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Ciclo de

Krebs
Ciclo del ácido cítrico o ciclo de
los ácidos tricarboxílicos
Generalidades
• 4 de los 8 pasos son
oxidaciones. La energía es
conservada en la formación de
cofactores reducidos NADH y
FADH2.

• Ciclo central en el metabolismo


productor de energía, también
produce intermediarios de 4 y 5
carbonos que sirven como
precursores en vias
biosintéticas.

• Para reemplazar los


intermediarios removidos para
biosintesis las células emplean
reacciones anapleróticas.
Reacciones del ciclo del ácido cítrico: generalidades
• Sucede en mitocondrias
(eucariotas aerobios).
Mitocondria principal sitio de
producción de ATP.

• En eucariotas fotosintéticos
ocurre en mitocondria (ciclo
oscuro), pero en ciclo de luz
ocurre en cloroplastos
(principal sitio de producción de
ATP) .

• En procariotas ocurre en
citosol. La membrana celular
tiene rol análogo a membrana
interna de la mitocondria en
síntesis de ATP.
Reacciones
del ciclo del
ácido
cítrico
Formación de citrato

✓ Oxaloacetato es el primer sustrato que se une a la enzima citrato


sintasa produciendo un cambio conformacional que crea el sitio de
unión para el segundo sustrato (acetil Co-A).
✓ La conversión de metilo en metileno permite la oxidación del acetato.
✓ En las secuencias de oxidación, usualmente están involucrados dos
grupos metileno (CH2-CH2), al menos uno de ellos es adyacente a un
grupo carbonilo.
Estructura de la
citrato sintasa
• Enzima homodimérica.

• Cada subunidad es un polímero


con dos dominios:
• -Largo y rígido
• -Más pequeño y flexible

• El sitio activo se encuentra entre


los dos dominios.
• El oxaloacetato (cetona) es el
primer sustrato, se une al
dominio flexible, lo cual
produce un cambio
conformacional que crea un sitio
de unión para la Acetil CoA
(tioéster).
Formación de isocitrato
via cis-Aconitato
• Enzima aconitasa cataliza la transformación
reversible de citrato a isocitrato a través de
la formación de un intermediario
tricarboxílico (cis-aconitato)
• Contiene un centro ferro-sulfurado que une
al sustrato al sitio activo de la enzima y en
la adición o remoción catalítica de H2O.
• En células carentes de Fe, pierde su centro
ferro-sulfurado y adquiere el rol de
regulador en la síntesis protéica del
metabolismo del hierro.
¿Sabes que son las enzimas “claro de luna”?
• Isocitrato deshidrogenasa cataliza la
descarboxilación oxidativa de isocitrato para
formar α-cetoglutarato.
• Mn+2 en el sitio activo interactúa con el grupo
carbonilo del intermediario de la reacción y
estabiliza el producto de la descarboxilación.

Oxidación de
isocitrato a α-
cetoglutarato
y CO2
Oxidación de isocitrato a α-
cetoglutarato y CO2
• Resaltan las semejanzas existentes con complejo
piruvato deshidrogenasa incluyendo el cofactor
TPP.
• Descarboxilación oxidativa del sustrato para
formar succinil-CoA y CO2.
• NAD+ sirve como aceptor de electrones y CoA es
el acarreador del grupo succinilo.
• La energía de la oxidación se conserva en la
Oxidación de formación del enlace tioester de succinil-CoA
α-
cetoglutarato
a succinil Co-A
Mecanismo conservado para la
descarboxilación oxidativa
Conversión de
succinil-CoA a
succinato
• Fosforilación a nivel de
sustrato: formación
acoplada de ATP (GTP) a
expensas de la energía
liberada por la
descarboxilación oxidativa
del α-cetoglutarato
(conservada en el enlace
tioester) del succinil CoA.
Energía de hidrólisis del
enlace tioéster= -36 kJ/ mol • La energía se conserva
en forma de ATP (GTP).
Oxidación de succinato a fumarato

Por cada par de electrones


transferidos a la cadena
respiratoria por FADH2 se Flavoproteina, participa en
sintetizan 1.5 ATPs cadena respiratoria
Hidratación de fumarato a malato
Oxidación de malato a
oxaloacetato
La energía derivada de las oxidaciones en
el ciclo es conservada eficientemente
Datos energéticos
• GTP puede donar su grupo fosforilo al ADP
para formar ATP, sin pérdida o ganancia de
energía:
GTP + ADP GDP + ATP ∆G’°= 0 kJ/mol
Nucleosido
disfosfato
quinasa
En cada vuelta (1 piruvato) del ciclo de Krebs se
producen:

2 CO2

3 NADH x 2.5= 7.5 ATP

1 FADH2 x 1.5= 1.5 ATP

1 GTP (o ATP)= 1 ATP

10 ATP x 2 piruvatos (glucosa) = 20 ATP


Preguntas que
debe hacerse el
estudiante de
bioquímica

▪ ¿Cuantas vueltas dará el ciclo de Krebs para catabolizar (oxidar) una


molécula de glucosa?

▪ ¿Cuántos GTP, NADH y FADH2 se producirán en total por molécula de


glucosa?

▪ ¿Cuántas moléculas netas de ATP se obtienen a partir de una


molécula de glucosa al final de la fosforilación oxidativa?
32 ATP x 30.5 kJ/mol= 976 kJ/mol = 34% de la energía obtenible de
la oxidación de glucosa. Con datos reales (∆G) la eficiencia es
cercana al 65%.
¿Porqué la oxidación del
acetato es tan complicada?
▪ Porque el cíclo del ácido cítrico es
anfibólico: funciona tanto como
ciclo catabólico que como
anabólico.

▪ Productos finales de 4 y 5
carbonos provenientes de
diversos procesos catabólicos
alimentan el ciclo y sirven como
combustibles.

▪ Bajo circunstancias metabólicas


específicas, algunos
intermediarios son tomados del
ciclo del ácido cítrico para ser
usados como precursores en
diversas vías biosintéticas.
Precursores biosintéticos producidos por un ciclo del
ácido cítrico incompleto en bacterias anaeróbicas

Es una Ausencia de complejo a-


fermentación en cetoglutarato
donde el NADH deshidrogenasa
producido por la
oxidación del
NAD+
isocitrato se
regenera a NAD+
cuando el
oxaloacetato se
reduce a
succinato.

Nelson & Cox, 2017


Ciclo del glioxilato
y su función

• En plantas, invertebrados,
algunos microorganismos
(Ej E. coli) y levaduras.

• El acetato puede servir


como combustible
energético y también como
fuente de
fosfoenolpiruvato para la
síntesis de carbohidratos. Sucrosa

• Ciclo glioxilato: conversión


de acetato proveniente de
oxidación de ácidos grasos
(TAG) en carbohidratos.

• Sucede en glioxisomas (ciclo


glioxilato), mitocondria y
citosol. Cap. 20. Nelson & Cox, 2017
Reacciones anapleróticas del ciclo del ácido cítrico
▪ Las reacciones
anapleróticas son
reacciones que
reponen intermediarios Acetil
del ciclo que han sido CoA
removidos para ser
utilizados como
precursores
biosintéticos.

▪ Reacciones
biosintéticas y
anapleróticas en
equilibrio dinámico
para que los
intermediarios del ciclo
del ácido cítrico
permanezcan
“constantes”. Nelson & Cox, 2017
Reacciones anapleróticas que reponen los
intermediarios del cíclo del ácido cítrico

Piruvato carboxilasa: compuesta de 4 subunidades idénticas,


cada una con una biotina (grupo prostético) unida
covalentemente. Acarrea grupos CO2.
• ¿Recuerdas en cual vía
estudiamos antes a la
piruvato carboxilasa?
Biotina
Vitamina requerida en dieta humana, también
es sintetizada por bacterias de la microbiota
intestinal. Su deficiencia ocurre principalmente
cuando se consumen grandes cantidades de
huevo crudo que tiene avidina (proteína afín a
la biotina), lo cual impide su absorción
intestinal.
Papel de la biotina en la reacción de la piruvato
carboxilasa

Tether: ligadura,
atadura, lazo
Ligaduras biológicas

Punto de
unión del
intermediario
activado a la
ligadura
REGULACIÓN DEL CICLO DEL
ÁCIDO CÍTRICO

Capítulo 16, subtema 16.3


El flujo de átomos de carbono provenientes del
piruvato hacia el ciclo de Krebs se regula
estrictamente en al menos tres niveles:
• Transporte de piruvato a la mitocondria
por el acarreador mitocondrial de
Regulación piruvato (MPC)
• La conversión de piruvato a acetil CoA
del ciclo de (complejo PDH)
• Entrada de acetil CoA en el ciclo
Krebs (reacción de la citrato sintasa).

• El ciclo también está regulado por las


enzimas isocitrado deshidrogenasa y α-
cetoglutarato deshidrogenasa.
Regulación del ciclo del ácido cítrico
¿Qué señal dá el calcio a
la célula muscular
cuando aumenta su
concentración?
¿Promueve el
catabolismo o el
anabolismo?
Mecanismos alostéricos:
• La actividad enzimática se apaga
La producción cuando hay alta concentración de
de acetil-CoA energéticos (combustible) en forma de
por el complejo ácidos grasos y acetil CoA. También
cuando la concentración de ATP celular
piruvato es elevada, y el radio NADH/NAD+ es
deshidrogenasa alto.
está regulada
por mecanismos • Se enciende cuando hay demanda
energética y se requiere un mayor flujo
alostéricos y de acetil CoA al ciclo. En ese momento
covalentes el radio NADH/NAD+ es bajo.
Regulación covalente:

• El complejo enzimático es inhibido por


La producción fosforilación reversible de un residuo
de acetil-CoA específico de Serina en la E1.
por el complejo • En presencia de altas concentraciones de
piruvato ATP: Piruvato deshidrogenasa quinasa
fosforila a la E1, inactivando el complejo.
deshidrogenasa
está regulada • En presencia de bajas concentraciones
por de ATP se remueve el grupo fosfato por
medio de una fosfoproteína fosfatasa,
mecanismos activando al complejo E1.
alostéricos y
• Piruvato deshidrogenasa quinasa:
covalentes activada alostéricamente por ATP
El ciclo del ácido cítrico está regulado en sus tres
pasos exergónicos
El flujo de metabolitos a través del ciclo del ácido cítrico está regulada por 3
factores:
1) Disponibilidad de sustrato.

2) Inhibición por acumulación de producto.

3) Inhibición alostérica por retroalimentación (feedback) de


enzimas que catalizan reacciones tempranas en la vía.

Las concentraciones de sustratos e intermediarios


del ciclo del ácido cítrico fijan el flujo a través de la
vía a una velocidad que provee concentraciones
óptimas de ATP y NADH.
La velocidad de la glucólisis y la del ciclo
del ácido cítrico están integrados (bajo
condiciones normales)
▪ Se metaboliza tanta glucosa como se
requiera por el ciclo del ácido cítrico
(suple de grupos acetilo).

▪ La velocidad de la glucólisis y del


ciclo del ácido cítrico están
coordinadas por medio de:
 Inhibición por altos niveles de
ATP y NADH (componentes
comunes en ambos ciclos)

 La concentración de citrato
(producto de la primera reacción
del ciclo del ácido cítrico) que
inhibe a la fosfofructoquinasa-1
en la glucólisis y a la citrato
sintasa en el ciclo de Krebs.
• ¿Que son los
metabolones?

INVESTIGA • ¿Cuál es la diferencia con


el término metaboloma?

• ¿Son solubles todas las


enzimas del ciclo de
Krebs?

• ¿Qué significa
“canalización de
sustratos”?

• ¿Qué ventaja tiene el


que las enzimas estén
organizadas como
complejos
multienzimáticos dentro
de la mitocondria?

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