(Apuntes) Caracterización genética de

bacterias endofíticas de arroz (Oryza

sativa L.) con actividad antimicrobiana
contra Burkholderia glumae
Tema:  (Apuntes) Caracterización genética de bacterias
endofíticas de arroz (Oryza sativa L.) con actividad
antimicrobiana contra Burkholderia glumae
Curso:  Microbiología
Fecha:  18-01-2023
Profesor/ponente:  Renzo Valdez

Vocabulario Definición
La motilidad es un término de la biología para
expresar la habilidad de moverse espontánea e
motilidad independientemente. Está referida tanto a organismos
unicelulares como multicelulares.

Los sideróforos microbianos son moléculas secretadas

sideróforos por microorganismos en condiciones de deficiencia de
hierro para secuestrar el hierro de su entorno

El biocontrol consiste en utilizar organismos vivos o

sustancias naturales para prevenir o reducir los daños
biocontrol causados por organismos nocivos (plagas animales,
malas hierbas y patógenos).
 1. Las bacterias endofíticas son bacterias
beneficiosas para las plantas que prosperan en
su interior y pueden mejorar su crecimiento en
condiciones normales y difíciles. Pueden
beneficiar directamente a las plantas huésped
mejorando la absorción de nutrientes y
modulando las fitohormonas relacionas con el
crecimiento y el estrés.
Bacterias endofíticas
2. Los endófitos son simbiontes microbianos que
residen en el interior de la planta durante la
mayor parte de su ciclo vital sin ningún impacto
perjudicial para la planta huésped. El uso de
estos simbiontes naturales ofrece la
oportunidad de maximizar la productividad de
los cultivos al tiempo que se reduce el impacto
ambiental de la agricultura.

Puntos Principales:
Objetivos:
Aislar y seleccionar bacterias endofíticas de arroz
capaces de inhibir al fitopatógeno Burkholderia
glumae THT.
Caracterizarlas por su genética y bioquímica.
Caracterizar la diversidad genética y los factores
de virulencia presentes en cepas de B. glumae y
de Burkholderia gladioli.
Metodología:
Colección de plantas de arroz en 4
departamentos del norte de Perú.
Desinfección de tejidos.
 Aislación de bacterias endofíticas por cultivo en
agar soya tripticasa (30 ◦C; 48 h) y en medio
selectivo (pH 4,5; 41 ◦C; 72 h).
Evaluaciones:
Actividad antimicrobiana frente a B. glumae
THT.
Producción de sideróforos.
Resistencia a la toxoflavina (producida por B.
glumae THT).
Determinación de la producción de enzimas
extracelulares.
Efectuación de ensayos de:
Motilidad.
Sensibilidad/resistencia a bactericidas.
Resultados:
Se aislaron 189 bacterias endofíticas.
9 presentaron actividad antimicrobiana contra
B. glumae THT.
3 sobresalieron : Burkholderia
vietnamiensis TUR04-01, B. vietnamiensis
TUR04-03 y Bacillus aryabhattai
AMH12-02.
Estas cepas produjeron sideróforos y al
menos el 55,5 % fueron resistentes a la
toxflavina.
 17 cepas de B. glumae y B. gladioli aisladas
fueron agrupadas en 9 perfiles BOX-PCR:
16 presentaron similitud con B. glumae
LMG2196T (100%).
1 con B. gladioli NBRC13700T (99,86%).
Hubo elevada diversidad de acuerdo al origen
geográfico y se encontraron factores de
virulencia.
Conclusión:
Se hallaron cepas del género Bacillus y
Burkholderia que podrían ser agentes de
biocontrol contra B. glumae.

Nota: Desglose de párrafos

" INTRODUCCIÓN "

1er párrafo

1.
El arroz constituye la fuente de hidratos de carbono
más importante para la tercera parte de la
población mundial; sin embargo, obtener una
óptima producción implica la aplicación de
fertilizantes, así como el control de plagas y
enfermedades.
2.
Burkholderia glumae y Burkholderia gladioli son
considerados los agentes etiológicos del añublo
bacterial de la panícula de arroz (ABPA).
3.
Esta enfermedad se manifiesta en la etapa de
floración y provoca infertilidad, con decoloración y
manchado de la gluma en desarrollo debido a la
producción de toxoflavina.
4.
La enfermedad ha sido reportada por primera vez
en Perú en 2013.
Revisión: Nanomaterials | Free Full-Text | Bioinspired Green Synthesis of Zinc Oxide
Nanoparticles from a Native Bacillus cereus Strain RNT6: Characterization and
Antibacterial Activity against Rice Panicle Blight Pathogens Burkholderia glumae and
B. gladioli (mdpi.com)

VOCABUL
CONCEPTUALIZACIÓN
ARIO
 1. Los carbohidratos son moléculas de azúcar. Junto con las
proteínas y las grasas, los carbohidratos son uno de los tres
nutrientes principales que se encuentran en alimentos y
bebidas. Su cuerpo descompone los carbohidratos en
Hidratos glucosa.
de 2. Alimento que consiste o contiene muchos azúcares,
carbono almidón, celulosa o sustancias similares que pueden
descomponerse para liberar energía en el cuerpo humano, y
constituyen uno de los principales grupos de alimentos
nutritivos. Ex.: "Mi nivel de azúcar en sangre aumenta
cuando como carbohidratos".

Agente Entidad química, biológica o física que puede causar una

etiológico enfermedad en un organismo.

gluma
 1. Sustantivo. Específicamente: cualquiera de las dos brácteas vacías en la
base de la espiguilla de las gramíneas (Poaceas).
2. En botánica, una gluma es una bráctea (estructura parecida a una hoja)
situada debajo de una espiguilla en la inflorescencia (racimo floral) de las
gramíneas (Poaceae) o de las flores de las juncias (Cyperaceae). Hay otros
dos tipos de brácteas en las espiguillas de las gramíneas: la lemma y la
palea.

Nota: Glumas muy reducidas, escariosas

Revisión:
1. Diapositiva 1 (unc.edu.ar)
2. Oryza sativa L. (unavarra.es)
3. Gramineas (upv.es)
4. herbarium (plantasyhongos.es)
 La toxoflavina es una toxina producida por una variedad de
bacterias, incluida la Burkholderia gladioli. También tiene
propiedades antibióticas. La toxoflavina actúa como indicador de
pH, cambiando de amarillo a incoloro a pH 10,5.

toxoflavina

Nota: A, La estructura química de la toxoflavina se muestra con la

numeración de los átomos.
Revisión:
1. Structural and Functional Analysis of Phytotoxin Toxoflavin-
Degrading Enzyme - PMC (nih.gov)

2do párrafo

1.
El agricultor arrocero no posee un método de
control efectivo para el tratamiento del ABPA: a
pesar del empleo intensivo de pesticidas, el 50% de
la producción puede perderse debido a esta
enfermedad.
2.
Hasta el momento el único agente químico capaz
de controlar la enfermedad es el ácido oxolínico;
sin embargo, dicho compuesto está prohibido por
las autoridades sanitarias porque constituye un
riesgo debido a la generación de resistencia y a la
presencia de cepas naturalmente resistentes a este
agente químico.
3.
A la fecha las estrategias de prevención son las más
empleadas.
VOCABULARIO CONCEPTUALIZACIÓN
 Añublo bacterial de la panícula de arroz

ABPA A. Síntomas de añublo bacterial de la panícula, mostrando

las panículas erguidas, descoloridas, decoloración de granos
y los tallos verdes; B. Colonias de Burkholderia glumae
mostrando la pigmentación amarilla de la toxoflavina sobre
medio de cultivo King B; C. Grupos de paniculas de arroz en
campo afectadas con añublo bacterial las cuales son fuente
de infecciones secundarias.
Revisión:
1. a. Síntomas de añublo bacterial de la panícula,
mostrando las panículas... | Download Scientific
Diagram (researchgate.net)
2. (PDF) MANEJO INTEGRADO DEL AÑUBLO BACTERIAL
DE LA PANÍCULA DEL ARROZ (Oryza sativa L.)
CAUSADO POR Burkholderia glumae KURITA & TABEI:
UNA REVISIÓN. (researchgate.net)
 1. El ácido oxolínico es un antibiótico de quinolona
desarrollado en Japón en los años 70.[1][2] Dosis 12-
20 mg/kg administrado por vía oral durante cinco a
diez días. El antibiótico actúa inhibiendo la enzima
ADN girasa. También actúa como inhibidor de la
recaptación de dopamina y tiene efectos estimulantes
en ratones[3].
2. El ácido oxolínico es un ácido
quinolinemonocarboxílico que tiene el grupo carboxi
en la posición 7, así como grupos oxo y etilo en las
posiciones 4 y 1, respectivamente, y un anillo de
dioxolo fusionado en las posiciones 5 y 6. Es un
antibiótico sintético. Se trata de un antibiótico
ácido oxolínico sintético utilizado en medicina veterinaria para el
tratamiento de infecciones bacterianas en ganado
vacuno, porcino y aves de corral. Actúa como agente
antiinfeccioso, fármaco antibacteriano, inhibidor
enzimático, agente antimicrobiano y agente
antifúngico. Es un ácido quinolinemonocarboxílico, un
compuesto heterotricíclico orgánico, un ácido
carboxílico aromático, un oxaciclo y un antibiótico de
quinolona. Es un ácido conjugado de un oxolinato.

Revisión:
1. Oxolinic acid - Wikipedia
2. Oxolinic acid | C13H11NO5 - PubChem (nih.gov)

3er párrafo
1.
Los microorganismos asociados al arroz han
coevolucionado con su hospedero en virtud de su
capacidad para reducir enfermedades en el nicho
ecológico compartido empleando diferentes
estrategias.
2.
Bajo esa perspectiva, el control biológico se ha
mostrado prometedor.
3.
Estrategias basadas en mecanismos biológicos
como el quorum quenching, la resistencia sistémica
inducida y la producción de metabolitos
antimicrobianos constituyen las más prometedoras.
4.
Shrestha et al. reportaron que cepas de Bacillus
amyloliquefaciensfueron capaces de inhibir el
crecimiento de B. glumae 336 g-1.
5.
La búsqueda de microorganismos que comparten el
hábitat con B. glumae durante el proceso de
desarrollo de la enfermedad se considera de interés,
ya que estos podrían servir para controlar el
patógeno.
VOCABULARIO CONCEPTUALIZACIÓN
 El término coevolución se utiliza para describir los casos en
los que dos (o más) especies afectan recíprocamente a la
evolución de la otra. Así, por ejemplo, un cambio evolutivo
en la morfología de una planta podría afectar a la
morfología de un herbívoro que se come la planta, lo que a
Coevolución
su vez podría afectar a la evolución de la planta, que podría
afectar a la evolución del herbívoro... y así sucesivamente.

Revisión:
Coevolution - Understanding Evolution (berkeley.edu)

nicho ecológico
 1. En ecología, el término "nicho" describe el papel que desempeña un
organismo en una comunidad. El nicho de una especie abarca tanto las
condiciones físicas y ambientales que requiere (como la temperatura o el
terreno) como las interacciones que tiene con otras especies (como la
depredación o la competencia).
2. El nicho ecológico es un término que designa la posición de una especie
dentro de un ecosistema, describiendo tanto la gama de condiciones
necesarias para la persistencia de la especie como su papel ecológico en
el ecosistema. El nicho ecológico engloba todas las interacciones entre
una especie y el entorno biótico y abiótico, por lo que representa un
concepto ecológico muy básico y fundamental. La definición provisional
presentada anteriormente indica que el concepto de nicho tiene dos
vertientes que no están tan estrechamente relacionadas: una se refiere a
los efectos que el medio ambiente tiene sobre una especie y la otra a los
efectos que una especie tiene sobre el medio ambiente. Sin embargo, en
la mayor parte del pensamiento ecológico se mezclan implícita o
explícitamente ambos significados. La razón es que la ecología trata de
las interacciones entre organismos, y si la persistencia de una especie está
determinada por la presencia de otras especies (fuentes de alimento,
competidores, depredadores, etc.), todas las especies se ven
naturalmente afectadas por el entorno y, al mismo tiempo, afectan al
entorno de otras especies.
3. Un nicho ecológico caracteriza la posición de una especie dentro de un
ecosistema y comprende tanto los requisitos de hábitat como el papel
funcional de una especie.
Revisión:
1. Ecological Niche - an overview | ScienceDirect Topics
2. Ecological Niche - ScienceDirect
 1. El quórum quenching (QQ) se refiere al mecanismo
por el que se puede interrumpir la comunicación
bacteriana. El QQ puede conseguirse inhibiendo la
producción de autoinductores, su detección por
receptores o su degradación (Natrah et al., 2011).
2. El fenómeno de quorum quenching consiste en la
degradación enzimática de las moléculas señal del
sistema de detección de quórum para evitar su
acumulación en el medio e inhibir el cambio de
expresión génica. Estas enzimas, debido a la
inhibición de la producción de autoinductores, son
capaces de impedir la producción de factores de
quórum virulencia, incluidas las biopelículas producidas por
quenching bacterias resistentes a los fármacos. La enzima AHL-
lactonasa producida por Bacillus cereus VT96 controla
directamente la producción de factores de virulencia
como la producción de exopolisacáridos, la formación
de biopelículas y la producción de piocianina en
Pseudomonas aeruginosa PAO1 (Rajesh y Rai 2016).

Revisión:
1. Frontiers | Quorum-Quenching Bacteria Isolated From
Red Sea Sediments Reduce Biofilm Formation by
Pseudomonas aeruginosa (frontiersin.org)
2. Prevention of biofilm formation by quorum
quenching | SpringerLink
Bacillus
amyloliquefaciens

Fuente: Scanning electron microscopic image of Bacillus

amyloliquefaciens VJ-1.   | Download Scientific Diagram
(researchgate.net)

4to párrafo

1.
Contar con un cepario de microorganismos con
potencial como antagonistas del citado patógeno
permitirá disponer de opciones para desarrollar
productos biopesticidas, capaces de reducir el uso
de agroquímicos perjudiciales para el
medioambiente, sobre todo, de antibióticos.
2.
Cuando se emplean de manera indiscriminada estos
últimos (antibióticos) generan resistencia y se
transforman en un problema de salud pública.
 3.
Por otro lado, el uso de biopesticidas contribuiría a
reducir los costos de producción, con lo que se
elevaría el nivel de competitividad del agricultor.
VOCABULARIO CONCEPTUALIZACIÓN

Los ceparios o colecciones de microorganismos son fuentes

de recursos genéticos cuyo propósito es la preservación de
la diversidad biológica, garantizando su disponibilidad para
actividades de docencia, investigación y comerciales.

cepario
Revisión:
Redalyc.Organización, mantenimiento y preservación de la
Colección de Cultivos Bacterianos del Instituto de Ciencias
Biológicas de la Universidad de Ciencias y Artes de
Chiapas(UNICACH), México

Los biopesticidas son ciertos tipos de pesticidas derivados

de materiales naturales como animales, plantas, bacterias y
ciertos minerales. Por ejemplo, el aceite de canola y el
bicarbonato de sodio tienen aplicaciones plaguicidas y se
biopesticida consideran bioplaguicidas. A 31 de agosto de 2020, había
390 ingredientes activos de biopesticidas registrados.

Revisión:
What are Biopesticides? | US EPA

5to párrafo

1.
El objetivo del presente trabajo fue aislar,
caracterizar, seleccionar e identificar bacterias
endofíticas (BE) de cultivos locales de arroz con
actividad antimicrobiana frente a B. glumae.
 2.
Asimismo, se quiso aislar cepas de B. glumae y B.
gladioli en áreas de cultivo de arroz de la zona norte
del Perú y estudiar su diversidad genética y los
factores de virulencia presentes.
3.
La hipótesis planteada es que los microorganismos
endofíticos aislados de cultivos locales de arroz han
coevolucionado con las cepas fitopatógenas de B.
glumae que predominan en dicha región y, por
ende, podrían presentar actividad antimicrobiana
frente a estas.
VOCABULARIO CONCEPTUALIZACIÓN

La virulencia se describe como la capacidad de un

organismo para infectar al huésped y causar una
enfermedad. Los factores de virulencia son las moléculas que
ayudan a la bacteria a colonizar el huésped a nivel celular.
Factor de Estos factores son de naturaleza secretora, asociada a la
virulencia membrana o citosólica.

Revisión:
Bacterial Virulence Factors: Secreted for Survival - PMC
(nih.gov)