TEMA 6: SÍNTESIS DE PROTEÍNAS (TRADUCCIÓN).

La síntesis de proteínas se denomina traducción, porque es el proceso bioquímico que

traduce la información contenida en los ácidos nucleicos en la información contenida en
una secuencia de aminoácidos.
La traducción tiene lugar en los ribosomas.
Propiedades
- Unidireccional.
Lectura de mRNA: 5’  3’.
Síntesis de proteínas: NH2  COOH
- Selectiva: no se traduce todo el mRNA.
- Necesitan un adaptador: tRNA.
- Reiterativa (polirribosoma): un mismo RNA mensajero puede ser leído a la vez
por múltiples ribosomas formando esta estructura.

CÓDIGO GENÉTICO.
El código genético es la conexión que relaciona la secuencia de bases del DNA (o de
sus transcritos de RNA) con la secuencia de aminoácidos de las proteínas.
Características del código genético:
1. Tres nucleótidos codifican un aminoácido. Un aminoácido está codificado por
un grupo de tres bases, denominado codón.
2. El código no se solapa. Consideremos una secuencia ABCDEF, en un código
que no se solapa, ABC designa el primer aminoácido, y DEF el segundo.
Mientras que en un código que se solape, ABC designa el primer aminoácido y
BCD el segundo.
3. El código carece de signos de puntuación y se lee secuencialmente.
4. Tiene direccionalidad. El código se lee desde el extremo 5’ del RNA mensajero
hacia su extremo 3’.
5. El código genético está degenerado pero no es ambiguo. Degeneración significa
que algunos aminoácidos están codificados por más de un codón, puesto que hay
64 posibles tripletes de bases y solo 20 aminoácidos. De hecho, 61 de los 64
posibles tripletes especifican aminoácidos concretos (entre ellos, AUG que
codifica la metionina: señal de inicio) y tres tripletes (los denominados codones
stop: UAA, UGA y UAG) que designan la terminación de la traducción. Por
tanto, para la mayoría de aminoácidos hay más de un codón.
6. Es casi universal.
Dentro de un triplete, los nucleótidos más importantes que generalmente dejan ya
asignado el aminoácido son los dos primeros nucleótidos.
El RNA de transferencia actúa como molécula adaptadora entre el codón y el
aminoácido que especifica. Hay por lo menos una molécula de tRNA para cada
aminoácido. Estas moléculas tienen muchas características estructurales en común,

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como cabría esperar, ya que todas las moléculas de tRNA tienen que ser capaces de
interaccionar casi de igual forma con los ribosomas, con los mRNA y con los factores
proteicos que intervienen en la traducción. La estructura tridimensional de estas
moléculas tiene forma de L. Contienen muchas bases atípicas, algunas de ellas son
derivados metilados o dimetilados de A, U, C o G. En el anticodón (tRNA) el primer
nucleótido es el situado más a la derecha, ahí se situa el extremo 5’.

Las primeras dos bases de un codón se emparejan de forma estándar, el reconocimiento

es exacto. El apareamiento entre un anticodón no siempre es perfecto en la tercera
posición del codón. Se dice que existe un balanceo en esa posición:
Primera base del anticodón Tercera base del codón
C G
A U
U AóG
G UóC
I U, C ó A
I: inosina (hipoxantina + ribosa)

Por tanto, en lugar de 61 tRNA, solo se necesitan 32 (31 + 1 secuencia inicio). Esto
supone un ahorro para la célula.
Haciendo cálculos, debería de haber una secuencia stop cada 20 tripletes
aproximadamente. Pero los genes son marcos abiertos de lectura (ORF), por lo que se
busca una secuencia en la que cada 50 tripletes aproximadamente no haya un codón de
stop. A esto se le denomina un gen.
EDICIÓN DEL mRNA.
Es un proceso que pueden realizar algunas células para modificar puntualmente la
secuencia de mRNA después de ser sintetizado por la RNA polimerasa. Se producen
desaminaciones. Esto se hace para cambiar el sentido del mRNA, dando lugar a
productos distintos.

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PROCESO DE TRADUCCIÓN.
Antes de la iniciación es necesario la activación del aminoácido: consiste en la unión de
los aminoácidos a los tRNA para ser llevados hasta el ribosoma. Lo realiza la enzima
aminoacil-tRNA-sintetasa consumiendo una molécula de ATP y existe una de éstas para
cada uno de los 20 aminoácidos. La unión del aminoácido a su tRNA específico se hace
entre su grupo carboxilo (-COOH) y el radical -OH del extremo 3' del tRNA.
El primer aminoácido va a ser siempre una metionina en eucariotas y una
formilmetionina en procariotas. La enzima transformilasa es la encargada de catalizar el
proceso que transforma la metionina en formilmetionina. El tetrahidrofolato (TH4)
transporta un grupo formil que se pasa a la metionina, formando así el aminoácido
procariótico. En procariotas, existe una secuencia consenso encargada de indicar donde
se encuentra la secuencia inicial. Se denomina secuencia Shine – Dalgarno. Esta
secuencia complementa con una región del rRNA 16S. En eucariotas el inicio es el
primer AUG más cercano al extremo 5’.
Iniciación

En primer lugar el mRNA se une por la secuencia inicial llamada región líder a la
subunidad menor del ribosoma. Seguidamente la subunidad menor se mueve hacia el
codón de iniciación AUG, entonces se une el primer aminoacil-tRNA, que transporta
metionina en eucariotas y formilmetionina en procariotas. A este complejo se une la
subunidad mayor del ribosoma, consumiéndose
GTP y formándose el complejo ribosomal o
complejo activo que posee tres lugares de unión:
E-P-A.

La subunidad aparece unida a factores de

iniciación (IF), en este caso IF – 3 que impide que
las subunidades se unan antes de tiempo.

- Centro P o centro peptidil. En él se sitúa el

primer aminoácil – tRNA y formación del enlace peptídico.
- Centro A o centro aceptor. Donde se ubican los siguientes tRNA con sus
aminoácidos.
- Centro E o centro de salida. En él se sitúa en tRNA que acaba de aportar su
aminoácido y que está a punto de salir del ribosoma.

El codón AUG se queda en la subunidad del ribosoma denominada P. El sitio A a su

vez se encuentra inhibido por IF – 1.

La metionina y formilmetionina van a ser los únicos aminoácidos que entran

directamente al centro P, ya que todos los demás entrarán por el A.

El tRNA viene unido con IF – 2 y GTP. El GTP pasa a GDP y se esambla la subunidad
mayor formando el complejo de iniciación.

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Elongación

1. Entrada de un aminoacil – tRNA.

EF: factores de elongación (EF – tu y EF – ts).
La unión tiene lugar cuando el factor de elongación EF – tu se une a GTP y
juntos entran en el sitio A. la hidrólisis del GTP a GDP libera el factor EF – tu
del ribosoma dejando al aminoacil – tRNA en su sitio. El EF – ts actúa como
intercambiador de GDP y GTP.

2. Transpeptidación.
Peptidil – transferasa.
Se produce la unión del aminoácido entrante al peptidil – tRNA que estaba en el
sitio P. La formación de este enlace peptídico la lleva a cabo una rRNA 23S de
la subunidad grande del ribosoma.

3. Traslocación.
Factor de elongación  EF – G (es una GTPasa).
Mediante gasto de GTP se transloca un triplete, dejando libre el sitio A para la
entrada de otro aminoacil – tRNA.

Resumiendo, un nuevo aminoacil-tRNA llega al centro A (aceptor), se forma un enlace

peptídico entre la metionina o la formilmetionina, según se trate de eucariotas o
procariotas, y el aminoácido del aminoacil-tRNA colocado en el centro A. Reacción
catalizada por la enzima peptidil-transferasa. El tRNA del centro P se queda sin
aminoácido, se produce la traslocación ribosomal y este tRNA es expulsado desde el
centro E. El dipeptitidil-tRNA queda en el centro P, el centro A está libre y a él llegara
un nuevo aminoacil-tRNA. Este mecanismo se repite, con consumo de GTP, hasta
llegar a las secuencias de final de síntesis.

Terminación

Tiene lugar cuando se llega a uno de los codones de terminación: UAA, UGA y UAG.

RF: factor de terminación.

Por un lado libera el péptido formado y desensambla el ribosoma para que se despegue
del mRNA.

Si tenemos que poner por ejemplo 200 aminoácidos, habremos gastado un total de 400
ATPs (dos por aminoácido).

Síntesis de proteínas en eucariotas

Iniciación:

Se parece mucho a la iniciación de procariotas, pero al poseer una capucha y una cola
poli A el mRNA el proceso es algo diferente.

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En eucariotas el codón de iniciación siempre es AUG. A diferencia de las bacterias, los
eucariotas no tienen una secuencia específica rica en purinas en el lado 5’ para
distinguir los AUG iniciadores de los internos. Una subunidad del ribosoma, unida a la
metionina – tRNA se une al capuchón del extremo 5’ del mRNA eucariótico y busca un
codón AUG moviéndose paso a paso en dirección 3’.

En casi todos los casos, el mRNA eucariótico solo tiene un lugar de inicio y, por tanto,
sirve de molde para la síntesis de una única proteína (es monocistrónico). En cambio, un
mRNA bacteriano puede tener múltiples secuencias de Shine – Dalgarno y, por tanto,
múltiples lugares de inicio, de manera que puede servir como molde para la síntesis de
varias proteínas (policistrónico).

Los eucariotas utilizan muchos más factores de iniciación que las bacterias y sus
interacciones son mucho más complejas. Un factor de iniciador eucariótico se
representa por eIF.

- eIF – 4E : es una proteína que se une al capuchón 7 – metilguanina.

- PAB : se une a la cola poli A.
- eIF – 4G : se une a los dos factores de iniciación anteriores.

Elongación:

La fase es muy similar.

También cambian los nombres de los factores de elongación, que son homólogos a los
bacterianos:

- EF – tu  eEF1α
- EF – ts  eEF1βγ
- EF – G  eEF2

A diferencia de los procariotas, los ribosomas eucarióticos no tienen un sitio E

físicamente, pero si funcionalmente.

Terminación:

En eucariotas, la terminación la lleva a cabo un único factor de liberación, eRF1, a

diferencia de las dos que operan en bacterias.

INHIBIDORES DE LA TRADUCCIÓN EN PROCARIOTAS.

- Puromicina: estructura similar al 3’ del tRNA. Entra en el sitio A del ribosoma y

se forma un peptidil – puromicina que bloquea la traducción.
- Tetraciclina: se une al sitio A y lo bloquea, impidiendo la unión de los aminoacil
– tRNA.
- Cloranfenicol: inhibe la peptidil transferasa.

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INHIBIDORES DE LA TRADUCCIÓN EN EUCARIOTAS.

- Cicloheximida: actúa igual que el cloranfenicol en procariotas. Inhibe la

translocación.
- Toxina de la difteria: inhibe al factor eEF2.
- Ricina: despuriniza una adenina del rRNA 28S y así inactiva la subunidad 60S
del ribosoma eucariótico.

MODIFICACIONES POSTRADUCCIONALES.

Plegamiento de las proteínas

Lo hace con ayuda de las chaperonas. Las chaperonas se unen a regiones hidrofóbicas
para evitar un plegamiento incorrecto de la proteína. Cuando la proteína se pliega, las
regiones hidrofóbicas se quedan en el interior, formando el núcleo hidrofóbico.

Distribución de las proteínas en su destino

No todas las proteínas recién sintetizadas están destinadas a funcionar en el citoplasma.

En procariotas, una proteína sintetizada puede quedarse en el citoplasma o ser enviadas
a la membrana plasmática. Las células eucariotas pueden dirigir las proteínas a destinos
internos como las mitocondrias, el núcleo y el retículo endoplasmático. Para ello hay
dos mecanismos: por un lado, la proteína se sintetiza en el citoplasma y después la
proteína completa se envía a su destino intracelular de forma postraduccional. Las
proteínas destinadas al núcleo, cloroplastos, mitocondrias y peroxisomas son enviadas
mediante este proceso. Por otro lado, las proteínas que se dirigen al retículo
endoplásmico (RE), que es un extenso sistema de membranas. Nos vamos a centrar en
esta última ruta:

Un ribosoma se encuentra libre en el citoplasma a menos que sea dirigido al RE rugoso.

La síntesis de proteínas enviadas a su destino por medio de esta ruta comienza en un
ribosoma libre, pero poco después de comenzar, la síntesis se detiene hasta que el
ribosoma es conducido al lado citoplasmático del RE. Cuando se adhiere a la
membrana, la síntesis se reanuda. Conforme la cadena polipeptídica es formada, va
siendo transportada hacia el lumen del RE. Según se va formando la proteína, aparece
una secuencia señal que será reconocida por SRP (partícula de reconocimiento de
señal).

a) Mitocondrias: en el citoplasma se impide que se plieguen las proteínas, debido a

las chaperonas, que las llevan hasta las mitocondrias. Se introduce en la
mitocondria por transporte Tim y Tom. Dentro de la mitocondria se corta la
secuencia señal.
b) Núcleo: las importinas se unen a la proteína en el citosol y lo pasan a través del
poro nuclear con gasto de ATP. Una vez dentro, la secuencia señal no se corta.

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Maduración de las proteínas

- Glicosilación de proteínas.
Hay un alcohol (dolicol – fosfato) en la membrana del retículo endoplasmático.
Mediante gasto de UDP se le van añadiendo varios azúcares (N –
acetilglucosamina, manosa, …). El dolicol tiene movimiento flipflop en la
membrana del retículo endoplásmico, luego puede pasar todos estos azucares
hacia el lumen.

- Formación de puentes disulfuro.

Hay algunas enzimas que digieren la formación de puentes disulfuro.

Degradación de proteínas

Es importante el tiempo de reacción.

- Degradación citosólica: ubiquitinacion y vida media de las proteínas.

Se forma un proteosoma, que degrada la proteína dando lugar a aminoácidos.
Según como sea el extremo N – terminal, la vida media de la proteína será
diferente.