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Bioquímica

Segundo semestre 2022

Instituto Profesional de Chile


Carrera: Kinesiología
Docente: Esteban Jeria Garay
Bioquímica.

Unidad II. Metabolismo.


Clase 12.

Esteban Jeria Garay.


Ingeniero en Biotecnología.
esteban.jeria@edu.ipchile.cl
Objetivos de la unidad.
• Reconocer el mecanismo introductorio en la mitocondria.
• Comprender la ruta metabólica del ciclo de Krebs.
• Comprender la cadena respiratoria.
• Comprender la fosforilación oxidativa.
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Acetil-Coenzima A (Acetil-CoA)

• Molécula intermedia
• Se forma a partir de
azúcares, ácidos grasos
(β-oxidación de ácidos
grasos) y aminoácidos

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Formación de Acetil-CoA
• Complejo enzimático
• Descarboxilación
oxidativa
• Irreversible
• El NADH libera un ión
E1 = piruvato deshidrogenasa
hidruro a la cadena
E2 = dihidropropil transacetilasa
E3 = dihidropropil deshidrogenasa
Enzimas transportadora de
Pirofosfato de tiamina (TTP)
electrones
Flavina adenina dinucleótido (FAD)
Co enzima A (CoA) Coenzimas
Nicotinamida adenina dinucleótido (NAD)
lipoato

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Ciclo del ácido cítrico o ciclo de Krebs
• Ruta metabólica cíclica.
• Ocurre en la matriz mitocondrial.
• Papel fundamental en la
generación de energía, sin
embargo sus intermediarios son
utilizados para la síntesis de
otros productos.
Reacciones anapleróticas: reacciones que generan intermediarios del
ácido cítrico, manteniendo la concentración de los intermediarios mas
o menos constante

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Formación del citrato (1)
• Condensación de la Acetil-CoA
con oxalacetato Condensación: combinación de dos
moléculas distintas para formar un
único producto
• Catalizada por la citrato sintasa

A la enzima se une primero el oxalacetato provocando un cambio conformacional en la enzima para


una posterior unión de la Acetil-CoA 10
Formación del isocitrato (2)
• El isocitrato se forma a través de la transformación intermedia
del cis-aconitato
• Proceso reversible
Deshidratació Hidratación
n

La aconitasa puede promover la adición y remoción reversible de una molécula de agua

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Formación de α-cetoglutarato (3)
• Descarboxilación oxidativa y deshidrogenación del isocitrato
para formar α-cetoglucerato
• Formación de CO2 y NADH Isoenzima: variantes de una
enzimas

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Formación de succinil-CoA (4)
• Descarboxilación oxidativa
• Existe formación de CO2 y NADH
• NAD+ actúa como aceptor de electrones
• CoA transporta el grupo succinilo

Complejo α–cetoglutarato deshidrogenasa es homologo al complejo piruvato deshidrogenasa


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Formación de succinato (5)
• Se rompe el enlace tioéster del succinil-CoA y se promueve la síntesis
de GTP o ATP (animales y plantas respectivamente), formándose en el
proceso succinato
• Reacción reversible mediada por succinil-CoA sintetasa o siccínico
tioquinasa

La formación de GTP o ATP depende de las isoenzimas de la succinil-CoA sintetasa


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Formación de fumarato (6)
• Oxidación del succinato
• Generación de FADH2
• Formación de trans-fumarato

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Formación de malato (7)
• Hidratación reversible del
fumarato para formar malato
• Reacción catalizada por la
enzima fumarasa
• La enzima cataliza la hidratación
del trans-fumarato pero no del
cis-fumarato

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Formación de oxalacetato (8)
• Última reacción del ciclo
• Oxidación del malato para formar oxalacetato catalizada por la
malato deshidrogenasa
• Formación de NADH
• La concentración intracelular del oxalacetato se debe mantener
baja

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Resumen

• Se genera una molécula


de ATP
• Se generan un gran
flujo de electrones
hacia la cadena
respiratoria a través del
NADH y FADH2

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Regulación del ciclo del ácido cítrico
• Regulación en las tres reacciones exergónicas

• Tres factores regulan el ciclo:


– Disponibilidad de sustrato
– Inhibición de productos acumulados
– Retroinhibición alostérica de las enzimas

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Regulación del ciclo del ácido cítrico

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Ciclo del glioxilato
• Plantas, algunos invertebrados, bacterias y levaduras
(vertebrados no poseen las enzimas de este ciclo)

• Forma modificada del ciclo de Krebs, que se salta los pasos de


descarboxilación permitiendo la producción neta de esqueletos
de carbono y no la pérdida como CO2, participando así en la
gluconeogénesis

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Fosforilación oxidativa
• Culminación del metabolismo energético
• Etapa final de la generación y obtención de energía
• Tiene lugar en la mitocondrias y cloroplastos
• Produce:
– Reducción de O2 a H2O gracias a los electrones cedidos por el NADH
y FADH2
– Formación de moléculas de ATP

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Aspectos relevantes de la fosforilación oxidativa

1. Interviene un flujo de electrones a través de una cadena de


transportadores ligados a membrana
2. El flujo de electrones (“cuesta abajo”) se encuentra acoplado a
un flujo de protones (“cuesta arriba”)
3. El flujo de protones a favor de su gradiente de concentración
(mediante canales de membrana) producen la energía
suficiente para la síntesis de ATP

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Fosforilación oxidativa
• Comienza con la entrada de electrones proveniente de
los procesos metabólicos anteriores
• Ni el NADH y NADPH pueden atravesar la membrana
interna de la mitocondria, por lo que solo entregan los
electrones

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Los electrones pasan a través de una
serie de transportadores unidos a la
membrana
• Serie de transportadores transmembrana
• Actúan de manera secuencial
• Un transportador adicional se une al proceso ubiquinona o Q
(en plantas se denomina plastoquinona y en bacterias
menaquinona)

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Complejo III transfiere
electrones desde la
ubiquinona al citocromo c

Complejo I y II
catalizan la Complejo II Complejo III Complejo IV
transferencia de (succionato (complejo transfiere
electrones a la deshidrogenasa)
ubiquinona a partir de
citocromo bc1 ) electrones desde
el citocromo c
NADH y succinato hacia el oxígeno

Complejo I Complejo IV
(NADH (citocromo c
deshidrogenasa) Transportadores oxidasa)
de electrones
como
complejos
enzimáticos

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¿Cómo se descubrió
que existían cuatro
complejos enzimáticos?

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Complejo I: NADH deshidrogenasa
• Complejo enzimático conformado por 42 cadenas
polipéptidicas
• Bomba de protones
• Forma de L
• Cataliza dos procesos acoplados:
– Transferencia de un ión hidruro del NADH hacia la ubiquinona
– Transferencia de cuatro protones hacia el espacio intermemebrana

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• NADH es oxidado y sus dos electrones son
transferidos a FMN, posteriormente pasan a un grupo
de Fe-S (transportadores de electrones) para
finalmente entregar a estos a la ubiquinona
(transportador de electrones liposoluble), pasa a a
través de la membrana de la mitocondria
FMN: rivoflavina 5-fosfato
Fe-S: proteína fierro-azufre 31
Coenzima Q o ubiquinona
• Transportador de electrones lipídico
• Se desplaza de manera libre por la membrana
• Transporta electrones hacia la cadena respiratoria desde el
NADH, succinato y oxidación de ácidos grasos

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Complejo II: succinato deshidrogenasa
• No es una bomba de
protones
• El donador de electrones es
el succinato (intermediario
del ciclo del ácido cítrico)
• Se transportan electrones
hacia la ubiquinona a partir
de FAD+ y un grupo
ferrosulfatado (Fe-S)

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Complejo III: complejo citocromo bc1
• Proteína soluble del
espacio intermembrana
• Se transfiere electrones
desde el ubiquinol al
citocromo c
• Existe transporte de
protones desde la matriz
hacia el espacio
intermembrana de la
mitocondria
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Complejo IV: citocromo oxidasa
• Enzima grande
• Se ubica en la membrana interna de la mitocondria
• Bombea protones
• Transporte de electrones desde el citocromo c al oxígeno
molecular, reduciéndolo a agua

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Complejo IV: citocromo oxidasa

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Síntesis de ATP

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ATP sintasa

F1: proteína periférica

F0 : proteína integral

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ATP sintasa

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Metabolismo.
• Regulación Hormonal de carbohidratos.
Neuroquímica: Adrenalina, Eleva los niveles de azúcar en los vasos
sanguíneos y estimula la degradación de glucosa en músculo e hígado.
Balance insulina/glucagón: Estas hormonas están directamente
relacionadas (inversas) en la mantención de la glucosa en sangre y tejidos.
Insulina: Estimula el transporte de glucosa al interior de tejidos y células y
favorece la biosíntesis de glucógeno.
Glucagón: Eleva los niveles sanguíneos de azúcares, y estimula la
degradación de glucosa en el hígado.
Metabolismo.

• Diferencias de la glucólisis y gluconeogénesis.


Primero proceso de degradación de la glucosa en moléculas o metabolitos secundarios con
producción de energía.
Principales enzimas propias del mecanismo: Hexoquinasa, fosfofructocinasa y piruvato cinasa.
Fuentes de la glucolisis: monosacáridos, como glucosa, fructosa y galactosa.

Segundo proceso involucrado en la biosíntesis de glucosa por metabolitos secundarios, no


necesariamente inversos a la glucolisis.
Principales enzimas propias del mecanismo: glucosa 6-fosfatasa, fructosa 1,6 bifosfatasa y
fosfoenolpiruvato.
Fuentes de la gluconeogénesis: metabolitos secundarios, piruvato (origen glucolítico, lipídico),
aminoácidos y glicerol.
FIN?

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