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COLEGIO ABRAHAM LINCOLN

ÁREA DE CIENCIAS NATURALES Y EDUCACIÓN AMBIENTAL


LABORATORIO “MODELOS DE SONDAS DE ADN”
BIOLOGÍA 11 – IV BIMESTRE – 2020 – 2021
“Alimenta responsablemente tu cuerpo y tu mente”

NOMBRES Santiago Soler, David Lozano, Julián Aragón, , Mario Pineda, CURSO 11°C FECHA 12/05/21
Santiago Puerta

Indicador de logro: 2.1 Formula, analiza y evalúa hipótesis, preguntas de investigación, predicciones, metodologías, técnicas, datos
primarios, datos secundarios y explicaciones científicas.

NOTAS IMPORTANTES:
 Hacer uso de los términos de instrucción
 Es importante ayudarse con un cronómetro u otro recurso y terminar la actividad unos minutos antes para cargarla y
enviarla en el módulo de tareas dentro de los tiempos estipulados.
 Favor contestar la guía en un color diferente a negro con el fin de facilitar la visualización y corrección de las
mismas.

Para recordar…

La mayoría de los individuos de la misma especie tienen ADN casi idéntico, pero existen secuencias de nucleótidos en ciertos lugares,
o loci, a lo largo del genoma llamadas repeticiones cortas en tándem o STR que varían entre individuos y se pueden utilizar para
distinguir a un individuo de otro. La técnica se centra en incorporar sondas para que detecten las STR que se componen típicamente
de dos a cinco bases nitrogenadas que se repiten varias veces dependiendo del individuo, por ejemplo, en la figura 1 la secuencia de
nucleótidos del STR es GATA y el individuo tiene 6 regiones de repetición, pero otro individuo puede tener no 6 sino por ejemplo 10
regiones de repetición para ese mismo STR.

Una sonda de ADN es una molécula corta de ADN con una sola hebra, ligada a un marcador identificable como una tintura
fluorescente. Como la sonda consta de una sola hebra, puede unirse a otro ADN que tenga una secuencia complementaria. A fin de
hallar una secuencia específica de bases nitrogenadas, los científicos mezclan una sonda con una muestra de ADN desconocida. La
sonda sólo se ligará a una muestra de ADN que contenga una secuencia de bases complementaria, mostrando así dónde se
encuentra la secuencia deseada. En esta actividad de laboratorio, harás un modelo del uso científico de una sonda de ADN.
Adaptado de Miller y Levine, Biología. Prentice hall

FIGURA 1.
Identificación de una región de repetición por STR en una muestra de ADN

Nota. Cada región de repetición es localizada por una sonda específica, por M Vargas, 2021

Cada individuo tiene conjuntos únicos, o perfiles, de alelos STR. Para muchos análisis forenses, los investigadores utilizan conjunto
básico de 13 sondas para ubicar 13 secuencias de STR en loci establecido en 1996 por el Laboratorio del FBI y que son nombrados
como: CSF1PO, FGA, TH01, TPOX, VWA, D3S1358, D5S818, D7S820, D8S1179, D13S317, D16S539, D18S51 y D21S11.

Cuando se analizan con las sondas los 13 loci, la posibilidad de que dos personas (con la excepción de gemelos idénticos) tengan el
mismo conjunto exacto de alelos para cada uno de estos 13 STR es extremadamente bajo, con la posibilidad de una coincidencia
perfecta al azar en los 13 loci de aproximadamente uno en cada 10 billones.

CRITERIO A: RECONOCER HECHOS Y FENÓMENOS: (EXPLORACION - 25 PUNTOS)

1. PLANTEAMIENTO DEL PROBLEMA:


En el laboratorio forense del CTI (Cuerpo Técnico de Investigaciones), un grupo de investigadores recibe dos muestras de ADN,
una recolectada en la escena del crimen y la otra proveniente de un presunto sospechoso al que se le encontró parte del botín,
pero que alega en su defensa que él encontró la bolsa con las joyas bajo la silla de un parque por lo que se declara inocente. La
tarea impuesta por la fiscalía es cotejar las pruebas para aclarar el caso, para lo cual, los investigadores deciden aplicar en este
caso la técnica de sondas de ADN. A partir del contexto dado elabora la pregunta de investigación. (5 PUNTOS)

¿ es posible determinar si el sospechoso es el culpable a partir de la muestra de ADN encontrada en la escena del crimen a a
partir de una sonda de ADN y la identificación de los STR ?
PUNTOS
OBTENIDOS

2. SELECCIÓN DE VARIABLES: A partir de la pregunta y el contexto del experimento, identificar:

a. Variable independiente: (Se refiere a la variable que se manipula en el laboratorio) (5 PUNTOS)


Identificación de repetición corta en Tándem o STR
PUNTOS
OBTENIDOS

b. Variable dependiente: (Se refiere a la variable donde se observa el efecto de la independiente) (5 PUNTOS)
Coincidencia de las STR del ADN del sospechoso y el ADN de la escena del crimen

PUNTOS
OBTENIDOS

c. Variables controladas: (Se refiere a las condiciones que se mantienen constantes durante todo el experimento
(5 PUNTOS)
1. perfiles de ADN de la escena del crimen y la muestra del sospechoso

2. Alelos identificados en la STR

PUNTOS
OBTENIDOS

3. PLANTEAMIENTO DE HIPÓTESIS:
(Elaborar suposiciones sobre los resultados que se obtendrán en el laboratorio (5 PUNTOS)
H0 El ADN de la escena del crimen y el ADN del sospecho no tuvieron coincidencias en sus STR, por lo cual es sospechoso
es inocente

H1 El ADN de la escena del crimen y el ADN del sospecho fueron totalmente idénticas sus STR, por ende, el sospechoso
es culpable

PUNTOS
OBTENIDOS

4. DISEÑO EXPERIMENTAL:

Lee con atención las instrucciones para que puedas determinar si el sospechoso es o no culpable del robo del que es
acusado. Los técnicos forenses obtuvieron células de la piel de una impresión de la frente del criminal que quedaron en una vitrina de
vidrio donde se exponían las joyas. El ADN ha sido aislado, con el PCR amplificado para 4 de los13 loci STR estándar y a partir de
estos se codificaron las sondas. (Figura 2)

FIGURA 2
Perfil de ADN para 4 secuencias de STR tomado en la escena del crimen

Nota. Cada línea de color muestra los alelos, uno paterno y el otro materno para cada uno de los cuatro principales STR
(D5S818, CSF1PO, D7S820, D8S1179) analizados, los números debajo de cada alelo indican la cantidad de regiones de
repetición para el STR. Cuando solo hay un número, indica que ambos alelos tienen el mismo número de regiones de
repetición, por M Vargas, 2021

CRITERIO B: REGISTRO Y PROCESAMIENTO DE DATOS: (ANÁLISIS - 30 PUNTOS)

5. RESULTADOS:

A continuación, se muestran los resultados de la secuencia de ADN del sospechoso al que se le aplicaron las sondas elaboradas a
partir de la muestra en la escena del crimen. En color verde se muestran los STR ´para cada uno de los alelos analizados y que fueron
rastreados por la sonda, ejemplo, para las secciones de ADN con el STR D5S818, la secuencia de nucleótidos es AGAT, donde el
alelo 1 presenta 7 regiones de repetición y el alelo 2 presenta 8 regiones de repetición (Los datos se tabulan en la tabla 1)

DATOS DEL PERFIL DE AND DEL SOSPECHOSO:

D5S818
alelo 1: 5'–CAATCATAGCCACAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACCAAAGAG–3'
alelo 2: 5'–CAATCATAGCCACAAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACCAAAGAG–3'
CSF1PO
alelo 1: 5'–GGCCATCTTCAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGCTAGTCC–3'
alelo 2: 5'–GGCCATCTTCAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGCTAGTCC–3'
D7S820
alelo 1: 5'–CCTCATTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGTCAG–3'
alelo 2: 5'–CCTCATTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGTCAG–3 '
D8S1179
alelo 1: 5'–GTTCATTTTCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACGAATGTACA–3'
alelo 2: 5'–GTTCATTTTCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACGAATGTACA–3'

a. Para cada una de las 3 secciones restantes de ADN, colorea las regiones de repetición (ten en cuenta como se hizo para la
secuencia D5S818) (5
PUNTOS)

P CSF1PO
U alelo 1: 5'–GGCCATCTTCAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGCTAGTCC–3'
N
T alelo 2: 5'–GGCCATCTTCAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATGCTAGTCC–3'
O D7S820
S alelo 1: 5'–CCTCATTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGTCAG–3'
O
alelo 2: 5'–CCTCATTGACGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATAGATACATAGTCAG–3'
B D8S1179
T alelo 1: 5'–GTTCATTTTCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACGAATGTACA–3'
E alelo 2: 5'–GTTCATTTTCATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACGAATGTACA–3'
N
I
D
O
S

b. A partir de la identificación de las regiones de repetición de los STR del perfil de ADN del sospechoso completa la tabla 1.
(5 puntos)

Tabla 1
Conteo de unidades de repetición para las cuatro secuencias de STR obtenidas del sospechoso del robo
LOCUS UNIDADES DE REPETICIÓN Número de repeticiones para Número de repeticiones para
el alelo 1 el alelo 2

STR D5S818 en el AGAT 7 8


cromosoma 5

STR CSF1PO en el TAGA 13 13


cromosoma 5

STR D7S820 en el GATA 6 12


cromosoma 7

STR D8S1179 en el TCTA 10 10


cromosoma 8

Nota. Conteo de unidades de repetición para las cuatro secuencias de STR obtenidas del sospechoso del robo, por M vargas, 2021

PUNTOS OBTENIDOS

c. Se tabula la secuencia de ADN para el alelo 1 de la sección codificada como D7S820. Completa la tabla escribiendo la sonda
que corresponda (recuerda que la sonda en este caso solo identifica las regiones de repetición STR) (5 PUNTOS)

C C T C A T T G A C G A T A G A T A G A T A G A T A G A T A G A T A C A T A G T C A G
C T A T C T A T C T A T C T A T C T A T C T A T

PUNTOS OBTENIDOS

d. Compara el perfil de ADN encontrado en la escena del crimen (figura 2) con el generado por el ADN del sospechoso (tabla 1).
Explica si el resultado del perfil de ADN favorece a la fiscalía o a la defensa: (10
PUNTOS)

Los resultados de ADN la escena del crimen ( figura 2) y los del sospechoso (tabla 1) son totalmente idénticos, por lo cual, es
posible decir que el sospechoso si estuvo involucrado en el crimen, entonces, esta evidencia favorecería a la fiscalía y
derribaría el argumento de la defensa del sospechoso

PUNTOS OBTENIDOS
e. Explica teniendo en cuenta la lectura de inicio, ¿por qué la sonda para este caso se programó para localizar únicamente las
regiones de repetición STR y no toda la secuencia de ADN? (5 PUNTOS)

Dado que los individuos de una misma especie( en este caso los humanos) tienen una secuencia de ADN casi idéntica, la cual
se compone únicamente por cuatro bases nitrogenadas: la Adenina (A), la timina(T), Citosina(C), Guanina( G), Es posible
decir que sería muy difícil diferenciar un individuo de otro, sin embargo, existen secuencias de nucleótidos en Tándem a lo
largo del genoma que ayudan a distinguir los individuos, la cantidad de repeticiones del Tándem en el genoma es el factor que
determinar las diferencias entre un individuo y otro, por tal razón es mas efectivo usar las regiones de repetición STR que toda
la secuencia de ADN

PUNTOS OBTENIDOS
Este criterio evalúa en qué medida el informe del alumno aporta pruebas de que este ha evaluado la investigación y los
resultados con respecto a la pregunta de investigación y al contexto científico aceptado,

8. CONCLUSIONES
a. Finalmente, los científicos sacan conclusiones que dan explicaciones claras y coherentes frente a los resultados obtenidos en el
experimento. Planteen una conclusión obtenida de la práctica donde se evidencie dominio conceptual y se indique la hipótesis
validada. (20 PUNTOS)

A partir de las sondas de ADN y las regiones de repetición STR se logro determinar que las muestras de ADN obtenidas de
la escena del crimen y del sospechoso del crimen fueron totalmente idénticas, esto significa que el sospechoso fue el
responsable de perpetrar el crimen, por ende, la fiscalía va a ganr el caso gracias a esta evidencia y gracias a esto se
valida la H1 El ADN de la escena del crimen y el ADN del sospecho fueron totalmente idénticas sus STR, por ende, el
sospechoso es culpable

PUNTOS OBTENIDOS

b. Identifiquen las limitaciones presentadas en la práctica, sus efectos y planteen sugerencias realistas y pertinentes para la mejora y
la ampliación de la misma. (10 PUNTOS)

LIMITACIONES EFECTOS MEJORAS

Este nos costó tiempo del trabajo Enfocarse primero en el diseño


Tardamos mucho tiempo en determinar reduciendo tiempo para el resto del experimental para posteriormente
las variables laboratorio determinar las variables

PUNTOS OBTENIDOS

AUTOEVALUACIÓN FORMATIVA:
Diligencia el siguiente cuadro registrando el nombre de cada uno de los integrantes del grupo e indiquen de manera clara y honesta
una fortaleza y un aspecto por mejorar en cuanto a su desempeño del trabajo desarrollado:

NOMBRE DEL ESTUDIANTE FORTALEZAS DEBILIDADES

1. Santiago Puerta Determinación de variables Tomo mucho tiempo en determinarlas

2. Mario Pineda Al inicio no se tenía claridad frente a lo


Desarrollo de tabla 1, y explicación de que se tenía que realizar.
esta

3. Julián Aragón Desarrollo experimental No se tenía claridad frente al análisis de


la situación al inicio

4. Santiago Soler Desarrollo de conclusiones Demora en el planteamiento de estas por


redacción

5. David Lozano Planteamiento de hipótesis Confusión a la hora de determinar si la


hipótesis planteada era correcta por lo
que se tuvo que plantear varias veces

CRITERIO D: COMUNICACÍÓN Y COMPROMISO PERSONAL (15 PUNTOS)

En este aspecto se valorará tu cumplimiento con los tiempos de trabajo, seguimiento de instrucciones, originalidad en su
autoría, organización de la información. Además, se tendrá en cuenta la presentación del informe en aspectos como:
ortografía, redacción y terminología usada.

PUNTOS OBTENIDOS

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