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Manual de Prácticas
BIOQUÍMICA DEL NITRÓGENO Y REGULACIÓN
GENÉTICA
Recopilado por:
Gustavo Hernández Mendoza
Introducción
Bioseguridad es el conjunto de políticas destinadas a mantener la vigilancia para proteger el medio
ambiente, la salud y la seguridad de los profesionales de la industria y de la salud que realizan
actividades que involucran riesgos ocupacionales procedentes de agentes biológicos, físicos o
químicos. Hoy en día la bioseguridad debe estar integrada a todos los procedimientos y técnicas de
aseguramiento de la calidad de los procesos y está basada en los siguientes principios:
a. Conocer los agentes de riesgo en el área de trabajo.
b. Tener buenas prácticas y técnicas de laboratorios.
c. Conocer de las normas de bioseguridad.
d. Manejar del protocolo en caso de emergencias y accidentes más comunes que se producen
en los laboratorios.
Objetivo General
Conocer y aplicar las normas de bioseguridad en la manipulación de sustancias químicas orgánicas
e inorgánicas.
Materiales y Métodos
1. Leer detalladamente el Manual de Seguridad del Laboratorio de Química.
Cuestionario
1. Describe brevemente las normas básicas de conducta que se deben observar en todo
laboratorio.
2. Antes de manipular una sustancia, ¿qué es lo que se debe de hacer?
3. ¿Cuáles son las causas más frecuentes de incendio en un laboratorio de química?
4. Si un compañero ha ingerido una sustancia corrosiva y ésta le ha afectado la garganta, la
tráquea, etc., ¿por qué de provocársele el vómito?
5. ¿Por qué son necesarios los pictogramas?
6. Enlista 5 frases R y 5 frases S del HCl y NaOH
Bibliografía
Gómez M., Matesanz A.I., Sánchez, A. y Souza P. (2005) Laboratorio de Química. 2ª Edición. Ed.
UAM.
Lister, T. (2002) Experimentos de Química Clásica (“The Royal Society of Chemistry”). Editorial
Síntesis. Biblioteca de Químicas. 1ª Edición.
Introducción
El tamaño de las células escapa al poder de resolución del ojo que se define como la distancia
mínima entre dos puntos para que puedan verse como objetos separados. El descubrimiento de las
células fue posible a partir de la invención del microscopio compuesto. El conocimiento de la célula
y el papel que juega en la formación de los tejidos animales y vegetales ha avanzado de manera
paralela al perfeccionamiento de las técnicas de microscopía. Una célula animal típica mide entre
10 y 20 mm de diámetro, unas cinco veces menos que el diámetro de la partícula más pequeña
observable por el ojo humano. Se han desarrollado diferentes sistemas de iluminación para el
microscopio, que permiten observar células o tejidos vivos, o fijados y teñidos.
El microscopio de campo claro es útil para la observación de material teñido, la tinción incrementa
el contraste entre la muestra y el medio que lo rodea. La imagen formada resalta sobre un fondo
blanco brillante. En este sistema, el trayecto que sigue la luz va desde la lámpara hasta el ojo del
observador pasando por un sistema de lentes que la alinea y la concentra.
August Köhler (1866-1948), físico alemán, desarrolló un sistema que permite el alineamiento del
sistema óptico con el sistema de iluminación sobre un mismo eje. Esto se realiza tomando como
referencia el diafragma de campo, que es un dispositivo que se encuentra sobre a la fuente de luz,
que regula la apertura para el paso de ésta. El diafragma de campo permite centrar el condensador
móvil. La iluminación de Köhler crea un campo visual que ilumina uniformemente el espécimen. Esta
técnica evita la aberración cromática, mejorando la resolución de las imágenes. Se pueden cambiar
los objetivos (10X, 40X y 100X), sin tener que volver a alinear el sistema. Para el uso correcto del
microscopio es indispensable que al inicio de cualquier observación se realice la iluminación de
Köhler alineando el condensador con respecto a la fuente de luz, su finalidad es obtener la
iluminación óptima de la muestra.
Objetivos
Identificar las partes del microscopio de campo claro, aprender a realizar la iluminación de Köhler
y observar diferentes tipos celulares.
Metodología
Para que los microscopios proporcionen imágenes de buena calidad las lentes deben estar limpias,
por lo que debe evitar tocarlas, ya que las huellas digitales alteran la calidad de la imagen observada.
Solo si es imprescindible debe limpiar las lentes, para llevarlo a cabo utilice únicamente papel
especial para la limpieza de las lentes (papel seda), no emplee pañuelos desechables ni cotonetes.
En el ambiente hay pequeñas partículas de polvo y si no se utiliza el material adecuado, las lentes
se deterioran dañando la calidad de la imagen. Use aceite de inmersión solo cuando va a utilizar el
objetivo de 100X. Evite que los demás objetivos entren en contacto con el aceite. Al finalizar la
sesión de laboratorio siempre limpie el aceite de la lente.
2. Limpie con un algodón con alcohol la yema de alguno de sus dedos y píquelo con una lanceta
estéril, coloque una gota de sangre en un vidrio de reloj que contenga 2 ml de solución de NaCl al
0.9%. Coloque una gota de esta suspensión en un portaobjetos, coloque un cubreobjetos y observe
al microscopio con los objetivos de 10X, 40X y 100X.
4. En un portaobjetos deposite una hoja de elodea, ponga una gota de safranina, coloque un
cubreobjetos y observe con los objetivos de 10X y 40X.
Resultados
Esquematice las células de las muestras observadas con los objetivos de 10X, 40X y 100X, anotando
el nombre de la célula, los componentes celulares identificados, así como el aumento total
empleado (para lo cual se multiplica el aumento del objetivo por el aumento del ocular).
Discusión
Discutir los resultados con base al fundamento del microscopio.
Conclusiones
Sintetizar brevemente los puntos más relevantes, aportando los conocimientos explorados a lo
largo de la experimentación.
Cuestionario
1. Indique la importancia del microscopio de campo claro en la investigación científica.
2. ¿Qué importancia tiene realizar la iluminación de Köhler?
3. ¿Qué cuidados hay que tener al utilizar el aceite de inmersión?
4. Indique los componentes celulares que haya observado en esta práctica en cada muestra.
5. Diga las diferencias y semejanzas que hay entre las células animales y vegetales.
6. ¿Se logró el objetivo de la Práctica? ¿Por qué?
Bibliografía
Barrera-Escorcia H., Cárdenas-Reygadas., R. 1997. El Microscopio Óptico. Plaza y Valdés Editores.
México, D.F.
Keller, E, Goldman, D. R. 2006. Light Microscopy. En: Basic Methods in Microscopy . Protocols and
Concepts from Cells: A Laboratory Manual. Spector D, Goldman RD eds. Cold Spring Harbor
Laboratory Press. Cold Spring Harbor. New York.
Introducción
El ADN es una de las partes fundamentales de los cromosomas, son estructuras constituidas por dos
pequeños filamentos o brazos, que pueden ser iguales o desiguales, están unidos por un punto
común llamado Centrómero; varían en forma y tamaño, pueden verse fácilmente al momento de la
división celular por medio de un microscopio. Los cromosomas químicamente están formados por
proteínas y por el Ácido desoxirribonucleico o ADN.
Objetivos
Extraer e identificar el ADN a partir del rompimiento y separación de las estructuras que lo
envuelven y protegen en las células vegetales.
Metodología
1. Coloca en el vaso de la licuadora aproximadamente media taza de chícharos verdes secos,
1.5g de cloruro de sodio y 200 ml (UNA TAZA) de agua fría.
2. Licua a alta velocidad por 15 seg.
3. Pasa por un colador la mezcla y colócala en una probeta.
4. Mide el volumen del licuado obtenido y agrega 1/6 de ese volumen de detergente líquido
(APROXIMADAMENTE 30ML)
5. Agita suavemente para que se mezclen el licuado y el detergente líquido. Deja la mezcla
reposar de 7 a 10 min.
6. Después vacíala en tubos de ensayo llenando sólo un 1/3 de tubo.
7. Agrega 0.5 gr. de ablandador de carne (ENZIMAS) al tubo y agita suavemente. Es importante
que agites muy suavemente, ya que de lo contrario se romperá el ADN y será difícil de observar.
8. Agita el tubo de ensayo y poco a poco agrega alcohol etílico (O ALCOHOL ISOPROPÍLICO 70-
95%) procurando que se deslice por las paredes, de manera que no se mezcle con el contenido del
tubo y forme una capa en la parte de arriba de la mezcla de chícharo. Agrega el alcohol hasta que
tengas la misma cantidad de alcohol que de la mezcla de chícharo.
9. Podrás entonces observar que el ADN sube poco a poco hacia la capa de alcohol. Puedes
usar un palillo para tomar con mucho cuidado el ADN.
10. Coloca un poco del material obtenido en un portaobjetos. Agrega una gota de azul de
metileno y un cubreobjetos. Observa al microscopio.
Resultados
Elabora un esquema de lo que hayas obtenido en el tubo y otro de tus observaciones al microscopio.
Conclusiones
Sintetizar brevemente los puntos más relevantes, aportando los conocimientos explorados a lo
largo de la experimentación.
Cuestionario
1. ¿Cuál es la función del ADN en la célula?
2. ¿Qué estructuras de la célula protegen al ADN?
3. ¿Qué función tiene el detergente para la extracción del ADN? (recuerda que los detergentes
actúan sobre los lípidos)
4. El ablandador contiene enzimas que destruyen proteínas. Explica para qué se utiliza en el
experimento.
5. ¿A qué sustancia es más afín el ADN, al agua o al alcohol?
Bibliografía
Brewer, C. y Smith, D. (2011). Vision and change in undergraduate biology education: a call to
action. Washington DC, USA: American Association for the Advancement of Science. [ Links ]
Cohn, E. (1925). The physical chemistry of the proteins. Physiological Reviews, 5(3), 349-437. [
Links ]
Esteban, R., Marcos-Merino, J. M. y Ochoa de Alda, J. A. G. (2019). Extracción de ADN con material
cotidiano: diseño, implementación y validación de una intervención activa interdisciplinar.
Educación Química, 30(1), 42-57. [ Links ]
Introducción
La extracción y purificación de ADN obtenido a partir de células de mamífero es requerida para una
gran variedad de aplicaciones en biología molecular, como el diagnóstico molecular, el análisis
forense, la terapia génica, la clonación de genes, la genotipificación, la secuenciación de genes y
genomas, la identificación de mutaciones y polimorfismos de un solo nucleótido (SNP), el análisis de
metilación de ADN y los modelos de animales knockout. Constituye el punto de inicio para
importantes análisis genéticos y genómicos enfocados en resolver problemas biomédicos, así como
para investigación farmacológica y biotecnológica, entre otras. El ADN puede ser aislado
directamente de tejidos preservados, tejidos vivos sólidos o líquidos, fluidos y cultivos celulares in
vitro, tanto de cultivos primarios como de líneas celulares establecidas (Ausubeletal.,2003).
Objetivos
Extraer y purificar ADN genómico empleando una cepa microbiológica de lavadura, además de ser
capaz de describir y explicar los fundamentos del protocolo de experimentación.
Materiales y Métodos
Metodología
1. Transferir 1.5 mL de cultivo a un tubo de 1.6 mL. Centrifugar a 13,000 rpm por 1 min.
3. Remover completamente el medio de cultivo con la ayuda de una micropipeta. Si es necesario,
volver a centrifugar por 30 s. Resuspender la pastilla en 50 μL de buffer STES.
5. Agregar 50 μL de perlas de vidrio en el tubo con las levaduras resuspendidas y agregar 20 μL de
buffer TE.
Resultados
Observe y documente los cambios físicos de la muestra durante todo el proceso de extracción y
purificación.
Discusión
Discutir los resultados en base a la diferencia entre las pastillas obtenidas de la centrifugación de la
levadura, de la levadura lisada y de la obtención de los ácidos nucleicos.
Conclusiones
Sintetizar brevemente los puntos más relevantes, aportando los conocimientos explorados a lo
largo de la experimentación.
Cuestionario
1. ¿Cuál es la diferencia entre ADN genómico y ADN cromosómico?
2. Mencione 2 medios de cultivo diferentes al YPD que podría utilizar para propagar levaduras.
3. ¿Qué son las nucleasas?
Bibliografía
Ausubel FM, BrentR , Kingston R E , Moore DD, Seidman JG, Smith JA, Struh lK. Current. Protocol sin
Molecular Biology. Estados Unidos: Wiley; 2003.
Bravo AL, González-de la Rosa CH and Le Borgne S. (2019) Manual de Laboratorio de Biología
Molecular para Ingeniería Biológica. Universidad Autónoma Metropolitana Cuajimalpa (ISBM 978-
607-477-728-4. Libro electrónico http://www.cua.uam.mx/conoce-la-uam-cuajimalpa/tu-unidad-
cuajimalpa/biblioteca-dr-miguel-leon-portilla/libros-electronicos/manual-de-practicas-de-
laboratorio-de-biologia-molecular.
Introducción
Objetivos
Reconoce una de las propuestas que explican el origen de la vida.
Materiales y Métodos
Metodología
Antes de iniciar la Práctica, consulte las recomendaciones de seguridad especificadas para cada
sustancia utilizada.
Utilice bata y guantes en todo momento.
1. Limpiar y secar las charolas de preparación de geles y los peines con agua destilada y
ensamblarlos. Colocar las charolas en una superficie horizontal y nivelada.
2. Acomodar los peines en cada charola a 0.5 -1.0 mm del fondo de ellas. Preparar, en una botella
una solución de agarosa al 0.7% (p/v) y, en otra al 1.5%, en buffer TBE 0.5×, disolver la agarosa
calentando las mezclas en horno de microondas. No apretar las tapas de las botellas. Verificar que
la agarosa esté completamente disuelta por medio de agitación.
La solución de agarosa se calienta mucho y puede hervir violentamente si se calienta por largos
periodos en el horno de microondas.
3. Dejar enfriar las soluciones de agarosa por debajo de 60 °C. Verter la agarosa tibia en cada charola
nivelada y esperar a que solidifique.
4. Remover cuidadosamente los peines y montar los geles con cada charola en las cámaras de
electroforesis.
5. Verter el buffer TBE 0.5x en las cámaras hasta cubrir el gel (~1 mm por encima del gel).
6. Descongelar las muestras de ADN y los marcadores de peso molecular en hielo.
Resultados
Evalúe las imágenes de los geles al comparar la migración de las bandas de cada carril y comente el
efecto de la concentración de agarosa. Determine el peso molecular aparente de cada banda.
Discusión
Discutir los resultados con base a lo reportado por otros autores.
Conclusiones
Sintetizar brevemente los puntos más relevantes, aportando los conocimientos explorados a lo
largo de la experimentación.
Cuestionario
1. El voltaje sugerido para la electroforesis en gel de agarosa es de 1 a 5 V/cm.
Excelencia en Educación Tecnológica®
“Surcando las Bases del Éxito” 13
a. Explique a que se refiere esta relación.En la cámara utilizada en esta práctica se
aplicaron 85 V, calcule los V/cm a los que corresponde.
b. Diga cuál es el intervalo de voltajes que pueden ser aplicados en la cámara utilizada
(para ello, calcular el voltaje correspondiente a 1 y 5 V/cm).
c. ¿Qué otras macromoléculas pueden ser separadas por electroforesis en gel?
d. ¿Cuál es el polímero más utilizado para cada una de esas macromoléculas?
2. Mencione tres tipos de agarosa disponibles comercialmente y sus características.
Bibliografía
Ausubel FM, BrentR , Kingston R E , Moore DD, Seidman JG, Smith JA, Struh lK. Current. Protocol sin
Molecular Biology. Estados Unidos: Wiley; 2003.