UNIVERSIDAD INTERAMERICANA DE PUERTO RICO

RECINTO DE AGUADILLA
DEPARTAMENTO DE CIENCIAS Y TECNOLOGIA

PRONTUARIO

Curso : MICR 4010 Ecología Microbiana

Créditos : Tres (3)

Requisitos : BIOL 3105

Profesoras : Gricel Ruiz

Oficina : CIT 227

Correo electrónico: gruiz@aguadilla.inter.edu

Descripción del curso

Comprende el estudio de la ecología de los microorganismos. Se discute la biodiversidad
microbiana; la estructura y dinámica de las poblaciones de importancia clínica y ambiental. Se
estudian las interacciones de los microorganismos con las plantas, los animales y otros
microorganismos en la naturaleza. Se discuten los ciclos de los nutrientes, con énfasis en la
descomposición de la materia orgánica. Dos horas de conferencia y tres de laboratorio
semanales. 3 créditos

Objetivos Terminales:

Al terminar el curso los estudiantes serán capaces de:

1. Discutir los conceptos generales de la ecología microbiana.
2. Explicar la intervención microbiana en el ciclo del carbono y en del nitrógeno.
3. Examinar la estructura y dinámica de las poblaciones microbianas en el suelo, en el agua
y en el aire.
4. Analizar los diferentes tipos de relaciones simbióticas existentes entre los
microorganismos.

Contenido:
1. Conceptos generales
a. Flujo de energía y niveles tróficos
b. Hábitats, microhábitats y adhesión
2. Estructura y dinámica de poblaciones microbianas en el agua
a. El agua como un medio
i. Temperatura y densidad del agua
ii. Gases disueltos y nutrientes
iii. Salinidad, pH, luz solar y corrientes
 b. Comunidades en el agua
i. Plancton y Neuston
ii. Epiliton y comunidades afines
iii. Epipsamon y comunidades asociadas
iv. Epipelon y comunidades asociadas
v. Epífiton
vi. Comunidades epizoicas
c. Eutroficación y contaminación

3. Estructura y dinámica de poblaciones microbianas en el aire

a. El aire en el exterior de construcciones
i. Liberación de microorganismos en el aire
ii. Número y distribución de microorganismos
iii. Microorganismos en las superficies aéreas de las plantas
iv. Microorganismos en las superficies de los animales
b. El aire en el interior de las construcciones
i. Número y distribución de microorganismos
4. Los microorganismos y su intervención en el ciclo del carbono
a. El ciclo biogeoquímico
b. El ciclo del carbono en el suelo
c. El ciclo del carbono en el agua
d. Equilibrio en el ciclo del carbono
e. Descomposición de tipos específicos de compuestos de carbono
f. Usos de la descomposición microbiana del carbono
5. Las conversiones microbianas de nitrógeno en el suelo
a. Ciclo biogeoquímico y distribución en la biosfera
b. Nitrógeno en ambientes acuáticos
c. Microbiología del ciclo del nitrógeno
i. Nitrificación
ii. Reducción de nitrato y desnitrificación
iii. Fijación de nitrógeno
d. Efecto del ciclo del nitrógeno en el medio y la agricultura
6. Estructura y dinámica de poblaciones microbianas en el suelo
a. Química, estructura y ambiente del suelo
b. Patrones de distribución de los microorganismos en el suelo
c. Tipos de microorganismos en el suelo
d. Sucesión, competencia y depredación en poblaciones del suelo
e. La rizosfera
f. Control biológico de patógenos que viven en el suelo
7. Simbiosis
a. Depredación y parasitismo
b. Comensalismo y amensalismo
c. Mutualismo
i. Simbiosis alga-animal
ii. Líquenes
iii. Asociaciones microorganismo-planta fijadora de nitrógeno
iv. Micorrizas
v. Sintrofia en bacterias fotosintéticas
 8. Sucesión Ecológica
a. Estrategias de reproducción k y r
b. Modelos ecológicos
9. Adaptaciones de los microorganismos al medio ambiente
10. Examen Final
Evaluación:

1. Examen midterm 25%

Este examen es presencial y será el lunes
6 de octubre de 2022
2. Un examen final 25%
Este examen es presencial y será el lunes
8 de diciembre de 2022. No hay reposición de finales.
3. Trabajo diario salón 10%
4. Laboratorio 30%
a. Trabajo diario (10%)
b. Informes (10%)
c. Examen Final de lab. (10%)
5. Presentaciones, pruebas cortas y otros. 10%
Texto
1. Barton, Larry L., et al. Microbial Ecology, John Wiley & Sons, Incorporated,
2011. ProQuest Ebook Central,
https://ebookcentral.proquest.com/lib/inter/detail.action?docID=697468.
2. Ian L. Pepper and Charles P. Gerba. 2004. Environmental Microbiology, Second Edition:
A Laboratory Manual. Academic Press

Bibliografía:

1. Ronald M. Atlas and Richard Bartha. 2002. Microbial Ecology: Fundamentals and
Applications. Benjamin Cummings.

2. Staley, James T, 2002. Biodiversity of microbial life : foundation of Earth's biosphere.

3. Harinder, P. S. Makkar. 2005. Methods in gut microbial ecology for ruminants

[electronic resource]

4. International Symposium on the Microbiology of Aerial Plant Surfaces (8th : 2005 :

Oxford, England). 2006. Microbial ecology of aerial plant surfaces [electronic resource]

5. Harinder, P. S. Makkar. 2005. Methods in gut microbial ecology for ruminants

[electronic resource]
 6. Cooper, J. E. 2006. Molecular approaches to soil, rhizosphere and plant microorganism
analysis [electronic resource].

7. Tortora, Gerard J. 2007. Microbiology : an introduction 9th ed.

8. Encyclopedia of microbiology. 2 nd. Ed. Joshua Lederberg Academic Press, 2000.

9. Leboffe, Michael J. A photographic atlas for the microbiology laboratory, Colo.:
Morton Publishing Company, 1996.

10. Tortora, Gerard J., Berdell R. Funke, Christine L. Case. Microbiology : an

introduction: 6th Ed. Menlo Park, Calif.: Benjamin/Cummings, 1998.
11. Upadhyay, Rajeev K Advances in Microbial Toxin: Research and Its
Bitechnological Exploitation. Kluwer Academic Publishers. 2002.

12. Wachett , Lawrence & Douglas Hershberger. Biocatalysis and Biodegradation:

Microbial Transformation of Organic Compounds. ASM Press . 2001.

Bases de datos con artículos de revistas científicas:

Applied and environmental microbiology
http://www.infotrac.apla.galegroup.com/itweb/aguadilla
http://www.proquest.com/proquest

EBSCOhost Electronic Journals Service

Wilson Web

Texto:

Ian L. Pepper and Charles P. Gerba. 2004. Environmental Microbiology, Second Edition: A
Laboratory Manual. Academic Press

Lista de Actividades para el Laboratorio de Ecología Microbiana

Actividad Nombre Fecha

1 Reglas de seguridad y Repaso de técnicas microbiológicas 8-23
Preparación de medios de cultivos (TSA, Rose Bemgal agar
Exp 1: Descomposición, Preaparación de la Columna Winadograsky y
Degradation of Oil
 2 Enumeración de poblaciones microbianas en Suelo 8-30 al
Exp. 2: Soil Mosture Content Determination 9-06
Exp. 3: Contact Slide Asssay
Exp .4: Filamentus Fungi
Exp. 5: Bacteria and Actinomycetes
Exp. 6: Algae: Enumeration by MPN

3 Exp. 7: Oxidation of Sulfur in Soil 9-13

Exp. 9: Nitrification and Denitrification
Objervación de Nódulos
4 Exp. 8: Dehydrogenase Activity of Soil 9-20
5 Aislamiento de microorganismos del agua 9-27
Exp. 19: Detection of Bacteriophages
Exp 20: Detection of Waterborne Parasites
6 Exp. 13 Assimilable Organic Carbon 10-04
7 Exp. 23: Areobiology: Sampling of Airborne Microorganisms 10-11
8 Análisis Filogenético 10-18
9 Examen de lab. 11-01
**Este prontuario está sujeto a cambio por el instructor. Este notificara cualquier cambio.
Normas del curso:

 La asistencia al laboratorio es compulsoria y se pasará lista diariamente.

 No está permitido traer fotocopias de libros de texto al salón.
 Los informes de laboratorio se entregarán no más tarde de una semana después de
completar el experimento; por cada día tarde perderá 1 puntos.
 Es responsabilidad del estudiante venir preparado al laboratorio. Debe traer bata de
laboratorio, zapatos cerrados, pantalón o falda larga, libreta, lápiz, calculadora.

Informes de Laboratorios
Los informes de laboratorio tienen que seguir el formato científico. Debe tener las
siguientes partes: Titulo, resumen, introducción, materiales y métodos, resultado y discusión y
referencia científica.

Titulo:
El título debe ser corto, conciso y claro. No debe tener más de 15 palabras.

Resumen:
Este debe explicar de forma clara y precisa el contenido del trabajo, tiene una extensión entre
200 a 250 palabras. Debe contener los objetivos principales de la investigación, la metodología
esencial, los resultados más importantes y las principales conclusiones.
Introducción:
El objetivo de la introducción es plantear la preguntar de la investigación. Primero se realiza una
revisión científica sobre trabajos previos relacionados al tema, que aspectos no están claros.
Qué importancia tiene este trabajo para aumentar el conocimiento científico. El último párrafo
debe tener el propósito, la hipótesis y porque se ha realizado la investigación. Su extensión debe
ser de 2 a 3 páginas a doble espacio.

Materiales y Método:
Esta parte explica cómo se realizó el trabajo. Se escribe siempre en párrafos, nunca en lista. Este
debe contener: la muestra, las técnicas utilizadas, el diseño experimental y estadístico.

Resultados y Discusión:
Aquí se mencionan y explique los resultados obtenidos. También se hacen conclusiones sobre el
por qué de estos resultados y su importancia. Aquí se debe contestar la pregunta de la
investigación y comprobar sus hipótesis. El último párrafo debe tener un resumen de los
hallazgos e ideas más importantes de la investigación y recomendaciones para futuros trabajos.
(3 a 4 pág.)

Referencias:
Según el formato de la APA.

Revisado por Dra. Ruiz en agosto de 2022.