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BIOLOGICA.
FACULTAD CIENCIAS DE
LA SALUD.
UNIVERSIDAD
NACIONAL DE SALTA.
2021
GENETICA MOLECULAR Y
SINTESIS DE PROTEINAS
CARTILLA METABOLISMO CELULAR
GENETICA MOLECULAR. SINTESIS DE PROTEINA
En 1.953 Watson y Crick postularon un modelo tridimensional preciso para la estructura del ADN.
Este modelo no solo explicaba las propiedades físicas y químicas del ADN, sino que sugería un
mecanismo por medio del cual la información genética podía replicarse con exactitud. El modelo
estructural del ADN de Watson y Crick consiste en dos cadenas polinucleotídicas dextro-helicoidales,
enrolladas sobre un mismo eje y constituyendo una doble hélice. Las bases púricas y pirimídicas de
cada hebra se encuentran en el interior de la doble hélice.
El aparejamiento de las bases apartadas por ambas hebras es tal que solamente ciertas bases
encajan en el interior de la estructura de manera que puedan unirse unas a otras por puentes
hidrógeno. La complementariedad de bases nitrogenadas, adenina - timina, citosina – guanina; que
son las parejas que muestran exacta equivalencia:
Si el par sería A - G serían demasiado grandes para poder encajar dentro de la doble hélice de estas
dimensiones.
Si la pareja fuera G - T las bases se encontrarían muy distanciadas para poder formar enlaces
hidrógeno estables.
A T
A T
G C
A T
T A
C G
A T
G C
Además, los enlaces hidrógeno entre A – G y C – T son más débiles que A – T y G – C, o sea
que la doble hélice implica aquellas parejas que poseen el máximo de estabilidad.
Se postuló que la periodicidad de 3,4 Å (3,4 Angstrom) se debe a que las bases están
CONCEPTOS CLAVES
GEN: es una secuencia ordenada de nucleótidos en la molécula de ADN (o ARN) que contiene la
información necesaria para la síntesis de una macromolécula con función celular específica,
habitualmente proteínas, pero también ARNm, ARNr y ARNt. El gen es considerado la unidad de
almacenamiento de información genética y unidad de la herencia, pues transmite esa información
a la descendencia.
CROMATINA: está compuesta por complejos de ADN y proteínas, es el material que forma los
cromosomas en los organismos eucariotas. La parte proteíca está constituida principalmente por
Histonas.
Este dogma definió tres procesos fundamentales de los cuales el primero es el de réplica, es
decir la "copia" del ADN con formación de moléculas hijas. Veremos como sucede éste proceso a
nivel molecular. La característica más sorprendente de la hipótesis de Watson y Crick, es que las dos
hebras del ADN duplo helicoidales son complementarias.
Endonucleasa
ADN – polimerasa
2. O bien podría ser utilizado como patrón sobre el cual la enzima podría construir una hebra
complementaria al ADN preformado.
ADN
|
nd ATP d AMP
nd GTP ADN preformado |
d GMP + 4 PPi
nd CTP Mg++ |
nd TTP d CMP
|
d TMP
ADN ligasa
La ADN ligasa repara el hueco que queda en la unión entre los nucleótidos, es decir une dos
nucleótidos mediante un enlace fosfodiester. Esta enzima establece el enlace covalente entre el 3´-
OH del último nucleótido añadido por la ADN polimerasa y el 5´-P del último nucleótido. Esta unión
requiere energía aportada por el ATP.
MECANISMO DE REPLICACIÓN
Antes de hablar de la replicación es importante acotar que la cadena de ADN recién sintetizada
se prolonga en dirección opuesta a la cadena de ADN patrón, es decir, tiene una polaridad opuesta
o antiparalela.
P 3'
T
A T
5' 3' 5'
cebadora 3' P
P 3' 5' 3'
5'
T A
T
3'
P
P
Kornberg: postuló que la réplica comienza con la producción de una mella o una rotura en
una hebra por acción de una endonucleasa, que actúa a nivel del enlace 5´3´.
La ADN polimerasa se fija a dicha rotura y comienza a prolongar el extremo 5´, con unidades
de mononucléotidos (MN).
El extremo 5' se desplaza de la estructura duplex. Se sugiere que el extremo 5' puede estar
sujeto por adherencia a la membrana celular. La réplica continua durante cierto trecho mientras
que el extremo 5' se va "pelando". La ADN polimerasa se desplaza de lugar, o salta, desde la hebra
patrón intacta a la hebra mellada en el sitio donde se separan ambas hebras y comienza a adicionar
unidades de mononucleótidos utilizando como patrón la fibra mellada. La replicación continúa hasta
que el extremo se ha replicado por completo y entonces la enzima se retira.
Toda molécula de ARN presente en una célula ha sido sintetizada a partir de un molde ADN,
en un proceso llamado Transcripción. Entonces para ello se necesita un molde de ADN y un complejo
aparato proteico que se encarga de sintetizar la molécula final, el ARN, utilizando para ello,
ribonucleótidos.
La síntesis de ARN es un proceso altamente selectivo, ya que no todos los genes van a
transcribirse a la vez, la célula debe detectar el momento en que necesita transcribir un
determinado mensaje y lo hará sólo cuando lo necesite, en un determinado momento de la vida del
organismo o en determinados tejidos, dependiendo de la necesidad de dicho organismo.
El ARN se transcribe a partir de una sola hebra de ADN, se denomina Gen a la secuencia que
coincide con el ARN transcrito. Cualquiera de las dos hebras del ADN puede servir de molde y la
dirección de la síntesis siempre será 5´- 3´.
Él ARNm es un buen candidato para transportar la información por una serie de evidencias:
a) El ARN tiene una estructura semejante a las cadenas del ADN y sus bases nucleotídicas
pueden formar puentes hidrogeno con las bases del ADN siguiendo las reglas de
complementariedad de Watson y Crick.
b) El ARN puede contener y transmitir información genética; esto lo demuestra el hecho de que
algunos virus no contienen ADN y su ARN puede actuar como agente infeccioso. Ej., el virus
del mosaico del tabaco que causa infecciones virales en las hojas de las plantas.
c) El ARN se sintetiza en el núcleo, pero los ribosomas que están en el citoplasma, donde se
realiza la síntesis proteica, contienen más del 70% del ARN celular.
La enzima ARN polimerasa, cataliza la adición de ribonucleótidos trifosforados para la síntesis del
ARN mensajero. Actúa en conjunto con el factor sigma (σ). Las enzimas ARN polimerasas van a
empezar a sintetizar una cadena de nucleótidos en sentido 5´-3´ y requerirán de Mg++ y Zn++.
Etapa del proceso de Transcripción: La ARN polimerasa junto con el factor sigma (σ) se unen al
promotor. Una vez comenzada la síntesis de ARN, el factor σ se libera y la ARN polimerasa continua
con la síntesis del ARN hasta que transcribre la secuencia de terminación.
La ARN polimerasa se une reversiblemente al ADN en varios sitios de éste. Sin embargo
cuando esta unión se hace en una región específica que es el gen promotor el factor σ
(Factor Sigma) reconoce la secuencia nucleotídica y estabiliza el complejo ADN-ARN polimerasa.
Esta estabilización permite que la enzima inicie la separación de las hebras de la doble hélice
del ADN permitiendo la iniciación de la trascripción.
B. Iniciación de la transcripción
A T C T G A G A C T A T C T G A G A C T
T A G A T A G A
G T G T
A A
C T C C T C
G G A
3'
P P P OH P P P OH
OH
P
5'
T A G A
G T
Se forma el primer enlace
internucleótido A
C T C
G A
P P P P OH + P P
5'
Una vez unida la enzima a un promotor en el ADN, se inicia la transcripción por unión de dos
nucleótidos trifosforados a la enzima. En general todos los ARN comienzan a sintetizarse por ATP y
GTP. Al tomar posición los dos primeros sustratos, el OH 3' del nucleótido trifosforado iniciador
ataca el enlace fosfodiéster entre los fosfatos alfa y beta del segundo nucleótido y se forma el primer
enlace internucléotido.
A T C T G A G A C T
T A G A
G T
A La enzima se desplaza
por la hebra del ADN
C T C
G A G A
P P P P P P OH
D. Terminación de la transcripción:
secuencia terminadora
reconocida por la enzima
2.
factor de terminación
Ro
La ARN polimerasa continúa la copia de ADN hasta la presencia de una secuencia concreta de
terminación que provoca su disociación. La secuencia de terminación suele estar formada por una
repetición de bases de adenina que se transcribe como una secuencia de uracilos en el ARN
sintetizado.
EL CODIGO GENETICO
Una vez que Crick (1958) propuso la Hipótesis de la Secuencia ("existe una relación entre la
ordenación lineal de nucleótidos en el ADN y la ordenación lineal de aminoácidos en los
polipéptidos"), la comunidad científica la admitió y se plantearon dos preguntas:
La primera pregunta conlleva el estudio del desciframiento del código genético y el estudio
de sus características. La segunda pregunta consiste en el estudio de los procesos genéticos de la
síntesis de proteínas: la transcripción y la traducción.
Se denomina código genético a la relación entre la secuencia de bases nitrogenadas del
ARNm y la secuencia de aminoácidos de una proteína.
Existen 64 posibles combinaciones de tres bases que dan lugar a los 20 aminoácidos. Cada
combinación de tres bases se denomina triplete o codón.
CARACTERISTICAS DEL CODIGO GENETICO
a) Es Organizado: está formado por una secuencia lineal de bases nitrogenadas, llamadas
triplete o codón. Cada tres nucleótidos se determina un aminoácido.
b) NO es Solapado, ni tienen superposiciones: entre los codones sucesivos no hay espacios ni
separaciones.
QUIMICA BIOLOGICA. FACULTAD SALUD. 15
c) Es Universal: el mismo triplete de bases, en diferentes especies, codifica para el mismo
aminoácido.
d) Es Degenerado, hay más tripletes o codones que aminoácidos. Salvo dos aminoácidos los
demás están codificados por más de un codón, lo que supone una ventaja, al poder cambiar
una base sin que cambie el aminoácido y por tanto la proteína.
e) Existe un solo codón de iniciación AUG y tres de finalización UAG, UGA y UAA.
El código se representa en una tabla que identifica el aminoácido codificado por cada codón.
El número de codones posibles es 64, de los cuales 61 codifican aminoácidos (siendo además uno
de ellos el codón de inicio, AUG) y los tres restantes, no corresponden a ningún AA, son codones de
parada o stop (UAA, UAG, UGA), que indican a la maquinaria de traducción que el mensaje se ha
terminado de leer.
TABLA REPRESENTATIVA DEL CODIGO GENETICO
Ahora, vamos a considerar la tercera gran cuestión que plantea la continuidad genética de
los organismos vivos.
La Traducción explica cómo se traslada la información genética contenida en la secuencia
nucleótidica del ARNm , de tal suerte que los aminoácidos se engarcen formando una cadena
polipeptídica con una secuencia aminoácidica específica.
Trataremos los mecanismos enzimáticos por medio de los cuales se constituye la cadena
polipeptídica, es decir, como se realiza la síntesis proteica. Además, veremos el funcionamiento de
los ribosomas asegurando la adecuada transferencia de la información del ARN m, y el papel
adaptador del ARNt.
Estructura ribosómica
El ribosoma tiene 3 sitios que pueden ser ocupados por el ARNt: el sitio A (de AA) donde sola
podrá unirse un aminoacil-ARNt, es decir un ARNt con un único AA; el sitio P (de péptido), donde
entrará el peptidil-ARNt, es decir un ARNt con el péptido naciente unido y ek ditio E (de Exit) donde
encajará el factor de liberación o terminación.
El ARN t, posee una conformación tridimensional similar a una hoja de trébol de manera que
presentan sus cadenas el máximo de aparejamiento intracatenario.
A
| Locus de enlace aminoácido
C
|
G C
Mg++
ATP + AA ácido amino acil adenílico + PPi
O
H O
P O P O P O CH2
R C C OH + O
OH
NH2 Adenina
H O O
R C C O P O CH2 + PPi
O Adenina
NH2 OH
30 S
LP LA
50 S
Representación de los tres sitios del ribosoma. E: sitio de salida del tRNA; P: sitio de unión del peptidil-
tRNA; A: sitio donde entra el tRNA con el aminoácido cargado.
Para que puedan unirse el ARNm y el ARNt AA el ribosoma debe disociarse en sus dos
subunidades. Participan en este proceso factores proteicos F1 F2 F3 (llamados también
disociasaribosomal) y GTP. Estos factores permiten la disociación de los ribosomas y además la
unión del ARNm en el lugar donde se inicia el mensaje.
CRECIMIENTO
DE LA CADENA
POLIPEPTIDICA
LP LA
(metionina) AA AA
NH NH
R CH
R CH
C O LP HO LP descargado
O O C
NH
NH2
R C H
R CH
C O
C O LA LA
O O
ARNm
Para la formación del nuevo enlace peptídico es necesario una enzima denominada
peptidil-transferasa. El ARNt "descargado" que ya no lleva su AA, continúa unido al LP.
El peptidil ARNt recién alargado está unido al LA.
3.- En la tercera fase del ciclo de alargamiento el peptidil - ARNt se desplaza físicamente
desde el LA al LP y desaloja de este último al sitio del ARNt “descargado”. Esta compleja
reacción de translocación se cree que es resultado de un cambio de conformación en el
ribosoma, que tiene lugar a costa de la hidrólisis del GTP. Para esta fase se requiere una
proteína especifica denominada factor G. Simultáneamente con la translocación del
peptidil - ARNt tiene lugar la del ARNm que desplaza un codón a lo largo del ribosoma.
O CH
NH
R C H
C O LP
O
LA
¿Cómo controla la célula o un organismo pluricelular, cuando debe expresar unos genes y no
otros? Esta capacidad de las células de flexibilización interna se consigue por la diferente expresión
de sus genes.
En el caso de organismos pluricelulares la complejidad es mayor, porque en cada tejido sus
células expresaran unas proteínas características que determinen la función de ese tejido, entonces
la clave está en la especialización de cómo regulan las células la expresión de determinados genes.
Por lo tanto, las células vivas disponen de mecanismos que regulan la cantidad de proteínas
que se sintetizan. Estos mecanismos de regulación fueron estudiados en células bacterianas y se
observó que la cantidad de enzimas que se acumula en el medio depende de la naturaleza de los
nutrientes. En base a todos estos estudios se distinguió dos tipos de respuestas:
De inducción enzimática
De represión enzimática
INDUCCION
Si estamos en presencia de una inducción enzimática, la enzima que se induce a que se
sintetice se denomina enzima inducible. Esta enzima inducible se encuentra en pequeña cantidad
en el medio, pero cuando se agrega un sustrato sobre el cual debe actuar su concentración aumenta
para transformar a ese sustrato en un metabolito que puede ser utilizado por la célula. Ej.: un tipo
de E. coli usa como fuente de carbono a la glucosa. Si en el medio en lugar de colocar glucosa
colocamos lactosa, la célula inmediatamente comienza a sintetizar β -galactosidasa que desdobla
la lactosa en galactosa y glucosa. Si volvemos a colocar glucosa, la enzima β -galactosidasa deja de
sintetizarse y alcanza un nivel bajo. La mayoría de las enzimas inducibles catalizan las reacciones
del catabolismo. Estas enzimas inducibles son diferentes a las enzimas constitutivas que se forman
a velocidades constantes independientemente de la presencia del sustrato (por ej. las enzimas de
la glicólisis).
REPRESIÓN ENZIMATICA
La célula tiene enzimas requeridas para la síntesis de los 20 aminoácidos. Si agregamos al
medio un aminoácido, por ej. histidina, la enzima que le sintetizaba es reprimida y desaparece de la
célula. Todas las enzimas inducibles están codificadas por genes. En los genes hay locus que
determinan la formación de las enzimas. Un locus se denomina gen estructural, que es el que
determina la secuencia de aminoácidos de la enzima. El otro locus, llamado gen regulador, es
interruptor, es decir, que está determinando si el gen estructural se transcribe o no. O sea que el
gen estructural codifica una enzima que se sintetiza normalmente siempre que el gen regulador no
reprima su síntesis.
Jacob y Monod formularon una hipótesis general respecto a la función de los genes estructural y
regulador) en los 2 procesos.
Inducción
El gen regulador transcribe un ARN mensajero que codifica una proteína denominada represor.
ARNm
regulador
operador
estructural represor
El gen estructural
Este represor tiene un locus de unión específico próximo al gen estructural. Este locus se
denomina operador.
¿Qué sucede en una inducción, es decir, cuando se agrega al medio un sustrato que debe
degradarse? El sustrato, que sería el inductor, se combina con el represor formando un complejo
inductor-represor inactivo, que no puede unirse al operador.
represor
inductor
Represión
Si agregamos al medio un aminoácido por ej. histidina, la célula no necesita utilizar las enzimas que
lo sintetizan.
ARNm
regulador
operador
estructural represor
Regulación coordinada
También existe un mecanismo de regulación coordinada por el cual un grupo de enzimas puede ser
reprimida o inducida por un sólo represor o por un sólo inductor. Por ejemplo, para sintetizar
histidina se necesita un grupo de enzimas. Todas se encuentran codificadas en los genes ocupando
locus vecinos.
operador z x a b
Este grupo de genes relacionados constituyen un operón; o sea que el operón se encuentra
codificando todas las enzimas que participan en la biosíntesis de histidina.
Cuando el represor se une al operador no se sintetiza ninguna de las enzimas del operón. Si se
elimina el represar se sintetizan todas las enzimas que codifica el operón.
Benyon Sarah y O´Neale Roach (2004) Lo esencial en metabolismo y nutrición. Ed.El SEVIER
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Feduchi Canosa. Romero Magdalena Carlos Yañez Esther (2016) Bioquímica: Conceptos
Esenciales. Ed. Médica Panamericana. Buenos Aires.
BIBLIOGRAFIA COMPLEMENTARIA
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