DEPARTAMENTO ACADÉMICO DE QUÍMICA BIOLÓGICA

Y FISIOLOGÍA ANIMAL

BIOQUÍMICA

❑ Estudio de ADN. Generalidades. Estructura. Replicación.

❑ Código genético
 El DNA y el RNA son polímeros lineales largos, llamados ácidos nucleicos que contienen
información que puede ser transmitida de una generación a la siguiente.

Estas moléculas están constituidas por nucleótidos

La información genética está almacenada en la secuencia de las bases dispuestas a lo

largo de una cadena de ácido nucleico.

Los genes especifican los tipos de proteínas que fabrican las células, lo que se da mediante
procesos de transcripción y traducción (flujo de información genética o expresión génica):
Transcripción Traducción
DNA RNA Proteína

Este flujo de información depende del código genético, que define la relación entre la
secuencia de bases (del DNA ó del mRNA) y la secuencia de Aas de una proteína. Una
secuencia de 3 bases, llamada codón, especifica un Aminoácido.
Un ácido nucleico está formado por cuatro tipos de bases unidas a un eje
de azúcar-fosfato

Estructura polimérica
de los ác. nucleicos.

Ejes del DNA y RNA. Los ejes

están formados por uniones
fosfodiéster de 3´ a 5´.
El RNA y el DNA difieren en un azúcar y en una de las bases
Los nucleótidos son las unidades monoméricas de los ácidos nucleicos

Nucleósido:

Nucleótido:
Estructura de una cadena de DNA. La cadena tiene un extremo 5´, que normalmente
está unido a un fosfato; y un extremo 3´ que presenta normalmente un OH libre. Por
convenio, la secuencia de bases se escribe en la dirección 5´ 3´.
 Parejas de bases complementarias forman una doble hélice

La estructura doble-helicoidal del DNA facilita la replicación del material genético, es

decir, la generación de dos copias del ácido nucleico a partir de una sola.

La doble hélice es estable gracias a puentes de hidrógeno e interacciones hidrofóbicas

Mediante difracción de rayos X de fibras de DNA,

se determinó que estaba formado por dos cadenas
que marcaban una estructura helicoidal regular.
Watson y Crick, utilizando los patrones de
difracción, determinaron las características del
DNA:
1. Hay dos cadenas helicoidales de polinucleótidos
enrolladas a lo largo de un eje común (cadenas
transcurren en posiciones opuestas).
2. Los ejes azúcar-fosfato se sitúan en el exterior.
3. Las bases son casi perpendiculares al eje y las
bases adyacentes están separadas 3,4 A°.
4. El diámetro de la hélice es de 20 A°. Reglas de
emparejamiento de bases: A-T, G-C (unidas por
puentes de H).
Estructura de los pares de bases
propuestos por Watson y Crick.
1900
1944
She died of pneumonia on August 8, 2003, at the age of 75
 La doble hélice facilita la transmisión precisa de la información hereditaria

La secuencia de bases de una hebra de la doble hélice

determina de forma precisa la secuencia de la otra hebra.
La separación de la doble hélice en sus dos cadenas
componentes, producirá dos moldes de hebra simple
sobre los cuales se formarán nuevas dobles hélices; al
replicarse el DNA, una de las cadenas de las moléculas de
DNA descendientes se sintetizará de novo y la otra se
transmitirá intacta de la hebra parental.

Diagrama de replicación semiconservativa

 La doble hélice se puede fundir reversiblemente

Durante la replicación del DNA y otros procesos, deben separarse las dos hebras de la
doble hélice al menos en una región localizada.

Las dos hebras de la hélice de DNA se separan cuando se rompen los puentes de hidrógeno
que unen los pares de bases.
En laboratorio se puede deshacer la doble hélice calentando una disolución de DNA o bien
añadiendo un ácido o un álcali para ionizar las bases.
La disociación de la doble hélice normalmente se llama fusión porque tiene lugar de forma
relativamente brusca a una T° determinada: temperatura de fusión (Tm): aquella T° en la
cual se deshace la mitad de la estructura helicoidal. Cuando la T° desciende por debajo de la
Tm las hebras se reasocian.
En las células, la doble hélice no se funde por calentamiento sino por acción de las helicasas
(que utilizan ATP).
 Algunas moléculas de DNA son circulares y están superenrolladas

Las moléculas de DNA de los cromosomas humanos son lineales.

Por microscopía electrónica se ha determinado que moléculas de DNA de otros organismos
son circulares (referido a la continuidad más no a la forma geométrica).
El eje de la doble hélice de DNA circular puede a su vez estar enrollado formando una
superhélice (conveniente por dos razones: se obtiene una forma más compacta y se puede
afectar la interacción con otras moléculas).

Micrografía electrónica
de DNA circular de la
mitocondria. A. Forma
relajada B. Forma
superenrollada.

A B
 Los ácidos nucleicos de hebra simple pueden adoptar estructuras complicadas

Los ác. nucleicos de hebra simple, a menudo se repliegan sobre sí mismos para formar
estructuras definidas, que son importantes en el ribosoma.
La estructura más simple es la horquilla, que se forma cuando dos secuencias
complementarias de una misma hebra simple se unen dando lugar a una estruct. de
doble hélice.

Estructuras en horquilla
 Los ácidos nucleicos pueden adoptar estructuras más complejas a
través de interacciones entre bases más alejadas. Los iones
metálicos como el Mg2+ ayudan a la estabilización.

Bajo esta estructura el RNA puede realizar ciertas funciones que

el DNA no puede y que algunas proteínas tampoco.

Estructura compleja de
una molécula de RNA
 Las polimerasas replican el DNA a partir de las instrucciones de moldes

Las DNA polimerasas promueven la formación de enlaces entre las unidades del eje del DNA

Las DNA polimerasas catalizan la formación de enlaces fosfodiéster

Las DNA polimerasas catalizan la adición de los desoxirribonucleótidos a una hebra

de DNA molde. La síntesis de DNA tiene las sgtes características:
1. Se requiere de los 4 precursores activados: los desoxirribonucleósidos 5´-
trifosfatos: dATP, dGTP, dCTP, dTTP, así como de Mg2+ .
2. La nueva cadena de DNA se ensambla directamente sobre un molde preexistente
de DNA. Las DNA polimerasas catalizan la formación de un enlace fosfodiéster, es
un enzima dirigido por un molde.
3. Las DNA polimerasas requieren un cebador o “primer” para empezar la síntesis.
La elongación de la cadena de DNA se realiza en la dirección 5´ 3´.
4. Muchas DNA polimerasas pueden corregir los errores en el DNA eliminando los
nucleótidos mal emparejados.
Reacción de polimerización catalizada por las DNA polimerasas

Replicación del DNA. Formación del enlace fosfodiéster

 Los genes de algunos virus son de RNA

Los genes de todos los organismos celulares son de DNA, lo mismo ocurre en algunos
virus, pero en otros es el RNA. Ejm:
Virus del mosaico del tabaco.
Retrovirus (Ejm. VIH-1).
La expresión génica es la transformación de la información del DNA en moléculas funcionales

La expresión génica no es más que:

Transcripción Traducción
DNA mRNA Proteína

Varios tipos de RNA desempeñan una función clave en la expresión génica

Los RNA ejercen diversas funciones desde la catálisis hasta la regulación. Existen diversos
tipos:
1. El RNA mensajero (mRNA) es el molde para la síntesis de proteínas o traducción.
2. El RNA de transferencia (tRNA) transporta los Aas en forma activada al ribosoma para
la formación de enlaces peptídicos (dictado por el mRNA), existe al menos un tipo
por cada uno de los 20 Aas.
3. El RNA ribosómico (rRNA), es el componente principal de los ribosomas, tiene
función catalítica y estructural.
4. El RNA nuclear pequeño (snRNA), participa en el empalme de los exones del RNA.
5. Los microRNA (miRNA), moléculas pequeñas de RNA, se unen a mRNA
complementarias e inhiben su traducción.
6. Los RNA pequeños de interferencia (siRNA), moléc. pequeñas de RNA que se unen al
mRNA y facilitan su degradación.
 Todo el RNA celular se sintetiza por las RNA polimerasas

La síntesis de RNA a partir de un DNA molde se denomina transcripción y está catalizada por
el enzima RNA polimerasa. Este enzima cataliza la iniciación y elongación de las cadenas de
RNA, requieren de los sgtes componentes:
1. Un molde, de preferencia DNA de doble hebra, tb DNA de hebra simple, no RNA ó
híbrido RNA-DNA.
2. Precursores activados: los 4 ribonucleósidos trifosfato: ATP, GTP, UTP y CTP.
3. Un ion metálico divalente: Mg2+ ó el Mn2+ .
Existen semejanzas con la síntesis de DNA:
La dirección de la síntesis es 5´ 3´.
Ataque nucleofílico del grupo 3´-OH de la cadena en crec. sobre el fosfato del nucleótido
recién adicionado.
Síntesis favorecida por hidrólisis de pirofosfato.
Toman instrucciones de un DNA molde.
Al contrario del DNA polimerasa, el RNA polimerasa no requiere de cebador y no tiene
capacidad nucleásica (no corta los nucleót. mal emparejados).
Complementariedad entre mRNA y DNA
Mecanismo de transcripción en la reacción de elongación catalizada por el RNA polimerasa
La transcripción comienza junto a centros promotores y finaliza en los centros de terminación

El RNA polimerasa debe detectar y transcribir genes específicos situados en tramos

enormes de DNA.
¿Cómo saber donde se inicia la transcripción?
Los DNA moldes contienen regiones llamadas centros promotores, que se unen
especif. a la RNA polimerasa.

Lo importante es saber que unas señales concretas de iniciación y terminación de la

transcripción, están codificadas en el molde de DNA.
 El RNA discurre a lo largo del molde de DNA hasta alcanzar la secuencia de terminación

En procariotas: la señal de terminación consiste en una horquilla de bases emparejadas

(ricas en G y C) en la molécula de RNA recién sintetizada y ésta se disocia del RNA
polimerasa cuando a la horquilla le sigue una hilera de residuos U.
Otras veces la terminación de la sínt. de RNA se da por acción de la proteína ro (ρ).
No se conoce mucho sobre la terminación de la transcripción en eucariotas.

Señal de terminación en procariotas

 En eucariotas, el RNA mensajero se modifica después de la transcripción

Una estructura en forma de cofia se une al extremo 5´, y una secuencia de

adenilatos, la cola poli (A), se añade al extremo 3´.
 El RNA de transferencia es la molécula adaptadora en la síntesis de proteínas

El tRNA contiene un centro de unión del aminoácido y un centro de reconocimiento del

molde (mRNA). Cada molécula de tRNA transporta un Aa específico en forma activada
hasta el lugar de la síntesis de la proteína.

5´

3´

Unión del Aa catalizada por aminoacil-tRNA Anticodón: Sec. de 3 bases que reconoce una sec.
sintetasa (específ. para cada Aa), requiere de ATP. complementaria de 3 bases en el mRNA (codón).
Los aminoácidos se codifican por grupos de tres bases comenzando desde un punto fijo

El código genético es la relación entre las secuencias de bases en el DNA (o de su RNA

transcrito) y la secuencia de Aas en las proteínas.
El código genético pta las sgtes características:
1. Tres nucleótidos codifican un Aa. Un Aa está codificado por un grupo de 3 bases
o codón.
2. El código no se solapa. Si se tiene una secuencia de bases: ABCDEF, en un código
con solapamiento ABC codificará el primer Aas, BCD codificará el sgte y así suces.;
en un código sin solapamiento: ABC codificará el 1° Aas, DEF el 2° y así suces.
3. El código no tiene puntuación. La secuencia de bases se lee secuencialmente.
4. El código genético está degenerado. Algunos Aas están codificados por más de un
codón, existen 64 posibles tripletes: 61 especifican para un Aa en particular (más
de un triplete para un mismo Aa) y 3 (codones stop) designan la terminación de la
traducción.
Los 64 codones se han descifrado. Sólo el triptófano y la metionina están codificados por un
solo triplete; el resto por dos ó más tripletes, ejm: Leu, Ser y Arg codificados por 6 codones.
Los codones que codifican para el mismo Aa se llaman sinónimos, la mayoría difieren en la
última base del triplete. La degeneración reduce al mínimo los efectos de las mutaciones.
 El RNA mensajero contiene señales de iniciación y de parada para la síntesis de proteínas

El mRNA se traduce a proteínas en los ribosomas, grandes complejos moleculares compuestos

de proteínas y RNA ribosómico.

En procariotas, la iniciación de la síntesis proteica comienza con un Aa modificado: la

formilmetionina, transportado por un tRNA específico (tRNA iniciador) que reconoce
el codón AUG y menos frecuente al GUG; esto es sólo una parte de la señal de
iniciación, ya que el codón viene precedido por una secuencia rica en purinas (sec.
Shine-Dalgrano que puede emparejarse con una sec. complementaria de rRNA).
 En eucariotas, la señal de iniciación para la síntesis de proteínas es el AUG más próximo
al extremo 5´ de una molécula de mRNA, este codón es leído por un tRNA iniciador
cargado con Met.

Los codones UAA, UAG y UGA designan la terminación de la cadena, estos no son leídos
por tRNA pero sí por proteínas específicas llamadas factores de liberación, la unión de éstos
a los ribosomas libera la proteína recién sintetizada.

El código genético es prácticamente pero no absolutamente universal

 La mayoría de los genes de eucariotas son mosaicos de intrones y exones

En bacterias, las cadenas polipeptídicas están codificadas por una disposición contínua de
codones, mientras que en los organismos superiores se descubrió que diversos genes
eran discontinuos (formados por intrones, que no codifican proteínas y por exones). ¿En
qué fase se eliminan los intrones?
 El procesamiento del RNA genera el RNA maduro

Las cadenas de RNA recién sintetizadas se denominan pre-mRNA o transcritos primarios

y deben pasar por un proceso de maduración, en el cual se eliminan aquellas regiones
denominadas intrones mientras que se mantienen los exones (mRNA maduro).

El entrecortado o splicing es realizado por los

“spliceosomas” (asociación de proteínas y
pequeñas moléculas de RNA de función catal.)
que reconocen las señales del RNA naciente
que especifica los puntos de corte así como la
señal de empalme.

Secuencia consenso para el corte y empalme de mRNAs

Transcripción y procesado del gen de la β-globina