Tema 29 Traducción: Biosíntesis de proteínas.

Índice
1. Generalidades de la traducción.
2. Reconocimiento codón-anticodón.
3. Activación de aminoácidos y ribosomas.
4. Iniciación de la traducción.
5. Etapas de la síntesis de proteínas.
6. Coste energético de la traducción.
7. Inhibidores de la traducción.
8. Procesamiento post transcripcional.

1. Generalidades de la traducción.
Gracias a la traducción se pasa de un alfabeto de cuatro letras (AUCG) a un alfabeto de 20 letras (los 20
aminoácidos que componen las proteínas).
Este proceso tiene lugar en los ribosomas y en él participan: aminoácidos, ARN de diversos tipos
organizados en macrocomplejos, factores proteicos (más de 50) y nucleótidos trifosfato como moléculas
dadoras de energía.
Intervienen tres tipos de ARN y cada uno desarrolla una función determinada:

• ARN mensajero: lleva la información genética hasta los ribosomas.

• ARN ribosómico: forma parte de los ribosomas.
• ARN de transferencia: transporta los aminoácidos a los ribosomas.

El proceso de traducción se divide en las siguientes etapas:

• Activación previa de los aminoácidos.

• Traducción, que consta a su vez de tres fases: iniciación de la síntesis, elongación de la cadena
polipeptídica y terminación.
• Asociación de varias cadenas polipeptídicas para formar las proteínas (no aparece en este tema)
• Control post traduccional.

2. Reconocimiento codón-anticodón.

Para poder descodificar un lenguaje de 4

letras (A, C, G, U) y convertirlo en un
lenguaje con 20 letras (aminoácidos), las
cuatro letras de los ácidos nucleicos
deben ser leídos en grupos. Estos grupos
están compuestos por 3 pares de bases
(codones o tripletes), los cuales dan lugar
a 64 combinaciones posibles para codificar los 20 aminoácidos. Varios codones o tripletes dan lugar al
mismo aminoácido, por eso, que haya más combinaciones posibles que aminoácidos no supone ningún
problema. Por esto decimos que el código genético está degenerado. Hay codones que no codifican ningún
aminoácido porque son codones de terminación o parada, que indican a la maquinaria de traducción que el
mensaje se ha terminado de leer. El código genético es universal, es decir, es igual para todas las especies.
Es necesario que haya una molécula adaptadora que pueda unirse, por un lado, al codón, y por otro, al
aminoácido especificado. Este es el papel fundamental del RNA de transferencia; su molécula tiene forma
de hoja de trébol, con un brazo que expone una secuencia de tres bases que son complementarias al
codón del mRNA (y, por ello, se llama anticodón) y con otro brazo en el otro extremo de la molécula que se
une covalentemente al aminoácido → el carboxilo del aminoácido es esterificado al 3’ o al 2’-hidroxilo de
la ribosa en el extremo 3’ de la cadena del TRNA por acción de una aminoacil-TRNA-sintetasa).
 Entre los aminoácidos debe formarse un enlace peptídico.

Características del ARNt:

1. Son cadenas sencillas que contienen entre 73 y 93
ribonucleótidos.
2. Contienen muchas bases poco comunes: ribotimidina,
pseudouracilo…
3. El extremo 5’ está fosforilado, generalmente pG
4. La secuencia 3’ es CCA
5. Alrededor de la mitad de bases, apareadas
6. El lazo anticodón consta de 7 bases: 5’-pirimidina-pirimidina-X
Y-Z-purina modificada-base variable-3´

Formación del enlace peptídico

La adición sucesiva de aminoácidos al extremo carboxilo de la
cadena peptídica en crecimiento se realiza mediante la formación de enlaces peptídicos.

3. Activación de los aminoácidos y ribosomas.

3.1 Activación de aminoácidos.

Las enzimas encargadas de unir específicamente a cada RNA transferente su aminoácido
correspondiente, son las aminoacil TRNA sintetasas : una enzima diferente para cada aminoácido. Son
enzimas que catalizan la unión covalente entre el extremo 3’-OH del TRNA (que siempre corresponde a
una A) y el grupo α-COOH del aminoácido que va a cargar. Esta reacción, que sería energéticamente
desfavorable, debe acoplarse a la hidrólisis de una molécula de ATP. En realidad se produce en dos
pasos sucesivos: primero, la activación del aminoácido como aminoacil-AMP liberando un PP2 del
enlace fosfoanhídrido y posteriormente la unión de éste aminoácido activado al extremo 3'-OH del
tRNA mediante la liberación del AMP. Las enzimas se encargan de unir correctamente el AMP al
aminoácido que encaja en su centro activo, y posteriormente lo acoplarán al tRNA correspondiente. Los
tRNA con los aminoácidos cargados deberán ir leyendo el mensaje en el mRNA mediante la
complementariedad del codón y el anticodón. El enlace éster formado entre el aminoácido y el tRNA
está activado energéticamente, lo que favorecerá la posterior formación del enlace peptídico.

3.2 Estructura y propiedades de los ribosomas.

Los ribosomas son complejos formados por RNA y proteínas.

Cada ribosoma consta de dos subunidades (la grande y la pequeña) cada una con un número y clase de
RNAr correspondiente además de proteínas ribosomales.

El RNAr juega un papel central en la función de los ribosomas (2/3 de la masa). La actividad peptidil-transferasa
corresponde al RNAr 23s. Las proteínas están localizadas en la superficie ribosomal y tienen una función
estructural. El ribosoma tiene tres sitios que pueden ser ocupados por TRNA:

→ sitio A (de aminoácido) donde solo podrá unirse(entrar) un aminoacil-TRNA ( TRNA portando un único
aminoácido)

→ sitio P (péptido) donde entrará la peptidil-TRNA, molécula de TRNA con el péptido naciente unido

→ sitio E (de Exit) donde encajará el factor de liberación o terminación (por donde sale el ARNt sin el aa).

1. La ruptura de un único enlace del rRNA de 16S bloquea la síntesis de proteínas

2. La omisión de proteínas concretas durante la reconstitución in vitro de las subunidades 30S provoca una
disminución de la actividad del ribosoma en lugar de una pérdida total de su funcionalidad
3. Una secuencia del rRNA 16S selecciona el lugar de iniciación en el mRNA
4. La base oscilante del tRNA que ocupa el lugar P del ribosoma está apareada con una base localizada en una
secuencia de 14 nucleótidos del rRNA 16S conservada durante miles de millones de años en la evolución
5. El extremo aceptor 3’ del tRNA (CCA) interacciona con una región conservada del rRNA de 23S
 6. Los ribosomas prácticamente desprovistos de proteínas aun pueden catalizar la formación de enlaces
peptídicos. Por el contrario, el rRNA de 23S es esencial para la actividad peptidil-transferasa
7. La mayoría de los antibióticos que interfieren en la síntesis de proteínas lo hacen mediante interacciones
específicas con el rRNA, no con las proteínas ribosómicas

El sitio unión de los TRNAS se encuentran en la interfase

entre las subunidades ribosomales mayor y menor.

Acoplamiento transcripción-traducción.

En procariotas la transcripción y la traducción se encuentran

acopladas en el tiempo. Mientras que en eucariotas debe
haber finalizado la transcripción para que se produzca la
traducción. En ambos tipos de organismo varios ribosomas
traducen al mismo tiempo un mismo segmento.

Otra diferencia en la traducción entre eucariotas y

procariotas es que los organismos procariotas son
policistrónicos mientras que los eucariotas son
monocistrónicos. Esto quiere decir que en procariotas, el segmento de ADN que se va a traducir está dividido en
varios fragmentos con espacio entre ellos. Mientras que en eucariotas el segmento de ADN que se va a traducir es
continuo. Por tanto, en eucariotas al traducir un solo fragmento de ADN se sintetizará una proteína, y en
procariotas se sintetizarán tres.

Tanto en eucariotas como en procariotas la síntesis de proteína se produce en la misma dirección. La traducción
comienza en el extremo N-terminal.

El ARNm se lee en sentido 5´ → 3´

También la asociación y disociación del ribosoma a los segmentos de mRNA es igual en ambos tipos celulares. Es
decir, el ribosoma siempre se asocia y disocia a los segmentos de RNA de la misma manera y en el mismo orden
tanto en eucariotas y procariotas.

INICIACIÓN

La secuencia Shine-Dalgarno (secuencia rica en purians) se encuentra a unos 10

nucleótidos hacia arriba (upstream) del codón de inicio.
Esta secuencia es la secuencia iniciadora en procariotas y es complementaria a una
secuencia presente en el rRNA 16S
El apareamiento entre estos RNAs posiciona el codón de iniciación en el sitio P del
ribosoma.
En procariotas el aminoácido iniciador es la N- formilmetionina. La metionina se formila
después de unirse al tRNA iniciador (tRNAfMet), diferente del tRNAMet. Existe una única
Met-tRNA-sintasa que carga el tRNAfMet y el tRNAMet

- Formación del complejo de iniciación 30S : participan 3 factores de iniciación:

IF1, IF2 e IF3
● El IF3 se une a la subunidad 30S y bloquea la unión con la subunidad grande
● El IF1 evita la unión de otros aa-tRNAs al sitio A
● Se une el mRNA a la subunidad 30S
● El IF2 (una proteína G con actividad GTPasa) transporta el fMet-tRNAfMet al
ribosoma

El formilmetionil-tRNAfmet es el único que entra por el sitio P del ribosoma; el resto entran por el sitio A

- Formación del complejo de iniciación 70S

● Cuando el apareamiento codón/anticodón se ha formado se liberan los

IF1 e IF3, y entra la subunidad 50S.
● La subunidad grande activa la actividad GTPasa de IF2, hidrolizando el
 GTP y liberándose.
● El ribosoma está preparado para la fase de elongación: > Sitios A y E libres > fMet-tRNAfMet, en el sitio P,
está apareado con el codón AUG.

ELONGACIÓN
- Unión del aa-tRNA al sitio A

El resto de aminoacil-tRNAs son transportados al sitio A del ribosoma asociados con el

factor EF-Tu. El EF-Tu también es una proteína G, y requiere GTP para unirse al
aa-tRNA y al ribosoma.

Cuando se ha formado correctamente el apareamiento codón/anticodón, el GTP se

hidroliza. La energía de la hidrólisis contribuye a la fidelidad de la síntesis.

Una vez hidrolizado el GTP, el EF-Tu sale del ribosoma. El EF-Tu unido a GDP no tiene
afinidad por los aminoácil- tRNAs. El intercambio de GDP por GTP es catalizado por el
EF-Ts

El EF-Tu no interacciona con el fMet-tRNAfMet → el fMet- tRNAfMet no es transportado

al sitio A.

- Formación del enlace peptídico

El rRNA 23S (interacciona con los extremos CCA de los tRNAs) es responsable de la
actividad peptidil-transferasa. El grupo amino del aa-tRNA del sitio A ataca el enlace
éster entre el tRNAfMet y la fMet del sitio P

- Translocación de m/tRNAs

El EF-G (translocasa) es una GTPasa que sólo se une al ribosoma cuando

tiene GTP unido
El EF-G se une al sitio A de la subunidad grande→ hidrólisis del GTP → cambio conformacional en
el EF-G que hace que ocupe el sitio A de la subunidad pequeña → disociación de EF-G → sitio A
libre.

TERMINACIÓN

Los codones de finalización no son reconocidos por los aa-tRNA y si por

proteínas denominadas factores de liberación (RFs).

Los RFs activan la hidrólisis del enlace entre el péptido y el último

tRNA: la actividad peptidil-transferasa transfiere el polipéptido a una
molécula de H2O en vez de a un aminoácido.

El factor de liberación del ribosoma (Ribosome Release Factor o

RRF) junto con el EF-G son necesarios para la liberación del mRNA, tRNA
y las dos subunidades ribosomales de manera dependiente de GTP

TRADUCCIÓN EN EUCARIOTAS

Mismos fundamentos estructurales y mecanísticos. Pasos más

complejos y participación de más proteínas

Principales diferencias

* Ribosomas de 80S (60S + 40S). En procariotes es 70S(50S + 30S)

* El Aa iniciador es la Met, y no la fMet

* El codón de inicio es siempre AUG: no tienen la secuencia rica en

purinas (secuencia Shine-Dalgarno). AUG más cerca del extremo 5’ del
mRNA

FACTORES DE INICIACIÓN:
 *La estructura del mRNA es circular: la cabeza 5’ (cap) y la
cola 3’ (poli-A) se unen al mismo complejo de factores. Tiene
un único factor de finalización

6. Traducción: coste energético.

Formación del aa-tRNA 2 ATP -> 2 AMP

Primera parte de la elongación 1 GTP -> 1 GDP

Translocación 1 GTP -> 1 GDP

Hidrólisis por parte de a la aa-TRNA 1 ATP -> 1ADP

sintasa de cada aa incorporado
erróneamente

7. Inhibidores de la síntesis de proteínas.

• Puromicina: análogo de los aa-TRNA tanto en eucariotas como en procariotas. Entra al sitio A del ribosoma,
se une covalentemente al último aa y provoca la finalización prematura de la síntesis proteica. En procariotas
provoca errores en la lectura de los mRNAs a bajas concentraciones.A altas concentraciones inhibe la
iniciación al interferir con la unión del fMet-tRNAfMet a los ribosomas.Inhibe la actividad peptidil transferasa
de la subunidad 60S (eucariotas)
• Tetraciclina: se una al sitio A de la subunidad 30S bloqueando la entrada de los aminoacil-tRNAs.
(procariotas, mitocondrias)
• Cloranfenicol: inhibe la peptidil transferasa de la subunidad ribosomal 50S. (procariotas, mitocondrias)
• Estreptomicina: en procariotas provoca errores en la lectura de los RNAms a bajas concentraciones. A altas
concentraciones inhibe la iniciación.
• Ciclohexamida: inhibe la actividad peptidil transferasa de la subunidad 60S (eucariotas) •
Toxina de la difteria: detiene la translocación y la síntesis proteica en eucariotas.
• Ricina: evita la unión de factores de elongación e inactiva todo el ribosoma. La ricina es la tercera sustancia
más tóxica conocida.
8. Procesamiento post traduccional
Muchas proteínas, una vez han sido sintetizadas, sufren modificaciones que provocan que dicha proteína se active
o inactive. Estas modificaciones pueden ser:

- Eliminación residuos N-terminal (fMet, Met, etc.)

• Modificaciones residuos N- y/o C-terminal (N-acetilación,
etc.)
• Pérdida de las secuencias señal (del extremo N-terminal).
• Modificaciones de aa individuales (fosforilación,
carboxilación, etc.)
• Adición de cadenas de carbohidratos (N- a Asn; O- a Ser o Thr).
• grupos isoprenil (Ras y de otras proteínas G, etc.)
• grupos prostéticos (Hemo a la hemoglobina o citocromo c).
• Procesamiento proteolítico (proinsulina, tripsinógeno, etc.) (zimógenos → proenzimas)
• Formación de puentes disulfuro