SINTESIS DE PROTEINAS A PARTIR DE m Y t RNA

El objetivo es revisar que es lo que ocurre al interior de la celula con este ribosoma de m
RNA y t RNA que permiten la producción o la síntesis de una molecula proteica.

El modelo en el cual se plantea inicialmente de cómo molecularmente ocurria este

fenómeno, es u n modelo en el cual hay una molecula de m RNA, el ribosoma deslisandose
a lo largo de el RNA ribosomal y permitiendo por ese deslisamiento la lectura de esas
unidades de tiene el nombre de codones(tripletas de nucleótidos presentes en un mRNA)
y que el ribosoma lee estas tripletas , a partir de esta lectura va a empezar a unir mediante
enlaces peptidicos aminoácidos para finalmente construir una cadena polipectidica que va
a construir una proteína.

Uno de los primeros hallazgos de cómo funciona este modelo permitió reconocer que los
ribosomas también tienen una dirección de síntesis proteica y esta dirección implica
crecer desde el extremo amino terminal hacia el extremo carboxilo y que en este proceso
de lectura el ribosoma se mueve a lo largo de el RNA y 1 codon a la vez.

Este modelo tiene una implicación conformacional o estructural y esta implicación nos
dice que de alguna manera el m RNA debe encajar , y debe pasar por medio de el
ribosoma para que este lo lea y se pueda producir la síntesis proteica.

Al parecer lo que ocurre es que el ribosoma completamente ensamblado recibe como

entre una subunidad pequeña y grande a ese m RNA y es como una especie de túnel que
existiera entre esas 2 subunidades que permite el paso de el RNA.

Por el hallazgo de el nuevo modelo se generaron nuevas dudas, lo primero que se trato de
establecer era como inicio el proceso y se dijo que debe haber un complejo de iniciación y
que este debe ser el encargado de permitir de alguna manera que se forme una
estructura, esa organización supramolecular que trae como resultado un ribosoma
ensamblado y un m RNA.

La subunidad pequeña tiene la capacidad de pegarse al m RNA y a partir de esto el

complejo de iniciación era una especie de formación en la cual la subunidad pequeña
enganchaba al m RNA.

Este proceso de enganche se hace mediado por un enlace proteico que recibe el nombre
de factor de inserción proteica.

Estos 3 elementos: subunidad pequeña, m RNA y factor de inserción se unen, en la

subunidad pequeña hay una especie de hendidura y cuando se produce el enganche de el
m RNA, el codón queda justo dentro de una de sus cavidades, y este complejo ahora
permita la entrada de un t RNA que sea complementario a ese codón, osea que tenga un
anti codón que pueda unirse a la secuencia AUG.

La gran mayoría de los m RNA siempre el primer nucleótido que se ve tiene la secuencia
AUG.

Si se mira el código genético AUG codifica por el aminoácido metionina osea que el t RNA
seria un metionil de RNA.

Posteriormente se dijo que este primer t RNA no siempre traia metionina sino que traia
una metionina modificada covalentemente con un grupo formilo (formil metionil t RNA).
y tiene secuencia TAU, al igual en este proceso se necesita de un factor proteico
modulador o ayudante.

En esta entrada de t RNA también se requiere de un factor de iniciación 1 y 2. (tiene la

capacidad de unir a GTP)

El acomplejamiento molecular ha crecido, toda esta estructura cambia

conformacionalmente la disposición geométrica de las proteínas de la subunidad pequeña
y permitan que ahora ellas se puedan encajar con las subunidades grandes osea que
ahora se forma definitivamente un ribosoma completo, para poder hacer esto el factor de
iniciación 2 dona energía mediante la hidrólisis de un grupo fosfato, convirtiéndose este
factor 2 (GTP) en un factor de iniciación GDP mas un grupo fosfato.

VENTAJAS

El m RNA puede ser un previo modulador del ensamble de ribosomas queda en la mitad
entre la subunidad grande y la pequeña.

La subunidad grande tiene 3 cavidades y estas cavidades tenían el tamaño preciso para la
entrada de t RNA .

En procariotas al parecer hay una modulacion positiva de la formación del complejo de

iniciación, por la cola poliapro que han puesto en el extremo 3´, ayuda a que las proteínas
de unión al RNA puedan reconocer específicamente primero la subunidad pequeña y
después module la unión de la subunidad grande al complejo de iniciación.

El espacio compartido que esta vacio, es ocupado por un nuevo t RNA , (uno que sea
complementario al codón) . se necesita un componente proteico que module la entrada
de el t RNA y esas proteínas son los factores de elongación TU ( es un factor proteico que
tiene unido GTP).
Al producirse la entrada del t RNA , el ribosoma corta el enlace que hay entre el m RNA y
el aminoácido, y ese aminoácido lo transfiere al aminoácido de el siguiente t RNA
formando un enlace peptidico y generando un bipeptido por consiguiente queda un t RNA
sin aminoácido y un t RNA bipeptido.

A las cavidades se les da nombres:

SITIO E

SITIO P: por peptidil (este espacio esta diseñado para tener t RNA que tengan péptidos)

SITIO A: por aminoacil ( esta diseñado para tener t RNA que tengan aminoácidos)

Cuando se hace la transferencia hay una consecuencia el sitio P queda con un t RNA sin
nada y el sitio A queda con un peptidil t RNA , entonces el ribosoma se corre,
consecuencia el t RNA sin nada ocupa ahora el sitio E ( que es un sitio de salida), el t RNA
con el péptido queda en el sitio P (que es normal) y el sitio A queda vacio ; para poder
hacer este movimiento se necesita energía y esa energía se la obtiene de la hidrólisis que
hace el factor de iniciación TU de su GTP que traia unido convirtiéndolo en GTP y GDP + un
grupo ortobifosfato y liberando el factor de elongación que ahora cambia de ser TU a
factor de elongación G .

Esto trae una nueva consecuencia queda el sitio A vacio , y el ribosoma se puede mover y
empieza a crecer la cadena polipeptidica.

Todo esto ocurre en procariotas.

En los eucariotas hay la secuencia polia, en la terminación de la síntesis proteica aparecen

un grupo de proteínas adicionales, estas proteínas tienen acción exonucleasa ( remover
algunas adeninas de las colas).

A la celula le interesa que tan viejo es el m RNA por que puede recibir modificaciones
covalentes y también puede cambiar el mensaje, y en la lectura puede generar proteínas
que no son funcionales.

En cada paso se gasta mucha energía entonces no interesa gastar energía en proteínas
que no sirven.

En los eucariotas la iniciación es ligeramente diferente, la elongación es muy similar a la

de los procariotas.

La síntesis proteica se complementa diceinedo que