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Existen 3 vías de transporte entre los compartimentos de diferentes formas por los que se mueven
las proteínas (del citoplasma del orgánulo):
● A través de los NPC (complejos de poro nuclear: proteínas nucleares), que permiten la
entrada de proteínas grandes y de moléculas pequeñas (por difusión simple) en el núcleo.
● A través de proteínas transportadoras o translocadoras de membrana de los orgánulos
(proteínas de la mitocondria, cloroplastos, peroxisomas).
● A través de vesículas de transporte (proteínas de membrana, de los lisosomas y
extracelulares), las cuales se fusionan volcando el contenido de las vesículas a los orgánulos.
El destino de cualquier proteína depende de que su secuencia de aminoácidos contenga una
secuencia señal (esta secuencia señal únicamente se forma cuando la proteína está plegada). La
enzima peptidasa señal corta este trozo de la proteína una vez que llega a su destino porque ya no
sirve, ya que esa parte solo indicaba a dónde debía ir la proteína.
Las proteínas que carecen de esta secuencia permanecen en el citosol. Esta secuencia es un
segmento de la proteína de unos 15 a 60 Aa. En ocasiones, se elimina de la proteína una vez
realizada la distribución.
Junto al receptor de la SRP existe un canal translocador. En el momento en el que este detecta que
existe una secuencia señal se abre, libera el SRP y permite la síntesis de la proteína a través del
translocador (ya que ya no está ocupado el lugar de factor de elongación). Una vez que el
translocador reconoce al péptido señal, libera el SRP y el receptor SRP los cuales se liberan y se
reciclan para volver a usarse.
3.1.3.- Translocación en proteínas solubles:
Se encuentran dentro del lumen del retículo endoplasmático. Este
tipo de proteínas están destinadas para la secreción o bien para
almacenarse en el lumen de los orgánulos.
El canal translocador es un poro acuoso que se encuentra en la
membrana del RER, su función es reconocer al péptido señal y
permitir la síntesis de la proteína a través de su poro acuoso. El
centro del poro se denomina complejo Sec61, (conservado en
especies estudiadas). Está formado por 3 subunidades, las cuales
van a provocar que el poro esté siempre cerrado, muy conservado.
Este poro acuoso es una estructura dinámica que se abre solamente
como un translocador cuando el polipéptido atraviesa la membrana
del RE. En un translocador inactivo es importante que se mantenga
cerrado , de tal manera que el RE retiene los iones impermeables
(como el Ca 2 +), que sino, saldría fuera de la membrana.
Su estructura consta de varias α-hélices rodeando un canal a través del cual pasa el polipéptido. Este
canal permanece cerrado por una α-hélice de menor tamaño y solo se abre transitoriamente cuando
hay un polipéptido. Posee un mecanismo de apertura lateral adicional que permite el acceso del
polipéptido (parte hidrofñobica) a la bicapa lipídica. Este mecanismo es importante para:
El péptido señal puede entrar el extremo N-terminal y sintetizarse este extremo o entrar el
C-terminal y sintetizar ese extremo. Los Aa que rodean la secuencia señal con carga más negativa van
a quedar en el interior del lumen, y los más positivos hacia el citosol. Si los Aa más positivos están
cerca del extremo N-terminal, este extremo quedará fuera y la proteína se sintetizará con el
C-terminal hacia el interior. Si los Aa más positivos quedan hacia el extremo C-terminal, y los más
negativos al N-terminal; el extremo C-terminal se terminará de sintetizar en el citoplasma, y el
N-terminal en el interior del lumen.
3.1.4.- Translocación al RE de proteínas transmembrana multipaso.
La translocación al RE de proteínas transmembrana multipaso (con múltiples dominios
transmembrana) se produce en las proteínas de pasos múltiples se localizan pares de secuencias de
comienzo y de detención de la transferencia. La proteína se sintetiza todo, tanto dentro como fuera.
La peptidasa de señal corta solo la última señal comienzo.
Una enzima llamada oligosacaril transferasa realiza la modificación: su sitio activo está expuesto en el
lumen del RE, por lo que las proteínas citosólicas no pueden glicosilarse de este modo, es decir, va a
transferir un oligosacárido desde un lípido denominado dolicol, a un residuo de asparagina en el
momento en el que detecta su presencia. Siempre se asocia una enzima oligosacaril transferasa con
un canal translocador, lo que permite una glicosilación eficiente.
Ensamblaje del oligosacárido precursor: la cadena de
carbohidratos no se ensambla sobre la proteína, sino que lo
hace sobre un lípido portador (dolicol) y, luego, se transfiere en
bloque al residuo de asparagina de la proteína. Este es el
dolicol, un lípido portador especial cuya función es permitir
que sobre él se sintetice un oligosacárido y transferir dicho
oligosacárido hasta que se transporte. Se encuentra en el lado
citosólico de la membrana del RE y después el precursor unido
al dolicol cambia su orientación en la membrana (ver foto
siguiente). Allí comienza a glucosilarse en la parte
citoplasmática mediante el gasto de energía con la unión de
diferentes glúcidos, hasta un punto en el que ha crecido tanto
que se produce flip y pasa la parte glucosilada al interior del RE.
Una vez que ha entrado en el lumen del RE, va a seguir
adquiriendo más glúcidos hasta formar el oligosacárido
maduro.
Estas modificaciones en las proteínas son necesarias porque protegen a las proteínas hasta que se
pliegan en su forma correcta y las guían hasta el orgánulo apropiado porque actúa como una señal
de transporte.
5.- Plegamiento de proteínas en el RE:
La n-glicosilación es importante para el plegamiento de las proteínas. Esta N-glicosilación, luego se va
a ir modificando, y va a marcar para que vaya pasando de un sitio a otro hasta su destino final.
Las proteínas deben encontrarse bien plegadas, ya que sino, podrían amontonarse y anticipar la
apoptosis de la célula. Si por sí solas no pueden conformar su estructura cuaternaria, las chaperonas,
entre otros, ayudarán a las proyrínas para que terminen su proceso de plegamiento.
Los oligosacáridos son necesarios para el correcto plegamiento de las proteínas. Dentro del RE
actúan como marcadores para las chaperonas denominadas calnexina y calreticulina. Ambas son
dependientes de calcio (Ca 2+ ), ya que lo requieren, el cual está muy enriquecido en el interior del
RE. Estas chaperonas son lectinas (unen azúcares) que reconocen glicoproteínas mal o
incompletamente plegadas, evitando que se agreguen. Reconocen N-oligosacáridos con una glucosa
en la posición terminal y retienen a la proteína en el RE.
Las glucosidasas eliminan residuos de glucosa y, cuando solo queda una glucosa, la proteína es
reconocida por la chaperona. La glucosiltransferasa es crucial porque continúa añadiendo más
glucosas a la proteína si está mal plegada. Así, se mantiene la afinidad por las chaperonas y se retiene
en el RE hasta que la glicoproteína está correctamente plegada. Ocurren ciclos hasta el correcto
plegamiento.
Las calnexinas están ancladas en el interior del retículo. Es una proteína capaz de reconocer los
carbohidratos que se han unido a la proteína evitando que las proteínas se plieguen mal y, por tanto,
formen agregados, por ello tienen función de chaperona.
Una proteína desplegada y glucosilada que posee un oligosacárido que termina en 3 glucosas, sufre
la eliminación de dos de estas, lo que supone una señal para que la calnexina se una a la glucosa y
compruebe si la proteína está bien o mal plegada, si está mal plegada tratará de plegarla. Si está bien
plegada o la pliega correctamente una enzima glucosilada cortará la última glucosa que queda y, tras
ser reconocida como bien plegada por la glucosil transferasa, la proteína bien plegada queda en el
RE.
Si no consigue plegarla, entra una glucosiltransferasa que reconoce que la proteína está mal plegada
y añade de nuevo la última glucosa.
*También se chequean que los enlaces de disulfuro estén bien formados, si no, las chaperonas se
encargan de modificar estos enlaces.
Algunas proteínas nunca llegan a plegarse bien, por lo que tienen que ser exportadas
(retrotranslocadas) del RE y degradadas en el citosol por el proteasoma. Cuando la calnexina y
calreticulina son incapaces de plegar la proteína, estas van a pasar por un complejo translocador de
proteínas que va a llevarlas desde la membrana del lumen del RE hasta el citoplasma. Una vez en el
citoplasma, el oligosacárido será retirado en bloque por la N-glicanasa, marcada con una cola de
poliubiquitina por el complejo E3 ubiquitina ligasa que va a unir una poliubiquitina a la proteína mal
plegada, lo que va a provocar que la proteína vaya al proteasoma, donde se degradará.
.
La células controla la cantidad de proteínas mal plegadas en los diferentes compartimentos, y cuando
esta es muy elevada, se produce la respuesta a proteínas mal plegadas. Esta respuesta está mediada
por tres tipos de sensores (proteínas transmembrana) localizados en la membrana del RE. Esta
respuesta implica la activación transcripcional de genes implicados en procesos de.
● Plegamientos de proteínas (genes que codifican chaperonas).
● Retrotranslocación de proteínas desde el RE al citosol.
● Degradación de proteínas en el citosol.
● Incluso pueden inhibir la síntesis de proteínas.
Todo esto lo hace para llevar a la misma conclusión: EVITAR ACUMULACIÓN DE PROTEÍNAS MAL
PLEGADAS.
5.2.- Señalización e proteínas mal plegadas:
1. Oligomerización: es la agregación de moléculas para la formación de una estructura más
compleja.
● Puede tener un efecto positivo, regulando la función de las proteínas y convirtiéndolas
en funcionales.
● Pueden tener un efecto negativo, generando proteínas no funcionales y la formación de
depósitos en fibras que dan lugar a un gran número de enfermedades (E de Alzheimer, E
de Parkinson, encefalopatía espongifrome…).
2. Quinasas: son un conjunto de enzimas cuya función
principal es la de fosforilar otras proteínas, activando o
silenciando su actividad. La acción de fosforilar una
proteína hace que adopte nuevas capacidades.
Hay 3 mecanismos que se ponen en marcha cuando hay muchas proteínas mal plegadas, los cuales
consisten en la síntesis abundante de chaperonas. Una vez que hay una acumulación de proteínas en
el citosol mal plegadas, esto hace que, de una manera u de otra, se estimule el proceso de
transcripción de genes encargados de sintetizar chaperonas (ayudan a que se pliegan de una manera
correcta las proteínas). Esta respuesta de proteínas mal formadas “unfolded protein response”
puede tener distintos tipos de soluciones, con un mismo propósito: puede estimular la producción
de proteínas dedicadas a retro translocar, degradar proteínas en el citosol….
1. IRE1. Debido a la existencia de gran cantidad de proteínas mal plegadas se produce una señal
que provoca la unión de estas proteínas al receptor IRE1, una vez unidas a este receptor, se
dimeriza, formando un dímero de IRE1 y se autofosforila; debido a esto, IRE1 adquiere una
capacidad mayor de ribonucleasa en la cara citosólica. Esta función permite eliminar un
intrón en el pre-ARNm, formando el ARNm maduro, el cual es utilizado para traducir y
formar un factor de transcripción (proteínas capaces de unirse a los promotores de los genes
y activar la síntesis de ARNm). Estos factores de transcripción pasan a través del NPC y se
unirán a promotores de genes de chaperonas, aumentando la transcripción de ARNm, que va
al citoplasma y entra en el ribosoma. Se ha producido un gen activador que regula a toda
proteína. Esta proteína activa la transcripción de genes, codificando las proteínas que
intervienen en las que se encuentran mal plegadas. Tras esto, a través de transporte
co-traduccional, penetra en el RE en forma de chaperona, permitiendo que se degraden las
proteínas mal plegadas.
2. PERK. Se inicia cuando hay muchas proteínas en el RE. PERK es una proteína del RE, pero
pone en marcha su mecanismo en el citosol. Es capaz de reconocer la proteína mal plegada,
de tal forma que se dimeriza (hay 2 monómeros que se unen en un dímero) y se autofosforila
con gasto de ATP. Tiene una parte receptora en el lumen que reconoce las proteínas mal
formadas. Después de la dimerización se mandan señales por el citoplasma para inhibir la
síntesis de todas las proteínas, excepto de las chaperonas. Con esto se disminuye la
formación de proteínas mal plegadas y aumenta la de chaperonas para eliminar las que ya
hay. Traducción selectiva de una proteína reguladora que aumentará la transcripción de
genes que codifican chaperonas.
3. ATF6. Esta proteína está formada por un factor de transcripción inactivo en la membrana del
RE y un receptor. La acumulación de proteínas mal plegadas lo activa, se une a una de ellas
liberándolo de la membrana del RE y va a migrar al aparato de Golgi. Tras migrar al AG, una
proteasa escinde su dominio citosólico, y este dominio de la proteína es un nuevo factor
regulador de la transcripción de genes que codifican chaperonas.
Las proteínas mal plegadas también activan una segunda quinasa transmembrana en el RE, que
inhibe un factor de iniciación de la traducción al fosforilarlo y, por lo tanto, reduce la producción de
nuevas proteínas en toda la célula. Una consecuencia de la reducción en la traducción de proteínas
es reducir el flujo de proteínas hacia el RE, lo que limita la carga de proteínas que deben plegarse allí.
Algunas proteínas, sin embargo, se traducen preferentemente cuando los factores de iniciación de la
traducción son escasos, y uno de ellos es una proteína reguladora de genes que ayuda a activar la
transcripción de los genes que codifican proteínas activas en la respuesta de proteínas desplegadas.
Finalmente, una tercera proteína reguladora de genes se sintetiza inicialmente como una proteína
integral de membrana del RE. Debido a que está unido covalentemente a la membrana, no puede
activar la transcripción de genes en el núcleo. Cuando las proteínas mal plegadas se acumulan en el
RE, la proteína transmembrana se transporta allí, donde encuentra proteasas que escinden su
dominio citosólico, que ahora puede migrar al núcleo y ayudar a activar la transcripción de los genes
que codifican las proteínas involucradas en el desdoblamiento. respuesta proteica.
5.3.- Proteínas integrales ancladas a GPI (glycosilfosfatidilinositol):
Algunas proteínas cuyo destino será la membrana
plasmática se unen covalentemente a
glicosilfosfatidilinositol (anclaje a lípidos) en
extremo carboxi terminal.
La señal que especifica esta modificación es una
región hidrofóbica en su extremo carboxi terminal y
Aa adyacentes.
Unión catalizada por enzimas del lumen del RE. A la
vez, corta la región hidrofóbica y la proteína queda
totalmente expuesta en el lumen del RE (y
eventualmente en el exterior de la membrana
plasmática).
Los parásitos tripanosomas, por ejemplo, utilizan este mecanismo para deshacerse de su capa de
proteínas de superficie ancladas a GPI cuando son atacados por el sistema inmunitario. Los anclajes
GPI también se pueden usar para dirigir las proteínas de la membrana plasmática hacia las balsas
lipídicas y, por lo tanto, segregar las proteínas de otras proteínas de la membrana.
El proceso de síntesis de fosfatidilcolina comienza en la cara de la membrana del RE, lugar principal
de la síntesis de la mayoría de lípidos, incluidos los fosfolípidos y el colesterol. La esfingomielina y los
glicolípidos finalizan su síntesis en el Golgi. Es un proceso catalizado por enzimas de la membrana del
RE, cuya región catalítica se orienta hacia el citosol (donde se encuentran la mayoría de los
metabolitos precursores). La síntesis de fosfolípidos ocurre exclusivamente en la cara citosólica de la
membrana del RE. La membrana se va a agrandar, ya que va a recibir ácidos grasos, los cuales llegan
unidos con una proteína que lo transporta.
Dos ácidos grasos se introducen en el interior de la membrana (cara citosólica), estos ácidos grasos
se activan por la CoA transferasa que introduce una CoA a ambos ácidos grasos, en ese momento
una acil trasnferasa va a eliminar las CoA y va a añadir un glicerol 3-fosfato. Una enzima fosfatasa
elimina el grupo fosfato y, tras esto, la enzima colina fosfotransferasa transfiere un grupo fosfocolina
al C3 del glicerol, formando una fosfatidilcolina.
6.1.- Translocación de lípidos de la membrana:
La membrana del retículo endoplasmático sintetiza su mayoría de los lípidos, incluyendo los
fosfolípidos y el colesterol, necesarios para construir nuevas células de membrana. La fosfatidilcolina
es el fosfolípido mayoritario en la membrana, y como sus ácidos grasos son completamente
hidrofóbicos, son conducidos desde sus sitios de síntesis al RE por una proteína fijadora de ácidos
grasos en el citosol. Después de llegar a la membrana del RE y activarse con CoA, las aciltransferasas
agregan sucesivamente dos ácidos grasos al fosfato de glicerol para producir ácido fosfatídico. El
ácido fosfatídico es suficientemente insoluble en agua para permanecer en la bicapa lipídica y no
puede ser extraído de la bicapa por las proteínas de unión a ácidos grasos. Siendo este el mecanismo
por el cual se agranda la bicapa lipídica del RE. Los pasos posteriores determinan el grupo de cabeza
de una molécula lipídica recién formada y, por lo tanto, la naturaleza química de la bicapa, pero no
dan como resultado un crecimiento neto de la membrana.
Los otros dos fosfolípidos de membrana principales (fosfatidil etanolamina y fosfatidilserina), así
como el fosfolípido menor fosfatidilinositol (PI), se sintetizan de esta manera.
Debido a que la síntesis de fosfolípidos tiene lugar en la mitad citosólica de la bicapa lipídica del RE,
es necesario que exista un mecanismo que transfiera algunas de las moléculas de fosfolípidos recién
formadas a la hoja luminal de la bicapa. En las bicapas lipídicas sintéticas, los lípidos no se “invierten”
de esta manera, pero en el ER este movimiento de flip-flop sí que se realiza, gracias a la enzima
escramblasa.
Los lípidos sintetizados desde el RE llegan en una vesícula (ambos lados igualados en número por la
escramblasa) a la membrana plasmática y se colocan de forma aleatoria; las enzimas flipasas actúan
realizando flip-flop, reconociendo los lípidos y ordenándolos, permitiendo que la membrana posea
su asimetría característica.
La célula esta compartimentada de numerosos orgánulos.
Esta encargado de que maduren las proteínas
COMPARTIMENTOS CELULARES:
Cada compartimento tiene sus enzimas y sus cosas para realizar su función por ello, es esencial
que las proteínas lleguen al órgano necesario.
las células tienen que importar o exportar los compartimentos. En el núcleo las NLS y las NES
Todas las cleulas animales vegetales tienen los mismo organelos pero depende de su funcion
tendra más o menos organelos. Celula tiene que producir mucha grasa adipocito→ mucho reticulo
y luego golgi muy desarrollado
La informacion necesaria de madre e hija viene no exclusivamente dle ADN hay que partir d elos
organelos de las celulasd anteriores. La celula necesita la informacion de la organela previa.
SECUENCIAS SEÑALES:
Aa básicos, determinados de uns secuencia determinada, que hace que la proteina sea esa y no
otra.
aa hidrofobicos, no son polares, señal necesariapara importar al reticulo. Hay otra seal pars volver
al reticulo
RETICULOI ENDOPLASMATICO
visualmente es esponjoso, com si fuesen tubulos y hojas, formandoe sa cantidad enrome de
superficie de membrana, y asi haya muchos ribosomas, y sinteticen muchas proteinas.
Cualqueirr region del citosol.
sintetiza proteinas
sitnetiza lipidos
almacena calcio (musuculares) tamb en el retculo
COOTRADUCCIONAL:
Estas proteinas necesitan una secuencia señal
solubles dentro dle retiuclo: entran totoakennte al reticulo y se quedan allí. Se va sntetizando y va
entrando. Hay a veces que es soluble y otros que se quea insertado en la membrana.
No es inmediato, necesita una proteina que lo reconozca y enganche al ribosoma y se lo lleve a la
membrana
esa particula es PRS. Es la marrón. eta formada por unos polipéptidos, dominios que tienen
funciones. Una funcion es de pinza otro de pausar la traducción y unso RNA que se ensamblan
para formaresta particula.
Es coo una llave inglesa, una zona se dobla interaccioanndo con tood el ribosoma.
en la membrasna del reticulo habra un receptor de esta particula. Esto marron toene que
reocnocer a un receptore que etsa anclado en la membrana. Poner a la proteina que se esta
formando se pone muy cerquita dle translocador.
SRP
receptor
translocon (proteina tarnsolcadora)
1.- secuencia señal
2.- la srp reocncoe la señal interacciona con ella y con el ribosoma
3.- arrastra el complejo y lo lleva al retiuclo
4.- el receptor reconoce al contento
5.- la priteina ya tiene el translocador muy cerca. La propia proteina reconcoed la proteina azul y se
inserta en él. Los aminoacidos azules seran hidrofobicos (afinidad cpn los aa de la proteina)
6.- se corta y la proteina se queda suelta
EL CANAL TRASNLOCADOR:
El principal se llama complejo sec 61
Constituido de 6unidades que seconservan a lo largo del tiempo y de la evolcuion → funciona bue.
si se tiene que quedar inserta tiene que salir porun lado muy detallado.