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3.

ESTRUCTURA Y
PROPIEDADES DE ACIDOS
NUCLEICOS
Dra. Zulema Bustamante Garcia
MSc.

COMPONENTES FUNDAMENTALES DE LOS


ACIDOS NUCLEICOS

• Bases nitrogenadas:

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Estructura de nucleósidos
• Nucleosido= base nitrogenada + azúcar

Nucleósidos que forman parte de


ácidos nucleicos

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Estructura de nucleótidos
• Nucleótido= nucleósido+ fosfato

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NUCLEOTIDOS en ADN

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Estructura de ácidos nucleicos aspectos
generales
Eucariotas Procariotas Virus Función
DNA En núcleo En la zona Dentro de Depositario
celular nucleoide la cápside y transmisor
(varios del citosol (solo en de la
cromosomas), (un algunos información
matriz cromosoma tipos de genética,
mitocondrial y varios virus) organizada
y en estroma de plásmidos) en genes
cloroplastos que
codifican
productos
génicos
(proteínas o
RNAs)
RNA En núcleo Dentro de Intervienen
celular En citosol la cápside en la
(temporalmente), (en otros transmisión
en citosol, en tipos de de la
matriz virus) información
mitocondrial y en desde el
estroma de DNA hasta
cloroplastos los
productos
génicos

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Niveles estructurales:

• 1.Estructura primaria: Por unión de numerosos


nucleótidos, mediante enlaces fosfodiester, en la
cadena se define la secuencia del ácido nucleico.
• 2.Estructura secundaria: Conformación local,
asociación de cadenas polinucleótidas, a través de las
bases nitrogenadas
• 3.Estructura de orden superior: Estructuras
tridimensionales que surgen a partir de los niveles
primarios y secundarios, como el
superenrollamiento.

Estructura primaria de los ácidos


nucleícos

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Formas de representación lineal

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MODELO DE WATSON Y CRICK
» Antiparalelismo de las dos hebras

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Parámetros cuantitativos de la doble
hélice

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Modelo espacial compacto B-DNA y A-
DNA

Modelo espacial compacto Z-DNA


• Encontrado en algunas regiones del DNA de células eucariotas

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Superficie de la molécula : Surcos del B-
DNA

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VARIANTES LOCALES DE LA ESTRUCTURA DEL
DNA
• Curvatura de la doble hélice
• Palíndromos: Regiones del DNA cuya secuencia es la
misma en ambas hebras: Son importantes debido a
que
– Son lugares diana para la enzimas de restricción
– Actúan como centros reguladores de la información
génica
– Dan lugar a estructuras secundarias peculiares en el DNA y
RNA

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Repeticiones invertidas

Repeticiones directas
• Cuando en un DNA hay repetición de una secuencia leida en el mismo
sentido. No son palíndromos porque no se cumple el criterio de igualdad
de secuencia leída en el sentido opuesto

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Repeticiones directas
• Tiene interés porque aparece con enorme
frecuencia en posiciones contiguas o
adiacentes (Repeticiones en tandem)
• O separadas por un número elevado de bases
( Repeticiones dispersas)

Repeticiones especulares
• Cuando la secuencia se repite en forma
invertida

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DESNATURALIZACION y RENATURALIZACION DEL DNA
• Los ácidos nucleicos se desnaturalizan (pierden su
conformación duplohelicoidal) por efecto de:
• -agentes químicos
• -agentes físicos
• La desnaturalización se debe a la rotura de puentes de
hidrógeno entre pares de bases y la perdida de interacciones
hidrofóbicas entre bases apiladas.
• Las dos hebras de DNA se separan y pasan a una
conformación al azar, sin alterar la estructura. En los RNAs,
afecta a rRNA y a tRNA

Propiedades del ADN: Desnaturalización del ADN

• Temperatura
• Bases (NaOH)
• Urea, formaldehido
• Formamida
• Producen la
desnaturalización el
ADN

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DESNATURALIZACIÓN POR ACIDOS Y BASES

• El apareamiento de bases se debilita por ácidos y


bases, pero los ácidos pueden también afectar a la
estructura primaria (fosfodiester y N glucosídicos).
• Las bases como el NaOH, son utilizadas en los
ensayos químicos , puesto que permite la
recuperación de la estructura inicial, es decir la
renaturalización.

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DESNATURALIZACION POR AGENTES QUÍMICOS

• También Algunas moléculas sencillas,


altamente polares con grupo amino y
carbonilo, producen la desnaturalización del
DNA: urea, formamida y formaldehído.

INFLUENCIA DE LA DESNATURALIZACION SOBRE LAS PROPIEDADES


DEL DNA

• -Aumento de la absorción óptica


• El DNA de hebra sencilla (cuando esta
desnaturalizado) absorbe Luz UV en una
magnitud similar a nucleotidos libres, es decir
aumenta la absorción de luz UV a 260 nm.
(efecto hipercrómico), en relación al DNA de
doble hebra .

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TEMPERATURA DE FUSION
• Es la temperatura en
la cual el 50% del ADN
se desnaturaliza

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• Cuanto más abundante
son las C = G, mayor
Tm,
• debido a que requieren
mayor energía para
disociarse.

Dependencia de Tm
Temperatura de fusión
con el contenido
del DNA (Tm)
en G+C del DNA

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-Disminución de la viscosidad

• Al desnaturalizar el ADN, disminuye la


• Viscosidad.

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