BIOENERGTICA

La bioenergtica puede definirse como el estudio de los cambio de energa que acompaan a las reacciones bioqumicas (termodinmica bioqumica). Tambin se encarga del enfoque termodinmico de los procesos biolgicos a nivel molecular. Los organismos vivos se dividen en dos grandes grupos, segn la forma qumica por la que obtienen carbono del medio: Auttrofos: utilizan carbono inorgnico (CO 2 ) como fuente de carbono: o Quimioauttrofos: oxidan cmpuestos inorgnicos para generar ATP y NADPH o Fotoauttrofos: utilizan fotones de la luz visibles para generar ATP y NADPH (agua como donador de electrones). Hetertrofos: utilizan compuestos orgnicos como fuente de carbono y electrones. o Fotohetertrofos: utilizan luz como fuente de energa y compuestos orgnicos como fuente de carbono. o Hetertrofos verdaderos: oxidan molculas orgnicas para generar ATP y NADPH.

METABOLISMO
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El metabolismo trata de obtener energa qumica mediante la captura de en energa solar o mediante la degradacin de nutrientes tomados del medio ricos en energa. Luego se conviertes esos nutrientes en molculas propias de la clula y se polimerizan precursores monomricos en macromolculas. Asimismo, se sintetizan y degradan biomolcular requeridas para funciones especiales: lpidos de membrana, mensajeros intracelulares, pigmentos Rutas catablicas: transforman molculas grandes en pequeas mediante reacciones de oxidacin, generando energa en forma de ATP, NAD(P)H, etc. Rutas anablicas: se sintetizan molculas grandes a partir de molculas pequeas mediante reacciones de reduccin consumiendo energa metablica.

El metabolismo intermedio se divide en: -

El contacto entre catabolismo y anabolismo es el ATP y NADPH. stos se genran en precesos degradativos y se consumen en reacciones biosintticas. Las rutas catablicas (fundamentalmente glicolisis y TCA) contribuyen con esqueletos carbonados para que comiencen numerosas rutas anablicas (2,3-BPG a partir de 1,3-BPG; F2,6-BP; Acetil-CoA; varios intermediarios del TCA). -

2,3-BPG se produce a partir de 1,3-BFG (que no sigue la glucolisis) y es un efector alosterico de la Hb. Facilita la entrega de O2 a los tejidos porque disminuye la afinidad de la Hb por el O2. F 2,6-BP a partir de 1,6; es un factor alosterico que estimula la actividad de la fosfofructokinasa. Acetil CoA: en vez de seguir el ciclo de Krebs, sale al citosol para sintetizar cidos grsos, colesterol, cuerpos cetnicos, etc. Intermediarios del TCA: o siguen el ciclo o se usan con fines biosinteticos, como el succinil CoA para sintetizar porfirinas.

Las rutas catablicas son convergentes, y las anablicas son divergentes.

REGULACIN DE LAS RUTAS METABLICAS

Las rutas metablicas estn reguladas lo que sirve para que la velocidad de la via se adapte a las necesidades de la celula y para que las rutas de sntesis y degradacin no estn activas a la vez. Sin embargo, no hay que considerar las rutas anablicas y catablicas como inversas, muchas de ellas tienen a menudo localizacin diferente. La regulacin se da a tres niveles: Por enzimas alostricos, capaces de cambiar la actividad cataltica en respuesta a moduladores estimuladores o inhibidores. (el ATP y el AMPc actan en procesos de regulacin alosterica) Mediante regulacin hormonal (se unen a receptores de membrana, que estimulan la actividad de otros receptores) Por regulacin de la concentracin de un enzima en la clula.

LEYES DE LA TERMODINMICA -

Las reacciones bioqumicas que se llevan a cabo en los organismos vivos se ajustan a las leyes fsicoqumicas de la naturaleza y estn sometidas a las leyes de la termodinmica.

SISTEMA DE REACCIN

Primera ley: en cualquier cambio fsico o qumico, la cantidad total de energa en el universo permanece constante. La energa puede cambiar de forma o puede ser transportada de una regin a otra, pero no puede se creada, o destruida. Segunda ley: en todos los procesos natrales, la entropa del universo aumenta.

El sistema de reaccin es el conjunto de materia que est experimentando un proceso qumico o fsico determinado, tanto en un organismo como en una clula. As, por tanto: Las clulas son sistemas ABIERTOS, ya que intercambian con su entorno tano materiales como energa. Los sistemas vivos no se encuentran nunca en equilibrio con su entorno. Las constantes transacciones entre el sistema y el entorno explican cmo los organismo pueden crear orden en su interior al tiempo que operan dentro de la segunda ley de la termodinmica. + =

BIOENERGTICA
Las variables termodinmicas que describen los cambios que tienen lugar en una reaccin qumica son la energa libre de Gibbs (G), entalpa (H) y entropa (S), y estn relacionadas tal que: Donde H es la tendencia a adquirir el estado de enlace energticamente ms estable y S es la tendencia a conseguir el mayor grado de desorden. H expresa una medida de la cantidad de energa absorbida o cedida por un sistema termodinmico, es decir, la cantidad de energa que un sistema puede intercambiar con su entorno. S permite determinar la parte de la energa que no puede utilizarse para producir trabajo. G es un potencial termodinmico, con unidades de energa, que da la condicin de equilicrio y de espontaneidad para una reaccin qumica ( a presin y temperatura constantes). En una reaccin, si H > 0, la reaccin es endotrmica (absorbe calor); mientras que si H < 0 es exotrmica (desprende calor). =

ENERGA LIBRE DE GIBBS

La energa libre (G) es la cantidad de energa de un sistema para realizar trabajo biolgico, a presin y temperatura constantes. Un proceso tiene a producirse si G es negativa. Sin embargo, las reacciones concretas en una reaccin global pueden ser endergnicas, puesto que estas reacciones son acopladas a otras que s desprenden energa, de modo que el proceso total es exergnico. La fuente principal de energa proviene del ATP y GTP. En este ejemplo, la tercera reaccin es exergnica, pese a que la primera sea endergnica. Eso se debe a que la segunda reaccin (la hidrlisis del ATP) es ms exergnica y cede la energa que se necesita para la primera reaccin. Si G < 0, la reaccin es exergnica o espontanea (se desprende energa) Si G > 0, la reaccin es endergnica, no espontanea (se consume energa) Si G = 0, la reaccin est en equilibrio

La energa libre ES UNA FUNCIN DE ESTADO, por lo que no depende del mecanismo seguido, sino del estado final e inicial. G ni proporciona informacin sobre la velocidad de la reaccin, solo si esta se va a dar o no.

Gibbs demostr que el cambio de energa libre G real de una reaccin qumica se da en funcin de la G estndar (G, una constante especfica de cada reaccin especfica) y de un trmino que expresa la concentracin inicial de reactivos y productos. G se define a 25C cuando la concentracin de reactivos y productos es 1M y a 1 atm de presin, y a pH = 0. En bioqumica G se define a pH = 7 y [H 2 O] = 55,5 M. Cuando un sistema de reaccin no est en equilibrio, la tendencia a desplazarse hacia el equilibrio representa una fuerza motriz. Su magnitud se expresa como el cambio de energa libre de reaccin G. Cuando un sistema ha alcanzado el equilibrio no persiste ninguna fuerza que la induzca a ir en una direccin u otra y no puede realizar un trabajo, G = 0. G = G + ln [] [ ]

En equilibrio, G = 0, por lo que:

La constante universal de los gases es una constante fsica que relaciona entre s diversas funciones de estado termodinmicas, estableciendo esencialmente un relacin entre la energa, la temperatura y la cantidad de materia. Si Keq > 1 G < 0 Si Keq < 1 G > 0 A+BC+D A+BC+D

G = ln

EL ATP Y EL SUMINISTRO ENERGTICO

El ATP suministra energa no slo por la hidrlisis, sino por la transferencia de grupo. Es una reaccin que se da en dos pasos. En el ejemplo, el grupo P se transfiere al glutamato, y luego el NH3 desplaca al P, que se libera como Pi. Los enlace fosfoanhidro del ATP poseen alta energa porque liberan elevadas cantidades de energa cuando se rompen. Esto implica que la G es muy alta. Cualquier compuesto situado en la escala por encima del ATP (1,3BPG, fosfocreatina, ADP) tender a perder su grupo fosfato y a cederlo a una molcula capaz de aceptar dicho grupo, la cual se hallar en la parte inferior de la escala (GP6, G1P, Acetil CoA). Hay que tener en cuenta que G del ATP ser diferente de la G real, ya que las concentraciones de ATP son menores que la estndar. G = -30,5 KJ/mol Otras molculas, como el fosfoenolpiruvato (PEP) tambin poseen G de hidrlisis elevadas: G real = -50 a -65 KJ/mol

PROCESOS DE FORMACIN O CONSUMICIN DE ATP

Formacin Fosforilacin a nivel de sustrato: generalmente, se suele producir fuera de la mitocondria y no interviene la ATP sintasa, sino las enzimas quinasas. Transferencia de grupo fosfato desde un compuesto de alta energa al ATP (Gliclisis). Por ejemplo, la ltima reaccin de la glicolisis, donde el fosfoenolpiruvato pasa a piruvato, hay un intercambio energtico muy elevado, por lo que se forma ATP. Lo mismo ocurre con 1,3-BPG + ADP a 3-PG + ATP. Fosforilacin oxidativa: transferencia de electrones al O 2 acoplado a la biosntesis de ATP en la membrana mitocondrial por la oxidacin de molculas como el NADH y el FADH 2 .

El 1,3-bisfosfoglicerato, cuando es hidrolizado, cede elevadas cantidades de energa:

EL FLUJO DE ELECTRONES PUEDE REALIZAR TRABAJO BIOLGICO

En este paso, se froma ATP. Hay que tener en cuenta que el fosfoglicerato posee una forma resonante que provoca estabilidad, por lo que G es baja.

El flujo de electrones es un proceso exergnico porque el O 2 tiene mayor afinidad por los e- (cuando las especies qumicas difieren en su afinidad por los e- stos fluyen espontneamente con una fuerza proporcional a la diferencia de afinidad fuerza electromotriz: fem.

La glucosa, una molcula medianamente reducida, libera electrones durante su catabolismo (oxidacin). Estos electrones pasan a travs de intermediarios hasta el O 2 .

La fem puede realizar trabajo si se coloca en el circuito un transductor de energa, el cual se puede acoplar a diferentes dispositivos para realizar trabajo til. En la mitocondria, enzimas ligados a la membrana, acoplan el flujo de e- a la produccin de una diferencia de pH transmembrana y una diferencia de potencial transmembrana con lo que se consigue trabajo osmtico y elctrico. El gradiente de protones as formado tiene energa potencial, a veces llamada fuerza protonmotriz en analoga a la fem.

ESTADOS DE OXIDACIN DEL CARBONO

+ 6 2 6 2 + 6 2

( < 0)

En BQ nos interesa saber los estados de oxidacin del C. Los C ms reducidos son los del ETANO. Los C ms oxidados. COMPLETAR

POTENCIAL DE REDUCCIN MIDE LA AFINIDAD POR ELECTRONES

Cuando 2 pares redox conjugados estn juntos en disolucin, la transferencia de e- del donador al aceptor puede ocurrir espontneamente. La tendencia de dicha reaccin depende de la afinidad relativa del aceptor de e- de cada par redox por los e-.El potencial redox standard E indica dicha afinidad 5

El standard de refencia es la reaccin:

Cuando se conecta el electrodo de H a travs de un circuito externo a otra semicelda en la que estn presentes las especies oxidada y reducida en concentracin estndar (25 C, 1M, 1 atm), los e- fluyen desde la semicelda con menor E a mayor E. Por convenio, a quien tiene mayor tendencia a captar electrones se le asigna el E positivo. [ ] 0,0598 log = + [ ]

+ + 2

1 2

(E = 0,0 V)

= +

[ ] ln [ ]

En una reaccin redox, se puede calcular el cambio del potencial redox y la energa libre: = = = () ()