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Tema 2.

Cinética
enzimática

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
Indice

1. Cinética enzimática. Aproximación de Michaelis-Menten


2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax
3. Inhibición enzimática
4. Regulación enzimática

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
1. Cinética enzimática

[ES]
S + E P + E
Velocidad de la
reacción catalizada

¿cómo podemos medir la


actividad enzimática?

Cantidad de sustrato consumido en la unidad de tiempo, o


la cantidad de producto formado en la unidad de tiempo.

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

[ES]
S + E P + E
Velocidad = Cantidad de enzima que:

µmol S consumido / minuto mol S consumido / segundo

µmol P obtenido / minuto mol P obtenido / segundo

1 Unidad (U) = 1 µmol /min 1 katal = 1 mol /segundo

1 katal = 6·107 U
Avtividad enzimática

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

[ES]
S + E P + E

Velocidad = Actividad enzimática

U /ml extracto crudo

Si conocemos el Volumen (ml): U totales

Si conocemos la proteína (mg/ml):


U/mg proteína (Actividad Específica)

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

[ES]
S + E P + E
Tª y pH

Determinar la actividad de una enzima (en U/mg proteína), de una


preparación enzimática con una proteína de 1,56 mg/ml, sabiendo que:

a) El tiempo de reacción fue de 10 min de reacción a 35 ºC


b) El volumen total de ensayo fue de 3 mL y se utilizaron 0,25 mL de la
preparación enzimática.
c) Se obtuvo un incremento de absorbancia a 526 nm de 0,437 (referidos a la
formación del producto de la reacción).
d) El coeficiente () de extinción molar del producto (P) a 526 nm es de 0,286
mM-1·cm-1.
Ecuación de Lambert –Beer
Abs = ·L·c
Solución: 1,17 U/mg

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Curso 3º
1. Cinética enzimática
1913
Cinética de Michaelis-Menten

Victor Henri (1902)


hidrólisis de la sacarosa
(sacarasa)

[ES]
S + E P + E
V0
Leonor Michaelis Maud Leonora Menten

Representando V0 frente a la [S]

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

Saturación
Velocidad de reacción (U)
Actividad enzimática

E
SP

Cinética de
Michaelis-Menten

Concentración de sustrato (mM)

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

(Actividad enzimática)

Ecuación de Michaelis-Menten

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Curso 3º
1. Cinética enzimática

Si [S] >>> Km  Km + [S]  [S]

Si [S] <<< Km  Km + [S]  Km

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Curso 3º
Indice

GS, imagen estereoscópica

1. Cinética enzimática. Aproximación de Michaelis-Menten


2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax
3. Inhibición enzimática
4. Regulación enzimática

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

¿Qué significado tiene la Km?

• Significado cinético: nos indica la


concentración de sustrato necesaria para
alcanzar la mitad de la velocidad máxima.

• Significado fisiológico: es una medida de la


afinidad del enzima por el sustrato. Así,
cuanto más pequeña es la Km, mayor
afinidad del enzima por el sustrato.

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Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

LEUCEMIA LINFOIDE

Asn  Asp + NH4+


Asparraginasa

Fuente Animal
Vegetal
la de menor Microbiana
Km
(mayor afinidad)

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Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

¿ Cómo obtener los parámetros cinéticos. Km y Vmax ?

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Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

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Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

y = ax + b

Representación de
dobles inversos o de
Lineweaver-Burke

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Curso 3º
2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax

y = ax + b

Representación de
Eadie y Hofstee

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Curso 3º
Indice

1. Cinética enzimática. Aproximación de Michaelis-Menten


2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax
3. Inhibición enzimática
4. Regulación enzimática

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

INHIBIDOR: sustancia que interacciona con la


enzima e interfiere en su actividad catalítica

1) INHIBIDORES REVERSIBLES:
Competitivo
No Competitivo
Acompetitivo
2) INHIBIDORES IRREVERSIBLES:
Uniones covalentes

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva

El inhibidor compite
con el S por el sitio
activo

K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
E+I EI

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva
La Vmax no varía
Lineweaver-Burke

El inhibidor compite
con el S por el sitio
activo

K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
E+I EI

La Km aparentemente aumenta - 1/Km

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva
La Vmax no varía

ap

ap
Km = Km (1+[I]/Ki)
K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
E+I EI

La Km aparentemente aumenta - 1/Km

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva

Los inhibidores competitivos se utilizan normalmente


como fármacos
IBUPROFENO actúa sobre la ciclooxigenasa

ASPIRINA actúa sobre la ciclooxigenasa

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva

Los inhibidores competitivos se utilizan normalmente


como fármacos
IBUPROFENO actúa sobre la ciclooxigenasa

ASPIRINA actúa sobre la ciclooxigenasa

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva

Los inhibidores competitivos se utilizan normalmente


como fármacos
IBUPROFENO actúa sobre la ciclooxigenasa

ASPIRINA actúa sobre la ciclooxigenasa

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva

La amoxicilina inhibe la
síntesis de la pared
celular bacteriana durante
la fase de crecimiento
mediante la inhibición
competitiva de la
transpeptidasas.

Cada comprimido contiene:


Amoxicilina (trihidrato)..............................500 mg
Acido clavulánico (sal de potasio)............125 mg

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición NO competitiva

el inhibidor interacciona
con la enzima por una
zona distinta al sitio
activo

K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
E+I EI
Ki2
ES+I EIS

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición NO competitiva
Inhibición no competitiva
el inhibidor interacciona
con la enzima por una 1/V Con I
zona distinta al sitio
ap activo
Vmax = Vmax / (1+[I]/Ki) 1/V ’max Sin I

K1 K2
E+S ES E+P
K-1 1/Vmax
Ki
E+I EI
- 1/Km 0 1/[S]
Ki2
ES+I EIS
La Km no varía y la Vmax si varia
La Vmax aparentemente disminuye

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición NO competitiva

Ag+

Hg2+ Pb2+

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición Acompetitiva

S
El inhibidor interacciona
sólo con el complejo
[ES], evitando la
reacción
X P

I
K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
ES+I EIS

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición Acompetitiva

El inhibidor interacciona
sólo con el complejo
[ES], evitando la
reacción

K1 K2
E+S ES E+P
K-1

Ki
ES+I EIS
Afecta a la Vmax y a la Km (ambas disminuyen)
Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática
Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición Acompetitiva

El glifosato es el principio
activo del herbicida Roundup,
que inhibe acompetitivamente
la síntesis de aminoácidos
aromáticos en las plantas

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

1/Act
1/Act 1/Act

1/[S] 1/[S] 1/[S]

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

INHIBIDOR: sustancia que interacciona con la


enzima e interfiere en su actividad catalítica

1) INHIBIDORES REVERSIBLES:
Competitivo
No Competitivo
Acompetitivo
2) INHIBIDORES IRREVERSIBLES:
Uniones covalentes

Grado de Química Tema 2. Cinética enzimática


Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición Irreversible

El inhibidor se une S
covalentemente al
enzima, evitando la
reacción
K1 K2
E+S ES E+P
K-1

I
Ki
ES+I EIS
K*i Similar a la inhibición competitiva
E+I EI

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición competitiva irreversible

El ácido clavulánico es un
inhibidor Competitivo
irreversible de la
penicilinasa bacteriana

Cada comprimido contiene:


Amoxicilina (trihidrato)..............................500 mg
Acido clavulánico (sal de potasio)............125 mg

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

(Penicilasa)

(Penicilasa)

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• En la inhibición Irreversible

Los inhibidores competitivos se parecen a los sustratos

O Sustrato O Inhibidor
C H2N S NH2
HO NH2

PABA Sulfanilamide

PABA precursor del ácido fólico en bacterias


PABA: ácido paraaminobenzóico

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Curso 3º
3. Inhibición enzimática

• Inhibición competitiva irreversible

acetilcolina

Gas Sarín

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Curso 3º
Indice

1. Cinética enzimática. Aproximación de Michaelis-Menten


2. Concepto y sentido fisiológico de la Km y de la Vmax
3. Inhibición enzimática
4. Regulación enzimática

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación genética)


• A nivel de actividad ([S], [E], I, Tª, pH, otros)

Tª óptima
Actividad (U)

Temperatura

Desnaturalización térmica

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación genética)


• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
Ln k (Actividad enzimática)

10
Tª óptima
8
Actividad (U)

Ln k
4
y = -6,4308x + 27 ,027
2

0
2,95 3,00 3,05 3,10 3,15 3,20 3,25 3,30
Temperatura (1/K)*1000

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación genética)


• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)

pH óptimo
Cada enzima
tiene su pH
Actividad (U)

óptimo de trabajo

Tamponar el proceso:
• fosfato
pH
• Tris-HCl
• MOS, MES, …..

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación


genética)
• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
• Enzimas regulatorias

Retro-inhibición

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación


genética)
• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
Enzimas alostéticas
• Enzimas regulatorias

Están especializadas en
regularse respondiendo de
forma muy sensible a
señales externas

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación


genética)
• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
Enzimas alostéticas
• Enzimas regulatorias

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias
Enzimas alostéticas
Moduladores
(positivo y negativo)

Si el modulador coincide con el sustrato (regulación homotrópica)


Si el modulador es distinto al sustrato (regulación heterotrópica)

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias (Enzimas alostética)

Enzima alostérica
Vo (µmol/min)

Enzima no alostérica

[S] ( mM)

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias (Enzimas alostéticas)

Modulador positivo
Enzima alostérica
Vo (µmol/min)

Modulador negativo

[S] ( mM)

S0,5
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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias (Enzimas alostéticas)

Modulador Positivo
Modulador positivo

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias (Enzimas alostéticas)

Modulador negativo

Modulador negativo

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

•Enzimas regulatorias (Enzimas alostéticas)

Archibal Hill (1913) Indice de Hill (n)

n > 1, la cooperatividad positiva


n < 1, la cooperatividad negativa
n=1 Michaelis-Menten.

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4. Regulación enzimática
y = ax + b
S0,5
•Enzimas regulatorias (Enzimas alostéticas)

n=2,3
Dobles inversos

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Curso 3º
4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación genética)


• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
• Enzimas regulatorias
• Enzimas interconvertibles (por unión covalente)
Fosforilación/desfosforilación
Enzima - Pi Inactiva
Piruvato
deshidrogenasa

Piruvato Piruvato Piruvato


deshidrogenasa deshidrogenasa deshidrogenasa
quinasa
ATP fosfatasa

Pi
Piruvato
deshidrogenasa

Enzima Activa

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4. Regulación enzimática

• A nivel de síntesis enzimática (regulación genética)


• A nivel de actividad ([S], [E], I, pH, Tª , otros)
• Enzimas regulatorias
• Enzimas interconvertibles
• Zimógenos

Regulación por eliminación proteolítica de


pequeños segmentos peptídicos

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4. Regulación enzimática

Zimógenos (Pepsina)

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Curso 3º
Tema 2.
Cinética
enzimática

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Curso 3º
Otras imágenes estereoscópicas

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