03.

Aminoácidos

Verónica González Núñez

Universidad de Salamanca
ESQUEMA

I. Definición, funciones y clasificación

II.  Aminoácidos proteinógenos codificables

III. Aminoácidos proteinógenos no codificables

IV.  Aminoácidos no proteinógenos

V. Derivados de aminoácidos

VI. Comportamiento ácido‐base de los aminoácidos
Ec. Henderson‐Hasselbalch
Formas iónicas de los aminoácidos
Punto isoeléctrico (pI)
Curvas de valoración de los aminoácidos
I. AMINOÁCIDOS. DEFINICIÓN

Concepto de aminoácido
Compuesto nitrogenado que se caracteriza
por presentar un grupo amino (‐NH2) y un
grupo carboxilo (‐COOH) unidos al mismo
carbono (C)

Estructura de un ‐aminoácido
Estudio de los aminoácidos: Estructura química
Propiedades químicas y biológicas
Abreviaturas (3 letras y 1 letra)
Esencialidad
Aminoácidos. Características

Funciones
Estructural ‐ Forman parte de las proteínas
Informativa ‐ Hormonas: T3, T4
‐ Neurotransmisores: Glu, Gly, GABA
‐ Mediadores químicos: histamina

Generalmente NO tienen función energética

Aunque sí se emplean como combustible alternativo en ausencia de otros
sustratos (Glc, AG) = 4 Kcal/g
Las cadenas hidrocarbonadas de los  se pueden degradar hasta acetil‐CoA ó
acetoacetil‐CoA, ó bien hasta precursores de Glc
En base a la vía degradativa, los  se clasifican en:
  glucogénicos: transformación en precursores de Glc
Gly, Ala, Val, Met, Ser, Thr, Cys, Pro, Asn, Gln, Asp, Glu, Arg, His
  cetogénicos puros: se transforman en acetil‐CoA ó acetoacetil‐CoA
Leu, Lys
  mixtos: parte de sus C se transforman en acetil‐CoA ó acetoacetil‐CoA y
otros C en precursores de Glc
Ile, Phe, Tyr, Trp
Características de los aminoácidos (II)

Características generales
‐ Anfoterismo: pueden actuar como
ácidos ó como bases, dependiendo del
pH del medio
‐ Se pueden polimerizar
 Formación de péptidos y proteínas
‐ Propiedades ácido – base claves para su
funcionalidad
‐ Estructura tetraédrica con al menos un
carbono asimétrico (menos la Gly): C
 Estereoisomería
‐ Todos los  proteinógenos son L‐
‐ Diversidad en sus propiedades físicas
‐ Diversidad de grupos funcionales en su Configuración S de la mayoría de los L‐
cadena lateral, y por lo tanto de su
reactividad química
‐ Peso medio: 110 Da
Clasificación de los aminoácidos

Clasificación Aminoácidos proteinógenos codificables (20)

Aminoácidos proteinógenos no codificables
Aminoácidos no proteinógenos
Derivados de aminoácidos

Esencialidad

Los  esenciales han de ser aportados por la dieta, ya que no pueden ser
sintetizados de novo en humanos
 esenciales: Val, Leu, Ile, Met, Phe, Trp, Thr, Lys, His (Arg)
 condicionales: Arg, Cys, Gln, Gly, Pro, Tyr, Ser
‐ esenciales en determinados momentos, enfermedades ó estrés
‐ ej. la Arg es esencial en niños pequeños porque sus requerimientos son mayores
que su capacidad para sintetizarla por el ciclo de la urea

Características de los aminoácidos proteinógenos
Indice hidropático
Frecuencia de aparición en las proteínas
Número de tripletes que lo codifican
Asx: Asp ó Asn
Glx: Glu ó Gln
II. AMINOÁCIDOS PROTEINÓGENOS CODIFICABLES (20)

SIEMPRE SON L‐aminoácidos

Clasificación
 hidrofóbicos alifáticos (7): Glicina (Gly), Alanina (Ala), Valina (Val), Leucina (Leu),
Isoleucina (Ile), Metionina (Met), Prolina (Pro)
 hidrofóbicos aromáticos (3): Fenilalanina (Phe), Tirosina (Tyr), Triptófano (Trp)
 hidrofílicos sin carga (5): Serina (Ser), Treonina (Thr), Cisteína (Cys), Asparragina
(Asn), Glutamina (Gln)
 ácidos (2): Ácido aspártico (Asp), Acido glutámico (Glu)
 básicos (3): Lisina (Lys), Arginina (Arg), Histidina (His)

Numeración
de los C de los 
Aminoácidos hidrofóbicos alifáticos (I)

Glicina (Gly), Alanina (Ala), Valina (Val), Leucina (Leu), Isoleucina (Ile) & Metionina (Met)
Prolina (Pro)
Características
‐ Hidrofobicidad de la cadena lateral (exc. Gly)
‐ Localizados en el interior de las proteínas
‐ Contribuyen a la formación de la estructura global de la proteína (debido al efecto
hidrofóbico)
‐ Reactividad química muy baja

Ala –  muy frecuente en las proteínas

Gly – el  más pequeño. Muy flexible
 muy pequeño y menos frecuente que la Ala
puede aparecer en los giros o codos de las proteínas (giros en )
es aquiral =sin actividad óptica porque no presenta ningún carbono asimétrico
forma parte de la triple hélice del colágeno

Met –  iniciador en la síntesis de proteínas

Leu, Ile, Val – s ramificados
Ile ‐ 2 carbonos asimétricos
Aminoácidos hidrofóbicos alifáticos (II)

Gly Ala Pro Val

Leu Ile Met

Prolina

Prolina (Pro)

‐ Es un iminoácido: el grupo amino forma parte de un ciclo

‐ Aminoácido con gran rigidez estructural, por lo que no puede estar presente
en las estructuras secundarias de las proteínas como el ‐hélice y la ‐lámina
(produce distorsiones)

‐ Importante papel estructural: codos de las proteínas (giros en )

triple hélice de colágeno (como hidroxiprolina)

‐ Invariable en series filogenéticas

Aminoácidos hidrofóbicos aromáticos (I)

Fenilalanina (Phe), Tirosina (Tyr) & Triptófano (Trp)

Características
‐ Alta hidrofobicidad
‐ Muy voluminosos
‐ Tienden a localizarse en el interior de las proteínas

‐ Tyr – grupo –OH  se puede disociar (O‐) a pH muy alto

se puede fosforilar

‐ Presentan absorbancia a 280nm  detección de proteínas por

espectrofotometría sin degradar las proteínas
(problema: diferencias en la % de  aromáticos entre las distintas proteínas)

Precursores de hormonas y neurotransmisores

Tyr: melanina
catecolaminas: adrenalina, noradrenalina, dopamina
hormonas tiroideas
Trp: serotonina
Aminoácidos hidrofóbicos aromáticos (II)

Phe Tyr Trp

Aminoácidos hidrofílicos sin carga (I)
Serina (Ser), Treonina (Thr), Cisteína (Cys), Asparragina (Asn) & Glutamina (Gln)
Características
‐ Mayor carácter hidrofílico. Se localizan en la superficie de las proteínas
Hidroxiaminoácidos ‐ Ser, Thr
‐ Participan en la formación de enlaces glicosídicos: son sitios de unión de glúcidos a
las cadenas proteicas para formar glucoproteínas
‐ El grupo –OH se puede fosforilar, siendo un mecanismo de regulación de la actividad
proteica
‐ Ser: localizada en el centro activo de enzimas
‐ Thr: 2 carbonos asimétricos

Amidas de los ácidos dicarboxílicos – Asn, Gln

‐ Intermediarios en el metabolismo nitrogenado
‐ Gln: recaptación de neurotransmisores
mecanismo de tampón de grupos amonio
‐ Asn: sitio de unión de glúcidos a las cadenas proteicas para formar glucoproteínas
‐ Participan en la donación de esqueletos carbonados para la gluconeogénesis (GNG)
Aminoácidos hidrofílicos sin carga (II)

Tioaminoácidos – Cys

‐ Formación de enlaces disulfuro, intra‐ e intercatenarios, estabilizando la estructura

terciaria ó cuaternaria de las proteínas

‐ Participa en el centro activo de enzimas (reacciones redox)

‐ El grupo –SH se puede disociar (S‐) a pH muy alto

‐ Puede formar parte de complejos con iones metálicos (ej. Dedos de Zn)

‐ Forma parte del glutation (GSH), y la oxidación de sus Cys permite regular el estado
redox del medio interno

‐ Curiosidad: la oxidación de las Cys de las queratinas del pelo permite que éste
adopte la estructura rizada
Aminoácidos hidrofílicos sin carga (III)

Ser Thr Cys

Asn Gln
Aminoácidos ácidos (I)

Acido aspártico (Asp) & Acido glutámico (Glu)

Características

‐ Carga negativa a pH fisiológico debido al grupo carboxilato de la cadena lateral

‐ Muy polares, por lo que se encuentran en la superficie de las proteínas
‐ Pueden formar puentes salinos con cationes
iones inorgánicos: sitios de fijación de cationes en las proteínas, por ejemplo
iones metálicos
con cadenas laterales cargadas positivamente: formación de puentes salinos
para la estabilización de las estructuras terciaria y cuaternaria de las proteínas
‐ Se localizan en el centro activo de glicosidasas y Serín proteasas
‐ Implicados en el metabolismo nitrogenado: transferencia de grupos amino mediante la
acción de las siguientes enzimas: ASAT, ALAT, Glu DH, Gln sintetasa, Glutaminasa
‐ Relación con la GNG: las reacciones de transferencia de grupos amino (ASAT) permiten
incorporar los restos carbonados de ciertos aminoácidos a la vía gluconeogénica
Aminoácidos ácidos (II)

Acido aspártico
Asp
Acido glutámico
Glu
Aminoácidos básicos (I)

Lisina (Lys), Arginina (Arg) & Histidina (His)

Características

‐ Carga positiva de Lys y Arg a pH fisiológico debido al grupo aminoderivado de la

cadena lateral
His: carga positiva ó neutra, ya que pKR ≈ pH fis

‐ Muy polares, por lo que se encuentran en la superficie de las proteínas

‐ Pueden formar puentes salinos con aniones, especialmente con cadenas laterales
cargadas negativamente: estabilización de las estructuras terciaria y cuaternaria de
las proteínas

Lys – forma bases de Schiff (intermediarios covalentes en la catálisis enzimática)

Unión de coenzimas a las proteínas

Arg – ciclo de la urea

His – centro activo de muchas enzimas (carácter nucleófilo del grupo imidazol)
pKR ≈ pH fisiológico – tampón en medios biológicos (muy abundante en Hb & Mb)
Aminoácidos básicos (II)

Lys Arg His

III. AMINOÁCIDOS PROTEINÓGENOS NO CODIFICABLES

NO son incorporados en los ribosomas excepto la Selenocisteína

Aparecen como consecuencia de modificaciones postraduccionales de las proteínas
Estas modificaciones son generalmente reversibles e importantes para la función,
regulación y señalización de las proteínas (especialmente la fosforilación)

Principales  proteinógenos no codificables

‐  hidroxilados: 5‐hidroxi‐Lys, 4‐hidroxi‐Pro (en el colágeno)
‐  fosforilados: fosfo‐Ser, fosfo‐Thr, fosfo‐Tyr (regulación de la función proteica)
‐  dimerizados: cistina (puente disulfuro, que mantiene la estructura 3D de las
proteínas y regula el estado redox del medio interno)
‐  metilados: 6N‐Me‐Lys (presente en la miosina)
‐  carboxilados: ‐carboxi‐Glu (en los factores de coagulación)
‐  con Se: Selenocisteína [Sec / U] (centro activo de determinadas enzimas)
The 21st . Codificado por el codon UGA (con elemento SECIS en el mRNA)
‐ desmosina: cross‐link de varias cadenas polipeptídicas (en la elastina)
Aminoácidos proteinógenos no codificables (II)

Modificaciones reversibles: implicadas en la regulación de la actividad proteica
Aminoácidos proteinógenos no codificables (III)

Dimerización de dos Cys
IV. AMINOÁCIDOS NO PROTEINÓGENOS

Aminoácidos no proteinógenos

L‐
intermediarios metabólicos

Ornitina & Citrulina

intermediarios en el ciclo de la
urea

Homo‐Ser & Homo‐Cys

COO- COO-
+ +
H 3N C H H 3N C H
intermediarios en el
metabolismo de  CH2 CH2
marcadores de stress oxidativo CH2 CH2OH
SH Homoserina
Homocisteína
Aminoácidos no proteinógenos (II)

COO-
COO- COO-
+ CH2
H C NH3 CH2
CH2
CH3
CH2
D‐Alanina
CH2
NH3+
NH3+
‐Alanina
GABA
‐Aminobutirato

Aminoacidos no proteinógenos

D‐Ala, D‐Ser, D‐Glu – pared celular bacteriana
diana de antibióticos ‐lactámicos (penicilinas)

‐, ‐ y ‐: ‐Ala  forma parte del ácido pantoténico (CoA‐SH)

GABA  neurotransmisor en el SNC
V. DERIVADOS DE AMINOÁCIDOS

Phe/Tyr  L‐Dopa  catecolaminas: adrenalina, noradrenalina

hormonas tiroideas: T3, T4
melanina

Trp  serotonina, melatonina
Cys  taurina (sales biliares)
His  histamina regulador de la respuesta inmune local

O OH
Catecolaminas (adrenalina)
NH2

Hormonas tiroideas (T3, T4)

HO
OH
Melanina
L‐DOPA
(dihidroxifenilalanina)
VI. COMPORTAMIENTO ÁCIDO-BASE DE LOS AMINOÁCIDOS

Sea el equilibrio entre las formas AH y A‐, caracterizado por su constante de 
  [ A  ][ H 3 O  ]
equilibrio Ka AH  A  H 3O
Ka
Ka  [ AH ]

Reorganizando términos, se obtiene la ecuación de Henderson‐Hasselbalch


 Log10 [ H 3O ]  ( Log10 K a [ AH ]
) [ A ]
[ A ]
pH  pK a  Log10
[ AH ]
Consideraciones

1. Cuando [A‐] = [AH], entonces  Ka = [H3O+] y  pKa = pH

2. La mayor capacidad tampón se localiza a pH = pKa ± 1
Cuando pH = pKa + 1,  el 90% de las especies en solución son A‐
el 10% de las especies en solución son AH

3. Cuando pH = pKa ± 2, la relación entre [A‐] y [AH] es de 1:100
Propiedades ácido-base de los aminoácidos (I)

Los aminoácidos son anfolitos

‐ pueden comportarse como ácidos ó como bases dependiendo del pH del medio
‐ ésto es posible gracias a la existencia de dos grupos disociables: el grupo ‐
carboxilo y el ‐amino
‐ las cargas de estos dos grupos puede neutralizarse mutuamente, apareciendo el
ion dipolar ó Zwitterion
Propiedades ácido-base de los aminoácidos (II)
Propiedades ácido-base de los aminoácidos (III)

(I) (II) (III) Curva de valoración de la Gly

(aminoácido neutro)

[ R COO  ][ H 3O  ]
KC  [ R COOH ]

[ R  COO  ]
pKn pH  pK C  Log10
[ R  COOH ]
[ R  NH 2 ][ H 3O  ]
KN  [ R  NH 3 ]

[ R  NH 2 ]
pKc pH  pK N  Log10 
[ R  NH 3 ]

pK C  pK N
pI 
2
Formas iónicas y propiedades de los aminoácidos en disolución

Zwitterion o ion dipolar

‐ El grupo ‐carboxilo y el grupo amino están disociados
‐ La carga neta del aminoácido es nula
‐ A este pH, el aminoácido no presenta movilidad
electroforética
+

Punto isoeléctrico (pI)
‐ pH en que la carga neta del aminoácido es nula
‐ El aminoácido se encuentra mayoritariamente en forma Zwitterion o ion dipolar
de ion dipolar (Q = 0), pH = 6‐8  especie (II)
‐ El pI de los aminoácidos neutros se localiza a pH ≈ 6‐8

Rangos de pH
pH = pKC;  [I] = [II]  Q = 0.5
pH = pKN;  [II] = [III]  Q = ‐0.5
pH = pKC ‐ 2;   [I] / [II] = 100:1;  Q = +1
pH = pKN + 2;  [III] / [II] = 1:100;  Q = ‐1
Zonas tampón: pK ± 1 (relación [ácido] : [base] = 10:1 o 1:10)
Solubilidad: mínima en el pI y máxima en los extremos del pH
Curva de valoración del ácido glutámico (aminoácido ácido)

(I) (II) (III) (IV)

Orden de desprotonación

1. –COOH (C)     pKC

2. –COOH  (cadena lateral) pKR
pKn
3. –NH3+ (C)   pKN

pK C  pK R
pI aa  acidos  3
2
pKc

Q = ‐1 a pH fisiológico
Curva de valoración de la histidina (aminoácido básico)
(I) (II) (III) (IV)
Orden de desprotonación

1. –COOH (C)     pKC
2. –NH+‐ (cadena lateral) pKR
3. –NH3+ (C)   pKN

pKn
Lys/Arg

1. –COOH (C)     pKC
2. –NH3+ (C)   pKN
3. –NH3+ (cadena lateral) pKR
pKc
pK N  pK R
pI aa basi cos  7
2

Lys/Arg Q = +1 a pH fisiológico
Importancia de la His como tampón de los  His Q = 0 a pH fisiológico
medios biológicos!!!!
Estabilización de la carga por resonancia
Valores pKa de los grupos ionizables de las proteínas

Grupo ionizable y pKa                                                    Q a pH fisiológico
O O

‐carboxilo terminal = 3.1 R R
-
‐1
OH O

O O
Asp, Glu = 4.1 R R
-
‐1
OH O

H+
R N R N
His = 6.0 0 / +1
N N
H H

‐amino terminal = 8.0
+
R NH3 R NH2 +1
-
Cys = 8.3 R SH R S 0

-
Tyr = 10.9 R OH R O 0

+
Lys = 10.8 R NH3 R NH2 +1
+
NH2 NH

Arg = 12.5 H2N H2N +1

NH2 NH2
Importancia de las propiedades ácido – base de los aminoácidos

Debido a que algunos aminoácidos tienen grupos disociables en sus cadenas laterales, 
LAS PROTEINAS TIENEN CARGA 

Sea el siguiente polipéptido:        ARCQGEIHMKFDT

El extremo AMINO‐terminal, Lys & Arg SIEMPRE presentan CARGA POSITIVA

El extremo CARBOXILO‐terminal, Asp & Glu SIEMPRE presentan CARGA NEGATIVA

La His puede presentar CARGA POSITIVA O NEUTRA
Importancia de las propiedades ácido – base de los aminoácidos (II)

Las interacciones electrostáticas intervienen en los siguientes procesos

Mantenimiento del pH del medio interno
debido a la capacidad tampón del grupo imidazol de la histidina
Mantenimiento de la estructura tridimensional de las proteínas
p. ej. en el acercamiento de dos dominios proteicos con cargas opuestas
Interacción de las proteínas con otras moléculas
p. ej. Interacción del DNA con proteínas histónicas, debido a la existencia de cargas en
ambas moléculas
Activación ó inactivación de enzimas
p. ej. La fosforilación de proteínas es uno de los mecanismos más conocidos para la
activación ó inactivación de enzimas: la introducción de cargas negativas en un dominio
proteico altera la conformación tridimensional de la proteína, modificando así su
actividad biológica
Catálisis enzimática
El centro activo de las enzimas suele contener aminoácidos con carga, que interaccionan
con el sustrato, o bien son los residuos catalíticos
Cambios de la expresión génica
p. ej. La acetilación de histonas en Lys supone una pérdida neta de carga positiva; ésto
hace que la interacción DNA # histonas sea menos intensa y que el DNA se descondense,
permitiendo la entrada de la maquinaria transcripcional y la expresión de un gen dado