BIOQUÍMICA ESTRUCTURAL Y METABÓLICA

Clase Práctica No. 26

EJERCICIOS TEMA VI. Ciclo de Krebs

1). El ciclo del ácido cítrico utiliza ocho reacciones para catabolizar el acetil-CoA:

Oxalacetato + acetilCoA 1.1 Identificar las enzimas que catalizan cada una de
las reacciones.
Citrato 1.2 ¿Qué cofactores son necesarios en cada reacción?
1.3 Indicar el tipo de reacción catalizada:
Isocitrato - Condensación (formación de enlace carbono-
carbono).
α- ceto glutarato - Descarboxilación (pérdida de CO2)
- Oxidación-Reducción
Succinil-CoA - Fosforilación a nivel de sustrato
- Hidratación (adición de agua)
Succinato 1.4 ¿Cuáles reducen NAD+
1.5 ¿Cuáles son irreversibles?. Justificar
Fumarato

Malato

Oxalacetato
1.1
- citrato sintasa
- aconitasa
- aconitasa
- isocitrato deshidrogenasa
- dihidrolipoil-deshidrogenasa
-succinato deshidrogenasa
-fumarasa
-fumarasa
1.2
Reacción ihibidores
Isocitrato deshidrogenasa NAD
Succinato deshidrogenasa FAD
Malato deshidrogenasa NAD
α- glutarato deshidrogenasa NAD+ CoA SH
1.3

1.4 Las reacciones que reducen el NAD+ son la 3 (isocitrato a oxalosuccinato), la reacción 4
(alfa-cetoglutarato a succinil-CoA) y la reacción 8 (L-Malato a L-Oxalacetato).
1.5. En el proceso tenemos reacciones irreversibles dentro de las cuales tenemos la reacción 1
(Acetil-CoA y oxalacetato a citrato por la citrato sintasa), la reacción 3 (isocitrato a alfa
cetoglutarato por la isocitrato deshidrogenasa) y la reacción 4 (alfa-cetoglutarato a succinil-CoA
por el complejo alfa-cetoglutarato deshidrogenasa).

2). Los enfermos de beri-beri, una enfermedad originada por el déficit de tiamina, tienen niveles
sanguíneos de piruvato y de α-cetoglutarato elevados, en especial después de comidas ricas en
glucosa. ¿Qué relación existe entre estos efectos y el déficit en tiamina?
→ La tiamina es uno de los compuestos que ayudan a procesar el piruvato y el α-cetoglutarato, y
la ausencia de esta hará que se acumulen. Por lo que no se podría llevar el ciclo de Krebs,
primero porque no se obtendría Acetil CoA y segundo porque no se podría procesar.

3). El oxalacetato mitocondrial es precursor de muchos aminoácidos. ¿Qué pasa con la entrada
del piruvato en el ciclo del ácido cítrico a medida que el oxalacetato es utilizado en la
biosíntesis de aminoácidos? ¿Cómo se repone el oxalacetato en las
células animales?
→ El piruvato, por descarboxilación, se convierte en Acetil CoA, y este junto al oxalacetato dan
inicio al ciclo de Krebs dando lugar al citrato. Se reponen mediante la formación de oxalacetato a
partir del piruvato.

4). La reacción del ciclo de Krebs catalizada por la succinil-CoA sintetasa produce el
compuesto de alta energía GTP. ¿Cómo se incorpora la energía del GTP a la reserva
de ATP celular?
 → El GTP formado impulsa la síntesis final de ATP, mediante la acción de la nucleósido
difosfato quinasa.

5). Relación entre respiración y ciclo del ácido cítrico. A pesar de que el oxígeno no participa
directamente en el ciclo del ácido cítrico, éste opera únicamente en presencia
de O2. ¿Por qué?
→ El ácido cítrico es la respiración celular. Se da en células por lo que el O2 está presente
Este y aunque no lo use directamente en sus reacciones, sin el no puede realizar ningún proceso.

**6). Calcular el rendimiento en ATP, en la oxidación de una molécula de glucosa por un

homogenado celular, donde la glucolisis, complejo piruvato- deshidrogenasa, ciclo de
Krebs, cadena respiratoria y fosforilación oxidativa son completamente activos.

→
Glucollisis 2ATP y NADH 6 ATP 8 ATP
acido piruvico 2 NADH 6 ATP 6 ATP
ciclo krebs 2 ATP y 6 NADH Y 2 FADH_2 24 ATP
total 38
Se gastan dos ATP por el reingreso de 2NADH producidos en la glucolisis 36
36 ATP

7). En el siguiente esquema del ciclo del ácido cítrico:

a) Completar las estructuras los nombres de los compuestos o de las enzimas. Faltan
isocitrato, a-cetoglutarato, Succunil-CoA, Fumarato y Malato, en ese orden
b) Si interviene algún compuesto de “alta energía”, señalar cuál es y por qué El
Succinil-CoA, gracias a su enlace tioéster. Lo que permite formar GTP.
c) Indicar si alguna reacción es una fosforilación a nivel de sustrato. Justificar. Cuando el
Succinil-CoA pasa a Succinato, el GDP se fosforila en GTP.
d) ¿Qué enzimas requieren FAD? La succinato deshidrogenasa.
e) ¿Qué reacciones son descarboxilaciones? Nombrar las enzimas que las catalizan.La
3(isocitrato a alfa cetoglitarato) y la 4(alfa cetoglitarato a Succini-CoA), con
Isocitrato deshidrogenasa y la a-cetoglutarato deshidrogenasa respectivamente.
f) ¿Cuáles enzimas son reguladas y por quiénes? Citrato sintasa, isocitrato
deshidrogenasa y α-cetoglutarato deshidrogenasa son reguladas por el ATP,
g) ¿Qué significa que el ciclo de Krebs es anfibólico? Que es catabólico y anabólico al
mismo tiempo, en distintas partes.
h) ¿Qué son las reacciones anapleróticas? Nombrar alguna. Son reacciones que
proporcionan intermediarios para los compuestos del ciclo de Krebs. De piruvato a
oxalacetato.

8). Describa en términos generales como afectó la aparición del oxígeno molecular en la
atmósfera de la Tierra, hace alrededor de 3000 millones de años la historia de los seres vivos.
→Antes de la existencia del oxígeno, los primeros seres vivos eran aerobicas, lo que quiere
decir que no hacia falta de oxigeno para subsistir. Esta evolucionó cuando apareció el
oxígeno, la bacteria aerobia (mitocondria) como un organelo en las células aerobias para la
generación de energía con el uso del O2.

9). Describa los estilos de vías de los organismos siguientes:

a) anaerobios estrictos: Son aquellos organismos que no pueden vivir en presencia del
oxígeno entonces subsisten a través de fermentación y respiración anaerobia, entre estas usan
principalmente la fermentación láctica.
b) anaerobios que toleran el aire:Estos organismos que si toleran el aire son estrictamente
fermentativos, se especializan en la fermentación, pueden usar tanto respiración aeróbica
como anaeróbica.
c) anaerobios facultativos: Estos organismos usan preferiblemente la respiración aeróbica,
pero tienen la habilidad o facultad de también usar la anaerobia.
d) aerobios estrictos: Son organismos los cuales necesitan del oxígeno para subsistir, sin él no
pueden vivir. Un ejemplo muy claro es el ser humano. Aunque tenemos procesos anaeróbicos
si no tenemos presencia de O2 morimos.

9). Un corredor necesita una cantidad de energía tremenda durante una carrera. ¿Explique
cómo afecta el uso del ATP por los músculos que se contra el ciclo del ácido cítrico?.
→Como necesitan una gran cantidad de energía, se activaran varias vías metabólicas y lo más
seguro e que también utilice reservas de lípidos y carbohidratos .

10). Describa dos funciones importantes del ciclo del ácido cítrico.
→ en el suministro de esqueletos de carbono para la gluconeogénesis, la síntesis de ácidos grasos
y la interconversión de aminoácidos.
→ Genera NADH y FADH, necesarios para la generación de ATP. Liberar protones y
electrones.
 11). La acetil CoA se forma en las mitocondrias y se utiliza en el citoplasma para la síntesis
de ácidos grasos. Sin embargo, la acetil coA no puede atravesar la membrana mitocondrial.
¿Cómo se resuelve este problema?.
→ El Acetil-CoA + oxalacetato con la enzima citrato sintasa forman citrato, y con este puede
salir de la mitocondria mediante la lanzadera de citrato.
12). ¿Cuáles de las siguientes condiciones indican un estado celular de baja energía?. ¿Qué
reacciones ioquímicas afectan cada condición?
a) un cociente NADH/NAD+ elevado
b) un cociente ATP/ADP elevado
c) una concentración elevada de acetil CoA
d) una concentración baja de citrato
e) una concentración elevada de succinil-CoA

13). ¿Cuál es el significado de las reacciones de fosforilación a nivel de sustrato?. ¿Cuál de

las reacciones del ciclo del ácido cítrico implica una fosforilación a nivel de sustrato?.
Nombre otro ejemplo de ruta bioquímica que le sea familiar.
→ Es la creación de ATP y GTP, en esta el sustrato da un grupo fosfato a un ADP o un GDP para
la creación de las moléculas anteriormente mencionadas. Una reacción que es de este tipo en el
ciclo de Krebs es la reacción 4 donde el succinil-CoA pasa a succinato por medio de la succinil-
CoA sintetasa.

14). La deficiencia de piruvato carboxilasa es normalmente una enfermedad mortal debido a

la ausencia de la enzima o a una enzima defectuosa que convierte el piruvato en oxalacetato.
Se caracteriza por grados variables de retraso mental y alteraciones de varias rutas
metabólicas, especialmente las que corresponden a los aminoácidos ysus productos de
degradación. Un síntoma destacado de esta enfermedad es la aciduría láctica (ácido láctico en
la orina). Tras revisar la función de la piruvato carboxilasa, explique por qué se produce este
síntoma.
→ La piruvato carboxilasa su función es pasar los piruvatos a oxalacetato, por lo que, si esta
enzima está fallando entonces no dejaría producir oxalacetato a base del piruvato y el cuerpo para
poder deshacerse de él es probable que lo mande a la fermentación láctica y probablemente haya
falta de energía porque no hay ciclo de Krebs.

15). Describa brevemente la justificación biológica de cada uno de los siguientes fenómenos
alostéricos: (a) la activación de la piruvato descarboxilasa por la acetil-coA, (b) la activación
por la piruvato deshidrogenasa quinasa por el NADH, (c) la inhibición de la isocitrato
deshidrogenasa por el NADH, (d) la activación de la isocitrato deshidrogenasa por el ADP,
(e) la inhibición de la a-cetoglutarato deshidrogenasa por la succinil-CoA, y (f) la activación
del complejo piruvato deshidrogenasa por el AMP.
→A)La piruvato descarboxilasa convierte piruvato a acetaldehído, se activa con el
acetil-CoA ya que cuando hay aumentos de acetil-CoA no es necesario que el piruvato
pase a acetil-CoA por medio de otra ruta.
→B)La piruvato deshidrogenasa quinasa se activa por NADH porque con el mismo se
lleva a cabo la glucólisis.
→C)La isocitrato deshidrogenasa cataliza una reacción oxidativa que utiliza NAD y lo
convierte en NADH, los altos niveles de NADH inhiben la reacciones porque por el
momento no es necesario sintetizar más.
→D) La isocitrato deshidrogenasa cataliza una descarboxilación oxidativa y en el proceso
produce ATP, por lo que la presencia de ADP que se necesita para formar ATP.
→E) Las concentraciones altas del producto inhiben la enzima.
→F)La presencia de mucho AMP indica la falta de energía, por lo que se inicia el cilo de
Krebs para producir energía en forma de ATP.