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Características
-Quimioautótrofos: organismos que usan como fuente principal o única de carbono y energía compuestos C1 (por ejemplo, CO2,
CH4 o CH3OH metilótrofos).
-La mayoría de las formas de vida en la tierra dependen del proceso de fotosíntesis.
-Las bacterias fotosintéticas se encuentran en las aguas más profundas de los lagos
permanentemente estratificados (meromícticos) donde las condiciones son anaeróbicas, pero
hay luz disponible.
-Algunas reacciones en el proceso fotosintético son bastante lentas e ineficaces. Por tanto, un
aspecto importante del estudio de los organismos fotosintéticos es la mejora de la eficiencia
del proceso mediante la ingeniería genética.
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La producción de pigmentos carotenoides que absorben la luz también representa una diferencia
característica.
• Las bacterias púrpura contienen una variedad de pigmentos carotenoides alifáticos y arilo, mientras
que las bacterias verdes contienen sólo carotenoides de arilo
• Los pigmentos carotenoides absorben la energía de la luz y la transfieren a las moléculas de clorofila
del complejo antena.
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• Las algas y las células de las plantas superiores contienen cloroplastos. Estructuras
comparables(cromatóforos) en las bacterias fotosintéticas.
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• Las Chlorobacteriaceae (bacteria verde) contienen vesículas encerradas dentro de una delgada membrana no unitaria que no está
directamente asociada con la membrana celular.
• Metabólicamente las bacterias verdes son organismos anaeróbicos estrictos que son obligatoriamente fotosintéticos.
• Utilizan H2S, tiosulfato o H2 como donador de electrones y CO2 como fuente de carbono
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a) Bacterias de azufre moradas (Thiorhodaceae) que utilizan H2S como donante de electrones
b) Bacterias púrpura sin azufre (Athiorhodaceae) dependen de compuestos orgánicos como los ácidos grasos de cadena corta para
metabolismo fotosintético.
.
5.2 Mecanismo de la fijación autotrófica de CO2
Fijación del CO2
• Los organismos fotosintéticos (autótrofos) sintetizan carbohidratos reduciendo el CO2 a expensas de la
energía (ATP y NADPH) generada por la cadena de transferencia electrónica de la fotosíntesis.
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Ciclo de Calvin
• Es el proceso de fijación del CO2 atmosférico que realizan los organismos autótrofos para
sintetizar azúcares. Consta de 3 etapas:
El rendimiento neto del ciclo será de una triosa-P por cada 3 moléculas de CO2 asimiladas
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RubisCO: Enzima encargada de la fijación del CO2 (Etapa I)
• Cataliza la unión covalente del CO2 a la ribulosa-bisP y la escisión del intermediario de 6 C.
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Etapa II: Reducción y producción de azúcares
• El cofactor de reducción es NADPH
• Cada triosa-fosfato generada cuesta 6 NADPH y 9 ATP(3 ATP se usan para regenerar ribulosa1,5-bP).
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Etapa III: Regeneración del aceptor de CO2
• De forma análoga a la fase no oxidativa de la ruta de las pentosas fosfato, 5 triosas fosfato
generan 3 pentosas bisfosfato.
1. Rubisco
2. Sedoheptulosa1,7-bisfosfatasa
3. Ribulosa5-fosfato quinasa
Bacterias fotosintéticas autótrofas:fijación de CO2
• Se produce principalmente a través de la vía reductora de la pentosa fosfato
• Solo dos de las reacciones, fosforribuloquinasa y ribulosa bisfosfato carboxilasa (RuBisCO), son
específicas de la fotosíntesis u organismos quimioautotróficos
• Las otras reacciones se mantienen en común con la metabolismo de carbohidratos de organismos no fotosintéticos.
• Seis vueltas del ciclo dan como resultado la síntesis de 1 mol de hexosa (F-6-P) ---------------------------
• Los organismos que utilizan la vía C4 poseen la enzima piruvato-ortofosfato diquinasa, que
sintetiza fosfoenolpiruvato (PEP) -----------------------------------------------------------------------------------
Fotosíntesis
• Fotosíntesis plantas verdes, algas, cianobacterias o bacterias fotosintéticas --- absorción de luz por una
molécula de pigmento energía luminosa absorbida a los portadores de electrones -- transducir la energía
en forma química.
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Ficobiliproteínas
• En las cianobacterias y las algas rojas eucariotas
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• La mayoría de estas bacterias son autótrofas facultativas y crecen fácilmente en sustratos orgánicos. ----------------------------
• La proteobacteria quimiolitoautotrófica facultativa, Ralstonia eutropha (anteriormente Alcaligenes eutrophus), puede utilizar H2
como única fuente de energía. ------------------------------------------------
• Una hidrogenasa unida a la membrana, esta principalmente involucrada en la fosforilación acoplada al transporte de electrones
• La otra es una enzima citoplasmática que reduce NAD para proporcionar equivalentes reductores.------------------------------------
• La reducción de CO2 por H2 es:
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• El CO2 se asimila de forma autótrofa a través de las reacciones esenciales de con fosforribuloquinasa y ribulosa-1,5-bisfosfato
carboxilasa en el ciclo de Calvin
• En Ralstonia eutropha, la fosforribuloquinasa se inactiva parcialmente cuando un cultivo autótrofo se cambia a un crecimiento
heterótrofo con piruvato como fuente de carbono y energía. La reactivación de la fosforribuloquinasa ocurre después del
agotamiento de piruvato del medio. --------------------------------------------------------------------------
• El autótrofo de hidrógeno, Xanthobacter, puede crecer autotróficamente con hidrógeno o metanol como fuente de energía.
• El metanol se oxida a formaldehído, formiato, y luego a CO2 por la acción secuencial de la metanol deshidrogenasa, formaldehído
deshidrogenasa y formiato deshidrogenasa:
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• El ciclo del N
Fijación de nitrógeno
• Es la combinación de dinitrógeno con O o H para formar
óxidos (NOx) o NH4+.
• El nitrógeno molecular es el principal componente de la atmósfera porque es inerte y no aprovechable directamente por la
mayoría de los seres vivos.
La fijación de nitrógeno puede ocurrir de dos formas:
2) Fijación biológica: por la acción de bacterias. Estas últimas cuentan con una enzima llamada nitrogenasa, la cual está presente en
bacterias como:
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siguiente diapositiva -----------------------------------------------------------------------------------
Nitrificación
La nitrificación implica la oxidación de amonio a nitrato, y es llevada en dos fases por organismos diferentes:
a) Oxidación NH4+ NO2- (nitrosación) es llevada a cabo por bacterias de los géneros Nitrosomonas, Nitrospira, etc.
b) Oxidación de NO2- NO3- (nitratación) es catalizado por la enzima NxrGHI, una enzima homóloga a la NarGHI pero que a
diferencia de esta última, es capaz de catalizar la reacción inversa. Este proceso es realizado por bacterias del género Nitrobacter y
Nitrospira, y lo usan para obtener equivalentes de reducción para generar energía celular y fijar C (litoautotrofos).
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Nitrosación
-En primer lugar se produce un paso intermedio en que el NH3 pasa a hidroxilamina (NH20). La
enzima que interviene es unamonooxigenasa que produce la oxidación del NH3. En el segundo
paso la NH2O es oxidada a NO2- mediante una hidroxilamina óxidoreductasa.
--La primera es una enzima constitutiva ligada a la membrana celular, la segunda actúa a nivel
del periplasma.
--Los electrones necesarios para que el NH3 se reduzca proceden de la cesión directa de la
hidroxilamina-óxidoreductasa al citocromo "c" por la cadena transportadora de e- hasta el
oxígeno generando una fuerza motriz de protones que generará ATP. ---------------------------
Nitratación
-Se realiza por una enzima nitrooxidasa, en este caso los e- se incorporan sobre los citocromos,
la cadena es muy corta y el rendimiento de generación de ATP no es muy alto. El metabolismo
es típicamente quimiolitótrofo, viven en aerobiosis. -En ocasiones el NH3 se puede
oxidar en anoxia por acción del nitrato, aceptor de e-. para la formación del H2. Reacción muy
exotérica con alta liberación de energía.
En las bacterias nitrobacter se emplea el ciclo de Calvin para fijar CO2, algunas utilizan
compuestos orgánicos porque en la fijación del CO2 se utilizan mucha energia. ----------------------
Nitrificación
• Oxidación biológica del amonio a nitrato por microorganismos aerobios que usan O2 como aceptor de electrones (oxidante).
• El C lo obtienen del CO2 atmosférico (autótrofos)
Importancia de la nitrificación
• El nitrógeno es abundante en la atmósfera
• Pero no puede ser absorbido directamente por la mayoría de las plantas
• Las bacterias generan nitratos, que son fuente de nitrógeno de las plantas (síntesis de moléculas: proteínas, clorofila, vitaminas,
enzimas, etc.) •
El nitrógeno es un nutriente limitante porque restringe el crecimiento de la planta. INSERTAR “BACTERIAS
- NITRIFICANTES AUTOTROFAS ” IMAGEN
Poblaciones heterótrofas nitrificantes
Las poblaciones heterótrofas están constituidas por un gran número de bacterias y algunos hongos, pero si diferencian de las
anteriores en que su efectividad, en la producción de formas oxidadas de nitrógeno, es muy escasa y necesitan determinadas
condiciones para que tenga lugar.
-la concentración de amoníaco exceda a la necesaria para ser utilizada como fuente de nitrógeno.
-realizan el proceso cuando las condiciones de crecimiento no son adecuadas (metabolismo de mantenimiento)
Oxidacion de amonio
Desnitrificación
La desnitrificación tiene lugar bajo condiciones especiales:
• Tanto en ecosistemas terrestres como en marinos se produce cuando el O2 (g) esescaso, o nulo (micro- y anaerobiosis).
• Las bacterias desnitrificantes "respiran" nitrato, i.e. lo usan como aceptor terminal de electrones en lugar del O2 (g). -----------------
Amonificación
La amonificación puede ser de dos tipos:
• Desasimilatoria: cuando no hay O2(g) (anaerobiosis) ciertas bacterias que no poseen las enzimas de la desnitrificación pueden
igualmente respirar nitrato gracias a la Nap (nitrato reductasa periplasmática) y la Nrf (nitrito reductasa penta-hemica).
• Asimilatoria: Es independiente del O2(g). La expresión de las enzimas de esta vía es regulada por la [NO3-]/[NH4+]. Relación alta,
induce la expresión de los genes que codifican Nas y Nrf; mientras que una relación baja los reprime.
a) Pérdida de la biodiversidad
Alteraciones del ciclo del nitrógeno b) Disminución en la calidad del aire
• Exceso de nitrógeno en los fertilizante agrícolas
c) Aumento de los gases de efecto invernadero
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• El empleo de bacterias desnitrificantes en biorreactores de filtros sumergidos es útil para eliminar los nitratos y nitritos presentes
en aguas contaminadas.
• El rendimiento de los bioreactores para descontaminar nitratos y nitritos depende tanto de la actividad desnitrificante de las
bacterias como de su capacidad para formar películas biológicas o biopelículas.
• En las bacterias desnitrificantes Pseudomonas stutzeri y Bradyrhizobium japonicum se han identificado y caracterizado los genes
nir, nor y nos que codifican las enzimas nitrito reductasa, óxido nítrico reductasa y óxido nitroso reductasa, respectivamente.
• Mediante técnicas de Ingeniería Genética es posible obtener bacterias con copias extras de cualquiera de los genes de la
desnitrificación para incrementar el rendimimiento en la descontaminación de nitratos.
• La existencia de una copia extra del gen nirK en B. japonicum resultó en la capacidad de la bacteria para consumir más nitrito.
• Estas bacterias se encuentran principalmente en ambientes anóxicos ricos en sulfatos (en suelos, lodos de estuarios, aguas dulces,
de alcantarillado y marinas, salobres, termales y áreas geotermales, depósitos de sulfuro, en pozos petroleros y de gas, en el
intestino de mamíferos e insectos). -----------------------------------------------------------------------------------------
• Varios compuestos inorgánicos de azufre son aceptores importantes de electrones en las reacciones anóxicas (reacciones donde
no existe oxígeno molecular, O2, aunque eloxígeno puede encontrarse formando parte de otras moléculas, como por ejemplo
sulfato o tiosulfato).
• El sulfato es la forma más oxidada del azufre (+6) y lo usan las bacterias sulfato reductoras (BSR), como aceptor final de electrones,
convirtiéndolo en la forma más reducida, sulfuro (-2).
• Tal como ocurre con el nitrógeno, es importante distinguir entre la reducción asimilativa y no asimilativa del sulfato-----------------
• El grupo (a) que comprende las especies que oxidan incompletamente sus sustratos hasta acetato y lo acumulan: Desulfovibrio,
Desulfomicrobium, Desulfobotulus, Desulfofustis, Desulfotomaculum, Desulfomonile, Desulfobacula, Archaeoglobus, Desulfobulbus,
Desulforhopalus, Thermodesulfobacterium.
• El grupo (b) que incluye a las especies que en principio son capaces de oxidar los compuestos orgánicos incluyendo acetato
completamente a CO2: Desulfobacter,Desulfobacterium, Desulfococcus, Desulfonema, desulfosarcina, Desulfoarculus,Desulfacinum,
Desulforhabdus y Thermodesulforhabdu.
Metabolismo de (BSR)
• Para que sea metabólicamente utilizable, el sulfato debe ser previamente activado por su unión con ATP.
• Valiéndose de estos enlaces de alta energía se realiza la reducción a H2S mediante la enzima sulfito reductasa. ------------------
• En comparación, Desulfotomaculum conserva la energía del enlace PPi por medio de la enzima acetato PPi fosfotransferasa y la
posterior formación de ATP por acetato quinasa:
• Estas reacciones permiten que Desulfotomaculum utilice PPi como fuente de energía para el crecimiento con acetato y sulfato. La
conversión de APS (fosfosulfato de adenosina) en sulfito por APS reductasa requiere la adición de dos electrones:
Metabolismo de BSO
• Algunas reacciones de oxidación del S identificadas en microorganismos, indican la transición de las siguientes especies químicas:
• Aunque los intermediarios pueden interaccionar químicamente, haciendo la ruta más compleja, tal es el caso de la formación del
tiosulfato (S2O3^2–), el cual se forma por la combinación química del S^0 y el SO3^2–, este compuesto también puede ser oxidado
por microorganismos a tetrationato (S4O6^2–) a través de la siguiente reacción general:
• El azufre elemental es muy valioso a nivel comercial, ya que partir de él se produce el ácido sulfúrico, de uso doméstico e
industrial.
• Es indispensable mantener un equilibrio entre el azufre y el resto de los elementos químicos, de modo que el S no aumente hasta
niveles anormales.
• Cuando este gas es atravesado por la lluvia se produce la lluvia ácida (corrosiva), que cae al suelo dañando el medio ambiente
(reduciendo el pH)
5.7 Metilótrofos
Metanogénesis
• Es la etapa final de la digestión anaerobia.
• La formación de metano se da a partir de dos rutas principales:
2) Hidrogenotrófica: los microorganismos crecen en sustratos como hidrógeno (H2), y dióxido de carbono (CO2)
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Metanogénesis
• Su metabolismo se caracteriza por integrar las vías biosintéticas y bioenergéticas para la producción de ATP, además en ausencia
de hidrógeno, oxidan compuestos para la obtención de electrones
• El producto final es el metano (CH4) y el aporte de la vía hidrogenotrófica es del 27 al 30 % y por la vía acetoclástica es del 70%
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a) Sustratos monocarbonados
Microorganismos metanogénicos
• Análisis del ARNr 16S ha permitido identificar aproximadamente unas 90 especies de metanógenas distribuidas en 5 clases
distintas:
• Estas bacterias abundan en ambientes donde se encuentran aceptores de electrones tales como O2, NO^3- , Fe^3+ , y SO4^2-
• Hábitats típicos: digestores anaerobios, sedimentos anóxicos, suelos de humedales y tractos gastrointestinales
Metilótrofos
• Las bacterias metilotróficas pueden utilizar metano, metanol, metilamina o formiato como única fuente de carbono y energía.
• El término metanótrofo designa metilótrofos que pueden utilizar metano para producir carbono y energía.
• También hay varios especies de levaduras y mohos que pueden utilizar metano o metanol.
• La mayoría de los metilótrofos son obligados porque solo pueden usar compuestos C1. ------------------------------------------
Metilótrofos
• Las reacciones de la vía general de oxidación son: -
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formaldehído
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El metano puede:
Microorganismos metilotróficos
• Incluyen:
a) Paracoccus denitrificans y varias especies de Pseudomonas, Hyphomicrobium y Xanthobacter.
b) Metilótrofos obligados géneros Methylophilus, Methylobacterium, Methylococcus, Methylosinus o Methylomonas.
c) Levaduras metilotróficas: Hansenula, Candida, Torulopsis y Pichia
• Los organismos oxidantes del metanol son útiles para la producción de proteínas unicelulares; las células microbianas se utilizan
como suplementos alimenticios para animales.
• Cultivar tales organismos en residuos proporciona un medio importante de reciclar éstos en productos útiles.
• Algunos de los metilótrofos muestran una amplia gama de biotransformaciones de potencial importancia comercial.