividad, por eso su cinética es hiperbólica. Las
enzimas alostéricas, presentan cooperatividad, por eso su cinética es sigmoidal.
Eso deben Recordarlo!!!

128- Mencionar los seis mecanismos de catálisis enzimática.


Mecanismos de catálisis enzimática: catálisis ácido-básica general; catálisis
covalente; catálisis electrostática; catálisis por iones metálicos; catálisis por
orientación y proximidad y catálisis por unión preferencial al complejo de
transición.

129- Interpretar correctamente, los mecanismos de catálisis enzimática anteriores,


mediante modelos específicos propuestos.
OJO: de los mecanismos de catálisis, solo se Evaluará la siguiente Información:

La catálisis ácido-básica general se caracteriza, por la generación de especies más


reactivas. En este mecanismo participan los -aa cargados, también la His, Cys,
Ser y Tyr. Eso deben Recordarlo!!!

En la catálisis covalente se generan intermediarios más reactivos. En este


mecanismo, participan los -aa His, Asp y Ser. La típica “triada” de las Proteasas
de Serina. Eso deben Recordarlo!!!

La catálisis electrostática se caracteriza, por la salida de H2O del sitio catalítico,


para la estabilización de los intermediarios de reacción o del Complejo de
transición. Los -aa cargados son típicos en este mecanismo. Eso deben
Recordarlo!!!

La catálisis por iones metálicos se caracteriza, por la transferencia de electrones y


la generación de especies más reactivas. Es típica la participación del -aa His
reaccionando con los iones de Zn. Eso deben Recordarlo!!!

La catálisis por orientación y proximidad se caracteriza, por aumentar la


concentración efectiva de las especies reaccionantes en el sitio catalítico. Eso
deben Recordarlo!!!

La catálisis por la unión preferencial al complejo de transición se caracteriza, por


la estabilización del Complejo de transición. Uno de los -aa que participa es la Pro.
Eso deben Recordarlo!!!

130- Explicar la importancia de regular las velocidades de las vías metabólicas en


relación con la homeostasis celular.
El control estricto de las vías metabólicas es importante porque es lo que permitirá
que el medio intra-celular permanezca constante o en homeostasis. Fundamental
en los estados de Salud o Enfermedad.

131- Mencionar los mecanismos generales que regulan las velocidades de las vías
metabólicas.
Las velocidades de las vías metabólicas se regulan por 2 mecanismos generales.
a- Control de la Eficacia Catalítica; b- Control de la Cantidad de Enzima. Eso deben
Recordarlo!!!

132- Explicar los siguientes mecanismos específicos que regulan la cantidad o


concentración de las enzimas:
a- Estos mecanismos son Inducción-Represión; b-Velocidad de la Traducción; c-
Ubiquitinación. Todos estos mecanismos son a largo plazo, horas o días. Eso deben
Recordarlo!!!

a- Inducción-Represión:
El mecanismo de I-R funciona de la siguiente forma. Inducción se refiere a favorecer
la expresión de un “Gen”.
OJO: como, deben Recordar, un Gen es una secuencia de DNA que codifica para un
tipo de RNA, que en el caso que nos ocupa, es el RNA-mensajero. Cuando la
molécula señal que controla el proceso, favorece el ensamblaje de la “Maquinaria
de la Transcripción”, una compleja y organizada estructura de muchas proteínas
que funcionan para que la enzima RNA-Polimerasa-II, se posicione correctamente
en el sitio de inicio de la Transcripción y comience a sintetizar al RNA-mensajero
utilizando como molde al DNA, se dice que esa molécula es Inductora del proceso.

OJO: en pocas palabras, Inducción es el proceso por el cual el DNA  RNA-


mensajero. Eso deben Recordarlo!!!

En la Figura de la izquierda se presenta el ensamblaje de la “Maquinaria de la


Transcripción”. En la Figura de la derecha, la formación del RNA-mensajero y el
proceso de la Traducción.

OJO: Represión es el proceso contrario, la molécula señal que controla, se opone


al ensamblaje de la “Maquinaria de la Transcripción”, y el DNA No se expresa, es
decir, No se sintetiza el RNA-mensajero!! Eso deben Recordarlo!!!

b- Control de la Velocidad de laTraducción:


Este control se da a varios niveles:
1- a nivel del ensamblaje de la “Maquinaria de la Traducción”; 2- a nivel del proceso
de “Corte y Empalme”, mejor conocido como “splicing”; 3- a nivel de la degradación
del RNA-mensajero, que es el “Puta molde”, que se lee para formar a las proteínas.
Solo se les Evaluará el # 1.

OJO: para el ensamblaje de la “Maquinaria de la Traducción”, se requiere de una


proteína, el eIF-2-, eucariotic-Initiaton-Factor-2-, que actúa controlando el
ensamblaje de esa “Maquinaria Proteica”, que es la que permite que los Ribosomas
se posicionen sobre el codón de Iniciación AUG, y se inicie la síntesis proteica!!
Eso deben Recordarlo!!!

El eIF-2- es una de las 3 subunidades, del Factor iniciador-2, eIF-2. Las otras
subunidades son la  y la .
El eIF-2 es al igual que las proteínas G, una proteína que se une a Nucleótidos de
Guanina. Cuando el eIF-2 está unido al GDP, por la subunidad-, eIF-2--GDP, está
inactivo. El eIF-2- es la subunidad que intercambia al GDP por el GTP, para la
activación del eIF-2--GTP. De esta forma, el eIF-2- se une a la Maquinaria Proteica
y el proceso de síntesis proteica se inicia.
eIF-2--GDP + eIF-2- + GTP  eIF-2--GTP + eIF-2- + GDP
inactivo activo

OJO: cuando el eIF-2- es fosforilado sobre un residuo específico de Serina, por 4


diferentes Quinasas, interacciona con el eIF-2- para formar un complejo eIF-2--
eIF-2-, el cual es inactivo, y, por lo tanto, incapaz de intercambiar al GTP por el GDP.
Así, el eIF-2- No interacciona con la Maquinaria Proteica y el proceso de síntesis
proteica No se inicia!!
eIF-2--Ser-OH + ATP  eIF-2--Ser-O-P + ADP
Enzimas: eIF-2--Quinasas.

eIF-2--Ser-O-P + eIF-2-  eIF-2--Ser-O-P-eIF-2-


complejo Inactivo

OJO: de Todo lo planteado, deben Recordar: a- la subunidad que se une a los


nucleótidos; b- la subunidad intercambiadora de nucleótidos; c- la subunidad que
se une, a la Maquinaria Proteica de la Traducción; d- la subunidad que es
fosforilada y las consecuencias!!

Todo esto se puede apreciar en la siguiente Figura.

OJO: las Figuras dicen más que Mil Palabras!!


c- Ubiquitinación:
La Ubiquitinación es el proceso enzimático de modificación proteica post-
Traducción por el cual, proteínas, fundamentalmente intra-celulares, son
degradadas en una estructura supra-molecular multi-proteica, denominada
Protea-soma o Proteo-soma 26 S. Este complejo se encuentra tanto en el núcleo
como en el citoplasma y es dependiente del ATP, e independiente del sistema
proteo-lítico-lisosomal.
Consiste de al menos, 20 tipos de sub-unidades proteicas, y posee al menos, cinco tipos
diferentes de actividades de Peptidasas que hidrolizan residuos amino-ácidicos,
básicos, hidro-fóbicos, acídicos y neutros.

OJO: se le conoce como Ubiquitinación, porque la proteína que “Marca” a las


proteínas que van a ser degradadas es la Ubiquitina. Esta es una proteína “ubicua”,
antes se le llamaba “omnipresente”, en las células eucariotas.
La Ubiquitina se une a la proteína que va a ser degradada, a través de una secuencia
característica, PEST, por los -aa que la forman, y la dirige al Proteo-soma en donde
es hidrolizada por Proteasas específicas en sus -aa constituyentes. Eso deben
Recordarlo!!!

OJO: el proceso de marcar una proteína con Ubiquitina, la Ubiquitinación, consta


de 3 pasos:
1- Activación de la Ubiquitina:
La Ubiquitina es activada en una reacción de 2 pasos catalizada por E1, que es la
enzima activadora de Ubiquitina, este es un proceso que requiere ATP como fuente
de energía.
E1 + Ubiquitina + ATP  E1-Ubiquitina + AMP + PPi

2- Transferencia de la Ubiquitina del sitio catalítico de E1, a E2. Reacción catalizada


por E1. E2 es la Enzima Conjugadora de Ubiquitina.
E1-Ubiquitina + E2  E2-Ubiquitina + E1
Después de que la primera Ubiquitina se ha unido a E2, continúan uniéndose más
Ubiquitinas hasta formar una cola de E2-poli-Ubiquitina …
E2-Ubiquitina + Ubiquitinas  E2-Ubiquitina-U-U-U-U-U-U………

3- El paso final de la cascada de Ubiquitinación es la formación de un enlace iso-


peptídico entre un residuo de Lisina de la proteína que va a ser degradada y la
Glicina del extremo carboxilo terminal de la Ubiquitina.

E2-Ubiquitina-U-U-U-U-U-U-……+ proteína-PEST  Ubiquitina-proteína-PEST

Esta reacción es catalizada por E3. E3 es la Enzima Ligasa de Ubiquitina.

Ubiquitina-proteína-PEST  Proteo-soma + -aa + Ubiquitina

OJO: la Ubiquitina No es degradada, por las enzimas del Proteo-soma!!

En la cascada de Ubiquitinación, la enzima E1 puede unirse con docenas de E2, que


pueden a su vez, unirse con cientos de E3 de un modo jerárquico.
En la siguiente Figura, se presenta, el proceso de Ubiquitinación.

Cultura General: en 1982 se pensaba que la Ubiquitinación y el Proteo-soma sólo


debían considerarse como un “basurero” para la célula, en el que se degradaban
proteínas alteradas. Investigaciones realizadas desde esa época, han permitido
reconocer que este sistema No sólo está relacionado con la degradación de proteínas
alteradas, sino que, sorprendentemente, está involucrado también, en procesos tan
diversos como el control del ciclo celular, el tráfico de proteínas, la biogénesis de las
organelas, o el control de la Transcripción. Existen evidencias que permiten suponer
que casi cualquier proceso que ocurra en la célula puede estar relacionado a este
sistema. Además, se espera que en un futuro cercano se descubran nuevas estrategias
de regulación involucradas con la Ubiquitinación.
133- Explicar la diferencia entre una enzima Constitutiva y una enzima Inducida.
La diferencia está, en el proceso de síntesis de las enzimas a nivel celular. Las
llamadas constitutivas son síntetizadas constantemente, y son las responsables
del mantenimiento de las funciones básicas celulares. Esto es así, porque los genes
que codifican para las ellas se están expresando en todo momento. Eso son los
llamados, “house keeping genes” Eso deben Recordarlo!!!
Las enzimas inducidas por su parte, No son síntetizadas constantemente. Esto es
así, porque los genes que codifican para las ellas se expresan en determinados
momentos y ante determinados estímulos. Eso deben Recordarlo!!!

134- Explicar los siguientes mecanismos que regulan la eficacia catalítica de las
enzimas:
a- disponibilidad de Sustrato; b- disponibilidad de Cofactores; c-
compartimentación; d- retro-alimentación negativa o inhibición por el producto
final; e- modificación covalente reversible; f- modificación covalente irreversible;
g- alosterismo; h- cambio en el nivel estructural proteico.

OJO: Todos estos mecanismos de control son a corto plazo y permiten dar
respuestas mucho más rápidas a las necesidades celulares. Eso deben
Recordarlo!!!

Disponibilidad de Sustrato:
a- Al  la disponibilidad de Sustrato, la enzima lo une al sitio catalítico y lo
transforma eficientemente. Por lo que la velocidad de la reacción  de manera
proporcional a la Sustrato.
OJO: lo que se les ha dicho SIEMPRE, tengo la Enzima; tengo al Sustrato, hay
Reacción!! Eso lo resume Todo!! Eso deben Recordarlo!!!

b- Disponibilidad de Cofactores:
Si una enzima requiere de cofactores y éstos están disponibles, la reacción se verá
favorecida.
OJO: lo que se les ha dicho SIEMPRE, tengo la Enzima; tengo al Sustrato, tengo al
cofactor en el estado correcto, hay Reacción!! Eso lo resume Todo!! Eso deben
Recordarlo!!!

c- Compartimentación:
Los compartimientos son espacios físicos dentro de las células. Si una enzima se
encuentra en un compartimiento, por ejemplo, en el citosol, y el Sustrato también,
entonces la reacción se verá favorecida. Eso deben Recordarlo!!!
Cuando una enzima se encuentra en un compartimiento y el Sustrato en otro, si existe
una Translocasa**, que lo transporte al compartimiento donde está la enzima, la
reacción se verá favorecida. Eso deben Recordarlo!!!
**- Una Translocasa, es una proteína que transporta metabolitos o iones, de un
compartimiento a otro.
OJO: este es el caso del Piruvato, metabolito que se forma en el citosol y las
enzimas que lo transforman, las 3 del complejo multi-enzimático de la Piruvato-
Deshidrogenasa y la Piruvato-Carboxilasa, están en las mitocondrias.

d- Retro-Alimentación negativa, o inhibición por el producto final:


Este mecanismo se conoce también, como “negative feed back”. El producto final
de una vía Metabólica, inhibe a la enzima que cataliza la reacción generadora de
flujo.

e- Modificación Covalente Reversible:


Por este mecanismo, una enzima pasa de un estado a otro y regresa, al estado
inicial. El ejemplo más común, son las reacciones de Fosforilación, des-
Fosforilación. Los residuos aminoacídicos que sufren estas reacciones son los que
presentan los grupos funcionales, OH, que son, la Serina, Treonina y Tirosina. Las
enzimas que catalizan estas reacciones se conocen como Quinasas y Fosfatasas,
respectivamente. Son de las Clases, Transferasas e Hidrolasas.
OJO: las Quinasas o cinasas, Fosforilan y las Fosfatasas des-Fosforilan. Eso deben
Recordarlo!!!
Tarea # 3. a- Investigar el nombre de los científicos que recibieron el premio nobel,
por descubrir el mecanismo de la Modificación Covalente Reversible; b- Investigar
el año en el que recibieron el premio.

Pista: la enzima que estudiaron fue la Glucógeno-Fosforilasa, que es la aparece a


la derecha, en Figura anterior.

f- Modificación Covalente Irreversible:


Por este mecanismo, una enzima pasa de un estado a otro y No regresa, al estado
inicial. El ejemplo más común, son las modificaciones extra-celulares que sufren,
determinadas proteínas conocidas como “Factores de la Coagulación”. Estas
proteínas son secretadas al plasma en forma de Zimógenos o precursores
proteicos inactivos. Eso deben Recordarlo!!!
Como ejemplo se tiene, al Factor II de la Coagulación, que es la pro-Trombina y al
Fibrinógeno. En el plasma, la pro-Trombina es activada a Trombina, por la acción
de enzimas Proteasas específicas, que catalizan la hidro-lisis parcial, de
determinados enlaces peptídicos. La Trombina transforma a su vez, al Fibrinógeno
en Fibrina.
OJO: la Trombina es la forma catalíticamente activa!!
pro-Trombina + H2O  Trombina + Péptido Enzima: Proteasa.
pro-Enzima Enzima activa

g- Alosterismo:
Este mecanismo consiste en los cambios conformacionales que sufren las enzimas
Alostéricas, cuando a su sitio o sitios reguladores, se unen metabolitos llamados
“efectores alostéricos”. La respuesta puede ser un  o una , de la actividad
enzimática. Se les conoce como efectores alostéricos positivos si hay un  de la
actividad, y efectores alostéricos negativos, si ésta . Eso deben Recordarlo!!!

OJO: como ya se planteó, los efectores alostéricos modulan la Velocidad del


proceso de catálisis, afectando el valor de la KM o el de la Vmáx. Los llamados
parámetros cinéticos. Eso deben Recordarlo!!!
h- Cambio en el nivel estructural proteico:
Este mecanismo consiste en el paso del nivel cuaternario de complejidad
estructural al nivel terciario. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: el ejemplo típico es el de la Proteína Quinasa-A, PK-A, que pasa de la forma
tetra-mérica a la mono-mérica cuando el AMP-cíclico se une a sus sub-unidades
reguladoras.
La forma mono-mérica es la catalíticamente activa. Eso deben Recordarlo!!!

Esto se presenta en la siguiente Figura.

135- Explicar los siguientes mecanismos específicos que regulan la eficacia


catalítica de las enzimas por:
a- Disponibilidad de Sustrato; b- Disponibilidad de Cofactores; c-
Compartimentación; d- Lanzadera del Glicerol-3-P/Di-Hidroxi-Acetona-P, DHA-P;
e- Movilización del GLUT-4; f- Poder Reductor Celular, PRC; g- Carga Energética
Celular, CEC.
OJO: los mecanismos de la “a” a la “c”, ya fueron respondidos en la Pregunta anterior.

d- Lanzadera del Glicerol-3-P/DHA-P:


Las Lanzaderas, shuttle, son secuencias de reacciones específicas, que permiten
la transferencia de “equivalentes reductores” de un compartimiento a otro,
específicamente del Citosol a las Mitocondrias. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: esto se debe a que los cofactores reducidos como el NADH, No atraviesan la
membrana mitocondrial interna. La Lanzadera del Glicerol-3-P/DHA-P, favorece la
transferencia de equivalentes reductores del NADH formados en la vía de la Glucó-
lisis. Para ello, en la primera reacción, la DHA-P es reducida a Glicerol-3-P, que en
la membrana mitocondrial externa reacciona con el FAD que se reduce a FADH2
con la re-generación del NAD+ y de la DHA-P para continuar con la secuencia de
reacciones.
DHA-P + NADH  Glicerol-3-P + NAD+ Enzima: Glicerol-3-P-DH.
Glicerol-3-P + FAD  DHA-P+ FADH2 Enzima: Glicerol-3-P-DH**.
**- Esta es la iso-forma mitocondrial, como se presenta en las siguientes Figuras.

El FADH2 entrega los equivalentes reductores del NADH al Complejo II de la Cadena


Respiratoria, que termina con la formación de 1,5 mol de ATP!!

OJO: el NAD+ queda disponible para continuar aceptando equivalentes reductores.


De esta manera, se mantiene  la velocidad de la vía de la Glucó-lisis, lo que No
ocurriría si el NADH No se oxidara a NAD+. De esta forma se resuelve el problema
de la “Disponibilidad del Cofactor”.
e- Movilización del GLUT-4:
Por este mecanismo, el transportador de Glucosa 4, que se encuentra en el citosol,
en vesículas de almacenamiento, endosomas, en las células de los tejidos, Adiposo
y Muscular, es movilizado o translocado, hacia la membrana, lo que favorece que
estas células capten a la Glucosa. Eso deben Recordarlo!!!
OJO: este complejo proceso, es regulado por la hormona Insulina, como se
presenta en las siguientes Figuras.

f- Poder Reductor Celular, PRC:


Por este mecanismo, el control de las actividades enzimáticas de las Vías
Metabólicas se da por, la disponibilidad de los cofactores. Por ejemplo, si una
enzima requiere del cofactor en la forma reducida y éste se encuentra en la forma
oxidada, No hay reacción!! Lo contrario también es cierto!!

OJO: a las concentraciones relativas de las co-enzimas reducidas /co-enzimas


oxidadas, es a lo que se le conoce como el PRC. Eso deben Recordarlo!!!

Co-enzimas Reducidas - Co-enzimasOxidadas /Co-enzimas Reducidas = PRC.


Los cofactores que participan son el NADH FADH2. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: cuando se encuentran en esta forma, NADH / NAD+; FADH2 / FAD, el


PRC está .
Si el PRC se forma en el citosol, debe ser transferido a las mitocondrias, como ya
se explicó, esta es la función de las Lanzaderas!! Eso deben Recordarlo!!!
Cuando se encuentran en esta forma, NAD+ / NADH; FAD / FADH2, el PRC
está .

g- Carga Energética Celular, CEC:


Por este mecanismo, el control de las actividades enzimáticas de las Vías
Metabólicas se da por, las concentraciones relativas de los Nucleósidos de
Adenosina Fosfato, ATP, ADP y AMP. Eso deben Recordarlo!!!

ATP + 1/2ADP / AMP + ADP + ATP = CEC.

OJO: como se presenta en la siguiente Figura, las Vías Catabólicas  el PRC y la


CEC, que serán utilizados en las Vías Anabólicas. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la CEC  cuando:


1- las co-enzimas reducidas entregan sus equivalentes reductores a los Complejos
enzimáticos de la vía de la Cadena Respiratoria, lo que crea un “gradiente
electroquímico” con liberación de energía, que se utiliza para la fosforilación del
ADP para formar al ATP.
ADP + Pi + energía  ATP

Este Proceso es conocido como “Fosforilación Oxidativa”. Eso deben Recordarlo!!!

2- la formación del ATP es consecuencia de la energía liberada desde metabolitos


conocidos como “Fosfatos de alta energía”, o “metabolitos con un elevado potencial
de transferencia de grupos Fosfato”. Este Proceso es conocido como
“Fosforilación a nivel de Sustrato”. Eso deben Recordarlo!!!
PEP + ADP  ATP + Piruvato.

1,3-BPG + ADP  ATP + 3-BPG.


136- Definir los términos enzimas funcionales y No funcionales plasmáticas.
Las enzimas funcionales son aquellas que se sintetizan y son secretadas al plasma.
Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la gran mayoría de estas enzimas son sintetizadas en el hígado!! Eso deben
Recordarlo!!!
No confundirlas con la enzimas Constitutivas e Inducidas, ya presentadas!!

OJO: las enzimas No funcionales son sintetizadas en los diferentes tejidos y


permanecen en esas células. Eso deben Recordarlo!!!

137- Comparar la concentración plasmática de las enzimas funcionales y No


funcionales.
La concentración plasmática de las enzimas funcionales es mucho mayor que la
de las enzimas No funcionales. Eso deben Recordarlo!!!

OJO: la concentración plasmática de las enzimas funcionales  cuando ocurre una


daño o falla hepática. Eso deben Recordarlo!!!

138- Explicar el  de concentración anormal de las enzimas No funcionales en el


plasma.
La concentración de las enzimas No funcionales en el plasma  cuando ocurre:
a- un daño o lesión tisular, llamado necrosis; b- un  en el catabolismo celular, por
reparación o por Cáncer; c- obstrucción en la salida exocrina, este es el caso de la
enzima -Amilasa pancreática; etc. Eso deben Recordarlo!!!

139- Definir el concepto de perfil enzimático tisular.


Se denomina “perfil enzimático” a las diferentes enzimas e iso-enzimas que son
sintetizadas en un tejido específico.

OJO: las enzimas que se utilizan en el perfil enzimático como herramientas para el
diagnóstico Clínico son las enzimas No funcionales, cuya concentración en plasma
es muy , < 1:1000!! Eso deben Recordarlo!!!

140- Listar los aspectos que se deben tomar en consideración al utilizar un perfil
enzimático como medio de diagnóstico.
Los aspectos a considerar son, los siguientes:
a- Distribución tisular; b- El momento en que es liberada; c- El periodo de vida
media en el plasma; d- La existencia o No de iso-enzimas.

OJO: la existencia de iso-enzimas se determina realizando una separación


electroforética. En la electroforesis se separan los componentes proteicos
utilizando un campo eléctrico y un Amortiguador apropiado, para que la carga que
predomine en las Muestras sea negativa. De forma que la separación o migración
electroforética sea del Cátodo- al Ánodo+. Las proteínas que más migren serán las
más pequeñas y con mayor densidad de carga negativas.
En la siguiente Figura se presenta, la dirección de la separación o migración
electroforética para la enzima Fosfatasa Alcalina. La intensidad de la banda es
directamente proporcional, a la concentración plasmática.

OJO: si la enzima posee 2 sub-unidades diferentes, entonces se presentarán 3 iso-


formas o iso-enzimas, con movilidades electroforéticas y distribuciones tisulares
distintas. Este es el caso de la enzima Creatina-Quinasa, CK. Las iso-formas son
las CK1 o BB; CK2 o MB y CK3 o MM. Esto se presenta en la Figura de la derecha.

OJO: las letras B y M, provienen del inglés Brain y Muscle.


Los números se refieren a la distancia de migración en la electroforesis, el número
1 corresponde a la fracción que más migra y el 3, a la que menos migra. Las áreas
bajo las curvas indican el tamaño molecular.
Por otra parte, la enzima, Lactato-DH, LDH, está constituida por 4 sub-unidades
diferentes, eso explica la existencia de 5 iso-formas con movilidades
electroforéticas y distribuciones tisulares distintas. La LDH1 o H4; LDH2 o H3M1;
LDH3 o H2M2; LDH4 o H1M3; LDH5 o M4.

En la siguiente Figura se presenta, el % relativo de estas iso-formas y, con las áreas


bajo las curvas, el tamaño molecular.

141- Listar las enzimas, que constituyen los perfiles de los siguientes tejidos:
cardiaco, hepático, pancreático, óseo, muscular, cerebral, próstata.
Perfiles enzimáticos:
Cardiaco: CK2; AST; ALT; LDH1; Hidroxi-Butirato-DH.
Hepático: ALT; AST; Fosfatasa Alcalina; LDH5; -Glutamil-trans-Peptidasa;
Glutamato-DH.

Pancreático: Amilasa pancreática; Lipasa pancreática.

Óseo: Fosfatasa Alcalina.

Muscular: CK3; LDH2.

Cerebral: CK1.

Próstata: Fosfatasa Ácida.

OJO: TODO eso, Eso deben Recordarlo!!!

142- Explicar la importancia de la adecuada selección de la determinación de las


actividades enzimáticas de la Creatina Quinasao Lactato-DH, con respecto al
tiempo, en un paciente que ha sufrido un Infarto Agudo al Miocardio, IAM.
OJO: al Infarto se le conoce como “Agudo”, por la aparición brusca de los síntomas
característicos: dolor intenso en el pecho, en la zona precordial, sensación de
malestar general, mareo, náuseas y sudoración. El dolor puede extenderse al brazo
izquierdo, a la mandíbula, al hombro, a la espalda o al cuello.
La selección adecuada de las actividades enzimáticas es importante: 1- porque
complementan los hallazgos en el electrocardiograma, ECG; 2- porque las
concentraciones plasmáticas de cada enzima van  de manera independiente, en
diferentes periodos de tiempo. Por ejemplo, los niveles de la CK2 son los primeros
en , de 3 a 6 horas después de presentarse un Infarto. Por ello, su
determinación de es muy útil para detectar los Casos tempranos, en los que los
cambios en el ECG pueden ser ambiguos.
Alcanza un máximo tras 24 horas y a partir de entonces  rápidamente. Puesto que
es la primera en disminuir, se puede utilizar como marcador de reInfarto, es decir,
de otro episodio isquémico.
Los niveles de la LDH1, alcanzan su máximo tras 3 días y se mantienen de 6 a 8 días.
Los niveles de AST, alcanzan su máximo tras 48 horas.

OJO: la liberación de la AST No es específica del IAM, así, enfermedades que


afectan al hígado o al músculo esquelético, también la actividad de esta enzima.

OJO: todo lo planteado se presenta en la siguiente Figura.

OJO: en la Figura anterior se incluye a la enzima Hidroxi-Butirato-DH, que también


actúa como marcador de daño cardíaco y complementa La función de La LDH1.
OJO: como, se puede observar, el comportamiento de cada uno de los marcadores
es diferente, por eso se utilizan como una batería.

OJO: la determinación de las actividades de la LDH1 y de la AST, muy utilizadas en


el pasado, ahora han caído en desuso en los países desarrollados. Estas
determinaciones se han sustituido por la determinación de las llamadas
Troponinas**. Las Troponinas sin ser enzimas, se han constituido en marcadores
confiables para el IAM.
**- La Troponina un complejo molecular que actúa regulando en el músculo
esquelético, la interacción entre las proteínas Actina y Miosina, mediada por el ión
Ca2+ durante contracción muscular. Está formada por tres subunidades, la
Troponina C,Troponina I, y la Troponina T.

OJO: como las subunidades I y T, presentan isoformas características del


músculo cardiaco, son las que se utilizan para diagnosticar el IAM. Se han
convertido en una de las principales Pruebas para la detección temprana de un
episodio isquémico y para monitorear al Paciente.
Sus concentraciones en plasma  entre 4 a 6 horas después de presentarse un
Infarto, y permanecen  durante mucho tiempo.
La Troponina T, puede tardar 4 semanas en volver a los valores fisiológicos. La
Troponina I se normaliza tras 5 a 10 días. Además, es mucho más específica de
músculo cardiaco.
Como se presenta en la siguiente Figura, ya No se incluyen la LDH1 Ni la AST.

OJO:
también se ha incluido la determinación del “Péptido Natri-urético Cerebral” BNP,
que es un marcador confiable de la función ventricular.
La medición de BNP se utiliza para el diagnóstico y estimación de la severidad de la
Insuficiencia Cardíaca Congestiva. Las concentraciones plasmáticas del BNP se
encuentran también elevadas en Pacientes con falla Ventricular Izquierda Sintomática
o Asintomática. También se usa para la clasificación del riesgo en Pacientes con
Síndromes Coronarios Agudos. El efecto natri-urético del BNP es producir un aumento
en la producción de orina.

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