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es/doc/4509298/estructura-eucariota-estructura-genoma-procariota

Consulta: 07-12-2019

Estructura Estructura
Genoma Procariota Genoma Eucariota

• Organización compacta (poco • Genoma compuesto por 2 o

espacio entre genes) más moléculas de ADN linear
(cromosomas)
•Información adicional en plásmidos
• Organización menos compacta
• DNA no codificante en pequeños
segmentos dispersos en el genoma • DNA repetitivo (disperso y en
(<11%) tandem)
• No hay intrones • Intrones
• Organización en operones (E.coli
aprox 600 operones con 2 o más
genes)

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 Estructura Genoma Procariota
• DNA genómico  Nucleoide : empaquetamiento en forma organizada
•Molécula de DNA circular única (80%) + Proteínas básicas asociadas

Super-enrollamiento
(agregado de giros al DNA)

•DNA girasa (topoisomerasa II)

•DNA topoisomerasa I

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 Nucleoide
• Organización de dominios : aprox. 400 dominios: Loops super-enrollados (10-
40kb)

•DNA genómico unido a un “core” proteico a partir del cual radian los loops

•Proteínas asociadas: DNA girasa, DNA topoisomerasa I, más al menos 4 proteínas

 HU la más abundante (Tetrámeros)

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 Variaciones en Procariotas

•Algunos genoma linear Ej: Borrelia burgdorferi

•Algunos genomas de tamaño mayor Ej. B.megaterium (30 x 106pb)

•DNA circular o linear subgenómico  genoma multipartito (Brivio

cholera, Borrelia)

•Archae
 empaquetamiento con proteínas similares a Histonas

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 Genoma eucariota nuclear
• Moléculas de DNA linear
 cromosomas

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 Características de los cromosomas

• Centrómero:
– DNA centromérico: secuencias
repetitivas
• humanos DNA alfoide: repeticiones de
171pb (1x106pb)
• Levaduras : sec.mínima 125pb

– Proteínas unidas al centrómero

• humanos al menos 7 proteínas, una de
ellas CENP-A reemplaza a histona H3

– Cinetocoro: unión de microtúbulos

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7
•Telómeros
– Indica el extremo de los cromosomas y los protege
• Evita recombinación entre cromosomas
• Evita la unión de extremos de cromosomas
– Replicación completa de los cromosomas
– Organización funcional de cromosomas en el Núcleo

–DNA repetitivo
•Humanos: cientos de copias de la secuencia
– 5’-TTAGGG-3’
–Extensión del extremo 3’ como simple cadena
–Proteínas teloméricas:
•TRF1 (regula el largo de los telómeros)
•TRF2 (mantiene la extensión de DNA simple cadena, T loop)

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9
 Cromatina : 50% DNA + 50% Proteínas básicas (Histonas)

1er nivel de organización: NUCLEOSOMAS

ADN: aprox 200pb

• ADN asociado al core 146 pb

• ADN linker 10-90 pb

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 Histonas core:
H2A H2B H3 H4

Histonas linker:
H1 a-e, H1º, H1t y H5

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12
Metilación y Acetilación: amino
libre de Lisina
Metilación: en Arginina y Histidina
Fosforilación: grupos OH de
Serina y Histidina

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 Modificaciones de Histonas

• Modificaciones:
– Acetilación/ Deacetilación de residuos Lys (HAT / HDAC)

• neutralización de cargas positivas de Histonas

– Metilación de Lys y Arg

– Fosforilación de Ser y Thr

• mitosis y meiosis: condensación de cromosomas

– Ubiquitinación

– ADP ribosilación

• Variantes de Histonas
– Reemplazan a H3 o H2A en algunos nucleosomas
• CENP-A en centrómeros

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Nucleosomas y fibra de 30nm

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•Unión del DNA a la matriz nuclear : MAR (sec. ricas en AT)
•Dominios estructurales y funcionales

Dominios estructurales
•Loops de ADN

Loops de ADN 40-

Dominios funcionales 100kb
•Regiones sensibles a
DNasa
•Límites: regiones
aislantes, 1-2kb
(insulator)

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Empaquetamiento en
cromosomas
Mitóticos

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18
 Heterocromatina /Eucromatina

Heterocromatina
•Principalmente DNA Eucromatina
repetitivo (Centrómeros, •Sensibilidad a nucleasas
Telómeros, Transposones)
•Alta densidad génica
•Baja densidad génica
•DNA potencialmente activo
•Densamente empaquetada
transcripcionalmente
•Sin sitios HS
•Histonas acetiladas
•Ordenamiento regular de
•Metilación Lys-4 H3
nucleosomas
•DNA no metilado
•Replicación tardía en fase S
•Crossing-over reducidos

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• Heterocromatina: Modificaciones covalentes características

– Histonas desacetiladas
– Metilación Lys-9 H3 (unión prot HP-1)
– Metilación DNA (CpG)

• Heterocromatina constitutiva
– Grandes regiones principalmente secuencias repetitivas
• Telómeros, centrómeros, transposones

• Heterocromatina Facultativa
– Regiones genómicas empaquetadas en algunos grupos de células o en
1 solo cromosoma homólogo
• Cromosoma X

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Cromosomas sexuales
Cromosoma X
•1000-2000 genes
•La mayor parte de los genes sin
contraparte en el Y (solo 9 genes
descriptos)
•Inactivación de un cromosoma
Cromosoma Y
•Pequeña reg de homología con
cromosoma X
•95% no autosomal (seq
transpuestas de X, seq de X
degeneradas, Amplicon (8 bloques
palindrómicos)
•Pocos genes (aprox 156, la mitad
pseudogenes)
•60 genes específicos de macho que
se expresan en testículo (gen SRY)
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Heterocromatina Facultativa
Inactivación del cromosoma X

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23
 Inactivación del cromosoma X
Modificación del estado de la cromatina (actividad de acetilasas,
metilasas). Inicio en un locus específico Xic y progresión a todo el
cromosoma. Sitio de iniciación Xic: produce un ARN no traducido ARN Xist.

ARN Xist: permanece unido al ADN, recubrimiento del cromosoma Xi.

Señal para el inicio de modificaciones de la cromatina (hipoacetilación, metilación
del ADN)

Gen Tsix: Transcripto antisentido

Regulador negativo de Xist: Regula la elección del cromosoma X que permanece activo

Región Xpr: sensado del número de cromosomas X. Coordina la expresión

reciproca de Xist/ Tsix

Metilación del ADN, bajos niveles de acetilación de Histonas, bajos niveles de metilación de
Lys-4 de histona H3, y altos niveles de metilación de Lys-9 de histona H3, asociados a
silenciamiento génico. Adicionalmente, los nucleosomas del Xi presentan una variante de
histona llamada macroH2A.

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 Imprinting
Genes cuya expresión está determinada por su origen parental.
Expresión exclusiva del alelo materno por imprinting del paterno o
viceversa

Asimetría en la función de los genomas

parentales

Mecanismo de imprinting:
Iniciado durante gametogénesis en forma diferencial en espermatogénesis y
ovogénesis. Genes “imprinted” en general agrupados, regulación coordinada
a partir de centros IC que determinan regiones de metilación diferencial
DMR
 Metilación del ADN en CpG en los promotores de los genes  inactivación
 Demetilación  ARN antisentido inactivación

Formación de células germinales primordiales: Remoción de todo imprinting

Los patrones de metilación genómica de ovocitos y espermatozoides

depende de la actividad de ADN metiltransferasas Dnmt

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