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En simples palabras: el ADN puede dar origen a si mismo x la REPLICACIÓN y al ARN por la TRANSCRIPCIÓN. El ARN puede dar
origen a ADN por la TPRASCRIPCIÓN REVERSA y a si mismo por una replicación con un molde de ARN y también ser de molde para
la traducción de proteínas. Y las proteínas pueden servir como factores de transcripción afectando la replicación del ADN, y a si
mismo las proteínas pueden almacenar información que afecta a otras proteínas (esto se descubrió por enfermedades en priones)
RESUMEN HISTÓRICO:
1869: Friedich Miescher extrajo del pus una sustancia ácida que llamó nucleína.
1893: Albert Kossel determina que el ácido nucleico está compuesto por cuantro pares de bases (2 purinas y 2
pirimidinas)
1919: Pheobus Levene descubrió que el DNA estaba hecho de una cadena
de nucleótidos.
1920: Levene propuso la “teoría del tetranucleótido” que decia que el
DNA está hecho por iguales cantidades de C, G, A y T. PERO ES FALSO. En
realidad las cantidades de C Y G con A y T son iguales.
REPLICACIÓN SEMICONSERVATIVA
Cada hélice nueva que se genera tiene una hebra vieja y una nueva. La síntesis es en dirección 5´- 3´y la hebra molde se
lee en sentido 3´- 5´
RESUMEN DE LA REPLICACIÓN:
-la helicasa va a abrir la dible hebra.
-La primasa sintetiza el primer, hecho de RNA, su funcion es entregar el OH libre para que la polimerasa añada el 1er
nucleótido.
-Una vez abierta la doble hebra se unen inmediatamente proteínas estabilizdoras de hebra simple (SSBP).
-La polimerasa con su actividad exonucleasa remueve los primer de RNA y con su actividad polimerasa introduce los
nucleótidos de DNA correspondientes en los espacios
-La DNA ligasa une los fragmentos de DNA sueltos
ETAPAS DE LA REPLICACIÓN
INICIACIÓN
-ORIGEN DE LA REPLICACIÓN: es el lugar del Dna donde existe una secuencia específica donde se inicia la primera
separación de la hebra.
-En bacterias se desubrio una secuencia con:
3 repeticiones de 13 pares de bases
Origen de replicación
4 repeticiones de 9 pares de bases
-Existen proteínas como la DNAa (que usan atp) que es unen al sector donde etan las 4 rep de
9 pdb, y producen un lazo que genera la energía necesaria para abrir la doble hebra
-Inmediatamente se une la helicasa para separar las hebras.
ELONGACIÓN
-Se abre la doble héloce, se pone un primer primer y se comienza la sintesis de DNA.
-La polimerasa desplaza alas SSBP mientras se va moviendo
-La girasa o topisomerasa se encarga de ir liberando la tención en la hebra para que la
helicasa las separa, haciendo cortes.
TERMINACIÓN:
-La polimerasa degrada los primer,
sintetiza el DNA en su lugar y la ligasa
sella los nicks
- La ligasa adenila a uno de los extremos
(donde esta el fosfato) (adenilar es
ponerle un grupo fosfato unido a una
ribosa y adenina o AMP), para activar al
fostfato al que se le unió, este fosfato
activado se une al otro extremo, sale el
foscafo con su riboda y adenida y el nick
queda sellado.
¿De donde sale ese AMP? La enzima lo capta y lo une a un resudio de aaen el grupo amino libre (autoadenilazión)
TIPOS DE ARN
RNAm : transfiere la información que está en los genes para sintetizar porteínas Los tres participan
RNAt : encargado de leer el mensaje y poner a los aa correspondientes en la
RNAr : lugar donde ocurre la sínteis proteíca TRADUCCIÓN
SINTESIS DE RNA DEPENDIENTE DE ADN: RNA POLIMERASA
-La enzima encargada es la RNA polimersasa (analoga de la primasa)
-Genrea nucleótidos en RNA a partir de un molde de DNA
-Se lee de 3’ a 5’ y se sintetiza de 5’ a 3’ (igual que ADN)
-El sitio actico de la RNA polimerasa es muy parecido al de la ADN polimerasa
-NO HAY PROOFREADING (el RNA no es tan importante de corregir como el DNA)
-Posee solo un sitio activo (el DNA tiene 2)
-Siempre va a leer en direccion 3’ 5’
INICIACIÓN DE LA TRANSCRIPCIÓN
-Todo referente a procesamiento ocurre en el núcleo, los pre-RNA nunca salen asi de ahí.
-La RNA polimerasa abre una burbuja
-El lugar que reconoce la RNA polimerasa y comienza la sintesis se llama SITIO PROMOTOR (es una secuenca espefíca)
-En los procarioentes, es encontro que existe una secuencia denominada CAJA TATA (secuencia de TATAAA)
-Los factores de transcripción la reconocen y luego la sintesis comienza en el nucleótido +1 (el nucleotido de atrás es el
-1)
-Los factores de transcripción le dicen a la polimeraza donde unirse
-En eucariontes existe un PROMOTOR MÍNIMO, donde estaria el equivalente al promotor del procariontes. Tambien
existe una zona llamada ELEMENTOS PROXIMALES, que se ubican alrededor de 200 nucleíotidos maa atrás del
nucleotido +1 y ayuda a localizar a la RNA polimeraza. Y existe otro complejo conocido como ELEMENTOS DISTALES que
pueden ubicarsa hata + de 1000 bases atrás del nucleotido +1, pero gracias al plegamiento que subre el DNA ayudado
por los factores de transcripción, el ENHANCER (elementos distales) queda en el sitio promotor y ayuda a estabilzarlo.
-Si el enhancer no está la transcripcion ocurre igual pero en menor intensidad
-Volviendo con los procariontes, en torno a la region -10 se encuentra la caja TATA
-En cuanto a la prioridadm si el intron no tiene adenida, se usa la guanina del esplieceosoma
-En el mecanismo del grupo I, la guanosina ataca con su OH del C3, mientras que en el grupo II, como la adenina esta en
el intron, el ataque lo hace con su OH del C2, porque el del C2 está ocupado.
-Antes se creía que 1 gen iba a codificar para 1 proteína. Pero ahora se sabe que existe el splicin alternativo, es decir, se
eliminan selectivamente exones y una sola secuencia de DNA puede generar distintos RNAm, por lo tanto, un gen puede
generar distintas proteínas.
EJEMPLO: en un mismo gen (gen de la calcitonina) puede codificar para distintas proteínas DEPENDIENDO DEL TEJIDO
EN EL QUE SE REALICE LA TRADUCCIÓN. En un experimento en ratones la calcitonina en la tiroides codificaba para
calcitonina, y en el cerebro para CGRP.
TRADUCCIÓN
-El ribosoma traduce una secuencia de codones (tripletes) a un aa
-Existe un codon de partida: AUG, que codifica para METIONINA. Entonces, en la sintesis el primer aa de una proteína es
metionina (pero no necesariamente el péptido maduro)
-Tambíen existen codones de termino, donde se desensambla y se detiene la traducción
codón de inicio: AUG (metionina)
codones de termino: UAA (tirosina)
UAG (tirosina)
UGA (cisteína)
Partes de la traducción
1. ACTIVACIÓN DEL AA: el aa se une al tRNA
2. INICIACION
3. ELONGACIÓN Solo estos 3 pasos ocurren en el ribosoma
4. TERMINACIÓN
5. PLEGAMIENTO Y PROCESAMIENTO POST-TRADUCCIONAL
-El RNAm debe poseer en algun pundo un codon de inicio (AUG) y alguno d elos 3 codones de termino, y todo lo que
esté entre medio será traducido.
INICIACIÓN:
-Es la union de los componentes al RNA y el ensamblaje sobre el codon de inicio
-Los factores de iniciacion 1 y 3 se unen al 5’ del RNA, en una zona cercana a la secuencia de incio que le señalan a la sub
unidad manor donde unirse. Al unirse, la zona P queda sobre el codon de inicio
-Con ayuda de los factores de inciciacion 2, entra el tRNA que codifica para metionina
-Entra la sub unidad mayor sobre el codon de inicio y se forman los 3 sitios (EPA)
-Los sitios P y A están constiturídos principalmente por la sub unidad menor y el sitio E por la mayor. Y una ves
ensamblado todo, se liberan los factores de iniciacion
y se termina la INICIACION.
SECUENCA DE SHINE-DERLGARNO
(fue descubirta en bacterias)
-Es una secuencia de RNAm que es el sitio de union
del ribosoma, ubicado 8 bases mas arriba del codon
de inicio
-La sub unidad menor se aparea con la secuencia de
shine-delgarno
ELONGACIÓN:
-Parte con la entrada del 2do aa
cargado con el tRNA. Participan
factores.
-Los dos aminoácidos se unen entre si
con un enlace peptídico: el extremo
amino hace un ataque el extremo
carboxilo y queda todo unido en el
tRNA del sitio A. El tRNA del sitio P
queda sin carga
-Se mueve el 1er tRNA al sitio E y el 2do
tRNA se mueve al sitio P, luego entra otro
tRNA al sitio A.
TERMINACIÓN:
-El RNA ribosomal se topa con el codon de stop, y es reconocido por factores de liberacion. Se genera el corte de la
cadena peptídica en crecimiento y el desensamble de todos los componentes.
-Existen antibióticos como la puromicina que interrumpen la formación de la proteína, acttúa como un factor de
liberación canticipada. Entra al sitio A y se une al peptido en crecimiento
-Los ribosomas no son iguales en bacterias y en eucariontes, las subunidades son de distinto tamaño al igual que los
factores usados (en eucariontes es mas complicado)
-En procariontes la TRANSCRIPCION es simultánea a la TRADUCCIÓN (porque no hay nucleo)
• El tRNA es el encargado de hacer la traducción del leguaje de bases que trae el RNA mensajero y unirse al
codón que corresponde al aa que los codifica.
• Crick dedujo que debe existir una molécula que haga de “adaptador”: una enzima que pueda leer tanto el
lenguaje de RNA como DNA.
Breve repaso:
despues de que se transcribe el RNAm, en procariontes el mensajero realiza simultáneamente la traduccion,
pero en eucariontes el mRNA debe madurar para poder salir del núcleo y
realizar la traducción. Y la molécula adaptadora es el tRNA o RNA de
transferencia.
• En las clases anteriores nos centramos en la traducción propiamente tal (iniciación, elongación y
terminación). Pero existe una etapa previa llamada activación del tRNA.
• basicamente es poner el aa en el tRNA que le corresponde, tambien llamada sintesis de aminoacil tRNA,
que son los que se unen en el sitio A.
Paso 1: el extremo carboxilo del aa atacando al fosfato alfa Paso 2: el OH 3’ del tRNA ataca a carbono el aa y
del ATP, liberando a los 2 fosfatos restantes (Pi) y quedando libera al AMP, quedando unido con un enlace
unido como AMP. covalente.
• Todo este proceso, como ya habiamos mencionado, ocurren dentro de la enzima, porque hay
intermediarios que estan dentro de la enzima que estabilizan.
• El aa adenilado siempre esta dentro de la enzima, unido, no esta libre, y no se suelta de la enzima
hasta que se complete la reacción.
• El sitio activo reconoce tanto el aa como el tRNA específico (solo para recordar)
• Si hay al menos 20 aa, tienen que haber al menos 20 aminoacil tRNA sintetasa.
• Los aminoácidos son los ladrillos con los que se construyen todas las proteínas.
• Toda proteína posee la misma estructura fundamental: aminoácido.
• Un carbono quiral unido a un grupo amino (en la foto el aminoácido está a pH
fisiológico), un hidrógeno, un grupo carboxílico y una cadera radical que es variable según
el aminoácido.
• Este carbono al ser quiral puede ordenarse de distintas maneras espacialmente, es por
eso por lo que se dice que son isómeros.
ISOMERÍA
• Existen dos tipos de isomería:
ISOMERIA ESTRUCTURAL: son compuestos químicos diferentes con la misma fórmula general, pero con
distinta estructura
ISOMERIA ESPACIAL: la diferencia está en la distribución espacial de los grupos. (cis y trans, isómeros ópticos
o estereoisómero)
ISOMERÍA OPTICA
• Se descubrió, en el ejemplo de la
foto, que si el grupo 3 estuviera
abajo no era lo mismo que si
estuviera arriba.
• En este caso la formula estructural
será la misma al igual que sus
enlaces, pero su disposición espacial
no lo es, y podemos comprobarlo al
intentar superponer una molécula sobre la otra, nunca van a calzar.
• Esto se debe a una propiedad fisica que tienen las moléculas. Hacian pasar luz polarizada sobre la molécula
y ésta molécula desviaba la luz en un sentido, pero si se hacia lo mismo con la otra molécula (su isómero)
la luz se desviaba hacia el otro lado.
Tipos de isómeros ópticos:
DEXTRÓGIRO: es la molécula que desvía la luz en el sentido horario: R R: rectum (derecha)
(latín)
LEVÓGIRO: es el isómero que desvía la luz en el sentido antihorario: S S: sinister (izquierda)
ENANTIOMEROS
Los enantiomeros se generan en carbonnos que tienen 4 grupos
distintos y generan imágenes especulares.
Si ponemos un espejo (linea celeste) se ven iguales pero no se
pueden superponer.
• La mayoria de los aa son de serie L (levógiro), solo algunos son D, casi siempre son excepciones.
• Si uno habla de que un aa cargado, es porque su grupo radical esta cargada, ya sea positiva, neutra o polar.
• Todas estas clasificaciones se hacen en base al pH fisiológico (7)
• La cadena latera le entrega las propiedades a las distintos aminoácidos
GRUPO R NO POLAR Y ALIFÁTICO
• Lo componen:
GLICINA
ALANINA
PROLINA: es una cadena especial, esta unida
VALINA
LEUCINA
ISOLEUCINA
METIONINA: contiene un azufre en su cadena (no es
terminal)
*son insolubles*
GRUPO R AROMÁTICOS
• Lo componen:
FENILALANINA
TIROSINA
TRIPTÓFANO
• Son insolubles en agua.
• Lo componen:
SERINA
TREONINA
CISTEÍNA
ASPARIGINA
GLUTAMINA
• La cadena lateral no tiene carga pero posee grupos polares que son solubles
en agua, en forma de OH, O o SH
GRUPO R CON CARGA POSITIVA
• Lo componen:
LISINA
ARGININA
HISTIDINA
• La histidina sale no cargada porque a pH fisiológico solto el protón,
pero si se baja un poquito adquiere carga negativa.
• Lo componen:
ASPARTATO
GLUTAMATO
PEPTIDOS Y PROTEÍNAS
• Cuando los aa se unen se forman los péptidos o proteínas
• Los péptidos se nombran de AMINO a CARBOXILO, el
carboxilo de un aa se une al amino del otro (en amarillo) a
través de un enlace peptídico
• En los extremos queda en un lado un grupo amino libre, y
se llama EXTREMO AMINO TERMINAL. Y en el otro extremo el
grupo carboxilo queda libre y se llama EXTREMO CARBOXILO
TERMINIAL
• Los péptidos se pueden escribir según sus abreviaciones, y el orden del nombre es desde el grupo amino al
carboxilo. Este orden tiene un sentido biológico, porque cuando se sintetiza el RNA mensajero queda en
dirección 5’ – 3’ entonces cuando se traduce a proteína esta queda en dirección amino-carboxilo
ENLACE PEPTÍDICO
ESTRUCTURA PRIMARIA
• Se nombra de amino (porque ese aa tiene el grupo alfa amino libre) a carboxilo (porque ese aa tiene su
grupo carboxilo libre).
¿Como se descubrió la estructura primaria?: Frederick Sanger secuenció la primera estructura de una
proteína (insulina de bovino), lo hizo mediante métodos químicos. Actualmente estos métodos están
automatizados, muchas veces no se secuencia la proteína, se secuencia el DNA y se hace la traducción para
conocer la secuencia. Fred después intentó secuenciar el DNA, y creo un método de secuenciación que
también se utiliza actualmente para la secuenciación de DNA.
• Esta dada por la condensación entre un grupo amino y el grupo carboxilo del otro aa. Este enlace peptídico
bloquea al grupo amino y deja como cetona al grupo carboxilo.
• Químicamente hablando este grupo formado se llama AMIDA.
• En el grupo carboxilo, la carga negativa del oxígeno está desplazada entre los dos oxígenos, porque es su
forma de estabilizar el enlace químico, formando una estructura resonante. Esto casi siempre sucede
cuando hay enlaces dobles o simples alternados (como en
los anillos aromáticos) o cuando hay un enlace doble,
seguido de uno simple y un átomo que tenga electrones no
apareados, como es en le caso del N. Entonces, en el enlace
peptídico, la densidad de carga eléctrica negativa se va a
estabilizar en todo ese sector, generando una nube de
electrones (enlace semidoble). Este tipo de enlaces le
entrega una PLANARIDAD al enlace (los enlaces simples se
pueden girar pero los dobles no)
• Es por eso por lo que se dice que el enlace peptídico es
PLANAR. geométricamente, 3 puntos generan un plano, en
este caso conformados por el oxígeno, carbono y nitrógeno. Y por la geometría de los enlaces se genera
que este enlace genera plano, rodeado por enlaces de libre rotación.
• Lo que va a buscar la cadena con estos enlaces de libre rotación es la
estabilidad, disminuyendo el efecto estérico (alejar a los grupos
voluminosos, ya que tenderían a repelerse por sus nubes de
electrones). En este caso los grupos potencialmente mas voluminosos
son los grupos R.
¿Por qué se produce la unión del nitrógeno con el carbono y no con el oxígeno o con el otro carbono? El
carbono es más reactivo que el otro, porque al estar unido a dos oxígenos, los electrones del carbono están
más cerca de los oxígenos, por eso, el carbono tiene una densidad de carga menor a la de los oxígenos, se dice
que el carbono es DELTA POSITIVO, y los electrones del nitrógeno son atraídos por el carbono.
• Después de que se forma el enlace covalente, solo dos enlaces que están a los lados del enlace peptídico
quedarán con una rotación. Entonces la estructura queda con una seria de planos conectados por enlaces
que pueden rotar.
VUELTAS Y LAZOS
• Son parte de las estructuras secundarias, y son para unir laminas o hélices.
• La vuelta clasica está formada por 4 aa en donde se forma un puente de H que
estabiliza la vuelta entre el aa 1 y 4.
• Existen dos tupos de esta vuelta “clásica”: de tipo I
y II. Ambas formadas por 4 aa, unidas por puentes
de hidrógenos que estabilizan la vuelta entre los aa
1 y 4. La única diferencia estructural entre el tipo I
y II, es que en la de tipo II tiene una glicina en su
posición 3.
• Las vueltas son ricas en prolina, pero en su isómero
cis genera una curvatura por sí misma ayudando a
la curvatura de la vuelta. Mientras que el isómero
trans no lo posee.
• Otro tipo de unión entre las estructura secundarias son los loops o lazos. Estas son
uniones mas largas que las vueltas y son de estructura variable y generalmente son
movibles.
ESTRUCTURA TERCIARIA
• Es la conformación más estable de una proteína. Si no alcanza la
estructura terciaria, esta no cumple su función.
• Hay distintas fuerzas que estabilizan la estructura terciaria:
-enlaces débiles: enlaces de hidrógeno, interacciones iónicas y fuerzas
hidrofóbicas.
-enlaces covalentes: puentes disulfuro.
• Las estructuras terciarias se clasifican en globulares (es más redondita y
ningún eje es predominante) y fibrilares (un eje predomina por sobre los
otros).
Proteínas fibrilares: son de forma alargada, tienen una función
estructural, es una secuencia repetitiva de aa, es muy durable
(resistente), son comunes en proteínas insolubles (colágeno,
queratina, miosina, elastina etc.) Son menos sensibles a cambios de
pH, temperatura, etc.
Proteínas globulares: son de forma redonda o esférica. Tiene un
propósito funcional, están formadas por una secuencia irregular de
aa. Son mas sensibles a cambios de pH o temperatura. Son
generalmente solubles en agua y algunos ejemplos de estas son las
enzimas, hemoglobina, insulina, inmunoglobulina.
• Es una alfa hélice, que se une con otras y forman estructuras mas grandes hasta la fibrilla de queratina
EJEMPLO PROTEÍNAS GLOBULARES
MIOGLOBINA
DOMINIOS
ESTRUTURA CUATERNARIA
• Son interacciones entre dos o más subunidades (solo
proteínas con mas de una subunidad pueden tener
estructura cuaternaria).
• Pueden unirse subunidades idénticas, o distintas
• Se unen a través de superficies de interacciones, son todas
interacciones débiles (no se forman enlaces covalentes
entre las subunidades)
• Las cápside de virus son ejemplos de estructuras
cuaternarias.
• La secuencia de aa de una proteína determina su estructura tridimensional.
¿Cómo se sabe eso? Porque existen proteínas (como la ribonucleasa de bovino), que
al desaturar la proteína (se rompen los puentes disulfuro con mercaptoteanol más
elementos desnaturantes que rompen los elementos débiles). Ahora, si sacamos los
elementos que rompieron a la proteínas y solo queda la ribonucleasa en la solución,
ésta vuelve a su organización nativa, y vuelve a ser totalmente funcional. Solo
necesita agüita para que vuelva a su forma nativa. PERO LA MAYORIA DE LAS
PROTEÍNAS POR SI MISMAS NO PUEDEN HACERLO, ESTA ES UNA EXCEPCIÓN.
FUNCIONES DE LAS PROTEÍNAS
(HEMOGLOBINA)
• Es la encargada de cumplir las funciones de transporte de
oxígeno (presente en los eritrocitos).
• Es una estructura cuaternaria que posee como grupo
prostético el grupo HEME. El oxígeno posee una afinidad química por este
grupo.
• Los cuatro polipéptidos están distribuidos en
dos cadenas alfa y dos cadenas beta, por eso se
dice que es alfa 2 – beta 2. Y cada polipéptido
tiene un grupo Heme.
• El grupo heme es un sistema de anillos que
coordina el hierro, sin hierro se llama
protoporfirina 9.
• El hierro (Fe+2) se coordina hasta con 6
elementos distintos, pero dentro del grupo
heme ya tiene 4 enlaces ocupadas con nitrógeno, y le quedan otros dos
enlaces perpendiculares al anillo, uno para unir oxígeno, y en el otro se
una a una histidina para poder fijar el grupo en la cadena polipeptídica.
• La mioglobina es como un monómero de la hemoglobina (solo en
términos estructurales). Y nos sirve para estudiar el comportamiento de la
hemoglobina. Los jefes de Crick trabajaban con cristales de mioglobina
(como dato).
• Cuando el grupo Heme se une al oxígeno se producen pequeños cambios
conformacionales en la hemoglobina.
• Esta transición va
pasando a medida que se
unen los oxígenos.
En otras palabras, los grupos
Heme al unirse al oxígeno pasan de un sitio de baja afinidad a uno de alta afinidad. Y la
unión del ligando de un sitio afecta positivamente al otro.
1) MONOSACÁRIDOS (CH2O)n n = de 3 a 7:
a) Según grupo funcional:
-Aldosas: Grupo aldehído
-Cetosas: Grupo cetona
b) Según número de carbonos:
-Triosas: 3 carbonos Ejemplos: Aldotriosa (aldosa con 3 c),
-Tetrosas: 4 carbonos cetotriosa (cetosa con 3 c), aldohexosa
-Pentosas: 5 carbonos (aldosa con 6 c), cetohexosa (cetosa con
-Hexosas: 6 carbonos 6 c).
-Heptosas: 7 carbonos
c) Estereoisómeros:
-Los estereoisómeros son isómeros que solo difieren en la distribución
espacial de sus átomos. Los enantiómeros son casos de estereoisómeros que son imágenes
especulares. Fisher creó una nomenclatura para nombrar a los
enantiómeros basado en el gliceraldehido: D si el OH está a la
derecha y L si el OH está a la izquierda. Esta estructura guiará la
nomenclatura de los otros azúcares.
*Los azúcares más comunes en la naturaleza son de la serie D.
-Para nombrar cadenas más largas hay que fijarse en el carbono
que está más cerca (antes) del extremo terminal (CH2OH). En ese
carbono, si el OH está a la izquierda es L y si está a la derecha es D.
En la realidad, al ciclarse no forma un pentágono o hexágono como tal, sino que buscan
la manera de obtener más estabilidad, alejando más sus grupos voluminosos. Para esto
forman la conformación “silla”. Hay dos formas posibles de silla. Existe una
conformación intermedia llamada “bote”, donde las 2 puntas quedan hacia arriba.
Monosacáridos modificados:
Monosacáridos a los que se les agregan otros grupos funcionales: Aminoazúcares, glucosa-fosfato, N- acetilmurámico, etc.
2) DISACÁRIDOS:
Formados por 2 monosacáridos que se unen mediante enlace glicosídico. Es
semejante a un enlace éter (alcohol + alcohol = éter + agua) pero de los 2 OH que
participan, uno siempre pertenece a un carbono anomérico.
Los electrones del oxígeno del alcohol (OH) del monosacárido que se va a unir
atacan al carbono anomérico (hemiacetal) del otro monosacárido. Se libera el OH
del carbono anomérico y el H del oxígeno que ataca, liberándose una molécula de
agua. Es una reacción de condensación. El hemiacetal pasa a ser un acetal.
Para romper el enlace glicosídico se debe agregar una molécula de agua
(hidrólisis).
Generalmente reacciona el carbono anomérico de un monosacárido con el
carbono 4 de otro. Pero puede pasar que reaccionen 2 carbonos anoméricos. En
este caso se pueden diferenciar debido a que la presencia de un carbono
anomérico libre les da la propiedad de ser “azúcares reductores”
Si el enlace glicosídico se forma entre los dos carbonos anoméricos, el disacárido sería “no
reductor”, ya que ambos monosacáridos pierden la capacidad de pasar a la forma abierta.
Otra forma de que los azúcares pierdan su capacidad reductora es que se modifiquen
químicamente. Por ejemplo, el OH del carbono anomérico podría metilarse (unirse a un
metilo), y al abrirse no se generaría el grupo aldehído.
3) POLISACÁRIDOS:
Formados por uniones de más de 10 monosacáridos. Pueden ser lineales o ramificados.
Además, pueden ser homopolisacáridos (formado por el mismo tipo de monosacárido) o
heteropolisacáridos (formados por distintos monosacáridos).
Algunos ejemplos son:
1) Glicógeno: Forma en que se almacena la glucosa en los animales. Homopolisacárido (formado solo por glucosa) ramificado.
2) Almidón: Equivalente del glicógeno en plantas. Almacenamiento de glucosa (energía). Formado por amilosa:
Homopolisacárido (glucosa) lineal y amilopectina: Homopolisacárido (glucosa) ramificado.
3) Celulosa: Almacenamiento de glucosa con función estructural en plantas. Homopolisacárido (glucosa) no ramificado.
*La celulosa está formada por beta-glucosa a diferencia del almidón y glicógeno que están formados por alfa glucosa. Indica que
están formados por anómeros distintos. Las enzimas que los forman son capaces de notar las diferencias entre los anómeros.
* La amilopectina tiene ramificaciones cada 20
monómeros y el glicógeno cada 10 monómeros. Esto
hace al glicógeno más denso.
Metabolismo: Serie de vías metabólicas (transformaciones químicas de distintos compuestos), en las cuales participan las
enzimas. En general, el metabolismo se divide en:
Reacciones catabólicas → Degradación de moléculas grandes a moléculas más pequeñas. Se relacionan con la síntesis de ATP.
Reacciones anabólicas → Síntesis. Uso de energía para sintetizar moléculas más grandes.
Las vías metabólicas son una serie sucesiva de reacciones químicas, que van desde un sustrato inicial a un producto y cada
reacción está catalizada por enzimas distintas.
En general, la primera enzima de la vía es la enzima regulada que es capaz de activar o inhibir la vía. Si el producto es escaso, se
activa, pero si hay exceso del producto, éste funciona como inhibidor de la enzima, inhibiéndose la vía.
Sustrato = reactante
El equilibrio entre S y P
refleja la diferencia en
energía libre de sus estados
basales. En la figura, la
energía libre del estado basal
de P es inferior a la de S, por
lo que Δ G0 de la reacción es
negativo y el equilibrio
favorece a P. La posición y la
dirección de este equilibrio
no están afectadas por
ningún catalizador. Si Δ G es
positivo, significa que el nivel de energía de los productos es mayor que el de
los sustratos y, por lo tanto, la reacción debe absorber energía. Si la reacción
absorbe energía es endergónica, y el ΔG es positivo. Si la reacción libera
energía es exergónica y tiene un ΔG negativo.
Estado de transición:
-Punto intermedio en la transformación de sustratos a productos. Punto más alto de energía de la reacción química, debido a
que es el punto más inestable. Se conoce como energía de activación: Barrera de energía que los sustratos deben vencer para
transformarse en productos. La diferencia entre los niveles de energía del estado basal y del estado de transición se
denomina energía de activación.
-La energía del estado de transición o la “altura de la barrera” NO afecta el Δ G, ya que no afecta en la energía libre de los
sustratos y productos.
-La energía del estado de transición afecta en la velocidad de la reacción. Si la
barrera es más baja será más fácil y más rápido que se produzca la reacción.
-La función de las enzimas es estabilizar el estado de transición y con ello
disminuye la energía de activación, acelerando la reacción.
-El sitio activo de las enzimas está diseñado para interactuar con el estado de
transición y al formarse la unión, lo estabiliza.
Catálisis:
Es descrita como la estabilización del estado de transición a través de la unión
al catalizador.
Eduard Buchner descubrió que los extractos de levadura podían fermentar azúcar a alcohol, probando que la fermentación era
promovida por moléculas que continuaban funcionando cuando se removían de las células. No se necesitaba toda la levadura
sino sólo las “enzimas”. Aún no se les conocía como tal, pero a los extractos con
capacidad de producir la fermentación les llamó enzimas.
En esta imagen se entra más en detalle. Se muestra el sustrato solo, luego el punto
en que la enzima está unida al sustrato (ES). Después el sustrato se transforma en
producto (siempre unido a la enzima) y muestra el punto donde el sustrato está
unido a la enzima (EP) y luego la enzima se libera. La energía de activación de la
reacción catalizada es el estado de transición entre ES (enzima unida al sustrato) y EP
(enzima unida al producto).
*En la práctica, lo que encaja perfecto es el punto en que el sustrato se está transformando en producto (complejo activado).
Sin embargo, estos modelos son anteriores a ese conocimiento.
*Las uniones enzima-sustrato son mediante interacciones de todo tipo: enlaces iónicos, puentes de hidrógeno, etc.
Cinética enzimática
Estudia la velocidad de las reacciones catalizadas por enzimas.
-Cuando la reacción comienza a ocurrir, la concentración de los productos empieza a
aumentar y la concentración de sustratos empieza a disminuir.
-Si representamos la aparición de producto, o la desaparición de sustrato en función del
tiempo se obtiene la curva de velocidad de la reacción, o cinética de la reacción.
*La velocidad no es constante, y tiende a cero en el equilibrio. En general, se usa la
primera pendiente, en los tiempo iniciales, conocida como velocidad inicial.
*A medida que se forma el producto, como las reacciones son reversibles, comienzan a
reaccionar en sentido inverso, es decir, habrá productos que se estarán transformando
en sustrato y por esto disminuye la velocidad de la reacción.
Cuando se alcanza el equilibrio en la reacción es porque la velocidad de formación de
sustrato a producto es igual que la velocidad de transformación del producto a sustrato.
*Esta ecuación incluye EP, solo que se reduce o abrevia de esta forma.
Se puede desglosar en 2 reacciones:
K= constantes de velocidad que gobiernan la reacción. → k1: velocidad de formación complejo ES y k-1: velocidad de la ruptura
del complejo ES.
→ k2: Velocidad en que el complejo ES se transforma en producto y k-2: velocidad en que el producto se transforma en ES.
Luego de obtener varios puntos (repetir el paso anterior varias veces) se obtiene
el grafico Vi vs [S]:
-Existe otro tipo de enzimas, llamadas enzimas alostéricas, donde la enzima actúa
distinto a la normal: A diferencia de la normal que parte con su velocidad máxima y
después va disminuyendo, las enzimas alostéricas primero parten lento y después que
empieza a funcionar aumenta la velocidad hasta el punto máximo. La forma de la curva
es similar a la unión de la hemoglobina al oxígeno. Un sitio activo es afectado por el
funcionamiento de los otros (cooperatividad).
Cinética de enzimas “normales” → NO alostéricas
Ecuación de Michaelis y Menten
*Estos parámetros se usan para comparar la afinidad que tiene una enzima por
distintos sustratos.
*NO se puede comparar estos valores para enzimas diferentes.
Entonces, la ecuación
queda:
y = m x + n
m= pendiente
n=intersección con eje Y
La actividad enzimática depende del pH
Cuando se grafica V0 vs pH se obtiene una curva con forma de campana,
donde hay un rango de pH donde la enzima es funcional.
Por ejemplo, la glucosa-6-fosfatasa tiene un rango de pH óptimo
cercano a 8.
*pH óptimo: pH al que la enzima alcanza la máxima velocidad. Las
enzimas por lo general trabajan en un rango cercano al pH óptimo.
También se puede considerar un pH crítico, ya que cualquier variación
en el pH, ya sea aumento o disminución, hace que la velocidad baje.
-El principal efecto del pH es su acción sobre los grupos protonados y no
protonados. Al cambiarse la carga, cambiará la estructura y funcionamiento de las enzimas.
Inhibidores de enzimas
1) Inhibidor competitivo: Se une al sitio activo del sustrato
2) Inhibidor no competitivo: No se unen al sitio activo, pero al unirse afectan el funcionamiento de la enzima asociada al
sustrato.
-La inhibición competitiva y no competitiva se pueden distinguir por su efecto en la cinética enzimática:
1) En presencia del inhibidor competitivo, varía el Km (aumenta), pero Vmax se Inhibidor competitivo
mantiene constante. Esto pasa porque con inhibidor competitivo la afinidad disminuye y
por eso Km aumenta. La Vmax se mantiene constante porque a grandes
concentraciones de sustrato, el sustrato va a desplazar al inhibidor.
Inhibidor no competitivo
ESPECTROFOTOMETRÍA
La Luz blanca está compuesta de ondas de diversas
frecuencias. Cuando un rayo de luz blanca pasa por un
prisma se separa en sus componentes de acuerdo a la
longitud de onda.
Tramitancia → es el porcentaje de luz que atraviesa un
material, se calcula por la luz entrante y la luz que sale.
%T = I1/I0x100%
>Ecuación de Lambert-Beer
---> Es una mezcla entre la Ley de Lambert y la Ley de Beer.
• Lambert: la proporción de luz absorbida por una solución es independiente de la intensidad de luz incidente
sobre este.
• Beer: La luz absorbida es proporcional al número de moléculas por unidad de volumen.
[A = ε x c x l ]
- A: es la absorbancia de la muestra a una longitud de onda dada
- ε: es el coeficiente de extinción del compuesto a esa longitud de onda y sus unidades son (M x cm)-1.
- c: es la concentración molar de la especie que absorbe.
- l: es la longitud de paso de la celda que contiene la solución donde se realiza la medición y está dada en cm.
Consideraciones
- Con el ε y la absorbancia es usada para calcular la concentración de la
especie de solución (asumiendo que la única especie que absorbe es el
compuesto de interés).
- ε es una constante para una longitud de onda y condiciones del
compuesto determinada.
- Absorbancias mayores de 2 no son confiables porque muy poca luz está
alcanzando el detector para permitir mediciones acertadas.
>Espectrofotómetro
Peroxidasa
2H2O2 + 4 aminoantipirina + fenol Antipirilquinonimina + 4 H2O
Clase 22. Oct, 16
DNA 1
---> el paper de la estructura molecular de los ácidos nucleicos (doble hélice) apareció el 25 de abril de 1953, marcando
un antes y un después en la biología porque ahora se conocían las moléculas de la herencia y su estructura.
>Línea de tiempo
DNA 2
---> la polimerización de nucleótidos va dirigida por una secuencia conocida que la enzima va copiando, garantizando la
fidelidad de la mantención de la herencia. Ocupando una hebra molde se copia un polímero de ADN.
>Replicación
---> es semiconservativa, ya que tenemos un ADN que se separa en las dos hebras
que lo componen y sobre ese molde se van a dos hélices nuevas, ambas con una
hebra original y otra recién sintetizada.
Hay distintas polimerasas, cada una cumple funciones distintas. En el caso de la pol
III (pol C) tiene mas de 10 subunidades y tiene una actividad exonucleasa de 5’ a 3’.
- Exonucleasa 3’ a 5’: destruye pero para reparar.
- Exonucleasa 5’ a 3’: destruye ácidos nucleicos.
- DNA helicasa: separa las hebras de la doble hélice por una actividad de 3’ a 5’
- Core: actividad polimerasa, dos sitios activos, uno para cada hebra
Este proceso se da en 3 etapas:
En la glicolisis hay reacciones irreversibles y reversibles cuando la célula lo necesitase, entonces, para sintetizar glucosa
se usa ciertos componentes que quedaron de la glicolisis, pero que sirven
3 2
• El primer bypass va a ser el piruvato para
transformarlo en fosfoenol fosfato.
• El segundo bypass va a ser el paso de la
1 fructosa 1,6 bifosfato para formar fructosa
fosfato.
• El tercer bypass va a ser de glucosa 6
fosfato a glucosa.
PRIMER BYPASS: REACCION DE LA PIRUVATO QUINASA (10)
• En la glicolisis el fosfoenol piruvato a través del piruvato
quinasa se transforma en piruvato produciéndose un
ATP y un ADP por cada molécula (2 total)
Toma una molécula de carbonato (azul) que lo adiciona a este carbono al piruvato generando al oxaloacetato (producto
final ciclo Krebs y primer aceptor de acetil coenzimo A) después pepcarboxiquinasa con gasto de energía, en este caso
GTP, lo descarboxila, y queda fosforilado como fosforonol piruvato, hay una fosforilación de la molécula y una
descarboxilación,
Piruvato se transforma por la piruvato caeboxilasa que está en la matriz mitocondrial en oxaloacetato pero para salir de la
mitocondria hay una enzima que es malato desidrogenasa mitocondrial la transforma en malato y el malato es el que sale
al citosol, y una vez que está en el citosol hay una isoforma de la malato desidrogenasa en este caso citosolica que actua
en reversa y ahí transforma malato en oxaloacetato y ahí es sustrato de la pep fosfonolpiruvatocarboxiquinasa citosólica y
transforma oxloacetato en fosfonolpiruvato en el citoplasma, UNA FORMA DE HACER BAIPAS PERO PASANDO POR
MITOCONDRIA.
Caminos alternativos del Piruvato al Fosfoenolpiruvato. El camino que predomina depende del
glucogénico.
“Con lo que tengo, trato de hacer lo mejor que puedo”. Hay otra forma de hacer
este 1er by-pass, pero también hay un paso obligado por la mitocondria. Todo este
proceso sería más simple si esta PEP Carboxiquinasa Citosólica se encontrara en la
mitocondria, nos evitaríamos toda esta transformación a Malato y así sería más directo.
A esto se refiere la otra posibilidad porque, así como hay una PEP Carboxiquinasa en
el citoplasma hay otra en la mitocondria. Entonces tenemos que: el Piruvato es
transformado por la Piruvato Carboxilasa a Oxaloacetato y luego la PEP
Carboxiquinasa Mitocondrial lo transforma a PEP, y este PEP mitocondrial sí puede
salir al citoplasma.
Estas son las 2 posibilidades, una más directa en la que todo el by-pass ocurre en la
mitocondria (que sería el 2do proceso que vimos) y una más indirecta (que sería el
1er proceso visto). Hay gasto de energía en las 2 rxs.
El bypass es irreversible, ya que gasta energía y, además, su direccionalidad es fundamental para la Vía.
Este tipo de reacción que componen la ruta metabólica permiten su regulación, es decir, impiden que mientras ocurre el
glucolisis, ocurra la gluconeogénesis y viceversa, pues son reacciones antagónicas que no pueden suceder al mismo
tiempo. Entonces aquellas reacciones irreversibles permitirán controlar esta activación o desactivación de cada vía según
sean los requerimientos de la célula.
El origen del oxalacetato que se utiliza en la gluconeogénesis es indiferenciable químicamente, además todos tienen la
misma ubicación (la matriz mitocondrial). Eso quiere decir que, efectivamente, este compuesto puede provenir del ciclo
de Krebs, y es muy probable que los primeros oxalacetatos utilizados en la gluconeogénesis provinieran del ciclo del ácido
tricarboxilico, sin embargo, es contraproducente que solo provengan de allí, puesto que eso significa que este ciclo se
detendría. Por ello, es necesario que se utilice la enzima piruvato carboxilasa, quien proveerá constantemente de
oxalacetato a la gluconeogénesis sin desabastecer el ciclo de Krebs.
Gluconeogénesis
Reacciones secuenciales
Fosfoenolpiruvato sale al
citoplasma ocurren todas las
reacciones reversibles de la
glicolisis en el citoplasma.
No se ha logrado determinar cuál es el mecanismo exacto utilizado, pero se cree que es probable que ambas opciones
sucedan simultáneamente sin entorpecer una a la otra, es decir la glucosa podría:
1.-quedarse en el lumen del retículo y salir por la vía secretoria (sigue a las vesículas que expulsan proteínas de secreción)
2.- se observó que durante la gluconeogénesis había un aumento de la concentración de glucosa en el citosol, lo que
sugiere que primero abandona el retículo a través de transportadores y luego sale de la célula hasta llegar al torrente
sanguíneo.
Es muy importante que esta sea constante, ya que el órgano más dependiente de glucosa de todo el organismo es el
cerebro (neuronas), estas células son bastante estricto, sin embargo, en casos de extrema necesidad pueden degradar
cuerpos cetónicos.
Ante una disminución de la glicemia el cuerpo responde desmayándose, esto con el fin de mantener activas sólo las
funciones más vitales y optimizar el uso de glucosa.
El veía que en condiciones celulares no debería sintetizar glicógeno solo degradarlo, luego en argentina aislaron al
glicógeno sintetasa, tanto el glicógeno fosforilasa como el glicógeno sintetasa un rol central lo cumple la glucosa 1 fosfato,
esta es distinta a glucosa 6 fosfato (¿en qué? En la posición del fosfato) hay otra enzima llamada fosfoglucomutasa que
es la encargada de tomar el fosfato en posición 1 y ponerlo en posición 6, o viceversa, intercambiar glucosa 1 fosfato en 6
fosfato (¿por qué? Porque la glucosa 6-P entra en glicolisis)
El glicógeno es un homopolisacárido ramificado, solo hecho de glucosa, pero con ramas, es homo entonces posee enlaces
alfa 1-4 y alfa 1-6, pueden ser hasta de 50.000 y su función es almacenar energía tanto en CELULAS animales como
bacterias.
GRANULOS DE GLICOGENO.
un core, o núcleo central proteico, es una proteica llamada glicogenina, permite la unión
de los primeros azucares y después es un polisacárido ramificado, de puras glucosas
unidas.
Aquí en la polimerización hay una direccionalidad, el glicógeno va creciendo dejando extremos no reductores.
Alfa 1-6
Alfa 1-4
¿Qué pasa con las tres glucosas que fueron transferidas a la rama principal?,¿Qué
enzimas las degrada? La glicógeno fosforilasa y las iría cortando una a una, desde el
extremo no reductor y se liberaría glucosa 1-P.
• Ahora, esta glucosa 1 fosfato no nos sirve para la glicolisis. En este punto
entra la fosfoglucomutasa. Esta enzima transforma la glucosa 1 fosfato en
glucosa 6 fosfato
• Estos ciclos de glicógeno – glucosa son liberados al torrente sanguíneo para mantener el nivel de glucosa adecuado
en la sangre.
• Como recordatorio, para que la glucosa 6 fosfato se transforme en una glucosa libre, debe entrar al RE y ser
catalizada por la glucosa fosfatasa para sacarle el fosfato. Así puede salir del retículo y de la misma célula a través
del GLUT.
Los lípidos son compuestos orgánicos de origen biológico, son fundamentales para la
estructura y función de la célula, tienen una propiedad en común, son insolubles en agua,
pero solubles en solventes orgánicos (benceno, cloroformo, metanol) y su estructura
(como en la figura) es hidrocarbonada, los une muchos carbonos, esta cadena
hidrocarbonada hace que los lípidos sean insolubles.
1) En almacenamiento energético veremos los compuestos que forman las grasas y los aceites:
Los lípidos que sirven para almacenamiento energético derivan de compuestos, los ácidos grasos,
estos son ácidos carboxílicos, con cadenas hidrocarbonadas unidas a un grupo funcional (a un
grupo carboxílico).
Esta es la forma de un ácido graso, super importante para otras moléculas, compuesto por un
grupo carboxilo y una cadena hidrocarbonada, esta cadena puede contener desde 4 hasta 36
átomos de carbonos, pero en general en la naturaleza se da mayoritariamente entre 12 y 22
carbonos.
Este doble enlace produce una torsión en esta cadena hidrocarbonada y cambia
la estructura espacial del ácido graso.
En cambio, los ácidos grasos insaturados como el Ácido oleico, ac. linoleico, se encuentran en la mayoría de las grasas
vegetales (no como los saturados que son de origen animal), debido a esta torsión su estructura es liquida (se asocia más
a los aceites vegetales) esos son alimentos ricos en grasas insaturadas, son más bien líquidos a T° ambiente.
La aparición de estos dobles enlaces en los aceites los hace más susceptibles a que estos se ranceen (es un efecto, si el
aceite está mucho tiempo abierto, o expuesto al sol, se ponen con olor desagradable)
-Ácido graso monoinsaturado: un doble enlace. -Ácido graso polinsaturado: 2 o más dobles enlaces.
• Es importante conocer el nombre de estos ácidos grasos, ya que la algunos de ellos tienen importancia bilógica en
ciertas enfermedades, por ejemplo, en rumiantes, donde puede ocurrir un aumento de concentraciones en distintas
condiciones fisiológicas que afectan al individuo.
• Configuración cis: El isómero cis- posee los dos hidrógenos hacia el mismo lado de la cadena.
La mayoría de los ácidos grasos naturales están en configuración cis-.
• Configuración trans: El isómero trans- posee dos hidrógenos que se encuentran alternados.
De forma natural estos ácidos grasos se pueden encontrar en derivados lácteos, pues son
producidos en el tracto intestinal de los rumiantes. Sin embargo, principalmente los ácidos grasos trans proviene de
procesos químicas producidas en la industria alimentaria.
El propósito de crearlos artificialmente es mejorar las propiedades de estabilización térmica de la mantequilla (esta se
derrite a temperatura ambiente), entonces por medio de reacciones químicas llamada OXIGENACION PARCIAL se
buscó esta estabilidad pasando los ácidos grasos cis a trans, creando la margarina (la margarina es más temperatura
ambiente).
Los ácidos grasos trans son más estables porque tienen una conformación más lineal, semejante a los ácidos grasos
saturados. Eso provoca que aumenten su punto de fusión (temperatura en que una sustancia pasa de estado sólido a
liquido).
Cuando se empezó a comercializar la margarina esta generó problemas en la salud de las personas (colesterol alto,
problemas cardiacos), debido a que los ácidos grasos trans son muy similares a los ácidos grasos saturados.
La OMS recomienda eliminar el consumo de grasas trans industriales o limitarlos tanto como sea posible.
El aumento del 2% de la energía diaria con ácidos grasos trans (AGT)se relaciona con su aumento del 23% de riesgos
cardiovasculares. (es decir, un aumento en el consumo de AGT, significó un aumento en las enfermedades
cardiovasculares)
Los ácidos grasos trans modifican el perfil lipídico negativamente, aumentando los niveles del colesterol LDL (colesterol
malo) este puede genera placas de ateromas, es decir cuando los ácidos grasos se localizan en las venas y arterias
provocando enfermedades cardiovasculares, como infartos.
Además, el consumo de AGT se relaciona con la disminución de colesterol HDL (colesterol bueno, el cual lleva el colesterol
de los tejidos al hígado y los elimina).
Al tener una estructura lineal los ácidos grasos saturados pueden empaquetarse fuertemente provocando
que tenga una estructura sólida (como mantequilla), pues su punto de fusión es alto. Se ordenan por
interacciones hidrofóbicas, interacción que se produce entre estos tipos de ácidos grasos.
Las grasas que tienen mucho ácido graso saturados también están relacionados a estos efectos
mas dañinos a la salud, reconocible en alimentos, ya que en el mismo espacio hay muchas
moléculas de ácidos grasos, entonces hay mucho aporte calórico.
1° nomenclatura:
En este caso hay una insaturación, también tiene 16 átomos de carbono por lo que es
16:1 pero además podemos especificar la posición del doble enlace. Por lo que se cuenta,
también desde el carboxilo, sería 16:1 (Δ9).
2° nomenclatura:
A medida que
aumenta la longitud
de carbonos aumenta
el punto de fusión
Ácidos grasos ósea el paso de sólido
saturados: sin a líquido.
doble enlace.
Ácidos grasos
insaturados: con
doble enlace.
• Tenemos el ácido araquidónico, es uno de los
ácidos grasos más grandes.
ω-3
ω-6 polinsaturados
ω-9 monoinsaturados
• El proceso de hidrogenacion parcial tambien se puede producir cuando uno realiza frituras. Porque los aceites pasan
de una configuración cis (buena) a una trans (mala).
TRIACILGLICEROLES
• Estos ácidos grasos pueden ser de cualquier clasificación, y también se pueden encontrar
monogliceroles (1 AG) o digliceroles (2 AG), pero estos en general son intermediarios metabólicos
para luego formar los triacilgliceroles.
La forma en que se guardan (gotitas de grasa) es mucho más efectiva que, por ejemplo: el glucógeno,
porque de esta forma los adipocitos pueden ocupar 1/8 del volumen que ocupa la reserva energética
por glucógeno, es decir, el glucógeno ocupa mucho mayor espacio en
1-estearoil, 2-linoleoil, 3-palmitoil glicerol, un Triacilglicerol mixto.
comparación con estas moléculas de grasa (Triacilgliceroles), que
ocupan mucho menor espacio, por lo que es bastante eficiente (su
rendimiento es mayor por el espacio que ocupa).
Glicerol y un Triacilglicerol. El Triacilglicerol mixto que se muestra aquí tiene 3 ácidos grasos diferentes unidos a la columna
vertebral del glicerol. Cuando el glicerol tiene 2 ácidos grasos diferentes en C-1 y C-3, el C-2 es un centro quiral.
➢ ¿Por qué la grasa nos protege tan bien de las bajas temperaturas?
La grasa es un mal conductor del calor, por lo tanto impide la pérdida del calor, por eso nos protege de las
temperaturas bajas (esto es porque esta grasa se acumula).
➢ ¿Qué animal acumula mucha grasa para poder pasar el frío del invierno?
El oso pardo acumula mucha cantidad de esta grasa debajo de su piel para poder pasar estos inviernos tan crudos
y tener esta reserva energética.
Los hombres tienen alrededor de un 21 % de grasa, las mujeres tienen un poco más, un 26 % de grasa
y este almacenamiento de estas células grasas nos permite sobrevivir a los periodos de ayunos.
• Los TAGs que son sólidos a temperatura ambiente reciben el nombre de grasas (+ saturadas
porque se van a compactar mejor), mientras que los que son líquidos a esta temperatura reciben
el nombre de aceites (+ insaturados).
• Los TAGs con ácidos grasos de cadena insaturada tienen puntos de fusión más bajos (van a
ser más líquidos).
• El punto de fusión de un ácido graso aumenta con la longitud de la cadena (de los componentes
de sus ácidos grasos) y disminuye con el grado de saturación.
La próxima clase vamos a ver los componentes de las membranas biológicas, que son los fosfolípidos y los esteroles; y
las otras f(x)s de los lípidos como: las hormonas, las vitaminas, los cofactores enzimáticos, los pigmentos y los mensajeros
intracelulares.
➢ ¿Cuándo decía que el punto de fusión aumenta con la longitud de la cadena pero disminuye con el grado
de saturación, que pasa cuando una cadena es muy larga pero igual tiene muchos dobles enlaces? ¿qué
predomina?
Predominan las insaturaciones, porque esto provoca el doblez/torsión en la molécula del ácido graso. Por
ejemplo, si tenemos un Triacilglicerol con 2 ácidos grasos torsionados, la molécula va a estar más fluida, no va a
estar tan empaquetada, esta es la característica de los ácidos grasos saturados, que nosotros podemos poner
muchos seguidos y eso va a estar más compactado; en cambio, con una insaturación, tendremos muchas torsiones
y eso no va a permitir un mejor empaquetamiento, por lo tanto va a estar más fluido, va a predominar más la
insaturación que la cadena, ahí el punto de fusión va a ser más bajo porque son más líquidos.
Siempre debemos relacionar que los aceites estarán de una forma más líquida, porque no van a estar tan compactados
como los saturados, sino que van a estar más fluidos.
Tarea: revisar las moléculas y ensayar estos ejercicios porque en la prueba la profe nos va a colocar alguna molécula y
nosotros tendremos que contar los carbonos y ver su nomenclatura, debemos de conocer los nombres de estos ácidos
grasos y su importancia en algunas enfermedades metabólicas de las vacas en las que puede haber un aumento de
ellos que se ha relacionado con un aumento en la predisposición a enfermedades infecciosas, entonces, también pueden
tener otro tipo de f(x)s y modulaciones en los animales. La próxima clase veremos cómo estos ácidos grasos pueden
afectar a algunos animales, principalmente a los rumiantes.
Lípidos II
Vamos a ver esta 2da f(x) importante de los lípidos, que son los
componentes de las membranas biológicas. La 1ra clase vimos
• Funciones biológicas de los lípidos: cómo los lípidos pueden servir para almacenamiento energético, con la
1) Almacenamiento energético estructura base de los Triacilgliceroles que son los ácidos grasos.
(grasas y aceites):
o Triacilgliceroles. Debemos recordar que la característica de la arquitectura de una
2) Componentes de las membranas membrana es la doble capa lipídica (bicapa lipídica), que va a
biológicas: constituir una barrera para no permitir el paso de ciertas moléculas
o Fosfolípidos. polares o iones importantes hacia dentro de la célula. Entonces, es una
o Esteroles.
barrera para la protección de las moléculas que estén dentro de la
3) Otras funciones:
o Hormonas. célula. También, estos lípidos de las membranas tienen la característica
o Vitaminas. de ser anfipáticos (quiere decir que hay una parte/extremo de estos
o Cofactores enzimáticos. lípidos que es hidrofóbica: compuesta por cadenas hidrocarbonadas que
o Pigmentos. se compactan hacia dentro de la bicapa lipídica, y en el otro extremo
o Mensajeros intracelulares. esta la parte hidrofílica compuesta por las cabezas polares de los
fosfolípidos). Estas interacciones hidrofóbicas e hidrofílicas son las que
permiten que se forme esta bicapa lipídica.
• Glicerofosfolípidos/Fosfogliceridos:
contienen 1 molécula quiral de glicerol,
este glicerol, llamado 1-Glicerol 3-fosfato
va a tener 3 carbonos y va a estar
esterificado (unido por 1 enlace éster), con
2 ácidos grasos. Estos 2 ácidos grasos
pueden ser de distinto
tamaño/longitud/características. Por lo
tanto, la mayoría de los glicerofosfolípidos/fosfoglicéridos van a tener 2 de estos ácidos
grasos, 1 va a ser saturado y el otro va a ser insaturado. Además, van a estar unidos
con 1 grupo fosfato (con 1 enlace fosfodiéster). La diferencia de los distintos
Fosfogliceridos va a ser la sustitución a nivel del grupo sustituyente de cabeza (X).
o Son los fosfolípidos + abundantes de las membranas celulares (las membranas
tienen mayor cantidad de este tipo de lípidos).
o Contienen glicerol, ácidos grasos, fosfato y 1 grupo de cabeza polar.
o Se clasifican según el grupo de cabeza polar que se esterifica al grupo.
o El fosfoglicérido + sencillo es:
Nombre del Glicerofosfolípido Nombre de X Fórmula de X
Ácido Fosfatídico --- -H
Ahora vamos a ver a los Esfingolípidos y tendremos 2 tipos, 1 que va a tener el grupo fosfato y otro que va a estar unido
a 1 mono-oligo sacárido. Lo principal es que vamos a tener 1 molécula de Esfingosina que se va a diferenciar, 1 con 1
grupo fosfato y otro con 1 molécula de azúcar.
Donde tendremos 2 tipos uno que tendrá el grupo fosfato y otro que estará unido a un monosacárido o disacárido pero lo
principal es que NO vamos a tener un glicerol como el caso de los glicerofosfolipidos, si no que tendremos una molécula
de esfingosina es la molécula principal pero se va diferenciar teniendo 2 tipos uno con fosfato y otro unido a una molécula
de azúcar por lo tanto estos últimos se van a llamar glucolipidos o glucoesfingolipidos los que están unidos a una glucosa
o un di, tri o tetra sacáridos también pueden estar unidos a unos de los Oligosacáridos más complejos.
Cerebrósidos
Glucolípidos o
Glucoesfingolípidos
Globósidos
Gangliósidos
En el caso de los glucolipidos o glucoesfingolipidos tenemos los cerebrosidos importante señalar que los
glucoesfingolipidos NO tienen un fosfato esa es la gran diferencia con los esfingolipidos como tal pues los esfingolipidos
unidos a una glucosa no tienen fosfato.
• Cerebrosidos que tienen una molécula de glucosa unido mediante un enlace glucosidico con una glucosa.
• Globósidos con un di tri o tre sacaridos.
• Gangliósidos que están unidos a un oligosacárido más complejo pueden encontrarse en las células bacterianas.
Galactolípidos y sulfolípidos
Estos 2 galactolípidos son predominantes en los organelos fotosintéticos de algunos vegetales ósea que podrían estar
relacionados con la fotosíntesis de las plantas.
Este otro subgrupo llamado los sulfolípidos se caracterizan por poseer el grupo funcional que contiene un azufre entonces
tenemos un residuo de azúcar, pero sulfonado porque tiene este grupo de azufre por eso se les llama sulfolípidos.
En los mamíferos los que son más predominantes son los fosfolípidos porque tienen mayor número de lípidos .
Nombramos Esfingolípidos a cualquier estructura que tenga una esfingosina, pero si queremos distinguir a un tipo de
esfingolipidos por ejemplo a los Glucoesfingolípidos es mejor nombrarlo como glucoesfingolípidos no como esfingolípidos.
Esta estructura es solo de los ESFINGOLIPIDOS, no del glucoesfingolipido, porque este no tiene el
fosfato (p).
• Hormonas.
Hormonas esteroideas: Son hormonas que derivan del colesterol, en el caso de las
hormonas sexuales (testosterona y estradiol) van a regular el desarrollo de las estructuras
sexuales, en el caso de la testosterona (hormona sexual masculina) y perite el desarrollo de
los testículos. En cambio, el estradiol (hormona femenina) que se va a producir en los
ovarios, y también actúa como hormona de crecimiento para los
distintos órganos reproductivos.
Hormonas corticales: también derivan del colesterol como el
CORTISOL y la ALDOSTERONA van a ser producidas por la
corteza suprarrenal y van a tener una implicancia en
el metabolismo tanto de la sal como de la glucosa,
esas son sus funciones principales.
Definición de lo que hace una hormona: se
sintetizan en un tejido se transportan por la sangre a
otro tejido y ahí es donde ejercen su función, uniéndose a receptores específicos,
produciendo cambios en la expresión génica o metabolismo.
ORGANO DIANA: ORGANO DONDE VA A EJERCER SU FUNCION. (NO
DONDE SINTETIZA).
Otro tipo de funciones que tienen los lípidos, hay unas
moléculas que se llaman icosanoides o eicsanoides
estos son un grupo de moléculas que van a derivar de
unos ácidos grasos, (principalmente que tienen 20
carbonos) ejemplo el ACIDO ARAQUIDONICO
(tiene 20 c y 4 dobles enlaces) la mayoría de estos ico
vana a derivar de estos ácidos grasos que son el ácido
araquidónico.
Y estos van a formar unas moléculas muy importantes en varios procesos fisiológicos, como por ejemplo la
contracción del musculo liso, procesos inflamatorios, la percepción del dolor y la regulación del flujo sanguíneo,
dentro de los icosanoides o eicosanoides vamos a tener a los PROSTAGLANDINA (prostaglandina E1(PGE1): su
función es mediar la respuesta inflamatoria, son encargadas de producir dolor, fiebre en algunos cuadros
infecciosos, regulan presión sanguínea y también participan en la inducción del parto) TROMBOXANO
(tromboxano A2: su función es formación de coágulos sanguíneos) y LEUCOTRIENO (leucotrieno A4: está
involucrado de la contracción del músculo en las vías aérea, en el pulmón, se relaciona un poco cuando tenemos
un cuadro asmático, o respiratorio, muchos de los fármacos van a apuntar a estos tipos de moléculas)
Van a ver otros fármacos que son los antiinflamatorios no esteroidales, estos van a disminuir o regular la producción
de estas hormonas (prostaglandina y tromboxano) y aliviar el dolor.
PROSTAGLANDINA: CUADROS
INFLAMATORIOS.
TROMBOXANO: FORMACION DE
COAGULOS.
LEUCOTRIENO: CONTRACCION
DEL MUSCULO DEL PULMON.
• En resumen, existen algunos fármacos que regulan la producción de estas moléculas, potenciando la inflamación.
VITAMINAS: VITAMINA D
• Esta es la vitamina que ayuda a la fijación del calcio y el fósforo en nuestros huesos.
• La deficiencia de la D3 puede producir en niños raquitismo. Los bajos niveles de vitamina D 3 es un problema a nivel
mundial, en Chile cera del 15% de las mujeres en edad fértil y un 20% de los adultos mayores tienen un déficit severo
de vitamina D en la sangre.
• Otros problemas asociados a el déficit es la osteoporosis, sobre todo en lugres donde no hay mucha luz solar.
El retinol también tiene una función en la piel y ayuda a la estimulación del colágeno.
• Mensajeros intracelulares-fosfatidilinositoles
Entonces, en general hay una célula, receptores que son moléculas que
captan una señal o se van a unir a una molécula extracelular y ese receptor a
su vez se va a activar produciendo otras moléculas.
• Una molécula que actúa como segundo mensajero es aquella capaz de censar una señal externa a la célula, la
traducirla y “llevarla dentro de la célula”.
• Este” llevar el mensaje dentro de la célula” involucra activación de elementos o moléculas receptores dentro de la
célula, que a su vez activarán otras moléculas, generando una cascada de reacciones, todas estas moléculas
involucradas son mensajeros intracelulares. Finalmente, esta señal extracelular es trasportada hasta llegar al núcleo
de la célula donde se generará la síntesis de una proteína (ejemplo ARNm).
• Las señales intracelulares actúan mediante una serie de pasos que implican, por ejemplo, la activación de un receptor
en la superficie de la membrana.
Fosfatidilinositoles
• Son de nuestra importancia porque están muy involucrados en farmacología y procesos fisiológicos.
• Fosfolipasa C hidroliza al enlace entre el glicerol y el fosfato en el fosfatilinositol 4,5 bifosfato liberando los productos
inositol 1,4,5-trifosfato y diacilglicerol, que actúan como mensajeros intracelulares.
Idea principal: LA SEÑALIZACION INTRACELULAR CONSITE EN PASAR UNA SEÑAL EXTRACELULAR (FUERA DE
LA CELULA) HACIA DENTRO DE LA CELULA. ESTE ES UN PROCESO MEDIADO POR MENSAJEROS
INTRACELULARES O SEGUNDOS MENSAJEROS.
Metabolismo de Lípidos I
▪ Biomoléculas: Lípidos.
• Catabolismo de los ácidos grasos.
• Metabolismo de los ácidos grasos: las células pueden obtener a los ácidos grasos combustibles a partir de 3 fuentes.
o Consumo a partir de alimentos.
✓ Son las grasas consumidas en la dieta que aportan alrededor de un 40 % del total de energía que nosotros requerimos
diariamente.
o Almacenados en células del tejido adiposo (adipocitos). Los ácidos grasos se pueden almacenar en forma de Triacilglicerol en
“gotitas” que se forman en los adipocitos.
✓ En algunos animales es la única fuente de energía en animales de hibernación (como las aves migratorias).
o Síntesis de ácidos grasos (no lo profundizaremos tanto como los otros 2 mencionados anteriormente).
I. Consumo a partir de alimentos: cuando las grasas son ingeridas a través de la dieta estas tienen que de alguna forma
transformarse a moléculas + pequeñas (porque la grasa es una molécula + macroscópica), para poder ser absorbidas estas
tienen que de alguna forma solubilizarse o emulsionarse. Esto lo hacen a través de 1 solución de unas sales, llamadas sales
biliares, que es producida por la vesícula biliar. Lo que hacen estas sales biliares es emulsionar a estas grasas provenientes
de la dieta (del intestino delgado) y van a formar unas micelas. Las sales biliares provienen del colesterol y son un compuesto
anfipático (cara hidrofóbica + cara hidrofílica), por lo tanto, lo que hacen estas sales biliares es actuar como un detergente biológico sobre las grasas y las
transforman en micelas. En el interior de las micelas tenemos a los Triacilgliceroles y a su alrededor está rodeada por una cubierta de sales biliares,
transforman a las grasas en moléculas + pequeñas (microscópicas) con las interacción de la cara hidrofóbica junto a la parte hidrofóbica de los
Triacilgliceroles. Forman estas pequeñas micelas que favorecen la absorción, porque facilitan que 1 proteína (la Lipasa) degrade a los Triacilgliceroles en
ácidos grasos libres. La estructura de la micela va a permitir la digestión de los Triacilgliceroles, por medio de la Lipasa. La acción de la Lipasa va a provocar
la formación de monoglicéridos y diacilglicéridos de 1 sólo ácido graso, de 2 ácidos grasos; que naturalmente no se ven mucho y son intermediarios
metabólicos. Las Lipasas intestinales degradan a los Triacilgliceroles en el intestino pero quedan estos ácidos grasos libres que los otros productos (glicerol)
y que a lo mejor pueden ser absorbidos por la mucosa intestinal, pero dentro de la mucosa intestinal nuevamente, para pasar a la mucosa, son de nuevo
transformados a Triacilgliceroles y así, estos se van a incorporar a unas moléculas llamadas Quilomicrones, que van a unirse junto a otras proteínas
(moléculas) como por ej: colesterol y otros tipos de lípidos. Estos Quilomicrones finalmente van a facilitar el transporte a través de la sangre para que
lleguen a algunos tejidos como por ej: las células adiposas o células del músculo como el miocito. Ahora veremos con mayor detalle lo que es el Quilomicrón.
➢ Estructura molecular de un Quilomicrón: está compuesto principalmente por Triacilgliceroles, en un 90 % (una muy buena cantidad), van a
permitir que los ácidos grasos lleguen a esta célula. Y en un 7 % va a contener otros fosfolípidos, va a contener un 1 % de colesterol y va a
contener unas proteínas llamadas apolipoproteínas en un 2 %.
▪ Las apolipoproteínas (B-48, C-II y C-III), son proteínas que se unen a lípidos en la sangre y son responsables del transporte de TGA,
fosfolípidos, colesterol entre diferentes órganos.
▪ Las apolipoproteínas actúan como señales para el metabolismo del Quilomicrón.
▪ Apolipoproteína: sin lípidos (proteína sola).
▪ Lipoproteína: con lípidos (proteína asociada), cualquier proteína que esté unida covalentemente a grupos lipídicos. Vamos a tener
distintos tipos de lipoproteínas. El Quilomicrón es una estructura muy grande como podemos ver en las imágenes de microscopía
electrónica, pero también tenemos otro tipo de Lipoproteínas como por ej:
✓ Las VLDL: son Lipoproteínas de muy baja densidad, que transportan a los lípidos a los tejidos.
✓ Las LDL: son Lipoproteínas de baja densidad, principales transportadores de colesterol a los tejidos. Los ácidos grasos trans
están muy asociados a un alto nivel de la LDL (“colesterol malo”), esto es porque se ha asociado que las personas con
niveles elevados de LDL en sangre están + propensas a sufrir enfermedades cardiacas por el hecho de que este exceso
puede depositarse en las arterias y provoca que disminuya el diámetro de ellas y aumente la presión sanguínea, con un
mayor riesgo de sufrir infartos cardiacos o afecciones cardiovasculares.
✓ Las HDL: son Lipoproteínas de alta densidad, median (se encargan de) la eliminación del colesterol excesivo, de los tejidos
lo llevan al hígado para que se elimine.
LDL: Lipoproteinas de
baja densidad
Principales
transportadores de
colesterol a los tejidos
Nosotros hemos escuchado que LDL es el colesterol malo Esto es porque se ha asociado por ejemplo a las personas
con LDL elevado en sangre están propensas a enfermedades cardíacas por el exceso de LDL se ha visto que puede
depositarse más cantidad de lípidos, colesterol en las arterias eso hace disminuir el diámetro de las arterias y eso hace
que aumente la presión sanguínea por lo tanto hay un mayor riesgo de sufrir infartos cardíacos o una afección
cardiovascular debido al LDL lipoproteínas de baja densidad que son los que transportan el colesterol a los tejidos.
Por lo tanto nosotros debiéramos tener una razón entre el LDL Y HDL de
una cierta forma no que sobrepase la cantidad de LDL que tengamos
nosotros porque ese es el colesterol que será llevado a los tejidos y eso
se asociado a la arterosclerosis y esto es cuando se deposita la grasa
en los capilares en las arterias y en el fondo y aumenta el diámetro y
aumenta la Presión sanguínea y esto es lo que se le ha asociado a estas
lipoproteínas.
Pero esta es la ruta la digestión absorción y transporte de los lípidos hacia el tejido final.
Y por último par a obtener la energía estos ácidos grasos se descomponen proceso que se llama beta oxidación que
también es un paso de 3 etapas.
En primer lugar veremos cómo se movilizan los lípidos desde el adipocito se van a la sangre y llegan al tejido como
por ejemplo el musculo el tejido cardíaco etc.
Pero eso pasa por muchas reacciones enzimáticas que suceden dentro de la célula
para que finalmente pase esto, entonces cuando ya están como ácidos grasos libres
(en el adipocito), estos ácidos grasos pasan a la sangre se unen a la albumina y son
transportados por los tejidos, como por ejemplo el musculo esquelético (miocito)
(como en la imagen) y ahí en el miocito se vera toda la etapa de la beta oxidación
(degradación de ácidos grasos para ser convertidos como ATP.
Al final la unión el glucagón a su receptor hace que se active este receptor y a la vez que se active el adenilato ciclasa (otra
proteína que está en la membrana).
Entonces estamos en el adipocito, pasamos a la sangre y vamos al tejido o sea al miocito, porque este es el que va a
requerir la energía, para que ocurra esta beta oxidación necesitamos que el ácido grasos entre en la mitocondria (estamos
en un primer lugar en el citosol) ese es otro proceso que se llama la LANZADERA DE LA CARNITINA. (son tres reacciones).
ACTIVACION DE ÁCIDOS GRASOS EN LA MEMBRANA MITOCONDRIAL: LANZADERA DE LA CARNITINA
1) ACTIVACIÓN
2) PASO A LA MITOCONDRIA
• Luego de que entra el Acil graso a la matriz mitocondrial, el Acil graso-carnitina pasa a ser de nuevo Acil graso-CoA.
• Esta rxn está mediada por la carnitina aciltransferasa II.
• La carnitina se libera y vuelve al espacio intermembrana.
REACCIÓN QUÍMICA
Activación
• La activación ocurre en dos pasos:
1) el ión carboxilato desplaza a los dos
fosfatos externos del atp, para formar Acil
graso adenilato, con liberación de pirofosfato.
2) Se forma un enlace tioester entre el grupo
carboxilo del acido graso y el grupo tiol de la
CoA.
• Después de estos dos pasos se forma el ácido
graso “activado” = Acil graso-CoA
• La union a la carnitina I es transitoria. Esta rxn es catalizada por la carnitina aciltransferasa I. Aquí se forma la Acil graso-
carnitina
• De esta forma el ácido graso es capaz de entrar a la matriz mitocondrial a través de transportadores que están en la membrana
mitocondrial interna.
• El grupo acilo es transferido a una molécula de CoA. Esta rxn es catalizada por la carnitina aciltransferasa II.
• De esta manera que unido el Acil graso-CoA, con liberación de carnitina.
• La carnitina vuelve a la membrana interna por el transportador.
La beta oxidación es diferente para todos los ácidos grasos ya que estos se diferencian
en saturados e insaturados.
2) Los productos de la beta oxidación ( acetil CoA) se van al ciclo de Krebs donde se obtienen NADH, FADH2.
3) El NADH y FADH2 entran a la cadena respiratorio, donde sirven como donadores de electrones para obtener ATP.
• Beta-oxidación de ácidos grasos saturados
Estas son las reacciones principales que suceden en la beta-oxidación de los ácidos grasos saturados. En primer lugar,
ocurre una deshidrogenación del ácido graso CoA, en este caso está el palmitoilo-CoA que tiene 16 carbonos, con la
deshidrogenación se produce un doble enlace de tipo trans y luego hay una reacción de hidratación y se produce el 3-
hidroxiacil-CoA, de nuevo hay una deshidrogenación que está catalizada por la L-3-hidroxiacil-CoA deshidrogenasa para
formar el 3-ketoacil-CoA. Por último, hay una reacción que se llama Tiolisis que está catalizada por la enzima tiolasa y es
la que finalmente va a cortar en 2 carbonos este ácido graso- En el intermedio quedan 14 carbonos que es el acil-CoA
(meristoil-CoA). Luego, este meristoil CoA pasa de nuevo por todas estas reacciones y se remueven otros 2 carbonos más.
CoA-SH se le llama a la coenzima A cuando no está unido a un acil. OJO: miren las enzimas que participan en cada
reacción. Están en la siguiente imagen.<3
RESUMEN
• En este tipo de ácidos grasos encontramos un doble enlace con configuración CIS. Esto hace que la beta oxidación
ocurra de forma normal hasta llegar este punto (hasta el doble enlace con configuración cis).
• Cuando se encuentra con este doble enlace la enzima enoil-CoA hidratasa NO funciona con doble enlaces cis.
• Entonces es necesario un intermediario, esta es la enzima ENOIL-CoA ISOMERASA
• La enoil-CoA transforma el doble enlace cis – en uno trans-, así se pueden continuar las siguientes reacciones.
Metabolismo de Lípidos II
• Betaoxidación: proceso para obtener energía a través de los ácidos grasos. Consta
de 3 fases; en la 1ra parte se eliminan c/u de las unidades de acetil-CoA del extremo
carboxilo de 1 acil graso hasta convertirse en 8 Acetil-CoA. La Betaoxidación se
caracteriza porque el acil graso se va cortando de a 2 carbonos, entonces es una
seguidilla de rx dónde el acil graso lo vamos cortando de a 2 hasta que finalmente, todo el
acil graso se convierte en 8 moléculas de Acetil-CoA → esto en el caso de 1 acil graso de
16 carbonos. En la 2da parte, el Acetil CoA se oxida a CO2 en el ciclo del ácido cítrico.
En la 3ra parte, los electrones obtenidos de la 1ra y 2da parte, se transfieren al O 2 a
través de la cadena respiratoria mitocondrial, proporcionando la energía necesaria
para la síntesis de ATP mediante fosforilación oxidativa. También vimos el recuento de
cuántos ATP podríamos obtener si degradamos 1 molécula de Palmitoil CoA (de 16
carbonos), finalmente obteníamos alrededor de 108 ATP. Debemos recordar que la ruta del
Acetil CoA va a ser entrar al ciclo de Krebs/ciclo del ácido cítrico y finalmente, todo el NADH
y FADH2 van a entrar a la cadena respiratoria y se van a obtener ATP. Esto pasa en los
tejidos periféricos, dónde necesitamos energía.
• En esta clase vamos a ver lo que pasa en el hígado, dónde el Acetil CoA puede irse
a otra ruta (no a la ruta del ácido cítrico).
• Formación de cetonas y exportación desde el hígado: estamos en el hígado y debemos situarnos en él y
los hepatocitos (estamos en otra célula), en el hígado va a pasar algo distinto y esto pasa en algunas
situaciones fisiológicas como por ej:
o Se produce como respuesta a bajos niveles de glucosa, estados de ayuno prolongado, diabetes
no tratada. En estas situaciones va a pasar otra cosa, cuando se producen estos ayunos (cuando no
tenemos carbohidratos), cuando hay una diabetes no tratada (no hay una buena captación de
Glucosa)…
o …En esas situaciones, el Oxaloacetato se consume (prácticamente casi todo) en la
Gluconeogénesis para la formación de Glucosa, por lo que no está disponible para condensar
con Acetil CoA. En este tipo de situaciones, el cerebro depende de Glucosa (combustible), no así las
grasas, por lo tanto, en estos estados casi todo el Oxaloacetato se va a hacia la Gluconeogénesis para
formar Glucosa.
o Se producen principalmente en las mitocondrias de las células del hígado, para ser exportados
a otros tejidos como fuente energética (entre ellos el cerebro). De todas maneras, va a llegar un
punto en el que la Glucosa puede acabarse y ahí, el cerebro y otros tejidos pueden usar otras fuentes
de energía que se llaman Cetonas, comúnmente podemos escucharlas como los cuerpos cetónicos,
pero fue un malentendido nombrarlas cuerpo (según Lehninger), porque eso hace referencia a
sustancias que no son solubles y estas cetonas si son solubles (en sangre, plasma…).
Tenemos la Betaoxidación, dónde vamos a obtener el Acetil CoA (que normalmente se iría para el ciclo del ácido
cítrico), no va a poder entregarse, porque no va a tener Oxalacetato para que entre con la Acetil CoA al ácido cítrico,
porque este va a estar completamente dispuesto para la Gluconeogénesis. Esta vía está cerrada, no va a entrar el
Acetil CoA en estas situaciones extremas donde ya hay mucho consumo de Glucosa para el cerebro y otros
tejidos, llega un momento en el que no hay + Oxalacetato en el Hepatocito y el Acetil CoA tiene que tomar otra ruta
(que es esta formación de los cuerpos cetónicos), para obtener energía; y estos cuerpos cetónicos como: el
Acetoacetato, el Betahidroxibutirato y la Acetona (que vamos a verlos en mayor detalle), luego se exportan a los
tejidos (como por ej: el corazón, el músculo esquelético, el riñón y el cerebro), para ahí servir de energía.
• Se producen principalmente en
las mitocondrias de las células del
hígado para ser exportados a otros
tejidos como fuente energética.
Cuerpos cetónicos acetoacetato o b-hidroxybutirona estos se exportan a los tejidos como el corazón musculo
esquelético riñón y también en el cerebro para ahí servir de energía entonces es un mecanismo de adaptación que
tiene el cuerpo en estas condiciones fisiológicas un poco extremas cuando nosotros tenemos ayunos prolongados
entonces ahí nuestro cuerpo lleva esta guía de beta oxidación con la producción de acetil coa no va a entrar al ácido
cítrico que normalmente donde tendríamos energía si no que lo lleva a la formación de estos cuerpos cetónicos.
Principalmente en las Mitocondria del hígado y ahí son exportados a otros tejidos como fuente energética.
Lo principal que en estas condiciones extremas no va a haber disponibilidad del oxolacetato para que el acetil CoA
entre al ciclo del ácido crítico por lo tanto toma otra ruta y eso no vas a servir de energía.
En el hígado el Acetil-CoA puede tomar otra ruta de convertirse en cuerpos cetónicos y ser transportados en la sangre
a distintos tejidos para ser convertidos nuevamente en Acetil-CoAy ahí servir de energía porque en esos tejidos puede
entrar al ciclo del ácido cítrico.
β-hidroxibutirato
De la Acetoacetato en primer lugar una reacción que pasa espontáneamente que hay descarboxilación no enzimática
y donde formamos la acetona también se ha visto que puede ser catalizada por una enzima que es la Acetoacetato
descarboxilasa, pero en menor medida, pero lo principal es que es una reacción espontánea.
Es un cuerpo cetónico volátil es decir este se expele por nuestro aliento esto es muy importante por ejemplo los
diabéticos en algunos casos tienen un aliento alcohólico y esto es debido a la gran producción de la cetona entonces
la cetona puede finalmente expelerse por nuestro aliento por lo tanto esta no va a servir como fuente energética.
La otra reacción para formar finalmente el beta-hidroxibutirato es que el aceto acetato es reducido reversiblemente
(este puede ir para los dos lados) por la 3-hidroxibutirato deshidrogenasa y ahí formamos el otro cuerpo cetónico que
es el beta-hidroxibutirato entonces los cuerpos cetónicos(cetonas) que nos van a brindar energía son: acetoacetato y
beta-hidroxibutirato no así la acetona.
Entonces tenemos al beta-hidroxibutirato como intermediario tenemos al acetoacetato y obtenemos dos moléculas de
acetilCoA, que van a entrar al ciclo del ácido cítrico y ahí obtenemos energía, esta es la forma de como obtenemos
energía mediante otra vía (formación de cuerpos cetónicos) esto se va al ciclo de Krebs.
• Llega un punto en el que la vaca deja de comer porque ya no puede movilizarse hacia donde está la comida. Justo
esto se junta con el aumento en la demanda de glucosa y ácidos grasos para la producción láctea. Esto se llama
“balance energético negativo”.
• Para contrarrestar el balance negativo se produce la estimulación de la lipomovilización (se mueve gras para que
esa grasa nos de la energía).
Se describió la base genética para la restricción de fagos. Secuenciación del ADN de Sanger y
desarrollo del primer vector de
clonación, pBR322.
Se publicó el modelo de
recombinación de ADN en
fagos.
Primera transformación
de E. coli.
Se aislaron y caracterizaron
las ADN ligasas. Síntesis del primer
gen sintético. PCR concebida y
demostrada
Se aislaron las primeras
nucleasas de restricción.
Se demostró la especificidad de secuencia de las
nucleasas de restricción
Se fueron conociendo enzimas que degradan el DNA, como las enzimas de restricción, sus
secuencias.
Frederick Sanger logró la secuenciación de la insulina y en el 77´ inventó una técnica para
secuenciar el ADN.
El 83´ se inventó la técnica de PCR.
, el inventor de la PCR, fue galardonado con el
premio Nobel de Química en 1993.
La PCR no fue un descubrimiento, sino un invento.
Una DNA polimerasa especial (Taq) es utilizada para hacer
muchas copias de pequeña longitud de DNA (100-10000 pb)
definidas por primers.
¿Qué se necesita para la replicación de DNA? La DNA polimerasa
(síntesis de DNA), primasa (el partidor), helicasa (abre la hélice), un
DNA molde y nucleótidos.
La PCR está basada en la función biológica de la replicación.
Hay una pequeña modificación que se hizo con el descubrimiento, se usó una polimerasa
de Thermus aquaticus, la Taq, que es una polimerasa termorresistente.
PCR
La reacción imita la replicación de ADN.
ú Utiliza DNA polimerasas termoestables ->Taq polimerasa
Toda reacción contiene algunos componentes básicos:
ú Templados o plantillas de DNA.
ú Primers o Partidores.
ú dNTP mix: Desoxinucleótidos trifosfatos.
ú Buffer.
ú DNA polimerasa.
En esta reacción sintética de polimerización, no se usa la primasa porque se le entregan estos
partidores, los que determinan la región que se va a amplificar.
La PCR tiene muchas aplicaciones como
ingeniería genética, secuenciación,
identificación molecular, etc.
La detección de patógenos es la más
conocida actualmente por todo el tema del
covid-19.
¿En qué consiste la PCR?
Una de las limitaciones del PCR es que debemos conocer algo de la secuencia inicialmente
porque debemos sintetizar partidores específicos que determinan la región que se va a
amplificar.
1° hay que tener una secuencia templada del DNA, que es la secuencia que va a ser
amplificada.
Son 2 partidores, uno flanquea el 3´ y el otro el 5´ y con eso se determina la región que se va
a amplificar.
Para que los partidores se alineen, se debe separar la doble hebra y después unir los partidores.
Esto se logra jugando con la T°, aumentándola.
Entonces la PCR es una reacción que tiene varios pasos a distintas T° y estos son:
1. , es decir, romper la doble hebra a altas T°, más de 90°C.
2. , donde se baja la T° entorno a las 50°C-60°C para que estos
primers/partidores se puedan unir y formen los puentes de Hidrógeno (las líneas negras en
el esquema anterior).
3. , donde la T° se vuelve a subir un poco para que la polimerasa
pueda trabajar.
Los 3 pasos anteriores serían para un ciclo y
se formarían 4 hebras de DNA, pero para
lograr los miles de millones de copias que
logra esta técnica se debe repetir este ciclo y
así se logra una amplificación exponencial.
Después de 30 ciclos se lograrían 2 mil
millones de copias aprox.
Como se ven en la imagen, cada ciclo
tiene 3 pasos.
Entonces, la denaturación ocurre a
96°C, el templado/unión de partidores a
50°C y en la polimerización de fragmentos,
se sube la T° a 72°C porque es la óptima
para que la Taq polimerasa trabaje.
Se deja un tiempo para que la cadena
complementaria alcance el largo necesario
y luego se replica el ciclo dependiendo el n°
de copias que se quiera obtener.
Todas las T° son aproximadas.
Termociclador
Equipo que se utiliza para realizar las
PCR.
Cambia la T° de la placa, realizando este
juego de T°s.
La T° en el templado/unión de partidores
depende del largo del partidor que se
utilice.
En el final se ve que
la línea vuelve a
subir porque se
repite el ciclo, es
decir, se denatura,
templa y polimeriza
las veces que se
necesite.
PCR estándar:
Análisis de punto final, es decir, se
mezclan las cosas, se ponen en la
máquina, se espera a que el
termociclador llegue a 4°C infinito, se
retira el tubo con la muestra que se cree
que está amplificada y lo determinan
por la Electroforesis en gel.
Electroforesis en gel: Se tiene que correr un gel de agarosa y se ven los fragmentos como en
la imagen.
Como uno diseña los partidores para que se unan a secuencias específicas, se tiene una idea
del tamaño que tendría que tener la banda. Obviamente, van a haber uniones inespecificas,
dando bandas de tamaños distintos.
Tiene que coincidir el tamaño de la banda con el esperado y ademas si se dan muchas bandas
significa que la reacción sigue siendo inespecifica.
¿Qué quiere decir que sea inespecífica? Que el partidor se está uniendo a otras regiones.
¿Cómo se puede solucionar el problema anterior o cómo se le aumenta la especificidad a una
unión basada en enlaces de H? Se juega con la T°a, está es la mejor forma para hacer más esécifica
la unión de los partidores.
Por ejemplo: Cuando los partidores se unen y la T° es muy baja, se dan muchas uniones
inespecíficas y genera muchas bandas, entonces, para arreglar esto se tiene que estandarizar los
primers para que de 1 solo producto.
¿Cómo se hace? Basicamente se hacen PCR con distintas T°a hasta obtener la banda deseada.
La T° vendría siendo como un filtro de afinidad y la union totalmente especifica va a ser la última
en desaserce porque es la unón más fuerte.
T° de Annealing/T°a: T° a la que se unen los primers. Depende de la T° de fusión, longitud y
composición de los primers, estos no deben tener T°a muy diferentes entre si (no más de 5°C)
Ahora, ¿Cómo se demuestra sin lugar a error que lo que se amplificó es lo que se buscaba?
Secuenciando las bandas, aunque no siempre se hace.
Tipos de fluoroforos/fluorocromos:
1.Tintes que se unen al DNA de doble hebra y
cuando se unen, emiten fluorescencia. Es lo más
usado y lo más económico.
El tinte en solución emite Emisión de la fluorescencia El más conocido dentro de las marcas
poca fluorescencia. por unión. comerciales es el SYBR green.
✓ La
intensidad de fluorescencia va a ser
proporcinal a la cantidad de DNA de
doble hebra presente en el tubo.
✓ Puede monitorear la amplificación de
cualquier dsDNA.
✓ No se requieren sondas especificas.
Posibilidad que genere falsos positivos.
El tinte no es específico para la
secuencia de DNA que se va a amplificar,
sino que para todo dsDNA.
Generalmente, al final de la reacción
programa al equipo para que haga una
curva de disociación final y así conocer cuanto fragmentos se amplificaron (es una forma de
conocer un perfil térmico para saber cuantos fragmentos se estan amplificando al final).
PCR multiplex: En el mismo tubo se amplifica más de un producto y se pueden monitorear
por separado.
2. Sonda TaqMan
Es una adaptacion más cara que se utiliza mucho para la deteccion especifica, en especial de
patógenos.
El proceso es el mismo pero se diseña una sonda para una zona intermedia entre los partidores,
en una zona especifica, y se sintetiza está sonda TaqMan que tiene el fuoroforo y otro
compuesto químico que bloquea la emisión
de flrorescencia.
Si los primers dirigen una amplificación a la
zona especifica, cuando la polimerasa pase
va a llegar a la sonda, la actividad
5´exonucleasa la va a degradar porque le va
a estar molestando, entonces, al degradarla
libera el fluoroforo y emite la fluorescencia.
Fluorescencia será proporcional a las veces
que la polimerasa degrade la sonda, esto se
va a producir cada vez que se genere una
amplificación específica de partidores que
están más alejados de la sonda.
Partidores específicos: Partidores y en el
medio la sonda.
Pregunta de prueba:
¿Por qué una union inespecífica de partidores con la técnica de la sonda TaqMan NO produce un aumento de la
fluorescencia? Básicamente, cuando los partidores se unen inespecificamente (en una zona que no les
corresponde, por ejemplo), la sonda no va a estar ahí porque está diseñada para una región entre los
partidores del gen que queramos amplificar.
Entonces, tenemos 3 cosas especificas: Un primer al inicio, otro al final y la sonda que se une al medio de lo
que se quiere amplificar.
Para que aumente la flourescencia, la unión de los PRIMERS debe ser específica y la SONDA debe ser específica.
Dato cultural
Marcadores moleculares
Aplicación de los marcadores de ADN en el análisis forense molecular
En el laboratorio donde trabaja Manuel Ortiz Labrin (presentador) se ven varias aplicaciones de lo que son los marcadores,
orientado básicamente a lo que es medicina veterinaria. Suelen hacer análisis de ADN para varias aplicaciones pero sobre la
que se hablara será la aplicada a la ciencia forense, trabajan en conjunto con el ministerio público y policías (carabineros y PDI)
desde el punto de vista forense molecular para lograr encontrar a los posibles imputados de lo que es el delito de abigeato, este
delito afecta principalmente a los agricultores, a ganaderos de producción bovina tanto de leche como de carne, este un delito
sumamente oportunista que afecta a grandes y pequeños productores, es poco selectivo, afecta dónde hay posibilidad de robar
animales y produce grandes pérdidas económicas.
El análisis forense molecular les permite vinculación con el medio, tanto con víctimas como con la justicia, ya que también dictan
cursos de capacitación para toma de muestras forenses (toma de muestras, como conservarlas, como trasladarlas al laboratorio,
etc.) estas capacitaciones están dirigidas a personas de carabineros principalmente del Bio-bio al sur(Región de los lagos) lugares
en que la ganadería esta mas desarrollada y el delito es en mayor número. El laboratorio en el que trabajan esta principalmente
enfocado al análisis de paternidad en equino fino mediante análisis molecular
¿En qué consisten los marcadores genéticos?
Básicamente los marcadores genéticos son marcadores que presenta el individuo en la parte interna tanto sangre como células
que permiten su identificación., el laboratorio en el que trabaja se dirige prácticamente a la identificación animal.
Hace alrededor de 20 años atrás se utilizaban marcadores genéticos sanguíneos en las que se utilizaban técnicas muy diferentes
a las de ahora con los marcadores genéticos moleculares. Fueron técnicas usadas por mucho tiempo, pero luego aparecieron los
marcadores moleculares los cuales tienen muchas ventajas comparativas en relación con los marcadores genéticos sanguíneos,
ya que el tipo de muestra es muy variable y las muestras no dependen tanto de as condiciones., es por esto que de marcadores
genéticos sanguíneos se pasó a marcadores genéticos moleculares donde se usan muestras de diferente tipo y donde se esta
trabajando con marcadores de ADN específicamente con marcadores l amados microsatélites (o STR) que son secuencias
cortas repetidas en tándem, entonces esta es su principal aplicación, trabajar fragmentos en el ADN, además hay otras
aplicaciones que se verán mas adelante en la carrera, que son los QTL que tienen relación con características productivas de
los animales(tienen que ver con solidos lácteos o beta caseína).
✓ Sanguíneos:
- Antígenos eritrocitarios
- Polimorfismos bioquímicos
✓ Moleculares:
- Microsatélites (STR)
- Quantitive trait loci (QTL)
Microsatélites:
Estos son secuencias cortas repetidas en tándem. Principalmente en
mamíferos superiores son del tipo citosina adenina, en el caso del bovino
o equino son del tipo dinucleótido es decir son dos bases repetidas en
tándem, el numero de repeticiones en la cadena de ADN tiene herencia
mendeliana ósea que se transmite directamente de padre a hijos y es
por esto que tiene una aplicación muy grande en paternidades y por supuesto en identificación animal.
Una de las grandes ventajas que tienen los microsatélites es que son muy polimórficos, ya que tienen muchos alelos o muchas
formas.
El porcentaje de mutaciones entre distintas generaciones es muy bajo por lo tanto el ADN del individuo en general es una
mezcla de alelos que deben estar presentes en los padres, en este principio se basan las pruebas de paternidad y en el caso
de comparación de un individuo con otro, deben ser exactamente iguales ambos perfiles genéticos por lo que es una herramienta
muy utilizada por la justicia y son técnicas ya validadas en Chile, por lo que la evidencia orgánica es un elemento importante en
juicios, y esta evidencia científica permite cerrar casos ya que en los delitos de abigeato ya no se usan los testigos sino que
predomina mucho la evidencia científica..
Para análisis de paternidades en caballos hay dos laboratorios de los cuales uno está en Santiago y el otro es en el que trabajan,
pero con respecto al análisis forense molecular son el único.
✓ Aplicación en humanos:
- Aplicación en casos forenses (en animales la aplicación para casos forenses es secundaria), en la parte humana es
una de las principales aplicaciones, lo que se hace es comparar la evidencia de cierto suceso con evidencias
encontradas en poder del imputado
- Se puede usar en pruebas de paternidad, aunque la mayoría de las veces también es con un enfoque judicial, ya
que la probabilidad de que una persona en forma privada se haga un examen de paternidad durante su vida es
bastante baja.
- Investigaciones históricas
- Búsqueda de personas perdidas
- Desastres masivos
- También en el ejército de estados unidos se pide que todos los soldados que van a sitios de conflicto se hagan el
análisis de ADN que básicamente se usa como una información genética para poder identificar cuerpos,
antiguamente se utilizaba una cadena con dos placas metálicas de las cuales una quedaba en el cuerpo y la otra
se introducía en la boca para una identificación del cadáver pero en la actualidad las armas son mucho mas
poderosas por lo que encontrar cuerpos intactos es raro por lo tanto el análisis molecular cobra principal importancia
para poder identificar
- También está el CODIS que es una base de datos para personas que han cometido algún tipo de delito,
principalmente delitos del tipo sexual, todos os individuos que caen por algún tipo de delito sexual tienen que
someterse a una prueba de ADN y ese perfil genético entra a una base genética que es el CODIS donde todas
las evidencias que se encuentren posteriormente (como cadáveres o pruebas de violación) son comparados con
esta base de datos. Esta base de datos existe en varios países de mundo, pero originalmente lo creo el FBI.
✓ Aplicación en animales:
- Identificación
- Paternidades principalmente en equinos (ya que es obligatorio), están trabajando con varios registros genealógicos
como SOFO, SAGO, OGANA ( de Aysén) y ASOGAMA (de magallanes), trabajan con 4 de las 5 registros de caballos
chilenos que están en el país ( con el registro árabe, registro de caballos cuarto de milla , registros de deportes
ecuestres, en razas pesadas→ del ejercito y con algunas razas exóticas), es obligatoria la paternidad en caballos
ya que la única forma de que un criador pueda inscribir a un caballo en el registro genealógico es a través de esta
prueba que acredita de forma científica que es hijo de los padres declarados.. en bovinos se hacen muy pocas
pruebas de paternidad ya que no es obligatorio para las inscripciones voluntario en Chile aunque en otros países
es obligatorio), también las han trabajado en Wagyu y otras especies más exóticas que por razones de seguridad
arman su propio registro para usar el ADN como una herramienta de identificación.
- Trazabilidad
- Caracterización genética
- Análisis forense
¿Cuál es la ventaja de los marcadores de microsatélites por sobre otro tipo?
✓ Herencia simple y directa, los alelos de los padres pasan directamente a la descendencia, herncia mendeliana
✓ Alelos codominantes, ningún alelo domina a otro y todos tienen las mismas posibilidades de transmitirse a la descendencia
✓ Presencia desde el nacimiento, el individuo nace y crece con su perfil genético y no hay nada que los pueda cambiar
✓ Perfil genético inalterable, por lo que no hay fraudes con respecto al perfil genético
✓ Detectables por pruebas objetivas (ISAG)
Ventajas del uso de los perfiles genéticos:
✓ Permite diferentes tipos de muestras (peo, sangre, musculo, viseras, etc.) y además se puede trabajar con pequeñas
cantidades de muestras
✓ El ADN está presente en todas las células nucleadas, se trabaja con ADN nuclear por lo tanto mientras haya células
nucleadas es material suficiente para trabajar
✓ Los biosatélites son altamente variables por lo que es una herramienta muy poderosa para identificar individuos
✓ En general los marcadores con los que trabajan son de bajo peso molecular va de entre 80 pb a 250 pb en promedio
por lo que son bastante pequeños y la ventaja de esto es que se puede trabajar en multiplex
✓ Permite muy poca muestra, se trabaja con muy pequeñas cantidades
Extracción de ADN:
La muestra de pelo se esta trabajando en animales vivos, todo lo que es
paternidad se trabaja con muestras de pelo. En animales muertos no se
usa pelo por que el ADN del pelo no se sabe en que condiciones estuvo
(humedad, agua, etc.) lo importante es que el pelo que ingrese al
laboratorio sea un pelo seco (principal requisito) y que tenga raíces
porque en las raíces esta el ADN en el folículo piloso, por lo que en
animales muertos se piden otro tipo de muestras, pero en el animal vivo
la muestra ideal es la muestra de pelo, también se puede usar muestra
de sangre pero desde el punto de vista de la extracción la muestra de
pelo es mucho más fácil de extraer, también es más fácil de guardar
porque no requiere frio, es fácil de transportar y es fácil de acumular
por que se pueden guardar grandes cantidades en espacios mas
reducidos. y sin necesidad de frio., el único requisito importante es que la muestra sea tomada seca y ojalá con cierto grado de
limpieza (que no tenga feca o barro, por ejemplo), la muestra debe estar medianamente limpia y que no deje un sedimento
dentro de la bolsa (ya que en general en muestras muy sucias o húmedas, el ADN tiende a degradarse). Las ventajas del uso
del cabello como muestra es que es fácil de procesar, fácil de guardar, es bastante económica al extraer el ADN y el ADN
extraído es de muy buena calidad, este tipo de muestras es ideal para sus fines que son pruebas de paternidad y uso de
microsatélites, también en QTL se piden este tipo de muestras y sirven bastante bien.
En el caso del delito de abigeato, del robo de un animal vivo en que el animal de la víctima todavía permanece vivo se toma una
muestra de pelo y esta se compara con la probable madre del individuo, en este tipo de delito de abigeato se puede trabajar
con pelo y si el animal ya esta muerto se trabaja con otros tejidos.
Básicamente se extrae el ADN, usan varias técnicas de extracción con relación al tejido, para pelo usan una técnica que usa
una resina l amada chelex al 5% y proteínas acar (¿?), se incuba a 56° por toda una noche y al día siguiente se incuba a 95°
y se extrae el sobrenadante, en el sobrenadante estará e ADN puro y este será el ADN extraído, después de la extracción del
ADN se hace el PCR, hay una diferencia con respecto al PCR que conocemos que es que ahí usan partidores con fluorescencia,
cuando se trabaja en forma “normal” se pueden aislar 1 o 2 marcadores, se usan partidores sin fluorescencia que son bastante
más económicos, se usa una enzima que es la Taq, se usa el ADN extraído y se hace la amplificación después se corre en un
gel (de agarosa o de poliacrilamida), se hace la tinción y listo. Lo que ellos hacen es un poco diferente a eso, la primera diferencia
esta desde el punto de vista del primer, ya que usan partidores marcados con fluorescencia (1ra diferencia), la otra gran
diferencia es que ellos trabajan en multiplex, esto quiere decir que trabajan varios juegos de partidores en una sola reacción de
PCR, en caballos usan 17 juegos de partidores para 17 marcadores, en bovinos usan 11 marcadores, en perros usan 19
marcadores (trabajaron en perros en un caso muy puntual) , en ovinos igual han trabajado pero nos son especies (junto con el
perro) que ingresen habitualmente a laboratorio, entonces usan varios juegos
de partidores en relación al número de marcadores que están analizando y
todos estos marcadores vienen mezclados en un vial con fluorescencia,
entonces cuando se hace un mix de PCR finalmente se l amara un multiplex de
PCR, porque mezclan varios partidores en una sola reacción de PCR. Usan un
termociclador común y corriente, en general la dinámica y la técnica es la
misma, usan temperaturas de separación de ADN de 95° en donde el ADN se
desnatura y se abren las hebras, usan annealing de 60-61° y una extensión
de 72°, dentro de los ciclos que usan para equino y bovino se usan entre 30-
31 ciclos de PCR por lo tanto la cantidad de ADN que se logra juntar es
bastante alta, esto es el PCR básico, es el mismo principio que conocemos en
el que se usan as 3 temperaturas en un determinado número de ciclos.
Acá tenemos algunas fotos del termociclador que
están usando en la primera foto están los diferentes
marcadores de los partidores con sus colores de
fluorescencia, y estos fueron os primeros kit que se
compraron para caballo donde cada partidor de
cada marcador venia separado de un vial diferente
por lo tanto ellos trabajaron primero con 12
marcadores (esto fue en 2004), pero este kit
cambio y ahora los17 marcadores de microsatélite
vienen en un solo vial lo cual facilito mucho la técnica
porque mezclar todo esto podía conllevar errores y
todo error en prueba de paternidad es un individuo
mal deseado por lo que debe quedar fuera, por esto ahora se trabaja en un solo vial con los 17 marcadores con la fluorescencia
y se facilita mucho a técnica para ser también más fácil de manipular. Lo que es el termociclador es un aparato automatizado
que permite hacer las amplificaciones de forma automatizada.
Luego tenemos el montaje del gel, tenemos geles de agarosa, poliacrilamida, geles grandes o
pequeños, etc. Hay diferentes formas de trabajar el PCR, en el laboratorio no usan ninguna de
estas técnicas porque lo intentaron en un principio, pero se dieron cuenta que no es viable para
las aplicaciones como son paternidades con marcadores de microsatélite del tipo dinucleótido el
trabajar con estas técnicas porque además trabajan con grandes volúmenes de muestras ya que
al año están trabajando con alrededor de 3500-4000 muestras de caballos aprox. por lo que
estas técnicas de trabajar electroforesis en geles no era viable para sus fines.
Hicieron pruebas en el instituto de bioquímica con
un profesor especialista en análisis molecular y
analizaron algunos de los marcadores que se estaban usando en caballos para
paternidad y la lectura era muy compleja ya que podían tener que era un
homocigoto o puede ser un heterocigoto mas concentrado, pero en general
no era muy seguro poder leerlo con un gran numero de muestras haciendo
muchas electroforesis al día donde en un inicio trabajaban con 12 marcadores y ahora con 17, por
lo que tendrían que trabajar con muchos geles y era imposible trabajar con esa metodología por lo
cual empezaron a usar analizadores genéticos que tienen la ventaja de poder analizar varios
marcadores de microsatélites amplificados en una sola reacción de PCR y también leen fluorescencia
que es lo que también están usando. Al principio utilizaban un 310 que es un equipo de un solo
capilar donde se inyecta una muestra, la inyección y todo el proceso de electroforesis dura más o
menos 30 mnts aprox. y se corre una muestra, pero con todos los microsatélites que uno coloco en mil (¿?) de PCR, ósea que
lee los 12 o 17 de una por lo tanto facilita mucho el trabajo, aquí no hay tinciones por que vienen con fluorescencia. En el mismo
equipo hay una cámara lectora la cual envía señales a un computador y este lo traduce finalmente en un electroferograma lo
cual facilita absolutamente todo el trabajo de genotipificación del ADN que es el proceso final, tenemos la extracción de ADN
la amplificación de ADN y la genotipificación, en la actualidad usan un 3130 de 4 capilares en el que se pueden inyectar 4
muestras cada 20 mnts aprox., también hay otros modelos como el 3500 que también o usan pero está ubicado en el instituto
australomics (en campus isla teja) este es de 8 capilares, además hay otro que es mucho más portátil, más económico es de 4
capilares también pero la inyección de la muestra es muy cara por lo que no lo usan nunca (la universidad no lo tiene) es el SEQ
STUDIO, el 3500 lo suelen usar cuando sus equipos presentan algún problema. Entonces los analizadores genéticos permiten
un trabajo bastante intenso como todo laboratorio de paternidad requiere, ya que siempre hay mucha demanda, en Chile son
2 laboratorios de paternidad en caballos y se reparten alrededor de 8000 a 9000 muestras de caballos al año aprox. en el
laboratorio hacen un poco menos del 50% de los caballos que se analizan en el país, siempre hay una alta demanda por que
el examen es obligatorio.
Multiplex de PCR
Consiste en amplificar varios marcadores en una sola reacción de PCR, la ventaja es
que usa fluorescencia y el equipo es capaz de separar la fluorescencia, trae
fluorescencia azul, verde, roja, amarilla, etc. y la ventaja es que uno puede correr
marcadores de igual peso molecular, pero si tienen fluorescencia diferente el equipo
las puede leer igual. Si uno corre en un gel (de agarosa o acrilamida) marcadores de
un mismo peso molecular, durante la electroforesis las bandas se van a mezclar y no
vamos a ver que bandas pertenecen a que marcador y cuales a otros marcadores,
se va a producir un solapamiento de bandas en la electroforesis, en este caso el
equipo separa los colores y es factible hacer una lectura sin problemas y esta es la
gran ventaja del multiplex con un analizador genético, ahorra tiempo, reactivo, ahorra mano de obra, etc. la única desventaja es
que usan un kit comercial que tiene un costo..
El equipo por dentro tiene un polímero que es inyectado a presión, este
polímero ingresa a un capilar y por el capilar migra el ADN, tenemos el
autosampler donde se ubican cada una de las muestras por separado, cada
muestra ingresa al capilar y corre, hay un rayo láser que impacta a
fluorescencia y esa fluorescencia emite señales las cuales son captadas
En el laboratorio usan un 3130 de 4 capilares:
En el tubo tendremos el ADN de un individuo con los diferentes partidores de el
ADN amplificado con diferentes colores fluorescentes, este mismo ADN se inyecta
al capilar y aquí cuando la muestra de ADN pasa por delante del láser, este laser
impacta la fluorescencia y este emite una señal la cual es captada por un dispositivo
interno del equipo y esta señal se traslada a un procesador el cual finalmente
elabora un electroferograma
imagen del domicilio del imputado donde se encontraron diferentes cortes y el no tenía
como justificar compra, no tenía boleta ni factura, que acredite que eso lo compro el
Acá tenemos otro sitio del suceso en el campo de una vaca preñada, que además significa →
una gran pérdida económica para el pequeño productor. El delito de abigeato suele no ser
selectivo por lo que puede afectar a grande o pequeños productores que se sustentan con su
producción
Las personas que realizan el delito de Abigeato suelen tener mucha experiencia en faenamiento de animales, saben bien los
cortes, como cortar articulaciones, como sacar los lomos, etc. por lo tanto
as personas vinculadas al abigeato son personas que en algún momento han
realizado trabajos en el campo, pero la policía al mismo tiempo tiene mucha
experiencia con el perfil de personas, aunque también se sabe que hay
familias que se dedican al abigeato en pueblos chicos pero no se ha logrado
encontrar evidencias en poder de ellos. Para l egar a un juicio. Hoy en día
con e uso de ADN se han desbaratado varios grupos que desde siempre se
han dedicado al abigeato y que en algún momento ha quedado evidencia en
su poder y esa evidencia ha l egado al laboratorio.
Aquí hay lazos involucrados, hay amarras, nudos especiales que se conocen en →
el campo, lo que también requiere experiencia así también como sacar las paletas,
los lomos y un desmembramiento que no es fácil y requiere experiencia
Esta foto es de un caso que involucro a 16 vaquillas lo que significa una perdida
tremenda para ese predio, porque también había mucha genética involucrada (mucho
perfil genético), por lo tanto eran muchas muestras para un solo caso de abigeato y
sobrepasaban las 35 muestras de un solo caso y para abaratar costos se sugirió a la
fiscalía que se mandaran fotos de todos los miembros posteriores derechos de cada
vaquilla faenada y a partir de la fijación fotográfica ellos seleccionaron de las mas de
35 muestras, y l egaron al laboratorio alrededor de 14 muestras. La fijación fotográfica
también es una herramienta importante para seleccionar muestras y para saber si las
muestras son útiles o si hay suficiente cantidad de muestra.
Acá tenemos dos ejemplos con mochilas con material dedicado al delito de abigeato →
con solamente elementos dedicados a este delito. Este fue un caso de Chiloé y en el
serrucho encontraron evidencia que ligaba al portador de la mochila con una vaca faenada
Tipos de muestras
- En lo que son muestras de carne solo se necesita un pequeño trozo de carne
porque con muestras muy grandes se dificulta bastante guardarlas, lo que finalmente
usan es la punta de un tubo eppendorf de 1,7 por que luego esta cantidad se somete
a la extracción de ADN, usan una técnica l amada fenol-cloroformo que tiene muy
buenos resultados y no se necesita mucha muestra.
3 trozos de este
tamaño son más
que suficiente.
- El otro tipo de evidencia que l ega son las herramientas utilizadas en el delito como cuchil os, serruchos, sierras de
todo tipo, cadenas de motosierra (en las que pueden quedar pedazos de material orgánico del cual se puede aislar
ADN)
- También llegan botas o ropa del imputado de los cuales se puede l egar a extraer material orgánico, aunque en
pocas cantidades por que se extraen como escamas, pero es suficiente para aislar un ADN de buena calidad
En el caso de que el animal sea robado vivo se hace la prueba de paternidad, esta →
es de una muestra encontrada en el animal en poder del imputado y el imputado dijo tener
a la madre del animal por lo que se hizo la prueba donde (en rojo) se encontraron
incompatibilidades genéticas por lo que se concluye que no es la madre, tuvieron con una
vaca madre que estaba en poder de la víctima
Banco de ADN
Lo más común es que cuando el animal sale vivo del predio, el agricultor en general no
tiene al padre y la madre, por lo que el dueño necesita algo para demostrar que es el
dueño del bovino en cuestión. Existe lo que se l ama banco de ADN bovino fue una idea de algunas personas de fresia donde
postularon a un proyecto de SERCOTEC para lograr responder a este problema (cuando el dueño no tiene como demostrar que
es el dueño del animal ya que no tiene a la madre o al padre ni ninguna otra evidencia para demostrarlo) y este Banco de ADN
de pelo permite satisfacer esta gran necesidad, el objetivo de este es el almacenamiento de material genético aplicable a pruebas
comparativas, cierta persona contrata el servicio (500-1000 pesos por muestra) se toman las muestras de pelo del animal y
ellos lo guardaran en sus conteiner en Fresia y las almacenaran hasta que el animal muera, cuando el animal muere el dueño
avisa y la muestra se descarta, pero lo importante es que mientras el animal este vivo se va a tener una contramuestra para
examen comparativo guardada en caso de ser necesario. También es evidencia aplicable a delitos de abigeato en los cuales no
existe un sitio del suceso (robo del animal)
Este banco en la actualidad esta en busca de financiamiento del gobierno para que este pueda permanecer en el tiempo, ya
que el cobro que hacen por el servicio no logra rentabilizar el funcionamiento del banco de ADN.
Usan formularios preestablecidos para l enar
cada evidencia de muestra de pelo, además
tienen fichas por agricultor y manejan una
base de datos digital que también incluye
fotos de los individuos