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El agua y la vida
2.1 El agua componente principal de los seres vivos
Hay seis sustancias en el universo capaces de formar océanos.
Compuesto Punto de Fusión Punto de Rango en
(°C) Ebullición (°C) estado líquido
(°C)
Hidrógeno -259 -253 6
Helio -272 -269 3
Agua 0 100 100
Neón -249 -246 3
Amoniaco -78 -33 45
Metano -183 -162 21
4
2.2.2 Propiedades térmicas
El agua también tiene alto valores calor de vaporización, calor específico y
conductividad térmica; mostrando su alta cohesión intermolecular.
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2.2.3 El agua líquida alcanza su máxima densidad a 4°C
Figura 1a. Densidad del agua liquido/vidriosa, entre - Figura 1b. Densidad del agua liquido/vidriosa:
40°C y y100°C usando super enfriamiento. Usando super enfriamiento (roja) y simulación
(azul). 6
El hielo tiene su densidad mínima 0.917 g/mL a 0°C
Figura 2. Comparativo de variación de densidad con la temperatura para agua líquida/vidriosa super enfriada y
agua/hielo.
7
2.2.4 El agua tiene una tensión superficial relativamente alta
Sustancia Tensión La tensión superficial g es la energía por
Superficial unidad de área que se necesita para
(dinas/cm2) aumentar una superficie:
Agua 72
W = F Δx
Aceite 32
Ácido acético 28 = g (2 l Δx)
= g ΔS
Acetona 24
Etanol 23 Entonces
g = W/ΔS
La tensión superficial explica como la superficie del agua tiene una cierta
resistencia a fuerzas incidentes y también el fenómeno de capilaridad.
8
2.3 Las anomalías del agua favorecen la vida
Alto PF y PE para bajo PM y alto rango de T en estado líquido
océanos estable todo el año favorece origen y mantenimiento de la
vida.
Alto calor específico
se requiere más energía por gramo para elevar la temperatura en el
medio.
Alta conductividad calórica
la energía liberada en una reacción se reparte más rápidamente en el
medio.
Alto calor de vaporización
al evaporarse en la superficie del cuerpo el agua enfría dicha superficie.
9
2.3 Las anomalías del agua favorecen la vida (2)
Alta tensión superficial
favorece la flotación de plantas y animales en el agua
10
2.3 Las anomalías del agua favorecen la vida (3)
La densidad mayor del agua líquida
favorece la flotación del hielo,
que a su vez aísla el agua debajo del mismo,
del enfriamiento provocado por la baja temperatura externa.
11
2.4 El agua es un dipolo
En el agua las cargas están distribuidas asimétricamente, polarizadas, lo
cual resulta en un carácter dipolar.
0,0965
nm 104,5°
O
H
Muchos compuestos tienen carácter dipolar lo que explica sus
interacciones intermoleculares más fuertes que los que no están
polarizados. 12
2.5 El agua forma puentes de hidrógeno
La alta polarización de la molécula de agua le permite formar
interacciones conocidas como puentes o enlaces de hidrógeno.
13
1.6 El puente o enlace de hidrógeno es relativamente fuerte
El puente de hidrógeno es lineal y El puente de hidrógeno es
con alta direccionalidad. relativamente fuerte.
Enlace Energía de enlace
(KJ/mol)
C=O 745
F-H 568
P-O 502
O-H 460
N-H 393
C-C 345
C-N 340
F-H···F 155
O-H···N 29
O-H···O 21
N-H···N 13
N-H···O 8
14
2.7 El agua puede formar hasta 4 puentes de hidrógeno por
molécula
Esto permite explicar las diferentes
características anómalas de la
molécula de agua.
15
2.8 El hielo tiene una estructura cristalina.
El agua en estado sólido forma 4 puentes de hidrógeno por molécula
favoreciendo la estructura cristalina.
H H
H
O O H
H H O H H O
H H
H O
O
H
H H
H O
H
H
O H O H
H H O H O
O
H H
16
2.9 El vapor de agua forma 1 puente de hidrógeno / 2 moléculas
17
2.10 El agua líquida también tiene una estructura
2.10.1 El modelo de Nemethy y Scheraga (1962)
Propone que el agua liquida es una mezcla de polímeros o especies
moleculares.
Cada
Se molécula
basa en puede formarexistencia
la presunta 0, 1, 2, 3 de
o 4 paquetes
puentes de hidrógeno
moleculares de diversos tamaños: (H2O)n donde n =
1,2,3,....n.
Estimando la energía y densidad de cada especie
molecular se estima su concentración.
Con dicha información se puede calcular la variación
de propiedades (p. ej. densidad) con la temperatura.
Se compara el comportamiento calculado con el Distribución de enlaces por molécula
experimental. para agua liquida a 10°C
18
2.10.2 El modelo de Pople mejorado por Bernal (1964)
19
2.10.3 Hacia un modelo integrado del agua líquida
Aunque no hay un modelo definido; el agua liquida.
posee un ordenamiento estructural reticular,
las redes no son estáticas o permanentes,
los puentes de hidrógeno parecen estar distorsionados, pero
no podemos descartar la ruptura de algunos puentes
20
2.11 Interacción del agua con compuestos iónicos
2.11.1 El fenómeno de solvatación
Muchos compuestos iónicos se disuelven en agua por el fenómeno de
solvatación.
21
2.11.2 El agua tiene una alta constante dieléctrica
El agua solvata a una amplia gama La alta constante dieléctrica del agua
favorece su amplia capacidad para
de compuestos iónicos debido a su
disolver sustancias iónica y parcialmente
alta constante dieléctrica (e) . iónicas.
Sustancia Constante Dieléctrica
1 q+ q– er a 298°K
e r2 Agua 78.5
Dimetilsulfóxido 48.9
Donde
Metanol 32.6
F es la fuerza de atracción, Etanol 24.3
Acetona 20.7
q+, q– son las cargas de signos
Amoníaco 16.9
contrarios, Cloroformo 4.8
r es la distancia entre las cargas, Éter dietílico 4.3
y Benceno 2.3
Tetracloruro de carbono 2.2
e es la constante dieléctrica. Hexano 1.9
22
2.12 El agua muestra una baja ionización
25
2.13.3 Titulación del ácido acético y efecto amortiguador
Región de
amortiguamiento
Equivalentes de OH-
agregados
Porcentaje titulado
26
2.13.4 Significado de la pKa
La pKa corresponde al pH en que las especies no disociada y la base
conjugada están en igual concentración.
-
pH = pKa + log [A ]
[HA]
Si [HA] =
[A-] pH = pKa + log 1
pH = pKa
27
2.14 El efecto de pH en procesos biológicos
2.14a. Absorción del ibuprofeno en el estómago
A pH 2.5 hay cien veces más forma neutra [HA] que ionizada [A-] Se absorbe.
28
2.14b. Absorción del ibuprofeno en el intestino
¿Qué sucedería si es mismo compuesto estuviera presente en el intestino,
donde el pH es de 7.5?
¿Será un lugar apropiado en el organismo para su absorción?
[A-] [A-
] [A-
] [A-]
7.5 = 4.5 + log 3.0 = log 10 =
3.0
1000 =
[HA] [HA] [HA] [HA]
A pH 7.5 hay mil veces más forma ionizada [A-] que neutra [HA] No se absorbe.
29
2.15 Interacción del agua con compuestos polares
Muchos de los compuestos polares
(alcoholes, ácidos, esteres, aldehídos,
cetonas, aminas, amidas y similares) tiene la
posibilidad de formar puentes de hidrógeno
con el agua.
En macromoléculas, estas
interacciones entre grupos
funcionales polares también
facilita la estructura
tridimensional y la
funcionalidad.
30
2.15 Interacción del agua con compuestos polares (2)
Pueden tener interacciones dipolo-
dipolo.
31
2.16 Interacción entre el agua y los compuestos no polares
2.16.1 El efecto hidrofóbico
El agua busca solvatar los compuestos no polares.
ESTE ES EL EFECTO
HIDROFÓBICO.
32
2.16.1.1 Formación inicial de clatratos
33
2.16.1.2 Interacciones entre clatratos
Los clatratos no son estables y tienden a interactuar entre si, uniéndose los compuestos
no polares y liberando moléculas de agua de la estructura circundante.
34
2.16.2 Termodinámica del efecto hidrofóbico
transferencia de moléculas de hidrocarburo
Solubilidad de hidrocarburo en agua <—> de fase orgánica a la fase acuosa.
36
2.17.2 Solvatación y exclusión simultáneas de anfifilos
37
2.17.3 Formación de micelas
Interacción entre compuestos anfipáticos y agua formación de las micelas.
39
2.18 El agua como reactivo
El agua tiene comportamientos físico-químicos que le permite intervenir en
múltiples reacciones:
Nucleófilo.
40
Objetivos (1)
Al finalizar esta unidad el estudiante deberá ser capaz de
1.1 Elaborar una explicación del hecho que el agua sea el principal componente de los
seres vivos.
1.2 Describir las anomalías del agua en cuanto a sus puntos de ebullición, calor
específico, calor de vaporización, conductividad calórica, densidad y tensión
superficial.
1.3 Explicar el efecto de las anomalías del agua en los procesos biológicos.
1.4 Explicar el carácter dipolar del agua.
1.5 Explicar cómo el carácter dipolar del agua permite formar puentes de hidrógeno.
1.6 Describir el puente de hidrógeno como una interacción intermolecular
relativamente fuerte y direccionada.
1.7 Explicar como las propiedades más extremas del agua con respecto al fluoruro de
hidrógeno y al amoniaco reside en el número de puentes de hidrógeno por
molécula que puede formar. 41
Objetivos (2)
1.8 Describir la estructura del agua en estado sólido del agua y cómo se explica que
su densidad máxima sea a 4°C.
1.9 Describir cómo aún en el vapor de agua hay un puente de hidrógeno cada dos
moléculas.
1.10 Discutir los modelos de Nemethy y Scheraga (1962) y de Pople mejorado por
Bernal (1964) para la estructura del agua líquida.
1.11 Explicar la interacción del agua con compuestos iónicos.
1.12 Describir la baja ionización del agua y el uso del pH para expresarla.
1.13 Describir la interacción de ácidos y bases con el agua y la ecuación de
Hendersson-Hasselbach.
1.14 Aplicar la ecuación de Hendersson-Hasselbach en problemas simples.
1.15 Explicar la solubilidad de los compuestos covalentes polares en agua con base en
las interacciones como puentes de hidrógeno y dipolo-dipolo.
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Objetivos (3)
1.16 Explicar la insolubilidad de los compuestos no polares en agua con base en la
estructura del agua líquida conocido como el efecto hidrofóbico.
1.17 Explicar por qué la insolubilidad de compuestos no polares se describe mejor al
analizar la termodinámica de la interacción entre ellos y el agua.
1.18 Definir que es un compuesto anfipático y reconocerlo a partir de su fórmula.
1.19 Describir que es una micela, un liposoma y el rol de los compuestos anfipáticos en
su formación.
1.20 Describir las características del agua como reactivo.
43
Bibliografía para consultar
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Pags. 116-117.
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44
Liu, J., H. Xiao & J.Z.H. Zhang (2017) “Structure of liquid water – a dynamical mixture of
tetrahedral and ‘ring-and-chain’ like structures” Phys.Chem.Chem.Phys.19, 11931-11936.
https://doi.org/10.1039/c7cp00667e
Monroe, J., Barry, M., DeStefano, A., Gokturk, P.A., Jiao, S. Robinson-Brown, D., Webber,
T., Crumlin, E.J., Han, S. Scott Shell, M (2020) “Water structure and properties at
hydrophilic and hydrophobic hurfaces” Annu. Rev. of Chemi Biomol. Eng. 11.
Némethy G & A. Scherga (1962) “Structure of wáter and hydrophobic bonding in proteins”
J. Chem. Phys. 36, 3382 (1962). https://doi.org/10.1063/1.1732472
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Tanford, C. (1980) "The hydrophobic effect" J. Wiley & Sons; 2a Ed., New York. Caps 2 y 5.
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Ejercicios (2)
3. Describa como prepararía 100 ml de un tampón 0.2M, pH 6.92, a partir de fosfato
monobásico de sodio dihidratado, NaH2PO4 •H2O (PM 137) y de fosfato dibásico de
sodio Na2HPO4 (PM 142). ¿Cómo haría 100 ml de un tampón 0.002M, pH 6.92 a
partir del tampón 0.2M, pH 6.92? Las pKa’s del ácido fosfórico son 2.13, 7.22 y
12.32.
4. Describa como prepararía 100 ml de un tampón 0.2M, pH 10.38, a partir de
carbonato de sodio Na2CO3 (PM = 106) y de bicarbonato de sodio NaHCO3 (PM =
84). ¿Cómo haría 100 ml de un tampón 0.08M, pH 10.38 a partir del tampón
0.2M, pH 10.38? Las pKa’s del ácido carbónico son 6.38 y 10.38.
5. Describa como prepararía 100 ml de un tampón 0.2M, pH 8.71, a partir de ácido
clorhídrico (11.7N) y Tris (2-hidroxi-metil-2-aminopropanodiol) (PM = 121) La
pKa del Tris es 8.21.
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Ejercicios (2)
6. Describa como prepararía 100 mL de un tampón 0.2M, pH 8.21, a partir de ácido
clorhídrico (11.7N) y Tris (2-hidroxi-metil-2-aminopropanodiol) (PM 121).
¿Cómo haría 100 ml de un tampón 0.014M, pH 8.21 a partir del tampón 0.2M, pH
8.21? La pKa del Tris es 8.21.
7. Describa como prepararía 100 ml de un tampón 0.3M, pH 10.4, a partir de
amoniaco (3N) cloruro de amonio (PM 53.5). La pKa del amoniaco es 9.40.
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