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Biología molecular.
Tema:
Profesor:
OBJETIVO:
Separar y purificar ADN de las células mononucleares de sangre periférica por
centrifugación y filtración en columnas con membrana de sílice.
EQUIPO Y MATERIAL:
Centrifuga y baño María
Muestra de células
Congelador a -20 C
Tubo y aguja vacutainer
Gradillas
Guantes
Spin Columns with Collection Tubes
Collection Tubes (2.0 mL)
REACTIVOS:
Lysis/Binding Buffer
Digestion Buffer
Wash Buffer 1
Wash Buffer 2
Elution Buffer (10 mM Tris-HCl, pH 9.0, 0.1 mM EDTA)
RNase A (20 mg/mL) in 50 mM Tris-HCl, pH 8.0, 10 mM EDTA
Proteinase K (20 mg/mL) in storage buffer
MÉTODO:
1. Calentar el baño María a 55°C.
2. En un tubo de microcentrífuga estéril, agregar 200 uL de la muestra
de sangre fresca o congelada.
3. Agregar 180 uL de Genomic digestión y mezclar en Vortex hasta
obtener una solución homogénea.
4. Agregar 9 uL de proteinasa K a la muestra.
5. Agregar 9 uL de RNasa A a la muestra, mezclar en Vortex hasta
obtener una solución homogénea.
6. Agregar 180 uL de PureLink Genomic Lysis/Binding Buffer y mezclar en Vortex
hasta obtener una solución homogénea.
7. Incubar a 55°C por 10 minutos para promover la digestión de las
proteínas por la proteinasa K.
8. Agregar 200 uL de etanol absoluto al lisado, mezclar en Vortex
hasta obtener una solución homogénea.
9. Tomar una columna PureLink Spin Column y un tubo colector del
paquete.
10. Agregar el lisado de células a la columna.
11. Centrifugar la columna a temperatura ambiente a 10,000 g por 1 min.
12. Descartar el tubo de colección y tomar un nuevo tubo de colección, colocar la
columna en el tubo limpio.
13. Agregar 450 uL de Wash Buffer 1 (previamente diluido con etanol absoluto) a
la columna.
14. Centrifugar la columna a temperatura ambiente a 10,000 g por 2 min.
15. Descartar el tubo de colección y tomar un nuevo tubo de colección, colocar la
columna en el tubo limpio.
16. Agregar 450 uL de Wash Buffer 2 (previamente diluido con etanol absoluto) a
la columna.
17. Centrifugar a temperatura ambiente a 15,500 g por 6 minutos.
18. Descartar el tubo de colección y tomar un nuevo tubo de
microcentrifuga, colocar la columna en el tubo limpio.
19. Agregar 25-200 uL de PureLink Genomic Elution Buffer o de agua
grado molecular a la columna.
20. Incubar a temperatura ambiente (TA) por 1 min. Centrifugar a TA a
10,000 g por 1 minuto.
21. El tubo ahora contiene el ADN genómico.
22. Descartar la columna y almacenar el ADN a -20°C hasta su uso.
RESULTADOS:
Bueno, a juzgar por la siguiente práctica, la realización de la practica se llevo a
cabo con éxito ya que se logró la extracción del ADN del núcleo de la célula, esto
no servirá para la practica siguiente en la cual determinaremos la pureza del ADN
extraído.
en la práctica.
CONCLUSIÓN Y APLICACIONES:
En conclusión, la práctica fue de muy interesante ya que, bueno en este caso no
se está acostumbrado a este tipo de practicas y resulta gratificante que haya
salido bien, y que se logró seguir los pasos correctamente, el uso de los reactivos
fueron las adecuadas también la cantidad de estos, pipetear, aunque resulta un
poco de habilidad no fue un problema para el equipo.
La purificación del DNA es importante porque permite:
1. Identificar mutaciones.
2. Ver características propias de los tipos de DNA (Polimorfismo).
3. Para clonar (Genes específicos, fragmentos de cromosomas o individuos).
4. Aislar DNA afectado y compararlo con uno bueno.
5. Detectar en las muestras, la presencia de un largo espectro de agentes
patogénicos.
6. Identificar resistencia microbiana.
7. Evaluar desordenes genéticos, neurodegenerativos, neoplásicos,
inmunológicos.
8. Medicina forense para la identificación de personas.
9. Para hacer tests de paternidad.
PRACTICA NUMERO 2 “CUANTIFICACIÓN DEL ADN”
Introducción:
La espectrofotometría UV/Visible nos permite confirmar que contamos con
cantidad suficiente de ácidos nucleicos (DNA/RNA) de calidad adecuada antes de
llevar a cabo ensayos de PCR, análisis de SNPS (Polimorfismos de nucleótido
único) o la secuenciación automática de muestras de DNA de plásmidos,
productos de PCR. También nos ayudara para determinar la pureza de lo ya
obtenido.
Material:
- Nanoespectrofotómetro.
- Puntillas estériles mara
micropipeta.
- Micropipeta de 3 microlitros.
Método:
Bibliografías:
- Laura Patricia Alejos Velázquez,María del Consuelo Aragón
Martínez,Amelia Cornejo Romero. Extracción y purificación de
ADN.
http://www2.inecc.gob.mx/publicaciones2/libros/710/extraccion.p
df. Consultado el 27 de febrero 2019.
- Vallin Plous, Carlos (2007). Microarreglos de ADN y sus
aplicaciones en investigaciones biomédicas. Revista CENIC.
Ciencias Biológicas, 38(2),132-135.[fecha de Consulta 14 de
Febrero de 2020]. ISSN: 0253-5688. Disponible en:
https://www.redalyc.org/articulo.oa?id=1812/181221636005.
- Lisandro Alvarado. (2009). BIOLOGIA CELULAR EXTRACCIÓN
DE ADN . 15/02/2020, de Universidad Centroccidental Sitio web:
http://bibmed.ucla.edu.ve/edocs_bmucla/MaterialDidactico/Micro/
BioCelular/Practica/extraccion_adn.pdf.
- Gemma Rodríguez. (2014). CUANTIFICACIÓN DE ÁCIDOS
NUCLEICOS . 15/02/2020, de SERVICIO DE GENOMICA DEL
IIBm (SQP) Sitio web:
https://www.iib.uam.es/portal/documents/76122/76162/CUANTIFI
CACION+DE+%C3%81CIDOS+NUCLEICOS+V2.pdf/04333940-
c6ff-4419-ad85-cfd1e04dbca8.