Proyecto Genoma Humano (PGH)

¿Qué es?

El proyecto genoma humano fue un proyecto internacional de investigación científica

y estaba enfocado en Secuenciar los 3.000 millones de nucleótidos presentes en el
genoma humano(averiguar el orden exacto de las bases presentes en el ADN) y el
mapeo genético (localizar los genes en cada cromosoma) . Con el propósito de
descifrar el código genético, encontrar las funciones que llevan a cabo estas
secuenciaciones y lograr avanzar en los temas de evolución y variabilidad del ADN. Esa
información estructural permitirá conocer la base molecular de muchas enfermedades
y, sobre esa base, realizar el mejor diagnóstico posible.
Origen oficial: Estados Unidos, 1 de octubre 1990.
A pesar que el nombre del proyecto incluya la palabra “humano” no es 100% correcto
ya que el secuenciamiento de organismos modelo diferentes a los humanos (como
virus y plasmidos) formaban una parte importante en la base central de la
investigación.
Origen oficial: Estados Unidos, 1 de octubre 1990.
A pesar de desarrollarse principalmente en EE.UU este proyecto es internacional en
todos sus aspectos, teniendo agencias que coordinan con los diferentes países,
principalmente en Inglaterra, Francia, Alemania, Italia, Canadá, Japón y China.
El proyecto inicia bajo la dirección de James . Watson para ser reemplazado luego por
Francis Collins, con él que finalmente terminaría el proyecto ( James D. Watson fue
nombrado alto cargo del proyecto.)
Y se calculó que tendria una duracion de 15 años.

Antecedentes:
Los planteamientos iniciales se remontan aproximadamente a 1984, en donde el
problema se enfocó en el análisis del ADN para encontrar mutaciones en personas que
estuvieron expuestos a radiación por detonaciones de bombas atomicas.
Luego en 1985 california hubo una conferencia para ver la viabilidad de secuenciar el
genoma humano.
En este periodo aparecen personajes que Generaron impulso para el comienzo del
proyecto como:
Renato Dulbecco de forma independiente : (1986) sostuvo que sería importante la
investigación del genoma humano para ayudar en la investigacion sobre el cáncer
En 1988 se presentaron dos informes primordiales para el desarrollo del PGH en
EE.UU.
 Uno de ellos provino del Consejo Nacional de Investigaciones
 El otro provino del Comité bajo la Oficina de Evaluación Tecnológica del Congreso
de Estados Unidos
Ambos documentos enfatizaban las ventajas y beneficios de llevar a cabo el proyecto,
además de propuestas de financiamiento y de resaltar los roles del Instituto Nacional
de Salud y del Departamento de Energía Estados Unidos.
1988La oficina para la investigación sobre el genoma humano en el Instituto Nacional
de Salud (1988) que paso a llamarse Centro Nacional para la Investigación del Genoma
Humano (NHGRI) ese mismo año.
¿Se secuencio completamente el genoma humano?
Con la tecnología actual se ha logrado secuenciar alrededor del 99% del genoma
humano.
Este 1% aproximado restante corresponde a una porción del genoma que con los
métodos actuales de ese momento de secuenciación no han podido ser establecidos,
sin embargo se espera que en un futuro, con nuevos métodos y tecnología avanzada se
puedan aclarar.
Es por esto que se considera que con la tecnología actual de esos años estaría 100%
secuenciado. Con esta aclaración hecha podemos decir que la respuesta en general
sería que sí.

Y el principal método utilizado por el PGH para producir la versión final del código
genético humano se basa en un mapa, o en una secuencia basada en BAC, que es el
acrónimo en inglés de "cromosoma artificial bacteriano".

En términos sencillos el ADN es fragmentado y estos son clonados en basterias las

cuales lo almacenan y replican (productos a los que llamaremos clones BAC). Luego se
hace un mapeo de cada clon BAC para identificar el lugar de donde proviene el adn
humano en los clones BAC. Para secuenciarlos se fragmenta en partes más pequeñas
denominadas subclones. En estos subclones se lleva a cabo una "reacción en
secuencia". Después, los productos de la reacción en secuencia son introducidos en la
máquina secuenciadora (secuenciador) Luego una computadora junta estas secuencias
cortas para formar tramos continuos de secuencia que representan el ADN humano en
el clon BAC.

El ADN humano es fragmentado en piezas relativamente grandes pero de un tamaño

manejable (entre 150.000 y 200.000 pares de bases). Los fragmentos son clonados en
bacterias, las cuales almacenan y replican el ADN humano para que así pueda ser
preparado en cantidades lo suficientemente grandes como para secuenciarlo. Si se los
escoge cuidadosamente para minimizar las superposiciones, se necesita unos 20.000
clones BAC diferentes para abarcar los 3.000 millones de pares de bases del genoma
humano. A la colección de clones BAC que contienen todo el genoma humano se la
denomina una "biblioteca BAC".

En el método basado en BAC, se hace un "mapeo" de cada clon BAC para determinar el
lugar de donde proviene el ADN del genoma humano en los clones BAC. El uso de este
enfoque garantiza que los científicos puedan conocer la ubicación exacta de las letras
del ADN que son secuenciadas en cada clon y su relación espacial con el ADN humano
secuenciado en otros clones BAC.

Para la secuenciación, se corta a cada clon BAC en fragmentos todavía más pequeños
que tienen una longitud de cerca de 2.000 bases. Estas piezas se denominan
"subclones". En estos subclones se lleva a cabo una "reacción en secuencia". Después,
los productos de la reacción en secuencia son introducidos en la máquina
secuenciadora (secuenciador). El secuenciador genera de 500 a 800 pares de bases de
A, T, C y G en cada reacción en secuencia, por lo que cada bases es secuenciada unas
diez veces. Luego una computadora juntas estas secuencias cortas para formar tramos
continuos de secuencia que representan el ADN humano en el clon BAC.*

Estado actual del proyecto/Finalizado

En febrero de 2001 se publicó la mayor parte del genoma humano en un primer
borrador y la secuencia completa fue terminada y publicada en abril de 2003 por el
NHGRI, dos años antes de lo previsto.
Los resultados de esta investigación estan disponibles de manera pública y gratuita.
Y aunque el proyecto este terminado se continúan desarrollando proyectos afines.
En junio del 2021 el consorcio De telomero a telomero (T2T) ha obtenido la
secuencia más completa de un genoma humano hasta la fecha. Los investigadores
han reconstruido 3050 millones de pares de bases de la secuencia de un genoma
humano, completando un 8% aproximado de información que faltaba en los
resultados del PGH.
Y aunque el proyecto este terminado se continúan desarrollando proyectos afines.
 Nota: Una extensión del Proyecto Genoma Humano es el del Microbioma humano,
que intenta determinar las cualidades características de las comunidades microbianas
que se encuentran presentes en el cuerpo humano para determinar las posibles
correlaciones entre los cambios de estas comunidades y el estado de salud de la
persona.
En el 2020 el consorcio De telomero a telomero (T2T) ha obtenido la secuencia más
completa de un genoma humano hasta la fecha. Los investigadores han reconstruido
3050 millones de pares de bases de la secuencia de un genoma humano,
completando un 8% aproximado de información que faltaba en los resultados del
PGH.

*Sin embargo, la porción del genoma que contiene los genes está completa en casi
todas las formas funcionales para propósitos de investigación científica y está
disponible de manera pública y gratuita. Aunque ahora esté terminado el Proyecto
Genoma Humano, los científicos continuarán desarrollando y aplicando nuevas
tecnologías para los pocos problemas difíciles que restan.

La secuenciación del genoma humano más completa hasta la fecha ha sido posible
gracias a la combinación de dos aproximaciones tecnológicas. La primera de ellas es la
utilización de métodos de secuenciación que permiten secuenciar fragmentos de ADN
de gran longitud. En este caso los investigadores han combinado las tecnologías de
Oxford Nanopore y PacBio, disponibles solo desde hace unos pocos años, que facilitan
el ensamblaje de las diferentes piezas para formar el genoma completo. A grandes
rasgos, esta estrategia permite completar el mismo rompecabezas genómico, pero con
piezas mucho más grandes.

La segunda aproximación que ha simplificado la obtención del genoma T2T-CHM13 es

la utilización de una línea celular especial, CHM13, derivada de una complicación
gestacional poco frecuente conocida como mola hidatiforme. Este fenómeno,
caracterizado por el crecimiento anormal de las células que darían lugar a la placenta,
puede producirse por la fecundación de un óvulo sin núcleo por un espermatozoide
que duplica posteriormente su material hereditario.

La característica principal de las células CHM13 es que en esencia son haploides y

tienen la información correspondiente a un único complemento de cromosomas. Por
lo tanto, la secuencia obtenida tras analizar el ADN de estas células se corresponde
directamente a la de los cromosomas presentes. No es necesario resolver a qué
cromosoma de un par pertenece una secuencia concreta, con sus variaciones genéticas
correspondientes, como ocurre en las células diploides que forman los tejidos.