Estructura de los ácidos nucleicos

Thursday, May 26, 2022 4:07 PM

Generalidades de los ácidos nucleicos

Son moleculas poliméricas, hay dos tipos:

1. Monómeros de ribonucleótidos
2. Monómeros de desoxirribonucleótidos

Qué es un nucleótido? Es un ente molecular formado por una azúcar

(aldopentosa), base nitrogenada heterocíclica y acido fosfórico ionizado.

Base + azúcar = nucleósido

Nucleósido + fosfato = nucleótido

Las bases nitrogenadas son:

• Pirimídicas derivadas de la pirimidina, con un anillo sencillo, heterociclo con
grupos amino y ceto, la timina tiene un grupo metilo.
• Bases púricas derivadas de las purinas, anillo doble, heterociclo con grupos
amino y ceto.

Las bases púricas se unen por enlaces β -N-Glicosídico (tipo β) con el que se va a
unir la pentosa con la base nitrogenada en el N9 para purinas y el N1 para
pirimidinas.

Las primas son las posiciones del C esñn el azucar, de acuerdo al OH en la posición
del C2' es una ribosa o una desoxirribosa el nombre correcto es la 2' desoxi - D-
rribosa.

El otro enlace es con el fosfato y el C5' de la aldopentosa, se realiza un enlace

fosfodiester, como estamos a pH fisiologico esta cargado negativamente, es decir
desprotonado.

Esta carga negativa le confiere al nucleotido una dualidad en la estructura, pues el

fosfato tiene un caracter ácido y la base básico xD.

Funciones de los ácidos nucleicos

1. Almacenan la información genética.

2. Participan activamente en la expresión de la información génetica.

Estructura de los polímeros de nucleotidos

1. Lineal: bicatenarios como el DNA , el cual tiene extremos definidos

siendo una molecula lineal de doble cadena.
2. Circular: los extremos bicatenarios se unen y se cierran y se forma una
estructura circular cerrada covalentemente.

DNA cadena doble, RNA cadena sencilla, pero hay excepciones, la forma universal
de almacenanmiento es dsDNA y ssRNA.

En los virus puede haber de

todas las variedades,
Genoma: comjunto de todas las moleculas de DNA que tienen la informacion circular o lineal.
genetica de un organismo

En la celulas se divide en dos categorias: pDNA: plasmídico

mtDNA: mitocondrial
1. DNA cromosomal cpDNA: cloroplasto
2. DNA extra cromosomal: plasmidos y organelos (mitocondria, cloroplastos)

Tipos de RNA

El RNA y las proteinas evolucionaron

a la par, no es quien fue primero, el
rRNA cataliza la traducción
 - Housekeeping ncRNA: es RNA no codificante que esta involucrado en la
sintesis de proteínas (mantenimiento celular) como:
○ tRNA: RNA de transferencia permite de llevarlos al ribosoma e
incorporarlos uno a uno a la sintesis de proteínas.
○ rRNA: RNA ribosomal partícula ribonoproteica parte catalítica del
ribosoma
- Regulatory ncRNA: moléculas que auxilian a la regulacion de la transcripcion
y replicación:

Estructuras a aprender:

Recordemos que el nombre completo seria β-D-ribofuranosa (RNA) y β-

D-2'dexorribofuranosa.

Las bases nitrogenadas:

Revisa la Numeración

Bases nitrogenadas:

La timina y el uracilo son casi iguales con excepción de la metilación en el C5, por
Puente de hidrogeno: interaccion entre 2 atomos
lo que son bases homologas.
electronegativos y estos son puenteados por H que
conecta a los atomos.
Propiedades fisicoquímicas de las bases nitrogenadas:

 Formacion de puentes de hidrogeno:

 Absorción de luz UV debido a los dobles enlaces conjugados.
 Solubilidad es parcialmente hidrofobicas debido al heterociclo, lo que
3Dimensionalmente le da la tendencia a agruparse y apilarse con
interacciones hidrofobicas, aumentan las de van der Walls, son moleculas
planas que se van a apilar y juntarse hasta que el impedimento esterico haga
que se repelen y se giran para ya no interaccionar y van formando la helice.
Se apilan de forma helicoidal.
 Donador/Aceptor de H
Tautómeros (del griego tauto = igual y
griego meros = la parte) se denominan
 dos isómeros que se diferencian solo en
la posición de un grupo funcional.

Tautomeria ceto enol: desplazamiento de los

electrones para frmar dobles enlaces.

 La presencia de enlaces dobles entre los atomos electronegativoss de las

bases forma tautomeros.

Estas propiedades en amarillo son fundamentales para el almacenamiento y la

correcta transmisión de la info genética.

Se complementan entre donadores en una forma determinada, A con T pero si

cambias la forma se generan otros pares.

En la imagen vemos la formación de enlaces mediante puentes de hidrogeno en

una orientación determinada

Apareamiento de bases mediante formación de puentes de hidrogeno

A las moleculas que forman pares de bases de acuerdo a las moleculas de arriba se
les llama pares Watson-Crick:

C-G: C=O 2 con imino 2 Un par Watson y Crick se le llama al

Imino 3 con imino 1 apareamiento de bases CG y AT con la
Amino 4 con C=O 6 formacion de 3 y 2 puentes de H
respectivamente.
T-A: imino 3 con imino 1
C=O 4 con amino 6

Pero si estas se encuentran en otra forma se forma un tautomeros y se aparean de

diferente forma, a estas se les llama Hoogsteen, estos solo forman dos puentes de
Ejemplos:
H:

Todas las bases pueden tener tautomeros raros:

Cuando se generan tautomeros raros cambian el patrón de apareamiento, es

decir, la citocina ya no se aparea con guanina pero puede hacerlo con adenina.
Timina con guanina. Lo cual tiene como consecuencia la perdida de
complementariedad y de que ya no sabes cual es la complementariedad correcta
de la cadena ademas de que durante la sintesis se genera MISSMATCHING o
apareamiento erróneo durante la replicación:

Es decir que si la guanina esta en su forma tautomeríca rara se va a aparear con T y

si esto no se corrige durante la segunda ronda de replicación se van a formar
mutantes. A esto se le llama mutación puntual.

Formacion de los polinucleotidos

Es decir que si la guanina esta en su forma tautomeríca rara se va a aparear con T y
si esto no se corrige durante la segunda ronda de replicación se van a formar
mutantes. A esto se le llama mutación puntual.

Formacion de los polinucleotidos

El fosfato se va a enlazar con el OH3' de un nucleotido formando un enlace

fosfodiester con la posición 5' de otro nucleotido.

En el extremo 5' se tiene un fosfato libre y en el extremo 3' se tiene un OH libre

porque ya no hay otro nucleotido enlazante.

MODELO DE LA ESTRUCTURA DE LA DOBLE HELICE DEL DNA

El DNA es una doble cadena de polinucleotidos en la que las cadenas son

antiparalelas (5' -> 3'/ 3' <- 5') en la que las cadenas estan unidas por puentes de
hidrogeno complementarios entre bases puricas y Pirimídicas (A=T) (C≡G).

La doble cadena forma una estructura helicoidal (doble helice) en la que se forman
surcos en su superficie (Mayor y menor) con una periodicidad de 36 A por vuelta
con un diámetro de 20 A en la que las bases nitrogenadas estan apiladas al centro
y los fosfatos proyectados hacia el exterior, entre cada base apilada hay una
distancia de 3. 4 A lo que nos da una cantidad de 10 pares de bases por cada
vuelta.

Elementos fundamentales de la cadena de doble helice:

○ Cadenas
○ Disposición de las cadenas
○ Como se unen
○ Como se forma la helice
○ Cuales son las dimensiones de la helice
○ Como estan dispuestos los nucleótidos dentro de la helice (bases dentro, PO
afuera)

Concepto de doble helice

Las dos cadenas van girando pero al girar ambas se forma la doble helice y los
surcos al girar, sino solo seria una trenza.

Los surcos ayudan a visualizar la secuencia, ahí se interactúa a pesar de que la

cadena este cerrada, los surcos son las caras visibles. Y las proteinas pueden
interactuar con el DNA a pesar de que este cerrada la molecula.

Esta estructura del doble helice, puede alargarse, acortarse, es flexible, esto
ocasiona que se abran mas los surcos y haya una mayor interaccion.

Recuerda que las molecula tienen puntos de giro importantes, por lo que ocasiona
que no solo tengamos una forma del DNA.

Si se cambia las condiciones ambientales se forman las isoformas A y Z. La A es

mas ancha y la Z es levogira. La B es la mas comun.
Hay una cuarta que es la triple helice en donde tiene una tercer helice insertada en
los surcos, tiene un giro en forma de bisagra en donde se repite mediante
Hoogsteen:

También tiene 4 cadenas y tiene muchas GGGGG repetidas, haciendo bucles, es

decir que son 4 cadenas unidas.

En el RNA se forman estructuras mas complejas de tallo y asa, esto es porque

estan plegadas sobre si misma y son complementarias entre si mismas, y forman
estructuras de doble cadena pero estan plegadas sobre si mismas.