EJERCICIOS TEMA3.

AMINOÁCIDOS
Y PROTEÍNAS
Biología Celular
Ejercicio 1. Por cada uno de estos aminoácidos:
a. clasifíquelos según la cadena lateral
b. Relacione la estructura con el nombre del aminoácido, código de tres letras,
y código de una letra
Ejercicio 2. Por cada uno de estos aminoácidos:
a. clasifíquelos según la cadena lateral
b. Relacione la estructura con el nombre del aminoácido, código de tres letras,
y código de una letra
Ejercicio 3. Por cada uno de estos aminoácidos:
a. clasifíquelos según la cadena lateral
b. Relacione la estructura con el nombre del aminoácido, código de tres letras,
y código de una letra
Ejercicio 4. Por cada uno de los siguientes aminoácidos, considerando los
diferentes pKa (consultad la tabla de propiedades de los aminoácidos) y dibujar
el estado de protonación mayoritario. Indicad la carga beta y el pI
pH=1.5 pH=5 pH=7.4 pH=10
pH=1.5 pH=5 pH=7.4 pH=10
pH=1.5 pH=5 pH=7.4 pH=10
Ejercicio 5. En qué rango de pH vamos a encontrar el estado de de
protonación representado de los siguientes aminoácidos
Ejercicio 6. En relación al siguiente péptido conteste las siguientes preguntas:
a) Utilizando el código de una letra, escriba la secuencia del péptido
b) Señale los carbonos alfa de los aminoácidos
c) Señale cuál es la cadena principal y cuáles son las cadenas laterales
d) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales polares
e) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales apolares
f) Este péptido será detectado con el espectofotómetro, ¿ utilizando qué longitud de onda?
h) Cuáles son el primer y último aminoácido de este péptido
Ejercicio 7. En relación al siguiente péptido conteste las siguientes preguntas:
a) Utilizando el código de una letra, escriba la secuencia del péptido
b) Señale los carbonos alfa de los aminoácidos
c) Señale cuál es la cadena principal y cuáles son las cadenas laterales
d) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales polares
e) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales apolares
f) Este péptido será detectado con el espectofotómetro, ¿ utilizando qué longitud de onda?
h) Cuáles son el primer y último aminoácido de este péptido
Ejercicio 8. En relación al siguiente péptido conteste las siguientes preguntas:
a) Utilizando el código de una letra, escriba la secuencia del péptido
b) Señale los carbonos alfa de los aminoácidos
c) Señale cuál es la cadena principal y cuáles son las cadenas laterales
d) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales polares
e) Indique qué aminoácidos tienen cadenas laterales apolares
f) Este péptido será detectado con el espectofotómetro, ¿ utilizando qué longitudde onda?
h) Cuáles son el primery último aminoácido de este péptido
Ejercicio 9. En relación al siguiente péptido conteste las siguientes preguntas:
a) Cuáles son el primer y último aminoácido de este péptido
b) Señale los carbonos alfa de los aminoácidos
c) Señale cuál es la cadena principal y cuáles son las cadenas laterales
f) Este péptido, ¿será detectado con el espectofotómetro?
h) En qué rango de pH podemos encontrar este péptido
i) Utilizando el código de una letra, escriba la secuencia del péptido
Ejercicio 10. En relación a los siguientes péptidos, señale:

ATE KKE 1. Cuáles de estos péptidos serán

detectados por el espectrofotómetro.
2. Considerando la cadena lateral qué

CSA DDE péptidos serán más solubles en agua.

3. Si aplicamos un campo eléctrico a
PH7.4 qué péptidos migrarán hacia el
polo positivo.

ILA SSY
4. Si aplicamos un campo eléctrico a pH
7.4 qué péptidos migrarán hacia el
polo negativo.
5. Si aplicamos un campo eléctrico a pH
1.5 qué péptidos migrarán hacia el

WYT FVI
polo negativo.
Ejercicio 11. En relación a los siguientes péptidos señale:
a. El carbono alfa de cada aminoácido
b. Enlaces que permiten los ángulos de rotación ф y Ψ
Ejercicio 12. Verdadero o falso. Justifique.

a. La estructura secundaria depende del orden de los aminoácidos en una

determinada secuencia

b. La estructura secundaria se estabiliza gracias a los puentes de hidrógenos

que se establecen entre los átomos de las cadenas laterales.
Ejercicio 13. Utilizar las siguientes herramientas para predecir la estructura
secundaria.

Busque la secuencia de estas dos proteínas (FASTA) utilizando la siguiente base de datos:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein:

 Actina (376 aminoáncidos): actin, gamma-enteric smooth muscle isoform 1 precursor

[Homo sapiens]
 Histona H3 (135 aminoácidos): histone H3 [Homo sapiens]

a. A través de: http://www.compbio.dundee.ac.uk/jpred/ utilice su algoritmo de

predicción de estructura secundaria.
b. ¿Cuál de estas dos proteínas tiene más hélices alfa en su estructura?
c. ¿Cuán confiable es la predicción?
Ejercicio 14. Esta proteína es la mioglobina
a. Qué función tiene
b. ¿Qué tipo de estructura secundaria es mayoritaria?
c. ¿Tiene estructura terciaria y/o cuaternaria?
d. ¿Qué tipo de fuerzas intervienen en la adquisición de la estructura terciaria?
e. Busca la secuencia y predice la estructura secundaria
Ejercicio 15. Esta proteína es la hemoglobina
a. ¿Qué función tiene?
b. ¿Qué tipo de estructura secundaria es mayoritaria?
c. ¿Tiene estructura terciaria y/o cuaternaria?
d. ¿Qué tipo de fuerzas intervienen en la adquisición de la estructura terciaria?
Ejercicio 16. Esta proteína es la GFP (green fluorescent protein?
a. ¿En qué organismo la encontramos, y para qué se utiliza en el laboratorio?
b. ¿Qué tipo de estructura secundaria es mayoritaria?
c. ¿Tiene estructura terciaria y/o cuaternaria?
d. ¿Qué tipo de fuerzas intervienen en la adquisición de la estructura terciaria?
Ejercicio 17. Considerando la
siguiente reacción conteste las
siguientes preguntas.

a. Esta reacción, libera o requiere

energía.
b. ¿Esta reacción es espontánea o no.
(∆G<0)? Señale en el diagrama el ∆G?
c. Señale cuál es el estado de transición
d. ¿Requiere energía llegar al estado de
transición? Señale en el diagrama la
energía de activación.
e. ¿Cuál es la función de la enzima?.
Dibuje como sería la coordenada de
reacción en presencia del enzima
f. Este tipo de reacciones, ¿se dan en las
células?
Ejercicio 18. Considerando la
siguiente reacción conteste las
siguientes preguntas.

a. Esta reacción, libera o requiere

energía.
b. ¿Esta reacción es espontánea o no.
(∆G<0)? Señale en el diagrama el ∆G?
c. Señale cuál es el estado de transición
d. Requiere energía llegar al estado de
transición, señale en el diagrama la
energía de activación.
e. ¿Cuál es la función de la enzima?.
Dibuje como sería la coordenada de
reacción en presencia del enzima
f. Este tipo de reacciones, ¿se dan en las
células?
Ejercicio 19. Esta enzima es la
quimiotripsina
a. ¿Qué reacción cataliza?
b. En rojo están señalado los
aminoácidos del centro activo, ¿están
próximos en secuencia? ¿Qué es el
centro activo de una enzima?
c. Señale las regiones con estructura
secundaria, e indique de qué tipo son
d. ¿Cómo la enzima logra bajar la energía
de activación?
e. En el laboratorio se lleva a cabo una
reacción con esta enzima donde se
puede medir la cantidad de producto
que se obtiene. Se realiza la reacción a
37ºC y a 80ºC, ¿en qué condición se va
a obtener una mayor concentración de
producto? ¿por qué?