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CLASES 30 A 40 DE BIOQUÍMICA 2023 (ULTIMAS CLASES)

ACIDOS NUCLEICOS

Johan Friedrich Miescher

Fue un biólogo y médico suizo. Aisló varias moléculas ricas en fosfatos, a las cuales
llamó nucleínas (actualmente ácidos nucleicos), a partir del núcleo de los glóbulos
blancos en 1869, y así preparó el camino para su identificación como los portadores
de la información hereditaria, el ADN.
Este descubrimiento, que se publicó por primera vez en 1871, al principio no pareció
relevante, hasta que Albrecht Kossel hizo sus primeras investigaciones en su
estructura química.
También demostró que la regulación de la respiración depende de la concentración
de dióxido de carbono en la sangre.

Miescher y el ADN (ácido desoxirribonucleico)

Miescher era estudiante de Medicina, y en el laboratorio de Hoppe-Seyler su
maestro comenzó a analizar los restos de pus de los desechos quirúrgicos, aislando
los núcleos de los glóbulos blancos y extrayendo una sustancia ácida y cargada de
fósforo a la que denominó «nucleína» (hoy sabemos que esta sustancia es la
nucleoproteína). Después de tratar las células con soluciones salinas, alcohol,
ácidos y alcalinos, vio que las células tratadas con una solución salina daban un
precipitado gelatinoso cuando se acidificaba la solución. Miescher supuso que el
precipitado podría estar asociado con el núcleo celular. Para ensayar esta
posibilidad, se dedicó a aislar núcleos. Cuando trató los núcleos aislados con una
solución alcalina y luego la acidificó, observó un precipitado. El análisis de este
precipitado mostró que se trataba de un material complejo que contenía, entre otras
cosas, nitrógeno y fósforo. Las proporciones eran diferentes a cualquier otro
material biológico estudiado, por lo que concluyó que había aislado un componente
biológico no descrito previamente, asociado casi exclusivamente con el núcleo.
Miescher, que se había trasladado a Basilia, comenzó sus investigaciones con el
esperma de los salmones, y descubrió la presencia de una serie de sustancias, una
ácida (ácido nucleico o «nucleína») y una fuertemente básica, a la que denominó
«protamina» y que se identifica con las histonas.
Los estudios de Miescher jugaron un papel muy importante en la biología molecular,
que abrió las puertas a numerosas pruebas y experimentos que realizaron varias
personalidades diferentes, aunque en su época el término <<nucleína>> era muy
poco conocido y él nunca lo propuso como el ADN que conocemos hoy.
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He comenzado con esta minicápsula histórica porque la Ciencia tiene muchos
Principios que la unifican y evitan que sea monótona; uno de esos principios
unificadores es “La historia de los conceptos biológicos”
En forma concreta:
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i.- Los ácidos nucleicos son polinucleótidos. (Recuerde que en la jerarquía de la organización
molecular vimos que sus unidades estructurales son los nucleótidos.
ii.- Un nucleótido es todo compuesto formado por: BASE NITROGENADA + AZÚCAR +
FOSFATO (PO4)
iii.- Las bases nitrogenadas ya ud sabe cuáles son: Dos purinas (grandes) Adenina (A) y
Guanina (G) + 3 pirimidinas (pequeñas); Timina (T), Citosina (C) y Uracilo (U).- (yo no
respondo por objetos olvidados; y si lo que les enseño no se lo aprenden; se los van a
devanar más adelante)
iv.- Los azúcares son las dos pentosas: Ribosa® y Desoxirribosa(D)
v.- El fosfato lo representaremos por P
vi.- La A, la T y la U pueden formar dos Puentes de Hidrógeno
vii.- La G y la C pueden formar Tres
viii.- El ARN puede llevar: A, G, C y U +R + P
ix.- El ADN puede llevar: A, G, C, y T + D + P
x.- Los nucleótidos del ARN se llaman Ribonucleótidos y son 4 que representamos así:
P-R-A; P-R-G, P-R-C, P-R-U.- En consecuencia los ARN son polirribonucleótidos.
xi.- Los del ADN se llaman Desoxirribonucleótidos: P-D-A; P-D-G; P-D-T y, P-D-C.- Los ADN
son polidesoxirribonucleótidos.

ADN

El ADN está contenido en las células, ya sea disperso en su citoplasma (en el

caso de los organismos procariotas: bacterias y arqueas) y o dentro del núcleo
celular (en el caso de los eucariotas: plantas, animales, hongos y protistas).
Para su decodificación y empleo como molde, hace falta la intervención del ARN
o ácido ribonucleico, que lee la estructura y la emplea como molde, en un
proceso denominado trascripción/traducción.

Cabe decir que el ADN de cada individuo es único y diferente, producto de la

combinatoria de los códigos genéticos de sus padres en un proceso que se da al
azar. Esto, claro, en los organismos de reproducción sexual, en los
que cada progenitor aporta la mitad de su genoma para fabricar un
individuo nuevo. En el caso de organismos unicelulares de reproducción
asexual, la molécula de ADN se reproduce a sí misma en un proceso
llamado replicación.

El contenido genético del ADN es sumamente valioso para la vida, y a pesar de

ello es posible que sufra daños debido al contacto con mutágenos:
radiación ionizante, ciertos elementos químicos o incluso algunos fármacos
(como en el caso de la quimioterapia), lo cual acarrearía errores de trascripción
a la hora de la síntesis celular. Esto puede conducir a la enfermedad
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y muerte del individuo, o también a la transmisión hereditaria de las estructuras

defectuosas, dando origen a descendientes con defectos congénitos.

Estructura del ADN

La molécula de ADN es una tira larga de nucleótidos, Los fosfatos (P) son
los que conectan a un nucleótido con el siguiente, razón por la cual cada
nucleótido se distinga de los demás en la base nitrogenada que posee, y que
todas juntas elaboren una cadena llamada secuencia del ADN y que puede ser
trascrita empleando la inicial de cada base, por ejemplo: ATACACATAGATA…

El ADN tiene la forma de una doble hélice, enrollada sobre sí misma en tres
distintos patrones, de acuerdo a su secuencia, cantidad de bases y función
específica. Esta estructura se produce debido a la unión de dos tiras de
nucleótidos mediante puentes de hidrógeno.Observe en el diagrama lo
siguiente:

i.-Los peldaños de la doble hélice se forman entre una base grande y una
pequeña; A con T por los dos puentes de H; y G con C por tres puentes
de H.- A con C no es congruente porque A solo puede tener dos puentes y
C tres, lo mismo es para G con A.-
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ii.- La escalera es simétrica por la razón anterior.

iii) El total de bases grandes es igual al total de pequeñas. (A+G= T+C)

iv) Las dos bandas son antiparalelas ya que una va hacia abajo en que el P
va del C3 de la desoxirribosa va al C5 de la de abajo y la otra banda va
hacia arriba del C5 al C3

v.- Los ADN no necesariamente deben llevar los 4 desoxirribonucleótidos,

y pueden llevar varios repetidos.

Como el ADN es el que almacena la herencia y las variaciones entre los

indivíduos de la misma especie, debe irse duplicando y formando réplicas
a fin poder perpetuar la especie.

Replicación o duplicación del ADN

La replicación es el proceso mediante el cual una molécula de ADN genera

dos idénticas a sí misma, y es clave en la reproducción celular, ya que todas
las células del cuerpo han de tener el mismo exacto genoma (al igual que en los
organismos de reproducción asexual, que son prácticamente clones el uno del
otro).

El proceso consiste en la separación de las dos hebras del ADN, cada una
de las cuales funcionará como un molde para sintetizar una nueva compañera.
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Si todo sale bien, al final habrá dos moléculas idénticas del ADN original, ambas
en doble hélice. De allí que la replicación sea clave para la herencia.

Hay tres posibles tipos de replicación del ADN:

• Semiconservativa. Es como se ve en el esquema, las bandas se separan y

de cada una de las antiguas se sintetiza una nueva. De tal manera que la
nueva molécula tiene una banda madre y otra nueva. Y al final de cuentas se
generan dos moléculas hijas iguales a la molécula madre (mamá).

• Conservativa. Tendría lugar si las dos hebras antiguas, luego de servir de

molde, volvieran a juntarse con su antigua compañera y al final hubiese una
molécula de ADN enteramente nueva, junto a la vieja que se reconstituiría.

• Dispersiva. Ocurriría si las hélices resultantes estuvieran compuestas por

fragmentos del ADN viejo y del nuevo. La conservativa y la dispersiva NO se
dan

LOS ARN

Están compuestos por una hélice simple, en lugar de dos. Esta distinción
también es funcional, obviamente, pues el ADN contiene el molde genético y el
ARN es el encargado de ejecutarlo o transportarlo.

Hay tres clases de ARN: Ribosomal ARNr; Mensajero ARNm y de Transferencia

o Soluble ARNt o ARNs.

ARNr: Es el constituyente principal de los ribosomas.

ARNm: Se le llama así porque es el que trae el mensaje genético desde el

núcleo una vez que el ADN se lo ha transcrito y lo lleva hasta los ribosomas.
Cada mensaje lo que dice es que se sintetice una proteína o cadena
polipeptídica.

Contiene los codones o códigos para los aa

Por lo tanto una célula tiene tantos tipos de ARNm diferentes como sus tantas
clases de proteínas tiene.
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ARNt o ARNs: Son los encargados de acarrear los aa y llevarlos a los

ribosomas a fin de ensamblarlos con el ARNm y que se sintetice la proteína o
polipéptido. Por lo tanto el número de clases es de más o menos 60, para que
ajusten y sobren para pescar los 20 o 22 aa. Vea su estructura y características
en el siguiente esquema. Ellos llevan los anticodones

+ Tiene 3 brazos A, con el anticodón

D zona de unión a una enzima que lo une al aa

y T con la zona de unión al ribosoma

+ La zona libre ACC 3´

+ La parte 5´ con un grupo fosfórico libre

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CODIGO GENETICO
Es el tripleto de ribonucleótidos representados por las bases que en el ARNm
determinan a un aa. El código en cierto modo se determinó así: -Si fuera solo
una base; solo se codificarían 4 aa.- Si fueran 2 bases sería para 16aa (42).- Si
fuera de 3 salen 64 códigos o codones (43).- Si fuera de 4 salen 256 codones
(44).- Sería muy inestable y antieconómico.- Se concluyó y se ha demostrado
que los codones son de tres ribonucleótidos representados por sus bases.
El primer código o codón determinados fue el de la fenilalanina; UUU, para ello
se sintetizó un ARNm que solo llevaba U; se le llamó Pol-U; y el polipéptido
generado fue una Polifenilalanina. En la actualidad están dilucidados los de los
20 aa y además codones que no codifican ningún aa; pero que señalan el fin de
la síntesis de la proteína o polipéptido; son los que están en rojo y con STOP (
algunos les dan bombres de colores..ocre, ambar..).
Todas las proteínas comienzan siempre con la metionina (de color verde).- El
código tiene varias características, siendo las principales las siguientes:
1.- Es UNIVERSAL: Los codones son los mismos para todos los organismos
vivientes. (Es un solo lenguaje porque todos tenemos el mismo ancestro).
2.- Es DEGENERADO. Porque varios aa tienen 2 o más codones (la Leu tiene 6,
sólo la Met tiene uno por ser el del inicio, también el Trp tiene solo 1). Esto es
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similar a una chica que tiene dos o más novios, pero esos hombres son fieles
solo a ella.
3.- No es AMBIGUO; porque el codón solo es para un aa
4.- Una secuencia de codones (mensaje genético) NO tiene puntuaciones o
“comas” que separen un tripleto de otro y esto puede cambiar el mensaje y
darlo equivocado con graves consecuencias genéticas.

El siguiente esquema muestra como se ensambla el anticodón del ARNt con el

codón del ARNm.- El codón está en verde y en este caso es AAA que
corresponde a la Lys(pelota rosada) (mire la tabla) el anticodón(en rosado)
obviamente tiene que ser UUU. En el esquema de la derecha del ARNt hay
anomalía porque le falta el grupo meti azufre y la proteína que en este caso es
la insulina causa problemas generando un tipo de diabetes.
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SINTESIS PROTEICA

El que algunos llaman “el dogma de la biología molecular” en forma sencilla dice que:
1.- El ADN contiene toda la información genética en su secuencia ordenada de bases.
2.- La información genética es transcrita(TRANSCRIPCIÓN) del ADN al ARNm
3.- La información se traduce(TRADUCCION) en los ribosomas, y lo que dicen los mensajes
es: “Que se
sinteticen las proteínas”

Un mensaje en el ADN podría ser el contenido en esta secuencia de bases

CCCTAACAACCTTGTTACAACATGTTCATAAACATCAAACATAGTTAACCTTTTAATAACATTA
La transcripción en el ARNm sería:
GGGAUUGUUGAACAAUGUUGUACAAGUAUUUGUAGUUUGUAUCAAUUGGAAAAUUAUUGU
AAU.
La traducción del mensaje viene dada por la secuencia de los aa(estructura primaria). Los
buscamos en la tabla de codones viendo los tripletos de bases y serían estos:
Gly-Ile-Val-Glu-Gln-Cys-Cys-Thr-Ser-Ile-Cys-Ser-Leu-Tyr-Gln-Leu-Glu-Asn-Tyr-Cys-Asn
Esta es la cadena A de la insulina humana.

• El codón de iniciación de la síntesis proteica es el triplete AUG

El primer codón que se traduce en los ARNm es siempre el triplete AUG. cuya
información codifica al aminoácido metionina. Por lo tanto, este codón cumple dos
funciones: señala el sitio de comienzo de la traducción -caso en el cual recibe el
nombre de codón de iniciación -, y cuando se halla en otras localizaciones en el
ARNm codifica a las metioninas del interior de las moléculas proteicas.
Al especificar el primer aminoácido de la proteína, el codón AUG de iniciación
determina el encuadre de los sucesivos tripletes, lo que asegura la síntesis correcta
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de la molécula. Tómese como ejemplo la secuencia AUGGCCUGUAACGGU. Si el

ARNm es traducido a partir del codón AUG, los codones
siguientes serán GCC, UGU, AAC y GGU, que codifican, respectivamente, a los
aminoácidos alanina, cisteina ,asparagina y glicina. En cambio, si se omitiera la A del
codón de iniciación, el encuadre de los tripletes sería el siguiente: UGG, CCU, GUA y
ACG, los cuales se traducen en los aminoácidos triptófano, prolina, valina y treonina,
respectivamente. (No hay comas ; se pusieron por razones didácticas)
Algo semejante ocurriría si también se omitiera la U, pues resultaría un tercer tipo de
encuadre: GGC, CUG, UAA y CGC. En este caso, después de codificar los dos
primeros codones a los aminoácidos glicina y leucina, la traducción se detendría, ya
que UAA es un codón de terminación.

• Los aminoácidos se ligan por medio de uniones peptídicas

Recuerde que la unión de los aminoácidos entre sí para construir una proteína se
produce de modo que el grupo carboxilo de un aminoácido se combina con el grupo a
amínoácido siguiente, con pérdida de una molécula de agua H2O y recordemos que
esa combinación se llama enlace peptídico.
Cualquiera que sea su longitud, la proteína mantiene el carácter anfotérico de los
aminoácidos aislados, ya que contiene un grupo amino libre en uno de sus extremos
y un grupo carboxilo en el otro extremo. La proteína se sintetiza a partir de extremo
que lleva el grupo amino libre.
Antes de describir los procesos que dan lugar a la síntesis de las proteínas
analizaremos cómo arriban los ARNm al citoplasma, qué configuración poseen los
ARNt y cuál es la estructura de los ribosomas.
Los ARNm salen hacia el citoplasma por los poros de la envoltura nuclear. Ya en el
citosol, cada ARNm se combina con nuevas proteínas y con ribosomas, lo que lo
habilita para ejercer su función codificadora durante la síntesis proteica.
Algunos ARNm se localizan en sitios prefijados en el citoplasma, de modo que las
proteínas que codifican se sintetizan y se concentran en esos sitios. Un ejemplo es el
ARNm de la actina, que se sitúa en la zona periférica de las células epiteliales donde
se deposita la mayor parte de la actina .
• Las moléculas de los ARNt actúan como adaptadores, ya que discriminan
tanto a los codones del ARNm como a los aminoácidos compatibles con ellos.

Así la función básica de los ARNt es alinear a los aminoácidos siguiendo el orden de
los codones para poder cumplir con sus funciones, los ARNt ,adquieren una forma
característica semejante a un trébol de cuatro hojas (como ya lo vio en la figura). Los
cuatro brazos se generan por la presencia en los ARNt de secuencias de 3 a 5 pares de
nuelcótidos complementarios, los cuales se aparean entre sí como los nucleótidos de
las dos cadenas del ADN.
En la punta de uno de los brazos confluyen los extremos 5' y 3´ del ARNt. El extremo
3´ es más largo, de modo que sobresale el trinucleótido CCA que fue incorporado
durante el procesamiento. Este brazo se llama aceptador porque a él se liga el
aminoácido, que se une a la A del CCA.
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Los tres brazos restantes poseen en sus extremos secuencias de 7 a 8 nucleótidos no

apareados, -con forma de asas -, cuyas denominaciones derivan de los nucleótidos
que las caracterizan. Una de ellas contiene el triplete de nueleótidos del anticodón,
por lo que su composición varía en cada tipo de ARNt. Otra, en virtud de que
contiene dihidrouridinas (D), se denomina brazo o asa asa D. La tercera se conoce
como brazo o asa T, por el trinucleótido T y C que la identifica. La letra T simboliza
a la ribotimidina y la y a la seudouridina.
Entre el brazo T y el anticodón existe un asa adicional, llamada variable porque
su longitud difiere en los distintos ARN de transferencia.
Un plegamiento ulterior en el ARNt hace que deje de parecerse a un trébol de cuatro
hojas y adquiera la forma de la letra L. El cambio se debe a que se establecen
apareamientos inusuales entre algunos nueleótidos, como la combinación de un
nucleótido con dos a la vez.
Formada la L, los brazos D y T pasan a la zona de unión de sus dos ramas y el brazo
aceptador y el triplete de bases del anticodón se sitúan en las puntas de la molécula . .
Existen 20(22) aminoacil-ARNt sintetasas diferentes, cada una diseñada para
reconocer a un aminoácido y al ARNt compatible con él. Y se ligue sólo a uno
de los 20 (22) aminoácidos usados en la síntesis proteica. Ello es posible
porque cada aminoacil ARNt sintetasa identifica al ARNt por el anticodón, la
parte más específica del ARNt No obstante, en los ARNt existen otras señales
que son reconocidas por la enzima, generalmente tramos de nucleótidos
cercanos al anticodón.
Los mecanismos para alinear a los aminoacil ARNtAA de acuerdo con el orden
de los codones del ARNm son algo complicados. Requieren de los ribosomas
cuya primera tarea es localizar al codón AUG de iniciación y acomodarlo
correctamente para que el encuadre de ese triplete y el de los siguientes sea el
adecuado.
Luego el ribosoma se desliza hacia el extremo 3´del ARNm y traduce a los
sucesivos tripletes en aminoácidos. Estos son traídos – de a uno por vez – por
los respectivos ARNt. Las reacciones que ligan a los aminoácidos entre sí - es
decir , las uniones peptídicas - se producen dentro del ribosoma . Finalmente,
cuando el ribosoma arriba al codón de terminación – en el extremo 3´del
ARNm – cesa la síntesis proteica y se libera la proteína. Como podemos notar,
los ribosomas constituyen las "fábricas de las proteínas"
Cada ribosoma está compuesto por dos subunidades - una mayor y otra
menor – identificadas con las siglas 40S y 60S respectivamente (los números
hacen referencia a los coeficientes de sedimentación de las subunidades, es
decir a las velocidades con que sedimentan cuando son ultracentrifugadas, la
60S migra más rápido al fondo del tubo).
En la subunidad menor algunas proteínas forman dos áreas - una al lado de
la otra – denominadas sitio P (por peptidil) y sitio A (por aminoacil).
Por otro lado en la subunidad mayor las proteínas ribosómicas formarían
un túnel por el que saldría la cadena polipeptídica a medida que se sintetiza
Las etapas de la síntesis de proteínas
La síntesis de las proteínas se divide en tres etapas, llamadas:
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de iniciación , de alargamiento y de terminación

La etapa de iniciación concluye cuando la subunidad menor se combina con la
subunidad mayor y se forma el ribosoma. En él se encuentran los primeros dos
codones del ARNm: en el sitio P el codón AUG de iniciación -unido al
metionilARNt[i]met- y en el sitio A el codón que le sigue.
• El alargamiento de la cadena proteica es promovido por factores de
elongación

• La síntesis proteica concluye cuando el ribosoma alcanza el codón de

terminación

La etapa de terminación determina la conclusión de la síntesis de la proteína

cuando el sitio A del ribosoma es abordado por el codón de terminación del
ARNm (UUA, UGA o UAG, indistintamente). Ello deja al sitio A sin el esperado
aminoacil-ARNtAA, aunque pronto es ocupado por un factor de terminación
llamado eRF (eucaryotic releasing factor), que sabe reconocer a los tres codones de
terminación.
En síntesis la terminación de la cadena polipeptídica está señalada por el ARNm
mediante un codón que no especifica la incorporación de ningún aminoácido . Ese
codón de terminación puede ser UUA, UGA o UAG, y sobre él no se une ningún
ARNt. En cambio, es reconocido por dos proteínas llamadas factores de liberación
(eRF). Cuando esto sucede, la proteína terminada se libera del último ARNt, que
también se separa del ARNm. Por último también se disocian las subunidades
ribosómicas. Todos estos elementos pueden ser reutilizados en una nueva síntesis.
RESUMEN
Tres etapas en la síntesis de proteínas. a) Iniciación. La subunidad ribosómica más
pequeña se une al extremo 5´ de una molécula de ARNm. La primera molécula de
ARNt, que lleva el aminoácido modificado fMet, se enchufa en el codón iniciador
AUG de la molécula deARNm. La unidad ribosómica más grande se ubica en su
lugar, el ARNt ocupa el sitio P (peptidico). El sitio A (aminoacil) está vacante. El
complejo de iniciación está completo ahora.
b) Alargamiento. Un segundo ARNt con su aminoácido unido se mueve al sitio A y
su anticodón se enchufa en el mRNA. Se forma un enlace peptidico entre los dos
aminoácidos reunidos en el ribosoma. Al mismo tiempo, se rompe el enlace entre el
primer aminoácido y su ARNt. El ribosoma se mueve a lo largo de la cadena de
ARNm en una dirección 5´ a 3´ y el segundo ARNt, con el dipéptido unido se mueve
al sitio P desde el sitio A, a medida que el primer ARNt se desprende del ribosoma.
Un tercer ARNt se mueve al sitio A y se forma otro enlace peptÍdico. La cadena
peptídica naciente siempre está unida al tRNA que se está moviendo del sitio A al
sitio P, y el ARNt entrante que lleva el siguiente aminoácido siempre ocupa el sitio A.
Este paso se repite una y otra vez hasta que se completa el polipéptido. c)
Terminación. Cuando el ribosoma alcanza un codón de terminación (en este
ejemplo UGA), el polipéptido se escinde del último ARNt y el ARNt se desprende del
sitio P. El sitio A es ocupado por el factor de liberación que produce la disociación de
las dos subunidades del ribosoma