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INTRODUCCIÓN

Cada célula y tejido del cuerpo humano está compuesto de moléculas (compuestos
químicos), y el comportamiento de las células y los tejidos está determinado por las
interacciones físicas y químicas de esas moléculas. En otras palabras, la biología es una
"propiedad emergente" de la química. Como consecuencia, la salud humana depende de
la química, y la enfermedad humana a menudo se remonta a la disfunción molecular.
Muchos tratamientos existentes para enfermedades, desde gota hasta diabetes, desde
hipertensión hasta cáncer, se han desarrollado sobre la base de una sólida comprensión
de la bioquímica, y el diseño futuro de nuevos medicamentos y terapias se verá impulsado
por una comprensión más profunda de la base molecular de la enfermedad.

Comprender la bioquímica es una base excelente para aprender toda la biología, pero
puede ser difícil comprender la complejidad de los sistemas bioquímicos o comprender la
bioquímica en su contexto. En este curso, comenzaremos con los principios
fundamentales que rigen las interacciones de las moléculas individuales, y le mostraremos
cómo se aplican esos mismos principios a escala de células y organismos. En el camino,
verá cómo la bioquímica se cruza con la enfermedad humana y la atención clínica.

EL MAPA METABÓLICO

Cuando visita una ciudad en un país extranjero, es fácil sentirse abrumado. Es posible que
no sepa dónde está algo, y los signos pueden estar en un idioma diferente y usar símbolos
diferentes. Si simplemente vaga sin rumbo, puede perderse y perderse las vistas más
importantes. Pero si tiene un mapa y una guía local, puede explorar y descubrir con
seguridad muchas cosas nuevas y emocionantes.

Del mismo modo, estudiar bioquímica puede ser abrumador. Dentro de cada una de
nuestras células, innumerables moléculas están involucradas en reacciones químicas que
son vitales para la función de esas células. Si simplemente intenta memorizar cada
molécula y reacción cuando la encuentre, no llegará muy lejos y se perderá el aprendizaje
de los conceptos más importantes.

El metabolismo se refiere a la suma total de las reacciones químicas que están ocurriendo
en una célula u organismo. A continuación se muestra una representación simplificada del
metabolismo en humanos, que muestra cuántas moléculas orgánicas se pueden
interconvertir a través de una red metabólica.
Cada flecha sólida representa una reacción química única, transformando una molécula en
otra. Sin embargo, en el metabolismo, se pueden requerir múltiples pasos para convertir
una molécula en otra. En este caso, las reacciones individuales se encadenan juntas para
formar vías de varios pasos, representadas aquí con líneas discontinuas. Observe cuántas
de estas vías tienen flechas que apuntan en ambas direcciones. Esto se debe a que los
seres vivos a veces deben construir moléculas y otras veces (o en otras células y tejidos)
las descomponen, dependiendo de las necesidades actuales de la célula u organismo.

Todo esto puede parecer abrumador, ¡pero no te preocupes! A medida que avance en
este curso, aprenderá algunas reglas simples que se aplican a cada reacción que vea. En
este curso, nos centraremos en regiones particulares del mapa, pero con este mapa y con
nosotros como sus guías, aprenderá cómo algunas reglas simples pueden ayudarlo a
navegar por toda la complejidad del metabolismo y la bioquímica.

TEMAS RECURRENTES EN BIOQUÍMICA

A lo largo de este curso, volveremos a muchos conceptos clave una y otra vez.
Comprender estos conceptos lo ayudará a establecer conexiones entre procesos
aparentemente no relacionados y a comprender la complejidad de la bioquímica. Para
ayudarlo a reconocer los temas recurrentes en bioquímica, utilizaremos íconos para
señalar material en el curso que ejemplifique estos temas.
Termodinámica

Como verá, las transformaciones químicas que hacen posible la vida se rigen por la
termodinámica. Esto literalmente significa "movimiento de calor" y se refiere al
comportamiento de la energía en los sistemas físicos.

Regulación

Los seres vivos han evolucionado para controlar la velocidad a la que tienen lugar ciertas
reacciones químicas. Esta regulación evita que los organismos desperdicien energía y les
ayuda a mantener su entorno interno.

Acoplamiento

Muchas reacciones químicas que son esenciales para la vida son termodinámicamente
desfavorables. Estas reacciones no pueden ocurrir a menos que estén acopladas
(vinculadas) a un proceso que sea termodinámicamente favorable.

Anabolismo

Las moléculas biológicas complejas a menudo se construyen a partir de precursores más


simples. Las reacciones que acumulan moléculas de esta manera se denominan
"anabólicas", y a menudo requieren el aporte de energía.

Catabolismo

Muchas moléculas biológicas complejas se pueden descomponer en moléculas más


simples. Las reacciones que descomponen las moléculas se denominan "catabólicas" y, a
menudo, liberan energía que las células pueden aprovechar.

Compartimentación

Dentro de las células, las reacciones no ocurren en una solución homogénea. Las células
están altamente organizadas en compartimientos unidos a la membrana, y este contexto
espacial es crítico para la función celular.
Estructura

Las funciones de las moléculas biológicas dependen completamente de su estructura


química. Esto incluye tanto la forma física de las moléculas como sus propiedades
químicas, como la carga y la polaridad.
Además de estos conceptos recurrentes, algunos tipos de reacciones químicas se usan
repetidamente en sistemas biológicos, y ciertas moléculas son intermedios o puntos
finales importantes de diferentes vías anabólicas y catabólicas. A menudo señalaremos
estas reacciones y moléculas clave para indicar que debe prestar especial atención.

Reacciones clave

Moléculas Claves

Aunque no necesita memorizar muchas reacciones o moléculas específicas para que le


vaya bien en este curso, la capacidad de reconocer estas reacciones y moléculas le será de
gran utilidad en su futuro estudio de bioquímica.

ENLACE CLINICO - INTRODUCCION AL GOTA

En esta lección, aprenderá sobre la termodinámica y el papel fundamental de las enzimas


en las vías bioquímicas. Como verá, estos conceptos son importantes para comprender las
causas y los tratamientos de muchas enfermedades. Aquí, nos encontraremos con un
paciente con gota, una enfermedad dolorosa causada por la acumulación de un
compuesto químico llamado ácido úrico, que es un subproducto normal del metabolismo.
Para cuando trabaje en los conceptos clave de esta lección, tendrá las herramientas para
comprender la causa bioquímica de la gota de este paciente y comprender las terapias
que se dirigen a la base bioquímica de esta enfermedad.

SALIDA Y BIOQUÍMICA

La gota es una enfermedad bastante común: se estima que afecta a casi el 4% de la


población de EE. UU. El intenso dolor de un ataque agudo de gota es debilitante,
reduciendo drásticamente la calidad de vida. Esta enfermedad es causada por la
acumulación y acumulación de ácido úrico. El ácido úrico es un producto de
descomposición (un metabolito) de los nucleótidos que se encuentran en el ADN y el ARN.

Puede ser difícil responder sin saber más, pero por favor publique sus pensamientos sobre
las siguientes preguntas:
¿Qué podría causar que un metabolito se acumule en nuestros cuerpos?
¿Cómo podría ayudarnos la comprensión de la bioquímica a tratar una enfermedad como
la gota?
Por favor escriba su respuesta a continuación. ¡Piensa críticamente mientras elaboras tu
respuesta, pero ten en cuenta que hay muchas respuestas posibles! Debe enviar una
respuesta para ver cualquier explicación.

APRENDER LOS CONCEPTOS

En las siguientes páginas, encontrará una serie de videos conceptuales que lo guiarán a
través de conceptos clave relacionados con la termodinámica. Nos centraremos en una
importante vía metabólica llamada glucólisis. La glucólisis es la vía central en la
descomposición de los carbohidratos para obtener energía. La siguiente figura muestra las
reacciones de la glucólisis (resaltado) dentro de una descripción general de alto nivel de
algunas de las piezas clave del metabolismo celular. Las flechas sólidas representan
reacciones químicas únicas, y las flechas punteadas representan muchas reacciones en
una ruta. Continuará aprendiendo más sobre esta ruta y mapa a medida que avance en
este curso.

Pero no olvide que los principios de termodinámica que aprenderá mientras estudia la
glucólisis también se aplican a cualquier otra vía metabólica.

Asegúrese de verificar su comprensión respondiendo las preguntas de "Examínese a sí


mismo" que siguen a cada video.

DIAGRAMA DE COORDINACIÓN DE REACCIÓN

Prestar especial atención al papel de la energía en el siguiente proceso.


La "energía libre" (también llamada "energía libre de Gibbs" y abreviada "G") es una
propiedad de una molécula que refleja su capacidad para hacer el trabajo. La energía libre
de una molécula en un sistema biológico está determinada no solo por la energía potencial
almacenada en sus enlaces químicos, sino también por su concentración y parámetros
físicos como la temperatura y la presión.

Las reacciones químicas generalmente implican cambios en la energía libre de las


moléculas, y la diferencia en la energía libre entre las moléculas al final de una reacción
(los productos) y las moléculas que entraron en la reacción (los reactivos) le dice si una
reacción es termodinámicamente favorable o desfavorable

Resumen de video

- El cambio en la energía libre (G) de las moléculas en las reacciones químicas se puede representar en
un diagrama de coordenadas de reacción.
- Las reacciones con un cambio positivo en la energía libre (ΔG) son termodinámicamente
desfavorables, mientras que las reacciones con un ΔG negativo son termodinámicamente favorables.
- Incluso las reacciones termodinámicamente favorables pueden no ocurrir a una velocidad apreciable
si la reacción tiene una alta energía de activación.
- Los organismos vivos han desarrollado catalizadores biológicos llamados enzimas que disminuyen la
energía de activación de una reacción química.

TÚMATE TU MISMO

Las reacciones químicas a menudo se representan con una flecha apuntando en una
dirección. Sin embargo, así como es posible subir o bajar una colina en un paisaje físico, las
reacciones químicas son reversibles. En el ejemplo a continuación, una molécula de A y B
se une para formar una molécula de C, pero C también puede dividirse para formar A y B.

Si está en la cima de la colina y camina hacia abajo, la forma del paisaje no es diferente de
si está en la parte inferior de la colina subiendo. El cambio de elevación tiene la misma
magnitud, pero el signo opuesto. En otras palabras, si estás a 400 metros sobre el nivel del
mar y caminas a un lugar que está a 100 metros sobre el nivel del mar, tu elevación habrá
disminuido en 300 metros. Para caminar de regreso al lugar donde comenzó, debe aumentar
su elevación en 300 metros.
Del mismo modo, el panorama energético de una reacción química es el mismo para una
reacción directa e inversa. Si el ΔG para A + B → C es +10 kJ / mol, el ΔG de C → A + B
debe ser -10 kJ / mol.

PRINCIPIO DE LE CHATELIER

Hay algunos lugares donde sus intuiciones sobre los paisajes y la elevación pueden
engañarlo si intenta aplicarlas a las reacciones químicas. Por ejemplo, resulta que la
concentración de una molécula particular altera su energía libre.

Las moléculas que están en alta concentración tienen una energía libre más alta que las
moléculas en menor concentración. Esto significa que el ΔG de una reacción química está
determinado en parte por la concentración de productos y reactivos.

A medida que ocurren reacciones químicas, las concentraciones de productos y reactivos


pueden cambiar. Esto a su vez puede cambiar el ΔG - y por lo tanto la favorabilidad
termodinámica - de la reacción. Esto puede no tener sentido ahora, pero vamos a ayudarlo a
desarrollar su intuición química sobre este concepto.

Nota: es posible que deba reproducir los videos de esta sección varias veces para
comprender lo que está sucediendo, ¡eso está bien! Le recomendamos que regrese a
cualquier proceso que no tuvo sentido la primera vez. Tenga en cuenta que los videos a
continuación no tienen ninguna narración o sonido.

Una reacción química

Considere una reacción química reversible, que involucre las moléculas hipotéticas A, B y
C. A lo largo de esta unidad, suponga que las reacciones descritas tienen una energía de
activación baja, quizás porque la solución contiene una enzima que cataliza la reacción.
Cuando las moléculas de A y B chocan en solución, pueden reaccionar para formar C
Al mismo tiempo, las moléculas de C pueden dividirse en A y B.

Equilibrio
Se dice que una reacción química reversible está en equilibrio cuando la velocidad de las
reacciones directas e inversas son las mismas. En equilibrio, las concentraciones de
productos y reactivos no cambian apreciablemente con el tiempo, ¡pero esto no significa
que las reacciones se hayan detenido! Ambas reacciones continúan ocurriendo, pero en
promedio, el mismo número de reacciones A + B y reacciones de división C ocurren en un
período de tiempo determinado.

Equilibrio de perturbación

Ahora consideremos qué sucede con una reacción en equilibrio cuando ese equilibrio se
perturba.

Principio de Le Chatelier

El concepto presentado aquí se conoce como el principio de Le Chatelier, que en términos


generales establece lo siguiente: cuando un sistema está inicialmente en equilibrio, luego se
lo perturba, lo contrarrestará para regresar al equilibrio. Esto se debe a que cuando las
reacciones no están en equilibrio (en otras palabras, el ΔG no es igual a 0), por definición,
la reacción directa o inversa es más favorable termodinámicamente.

Tenga en cuenta que este es un principio termodinámico sobre la dirección del equilibrio en
un sistema, pero para las reacciones con una energía de activación baja o un catalizador
enzimático, podemos pensar en términos de velocidad de reacción. Esto significa que la
reacción directa o inversa tendrá una velocidad relativamente más alta, y las
concentraciones de los productos y reactivos cambiarán con el tiempo. La alteración de las
concentraciones de productos y reactivos también cambia su energía libre y, por lo tanto, el
ΔG de la reacción.

El ΔG de una reacción depende de muchos factores, como la temperatura, la presión y para


las reacciones que involucran gases, incluso el volumen del contenedor. Pero en los
sistemas biológicos, las principales variables en el ΔG de una reacción, además de las
moléculas mismas, son sus concentraciones. A continuación, aprenderá cómo el principio
de Le Chatelier puede ayudarnos a predecir el flujo de moléculas a través de vías
bioquímicas.

REACCIONES REVERSIBLES E IRREVERSIBLES

Si bien todas las reacciones son reversibles en principio, en condiciones celulares, algunas
reacciones están tan lejos del equilibrio que pueden considerarse irreversibles.
Las reacciones irreversibles tienen un gran ΔG negativo en condiciones celulares.
Aunque las reacciones con un ΔG positivo son termodinámicamente desfavorables, si el
ΔG de una reacción es lo suficientemente cercano a cero, aún puede ocurrir a cierta
velocidad.

BUCEO PROFUNDO - TERMODINÁMICA VS. CINÉTICA


Volvamos a una reacción teórica en la que una molécula de A se combina con una molécula
de B para formar una molécula de C. El diagrama de coordenadas de reacción para la
reacción se muestra a continuación.

Las respectivas energías libres de Gibbs de los reactivos y productos determinan el ∆G de


la reacción. Como recordatorio, el ∆G de una reacción es toda la información que
necesitamos para determinar si esa reacción es termodinámicamente favorable. Podemos
determinar la ∆G de una reacción tomando la diferencia en energía libre de los productos y
los reactivos como se muestra en la ecuación a continuación.

El producto C tiene una energía libre más baja que los reactivos A y B, por lo tanto, esta
reacción tiene un ∆G negativo. Un ∆G negativo nos dice que la reacción directa es
termodinámicamente favorable. Sin embargo, ¡solo conocer las propiedades
termodinámicas de una reacción no nos cuenta toda la historia! La termodinámica puede
decirnos si es energéticamente favorable que ocurra una reacción. Sin embargo, la
termodinámica no nos dice qué tan rápido procederá una reacción. De hecho, algunas
reacciones muy termodinámicamente favorables proceden tan lentamente que estas
reacciones no pueden observarse en una escala de tiempo biológicamente relevante. Se
requiere el conocimiento de la cinética de una reacción para determinar qué tan rápido
ocurrirá una reacción. Dicho de otra manera, la velocidad de una reacción se rige por la
cinética de esa reacción y no por el ∆G.

Al comienzo de esta lección, te encontraste con una metáfora de dos pueblos separados por
una montaña. En esta metáfora, la termodinámica de la reacción puede verse como la
diferencia de elevación entre las dos aldeas (ΔG). Del mismo modo, las influencias
cinéticas de la reacción pueden verse como el tamaño de la montaña que separa las dos
aldeas. Cuanto más alto sea el pico entre las dos aldeas, más difícil será cruzar de una aldea
a otra.

Entonces, ¿cuál es este pico en un diagrama de coordenadas de reacción y qué representa?

El punto más alto del pico entre los reactivos y los productos representa el estado de
transición y se denota con el símbolo de doble daga ‡. El estado de transición es el punto en
el que los reactivos están en el medio de romper los enlaces que se encuentran en los
reactivos y al mismo tiempo forman nuevos enlaces en los productos. Es importante saber
que en todas las reacciones, los reactivos deben formar un estado de transición para
convertirse en productos.

El estado de transición es muy inestable, y llegar a este estado requiere energía. La cantidad
de energía requerida para pasar de los reactivos al estado de transición se llama energía de
activación. La energía de activación se representa en el diagrama de coordenadas de
reacción como la diferencia de energía entre los reactivos y el estado de transición, como se
ve a continuación.

Para formar productos, los reactivos deben tener suficiente energía para alcanzar el
estado de transición. Dicho de otra manera, los reactivos deben adquirir energía mayor o
igual a la energía de activación para formar el estado de transición. Por lo tanto, la
capacidad de superar la energía de activación es lo que determina la velocidad de la
reacción. Las reacciones con una energía de activación más baja pueden alcanzar más
fácilmente el estado de transición y, por lo tanto, proceder a una velocidad más alta. Esto
puede ayudarnos a comprender cómo funcionan las enzimas: sin alterar la energía libre
general de una reacción, las enzimas mejoran las velocidades de reacción al promover la
formación del estado de transición.

En resumen, la velocidad a la que se puede alcanzar el estado de transición determina la


velocidad de formación de productos, ya que todos los reactivos deben pasar por el
estado de transición para convertirse en productos. Los bioquímicos a menudo dicen que
la termodinámica no nos dice nada sobre cinética. En términos prácticos, esto significa
que el ΔG de una reacción nos dice si una reacción es favorable, pero no nos dice nada
sobre la velocidad de esa reacción.

Presta atención al papel de estas tres moléculas importantes: glucosa, ATP y NADH

Ahora que ha aprendido cómo los cambios en la energía libre de las moléculas pueden
afectar el progreso de las reacciones químicas, y cómo estos principios pueden actuar en
múltiples reacciones, apliquemos estos principios a un proceso bioquímico real que ocurre
en sus células todos los días. La figura a continuación ofrece una visión general de cómo
esta vía, la glucólisis, se adapta al resto del metabolismo.

La glucólisis es una serie de 10 reacciones, cada una catalizada por una enzima diferente,
que divide una molécula de glucosa en dos moléculas de piruvato.
El ΔG de toda la ruta es muy negativo, pero algunas reacciones individuales pueden tener
un ΔG positivo en las células.
Se requiere inversión de energía al comienzo de la ruta, pero esta energía y más se
recuperan al final, con la formación neta de dos moléculas de ATP y dos moléculas de
NADH por cada molécula de glucosa.

REGLAMENTO, PARTE 1

Presta especial atención a las formas en que el control de la actividad enzimática afecta este
proceso

En una reacción de fosforilación, un grupo fosfato se transfiere de una molécula (a menudo


ATP u otro nucleótido trifosfato) a otra

Resumen de video

En el primer paso de la glucólisis, la glucosa se fosforila. Esto significa que un fosfato está unido
covalentemente a la glucosa. Las reacciones que usan ATP para obtener energía comúnmente resultan en
otra molécula fosforilada.
Las enzimas en las vías bioquímicas se pueden regular. Esto significa que su actividad se puede marcar hacia
arriba y hacia abajo, según los requisitos de la célula.
La inhibición de una enzima da como resultado una disminución en la actividad de esa enzima, elevando la
energía de activación de la reacción que cataliza.
Muchas vías bioquímicas tienen puntos de ramificación, en los que la misma molécula se puede convertir en
muchas otras moléculas, dependiendo de qué enzimas están presentes y activas en una célula.

Pay particular attention to ways in which controlling enzyme activity affects this process
Lo más probable es que las enzimas en una vía que catalizan reacciones irreversibles estén
reguladas.
Las enzimas que catalizan reacciones reversibles no se regulan con tanta frecuencia. Esto
significa que la dirección neta de estas reacciones reversibles depende de la
termodinámica de las reacciones, que pueden verse influenciadas por otras reacciones
que afectan la concentración de productos y reactivos.
Los productos finales de una ruta bioquímica a menudo inhiben las enzimas aguas arriba
en esa ruta.

ENLACE CLÍNICO

Ahora que ha aprendido algunos principios básicos de la termodinámica y el papel de las


enzimas en las vías bioquímicas, volvamos al Dr. Miloslavsky y su paciente con gota. La
gota es causada por la acumulación de ácido úrico, que es un subproducto del
metabolismo normal. El ácido úrico puede precipitarse de la solución en áreas como las
articulaciones, formando cristales de urato. Los pacientes con gota pueden experimentar
un dolor insoportable como resultado de la inflamación causada por una respuesta
inmune a estos cristales de urato.

ENTREVISTA AL PACIENTE - DIAGNÓSTICO Y TRATAMIENTO

En este video, el Dr. Miloslavsky se sienta con el paciente para discutir el diagnóstico de
gota y los tratamientos que han tratado de abordar la enfermedad.

Nuevos términos

Ácido úrico en sangre: la concentración de ácido úrico en la sangre generalmente se


expresa en miligramos por decilitro (mg / dL) de suero sanguíneo. Los niveles normales
son entre 2 y 7 mg / dL. Debido a que el ácido úrico tiene baja solubilidad, a niveles más
altos, puede precipitarse de la sangre.

Ultrasonido: un tipo de exploración que produce imágenes utilizando el reflejo de ondas


de sonido de alta frecuencia. Comúnmente utilizada para obtener imágenes de fetos en
desarrollo, esta técnica también se puede utilizar para visualizar cristales de urato en las
articulaciones.

Tomografía computarizada: un tipo de estudio de imágenes (tomografía axial


computarizada) que utiliza rayos X para visualizar órganos internos y otras estructuras
corporales.

Infusión: administración de un medicamento directamente en el torrente sanguíneo. El


fármaco pegloticasa es una proteína y se digeriría si se administra por vía oral.

Pancreatitis - Inflamación del páncreas. Esta es una complicación rara pero grave del
medicamento alopurinol.
EXAMEN DEL PACIENTE - SIGNOS Y SÍNTOMAS DE GOUT

En este video, el Dr. Miloslavsky examina a la paciente y discuten algunos de los signos y
síntomas de su condición.

Inflamación: una respuesta inmune que causa enrojecimiento, hinchazón, calor y dolor.

Tophus (tophi plural): una colección de cristales de urato que se depositan debajo de la
piel. Tophi puede o no estar asociado con inflamación.

LAS CAUSAS DE GOUT

En este video, el Dr. Hamnvik y el Dr. Miloslavsky discuten la presentación de la gota y


cómo se diagnostica, así como la epidemiología cambiante de esta enfermedad.

En esta entrevista, el Dr. Hamnvik mencionó que la gota solía llamarse "la enfermedad de
los reyes". Esto se debe a que hasta hace poco, solo los muy ricos podían permitirse el tipo
de estilos de vida que conducen a un mayor riesgo de gota. Esto incluye dietas ricas en
purinas (carne, mariscos y alcohol en particular) y un estilo de vida más sedentario.

TEMAS RECURRENTES EN BIOQUÍMICA

Ahora hemos visto cómo los principios termodinámicos simples gobiernan el flujo de
moléculas a través de vías bioquímicas. Las enzimas son mediadores críticos de este flujo
de moléculas. Incluso las reacciones energéticamente favorables pueden no ocurrir en
ausencia de un catalizador enzimático. Este es un principio que es válido
independientemente de la vía bioquímica en cuestión, como hemos visto en el caso de la
glucólisis y la descomposición de las purinas. Debido a su importancia, las enzimas son
objetivos farmacológicos muy comunes. Existen muchos medicamentos que pueden
activar o, más comúnmente, inhibir la actividad enzimática de una manera
terapéuticamente beneficiosa. Del mismo modo, las enzimas se pueden administrar como
medicamentos (generalmente por infusión) para tratar una variedad de enfermedades.

QUÍMICA DE AMINOÁCIDOS

Los aminoácidos, los componentes básicos de las proteínas, están formados por un
carbono central (Cα) unido covalentemente a un grupo amino y un grupo carboxilo. A un
pH neutro, los aminoácidos son zwitteriones (ion dipolar (aa no polar)), lo que significa
que tienen una carga positiva (en el grupo amino) y una carga negativa (en el grupo
carboxilo). Los polímeros de aminoácidos están unidos por enlaces peptídicos. El enlace
peptídico tiene una polaridad que juega un papel importante en la estructura de las
proteínas.
Aunque los aminoácidos tienen características comunes que les permiten formar
polímeros, también tienen variabilidad debido a sus cadenas laterales. Las cadenas
laterales (también denominadas grupos R) están conectadas al carbono Cα central y
pueden tener una variedad de propiedades químicas diferentes. Las cadenas laterales de
aminoácidos se pueden clasificar por una serie de propiedades, como si son polares
(tienen cadenas laterales que pueden formar enlaces de hidrógeno con agua), no polares
(tienen cadenas laterales que no forman enlaces de hidrógeno con el agua), hidrófobas,
aromáticas, cargadas (si es la carga positiva, tienen cadenas laterales que pueden actuar
como donantes de protones o aceptores que son protonados a un pH neutro), grandes o
pequeñas. Dos de los 20 aminoácidos codificados genéticamente son atípicos,
químicamente. La glicina, el aminoácido más pequeño, no tiene cadena lateral, sino que el
carbono Cα está unido a dos átomos de hidrógeno. En la prolina, la cadena lateral está
unida covalentemente al nitrógeno, creando una estructura de anillo en la columna
vertebral del aminoácido.

REACCIONES BIOQUIMICAS
Hay, en total, miles de enzimas diferentes que funcionan en las células humanas. Agrupar
las enzimas por las reacciones que catalizan puede ayudarnos a comprender sus funciones,
por lo que es útil estar al tanto de los tipos clave de reacciones que ocurren en las células. A
medida que aprenda sobre estas reacciones, preste atención a las enzimas y moléculas
involucradas en los ejemplos, ya que muchas de ellas juegan un papel importante en la
regulación metabólica.

CONDENSACIÓN E HIDRÓLISIS

La condensación implica unir covalentemente dos moléculas con la pérdida de una


molécula pequeña, a menudo agua (perdida).
La hidrólisis implica (incorpora) una molécula de agua que se incorpora a una molécula, lo
que hace que la molécula se divida en dos partes. La hidrólisis es uno de los tipos de
reacción más comunes en las células.
Las reacciones de hidrólisis son catalizadas por una amplia clase de enzimas llamadas
hidrolasas, que incluye lipasas, proteasas y nucleasas.

FOSFORILACIÓN Y DESFOSFORILACIÓN

La fosforilación implica la transferencia de un grupo fosfato a una molécula. El grupo se


transfiere desde otra molécula, a menudo ATP.
La desfosforilación implica la pérdida de un grupo fosfato de una molécula; Este es un tipo
específico de reacción de hidrólisis.
Las moléculas que obtienen un fosfato generalmente también obtienen energía libre.
A menudo catalizado por enzimas llamadas quinasas (fosforilación) y fosfatasas
(desfosforilación).
- La Fosfofructoquinasa-1 (PFK-1), cataliza la fosforilación de fructosa 1,6 bisfosfato
a partir de fructosa 6-fosfato y ATP.
REDUCCIÓN Y OXIDACIÓN (REDOX)

Las reacciones redox implican la transferencia de electrones. Típicamente, estas reacciones


están directamente acopladas en sistemas biológicos. En una reacción de reducción, una
molécula gana electrones. En una reacción de oxidación, una molécula pierde electrones.
A menudo, la transferencia de electrones también está asociada con la transferencia de
hidrógeno.
Muchas de estas reacciones en el metabolismo son catalizadas por enzimas llamadas
deshidrogenasas.

CARBOXILACIÓN Y DESCARBOXILACIÓN

La carboxilación implica la adición de dióxido de carbono (+ATP) a una molécula. Esto a


menudo requiere la inversión de energía.
La descarboxilación implica la pérdida de dióxido de carbono de una molécula. A menudo,
la descarboxilación también ocurre con una reacción redox.
Generalmente, estas reacciones son catalizadas por enzimas llamadas carboxilasas y
descarboxilasas.
- AcetilCoA + CO2 + ATP = Malonil-CoA (Este es el paso comprometido en la
síntesis correcta de ácidos grasos)
ISOMERIZACIÓN

La isomerización implica la transformación de una molécula en otra estructura química


(disposición de los átomos) sin alterar la fórmula química de la molécula.
En
general, estas reacciones son catalizadas por enzimas llamadas isomerasas y mutasas.

CONSTRUCCIÓN DE BLOQUES DE CÉLULAS

Los cuatro bloques de construcción principales de las células son clases importantes de
moléculas biológicas que son críticas para la estructura y función celular.

ELEMENTOS

Hay seis elementos diferentes que son muy comunes en las moléculas biológicas.

Carbono (C)
Hidrógeno (H)
Oxigeno (O)
Nitrógeno (N)
Fósforo (P)
Azufre (S)

Otros elementos son esenciales para la vida, pero no los verá con tanta frecuencia. A
menudo mostraremos esqueletos de carbono como líneas en moléculas, y no se muestran
hidrógenos. Se mostrarán nitrógeno, fósforo, azufre y oxígeno cuando estén presentes. A
continuación, verá dos representaciones diferentes de glyceraldehyde.
A veces, mostraremos hidrógenos explícitamente, pero solo cuando ayude a comprender la
orientación de los enlaces en una molécula. A continuación se muestra un ejemplo de
cuándo podríamos mostrar un hidrógeno (en una estructura de aminoácidos).

REPRESENTACIONES DE BONOS

La mayoría de las moléculas biológicas están formadas por esqueletos de carbono. El


carbono típicamente forma enlaces covalentes con otros tres o cuatro átomos a la vez. Si se
une con cuatro átomos, generalmente adopta una conformación de enlace tetraédrico. Si se
une con tres átomos, generalmente adopta una conformación de enlace trigonal. Esos están
representados en la figura a continuación. Tenga en cuenta los grupos R que se muestran en
esta molécula. R se usa típicamente en representaciones de moléculas biológicas para
representar moléculas adicionales que están unidas a una molécula de interés.

LOS BLOQUES DE CONSTRUCCIÓN

Los cuatro bloques de construcción principales de las células son:


Aminoácidos
Monosacáridos
Lípidos
Ácidos nucleicos

DIVERSIDAD ESTRUCTURAL

Los aminoácidos, los ácidos nucleicos y los monosacáridos pueden formar polímeros largos
de subunidades repetidas, mientras que los lípidos son estructuralmente más diversos. La
función biológica de cada clase de moléculas es un producto de su estructura y química.

Los aminoácidos están compuestos de un carbono central unido covalentemente a un grupo


amino y un grupo carboxilo y están unidos por enlaces peptídicos para formar polímeros de
proteínas.

Hay veinte aminoácidos que se encuentran comúnmente en las células que tienen cadenas
laterales con diferentes propiedades químicas.
Cuando se polimeriza para formar proteínas, la secuencia de aminoácidos y sus propiedades
químicas determinan la estructura de la proteína.
Las proteínas representan la mayoría de las enzimas de las células y constituyen muchos
componentes estructurales de las células.
Los monómeros de ácidos nucleicos pueden desempeñar papeles importantes en la
regulación de la energía en la célula, y también pueden formar polímeros largos de ADN y
ARN que actúan como material genético.

El trifosfato de adenosina (ATP(un ácido nucleico que se considera una de las principales
monedas energéticas de las células)) es un monómero de ácido nucleico que sirve como una
moneda energética principal de las células, y es una base de purina unida a un azúcar
(penstosa) y tres grupos fosfato.
El ADN es un polímero de ácido nucleico que sirve como la molécula de almacenamiento
genético de la célula, que se encuentra principalmente en el núcleo.
El ARN es un polímero de ácido nucleico que participa en la transferencia de información y
desempeña importantes funciones catalíticas (enzimáticas) en las células.
Los monosacáridos se polimerizan para crear disacáridos, oligosacáridos y polisacáridos.
Los monosacáridos son una moneda esencial en el cuerpo, como la glucosa, que se
descompone en la glucólisis.
Los polisacáridos son importantes para el almacenamiento y la regulación de la energía; El
glucógeno, un polisacárido ramificado almacena energía y participa en la regulación de los
niveles de glucosa en sangre.
Los lípidos son moléculas densas en energía que comparten la propiedad de tener un gran
componente insoluble en agua (hidrófobo).

Una clase de lípidos que forman las membranas son los fosfolípidos, que están compuestos
por un grupo de cabeza hidrofílica que contiene fosfato y dos grupos de cola hidrofóbicos.
Otros lípidos incluyen esteroles, triglicéridos y ácidos grasos, que juegan un papel en el
almacenamiento de energía, las membranas y la señalización.
Los ácidos grasos están compuestos por un grupo carboxilo (COOH) unido a una cadena
lineal de hidrocarburos; los ácidos grasos saturados tienen solo enlaces simples, mientras
que los ácidos grasos insaturados tienen algunos enlaces dobles en la cadena.

NADH

ATP

Pirubato deshidrigenasa
Aceti-CoA carboxilasa

Hexoquinasa

ESPECIALIZACIÓN CELULAR Y METABOLISMO

Existe una increíble diversidad de funciones metabólicas de las células, y muchos tejidos
tienen funciones metabólicas únicas. En consecuencia, muchas de las diferentes clases de
biomoléculas se metabolizan de manera diferente en diferentes células y tejidos.

HEPATOCITOS

Con frecuencia se dice que los hepatocitos (células hepáticas) son los reguladores maestros
del metabolismo. Algunas de las principales funciones metabólicas de los hepatocitos
incluyen:

- procesamiento de los monómeros de muchas moléculas dietéticas diferentes,


incluidos monosacáridos, aminoácidos y lípidos.
- eliminar el exceso de nitrógeno (generalmente de los aminoácidos) a través del ciclo
de la urea.
- inactivando las toxinas que ingresan al cuerpo a través del tracto digestivo.
- descomponiendo los carbohidratos para sintetizar ácidos grasos, que luego pueden
ser una fuente de energía para el resto del cuerpo.
- empaqueta los lípidos en moléculas conocidas como VLDL, que transportan lípidos
a otros tejidos del cuerpo.
- liberando glucosa a la sangre cuando los niveles de azúcar en la sangre son bajos.
Esto se logra mediante gluconeogénesis (síntesis de glucosa de novo) y
glucogenólisis (descomposición del glucógeno). Las células del hígado expresan
glucosa 6-fosfatasa, que es esencial para la liberación de glucosa en la sangre.
- almacenar glucosa en forma de glucógeno, que puede liberarse para ser utilizado
por otros tejidos.
- sintetizando cuerpos cetónicos para suministrar energía a las neuronas en el cerebro
cuando los niveles de azúcar en la sangre permanecen bajos durante un período
prolongado de tiempo.

ADIPOCITOS

Los adipocitos (células grasas) tienen varias funciones metabólicas importantes, que
incluyen:
- almacenar triacilgliceroles (grasas), que son muy densos en energía.
- descompone los triacilgliceroles y libera ácidos grasos en la sangre cuando los
niveles de energía del cuerpo son bajos.
- sintetizando ácidos grasos a partir de acetil-CoA y sintetizando triacilgliceroles a
partir de ácidos grasos y glicerol.
- Células de los islotes pancreáticos
o Las células de los islotes pancreáticos tienen funciones especializadas en la
señalización del estado metabólico del cuerpo.
 Las células β liberan insulina cuando los niveles de glucosa en
sangre son altos.
 Las células α liberan glucagón cuando los niveles de glucosa en
sangre son bajos.

MIOCITOS

Los miocitos (células musculares) tienen un papel especializado en el movimiento y la


contracción. Tienen características únicas del metabolismo que incluyen:

- uso de ácidos grasos como fuente de energía primaria en los niveles de actividad
basales.
- uso de glucosa (músculos esqueléticos) cuando el uso de energía es muy alto.
- almacenamiento de glucógeno que puede usarse cuando bajan los niveles de azúcar
en la sangre.

ERITROCITOS

Los eritrocitos (glóbulos rojos) tienen un papel especializado en el transporte de oxígeno.


Tienen características únicas del metabolismo que incluyen:

- falta de fosforilación oxidativa y no hay capacidad para descomponer proteínas o


ácidos grasos, porque carecen de mitocondrias.
- completa dependencia de la glucosa como fuente de energía.

CÉLULAS EPITELIALES RENALES.

Las células epiteliales del riñón tienen un papel especializado en la excreción de desechos y
la retención de moléculas importantes. Tienen características únicas del metabolismo que
incluyen:

- Expresión de un gran número de transportadores activos para excretar productos de


desecho y toxinas.
- expresión de un simportador de sodio / glucosa que les permite reabsorber la
glucosa de la orina.
- Regulación activa del equilibrio de ciertas sales clave (electrolitos) en el cuerpo.

CÉLULAS EPITELIALES INTESTINALES


Las células epiteliales intestinales tienen un papel especializado en la absorción de
nutrientes de los alimentos que comemos. Tienen características únicas del metabolismo
que incluyen:

- Expresión de un simportador de sodio / glucosa que les permite absorber la glucosa


de la luz intestinal.
- Expresión de una serie de bombas y canales que les permiten mantener activamente
un equilibrio de líquidos y electrolitos en el intestino.

NEURONAS

Las neuronas tienen un papel especializado en la coordinación de las acciones del resto del
cuerpo. Tienen características únicas del metabolismo que incluyen:

- expresión de una gran cantidad de bombas de iones y transportadores que les


permiten conducir señales eléctricas.
- La necesidad de un cierto nivel de glucosa para sostener el metabolismo.
- la capacidad de recolectar energía de los cuerpos cetónicos cuando el suministro de
energía del cuerpo es bajo.

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Basandome en las preguntas…¿dónde ve energía en el trabajo? Yo lo ve que al momento


de tener un trabajo tanto de actividad fisica y mental el cuerpo require de la produccion de
energia (ATP) y aplicación de esta para la realizacion del trabajo mismo. ¿Hay diferentes
formas de energía? Sí, en cuestion del ambito medico podemos tener energia quimica,
termica. ¿Se almacena la energía en alguna parte? En el ambito medico el amacenamiento
de energia se ve en la acumulacion del tejido adiposo.

Basandome en las preguntas…¿Qué podría causar que un metabolito se acumule en


nuestros cuerpos? En el caso de la acumulacion del acido urico (Gota) es por la alta
ingesta de proteinas de origen animal, por ende empieza el catabolismo de purinas y
como resultado da el exceso de acido urico.
¿Cómo podría ayudarnos la comprensión de la bioquímica a tratar una enfermedad como
la gota? Al momento de estudiar las rutas metabolicas como es el caso del catabolismo de
las purinas podemos observar que el resultado el xantina y d posterior a acido urico por
meio se la xantina oxidasa, por lo que comprendiento esta ruta podremos dar farmacos
especialisados que evitan la decantacion de este, tanto la ruta metabolica para poder ser
eliminado por via renal¡

La sacarosa no es descompuesta ya que si bien se le agrega azucar al agua pero le falta el


catalizador (enzima) para poder descomponerla y scar glucosa y fructosa

Predecir cómo el aumento de la concentración de A y B afectará la velocidad de esta


reacción. En otras palabras, si hay más de cada una de estas moléculas en la solución,
¿crees que reaccionarán para formar C con mayor o menor frecuencia en un período de
tiempo determinado? ¿Por qué?
- Al momento de que en una concentración aumentada tanto de A y B afectara la
velocidad de reacción y se hará con menor frecuencia de tiempo que las moléculas
de A y B se expondrán a una distancia menor haciendo que estas sean fusionadas
con mayor facilidad dando como producto a C, ya que es más difícil en menor
concentración ya que los espacios entre moléculas serian mayores y se requerirían
un mayor aporte energético para fusionarlas

Una reacción en la que una molécula se divide en dos no depende necesariamente de


colisiones de moléculas, pero la velocidad de esta reacción todavía se ve afectada por la
concentración de C. Si el 10% de las moléculas de C se dividen para formar A + B en un
período determinado de tiempo, ¿cómo afectará la concentración de C a la velocidad de la
reacción inversa?

La concentración de C se vera disminuida y la velocidad de la reacción será lenta ya que


esta esta dada por la concentración de C (dado que C se disminuye al 10% en un tiempo
determinado, cada tiempo se reajustara las concentraciones de C y se tomara de nuevo el
10% de la nueva concentración de este)

Si un sistema está en equilibrio, cambiar la concentración de un solo componente lo sacará


del equilibrio. Revise su respuesta a la pregunta 1: ¿qué cree que sucederá con las tasas de
las reacciones directas e inversas si se agrega una gran cantidad de B a la solución?

En este caso la velocidad de reacción aumentaría y dominaría el tiempo ya que B se


encontraría la facilidad de adaptarse a un A para formar C pero llegaría a un punto en
donde la concentración de A se nula y solo tengamos concentración de B y C por lo que el
tiempo de reacción se vería afectado

Dada una solución de A, B y C en equilibrio, agrega una gran cantidad de C. A partir de


este punto, ¿cómo cambiarían las concentraciones de A, B y C con el tiempo?

De manera inmediata se aumentarían las concentraciones tanto de A y B por la


descomposición de C, posteriormente se equilibrarían las concentraciones de A, B y C.

Dada una solución que no contiene moléculas de A, B o C, ¿qué pasaría si agrega solo
moléculas de A y B?

Al solo agregar A y B se crearía C a una velocidad y tiempo determinado dependiente de la


concentración de estos, dando como resultado la diminución de A y B y un aumento de C
para encontrar un equilibrio y tener A, B y C en las mismas proporciones.
En una célula con abundante energía (en forma de ATP y NADH), y también glucosa y
otros carbohidratos para descomponer, podría ser ventajoso almacenar algo de esa glucosa
en forma de glucógeno. ¿Cuál de las enzimas discutidas en este video (hexoquinasa, G6P
isomerasa o PFK-1) cree que es más probable que se inhiba para desviar esos carbohidratos
en la síntesis de glucógeno para el almacenamiento? ¿Por qué?

La G6P isomerasa es la que se inhibe ya que al momento de tener la abundante ATP y


NADH sirve como marcador energético para la G6P isómeras por lo que esta se desactiva y
entra en su lugar la fosfoglucomutasa para empezar la vía de la glucogénesis

¿Es probable que se regule la fosfoglucomutasa? ¿Por qué o por qué no? ¿Qué pasa con la
glucosa 6-fosfato deshidrogenasa?
Si se regula la fosfoglucomutasa, esta depende de la insulina y de las concentraciones de la
glucosa en sangre y el requerimiento energético del individuo, en el caso de esta esta
regulada por los requerimientos de nucleótidos, coenzimas DNA o RNA

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