UdeG/CUCBA/DBCyM/ABMyG Proyecto DNA Barcoding BBG
AR Villalobos-Arámbula
INFORME 1 “TÍTULO”
Recuerde que el título es lo que primero se lee por lo que debe ser atractivo, puede también plantearse como una
pregunta
Alumnos (en orden alfabético, al final el responsable del equipo en negritas e incluir su email)
Curso Biología Molecular Ciclo 2023B
Introducción (máximo media cuartilla – lo ideal dos
párrafos, incluir en el párrafo final el objetivo)
Incluye el planteamiento o formulación del problema
(objetivos, preguntas, justificación), el contexto
general de la investigación (dónde y cómo se realizó),
los conceptos centrales usados en la investigación y
sus limitaciones.
Esta sección debería justificar el objetivo de su trabajo,
enmarcando su idea particular dentro de un
paradigma de relevancia dentro de su disciplina. Incluir
al inicio un marco conceptual general que pueda
enmarcar a su trabajo en un paradigma actual.
Material y Métodos
Describir con claridad dónde, cuándo y cómo se llevó a
cabo el trabajo de laboratorio. Incluir sólo información
relevante con sus objetivos, aclarar al inicio de cada
párrafo por qué se empleó tal o cual técnica antes de
describirla (evite la transcripción de los protocolos) y
explicar detalles metodológicos únicamente si son
novedosos (o bien modificaciones a los protocolos
originales). Se sugiere algo como lo que se incluye a
continuación.
« En el equipo 1 se trabajaron ocho ejemplares de
herbario para extracción de DNA, dos ejemplares (cada
uno con dos tipos de muestras: hojas y brotes
deshidratados en gel de sílice) identificados
morfológicamente como Magnolia montebelloensis y
cuatro muestras de hongos, dos determinadas
morfológicamente hasta especie y dos hasta género
(Tabla 1). Antes de la extracción de DNA, las muestras
(trozos pequeños de entre 10-50 mg del píleo de
basidiomas deshidratados o de hoja o brote
deshidratados) se colocaron en microtubos de 2.0 mL
(tipo Eppendorf) y se trituraron con una esfera de acero
en TissueLyser LT Marca QIAGEN (Anexo 1) ».
TABLA 1. Datos de colectas del material trabajado para
extracción de DNA por el Equipo 1 de la Clase de Biología
Molecular en 2021A como parte del proyecto BBG.
Muestra Especie Phylum Orden Colector Año
29/08/2023 Guía Elaboración Informe 1 Extracción DNA
Dra.
El DNA genómico de todas las muestras se aisló
mediante el método de extracción con sales
(Referencia), con las siguientes modificaciones: PVP
(MW 10,000, Sigma) al 1 % en buffer salino,
incubación a 65°C y precipitación en isopropanol a -
20°C toda la noche. Debido a que el método de
extracción de DNA genómico proporciona una
introducción práctica al DNA, es importante
identificar los fundamentos teóricos y documentar
las condiciones óptimas en el laboratorio para cada
etapa del protocolo: 1) Homogeneización del tejido
y lisis celular. 2) Separación de proteínas y lípidos, 3)
Precipitación del DNA y 4) Purificación del DNA. Así,
en Anexo 2 se incluye la documentación de los
resultados de cada etapa del protocolo y el
fundamento teórico.
Para determinar la integridad, cantidad y pureza del DNA
genómico aislado se utilizó un gel de agarosa al 0.8 % con
GelREd marca Biotum, donde se cargaron y corrieron 5 μL
de la muestra de DNA genómico con 2 μL de buffer de
carga 6X. Debido a que la técnica de electroforesis en
geles de agarosa de DNA genómico proporciona una
introducción práctica para determinar la integridad,
cantidad y pureza del DNA aislado, es importante
identificar los fundamentos teóricos y documentar las
condiciones óptimas en el laboratorio para cada etapa del
protocolo de electroforesis: preparación del gel,
preparación del DNA para cargar, carga de la muestra en
el gel, corrimiento electroforético, documentación
fotográfica del gel, observación, análisis e interpretación
de bandas (Anexo 3). Finalmente para determinar la
integridad, cantidad y pureza del DNA aislado de cada una
de las muestras trabajadas por el equipo 1 se llevó a cabo
un entrenamiento en el análisis de resultados
esperados/observados a través de una guía (Lab 5).
Resultados y Discusión
Es importante tener en cuenta que la documentación
de los resultados de los procedimientos
experimentales va más allá de sólo presentar los datos
obtenidos o las situaciones inusuales o inesperadas, es
deseable identificar cómo y porqué ocurren y
demostrar la comprensión de los fundamentos
teóricos y de las técnicas de biología molecular
utilizadas. Y que el análisis de resultados se lleva a cabo
cuando se comparan los resultados esperados (según
los fundamentos teóricos), con los resultados
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UdeG/CUCBA/DBCyM/ABMyG Proyecto DNA Barcoding BBG Dra. AR Villalobos-Arámbula

obtenidos en los procedimientos experimentales (en Anexo 1 Muestras trabajadas por Equipo 1 de la Clase
par, equipo y en grupo), se debe hacer referencia Biología Molecular en 2023B
explícita a las formas en que se representan los datos
experimentales (Cuadros y Figuras). De igual manera, Recomiendo elaborar un Cuadro
se explica cómo lo documentado en las observaciones,
pudo o no influir en los resultados obtenidos
soportándolo con los fundamentos teóricos ya
establecidos.

Describir de forma clara y amena, los principales

resultados de sus experimentos. Conectar sus
resultados con sus objetivos para explicar para qué los
obtuvo. Para la discusión enfocarse en la
interpretación de sus principales resultados para que,
idealmente, pueda concluir dentro del marco
conceptual propuesto en la introducción. Es la sección
en donde la deducción y la especulación basada en los
propios resultados deberían encontrar un equilibrio.
Es donde el autor debería estampar su firma personal.

El protocolo de extracción y purificación nos permitió

obtener DNA genómico de buena (excelente o integro,
puro y en suficiente cantidad etc..) a partir de los
diferentes tipos de muestras de plantas y hongos. Como Anexo 2 Documentación de las etapas del protocolo de
puede observarse en la figura 1, la electroforesis extracción y purificación de DNA de las muestras
horizontal en gel de agarosa al 0.8 % permitió evaluar el trabajadas por Equipo 1 de la Clase Biología Molecular
estado físico del DNA, esto es, determinar si estaba en 2023B
degradado y si contenía sales, proteínas o RNA. Además, Etapa Documentación Fundamentos
al incluir una muestra control y un marcador de DNA con Lisis: Buffer Describir el propósito de cada
salino, SDS, reactivo utilizado en la etapa de
bandas de DNA de tamaño y concentración conocida, fue
proteinasa K, lisis
posible determinar la cantidad aproximada de DNA en calor
ng/µL (CUADRO II) lo que permitirá preparar diluciones Precipitación Describir la función del NaCl,
(10–50 ng/µL) o alícuotas de las muestras de DNA para la Proteínas: vortex, micocentifugación,
reacción en cadena de la polimerasa (PCR) y continuar NaCl 6M transferencia sobrenadante

con el flujo de trabajo del DNA barcoding. Precipitación Indicar la función del
DNA: isopropanol al agregar al
Isopropanol sobrenadante y el paso de
El trabajo con diferentes tipos de muestras por equipo mezclar por inversión suave
permitió la comparación de los resultados de cada etapa
Purificación Describir el propósito de
del protocolo de extracción de DNA. En todas las DNA: Etanol micocentifugación, decantación
muestras se consiguió aislar DNA (Fig. 1 y Cuadro II), lo al 70% y lavado
que nos permite confirmar que el protocolo de extracción Anexo 3 Etapas del Corrimiento Electroforético
de DNA utilizado es el adecuado para trabajar diferentes Etapa Técnica Conceptos
tipos de muestras y que los alumnos adquirimos las Preparación Gel Electroforesis ¿Cuál es la composición del gel y
su función en la electroforesis?
habilidades en las técnicas de laboratorio, en particular ..
Preparación Medición y ¿Cuál es la composición y la
Muestra DNA para Micropipeteo función del buffer de carga en la
Conclusiones Carga Centrifugación electroforesis en gel de agarosa?
Aquí se incluyen un resumen de todo lo realizado, los Carga Muestra DNA Electroforesis
horizontal
hallazgos más importantes de sus experimentos, las submarina
recomendaciones, el cumplimiento de los objetivos Corrimiento Incluir Fotografía ¿Qué factores determinan la
iniciales y una evaluación (aciertos, fallas y logística de Electroforético movilidad electroforética del
DNA en la electroforesis en gel
los experimentos) de agarosa?

Bibliografía

29/08/2023 Guía Elaboración Informe 1 Extracción DNA 2/2