Genética cuantitativa y evolución

multivariada

Anixa rubrum (Filipinas)

Problema

• Los sistemas genéticos usualmente son demasiado complejos para

modelarlos usando el álgebra de la genética de poblaciones Mendeliana
los cuales se basan en dinámicas alélicas en un número limitado de loci

• La variación de los rasgos fenotípicos usualmente es determinada por

una gran número de genes (rasgos poligénicos)

• La mayor parte de los rasgos tiene variación continua mas que discreta
(e.g., tamaño corporal, altura, color, etc)
Alelos aditivos

Supongamos un rasgo de variación continua que es el resultado de

la acción de varios loci

Frecuencia
Frecuencia

0 P
Fenotipo

Suponiendo que no hay efectos de interacción entre los loci (g1g2,

g2g5, g3g6g2, etc…), el fenotipo P resultará de la acción de los g loci
involucrados
Alelos aditivos: Ejemplo con sistema 1 gen - dos alelos

Son aquellos cuyos efectos X

fenotípicos se pueden sumar. Por
ejemplo, mientras más alelos A1 A1A1 A2A2
tenga una or, más roja será su
corola.
F1
A1A2 A1A2

F2

1 : 2 : 1
A1A1 A1A2 A2A2
fl
Alelos aditivos: 2 genes - 2 alelos cada uno
Si agregamos otro gen B con alelos aditivos B1 y B2, habrá una mayor variabilidad que en
el caso anterior. De modo que si cruzamos heterocigotos, A1A2B1B2 x A1A2B1B2
tendremos una descendencia…
Alelos aditivos Frecuencia

1/16
1/16 A1A1B1B1 4
2/16 A1A1B1B2 3
1/16 A1A1B2B2 2 3/16

1/16 A1A2B1B1 3
2/16 A1A2B1B2 2 6/16
1/16 A1A2B2B2 1

1/16 A2A2B1B1 2 3/16

2/16 A2A2B1B2 1
1/16 A2A2B2B2 0
1/16
Alelos aditivos

• Mientras mayor sea el número de loci que participan en producir

un rasgo, más suave será la distribución del rasgo

• En general se espera una distribución normal cuando la variación se

produce por la adición de un gran número de efectos (Teorema del
Límite Central)
El rol del ambiente
Partición de la variación fenotípica

• Un individuo X tiene un fenotipo que

se desvía del promedio en +P o -P
unidades del promedio

• Media poblacional en 0

• El fenotipo P es la suma de los efectos

genéticos y ambientales (X + E)

• Xm = 2

•
•
Xp = -1

Ɛ =5 } P=6
Partición de la variación fenotípica

• Si consideramos Xm, Xp y Ɛ como variables aleatorias con

distribución normal, entonces podemos estimar la varianza del
fenotipo P como:

• Como el promedio de P = 0, podemos decir que Xm =

0, Xp = 0 y Ɛ = 0

VP = VG + VE
Probabilidad de compartir alelos entre padres e hijos

Podemos expresar el fenotipo P de los parentales p como

∗ +! !
!! = !! + !! !

Y el fenotipo P de la descendencia o como

!! = !! + !! + !! !

De lo que se trata es de cuanti car la covariación de Pp y Po

!! = 2!"# !! = 2!"#(!! )!
!"# !! , !! = !"# !! = !! /2!
!"# !! , !! = !! /2!
fi
Partición de la variación fenotípica

• Suponiendo que los 2 gametos parentales son

extraidos al azar de la población, y tienen igual efecto
aditivo,
!! = 2!"# !! = 2!"#(!! )!

y suponiendo que no hay interacción entre alelos

(efectos de dominancia), la fracción de la varianza
fenotípica de la población que es atribuible a efectos
genéticos es:

2 VG VG Heredabilidad en
H = =
VG + VE VP sentido amplio

€
Probabilidad de compartir alelos entre padres e hijos

∗ +! !
!! = !! + !! !

!! = !! + !! + !! !

!"# !! , !! = !"# !! = !! /2!

!"# !! , !! = !! /2!
Probabilidad de compartir alelos entre padres e hijos

!"# !! , !! = !! /2!

• La correlación padre-hijo es una función creciente de la varianza

genética (VG)

• Sin diversidad genética, padres e hijos se parecerían tanto como

cualquier par de individuos tomados al azar en la población

• Con diversidad genética, el parecido se basa en que padres e hijos

comparten más alelos que que cualquier par de individuos
tomados al azar en la población
Podemos ahora estimar la heredabilidad

Como la probabilidad de compartir un alelo entre padres e hijos es 1 (r = 1),

la pendiente beta representa la heredabilidad del alelo (en sentido amplio)
Posibilidades
Efectos no aditivos

• Pero este es un modelo algo irreal, sin efectos no aditivos. En otras

situaciones algo más complicadas de interacción génica, los alelos
pueden interactuar y producir una fuente de variación adicional
sobre el fenotipo que llamaremos dominancia.

Interacción entre alelos

Sin interacción Con interacción
Dentro de un locus Aditiva Dominancia
Entre loci Aditiva Epistasis
Inclusión de la dominancia

• Al haber efectos de dominancia,

podemos estimar la fracción de la
varianza fenotípica de la población que
es atribuible exclusivamente a la
acción de efectos genéticos aditivos o
heredabilidad en sentido estrecho
como

2 VA VA
h = =
VA + VD + VE VP

€
Efectos maternos

• Una de las causas más importantes de parecido entre

padres-hijos no atribuible a la genética son los efectos
maternos (plantas, cuidado materno o paterno, nutrimiento
de embriones o fetos, etc).

• La mejor manera de obtener estimaciones de varianza

genética aditiva y heredabilidad que no contengan efectos
maternos es considerar solamente los efectos de los padres.

• Lo que necesitamos es algún método que nos permita

estimar los componentes de la varianza fenotípica en una
población.
Diseño de hermanos completos

!!" = !! + !! + !!! !
• zij = fenotipo de la
descendencia j del padre i

• si = efecto del padre i

• eij = error residual

(dominancia, varianza
ambiental, efecto
materno

Vz = Vs + Ve
Diseño de hermanos completos

!!" = !! + !! + !!! !
• zij = fenotipo de la
descendencia j del padre i

• si = efecto del padre i

• eij = error residual

(dominancia, varianza
ambiental, efecto
materno

Vz = Vs + Ve

Análisis de varianza de una vía

Diseño de hermanos completos/medio hermanos

!!"! = !! + !! + !!!! + !!"# !

• zijk = fenotipo de la k-ésima

cría de la familia del i-ésimo
padre y la j-ésima madre

• dij = efecto del la j-ésima

madre apareada con el
iésimo padre (efecto
materno)

• eijk = error residual

(dominancia, varianza
ambiental)

Vz = Vs + Vd + Ve
Diseño de hermanos completos/medio hermanos
El teorema fundamental de la selección natural

!
Δ! = ! !"#! !
!
El TFSN representa la acción de fuerzas opuestas

• La selección natural aumenta el tness

promedio de la población

• Otros procesos (mutación, deriva

genética, recombinación, etc.) mueven
la población en direcciones arbitrarias

• La selección natural aumenta la

frecuencia de los fenotipos más
adecuados a lo largo de las
generaciones

• La selección natural desplaza la

población hacia un genotipo óptimo de
acuerdo a las condiciones del ambiente.
Esto es lo que genera adaptación local
fi
Avance hacia un óptimo estable
Criterios para selección natural
 Tipos generales de selección

Medel
Los pinzones de Darwin

Los individuos que componen

las poblaciones son variables
y tal variación es, al menos en
parte, transmitida de padres a
hijos

Peter & Rosemary Grant

Los pinzones de Darwin

El número de pinzones
decreció desde 1975-1978
aparentemente debido a una
disminución en la abundancia
de semillas
Los pinzones de Darwin

Las semillas grandes y

duras fueron más
prevalentes en el tiempo
de sequía El Niño
lo cual ocasionó evolución
en el pico del pinzón
Coe cientes de selección (caso univariado)

Diferencial de selección Gradiente de selección

* COV (w,t)
s=t −t β=
Var(t)

€
fi
Selección direccional
Selección direccional

El diferencial de selección
es la diferencia entre el
promedio de la fracción
escogida y el promedio de
la población antes de la
selección
Respuesta a la selección (caso univariado)
Diferencia entre el valor promedio de la descendencia con el
promedio de la población en la generación previa.

h 2
=
[*
O − O]
=
R
[P *
− P] S

2
R=h s
€

€
Volviendo a los parámetros genéticos

El diferencial de selección
es la diferencia entre el
promedio de la fracción
escogida y el promedio de
la población antes de la
selección
Pregunta

• Para qué nos sirven los parámetros de heredabilidad y

correlaciones genéticas si tenemos las medidas de selección?

• Para hacer predicciones a corto plazo de cuánto cambio

evolutivo se espera que ocurra entre generaciones dadas
ciertas condiciones
Selección sobre rasgos correlacionados

Las estimaciones anteriores, si bien son útiles como

primera aproximación, confunden los efectos
directos de la selección sobre un carácter con
cualquier otro rasgo correlacionado
Gradientes de selección (caso multivariado)
Gradiente de selección direccional: Coe ciente de regresión
parcial en análisis de regresión múltiple (incluyendo sólo los términos
lineales). Indica el cambio parcial en el promedio fenotípico y re eja
selección direccional sore el carácter.

n n n n
$ 1' 2
w = α + ∑ β i zi + & )∑ γ ii zi + ∑ ∑
i=1
% 2 ( i=1 i=1 i< j

fi
fl
Gradientes de selección
Gradiente de selección direccional: Coe ciente de regresión
parcial en análisis de regresión múltiple (incluyendo sólo los términos
lineales). Indica el cambio parcial en el promedio fenotípico y re eja
selección direccional sore el carácter.

Gradiente de selección estabilizador/disruptivo: Coe ciente

de regresión parcial en análisis de regresión múltiple (incluyendo todos
los términos lineales, cuadráticos y productos). Indica el cambio parcial
en la varianza del carácter y re eja selección estabilizadora o disruptiva
dependiendo del signo del coe ciente.

n
$ 1' n 2
n n
w = α + ∑ β i zi + & )∑ γ ii zi + ∑ ∑ γ ij zi z j
i=1
% 2 ( i=1 i=1 i< j
fi
fl
fi
fi
fl
Selección estabilizadora sobre un insecto agallador

Weis & Abrahamson (1986)

Selección disruptiva sobre el pico de un un pinzón semillero

Pyrenestres ostrinus

Bates Smith (1993)

Selección disruptiva sobre el pico de un un pinzón semillero

Bates Smith (1993)

Gradientes de selección

Gradiente de selección correlacional: Coe ciente de regresión

parcial en análisis de regresión múltiple (incluyendo todos los términos
lineales, cuadráticos y productos). Indica el cambio parcial en la covarianza
entre cualquier par de caracteres i,j y re eja selección si la selección actúa
sobre la correlación entre los rasgos.

n
$ 1' n 2
n n
w = α + ∑ β i zi + & )∑ γ ii zi + ∑ ∑ γ ij zi z j
i=1
% 2 ( i=1 i=1 i< j

€
fl
fi
Selección correlacional

Permite estimar super cies de tness en combinaciones de rasgos

fi
fi
El ejemplo de las serpientes de Brodie

Thamnophis sirtalis

Brodie et al. (1995)

Componentes multiplicativos del tness

Podemos distinguir episodios de selección si identi camos

distintos componentes del tness a lo largo de la vida de los
individuos

Semilla (1) Plántula (2)

Reproductor (4) Juvenil (3)

fi
fi
fi
Dinámica de tness

fi
Los paisajes son dinámicos
Tristerix aphyllus (Loranthaceae)

• Planta holoparásita exclusiva

de cactáceas

• Pérdida de hojas representa

una posible adaptación a
nuevos hospederos
cactáceas

• Interacción antagonista que

ocurre desde ca. 5 millones
de años en las zonas áridas y
semiáridas de Chile
Ciclo de infección
Cambio en el signo y magnitud

Longitud Grosor Densidad

1997 *
1998
1999 *** *** ***
*
Año

2000
2001 *
2002 * **
2003 ** ***
2004 ** ***
2005 * * **
2006
-0.5 0.0 0.5 1.0 -1.0 -0.5 0.0 0.5 1.0 -0.5 0.0 0.5

Cambio fenotípico esperado

Respuesta a la selección (caso multivariado)

Respuesta a la selección. Cambio

Δz = fenotípico esperado entre padres y
descendencia
Δz = Gβ G= Matriz genética de varianza-covarianza

β = Gradiente de selección
€
€ 1# Δz & ) Var1 Cov12 Cov13 ,#β1 &
% ( + .% (
Δz
% ( +
2 = Cov12 Var2 Cov 23 .%β 2 (
€ %$Δz (' +*Cov Cov 23
.% (
Var3 -$β 3 '
3 13
Respuesta multivariada a la selección
 Plasticidad fenotípica

Medel
 El problema

Si los ambientes que una especie ocupa son

heterogéneos, debe haber distintos óptimos locales de
tness. Por lo tanto, es poco probable que un único
fenotipo con era el máximo tness en todas las
situaciones. Fenotipos tolerantes debieran ser favorecidos
en tales circunstancias.

Medel
fi
fi
fi
De niciones

Plasticidad fenotípica: Es la propiedad de un

genotipo determinado para producir distintos
fenotipos en respuesta a distintas condiciones
ambientales.

Comportamiento
Morfología
Fisiología
Crecimiento
Historia de vida
Demografía

Medel
fi
 Funciones de representación genotipo-fenotipo

Sistema Mendeliano simple

Gen A Rasgo 1

Gen B Rasgo 2

Gen C Rasgo 3

Medel
 Funciones de representación genotipo-fenotipo

Modelo genético cuantitativo

Gen A

Gen B Rasgo 1

Gen B

Medel
 Funciones de representación genotipo-fenotipo

Modelo de plasticidad fenotípica

Ambiente 1
Gen A
Fenotipo 1
Gen B

Gen A Ambiente 2

Fenotipo 2
Gen B

Medel
 Funciones de representación genotipo-fenotipo

Modelo de efectos epigenéticos + plasticidad

Ambiente 1
Gen A
Fenotipo 1
Gen B
Desarrollo

Gen A Ambiente 2

Fenotipo 2
Gen B

Medel
Visualización: normas de reacción

X(E) = c 0 + c1 E + e

• Plasticidad y norma de
reacción son conceptos
€ distintos.

• La norma de reacción es una

función que describe la
relación genotipo-especí ca
entre ambientes y fenotipos

• La plasticidad es un atributo
de la norma de reacción

Medel
fi
Visualización: normas de reacción

! Hay variación genética ! No hay variación genética

! No hay efecto ambiental ! Hay efecto ambiental
! No hay plasticidad ! Hay plasticidad
! No hay variación en plasticidad ! No hay variación en plasticidad

Medel
Visualización: normas de reacción

! Hay variación genética ! Hay variación genética

! Hay efecto ambiental ! No hay efecto ambiental
! Hay plasticidad ! No hay plasticidad
! Hay variación en plasticidad ! Hay variación en plasticidad?

Medel
¿ Por qué es importante estudiar plasticidad fenotípíca ?

Recordemos la descomposición del valor fenotípico de los individuos como

diferencias respecto de la media poblacional y de las subpoblaciones (grupos)
a las que pertenecen.

Modelo lineal

2 2 2
Componentes de la varianza σ =σ +σ
P G E

Modelo lineal + Interacción

€

Medel
 2 2 2 2 2
σ =σ +σ +σ +σ
P G E I e

y podemos€estimar la heredabilidad de las plasticidad como

2
2 σ I
h =
pl 2 (Scheiner & Lyman 1989)
σ P

Medel
Aproximaciones empíricas

• Manipulaciones ambientales
• Experimentos de transplante
• Manipulaciones fenotípicas
• Selección arti cial

Medel
fi
Manipulaciones ambientales

Análisis de varianza
Fuente gl
Genética (G) NG-1
Ambiental (E) NE-1
GxE (NG-1)(NE-1)
Error NGNE(n-1)

Modelo de efectos aleatorios

Modelos mixtos

Medel
Experimentos de transplante

Clonal Expectativa

Los clones se expresan en distintos

fenotipos entre ambientes

Medel
Manipulaciones ambientales

45
35

Tiempo de
desarrollo
Cerdas

25 0

14 21 26 14 21 26
Temperatura (˚C) Temperatura (˚C)

Medel
Manipulaciones fenotípicas: fenocopias y mutantes

Impatiens capensis Arabidopsis thaliana

Medel
Flexibilidad fenotípica

Son cambios fenotípicos reversibles que ocurren a lo largo de la vida de un

individuo como respuesta a un cambio ambiental

Las iguanas con mayor capacidad de

Erizos de mar convergen hacia un alto modi car su masa corporal en
o bajo diámetro corporal momentos de escasez de alimento
dependiendo de su densidad y tiene mayor sobrevivencia
disponibilidad de alimento

Medel
fi
Flexibilidad fenotípica

• Modi caciones del tracto

alimentario dependen de
la disponibilidad de
recursos en el ambiente

Medel
fi
Variación fenotípica cíclica

• Son cambios fenotípicos

relacionados al tness que
ocurren periódicamente a lo
largo del ciclo de vida de los
organismos en respuesta a
cambios ambientales

Medel
fi
Variación fenotípica cíclica

• Son cambios fenotípicos

relacionados al tness que
ocurren periódicamente a lo
largo del ciclo de vida de los
organismos en respuesta a
cambios ambientales

¿Son evolutivamente importantes estos cambios rápidos

inducidos por el ambiente?

Medel
fi
 Si las ventajas de ser plástico son tan
grandes, entonces, ¿ por qué no todos los
fenotipos son plásticos o presentan
plasticidad ilimitada ?

Medel
 Si las ventajas de ser plástico son tan
grandes, entonces, ¿ por qué no todos los
fenotipos son plásticos o presentan
plasticidad ilimitada ?

Porque hay costos a la plasticidad

• Mantención
• Producción
• Adquisición de información
• Inestabilidad del desarrollo
• Genéticos
Medel