Mg. Jorge Ballón Echegaray: jballone@unsa.edu.

pe
Blgo: Patrick Fernández Guzmán: pfernandezg@unsa.edu.pe

LAS NUEVAS VARIANTES DEL SARS Cov-

2,
CRISIS OPORTUNIDAD DATA INFORMACIÓN

CONOCIMIENTO

APRENDIZAJE
 UNIÓN SARS Cov-2 a su Receptor

ESTRUCTURA DEL VIRUS SARS Cov-2

MUTACIÓN
Los virus cometen
errores al copiar su
material genético.
Una mutación es un
cambio en una de las
letras (nucleótidos)
que forman el código
genético de un
organismo.
 MUTACIÓN
En el caso del SARS Cov-2, al
tratarse de un virus que usa el
ácido ribonucleico (ARN) como
material genético, las letras son la
adenina, la guanina, la citosina y
el uracilo (A, G, C y U)..
Estas letras se unen de tres en tres
formando tripletes (codones), que
son los que conforman los
diferentes tipos de aminoácidos
que, a su vez, son los que forman
las proteínas.

Las proteínas están implicadas tanto en la estructura como en las

funciones de un virus. “Por ejemplo, el coronavirus utiliza proteínas como
llaves para interactuar con las células humanas y poder ingresar a ellas e
iniciar su replicación. Las mutaciones que afecten a esas proteínas pueden
servir para que el virus INGRESE mejor a su célula blanco.
 AMOR (A, G, C y U)

ROMA CIUDAD
PUNTA

FRUTA
MORA NOMBRE

OMAR NOMBRE

ANALOGIA AROM PERFUME

PARA
ENTENDER
LAS ROAM VAGAR
(ingles)
MUTACIONES
 ¿Por qué es fundamental la secuenciación
genómica del SARS-CoV-2?

La vigilancia mundial de las secuencias

genéticas del SARS-CoV-2 y de los
metadatos conexos sirve de apoyo a la
respuesta ante el brote de COVID-19.
Facilita el seguimiento de la propagación
geográfica y temporal del SARS-CoV-2 y la
pronta detección y evaluación de
mutaciones que puedan influir en el poder
patógeno o la transmisión del virus o en
las medidas de respuesta adoptadas (como
las vacunas, el tratamiento y las pruebas
diagnósticas). (OMS)
Objetivos de la secuenciación del genoma del SARS-CoV-2 con fines de salud
pública. (1)
Actividades que no requieren muchos recursos y para cuyo seguimiento no es necesaria la
secuenciación o solo ocasionalmente
 Identificar el SARS-CoV-2 como agente causal de la enfermedad.
 Elaborar pruebas diagnósticas para el SARS-CoV-2.
 Sustentar el desarrollo de tratamientos y vacunas.
 Investigar el origen del SARS-CoV-2 y la fecha de la transmisión inicial al ser humano (en
curso).
 Reinfección:
• Evaluar y mejorar la comprensión de este fenómeno.
• Distinguir la infección prolongada de la reinfección en un individuo.

Secuenciación del genoma

del SARS-CoV-2 con fines
de salud pública OMS.
Enero 2021
Objetivos de la secuenciación del genoma del SARS-CoV-2 con fines de salud
pública. (2)
Actividades que requieren la prosecución de la labor de secuenciación
durante un periodo más prolongado

Evolución del SARS-CoV-2 y sus repercusiones en:

 la modificación del comportamiento vírico (cambio fenotípico), por ejemplo, la
tasa de transmisión o el poder patógeno;
 la inmunidad (por infección natural o vacunación);
 las pruebas diagnósticas (moleculares, serológicas o antigénicas);
 los tratamientos (por ejemplo, anticuerpos monoclonales).

Seguimiento de la circulación y la actividad del virus:

 Investigar la propagación geográfica y la reintroducción entre poblaciones.
 Investigar los brotes en determinados entornos y poblaciones (por ejemplo, en
hospitales).
 Rastrear la reintroducción zoonótica, de otras especies al ser humano o
viceversa.
 Vigilar las aguas ambientales y residuales.
 Apoyar la vigilancia convencional cuantificando el periodo de transmisión,
 O
OMICRO
M
B.1.1.529
South Africa
Nov 24, 2021
VARIANTE DE INTERES (WHO):

Variante con cambios genéticos que se predice o se sabe

que afectan las características del virus, tales como
transmisibilidad, gravedad de la enfermedad, escape
?
inmunológico, escape diagnóstico o terapéutico.
Identificado para causar una transmisión comunitaria
significativa o múltiples grupos de COVID-19, en varios
países con una prevalencia relativa creciente junto con un
número creciente de casos a lo largo del tiempo, u otros
impactos epidemiológicos aparentes que sugieren un
riesgo emergente para la salud pública mundial.

WHO label Pango   Earliest documented  

Date of designation 
  lineage* samples 

Lambda C.37 Peru, Dec-2020 14-Jun-2021

Mu B.1.621 Colombia, Jan-2021 30-Aug-2021
VARIANTE DE PREOCUPACIÓN WHO label
Pango   Earliest documented  
(WHO):  
lineage* samples 
Date of designation 

United Kingdom,  
Alpha 
Una variante del SARS-CoV-2 que cumple B.1.1.7  Sep-2020  18-Dec-2020
con la definición de un VARIANTE DE
Beta  B.1.351  South Africa,  
INTERES) y, a través de una evaluación May-2020 
18-Dec-2020
comparativa, se ha demostrado que está Gamma  P.1  Brazil,  
11-Jan-2021
asociada con uno o más de los siguientes Nov-2020 
cambios en un grado de importancia para la
Delta  India,   VOI: 4-Apr-2021 
salud pública mundial: B.1.617.2
Oct-2020  VOC: 11-May-2021 
• Aumento de la transmisibilidad o cambio
perjudicial en la epidemiología de
O
COVID-19; OMICRO
• Aumento de la virulencia o cambio en la M
presentación clínica de la enfermedad; B.1.1.529
• Disminución de la eficacia de las South Africa
Nov 24, 2021
medidas sociales y de salud pública o de
los diagnósticos, vacunas y terapéuticas
disponibles.
• Aumento en la transmisibilidad: ALFA BETA GAMMA
puede suponer un aumento en el
número de casos y por lo tanto en la
presión sobre el sistema asistencial.
• Aumento en la gravedad y/o
letalidad
• Escape a la respuesta inmune
(adquirida tras infección natural o
generada por algunas vacunas y
respuesta a anticuerpos
monoclonales)
• Disminución en la sensibilidad de los
métodos de diagnóstico
microbiológico
• Disminución a la respuesta al
tratamiento.
VARIANT OF CONCERN (Variante de Preocupación)

+++
++

+/-
VARIANT UNDER INVESTIGATION (Variante de Interés)
AGRADECIMIENTO Y RECONOCIMIENTO
 SECUENCIACIÓN GENÓMICA DE
SARS-COV-2

BLGO. PATRICK ROGER FERNANDEZ GUZMAN

 ESTRUCTURA
Envoltura

Proteínas de
reconocimiento

Ácido Nucléico

Ben Taylor (2010)

 TIPOS
ENRUTAMIENTO/
EXPRESIÓN

¿Y SARS-COV2?

Baltimore D. (1971). Expression of animal virus genomes. Bacteriological

¿QUÉ ES EL SECUENCIAMIENTO?
¿CUÁL FUE EL PRIMER GENOMA
SECUENCIADO?
 BACTERIÓFAGO PHI-X174

Frederick Sanger, et al. (1977) Rubén Megía González (2020)

 TECNOLOGIAS
1R 2DA (NGS) 3R
A A
FLUJO DE TRABAJO ILLUMINA
FLUJO DE TRABAJO ILLUMINA
FLUJO DE TRABAJO ILLUMINA
FLUJO DE TRABAJO ILLUMINA
FLUJO DE TRABAJO ILLUMINA
 FLUJO DE TRABAJO

Fuente: GISAID. (Consultada: 04/10/2021)

PROFUNDIDAD DE LECTURA
PROFUNDIDAD DE LECTURA
GENOM
A
1X

2X

3X

4X

5X

6X

7X

8X

…X
IMPORTANCIA DE LA VIGILANCIA GENÓMICA
IMPORTANCIA DE LA VIGILANCIA GENÓMICA
IMPORTANCIA DE LA VIGILANCIA GENÓMICA
 MODELOS BIOLÓGICOS EN LOS AVANCES
TECNOLÓGICOS

Byrk J (2017) La evolución en acción: los patógenos

Mg. Jorge Ballón Echegaray: jballone@unsa.edu.pe
Blgo: Patrick Fernández Guzmán: pfernandezg@unsa.edu.pe

GRACIAS