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CÉLULAS Y ORGANISMOS
TRABAJOS BIOLÓGICOS
ORGANISMOS HETERÓTROFOS
ORGANISMOS AUTÓTROFOS
(fotosintéticos)
Las células son capaces de transducir la energía. La energía química almacenada en ciertas moléculas
biológicas, como el ATP, se convierte en energía mecánica cuando los organelos se desplazan de un sitio de la
célula a otro; en energía eléctrica cuando los iones fluyen a través de la membrana, o en energía térmica cuando
se libera calor durante la contracción muscular.
La transducción energética más importante en el reino biológico es la conversión de luz solar en energía química,
el proceso de la fotosíntesis, que aporta el combustible que de manera directa o indirecta impulsa las
actividades de casi todas las formas de vida. Diversos animales, incluidas las luciérnagas y peces luminosos,
son capaces de convertir energía química de nuevo en luz. Sin embargo, sin importar el proceso de transducción,
la cantidad total de energía en el universo permanece constante.
ESTUDIO de las TRANSDUCCIONES DE ENERGÍA que tienen lugar en los SERES VIVOS
Cuantitativo
I Naturaleza
Procesos químicos
sobre los que se basan
Obedecen a las mismas leyes físicas que gobiernan todos los procesos naturales.
Función
TERMODINAMICA
Rama de la física que estudia las relaciones cuantitativas que existen entre
los distintos tipos de energía (eléctrica, química, radiante, mecánica, etc.)
Sistema: Porción del universo aislada, real o imaginariamente, que está sometida al estudio.
Para revisar las transformaciones de energía que implican materia, es necesario dividir al universo en dos
partes: el sistema en estudio y el resto del universo, al que se denominará entorno.
Un sistema puede definirse de varias maneras: puede ser cierto espacio en el universo o una cierta cantidad de
materia. Por ejemplo, el sistema puede ser una célula viva.
Los cambios en la energía de un sistema que se producen durante un fenómeno se manifiestan de dos maneras:
como cambio en el contenido de calor del sistema o en la realización de un trabajo. Aunque el sistema gane o
pierda energía, la primera ley de la termodinámica indica que la pérdida o ganancia deben equilibrarse con una
ganancia o pérdida en el entorno, de manera que la cantidad en el universo como un todo permanece constante.
ÉÉ
1 kg de agua pura 1 kg de agua pura 1 kg de agua pura
contenida en un vaso contenida en un vaso contenida en un vaso
1 kg de agua pura de precipitado de precipitado 1 kg de agua pura
de precipitado contenida en un vaso
contenida en un vaso
de precipitado de precipitado
i. :
T0= 0°C (hielo) = 273 K T4= 100°C = 373 K
P0=P1= 1 atm T1= 4° = 277 K T2= 25° = 298 K T3= 70°C = 343 K P4=P3=P2=P1= 1 atm
V0= 1091 ml P1= 1 atm P2=P1= 1 atm P3=P2=P1= 1 atm V4= 1044 ml
V1= 1000 ml V2= 1003 ml V3= 1023 ml
: propiedades del sistema que dependen del estado termodinámico del mismo
pero no del camino recorrido para alcanzarlo.
Energía interna (E o U): suma de todas las energías que posee el sistema (atómica, molecular, eléctrica, nuclear,
Entalpía (H): es una medida del contenido de calor del sistema (H: de heat)
No toda la energía interna
del sistema es utilizable
Energía libre de Gibbs (G): expresa la cantidad de energía capaz de realizar trabajo o energía útil del sistema.
: Entropía (S): es una expresión cuantitativa del desorden del sistema.
Matemáticamente: G = H – T.S por lo tanto G será mayor cuanto más grande sea H y menor sea S.
T (K) = T °C + 273
Unidades: E, H, y G en Joule/mol o caloría/mol; S en Joule/mol.K ó caloría/mol.K
¿
•
i i
T1= 4° = 277 K T2= 25° = 298 K T3= 70°C = 343 K
P1= 1 atm P2=P1= 1 atm P3=P2=P1= 1 atm
V1= 1000 ml V2= 1003 ml V3= 1023 ml
Funciones de estado Funciones de estado l
Funciones de estado o
Transformación
E E
• Si HII > HI (ΔH = HII - HI > 0), entonces el sistema absorbió calor durante la transformación, por lo tanto la
transformación es endotérmica.
•Si HII < HI (ΔH = HII - HI < 0), entonces el sistema perdió calor durante la transformación, por lo tanto la
transformación es exotérmica.
• Si GII > GI (ΔG = GII - GI > 0), entonces el sistema gana energía libre durante la transformación, por lo tanto la
transformación es endergónica.
•Si GII < GI (ΔG = GII - GI < 0), entonces el sistema libera energía útil durante la transformación, por lo tanto la
transformación es exergónica.
• Si SII > SI (ΔS = SII - SI > 0), entonces el sistema incrementa su entropía durante la transformación, por lo tanto
se desordena.
•Si SII < SI (ΔS = SII - SI < 0), entonces el sistema disminuye su entropía durante la transformación, por lo tanto
se ordena..
-
La primera ley de la termodinámica es la de
conservación de energía. Señala que la energía no se
crea ni se destruye. Sin embargo, la energía puede
convertirse (por transducción) de una forma a otra.
“En cualquier cambio físico o químico, la cantidad total de energía en el universo permanece constante”,
aunque pueda cambiar la forma de energía.
Matemáticamente: Δ Es = q - w
En condiciones de presión constante: q = ΔH Recordemos que H = entalpía = contenido de calor del sist
Entonces: ΔE = ΔH – w
Por lo tanto, midiendo la cantidad de calor absorbida o liberada en estas condiciones podemos conocer el cambio
energético que acompaña a la transformación.
“Esta ley nos permite conocer el cambio de energía que acompaña a la transformación”.
“En toda transformación espontánea la entropía del universo aumenta hasta alcanzar el equilibrio donde
la entropía del universo es la mayor posible en las condiciones de presión y temperatura dadas”.
Su
Equilibrio: Su
No hay más nada para desordenar
r
“Nos permite predecir si una transformación es espontánea o no
.
calculando o midiendo ΔSU midiendo SU inicial y S U final:
transformación espontánea si SUF > SUI → ΔSU > 0 → aumenta el desorden → espontánea;
ΔS U < 0 → no espontánea).
•
amo
Un criterio más útil que el cambio de entropía del universo es considerar a la segunda ley expresada de modo
alternativo considerando que:
“El sistema tiende espontáneamente a alcanzar el estado de mínima energía y de máxima entropía”.
Siendo G = H – T.S, esto equivale a decir: el sistema tiende espontáneamente al estado de mínima energía libre
“En toda transformación espontánea la energía libre del sistema disminuye hasta alcanzar el equilibrio
donde la energía libre es la mínima posible en las condiciones de presión y temperatura dadas”.
ü
La segunda ley de la termodinámica expresa el
concepto de que los fenómenos en el universo tienen
transformación espontánea una dirección; tienden a proceder “cuesta abajo” de
un estado de mayor energía a uno de menor energía.
Por tanto, en cualquier transformación energética
existe cada vez menor disponibilidad de energía
Equilibrio: Es para realizar trabajo adicional.
•
amo
Las rocas caen de los riscos al suelo y una vez en el fondo, su capacidad para realizar trabajo adicional es
reducida; es muy poco probable que se eleven de nuevo a la cima del risco.
Otro ejemplo: cuando se deja caer un cubo de azúcar en una taza de agua caliente, existe un desplazamiento
espontáneo de moléculas de un estado ordenado en el cristal a una condición mucho más desordenada, cuando
las moléculas de azúcar se dispersan en toda la solución
De igual manera, lo normal es que las cargas contrarias se atraigan, no se separen, y el calor fluye de un cuerpo
más caliente a uno más frío, no a la inversa. Se dice que estos fenómenos son espontáneos, un término que
indica que son favorables desde el punto de vista termodinámico y pueden ocurrir sin el aporte de energía
externa.
Equilibrio: Es
ans
• Si GII < GI (ΔG < 0), la transformación es espontánea, el sistema libera energía útil durante la transformación y
es capaz de realizar trabajo a medida que el sistema tiende al equilibrio. Transformación exergónica.
• Si GII > GI (ΔG > 0), la transformación no es espontánea, sólo podrá llevarse a cabo si se realiza trabajo sobre el
sistema. Transformación endergónica.
La cantidad de desorden de un sistema se puede cuantificar y expresar como la entropía del sistema: cuanto mayor
sea el desorden, mayor será la entropía. Así, otra vía para expresar la segunda ley de la termodinámica es decir que
los sistemas cambiaran espontáneamente hacia distribuciones con mayor nivel de entropía.
Las células vivas -al sobrevivir, crecer y formar organismos complejos- generan orden, por lo que podría parecer que
desafían la segunda ley de la termodinámica. ¿Cómo es posible? La respuesta es que una célula no es un sistema
aislado: la célula toma la energía del medio en forma de alimento o en forma de fotones procedentes del sol y la
utiliza para generar orden en su interior. En el curso de las reacciones químicas que generan orden, la célula
transforma en calor parte de la energía que utiliza. El calor se libera al entorno celular, el cual se desordena, de modo
que la entropía total -de la célula y del entorno que la rodea- aumenta, de acuerdo con las leyes de la termodinámica.
Para entender los principios que rigen estas transformaciones de energía, hay que imaginar una célula rodeada por un
mar de materia que representa el resto del universo. La célula vive y crecen por lo que genera orden interno. Sin
embargo, constantemente libera calor a medida que va sintetizando moléculas y las ensambla formando las
estructuras celulares. El calor es energía en su forma más desordenada -la colisión aleatoria de las moléculas.
Cuando una célula libera energía al mar, incrementa en él la intensidad de los movimientos moleculares (movimientos
térmicos) y, por tanto, la aleatoriedad, o desorden, del mar. La segunda ley de la termodinámica se cumple puesto que
el incremento de la cantidad de orden en el interior de la célula está compensando por un descenso del orden
(incremento de la entropía) en el mat de materia que la rodea , todavía mayor.
j.%faoaaa.a.ae
. • • •
tomado energía de las moléculas del alimento y ha •
•
liberado calor por una reacción que ordena las
moléculas del interior de la célula. El calor incrementa
•
. •
° ,
•
Maes CALOR .
\
el desorden en el medio que rodea la célula ,
Hjort
|
•
(representado por las flechas sesgadas y las moléculas . .
.
•
. • •
deformadas que indican aumentos de los movimientos " •
•
,
moleculares causados por el calor), por lo que cuando •
C 7 a a> C 7
> , , ,
El ΔG de la reacción en un instante determinado viene dado por las [R] y [P] en ese instante según la siguiente
ecuación matemática:
0° yo
]
① ,
a
30
c c
productos reactivos
y
Variación de energía libre estándar
Como la ∆G para una reacción determinada depende de la mezcla de reacción presente en un momento
determinado, no es un término útil para comparar la energética de varias reacciones. Para colocar las
reacciones en bases comparables y poder hacer varios tipos de cálculos, se adoptó una convención para
considerar el cambio en la energía libre que ocurre durante una reacción en un conjunto de condiciones estándar.
La variación de energía libre estándar (𝚫Gº) describe la energía libre emitida cuando los reactivos se
convierten en productos en estas condiciones estándar. Debe tenerse en mente que en la célula no existen
condiciones estándar y por tanto, hay que ser cauteloso para usar los valores de las diferencias de energía
libre estándar en los cálculos de energética celular.
a a 3 00 c)
(Kcal/mol)
c c
☐ y
°
ca
- O
. ① 1
a
C C> C?
zs
C
,
-
cuc s Coac '
g,_
Si
C C C
productos reactivos
Cuando G productos < G reactivos ∆G< 0, la reacción química ocurrirá espontáneamente en el sentido en el cual se
halla escrita y podrá efectuar una cantidad de trabajo equivalente a la disminución de G.
En realidad sólo realizará trabajo si de algún modo puede acoplarse a algún sistema o aparato que puede utilizar la
energía liberada.
Por lo tanto ∆G representa el trabajo máximo que puede realizar el sistema teóricamente. La cantidad efectiva
puede ser mucho menor o nula según la eficiencia del sistema o aparato empleado para el acoplamiento. Toda
aquella energía que no puede utilizarse se pierde como calor.
Para la reacción inversa (Productos → Reactivos) ∆G P→R tiene la misma magnitud pero signo opuesto que ∆G R→P
0° yo
]
① ① ,
a 3 00 c) a
zs
[
a
-
CUC S
C-cac '
C C C .
Ca -
7 "
ca
C Co Ca C C, ca ca
- G
C,
g,_
Si permitimos que la reacción tenga lugar hasta alcanzar el equilibrio: ↑[P] y ↓[R] ↑GP y ↓G R hasta que en el
equilibrio GP = GR ΔG = 0 y ya no se produce un cambio químico neto.
co
Coca > %
C z ,
a
co 3%
C 2 7 cq
R = 1,98 cal/mol K
1 cal = 4,184 J
Por lo tanto:
“ΔGº es una constante y tiene un valor característico para cada reacción que puede ser +, - ó cero según
sea la constante de equilibrio de esa reacción”
La relación entre la constante de equilibrio y el cambio de energía libre estándar se expresa en la ecuación:
C 2 M
a
Cuando el logaritmo natural (ln) se convierte en logaritmo base 10 (log10 ), la ecuación cambia a:
C 7.332
y a
donde R es la constante de gas (1.987 cal/mol ∙ K) y T es la temperatura absoluta (298°K). Recuérdese que el
logaritmo de 1 es cero. Por consiguiente, con base en la ecuación previa puede deducirse que las reacciones
que tienen constantes de equilibrio mayores de 1 tienen valores de ∆G° negativos lo que indica que pueden
ocurrir en forma espontánea en condiciones estándar. Las reacciones que tienen constantes de equilibrio
menores de 1 tienen valores de ∆G° positivos y no pueden ocurrir en forma espontánea en condiciones
estándar.
La mayoría de las reacciones bioquímicas tienen lugar en soluciones acuosas con un:
- pH cercano a 7
- [H2 O] = 55,5M
Por conveniencia de cálculo los bioquímicos definen un estado estándar ligeramente diferente en el que:
[H+ ] = 10 -7 M (pH:7) y [H2O] es 55,5M.
Las constantes físicas basadas en estado estándar bioquímico se escriben con una prima (‘) para distinguirlas de las
constantes usadas por los químicos y físicos. Ej: ΔGº’ y Keq’
'
C 3 7 cq
“El ΔGº’ nos dice en qué dirección y hasta que punto transcurrirá la reacción para alcanzar el equilibrio
cuando la concentración de cada componente es 1M, el pH es 7, la temperatura 25°C y la presión 1 atm”
Para la reacción inversa (Productos → Reactivos) ΔGº’ P→R tiene la misma magnitud pero signo opuesto.
“Si una reacción tiene ΔGº’ < 0 será espontánea en condiciones estándar”
Este ΔGº’ no nos indica que sucederá con esta transformación en otras condiciones para lo cual deberemos calcular
el ΔG.
? 1 Kcal/mol
3
∆GA→B = ∆GºA→B + RT ln ([B])/([A])
? 1 Kcal/mol
Reacción reversible: Puede realizarse en un sentido o en el contrario según los valores de las [R] y [P]
Potencialmente todas las reacciones son reversibles porque, según el valor que tome la relación [P]/[R], ΔG puede
ser mayor o menor que cero en distintos instantes.
0° yo
s
① ① ,
a
30
[
a
-
cuc s
C-cac '
En el equilibrio:
Coca
'
>
C z ,
co co
ΔGº = - RT ln Keq
a
co 3%
“Si una reacción tiene ΔGº < 0 será espontánea en condiciones estándar”
Si partimos de concentraciones 1M de reactivos y productos la reacción ocurrirá en el sentido en el que halla
escrita y la Keq > 1 en el equilibrio predominarán los productos.
Reversibilidad de las reacciones químicas en “condiciones celulares”: En condiciones celulares, una reacción es
reversible si su ΔGº’ es próximo a cero
'
3 C z s can
Reacciones
secuenciales '
3 C C } a can
Las reacciones con grandes valores positivos de ∆G°' casi siempre son impulsadas por el aporte de energía.
Estas dos reacciones comparten los intermediarios H2 O y Pi por lo tanto se pueden expresar como reacciones
secuenciales:
Glu + ATP → Glu-6-P + ADP. ΔGº’ global = ΔGº’ 1 + ΔGº’ 2= -16,7 KJ/mol
Por lo tanto la reacción global es exergónicas y la síntesis de la Glu-6-P puede realizarse gracias al acoplamiento de
la hidrólisis de ATP.
de eso se ocupa la
CINÉTICA QUÍMICA
Cinetica Quimica
/ K
Matemáticamente:
I i unidades: mol/min; mg/seg; etc.
s Z
También puede expresarse en términos de variación de concentraciones de P y R:
l l
Célula = volumen constante
Reacción: unidades: M/min; etc.
Para que una reacción química se produzca se necesita que las moléculas de reactivo colisionen entre sí y que
como resultado de estas colisiones se rompan y/o formen enlaces entre los átomos que forman parte de los
reactivos para generar productos.
Para que esto ocurra las moléculas deben tener cierta energía que haga que las colisiones sean efectivas.
Para que la reacción química tenga lugar las moléculas de reactivo deben alcanzar un
“ESTADO ACTIVADO”
“estado en el cual la probabilidad de que se rompan o formen nuevos enlaces es muy alta. Una vez que
alcanzan el estado activado rápidamente se transforman en producto”
Energía libre, G →
Energía de
activación, Ea
=
Ea P → R
Energía libre, G →
Ea R → P
=
Reactivo, R
ΔG de la Reactivo, R
reacción ΔG de la
reacción
Producto, P Producto, P
Progreso de la reacción →
Progreso de la reacción →
La velocidad de una reacción dependerá del tiempo que tarden las moléculas en alcanzar el estado activado
por lo tanto
Cuanto mayor sea la Ea más tardarán las moléculas en alcanzar el estado activado y menor será la velocidad
Consideremos la reacción:
sasc y run ccias ca
-
C y y
El papel arde fácilmente, liberando a la atmósfera energía en forma de calor, y agua y dióxido de carbono como
gases, pero el humo y las cenizas nunca recobrarán espontáneamente aquella entidad a partir de la atmósfera
calentada y se reconstruirán formando papel. Cuando el papel arde, su energía química se disipa en forma de
calor, aunque no desaparece del universo, puesto que la energía ni se crea ni se destruye, sino que se dispersa
de forma irrecuperable en los movimientos caóticos y desordenados de las moléculas. Al mismo tiempo, los
átomos de las moléculas de papel quedan dispersos y desordenados. En el lenguaje de la termodinámica, se ha
producido una pérdida de energía libre, es decir, la energía que puede ser aprovechada para realizar trabajo o
reacciones químicas. Esta pérdida refleja una pérdida del orden en el que la energía y las moléculas estaban
dispuestas en el papel.
Deberíamos tratar con más detalle el tema de la energía libre brevemente, pero el principio general es claro e
intuitivo: las reacciones químicas sólo se dan en la dirección que permite una pérdida de energía libre, en otras
palabras cualquier reacción se produce de forma espontánea en la dirección que transcurre “cuesta abajo”. En
este sentido, una reacción “cuesta abajo” se conoce como energéticamente favorable.
Aunque la forma más favorable energéticamente del carbono en condiciones normales sea el CO2 y la del
hidrógeno sea el H2O, un organismo vivo no desaparece en volutas de humo ni el apunte que tenés en la mano
arde en llamas. Esto es debido a que las moléculas de los organismos vivos y el apunte están en un estado
relativamente estable y no pueden pasar a un estado de menor energía sin un aporte de energía: en otras
palabras, para que pueda darse una reacción química que deje a una molécula en un estado más estable, está
molécula requiere una energía de activación -una especie de “empujón” por encima de una barrera energética.
En el caso del libro ardiendo, la energía de activación procede del calor de un fósforo encendido. Para las
moléculas que se hallan en solución acuosa, como las de la célula, el empujón lo suministran las colisiones
aleatorias inusuales ricas en energía, que se producen con las moléculas que las rodean, estas colisiones llegan
a ser más violentas cuanto más aumenta la temperatura.
-
Disminuir la Ea -
Adicionando un catalizador
En una célula viva, la energía extra por encima de la barrera la proporcionan en gran medida una clase de
proteínas especializadas: las enzimas. Cada enzima se une fuertemente a una o varias moléculas, denominadas
sustratos, y las mantiene en una situación tal que la energía de activación de una reacción química
determinada se reduce notablemente, de modo que se puede producir la unión de los sustratos. Una sustancia
que puede disminuir la energía de activación de una reacción se denomina catalizador; el catalizador
incrementa la velocidad de la reacción porque permite que se produzca una mayor proporción de colisiones
aleatorias con las moléculas que rodean al sustrato, las cuales hacen que éste sobrepase la barrera energética.
Las enzimas son uno de los catalizadores más eficientes que se conocen, capaces de acelerar las reacciones por
un factor de 10^14, o más.
De esta forma, permiten que se produzcan reacciones que normalmente no se darían rápidamente a
temperaturas normales.
Las enzimas también son muy selectivas. Habitualmente cada enzima cataliza una sola reacción particular: en
otras palabras, disminuye selectivamente la energía de activación de una sola de las reacciones posibles que
puede sufrir la molécula de sustrato que se ha unido a la enzima. De esta forma, las enzimas dirigen a cada una
de las muchas moléculas de la célula a través de vías específicas.
El éxito de los organismos vivos se puede atribuir a la capacidad de la célula para fabricar enzimas de diversos
tipos, cada una de las cuales tienen unas propiedades específicas. Cada enzima tiene una forma característica,
que contiene un sitio activo, un bolsillo o ranura de la enzima dentro del cual sólo encajan los sustratos
específicos. Como en el caso de otros catalizadores, las moléculas de enzima permanecen inalteradas después de
la reacción y, por lo tanto, pueden continuar actuando indefinidamente.
Inorgánicos
E
Energía de activación de
Biológicos Enzimas: en general proteínas la reacción sin catalizar
Las enzimas son catalizadores especialmente eficaces, ya que disminuyen la energía de activación, aún más que
los catalizadores inorgánicos.
El sustrato, la sacarosa,
Glucosa
Karakorum
Fructosa
Haworthi?
consta de glucosa + fructosa
a '
Formación del complejo
razzia rezarás
raaagaeuagaa-Eaaaz.tk
enzima-sustrato
:
Enlace
Sitio activo
3
La enzima rompe el
Enzima enlace glucosa-fructosa
Energía de activación de la
reacción catalizada
enzimáticamente
Energía
Energía
Energía de
Reactivos activación
Productos
.
.
Por ejemplo, la descomposición del agua oxigenada (H2 O2) puede ocurrir:
En las células: “Todas y cada una de las reacciones que ocurren están catalizadas enzimáticamente”
Esto permite que estas reacciones tengan lugar en tiempos compatibles con la vida
Glucosa + O 2 CO 2 + H2O
Gran cantidad de
energía de
Energía libre
Moléculas
transportadoras
activadas
Cantidad Cantidad
de energía de energía
liberada liberada
-
-
Tiempo
Está constituido por cadenas laterales de aminoácidos con características complementarias a la estructura del
sustrato [Ej; si sustrato tiene carga positiva (S+) en el sitio activo predominarán aminoácidos ácidos]. Determina la
especificidad de la enzima.
É
i
Ea no
Energía libre
catalizada
E-S
Ea catalizada
ΔG de la
reacción
s
s s
Progreso de la reacción
Sustrato
Este modelo permite explicar la gran especificidad de las enzimas por el
sustrato. NO permite explicar el hecho que la misma enzima catalice la Sitio activo c
y
C
Modelo del encaje inducido de Koshland (1958): presenta a las enzimas como estructuras dotadas de
plasticidad y flexibilidad.
, Complejo E-S
MODELO DINÁMICO
1. Concentración de sustrato
2. Concentración de enzima
3. Temperatura
4. pH
5. Inhibidores
772.5µs I
l
'S .
g
Depende de la afinidad de la enzima por el sustrato
Concentración de
sustrato [S] (μM)
1.0 -
Sustrato con alta
0,8 afinidad (S)
TT
Cuanto mayor sea la afinidad de la enzima por el
0,6 Sustrato con baja sustrato menor será la concentración de sustrato
afinidad (S’) requerida para ocupar la mitad de los sitios activos
0,4
a mayor afinidad menor Km
0,2
0
ns ns Concentración de sustrato ([S] o [S’])
Km de algunas enzimas:
Mayor
Vmax
GQ
Glucosa + ATP Glucosa-6-P + ADP
Glucosa Vo (o Act. Enz) HQ
Vmax GQ Glucoquinasa
Ni
= Reacción
Velocidad de reacción
Velocidad de reacción (mM/min)
Vmax
" °
2,0
#
° "
. .
i
ii.
.
_
• . .
. .
. . .
1,0
i.
. .
.
. , Vmax
i.: -
:. 0,5
Concentración de enzima (mM) [E] = 0,25 unit
0
Km
Concentración de sustrato [S]
Grupos funcionales -
" ,
pH óptimo: pH al cual la enzima presenta
su máxima capacidad catalítica
pH óptimo pH
|
Velocidad de reacción (V0)
Tripsina
Pepsina
El pH óptimo para las enzimas Fosfatasa
alcalina
pH óptimo pH humanas varía notablemente,
alcanzando incluso valores
extremos (por ejemplo: pHopt = 2
para pepsina, una enzima gástrica
. .
3 s
pH
:
2) Disminución progresiva de la velocidad de reacción debido a la
inactivación de la enzima por desnaturalización térmica de la proteína.
Temperatura (ºC)
|
aumenta la temperatura
Vmax o actividad catalítica
i
: Disminuye la velocidad porque se desnaturaliza la enzima
:
La T óptima para a mayoría de las enzimas humanas
está en el rango entre 35 y 40 °C, estas comienzan a
desnaturalizarse por encima de los 40°C.
T óptima Temperatura
Sustancias que disminuyen o anulan la actividad de las enzimas sin ser transformados por ellas (no son sustratos)
Irreversible
La inhibición enzimática puede ser
Reversible
Se combinan de modo permanente con la enzima uniéndose covalentemente a algún grupo funcional esencial para
la catálisis con lo cual la enzima queda inactivada irreversiblemente.
Sustrato
oiga :
Enzima
Sustrato
Inhibidor
Inhibidor unido
a la enzima
Los sustratos no pueden
unirse al sitio activo
B- Inhibidores Reversibles
La unión de la enzima y el inhibidor es temporal. Impide el normal funcionamiento de la enzima sólo mientras dura la
unión. Pueden ser de tres tipo: competitivos, no competitivos y acompetitivos.
00
por el sitio activo. Modifican Km pero no la Vmax.
?
Sitio activo
Vmax de la enzima s Productos O
☐ >
Inhibidor
Vmax
2 competitivo o
o
0
0
n
'
n
[S] ó .
Un inhibidor competitivo compite con el sustrato por el sitio activo del enzima. Mientras el inhibidor (I) ocupa el
sitio activo impide la fijación del sustrato al enzima. Estos inhibidores son estructuralmente similares al
sustrato, se combinan con la enzima formando un complejo E-S, que no conduce a la catálisis. Debido a que el
inhibidor se une de manera reversible a la enzima, se puede cambiar el sentido de la competición a favor del
sustrato simplemente añadiendo más sustrato. Cuando [S] excede sobradamente a [I] se minimiza la
probabilidad de que se fije una molécula de inhibidor, por lo que la reacción muestra una Vmax normal. No
obstante, la [S] a la cual se alcanza la mitad de la Vmax (Km) aumentará en presencia del inhibidor.
O
Se unen a la enzima en un sitio diferente al sitio activo
④
no competitivo
(alostérico) y la inactivan. Modifican Vmax pero no el Km.
Vmax
"
F
?
Sitio
Ó
Activo
s
Sitio
Vmax inhibidor
t
2
Inhibidor
no competitivo
0
0
n
[S] :O
Apoyo para biología 221 6822889
ATBs beta-lactámicos (Ej: Penicilina y sus derivados):
Antibióticos betalactámicos
Son inhibidores irreversibles de las transpeptidasas (TP) bacterianas.
7 Ji Yi s Ji Yi S
C }
Anillo ' si •
}
,
¡ '
'
C beta-lactámico
'
'
C
'
3 "
2
a .
S Naaaa
s C
3
C q C .
Penicilinas Cefalosporinas
C
3 C
C C 3
C ME
Gt
C
si qq.gl
3
Penicilina q
,
Amoxicilina
"
2
S
Ciertas bacterias tienen una enzima llamada betalactamasa que puede abrir el anillo lactámico, lo que vuelve al
compuesto inocuo para la bacteria.
Para preservar la utilidad de los antimicrobianos
Beta-lactamasa betalactámicos ante la presencia de betalactamasas, se
desarrollaron los inhibidores de betalactamasas, que se unen
Anillo Z
z
beta-lactámico
a ellas de forma irreversible y las inactivan. Existen tres
C C
tipos de inhibidores: el ácido clavulánico, el sulbactam y el
tazobactam, los cuales poseen escasa o nula actividad
S C
3
[ C
S
c
C
3 antimicrobiana. Cada inhibidor se diferencia por su eficacia
C c C
C C
3
y su potencia para inhibir las betalactamasas (el
C
3 C C
C
C
tazobactam es el más eficaz).
C .
.
ÁCIDO
PENICILINA PENICILINOICO Como alternativa para disminuir la resistencia bacteriana
activa inactivo
Garray b.
arar
[
FÁRMACO 5 1 S 1
ACTIVO
3C Ácido clavulánico
o
Beta-lactamasa Br
FÁRMACO 3C Me
3C
INACTIVO la Sr
Beta-lactamasa ENZIMA
INACTIVA
Sulbactam Tazobactam
Acido araquidónico
Cass C yum
C
AINEs
C 3
7
C
C
Leucotrieno A4
3
:
Prostaglandina E1
(PGE1)
Tromboxano A2
Antivirales análogos DE GUANOSINA (Ej: Aciclovir, Ganciclovir, etc.) inhiben la síntesis de ADN viral
Aciclovir
ti
HMG-CoA
reductasa
3-Hidroxi-3-metil-glutaril-CoA
(HMG-CoA)
HMG-CoA
C
reductasa
3
Mevalonato
C
3
. Colesterol
(intracelular)
Endocitosis mediada
Sustrato natural
C 3
por receptor
Colesterol de LDL
(extracelular)
C
3
Lovastatina
(análogo)
Cada conjunto de reacciones secuenciales se denomina RUTA O VÍA METABÓLICA. Pueden ser lineales,
ramificadas o cíclicas
3
]
3
C
2
3
]
Aquellas rutas metabólicas que poseen un ΔG global < 0 (ΣΔG de las reacciones) se dice que son cuesta abajo
porque liberan energía y se denominan catabólicas.
Las que poseen un ΔG global > 0 se dice que son cuesta arriba porque requieren del aporte de energía y se
denominan anabólicas.
“Todas y cada una de las reacciones del metabolismo intermediario están catalizadas enzimáticamente”
En condiciones celulares:
Para que un proceso metabólico pueda realizarse debe tener un ΔG GLOBAL ACOPLADO < 0
Para que esto ocurra en tiempos que permitan satisfacer las necesidades celulares
debe estar catalizado enzimáticamente
De modo que:
“Todos los proceso metabólicos pueden controlarse regulando la actividad de las enzimas que lo catalizan”
R @
Proteasa
. . .
•
En el metabolismo celular hay grupos de enzimas que funcionan conjuntamente en rutas secuenciales para llevar
a cabo un proceso metabólico determinado. La mayor parte de las enzimas de cada ruta metabólica siguen los
comportamientos cinéticos ya descritos. Sin embargo, en cada ruta hay uno o más enzimas que tienen un mayor
efecto sobre la velocidad global de la secuencia de reacciones. Estas enzimas reguladoras muestran una
actividad catalítica mayor o menor en respuesta a ciertas señales. Los ajustes en la velocidad de las
reacciones catalizadas por enzimas reguladoras y, por tanto, en la velocidad de la secuencia entera de
reacciones , permiten que la célula se adapte a las necesidades cambiantes de energía y biomoléculas requeridas
para su crecimiento y la reparación de sus componentes.
En la mayoría de sistemas multienzimáticos, la primera enzima de la secuencia es una enzima reguladora. Éste
es un lugar excelente para regular una ruta metabólica, puesto que la catálisis de tan sólo las primeras
reacciones de una ruta que conducen a un producto innecesario despilfarra energía y metabolitos requeridos en
procesos más importantes. Otras enzimas de la secuencia pueden tener papeles más sutiles en la regulación de,
flujo a través de la ruta.
La actividad de las enzimas reguladoras se modula mediante diversos caminos. Las enzimas alostéricas
funcionan a través de la unión reversible, no covalente, de compuestos reguladores denominados moduladores
alostéricos, los cuales son generalmente metabolitos pequeños o cofactores. Otras enzimas están reguladas por
modificación covalente reversible. Ambas clases de enzimas reguladoras tienden a tener varias subunidades y,
en algunos casos, el sitio o sitios reguladores y el sitio activo se encuentran en subunidades separadas.
El crecimiento y la supervivencia celular es dependen del uso eficaz de los recursos, eficiencia que es posible
gracias a la acción de las enzimas reguladoras.
La modificación covalente más común es la unión de grupos fosfato (fosforilación) a restos de Ser, Thr o Tyr:
/
La reacción inversa (eliminación del grupo fosfato) tiene efecto contrario en la Protein Protein
enzima y es llevada a cabo por las enzimas conocidas como fosfatasas. : kinasa fosfatasa
→ • s • O
C
2
3
C
L-Treonina
C
C 3 Sitio alostérico
Treonina El producto F es un inhibidor
deshidratasa
Primer paso comprometido alostérico de la enzima 3
|
en la vía A-F
QQ
7
Sustrato
3
Producto
•
①
¿
Producto
:
. final de A-F
Producto
ÜÜÜO
final de A-J