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OBJETIVOS ESPECFICOS
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Clasificar a los microorganismos en base a las caractersticas morfolgicas y/o fisiolgicas, utilizando los esquemas correspondientes.
9.
Discutir las bases de la clasificacin de los virus y cmo ellas difieren de las usadas
para la clasificacin de los otros microorganismos.
Clasificacin
Nomenclatura
Identificacin
Posteriormente, nuevas tcnicas de biologa molecular se usaron para estudiar la composicin del ARN ribosmico y revelaron que hay realmente dos tipos de clulas procariotas (arqueas y bacterias) y un tipo de clulas eucariotas. En 1978, Carl R. Woese propuso elevar
los tres tipos
de clulas a un nivel por encima del reino, llamado dominio y de ah surgi el sistema de clasificacin de tres dominios que se conoce en la actualidad y que comprende:
Bacteria (procariotas unicelulares cuya pared celular contiene peptidoglucano)
Arquea (procariotas unicelulares cuya pared celular no contiene peptidoglucano)
Eukarya (todos los eucariotas)
Los virus no son asignados a ningn reino ya que ellos son microorganismos acelulares
que comparten slo unas pocas caractersticas de seres vivientes.
Archaea
Bacterias
Proteobacterias
Espiroquetas
Eucarya
Animales
halobacterias
Methanosarcina
Bacterias
Grampositivas
Cianobacterias
Methanobacterium
Methanococcus
Flavobacterias
Hongos
Thermoplasma
Bacterias Verdes
Thermococcus
no azufradas
Thermoproteus
Thermotoga
Plantas
Mohos
mucosos
Entamoeba
Ciliados
Flagelados
Tricomonas
Pyrodictium
Microsporidia
Diplomonas
Aquifex
Adaptado de G..J. Olsen y C. R. Woese. Ribosomal RNA: A key to Phylogeny en The FASEB 7:113-123, 1993.
ENFOQUE CLSICO
Entre las caractersticas no morfolgicas que tienen valor taxonmico tenemos: composicin qumica de la pared celular, inclusiones citoplasmticas y productos de reserva,
composicin qumica de la cpsula, pigmentos, requerimientos nutricionales, capacidad
para usar diferentes fuentes de carbono, nitrgeno, azufre y energa, productos de
fermentacin, necesidades gaseosas, requerimientos y tolerancias de temperatura y pH,
sensibilidad a antibiticos, patogenicidad, relaciones simbiticas, caractersticas inmunolgicas, hbitat, etc.
Algunas de estas caractersticas pueden no ser aplicables en un grupo en particular, dependiendo del caso variarn el nmero y tipo de los datos recopilados para efectuar una
buena clasificacin.
El enfoque clsico es casual y no sistemtico, pero resulta muy til para algunos grupos de
bacterias.
2. ENFOQUE GENTICO O MOLECULAR
Tiene por objeto determinar el grado de relacin gentica de diferentes organismos. Este
enfoque involucra estudios diseados para demostrar directa o indirectamente que las secuencias de bases del ADN de dos organismos son semejantes o idnticas, lo cual puede
hacerse de varias maneras.
Calentar para
separar las cadenas
Determinar el grado de
hibridizacin
Hibridizacin completa
Microorganismos
idnticos
Hibridizacin parcial
No hibridizacin
Microorganismos relacionados
Microorganismos no
relacionados
Estas tcnicas de biologa molecular han dado lugar a nuevas herramientas moleculares que
se han adoptado rpidamente al campo del diagnstico microbiolgico. Este nuevo enfoque
utiliza factores genotpicos ms que fenotpicos para identificar microorganismos especficos.
Un ejemplo de estas tcnicas modernas de identificacin lo constituyen las sondas de cido
nucleico, son oligonucletidos cortos y de secuencia nica que se emplean como sonda de
hibridizacin para la identificacin de microorganismos. Estos mtodos son altamente sensibles y especficos.
Plasmidio
Fragmento
de ADN de
Salmonella
La
muestra
de
bacterias
desconocidas se recogen sobre
un filtro
Un fragmento de ADN
de Salmonella es
clonado en E. coli
El ADN se separa en
cadenas sencillas
Sonda de ADN
fluorescente
ADN de Salmonella
Ejemplo
de sondas
de ADN
la identificacin
bacteriana
Usodel
deuso
sondas
de ADN
parapara
identificar
bacterias
Fig. 10.16 Microbiology An introduction Tortora et al 7th edition
2.3
Hay muchos mtodos para comparar protenas, de los cuales el ms seguro es la determinacin de la secuencia de aminocidos de la protena purificada. Como esta secuencia
est directamente relacionada con la secuencia de bases de los genes que controlan
su sntesis, secuencias similares de aminocidos en protenas funcionalmente similares
indican que los organismos tienen secuencias similares de bases para estos genes.
3.4
Recombinacin gentica:
Sin embargo como incluso bacterias muy relacionadas no pueden aparearse por diversas
razones, el anlisis de la recombinacin gentica hace posible el reconocimiento de semejanzas pero no de diferencias, puesto que si no ocurre recombinacin, no se puede decir
por esta sola razn que no estn relacionadas.
NOMENCLATURA
Es el darle nombre a los microorganismos y su objetivo es precisamente elegir el nombre
adecuado y nombrar el germen siempre por el mismo nombre evitando as confusiones.
Es importante diferenciar entre taxonoma y nomenclatura, ya que nomenclatura es nicamente darle el nombre al organismo luego que se ha completado el trabajo taxonmico.
Para nombrar las bacterias se usa el esquema binomial en el cual el nombre de la bacteria
est constituido por 2 palabras; la primera es una palabra en latn o latinizada, que se escribe con la primera letra en mayscula e indica el GNERO, usualmente esta palabra proviene del nombre del descubridor u otro cientfico relacionado o describe la morfologa del
microorganismo. La segunda palabra indica la ESPECIE, se escribe con minscula, y es
usualmente descriptivo refirindose al color, origen, patogenicidad, etc.
Ejemplo: Bacillus subtilis
Gnero
Especie
Los nombres cientficos de las bacterias deben ser escrito en letra cursiva (Itlica) o en su
defecto cada palabra debe ser subrayada.
Las reglas y mtodos del sistema de Nomenclatura Bacteriana se encuentran en el Cdigo
Internacional de Nomenclatura Bacteriana.
IDENTIFICACIN
La informacin acerca de los microorganismos obtenidas de los mtodos ya citados, nos
permite no slo la clasificacin de nuevos microorganismos sino tambin la identificacin de
los microorganismos ya conocidos, aislados de muestras de orgenes diversos.
Dos de los mtodos utilizados para la identificacin son: las claves dicotmicas y los cladogramas.
Claves dicotmicas
Con el uso de las claves dicotmicas, la identificacin se basa en preguntas sucesivas, y
cada pregunta tiene dos respuestas posibles. Despus de responder una pregunta, se dirige
al investigador a otra pregunta hasta que el microorganismo es identificado. Aunque estas
claves a menudo tienen poco que ver con las relaciones filogenticas, son de gran valor para
la identificacin.
Cladogramas
Son mapas o diagramas, como el que se presenta en la pgina 3, que muestran relaciones
evolutivas entre los microorganismos, basados principalmente en la secuenciacin del ARN
ribosmico.
Grupo taxonmico
Orden
Familia
Tribu
Gnero
Sufijo
-ALES
-ACEAE
-EAE
Ejemplo
Pseudomonadales
Pseudomonadaceae
Pseudomonadeae
Pseudomonas
Ramificaciones
Tipo de esporas
Caractersticas de las colonias, las que se estudian macroscpicamente
La clasificacin de las levaduras usa principalmente el enfoque clsico con un gran nfasis
en pruebas bioqumicas de utilizacin de carbohidratos.
El esquema taxonmico tradicional empleado para la clasificacin de los hongos los ubica en
cuatro divisiones, basndose fundamentalmente en variaciones en la reproduccin sexual.
Divisin
ESPORAS
ASEXUALES
Zygomycota (Zi- Endgenas (en
gomicetos)
sacos)
Ascomycota
Exgenas
(Ascomicetos)
(en las puntas o
lados de las
hifas)
Basidiomycota
Exgenas
(Basidiomicetos)
(en las puntas o
lados de las
hifas)
Deuteromycota
Exgenas
(Deuteromicetos) (en las puntas o
(Hongos imperfec- lados de las
tos)
hifas)
ESPORAS
SEXUALES
Oosporas
Zigosporas
Ascosporas
MICELIO
EJEMPLOS
Cenoctico
Rhizopus, Mucor
Septado
Penicillium,
Levaduras
Basidiosporas Septado
Septado
Aspergillus,
Setas
Royas
Tizones
La mayora de los patgenos de humanos y
animales
Virus animales
b.
Virus de plantas
c.
De ahora en adelante, nos vamos a ocupar de los virus animales, debido al gran nmero de
enfermedades de origen viral que afectan al hombre y a los animales.
Caractersticas primarias
1.1 Organizacin de la cpsida
a. Forma y tamao de la partcula viral
b. Nmero de capsmeros
c.
Presencia o ausencia de cubierta lipdica
d. Simetra de la nucleocpsida
1.2 Estructura del cido nucleico
a.
Tipo de cido nucleico
b.
Nmero de cadenas
c.
Peso molecular del cido nucleico
d.
Nmero aproximado de genes
1.3 Presencia de transcriptasa
2.
Caractersticas secundarias
2.1
Husped
a. Especie
b. Tejido
2.2
Modo de transmisin
2.3
Caractersticas inmunolgicas
Los virus no se nombran usando el esquema binomial clsico que se utiliza para los otros
microorganismos, a los virus se les denomina con el nombre de la enfermedad que causan,
por ejemplo, virus de la rabia, virus del sarampin, etc.
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BIBLIOGRAFA
American Society for Microbiology. International Code of Nomenclature of Bacteria. 1976.
Black J. G. Microbiology. Principles and Explorations. Fourth Edition 1999 John Wiley &
Sons, Inc.
Davis, Dulbecco, Eisen and Ginsberg. Microbiology.
Company 1990.
Fourth
Edition. J. B. Lippincott
Madigan, Martinko y Parker. Brock Biologa de los Microorganismos. Octava Edicin 1998.
Prentice-Hall.
Olsen G.J. y Woese C.R. (1993). Ribosomal RNA: A key to phylogenery. FASEB J. 7: 113
123.
Pelczar, Reid and Chan. Microbiology. Fourth edition. 1977. Mcgraw-Hill.
Prescott, Harley y Klein 1999 Microbiologa. Cuarte edicin. McGraw-Hill Interamericana.
Stanier, Adelberg and Ingraham. General Microbiology. 4th Edition. 1977. The MacMillan
Press Ltd.
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Panamericana.
Weistreich and Lechtman. Microbiology. Fifth Edition. 1988 Macmillan Publishing Co.
De Haro Juan & Melic Antonio (2002). Taxonoma, Sistemtica, Filogenia y Clasificaciones.
URL: http://entomologia.rediris.es/documentos/taxonomia.htm
Prof. Magaly Pedrique de Aulacio
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ACTIVIDADES ADICIONALES
Buscar en un diccionario de ingls tcnico la traduccin al espaol de las palabras siguientes
Ancestor
Causative agent
Common name
Dichotomous key
Disease
DNA probes
Domain
Fingerprint
G + C ratio
Genus
Growth
Hierarchy
Isolate
Kingdom
Methanogen
Order
Profile
Scientific name
Specie
Strain
Disear una clave dicotmica que permita diferenciar un miembro del gnero Staphylococcus de un miembro del gnero Streptococcus
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Disear una clave dicotmica que permita diferenciar un miembro del gnero Pseudomonas de un miembro del gnero Escherichia.
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