CAPITULO 8 la guanosina y el 2 de la ribosa gracias a

transferasas que lo sacan del S adenosil

8.1 PROCESAMIENTO DEL PRE-ARN metionina del ambiente. Una vez formada el
MENSAJERO EUCARIONTE casquete una cinasa dependiente de ciclina
llamada CDK 9 ciclina T fosforila las serinas
Cuando apenas comienza a salir el extremo 2’ del CTD permitiendo que la polimerasa
5’ del transcrito de la Pol 2 unas proteínas se vuelva a elongar rápidamente.
encarga de ponerle un casquete 5’, después
mientras sigue saliendo el arn varias El objetivo del casquete es evitar que las 5’
proteínas se asocian varias proteínas exoribonucleasas degraden el extremo 5’.
encargadas del corte y del empalme eliminan
así las regiones intronicas y una vez
terminado la transcripción vienen otras
proteínas uniéndose en extremo poli A que
me pondrán la colapoli A. El objetivo de
cubrir los extremos es para evitar que las
enzimas del núcleo me degraden el arn
recién sinte+zado . Además la cola poli a y
el casquete me permiten identificar el
ARNm de todos los ARNm del núcleo. Una
vez formado el ARNm maduro este sale del
núcleo por los poros nucleares asociado a
proteínas transportadoras. En ningún
momento de todo este proceso el arn m se a
mantenido libre, siempre se a mantenido
asociado a estos complejos de proteínas
llamadas COMPLEJO DE
RIBONUCLEOPROTEINA.

LA CAPERUZA 5’ SE AÑADE A LOS UN GRUPO DIVERSO DE PROTEINAS

ARN NACIENTES POCO TIEMPO CON DOMINIOS DE UNIN AL ARN
DESPUES DE LA INICIACION DE LA CONSERVADOS SE ASOCIAN CON
TRANSCRIPCION LOS PRE-ARNm

Cuando comienza a salir el transcrito se
añade el casquete 5’. Se da gracias a que al
inicio la Pol 2 tiene una actividad lenta
gracias a la unión del NELF y DSIF. Cuando
se llega a los 25 nucleótidos se comienza a
formar el casquete. PROCESO:
La enzima dimerica encargada es la
FORMADORA DEL CAPUCHON, que
primer se une al CTD fosforilado por TF2H
del RTRB 1 de la POL 2. Una vez que se une
la enzima se activa, esta reconoce el extremo
5’ trifosfato del arn naciente (es trifosfato
porque antes de el no hubo un nucleótido
para formar un enlace fosfoester), en donde
su unidad FOSFO HIDROLASA RETIRA
el fosfato Y (el ultimo fosfato). Luego una
GUANIL TRANSFERASA trae un GMP
para que su extremo 5’ se una con el extremo
5’ del arn. Luego se metila el carbono 7 de
Las proteínas que se mantiene unidos al arn
mensajero durante todo su estadio en la
célula se denominan PARITUCLAS DE
RIBONUCLEOPROTEINA
HETEROGENEAS (hnRNP) que contienen
arn heterogéneo nuclear (pre ARN
mensajero unido a otros arn nucleares).
Contribuyen a los proceso del corte y
empalme, poli adenilizacion y la exportación
de arn al citoplasma. Las proteínas HnRNP
tiene dominios de unión al ARN y dominios
para interactuar con otras proteínas
FUNCIONES DE LAS PROTEINAS hnRNP:
Gracias a la unión de estas proteínas, el pre
ARNm se mantiene de manera uniforme y se
evita la creación de horquillas con bases
complementaria en el ARN , permitiendo
que las proteínas que actúen en su
preparación puedan actuar sin ningún
problema. Los HnRNp tienen diferentes
zonas de unión al pre ARN:
HnRNP A1, C, D: interactúan con regiones
ricas en pirimidinas (uracilo y citosina) de
los extremos 3’ de los intrones. Tambien
otras se unen a las regiones que permiten
identificar donde se debe realizar le corte y
empalme para eliminar intrones. Y otras se
ha visto que ayudan al transporte hacia el
citosol del ARN.
MOTIVOS DE UNION AL ARN: Son las
regiones de los HnRNP que se unen al ARN,
llamados también RPM. Tienen
generalmente 80 aminoácidos y de estos
salen 2 secuencias altamente conservadas
RNP1 y 2.
Uno de los dominios de estas proteínas
HnRNP llamado RRM, se compone de una
lamina B formada por 4 hebras de
aminoácidos que están rodeadas de 2 helices
alfa. En las 2 hebras centrales que forman la
lamina B se encuentran las secuencias RNP
1 y 2 que gracias a sus cadenas laterales
cargadas positivamente pueden
interaccionar con los fosfatos del arn
cargados negativamente.
Otro motivo estructural que permite unirse a
los ARN es el KH ( 45 aa) de las proteínas K
hn-RNP. Es similar a los RRM, pero más
pequeños. Tienen una lamina B del azúcar de la adenina formando un enlace
(formada de 3 hebras de aminoácidos) y 2
helices alfa. Aquí el ARN se va a unir a
aminoácidos hidrfobos de las hélices alfa y
de la B.
Otro motivo que tienen las proteinas HnRNP
son son las cajas RGG que tienen 5
repeticiones de esta secuencia
(arginina-glicina-glicina) que permiten la
unión al ADN.
EL PROCE DE CORTE Y EMPALME
SE PRODUCE EN SECUENCIAS
CORTAS, CONSERVADAS EN LOS
PRE-ARNm A TRAVES DE DOS
REACCIONES DE
TRANSESTERIFICACION.
Para que se el arn m funcional maduro se
deben eliminar los intrones y los exones se
deben unir, proceso conocido como CORTE
y EMPALME. Cuando se trata de un
transcrito corto, primero se da la agregación
de la cola poli A y luego se realiza el corte y
empalme. En cambio, cuando es un
transcrito largo el corte y el empalme se da
el antes de que se complete la transcripción
del ARN, es decir, en medio proceso de
elongación.
Las secuencias de ARN que se encuentran en
los extremos 5’ y 3’ se mantienen el ARN
maduro. Las secuencias que indican donde
se debe realizar los cortes van a ser
secuencias pequeñas: El intrón siempre
comienza con una Guanina y un Uracilo en
el extremo 5’, en cambio en el extremo 3’ va
a estar una adenina y una citocina. En el
centro del intrón va a encontrarse la
secuencia CURAY, llamada así por los
nucleótidos que la forman: C/citocina;
U/uracilo; R/purina ( Guanina o Adenina);
A/adenina; Y/pirimidina ( citosina o
Uracilo). La adenina de la secuencia
CURAY se denomina PUNTO DE
RAMIFICACION ya que este será el lugar
donde se una las G/U del extremo 5’ cuando
se despegue el intrón formando un Lazo
cuando se una la guanina.
También en el intrón hay una región rica en
pirimidinas (importante) en dirección 3’del
intrón del extremo 5’a la Adenina del
extremo 3’ , la guanina se une al carbono 2’
2’5’ fosfodiéster.
El corte y empalme se realiza por
REACCIONES DE
TRANSESTERIFICACION
SECUENCIALES
DURANTE EL RPCESO DE CORTE Y
EMPALME LOS snARN FORMAN
APAREAMIENTOS DE BASES CON
EL PRE-ARNm
Los arn nucleares pequeños (Sn ARN)
tienen la función de aparearse con algunas
bases del pre-ARNm para que se de el corte
y el empalme. Estos son ricos en uracilos , y
hay varios tipos: U1,U2,U4,U5,U6. Se
asocian a paroculas de ribo nucleoproteína
nucleares pequeñas (snRNP). Van de 107-
200 nucleótidos.
Para que se de el corte y empalme , se deben
unir el extremo 5’de un pre ARN mensajero
y la región 5; del snARN U1. Sn RNA U2 se
aprea con la secuencia del PUNTO DE
RAMIFICACION del curay
LOS ESPLICEOSOMAS
ENSAMBLADOS APARTIR DE LOS SN
RNP Y UN PRE ARNm , LLEVAN A
CABO EL PROCESO DE CORTE Y
EMPALME.
Cuando se va a realizar el proceso de corte y
empalme vienen a unirse las Sn ARN junto
con varias proteínas formando encima del
pre ARNm un complejo llamado
ESPLICEOSOMA (muy grande con una
masa similar a un ribosoma). Proceso de
ensamblaje, corte y empalme:
1. Las snARN U1 se aparea en el
extremo 5’ del intrón. Luego viene
una proteína llamada SF1 que se une
en el punto de ramificación A (del
curay) y la proteína U2AF que se
une al tramo de pirimidina ubicado
en el extremo 3’ del intrón y también
a las pares AG 3’del intrón.
2. SnARN U2 desplaza a SF1 para
unirse al punto de ramificación A
3. Los Sn RNP U5, U4,U6 se unen
formando un complejo , para unirse
a los U1 U2 y pre arn m ya
establecidos formando ahora si el
ESPLICEOSOMA
4. Comienzan a haber cambios en los
reordenamientos de los SnRNP que
hacen que SnRNP U1 y U4 se
desestabilicen y salgan haciendo
que el espliceosoma se vuelva
catalíticamente activo. U6 y U2 son
los sitios catalíticos que realizan las
reacciones de
TRANSESTERIFICACION que
son las siguientes:
• Primero el grupo Hidroxilo 2’del
sitio de ramificación A se une al
Fosfato 5’ de del exón que se
encuentra en dirección 5’ formando
un enlace 2’-5’fosfodiester. Luego
el OH 3’ del exón en dirección 5’
ataca al fosfato 5’ del exón en
dirección 3’ formando un enlace 3’
5’ fosfodiéster y permitiendo así que
ambos exones se unan y el intrón
liberado en forma de lazo se
eliminara por ARN asas y enzimas
desramiMcantes
5. Las SnRNP se disocian rápidamente
del intrón y pueden participar en
otro ciclo de corte y empalme
COMPLEJOS DE UNION A EXON. Uno
de ellos es el factor de exportación de ARN
(REF) que transporta al Arn mensajero hacia
el núcleo. Otras proteínas evalúan la calidad
del corte y empalme y si no es correcto lo
llevan a la degradación de ese arn mensajero,
proceso llamado DECAIMIENTO
MEDIADO POR SECUENCIAS SIN
SENTIDO.
Hay pre ARN mensajeros que no tiene las
secuencias GU-AC normales entre intrones ,
sino AU-AC, que utilizan un mecanismo
similar al descrito.
ELONGACION DE LA CADENA POR
LA ARN POLIMERASA 2 ESTA
ACOPLADA A LA PRECENCIA DE
FACTORES DE PROCESAMIENTO
DE ARN
El proceso de transcripción y los procesos
postraduccionales se asociación
perfectamente gracias al dominio CTD de la
pol 2. Esto se debe a que como este dominio
es muy largo pueden unirse varias proteínas
a sus residuos de serina fosforilados como
las proteínas que ponen el casquete 5’ , las
encargadas de la poliadenilizacion, y las
proteínas HnRNP encargadas del corte y
empalme para que todo se lleve acabo de
manera coordinada. Resulta que cuando las
HnRNP se unen al CTD, estas aumentan la
aMnidad de la CTD por las proteinas DSIF
y la CDK9 ciclina T (PTEF b), permitiendo
acelerar el proceso de transcripción. Gracias
a esto la transcripción solo se da cuando
existen las proteinas encargadas de procesar
el ARN, y si no las hay, la transcripción
PARA.
LAS PROTEINAS SR CONTRIBUYEN
A LA DEFINICIACION DEL EXON EN
LOS PRE ARN mensajeros LARGOS.
Los exones tambien ayudan a que las
proteinas Sn RNP U1 y 2 a encontrar los
sitios de corte y empalme. Esto se da gracias
a que dentro de los exones hay secuencias
llamadas AMPLIFICADORES DE CORTE
y EMPALME EXONICOS, lugares en
donde se unen las PROTEINAS SR ( on
proteínas HnRNP que tienen dominios de
unión al ARN que son los RRM y de unión
a proteínas llamados dominios RS). Una vez
que las proteínas SR se unen permiten que
las snRNP U1 se unan al sitio de corte y
empalme 5’ gracias a que interactúa con
estas por sus dominios RS. También ayuda a
que la Sn RNP U2 encuentre el PUNTO DE
RAMIFICACION A, debido a que
interactúa con las proteína U2AF (que tiene
una subunidad liviana de 35 Kd que se une
al sitio de corte y empalme en el extremo 3’
que interactúa directamente con las
proteínas SR, una vez que interactúa, la
subunidad liviana estimula a la subunidad
pesada de 65 KD que se encuentra unida al
sitio de pirimidinas para que permita que la
SnRNP U2 se una al PUNTO DE
RAMIFICACION). Gracias a esto se a
podido especificar claramente donde se
encuentran los exones en transcritos largos y
se delimita muy bien als regiones que deben
sufrir el corte.
LOS INTRONES DEL GRUPO II DE
AUTO PROCESAMIENTO
PROPORCIONAN PISTAS DE LA
EVOLUCION DE LOS SnARN
Experimentos han demostrado que existen
intrones que realizan por ellas mismas el
corte y empalme de los exones, es decir todo
el proceso anteriormente mencionado pero
sin proteínas. Estas se han llamado
INTRONES DE AUTO
PROCESAMIENTO y hay de dos tipos: El
1 se encuentra en protozoos, y el 2 se
encuentra en mitocondrias y cloroplastos.
Estos intrones se pliegan sobre ellos mismos
formando BUCLES. Realizan su auto
procesamiento de manera igual a la que lo
hace el espliceosoma: con reacciones de
transesterificación. Se piensa que los
intrones de los pre ARNm que utilizan el
espliceosoma, evolucionaron de estos
intrones de auto procesamiento, en donde se
perdió secuencias intronicas que serian los
futuros Sn ARN , ya que cuando se unen
estos a los sitios de corte y empalme, forman
estructuras similares a los bucles que forman
los intrones de auto procesamiento.
SIMPLEKINA que crea una plataforma para
el ensamblaje de estos factores de
escicion/poliadenilacion.Y por ultimo viene
la POLI A POLIMERASA (PAP) a unirse.
Una vez ensamblado se corta la cadena en
dirección 5’ 10-35 nucleótidos de las señales
poli A G/U. Una vez escindido, se separan
los factores CStF, CF 1 y 2 y la polimerasa
A actúa en 2 fases: La primera es LENTA,
en donde se añaden 12 adeninas al nuevo
extremo 3’ generado por el corte. Luego
viene una proteína que tiene la función de
potenciar a la polimerasa que es la PABP 2
haciendo que rápidamente termine de
agregar de 200 a 250 adeninas.

Los ARN mensajeros que codifican para

histonas no tienen una cola poli A, sino se
unen proteínas al extremo 3’.

También se piensa que los encargados de las

reacciones de corte y empalme son los Sn
ARN y las SnRNP solo estabilizan la
estructura tridimensional. Similar los
intrones auto procesantes de tipo 2 , que
utilizan proteínas llamadas MATURASAS
para realizar el corte y empalme.

LA ESCISION 3’ Y LA
POLIADENILACION DE LOS PRE-
ARNm ESTAN ESTRECHAMENTE
ACOPLADAS.

Para colocar la cola poli A , primero se debe

reconocer la secuencia AAUAAA que se
encuentra en el extremo 3’ del pre ARN
mensajero gracias a la proteína CPSF. Luego
vendrán 3 proteínas a estabilizar esta unión:
FACTOR ESTIMUANTE DEL CORTE
(CStF ) va a unirse a la secuencia rica en G/U
que se encuentra corriente abajo de la
secuencia AAUAAA; FACTOR DE
CORTE 1 (CF1) y otro llamado CF2. Todos
estas proteínas se ensamblan gracias a la

LAS EXONUCLEASAS NUCLEARES
DEGRADAN EL ARN QUE ES
PROCESADO Y ELIMINANDO DE
LOS PRE ARNm.
Los intrones que son sacados del arn
mensajero sufren un proceso de destrucción.
Primero el enlace 2’-5’ FOSFODIESTER se
elimina por la ENZIMA
DESRAMIFICANTE , permitiendo que este
intrón se encuentre de manera lineal, en vez
de forma de lazo. Luego se ataca por
exonucleasas.
Cuando se elimina un ARN mensajero con
un mal empalme y corte se da por un
complejo de 11 exonucleasas llamada
EXOSOMA. El cual elimina en dirección 3’-
5’. También tiene este complejo ARNs
HELICASAS para evitar que proteínas se
unan a este ARNm pudiendo evitar que actúa
el EXOSOMA.
Los ARNm normales evitan la degradación
por exonucleasas gracias a: EXTREMO 5’
en donde se añade un CASQUETE y el
EXTREMO 3’ en la elongación es protegido
por la POLIMERASA 2 , y luego por la
COLA POLI A que se le pone.
8.2 REGULACION DEL
PROCESAMIENTO DEL PRE
ARNm
Cuando se dan transcritos simples, el corte y
el empalme genera solo un tipo de ARN m
maduro. En cambio en los transcritos
complejos, el corte y empalme se puede dar
de muchas formas generando diferentes
ARN m que formaran proteínas diferentes.
EL CORTE Y EMPALM
ALTERNATIVO GENERA
TRANSCRITOS ON DIFERENTES
COMBINACIONES DE EXONES
El corte y empalme de exones
(reordenamiento de la posición de exones en
el ARNm ) es el principal mecanismo que
los eucariontes utilizan para expresar
diferentes proteínas que provienen de un
solos gen.
Varios tipos celulares pueden utilizar este
mecanismo para producir proteínas diferente
so isoformas de una proteínas par atender a
sus necesidades. También una sola célula
puede realizar diferentes cortes y empalmes,
que se dan por estimulos externos,
produciendo proteínas que se adapten a su
entorno.
UNA CASCADA REGULADA DE
CORTE Y EMPALME DE ARN
CONTROLA LA DIFERENCIACION
SEXUAL EN DROSOPHILA
Para ver como se da el proceso de corte y
empalme alternativo en una secuencia de
cascadas, se utiliza el ejemplo de las
drosophilas, en donde se ve como varia el
corte y empalme en los géneros hembra y
macho , por presencia de una proteína que se
encuentra activa en hembras.
PROCESO
1. La proteína Sxl (formada por el gen
SEX-LETHAL) se expresa en
etapas tempranas en hembras.
Luego el promotor de este gen se
paga, y se activa tanto en hembras
como en machos un nuevo promtor
para SEX LETHAL. Pero gracias a
que los machos no tienen la Sxl ya
formada, en el arn m maduro, no se
elimina un codón de detención,
haciendo que ese arn m no produzca
la proteína Sxl, a diferencia de la
hembra.
2. Esto se da ya que la Proteína SxL se
une al intrón en su extremo 3’ (al
intrón que se ubica entre el exón 2 y
3) haciendo que no se unan en este
lugar U2AF, ni U2 SnRNP. Como
no se unen entonces el U1 SnRNP
del exón 2 se va a unir con los U2AF
y U2SnRNP del siguiente intrón
(que se encuentra entre el exón 3 y 4
) haciendo que se de un corte y
empalme donde se elimine el exón
3, y se unan el exón 2 y 4. El sitio
donde se une la proteína SxL se
llama SILENCIADOR DEL
CORTE Y EMPALME
INTRONICO. En machos no se da
este proceso y se agrega al ARN m
maduro el exón 3 , el cual tiene el
codón de terminación temprano, por
eso aunque transcriba el gen SEX
LETHAL, no producirá una
proteína funcional
3. La proteína SxL no solo interviene
en el corte y empalme del gen SEX
LETHAL, sino también en el gen
TRANSFORMER. La proteína SxL
se une a una secuencia silenciadora
del corte y empalme ubicada en el
extremo 3’ del intrón que se
encuentra entre el exón 1 y 2
evitando así la unión de U2AF.
Gracias a esto se da el corte y
empalme con los U2AF y U2
SnRNP del intrón que se encuentra
entre el exón 2 y 3, ignorando en el
Arn m maduro al exón 2, que
también tiene un codón de
terminación temprana. Gracias a
esto se produce la proteína TRA
funcional en hembras, pero en
machos, debido a la ausencia de la
SxL , si se incorpora el exón 2, y en
la traducción no dará una proteína
funcional.
4. La proteína TRA forma un complejo
con las proteínas RBP1 y TRA 2
para que se unan al EXON 4 en una
secuencia llamada
POTENCIADOR DEL CORTE Y
EMPALME EXONICO, para
estimular el corte y empalme entre
los exones 3 y 4, además de
es+mular el corte y poli adenilación
en el extremo 3’ del exón. Sin esta
proteína, en machos el corte y empalme se
ignora al exón 4 y el exon 3se une con el
EXON 5. El exón 5se unirá con el 6 debido
a que tiene el sitio de corte y poli adenilación
produciendo una versión mas larga.
Produciendo así en cada sexo genes DSX estos canales de k se agrupan en varias zonas
diferentes que cada proteína DSX resultante de la cóclea, dejando así ver que el
suprimirá los genes para evitar el desarrollo aparecimiento o de isoformas que respondan
del sexo opuesto. a frecuencias sonoras similares depende de
medios externos de la célula. Se piensa que
LOS REPRESORES Y ACTIVADORES las actividades sinápticas que ocurren de los
DEL PROCESO DE CORTE Y nervios que inervan la cóclea, podrían en
EMPALME CONTROLAN ESTE ocasiones activar una proteína-cinasa
PROCESO EN SITIOS cuando hay despolarizaciones, haciendo que
ALTERNATIVOS. esta fosforile represores del corte y del
empalme, bloqueando cualquiera de las 8
Se ha visto que en seres humanos existen regiones que codiMcan la proteína.
proteínas similares a SxL que evitan el corte
y empalme de un exón , haciendo que no se
tome en cuenta para el arn m maduro, y
proteínas como TRA que permiten incluir a
exones en el corte y empalme, para que se
expresen en el arn mensajero maduro.
Gracias a esto se pueden formar isoformas
de proteínas en diferentes células del
organismo. Ejemplo de esto seria la
supresión del corte y empalme de los exones
E3A y E3B, de parte de proteínas
silenciadoras (generalmente HnRNp), para
formar un ARN de fibronectina sin ellos en
los hepatocitos. En cambio en fibroblastos
una proteína activadora
( generalmente proteínas SR) si incluiría a
E3 A y B para formar una fibronectina
diferente.

• Expresión de las proteínas del canal

de K+ en las células pilosas de
vertebrados en el oído interno.
Expresión de las isoformas DSCAM en las
CELULAS PILOSAS
neuronas reonales de la DROSOPHILA.
En la cóclea de los vertebrados existen
El gen DSCAM permiten determinar de que
células las cuales son las encargadas de
manera los exones realizaran al sinapsis con
percibir los sonidos y enviarlos por le nervio
dendritas, haciendo que mutaciones de este
vesobulo coclear. Son ciliadas llamadas
afecten a la sinapsis. El gen tiene 95 exones
células ciliadas. Dependiendo en donde se
los cuales realizan corte y empalme
ubiquen pueden idetificar sonidos a una baja
alternativo, formando alrededor de 38 mil
o a una alta frecuencia, en donde abrirán
isoformas posibles. Haciendo que se den
canales de K+ dependiendo de los cambios
formas de sinapsis diferentes en cada una.
de Ca+ en el interior de la célula. La
variación a las secuencias en las que
responden se debe al corte y empalme LA EDICION DEL ARN ALTERA LAS
alternativo de diferentes exones que dan SECUENCIAS DE ALGUNOS PRE
como resultado isoformas del canal de K, ARNm.
haciendo que cada una se abra a diferentes
concentraciones de calcio producto del Tras estudios en diferentes especies, se
cambio de las frecuencias que percibimos encontró que hay otras manera diferente de
del ambiente. Se a visto que las formas de procesamiento de ARN, llamado EDICION
DE ARN, en el cual se cambia las
secuenciación de nucleótidos del ARN
mensajero, es decir, el ARN m no tendrá la
misma secuencia de nucleótidos que los
exones del gen. Se da mucho en las
mitocondrias de protozoos. En seres
eucariontes superiores como nosotros, es
discil ver la EDICION DEL ARN, pero las
veces que se da, cambia solo un nucleótido,
pero ese cambio si se puede ver retejado en
las proteínas producidas. Esto se da en la
formación de la proteína APO B que forma
los transportadores de colesterol
plasmáticos. Dos células producen la apo B:
Hepatocitos y Enterocitos. Gracias a este
mecanismo hay dos isoformas de la APO B.
Los hepatocitos producen la forma APO B-
100 en donde no se altera el gen en el
nucleótido 6666. En cambio, los enterocitos
producen la forma APO B-48 , por edición
del nucleótido 6666 de C a U, haciendo que
el codón de glutamina CAA se convierta en
un codón de detención UAA. Por eso la apo
B 48 es más pequeña ya que en la traducción
terminara de manera mas temprana.
8.3 TRANPROTE DEL ARN mensajero
A TRAVES DE LA ENVOLTURA
NUCLEAR
Cuando se termina de procesar un ARN
mensajero este se mantiene unido a los
HnRNP , formando el complejo mRNP, los
cuales saldrán a través de poros nucleares del
núcleo celular. La membran nuclear también
es bilipídica con proteínas en ella, donde
algunas forman poros.
LAS MACROMOLECULAS ENTRAN
Y SALEN DEL NUCLEO A TRAVES DE
LOS COMPLEJOS DEL PORO
NUCLEAR.
Los poros nucleares se encuentran formados
por complejos de al enos 30 proteinas
llamados NUCLEOPORINAS que se
conforman en una estructura de manera
cilíndrica. Una de estas proteínas llamada
NUCLEOPORINA FG, forma una barrera
impidiendo el paso de moléculas grandes,
pero si permite el de moléculas pequeñas. Su
dominio globular se encuentra anclado en la
estructura donde manda filamentos dentro
del canal que incluso pueden ir al núcleo
plasma o al citoplasma, son ricas en
fenilalanina y glicina (HIDROFOBAS).
Sustancias de hasta 40 a 60 kilo daltons
pueden ingresar. Moléculas mayores a este
peso deben unirse a proteínas solubles del
nucleoplasma para interactuar con las núcleo
porinas FG.
Los complejos mRNP se unen a proteínas
solubles para interactuar con el poro,
llamados EXPORTADORES DE mRNP.
Uno de ellos es el heterodímero NXF1
(subunidad grande) /NXT1 (subunidad
pequeña). NXF1 se une al ARN y a proteinas
del complejo Mrnp como REF (factor de
exportación de ARN) que se une 20
nucleótidos corriente arriba de lo sitios
donde se unen exones. También
NXF1/NXT1 se asocia a las proteínas SR
que en el corte y empalme son
potenciadores, siendo así que también
cumple funciones en el transporte del
ARNm al citoplasma. Estos NXF1/NXT1
son los que interactúan con los filamentos de
las nucleoporinas FG para poder pasar por el
poro.
Los filamentos proteicos se extienden hacia
el nucleoplasma formando una cresta y
también llegan al citoplasma. También GLE
2, ayuda en este proceso al unirse a la NFX1
para que esta interactúe con la cresta nuclear
permitiendo que los complejos mRNP
unidos a los NFX1/NXT1 logren
introducirlo al poro. Luego se da el proceso
se REMODELACION DEL m-RNP en
donde estos filamentos proteicos (no son los
de la nucleoporina FG) interactúan con una
ARN helicasa ( Dbp5) para disociar
NXF1/NXT1 y otras proteínas. De las
proteínas que se disocian con el complejo
hay una división dependiendo en que etapa
se disociaran: Unas se disocian en etapas
tempranas de este proceso para que se
queden en el núcleo y esperar a otro
complejo m RNP, en cambio otros se
disocian una vez el arn m llega al citoplasma
enseguida (NXF1/NXT1- complejo de unión
a la caperuza 5’-PAPB2 unida a la cola poli
A). Todas gracias a la helicasa Dbp5 que se
encuentra unida a los filamentos proteicos
citoplasmáticos del poro). Una vez sale, los
filamentos citoplasmáticos del poro nuclear
se separan del complejo m-RNP gracias a
que el factor de iniciación de la traducción
de unión a la caperuza elF4-E se une y en
lugar de la PAPB2 que se separo vendrá
PAPB1 a unirse.

EXPORTACION NUCLEAR DE LOS m

RNP DE LOS ANILLOS DE BALBIANI.

Los transcritos del insecto chironomous para

la producción de proteínas que permiten su
fijación en las hojas de las plantas. Se vio en
PROTEINA SR EN LEVADURAS
ellos que los complejos de m RNP al pasar
por el poro nuclear, gracias a las helicasas y
También hay un control de calidad para
a la fosforilación de las cinasas en el extremo
evitar que un ARNm mal procesado pase por
citoplasmático permite que arn m se estire y
los poros. Las proteínas SR (Nlp3) que se
desenrollen, proceso importante para unirse
unen en los exones del pre ARN m se unen
a los ribosomas.
en sus formas FOSFORILADAS. Una vez
que se de la poli adenilación, unas
FOSFATASAS NUCLEARES
desfosforilan a las proteínas SR
(fundamental para poder interactuar con el
exportador NXF1/NXT1). Si la fosfatasa
reconoce que esta incorrectamente formado
el ARNm, no se des fosforila la proteína SR
y luego vendrá un exosoma a degradarlo. En
caso de que este correctamente formado se
da todo los pasos anteriores permitiéndolo
pasar al citoplasma. En el citoplasma una
LOS PRE ARN MENSAJEROS CON
CINASA
ESPLICEOSOMAS NO SON
fosforila nuevamente a la proteína SR
EXPORTADOS DESDE EL NUCLEO
permitiendo que se disocia tanto ella, como
NFX1/NXT1. Esto es importante debido a
que gracias al desacoplamiento abra menor Que los pre-ARNm con intrones salgan
cantidad de complejos m-RNP/ exportadores fuero del núcleo es algo negativo para la
NFT1-NXT1 permitiendo que estos célula ya que se puede llegar a traducir las
complejos ubicados en el núcleo al estar a secuencias intronicas que provocaría que
una mayor concentración puedan pasar por aminoácidos que no deberían estar, se
difusión simple por los poros. encuentren formando proteínas que no
cumplan las funciones que la célula requiere.
Para evitar esto se evita que los pre-ARN
unidos con espliceosomas pasen los poros
nucleares.
Se hizo un experimento para verificar esta
capacidad de los poros de rechazar pre-
ARNm unidos a espliceosomas. Se cogió un
gen que tenia un solo intrón y se hizo 2
pruebas:
- En una se altero una de las regiones
consenso que permiten el corte y
empalme, evitando así que se de el
corte por ese extremo, bloqueando
el proceso. El resultado fue que este
pre ARNm nunca salió del núcleo.
Se debe a que al alterar una de las
secuencias, no se unió uno de los
SnRNP que forman el
espliceosoma, pero los demás
componentes si se unieron. Esto fue
detectado por el poro nuclear y evito
su paso.
- En la segunda prueba se indujeron
mutaciones en ambas secuencias
consenso. Se vio que si paso el pre
ARNm hacia el citoplasma que
conservaba su intrón. Se debe a que
al alterar las secuencias consenso,
las proteínas SnRNP no
reconocieron las secuencias y no se
unieron por lo que no tenia el
espliceosoma. Por eso pudo pasar.
CORRELACION: En las talasemias, que
son enfermedades hemáticas, donde hay
concentraciones bajas de globinas, se
producen por mutaciones de uno de los sitios
consensos de corte y empalme, por lo que
muchos de los ARN mensajero de globina al
no disociarse del espliceosoma se eliminan
en el núcleo al no poder pasar.
LA PROTEINA REV REGULA EL
TRANSPORTE DE LOS ARNm
VIRALES NO PROCESADOS.
El VIH logra sacar del núcleo su transcrito
de arn sin procesar gracias a una proteína
que evita los controles celulares que
normalmente evitan sacar arn m no cortados
y empalmados.
Cuando se integra el código genético del
VIH a la célula. Contene solo una unidad de
transcripción que es transcrito por la POL 2
de la célula. Hay tres maneras en las cuales
se corta y empalma
1. Un arn mensajero sin cortar y
empalmar de 9 KB
2. Un ARN mensajero de 4 kb por la
eliminación de un intrón
3. Un ARN mensajero de 2 kb
formado por la eliminación de 2 o
más intrones
Cuando se forma los transcritos 1 y 2 del
VIH en la primera instancia de la infección
estas no pueden salir del núcleo debido a que
tienen intrones todavía. Sin embargo cuando
se da el transcrito numero 3, este al estar
completamente cortado y empalmado (sin
intrones) logra salir del núcleo. Esta se
traduce en una proteína llamada REV. La
cual ingresa nuevamente al núcleo al unirse
en sus regiones de LEUCINA a la
EXPORTINA 1 que la introduce dentro del
núcleo. Una vez dentro, esta proteína se une
a secuencias del ARN m del VIH llamadas
ELEMENTOS DE RESPUESTA REV
(RRE) , lo que permiten lugo a este ARN con
intrones atravesar los poros nucleares. Una
vez afuera los ARN 1 y 2 pueden formar las
proteínas de los viriones o en caso de la de 9
kpb, introducirse en viriones para luego salir
por gemación.
Otros retrovirus tienen secuencias en sus
transcritos llamados ELEMENTOS DE
TRANSPORTE CONSTITUTIVOS (Cte)
que se unen al NFX1/NTX1 con gran
afinidad, permitiendo así su salida del
núcleo.