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Termodinámica: es la rama de la física que estudia los efectos de los cambios de temperatura, presión y
volumen de un sistema a nivel macroscópico.
ATP: moneda energética. Es el nexo entre procesos biológicos dadores de energía y procesos biológicos
consumidores de energía
Metabolismo: es el conjunto de todas las transformaciones químicas que se producen en una célula u
organismo.
Obtener energía química a partir de la energía solar o degradando moléculas obtenidas del
ambiente.
Convertir nutrientes en moléculas características de la propia célula.
Polimerizar los precursores monoméricos en macromoléculas.
Sintetizar y degradar biomoléculas para funciones especializadas.
1. Catabolismo: rutas degradativas donde moléculas orgánicas que contienen energía se convierten
en productos mas pequeños y sencillos de baja energía. Proceso OXIDATIVO. ΔG (-)
Necesitan un aporte de energía (proveniente del potencial de transferencia del grupo fosforilo del
ATP y del poder reductor del NADH, NADPH, FADH2), el cual se consume. Son rutas
divergentes.
Trabajo Biológico y Energía:
Los seres vivos captan energía de diversas fuentes. Utilizan la energía para desarrollar TRABAJO
BIOLÓGICO. Esa energía sufre procesos de transducciones y transformaciones químicas en el interior
de las células que producen el trabajo biológico, como:
Biosíntesis (anabolismo)
Trabajo mecánico (contracción muscular)
Gradientes osmóticos (transporte contra gradiente)
Trabajo eléctrico (transmisión del impulso nervioso) etc.
Ese trabajo produce un aumento de entropía y productos finales del metabolismo como moléculas simples
CO2 , H2O y calor.
Según la forma química a través de la cual se obtiene carbono del medio, los organismos vivos se
dividen en:
- Autótrofos: utilizan CO2 de la atmosfera como única fuente de carbono a partir de la cual se
construyen todas sus biomoléculas carbonadas.
Sistema: es la parte del universo que elegimos para el estudio, el cual debe tener unos limites definidos.
Cualquier cosa que no se defina como parte del sistema se considera que es el entorno. El sistema y su
entorno constituyen el universo.
Estado de un sistema: forma de comportarse el sistema en un instante dado. Cuando se produce una
variación en el estado de un sistema, se dice que este ha sufrido una transformación, un proceso en el que
existe un estado inicial y un estado final.
Todo sistema contiene una determinada cantidad de energía interna, que indicamos con el símbolo U. La
energía interna es una función de estado extensiva y se expresa en Joules (J)
A menos que un sistema este aislado, puede intercambiar energía con su entorno y modificar su energía
interna, ese cambio lo definimos como:
ΔU= Uf - Ui
- Puede transferirse calor a un sistema o desde él (calor se designa con el símbolo q)
- Puede realizar un trabajo sobre su entorno o hacer que se realice un trabajo sobre él (trabajo se
designa con el símbolo w)
“La energía ni se crea ni se destruye, solo se transforma de una forma a otra, por lo que siempre
permanece constante”. La energía interna (U) solo puede cambiar por el intercambio de calor y trabajo
con el entorno; no obstante, la energía puede convertirse de una forma a otra.
2da ley de la termodinámica: "en todo proceso el desorden total del universo aumenta”. Establece
que todo sistema tiende a su máxima entropía.
Cantidades de energía termodinámica que describen los cambios de energía que tienen lugar dentro de
una reacción química:
Energía libre de Gibbs (G): cantidad de energía de un sistema capaz de hacer trabajo biológico. El
cambio en la energía libre de Gibbs durante una reacción provee información útil acerca de la energía y
espontaneidad de la reacción. ΔG Es una función de estado: depende del estado inicial y final, no del
camino seguido o mecanismo. (J/mol)
ΔG=0, equilibrio
Si ΔG es negativo, el sistema tiene menos energía libre en su estado final que en su estado inicial. Se
produce un proceso favorable o espontaneo. Es decir, es una reacción EXERGONICA porque se libera
energía. Un ejemplo de una reacción favorable es la Hidrólisis del ATP.
Si ΔG es positivo, indica que un proceso NO es favorable. El sistema gana energía, siendo una reacción
ENDERGONICA. Se necesita energía para realizar trabajo.
Si ΔG es 0 entonces el proceso no tiene una dirección favorable en uno ni otro sentido, por lo que el
sistema está en equilibrio.
La energía liberada por las reacciones EXERGONICAS es usada para dar lugar a las reacciones
ENDERGONICAS. Las células utilizan una estrategia denominada reacciones acopladas, en la que una
reacción energéticamente favorable (como la hidrólisis de ATP) se vincula directamente con una reacción
energéticamente desfavorable (endergónica). La vinculación suele ocurrir mediante un compuesto
intermedio compartido, lo que significa que el producto de una reacción es "tomado" y utilizado como
reactivo en la segunda reacción.
Un proceso espontaneo es aquel que sucede cuando una vez que la reacción inicia, transcurre por
sí misma, sin un aporte de energía externo, hasta que se agotan los reactivos o se agota el reactivo
limitante
Todas las reacciones químicas tienden a ir en la dirección que da lugar a una disminución de
energía del sistema.
Entalpía de enlace: es la energía necesaria para romper un mol de enlace de una sustancia en estado
gaseoso.
ΔG = ΔH - T ΔS (AGAHTAS)
Cuando ΔG (-), es decir, un proceso favorable/ espontaneo, ΔH es (-) y ΔS es (+).
Se podría decir que entropia (S) y la Energia libre (G) son inversas.
Las células heterotróficas adquieren energía libre de las moléculas de los nutrientes, la cual la
transforman en ATP para realizar trabajo biológico a temperatura constante.
Un sistema tiende a continuar cambiando hasta llegar a un equilibrio. Las concentraciones de reactivos y
productos en el equilibro se definen como Keq, y vienen dada por:
Cuando no esta en equilibrio, la tendencia a desplazarse hacia el equilibrio representa una fuerza motriz,
cuya magnitud se puede expresar como ΔG. En condiciones estándar, cuando los reactivos y productos se
encuentran a concentración 1M, la presión es a 1atm y la temp es 298K o 25 C, la fuerza propulsora del
sistema hacia el equilibrio se define como variación de energía libre estándar, ΔG°.
ΔG°: Variación de energía libre de una reacción que tiene lugar en condiciones estándar:
ΔG°’: Variación de energía libre estándar a pH 7. ΔGo’ es una forma alternativa de expresar la
constante de equilibrio. Es constante, tiene un valor fijo para cada reacción. Nos dice en que dirección y
hasta que punto debe transcurrir determinada reacción para alcanzar el equilibrio cuando las condiciones
son estándar.
ΔG: es la variación de energía libre real, es variable porque depende de la [ ] de reactivos, productos y de
la temperatura.
ΔG°’ es la diferencia entre el contenido de energía libre de los
ΔGo’= - RT LnKeq’ productos y el contenido en energía libre de los reactivos en
condiciones estándar.
Keq’ > 1 ΔGo’ (-) R P
Cuando ΔG°’ es (-), los P contienen menos energía libre que los
Keq’ < 1 ΔGo’ (+) R P reactivos y la reacción trascurrirá de manera espontanea en
condiciones estándar. Si ΔG°’ es (+) los P contienen mas energía
Keq’ = 1 ΔGo’= 0 libre que los reactivos y la reacción tendrá que transcurrir de manera
inversa
ΔGo’= - RT LnKeq’
Una reacción con ΔGo’ + puede transcurrir en dirección directa si ΔG es negativa. Esto es posible si el
término RT Ln ( [P]/ [R]) de la ecuación es negativa y tiene un valor absoluto mayor que ΔGo’.
Hidrólisis de ATP: La hidrólisis del ATP proporciona energía libre para impulsar reacciones
endergónicas, energéticamente desfavorables.
Se rompe el enlace fosfoanhidro a través de una ATPasa y se genera Pi ( fosfato como ion libre en
solución, llamado fosfato inorgánico) y ADP. El ADP puede hidrolizarse aún más para dar
energía, monofosfato de adenosina (AMP) y otro ortofosfato (Pi). La hidrólisis de los grupos fosfato en el
ATP es especialmente exergónica, porque el ion molecular del ortofosfato resultante se estabiliza en gran
medida mediante múltiples estructuras de resonancia, lo que hace que los productos (ADP y P i) tengan
menos energía que el reactivo (ATP).
ATP + H2O ADP + Pi (ortofosfato)
Formación de ATP:
- Fosforilación a nivel de sustrato: transferencia de grupo fosfato desde un compuesto de alta energía al
ATP. Produce el 2% del ATP.
Los otros nucleósidos trifosfato: GTP, UTP y CTP y los deoxinucleósidos trifosfato: dATP, dGTP,
dTTP, dCTP son energéticamente equivalentes al ATP.