Está en la página 1de 34

HUMANA

CA
BIO UÍMI

- F
QB II
MED -
Q

CÁTEDRA 1
UB
.

A - DPTO

SEMINARIO
CICLO DE KREBS
PIRUVATO DESHIDROGENASA
LANZADERAS
REACCIONES ANAPLERÓTICAS
PUNTOS DE FUGA

MATERIA: QUÍMICA BIOLÓGICA II


CÁTEDRA 1
DPTO. BIOQUÍMICA HUMANA - FMED - UBA
CICLO LECTIVO 2022

DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA


CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

SEMINARIO

Piruvato Deshidrogenasa -
Ciclo de Krebs - Puntos de fuga – Reacciones
anapleróticas - Lanzaderas

OBJETIVOS
Al finalizar el estudio de esta clase Usted deberá ser capaz de:
• Reconocer las fases de la respiración celular
• Mencionar origen y destino del piruvato en diferentes condiciones metabólicas
y diferentes tejidos
• Describir la reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa (PDH)
• Mencionar las enzimas y los cofactores del complejo de la PDH
• Conocer la regulación de la PDH
• Identificar origen y destino del acetil-CoA en diferentes condiciones metabólicas
• Describir el ciclo de Krebs
• Identificar sustratos, productos e intermediarios del ciclo de Krebs
• Mencionar todas las enzimas del ciclo de Krebs y sus cofactores
• Reconocer los puntos de control del ciclo de Krebs
• Entender las diferencias entre FAD y NAD+
• Explicar el balance energético del ciclo de Krebs
• Explicar la regulación del ciclo de Krebs según el control por nivel de sustrato y
por el nivel energético
• Conocer los intermediarios del ciclo que forman parte de reacciones
anapleróticas o de puntos de fuga y las reacciones asociadas.
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

El metabolismo oxidativo puede definirse como la utilización de la energía almacenada en


los nutrientes para la generación de ATP

Entonces, ¿para qué comemos? La ingesta de alimentos constituye una necesidad


fisiológica primordial porque cuando comemos ingerimos fuentes de energía. ¿Qué significa
esto? Los alimentos son combustibles, y al quemarlos (u oxidarlos, químicamente
hablando) obtenemos energía, que, conservada en forma de ATP, se utiliza para suplir las
necesidades energéticas del organismo.
En todas las células existen sistemas complejos de reacciones químicas
“cuidadosamente” reguladas que producen y requieren energía. Todos los procesos que
ocurren en nuestras células son procesos de transformación de energía. Los combustibles
metabólicos (glúcidos, lípidos y proteínas) son moléculas que contienen una gran cantidad
de enlaces C-C y C-H, que al romperse permiten obtener energía. Entre muchos otros,
algunos ejemplos de utilización de energía son el gradiente electroquímico que permite
crear un medio intracelular de composición diferente a la del medio externo, o el movimiento
organizado de grupos de células.
Los procesos de transformación involucrados en la utilización de la energía del
enlace químico de los combustibles pueden dividirse en tres fases: 1) obtención de energía
a partir de la oxidación de las moléculas combustibles, 2) conversión de esa energía a una
forma biológicamente útil, que es la que se encuentra en las uniones de alta energía del
ATP y 3) utilización de la energía contenida en las uniones del ATP. Las primeras dos fases
son parte del proceso de respiración celular.
Al hablar de respiración celular, nos referimos a los procesos celulares que, al oxidar
los combustibles biológicos, liberan CO2, consumen oxígeno y generan ATP. Los procesos
que constituyen la respiración celular pueden dividirse en 3 fases (ver Figura 1). En la fase
1 se produce la oxidación de los combustibles metabólicos con transferencia de electrones
a las coenzimas aceptoras NAD+ y FAD que se reducen a NADH y FADH2, respectivamente.
En esta fase, la mayoría de los combustibles metabólicos (glúcidos, ácidos grasos y muchos
aminoácidos) convergen en la generación del grupo acetilo (de 2 carbonos) activado: el
acetil-CoA. En la fase 2 ocurre la oxidación completa del grupo acetilo del acetil-CoA a CO2
(la forma más estable del carbono) en el ciclo de los ácidos tricarboxílicos (o CAT, o
ciclo de Krebs, o ciclo del ácido cítrico) y también aquí la energía se almacena
principalmente como NADH y FADH2. La fase 2 ocurre exclusivamente en las mitocondrias.
En la fase 3, la energía obtenida a partir de la oxidación de los combustibles (en forma de
coenzimas reducidas) es convertida en la energía de las uniones del ATP a través del
proceso de fosforilación oxidativa. Los electrones se transfieren desde el NADH y el
FADH2 (las coenzimas se reoxidan) al oxígeno, a través de la cadena de transporte de
electrones. Este proceso genera un potencial electroquímico en la forma de un gradiente
de protones a través de la membrana mitocondrial interna que puede utilizarse para la
síntesis de ATP a partir de ADP y fosfato inorgánico (Pi).

1
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Figura 1. Representación esquemática de las fases de la respiración celular

La velocidad de las reacciones involucradas en la oxidación de los combustibles está


coordinada en forma ajustada con la velocidad de utilización del ATP, por un mecanismo
de retroalimentación (feedback). Como consecuencia de este mecanismo de regulación,
los combustibles que no se van a utilizar inmediatamente se almacenan en vez de oxidarse.
Se denominan vías catabólicas a las reacciones metabólicas a través de las cuales
los combustibles ingeridos o almacenados son degradados para obtener energía. Las
reacciones catabólicas resultan generalmente en la conversión de moléculas grandes y
complejas en moléculas pequeñas y simples (finalmente a CO2 y H2O), en la producción de
energía y generalmente son reacciones de oxidación). La única vía que puede generar ATP
sin consumo de oxígeno es la glucólisis anaeróbica. Por el contrario, las vías metabólicas
involucradas en la biosíntesis de macromoléculas se denominan vías anabólicas y
generalmente resultan en la síntesis de moléculas grandes y complejas a partir de
precursores pequeños. A diferencia de las reacciones catabólicas, los procesos anabólicos
son reductivos (reacciones de reducción) y consumen energía.
Los ácidos grasos son el principal combustible metabólico del organismo.
Luego de una ingesta rica en glúcidos (por ejemplo, pastas, pan, azúcar, o papas), su
exceso se almacena en las unidades glucosilo del glucógeno. Sin embargo, esta forma de
almacenamiento es relativamente limitada, de manera que el exceso de glúcidos, que
sobrepasa la capacidad de ser convertido en glucógeno, se transforma en triacilglicéridos
(“depósitos lipídicos”) que se almacenan en el tejido adiposo. Obviamente, también el
exceso de lípidos de la dieta se almacena de esta forma.
Entre las comidas se liberan ácidos grasos de estos depósitos, circulan por la sangre
unidos a albúmina y se oxidan a acetil-CoA en el músculo, hígado y muchos otros tejidos,
por la vía de la -oxidación. Uno de los principales destinos metabólicos del acetil-CoA es
el Ciclo de Krebs y es el tema de esta clase. Las vías de oxidación de ácidos grasos utilizan
NAD+ y FAD como aceptores de electrones.
Todas las células requieren ATP en forma continua. Sin embargo, el aporte de
combustibles para obtener energía no es un proceso continuo. La disponibilidad constante
de combustibles a pesar de la discontinuidad de las ingestas alimenticias y de la variación
en la velocidad de su utilización se denomina homeostasis metabólica y se logra a través
de la regulación hormonal de las vías de almacenamiento y de movilización de combustibles
metabólicos, principalmente mediada por las hormonas metabólicas, esencialmente la

2
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
insulina y las hormonas contrarregulatorias de la insulina: el glucagon, la adrenalina y el
cortisol.
La glucosa tiene un rol central en la homeostasis metabólica debido a que el cerebro
y algunos otros tejidos no pueden usar ácidos grasos como combustibles metabólicos. Los
niveles sanguíneos de glucosa en personas sanas se mantienen en alrededor de 80 mg%.
Niveles inadecuados de insulina o resistencia de los tejidos a los efectos de la insulina
ocasionan la hiperglucemia característica de la Diabetes Mellitus.
El ciclo de Krebs constituye la etapa intermedia del metabolismo. Además de ser la
vía final de oxidación de los combustibles metabólicos, también provee de intermediarios
para procesos anabólicos. Este rol central en el metabolismo hace de la comprensión de
su funcionamiento y regulación, un tema clave para el estudio del metabolismo normal y de
su alteración en diferentes patologías.

PIRUVATO: ¿DE DONDE PROVIENE Y CUÁL ES SU DESTINO METABÓLICO?

Antes de empezar a hablar en detalle del ciclo de Krebs vamos a analizar primero
una de las reacciones que generan acetil-CoA. Nos referimos a la reacción de
descarboxilación oxidativa del piruvato, catalizada por el complejo de la piruvato
deshidrogenasa. Esta reacción NO FORMA PARTE DEL CICLO DE KREBS, pero la mayor
parte de los libros de texto la incluyen en esta unidad, posiblemente porque no forma parte
de ninguna otra vía metabólica. Esta reacción también ocurre en las mitocondrias y el
complejo enzimático que la cataliza es similar a uno que interviene en una de las reacciones
del ciclo, como veremos más adelante. Sin embargo, no confundirse, esta reacción NO ES
LA UNICA FUENTE DE acetil-CoA para el ciclo de Krebs y su importancia como fuente de
acetil-CoA depende de cada tejido. El piruvato es el producto final de la glucólisis aeróbica
que ocurre en el citosol y también de la degradación de algunos aminoácidos como alanina,
serina y cisteína. El destino del piruvato depende del tejido en el que se produce y de su
estado metabólico. Además de ser sustrato del complejo de la piruvato deshidrogenasa, el
piruvato puede ser utilizado en otras vías metabólicas como, por ejemplo: a) transaminación
a alanina, b) carboxilación para generar oxaloacetato (sustrato gluconeogénico) y c)
reducción a lactato (glucólisis anaeróbica).

PIRUVATO DESHIDROGENASA

Como ya hemos dicho, el piruvato se transforma en acetil-CoA por descarboxilación


oxidativa, en una reacción catalizada por un complejo multienzimático denominado
piruvato deshidrogenasa. La reacción es la siguiente:

Piruvato + NAD+ + CoA → acetil-CoA + CO2 + NADH + H+ Gº’ = -8 kcal/mol

3
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Esta enzima se localiza exclusivamente en mitocondrias, en altas concentraciones
en tejidos como el músculo cardíaco y el riñón. Dado el alto valor negativo del Gº’ de la
reacción, en condiciones fisiológicas la reacción es esencialmente irreversible, y este
hecho es la principal razón por la cual la conversión neta de ácidos grasos a carbohidratos
no puede ocurrir en nuestro organismo.
El peso molecular del complejo enzimático de riñón, corazón o hígado varía entre 7
y 8,5 x 106 y en mamíferos consta de tres tipos diferentes de subunidades catalíticas:

Número de Tipo Peso Estructura


subunidades Molecular
20 ó 30 piruvato deshidrogenasa (E1) 154.000 22 tetrámero
60 dihidrolipoil transacetilasa (E2) 52.000 idénticas
6 dihidrolipoil deshidrogenasa (E3) 110.000 2 dímero

El complejo de la piruvato deshidrogenasa está compuesto por tres actividades


enzimáticas, denominadas: piruvato deshidrogenasa propiamente dicha (E1), dihidrolipoil
transacetilasa (E2) y dihidrolipoil deshidrogenasa (E3). Cinco coenzimas o grupos
prostéticos participan en la reacción de la piruvato deshidrogenasa: pirofosfato de tiamina,
ácido lipoico, coenzima A, FAD y NAD+. La E1 tiene covalentemente unido pirofosfato de
tiamina, la E2 tiene covalentemente unido ácido lipoico y la E3 tiene covalentemente unido
FAD.
En la Figura 2 se indican las estructuras del pirofosfato de tiamina y en la Figura 3
las del ácido lipoico y su modificación en la reacción catalizada por el complejo de la piruvato
deshidrogenasa.

Figura 2. Estructuras del pirofosfato de tiamina

4
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Figura 3. Estructuras del ácido lipoico

Mecanismo de la reacción – Figura 4


1) El piruvato interactúa con el pirofosfato de tiamina de la subunidad piruvato
deshidrogenasa (E1) y sufre una descarboxilación convirtiéndose en un grupo hidroxietilo.
2) A continuación, se transfiere el grupo acetilo y 2 electrones al grupo lipoico unido a
la dihidrolipoil transacetilasa (E2) para formar el acetil-tioéster del ácido lipoico en su forma
reducida.
3) En el siguiente paso, se transfiere el grupo acetilo desde el ácido lipoico a la
coenzima A. Noten que en ambos casos se trata de tioésteres.
4) El ácido lipoico reducido es reoxidado en una reacción catalizada por la dihidrolipoil
deshidrogenasa (E3) que cataliza la transferencia de dos átomos de hidrógeno del ácido
lipoico reducido a la coenzima FAD, su grupo prostético.
5) El último paso consiste en la transferencia de un ion hidruro al NAD+, regenerando
la forma oxidada del FAD. El complejo se encuentra ahora en condiciones de producir la
transformación de una nueva molécula de piruvato.

Figura 4. Mecanismo general de la reacción catalizada por el complejo PDH

5
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
De la descripción del mecanismo de la reacción se desprende que existe una activa
participación de grupos tioles en el mecanismo catalítico de la enzima y por lo tanto agentes
que oxiden o formen complejos con los grupos tioles serán potentes inhibidores del
complejo enzimático. Por ejemplo, el arsenito.

REGULACIÓN DE LA ACTIVIDAD PIRUVATO DESHIDROGENASA

La actividad del complejo de la piruvato deshidrogenada presenta dos tipos de


regulación: 1) alostérica: dos de los productos de la reacción, el acetil-CoA y el NADH la
inhiben en forma alostérica, 2) por modificación covalente: el complejo existe en dos formas:
una forma activa (desfosforilada) y otra forma inactiva (fosforilada). La inactivación del
complejo es catalizada por una proteína quinasa dependiente de ATP-Mg2+ que está
fuertemente unida al complejo. La reactivación del complejo está catalizada por una
fosfoproteína fosfatasa que cataliza la desfosforilación del complejo en forma dependiente
de Mg2+ y de Ca2+. Tres residuos diferentes en la subunidad  de la piruvato
deshidrogenasa se fosforilan por la proteína quinasa, pero la fosforilación de solo uno de
ellos está relacionada con la actividad del complejo. La regulación diferencial de la quinasa
y de la fosfatasa es la clave de la regulación de la actividad del complejo.
La formación de acetil-CoA está coordinada con la velocidad de utilización del ATP.
Esto es consecuencia del efecto que tienen en su actividad las variaciones en las
concentraciones de ADP, piruvato, CoA-SH, NAD+, acetil-CoA y Ca2+ intramitocondrial.
Todos estos compuestos regulan la conversión de la enzima a la forma inactiva
(fosforilada). La quinasa es inhibida por ADP, cuyos niveles aumentan cuando aumenta el
consumo de ATP. Esta inhibición mantiene a la piruvato deshidrogenasa en la forma activa,
no fosforilada. En algunos tejidos, el aumento de la concentración de Ca2+ intramitocondrial,
que estimula la fosfatasa, contribuye al incremento de la forma desfosforilada y, por lo tanto,
la forma activa. El acetil-CoA y el NADH, productos de la reacción, inhiben a la forma
desfosforilada (activa) de la enzima, y también activan a la quinasa, llevando a un
desplazamiento del complejo a su forma inactiva. Además, la CoA-SH y el NAD+ inhiben a
la quinasa. Por lo tanto, cuando se produce un aumento en las relaciones NADH/NAD + o
acetil-CoA/CoA-SH (como por ejemplo durante la -oxidación de ácidos grasos), la
actividad del complejo enzimático disminuye marcadamente. Además, el piruvato es un
poderoso inhibidor de la quinasa y, por lo tanto, en presencia de altas concentraciones de
piruvato, la quinasa estará inhibida y el complejo tendrá su máxima actividad. Finalmente,
se ha demostrado que la administración de insulina puede activar a la piruvato
deshidrogenasa del tejido adiposo y que las catecolaminas (como la adrenalina) pueden
activar a la enzima del tejido cardíaco. Los mecanismos aún no están completamente
aclarados, pero podría estar involucrada una alteración en la distribución intracelular de
calcio, que afecta a la fosfoproteína fosfatasa. Estos efectos hormonales no están mediados
directamente por alteraciones en los niveles de AMPc dado que tanto la quinasa como la
fosfatasa del complejo son independientes de AMPc (Figura 5).

6
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Figura 5. Regulación de la actividad del complejo PDH

En conclusión, la actividad del complejo enzimático aumenta cuando se requiere un


aporte de acetil-CoA al ciclo o cuando aumenta la concentración de sus sustratos, aunque
en ese último caso, el destino final del acetil-CoA no será únicamente el ciclo.

Acetil-CoA

Como ya dijimos, la mayor parte de las principales vías catabólicas genera la unidad
de dos carbonos del acetil-CoA. El catabolismo de los glúcidos almacenados o ingeridos, a
través de la vía glucolítica, el de los ácidos grasos de cadena larga provenientes de la
lipólisis de los triacilglicéridos a través de la -oxidación, la oxidación de cuerpos cetónicos
y de etanol o el catabolismo de ciertos aminoácidos producto de proteólisis, luego de su
transaminación o desaminación y posterior oxidación proveen precursores para la
formación de acetil-CoA.

Figura 6. Estructura de la coenzima A

En la Figura 6 se muestra la estructura de la coenzima A (CoA-SH). Es un nucleótido


que se compone de -mercaptoetilamina, la vitamina ácido pantoténico y un nucleótido de
adenina, adenosina 3’- fosfato 5’-difosfato. Su grupo tiol (-SH) se encuentra reducido y está
involucrado en muchas reacciones de transferencia de grupos acilo en las que la CoA-SH
alternativamente funciona como el aceptor y luego el dador de la función acilo.
En muchas vías metabólicas, los intermediarios son compuestos donde participa la
CoA-SH, por ejemplo, en la -oxidación de ácidos grasos y en la degradación de
7
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
aminoácidos ramificados. Como muchos otros nucleótidos, los derivados de la CoA-SH no
se transportan libremente a través de las membranas celulares, sino que lo hacen a través
de transportadores o mecanismos específicos. También es importante señalar que el
enlace tioéster del acetil-CoA es un enlace rico en energía, y por lo tanto estos compuestos
pueden servir como dadores eficientes de grupos acilo en reacciones de transferencia de
acilo.
En la síntesis de acetil-CoA catalizada por la enzima acetato tioquinasa debe
utilizarse una molécula de ATP y la reacción se produce con gasto de 2 enlaces de alta
energía:
acetato + CoA-SH + ATP → acetil-CoA + AMP + PPi

Los destinos metabólicos del acetil-CoA generado en las mitocondrias pueden ser:
a) oxidación completa del grupo acetilo en el CAT, con generación de energía.
b) conversión a cuerpos cetónicos (en determinadas situaciones metabólicas, en el ayuno
y exclusivamente en el hígado): acetoacetato y -hidroxibutirato.
c) transferencia de acetilos al citosol y la subsecuente biosíntesis de moléculas complejas
como ácidos grasos de cadena larga y esteroles (en la saciedad).

CICLO DE LOS ÁCIDOS TRICARBOXÍLICOS (CAT) O CICLO DE KREBS O CICLO DEL


ÁCIDO CÍTRICO

Como ya mencionamos, en la mayoría de las vías de oxidación de combustibles


metabólicos se produce acetil-CoA. Su destino principal es la oxidación completa a CO2 en
una serie de reacciones oxidativas cíclicas, denominadas ciclo de los ácidos tricarboxílicos
(CAT). También se lo conoce como ciclo de Krebs, en homenaje al investigador que postuló
las características esenciales del ciclo en el año 1937. Todas las enzimas del ciclo se
localizan en la mitocondria, lo que coincide con la localización del complejo de la piruvato
deshidrogenasa y de las enzimas de la β-oxidación, las dos fuentes principales de acetil-
CoA. Una de las funciones principales del ciclo es la generación de equivalentes de
reducción, que se utilizan para generar energía (ATP), en la secuencia de transporte de
electrones y fosforilación oxidativa, procesos que también ocurren en las mitocondrias.
La oxidación del acetil-CoA ocurre en cuatro reacciones que transfieren electrones a
las coenzimas aceptoras NAD+ o FAD. En otras reacciones del ciclo se rearreglan los
enlaces para facilitar esta transferencia. Inicialmente la porción acetilo del acetil-CoA se
combina con el intermediario de cuatro carbonos, el oxaloacetato, para formar citrato (6
carbonos). Un rearreglo subsecuente de enlaces en el citrato es seguido por dos
descarboxilaciones oxidativas. Estas reacciones transfieren los electrones al NAD + y liberan
2 carbonos como 2 CO2. En el siguiente paso, se genera un enlace de alta energía del GTP
por un mecanismo de fosforilación a nivel de sustrato. En la porción remanente del ciclo
hay dos reacciones de transferencia electrónica adicionales y se regenera el oxaloacetato.
El proceso completo ocurre con la conservación de la mayor parte de la energía de los
enlaces químicos del grupo acetilo dando como productos finales 3 NADH, 1 FADH 2 y 1
GTP (Figura 7). Aproximadamente 2/3 del NADH y del FADH2 generados en todas las vías
de oxidación de combustibles provienen del CAT. La velocidad del ciclo está fuertemente
coordinada a la velocidad de utilización de ATP a través de la regulación de enzimas
individuales por compuestos relacionados con el ATP, por el estado de reducción del NAD +
y por la concentración mitocondrial de Ca2+.

8
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Figura 7. Visión general del ciclo de Krebs

OXIDACIÓN DE ACETIL-CoA EN EL CICLO DE LOS ACIDOS TRICARBOXÍLICOS

La primera reacción del CAT involucra la condensación del grupo acetilo con la
función -ceto del ácido dicarboxílico oxaloacetato, para formar citrato, un intermediario de
6 carbonos. Esta reacción es catalizada por la enzima citrato sintasa que se localiza en la
matriz mitocondrial. Es una reacción altamente exergónica (Gº’= -9 kcal/mol) que se
encuentra desplazada hacia la formación del citrato, considerablemente desplazada del
equilibrio en condiciones fisiológicas, lo que hace a este paso un candidato ideal para la
regulación. Sin embargo, no se ha demostrado que la enzima tenga reguladores alostéricos
en tejidos de mamíferos. El regulador principal de la enzima sería el aporte de sus sustratos:
acetil-CoA y oxaloacetato.

En el siguiente paso, catalizado por la enzima aconitasa, se forma isocitrato por la


transferencia de un grupo hidroxilo a un carbono adyacente, que posee un enlace C-H.
Esta reacción involucra la generación de un intermediario unido a la enzima, el cis-
aconitato. En el equilibrio existe un 90% de citrato, 3% de cis-aconitato y un 7% de isocitrato.
Por lo tanto, en el equilibrio, predomina el citrato. Aunque la reacción no requiere cofactores,
si requiere hierro (Fe2+) y existe evidencia de que éste estaría involucrado en un centro Fe-
S, componente esencial de la actividad hidratasa de la aconitasa.

9
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

La isocitrato deshidrogenasa cataliza la primera reacción de deshidrogenación del


ciclo. El isocitrato se convierte en -cetoglutarato en una reacción de descarboxilación
oxidativa. En este paso del ciclo se produce el primero (de los dos) CO 2 y se genera el
primero (de los tres) NADH + H+.

La enzima requiere NAD+ como aceptor de los equivalentes de reducción. Si bien


existe otra actividad de isocitrato deshidrogenasa en el citosol que requiere NADP +, no es
ésta la que participa del ciclo y su función en el citosol es la de proveer equivalentes de
reducción para procesos reductivos citosólicos. El equilibrio de la reacción está muy
desplazado hacia la formación de -cetoglutarato, con un Gº'= -5 kcal/mol. La enzima tiene
un peso molecular de 380.000 y está constituida por 8 subunidades idénticas. Se requiere
un metal divalente (Mn2+ o Mg2+) para la descarboxilación de la posición β del isocitrato. La
enzima se activa por ADP y en algunos casos por AMP y se inhibe por ATP y NADH. Por
lo tanto, se inhibe en condiciones de alta disponibilidad de energía (alta relación ATP/ (ADP
+ Pi) y NADH/NAD+). En situaciones de baja energía, la actividad de la enzima se estimula,
lo que permite acelerar la generación de energía por el ciclo.

La conversión de -cetoglutarato a succinil-CoA es catalizada por el complejo


multienzimático de la -cetoglutarato deshidrogenasa que está compuesto por 3
actividades enzimáticas diferentes: -cetoglutarato deshidrogenasa, dihidrolipoil
transuccinilasa y dihidrolipoil deshidrogenasa. Su peso molecular es de varios millones de
daltons y pertenece a una familia de complejos similares que descarboxilan oxidativamente
al -cetoglutarato, al piruvato, al -cetobutirato y a los -cetoácidos de los aminoácidos de
cadena ramificada (valina, leucina e isoleucina).

-cetoglutarato succinil-CoA

Este complejo es casi idéntico al de la piruvato deshidrogenasa en cuanto al tipo de


reacción que cataliza y a algunas de sus características estructurales. También en este

10
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
caso, el pirofosfato de tiamina, el ácido lipoico, la CoA-SH, el FAD y el NAD+ participan del
mecanismo catalítico. El equilibrio está desplazado hacia la formación de succinil-CoA con
un Gº’ = -8 kcal/mol. En esta reacción se genera la segunda molécula de CO2 y el segundo
equivalente de reducción del ciclo (NADH + H+). El otro producto, el succinil-CoA, es un
ejemplo de tioéster rico en energía, similar al acetil-CoA. A diferencia del complejo de la
piruvato deshidrogenasa, la actividad de este complejo no está regulada por fosforilación.
Los nucleósidos trifosfato ATP y GTP, NADH y succinil-CoA inhiben su actividad, mientras
que el aumento en la concentración de Ca2+ lo activa. La energía del enlace tioéster del
succinil-CoA se conserva en una reacción de fosforilación a nivel de sustrato en el siguiente
paso del ciclo. Nota: la “fosforilación a nivel de sustrato” consiste en la formación de un
nuevo enlace de fosfato de alta energía en una reacción en la que no participa directamente
el oxígeno.
La reacción catalizada por la succinil-CoA sintetasa o succinato tioquinasa
convierte el succinil-CoA en succinato y resulta en la fosforilación del GDP para generar
GTP. La reacción es libremente reversible con un Gº’= -0,7 kcal/mol.

Dada la presencia de la nucleósido difosfato quinasa, el grupo -fosfato del GTP


puede generar ATP por transferencia al ADP.
NDQ (Mg2+)
ADP + GTP ATP + GDP

El succinato se oxida a fumarato en la reacción catalizada por la succinato


deshidrogenasa. Se transfiere un electrón de cada grupo metileno adyacente del succinato
a un FAD unido a la succinato deshidrogenasa, formándose entonces el doble enlace del
fumarato.

Gº’ = 0 kcal/mol

Del FADH2 (forma reducida) unido a la enzima, los electrones pasan a la cadena de
transporte de electrones. La enzima, compuesta por dos subunidades, está fuertemente
unida a la membrana mitocondrial interna. La mayor de las subunidades contiene el sitio de
unión del sustrato, el FAD covalentemente unido a una lisina, varios átomos de hierro no-
hémico y de azufre lábiles, mientras que la subunidad menor contiene hierro no-hémico y
azufre lábil. Esta enzima es un ejemplo típico de una proteína hierro-azufre en la cual el
hierro no-hémico sufre un cambio de valencia durante la remoción de los electrones y de
los protones del succinato y la subsecuente transferencia de estos equivalentes de
reducción por el FAD covalentemente unido a la cadena de transporte de electrones a nivel
de la coenzima Q-citocromo b. La succinato deshidrogenasa es inhibida fuertemente por

11
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
malonato y oxaloacetato y activada por succinato. Dada su similitud estructural con el
succinato, el malonato es un inhibidor competitivo de la enzima.

En el siguiente paso del ciclo, el fumarato se hidrata para formar L-malato, en una
reacción catalizada por la enzima fumarasa. Un grupo OH- y un protón del agua se agregan
al doble enlace del fumarato transformándolo en malato. La fumarasa es estereoespecífica
para la forma trans del sustrato (la forma cis, el maleato o ácido maleico, no es sustrato de
esta enzima) y el producto de la reacción es solamente L-malato (no su isómero, el D-
malato). La reacción es libremente reversible en condiciones fisiológicas.

La última reacción del ciclo, catalizada por la malato deshidrogenasa, genera el


último (de tres) de los equivalentes de reducción como NADH + H+.

El grupo alcohol del malato se oxida a grupo ceto cediendo sus electrones a la
coenzima. En el equilibrio predomina el malato, dado que para esta reacción el Gº’= + 7,0
kcal/mol. La reacción es por lo tanto fuertemente endergónica en la dirección de formación

de oxaloacetato. Sin embargo, las reacciones siguientes catalizada por la citrato sintasa y
otras, permiten la formación del oxaloacetato pues mantienen sus niveles muy bajos, ya
que es utilizado en las siguientes reacciones. Además, el NADH producido se oxida
rápidamente en la cadena de transporte de electrones.

El oxaloacetato que es imprescindible para la oxidación del acetil-CoA siempre se


regenera: en cada ciclo, 2 carbonos se incorporan en la forma del grupo acetilo, 2 se
eliminan como CO2, y la unidad de 4 carbonos está presente en el succinato, fumarato,
malato y oxaloacetato.
Es importante destacar que la secuencia de las últimas reacciones del CAT:
oxidación por formación de un doble enlace, adición de agua al doble enlace y oxidación
del alcohol resultante a cetona, se encuentra en muchas vías metabólicas tales como la
oxidación de los ácidos grasos y de aminoácidos ramificados.

12
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Coenzimas

Diferencias entre NAD+ y FAD


En la oxidación del succinato a fumarato y en la oxidación del lipoato reducido a
lipoato disulfuro, el FAD es el aceptor de electrones. En las otras oxidaciones esa función
la cumple el NAD+. ¿Por qué? Estas coenzimas tienen diferentes propiedades y cumplen
funciones diferentes.
Las diferencias en la estructura química (Figura 8) de las dos coenzimas determinan
que ambas cumplan roles fisiológicos diferentes. El FAD puede aceptar electrones
individuales (H•) y formar un intermediario semi-reducido con un electrón. Por lo tanto,
participa en reacciones donde se transfieren electrones individuales desde dos átomos
diferentes tales como los dos C-H adyacentes en el succinato o los dos grupos SH del ácido
dihidrolipoico. El NAD+ se reduce luego de aceptar un ion hidruro (H-) en reacciones tales
como la conversión de un alcohol a cetona.
La forma radical libre del FAD, con un electrón extra, es muy reactiva y el FADH •
puede perder su electrón por exposición a agua o por iniciación de reacciones en cadena.
Sin embargo, esto no ocurre porque el FADH• permanece unido fuertemente (a veces
covalentemente) a la enzima mientras acepta y transfiere electrones a otro grupo de la
enzima. El FADH2 en la succinato deshidrogenasa está covalentemente unido y no se
disocia de la enzima que se encuentra en la membrana mitocondrial interna donde los
electrones del FADH2 son cedidos a la coenzima Q, un intermediario de la cadena de
transporte de electrones. Todas las otras enzimas del CAT se encuentran en la matriz
mitocondrial. A diferencia del FAD, el NAD+ está generalmente libre en solución, se une a
la deshidrogenasa y acepta electrones y luego se libera y difunde. Por lo tanto, el NAD + y
el NADH funcionan más como sustratos y productos que como coenzimas. Esta
característica le permite al NADH ser un regulador de la función celular. El NADH generado
por una deshidrogenasa puede inhibir a otra si no es reoxidado por la cadena de transporte
de electrones. La regulación del ciclo por la relación NADH/NAD+ es parte del mecanismo
que permite coordinar la oxidación de combustibles con la utilización de ATP.

Figura 8. Diferencias estructurales de las coenzimas del ciclo de Krebs

13
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Coenzima A

La CoA-SH es una coenzima de acilación y participa en reacciones en las que se


forma un enlace tioéster con un grupo acilo (acetil-CoA, succinil-CoA). El carbono
carbonílico, el carbono  y el carbono β del grupo acilo se activan en diferentes tipos de
reacciones por la formación del enlace tioéster con el grupo sulfhidrilo de la coenzima A. La
hidrólisis de este enlace tiene un alto valor negativo de Gº’ (aprox. -13 kcal/mol). El enlace
tioéster es mucho menos estable que un enlace éster, pues el azufre no comparte sus
electrones en estados de resonancia. La energía liberada por la ruptura del tioéster cumple
dos funciones en el CAT: provee la energía para la generación de GTP y hace que la
entrada del acetil-CoA al ciclo sea más favorable termodinámicamente.
En la condensación de la porción acetilo con oxaloacetato para formar citrato, la
ruptura del enlace tioéster del acetil-CoA ocurre con un Gº’= -7,7 kcal/mol. Cuando este
valor negativo se agrega al gran valor positivo para la reacción de la malato
deshidrogenasa, se obtiene un valor neto cercano a 0 para la conversión de malato a citrato.
Por lo tanto, la entrada del acetil-CoA al ciclo se facilita por la ruptura del enlace tioéster.
Dado que el enlace tioéster del acetil-CoA tiene un Gº’ de hidrólisis de -13 kcal/mol,
su formación requiere energía, como ya se mencionó. La energía es aportada por la
descarboxilación oxidativa del piruvato en la reacción catalizada por el complejo de la
piruvato deshidrogenasa o de reacciones de oxidación y ruptura de enlaces C-C de ácidos
grasos o aminoácidos.
El acetato también puede convertirse directamente en acetil-CoA utilizando la
energía aportada por ATP, en una reacción catalizada por la acetato tioquinasa, como ya
se describió.

BALANCE ENERGÉTICO DEL CICLO DE KREBS

¿Qué transformación neta ocurre en el ciclo?


En primer lugar, el grupo acetilo de dos carbonos del acetil-CoA se oxida generando
2 moléculas de CO2. Una función del ciclo es conservar la energía de esta oxidación en
forma de coenzimas transportadoras de electrones en estado reducido. El balance global
del ciclo muestra que el grupo acetilo funciona como fuente de carbonos para el CO 2 y
como fuente de electrones para la transferencia a las coenzimas.

acetil-CoA + 3 NAD+ + FAD + GDP + Pi + 2 H2O


2 CO2 + CoA-SH + 3 NADH + 3 H+ + FADH2 + GTP

El acetil-CoA es el combustible del CAT, su oxidación no involucra O2 directamente,


y se lleva a cabo removiendo electrones como hidrógeno o ion hidruro y agregando H 2O.
Los 4 oxígenos de los 2 CO2 provienen del grupo carbonilo del acetil-CoA, 2 H2O. Las
diferentes reacciones del ciclo involucran el rearreglo de los carbonos y los electrones
donados por el grupo acetilo de modo que los mismos carbonos y electrones no entran y
salen del ciclo en una sola vuelta.

14
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Figura 9. Visión global del Ciclo de Krebs

El rendimiento completo en compuestos que contienen energía es de 3 NADH, 1


FADH2 y 1 GTP. Las reacciones rédox son catalizadas por 4 deshidrogenasas: isocitrato
deshidrogenasa, -cetoglutarato deshidrogenasa, succinato deshidrogenasa y malato
deshidrogenasa. El enlace de alta energía del GTP se origina en una reacción de
fosforilación a nivel de sustrato catalizada por la succinato tioquinasa o succinil-CoA
sintetasa.
Los 4 equivalentes de reducción se usan subsecuentemente para generar energía.
Como se discutirá más adelante, la oxidación de cada mol de NADH + H+ resulta en la
formación de 2,5 moles de ATP mientras que la de FADH2 en 1,5.
Por lo tanto, la ganancia neta para la oxidación de cada mol de acetil-CoA en el CAT
es de 10 moles de ATP (Figura 10).

Tres reacciones del ciclo (las catalizadas por la citrato sintasa, la isocitrato
deshidrogenasa y la -cetoglutarato deshidrogenasa) tienen valores muy negativos de Gº’.
En condiciones fisiológicas, estas reacciones son irreversibles debido a sus altos valores
(negativos) de Gº’ y porque las enzimas involucradas catalizan las reacciones inversas
muy lentamente. Estas reacciones realizan la contribución principal al elevado Gº’
negativo del ciclo.

Aunque el ciclo del ácido cítrico genera directamente solo un ATP por vuelta (en la
conversión de succinil-CoA a succinato), las cuatro reacciones de oxidación en el ciclo
proporcionan un gran flujo de electrones hacia la cadena respiratoria a través de NADH y
FADH2 y, por lo tanto, llevan a la formación de un gran número de moléculas de ATP en la
fosforilación oxidativa. Como ya vimos, el rendimiento energético de la producción de dos
moléculas de piruvato a partir de una molécula de glucosa en la glucólisis es 2 ATP y 2
NADH. En la fosforilación oxidativa, el paso de dos electrones del NADH al O2 impulsa la

15
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
formación de aproximadamente 2,5 ATP, y el paso de dos electrones del FADH 2 al O2
produce alrededor de 1,5 ATP. Esta estequiometría nos permite calcular el rendimiento
global de ATP a partir de la oxidación completa de la glucosa. Cuando ambas moléculas de
piruvato se oxidan a 6 CO2 a través del complejo de piruvato deshidrogenasa y el ciclo del
ácido cítrico, y los electrones se transfieren al O2, mediante la fosforilación oxidativa se
obtienen hasta 32 ATP por glucosa. En números redondos, esto representa la conservación
de 32 X 7,29 kcal/mol= 233.27 kcal/mol, que representa el 34% del máximo teórico de
aproximadamente 678.8 kcal/mol disponible de la oxidación completa de glucosa. Estos
cálculos utilizan la variación de energía libre estándar. Cuando se corrige por la energía
libre real requerida para formar ATP dentro de las células la eficiencia calculada del proceso
está más cerca del 65% (Principios de Bioquímica, Lehninger).

Enzima Gº (kcal/mol)


citrato sintasa -7,7
aconitasa + 1,5
isocitrato deshidrogenasa -5,3
-cetoglutarato deshidrogenasa -8,0
succinato tioquinasa -0,7
succinato deshidrogenasa 0
fumarasa 0
malato deshidrogenasa + 7,1

REGULACIÓN DEL CICLO DE LOS ÁCIDOS TRICARBOXÍLICOS

La oxidación del acetil-CoA y la conservación de la energía en las coenzimas


reducidas que permite la generación de ATP son esenciales en todos los tejidos que
contienen mitocondrias. La velocidad de utilización de ATP es, por lo tanto, la fuerza
fisiológica primaria impulsora del ciclo. Existen dos señales principales de la velocidad de
utilización de ATP: a) el estado de fosforilación de los nucleótidos de adenina, que se refleja
en los niveles de ATP y ADP, y b) el estado de reducción del NAD+, reflejado en la relación
NADH/NAD+. Dentro de la célula y aún dentro de la mitocondria, la suma de la
concentración de nucleótidos de adenina (AMP, ADP y ATP) y la de NAD+ (NAD+ y NADH)
son relativamente constantes. Sin embargo, la velocidad de interconversión de los
nucleótidos de adenina y la velocidad de oxidación y reducción de las coenzimas varían
considerablemente entre distintas situaciones metabólicas. Por lo tanto, un aumento en la
utilización de ATP resultaría en una pequeña disminución en sus niveles y un aumento en
la concentración de ADP. Análogamente, un aumento en la oxidación de NADH por la
cadena de transporte provocaría un aumento en el contenido de NAD + y una disminución
en el de NADH.
Dado que las deshidrogenasas principales son dependientes del aporte continuo de
NAD+ y de FAD, sus actividades están estrictamente controladas por la cadena respiratoria
que es responsable de su oxidación y que está obligatoriamente acoplada a la generación
de ATP. De este modo, la actividad del ciclo es muy dependiente del control respiratorio,
que a su vez está afectado por el aporte de ADP + Pi y de oxígeno. Un agente inhibitorio o
una condición metabólica que interrumpa el aporte de oxígeno, el aporte continuo de ADP
o la fuente de equivalentes de reducción, inhibirán la actividad del ciclo. Este tipo de control
se conoce como “control grueso”.

16
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Hay también un número de interacciones mediadas por efectores entre
intermediarios, nucleótidos y las enzimas del ciclo que pueden ejercer un “control fino” de
su actividad.
Los conceptos generales con respecto a los mecanismos de regulación que se
aplican a todas las vías metabólicas pueden ser aplicados también en este caso. La
regulación de la velocidad de una vía metabólica ocurre sobre las enzimas que catalizan
los pasos limitantes de la velocidad, o sea los más lentos. Se puede hacer una analogía
considerando la velocidad promedio en una autopista cuando en alguna zona hay un
bloqueo que sólo deja libre un carril. En ese caso, el tránsito en esa zona se hace más lento
y esta disminución de la velocidad se transmite hacia el principio de la autopista.
Suponiendo que el lugar del bloqueo constituya la etapa limitante de la velocidad, una
modificación en el mismo, por ejemplo, la apertura de un nuevo carril para el tránsito
aumentará significativamente la velocidad global en la autopista. En forma semejante, la
velocidad de toda una vía metabólica está determinada por la de la reacción más lenta y
por lo tanto la regulación de la actividad de la vía ocurre principalmente a ese nivel.
Otro de los conceptos generales que también se aplica aquí, es que las vías que
deben mantener un nivel constante de un producto final, como el ATP se regulan por un
feedback de ese producto o un metabolito relacionado. En este caso, ATP, ADP, NADH y
NAD+ participan en la regulación por feedback (o retroalimentación).
La regulación del ciclo ocurre principalmente a nivel de dos enzimas: la isocitrato
deshidrogenasa y la -cetoglutarato deshidrogenasa. La capacidad de ambas enzimas es
relativamente baja en condiciones fisiológicas y por lo tanto constituyen los pasos limitantes
del ciclo. La isocitrato deshidrogenasa es una enzima oligomérica (formada por varias
subunidades) que es activada alostéricamente por ADP e inhibida por NADH. En ausencia
de ADP exhibe cooperatividad positiva, es decir que cuando el isocitrato se une a la primera
subunidad, las otras subunidades se convierten a una conformación activa. En presencia
de ADP cambia la conformación de todas las subunidades de modo que el isocitrato se une
más rápidamente a la enzima y el Km aparente cambia a un valor mucho menor. Por lo
tanto, a la concentración de isocitrato encontrada en la matriz mitocondrial, un pequeño
cambio en la concentración de ADP puede producir un gran cambio en la velocidad del
ciclo. Pequeños cambios en la concentración del producto NADH y del cosustrato NAD +
también afectan la velocidad de la enzima más de lo que lo harían en una enzima no
alostérica.
La -cetoglutarato deshidrogenasa es regulada en forma negativa por los
productos de la reacción: NADH y succinil-CoA.
Ambas enzimas, la isocitrato deshidrogenasa y la -cetoglutarato deshidrogenasa,
se activan por aumento en la concentración de Ca2+ mitocondrial. En el músculo esquelético
en contracción y posiblemente en otros tejidos musculares, la liberación de Ca 2+ del retículo
sarcoplásmico y el aumento en la concentración mitocondrial de Ca2+ durante la contracción
puede proveer una activación adicional de estas enzimas en una situación metabólica en la
que el ATP se está hidrolizando rápidamente (contracción muscular).
Ninguna de estas enzimas cataliza la primera reacción del ciclo, y por lo tanto no
afectan directamente la velocidad de entrada del acetil-CoA. En mamíferos, la enzima
citrato sintasa es una enzima simple y no se regula alostéricamente. Cuando la isocitrato
deshidrogenasa se activa, la concentración de citrato disminuye. En el equilibrio en
condiciones estándar, la reacción malato-oxaloacetato está francamente inclinada hacia la
reducción del oxaloacetato a malato. Sin embargo, los niveles de oxaloacetato en
condiciones reales son muy bajas (debido a su rápido consumo en la reacción de la citrato
sintasa), y esto favorece la reacción en la dirección de oxidación del malato, a pesar de ser
una reacción endergónica en condiciones estándar. Cuando la relación NADH/NAD+
disminuye, la reacción de oxidación del malato también se favorece.

17
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Además de lo ya mencionado, otros factores están involucrados en la regulación de
la actividad del CAT. Por ejemplo, el aporte de sustratos como las unidades de acetilo que
provienen del piruvato o de ácidos grasos, es un factor crucial para determinar la velocidad
del ciclo. Por lo tanto, la regulación de la piruvato deshidrogenasa tendrá un efecto
importante en la velocidad del ciclo. De modo similar, cualquier mecanismo que regule los
procesos de transporte y la -oxidación de ácidos grasos será un determinante efectivo de
la actividad del ciclo.

En resumen
La velocidad del ciclo de Krebs se puede modificar por dos factores:

Disponibilidad de sustratos: la velocidad del ciclo depende de un equilibrio entre vías que
aportan intermediarios, las vías que consumen dichos intermediarios utilizándolos en vías
anabólicas. Existe un control importante a través de la cadena respiratoria y fosforilación
oxidativa en relación al ADP y utilización del ATP y por lo tanto en relación con las
concentraciones de coenzimas oxidadas. En algunos tejidos como el encéfalo, que
depende de la glucosa para formar acetil-CoA, el control puede ocurrir sobre la PDH.

Nivel energético: el nivel energético se evalúa mediante dos relaciones:


la relación ATP/ADP: altos niveles de esta relación frenan a la isocitrato deshidrogenasa,
con aumento de isocitrato, que vuelve hacia citrato, el cual sale hacia el citoplasma e inhibe
la glucólisis. El aumento de ATP aumenta la Km de la citrato sintasa, que pierde afinidad
por el acetil-CoA. También disminuye el grado de regeneración del GDP, frenando a la
succinato tioquinasa y aumentando los niveles de succinil-CoA que inhibe competitivamente
a la citrato sintasa.
la relación NADH+H+/NAD+: altos niveles de la coenzima reducida frenan a la isocitrato DH,
la -cetoglutarato DH y a la malato DH.

En conclusión, la regulación de la actividad del ciclo le permite a la célula adaptarse


a diferentes situaciones metabólicas. Es decir, en aquellas donde se requiera una gran
actividad para producir la oxidación completa de moléculas combustibles, las enzimas
funcionarán con su máxima capacidad y en aquellas donde el requerimiento sea menor,
disminuirá la oxidación del acetil-CoA que se desviará hacia la formación de triacilglicéridos.
De este modo, el organismo logra mantener la homeostasis calórica a pesar de las
variaciones en el aporte de combustibles y en su utilización.

PUNTOS DE FUGA Y REACCIONES ANAPLEROTICAS

El ciclo de Krebs o ciclo de los ácidos tricarboxílicos (CAT) es una vía anfibólica,
eso significa que sirve tanto en procesos catabólicos como anabólicos. Además de su rol
en el catabolismo oxidativo donde los esqueletos carbonados de hidratos de carbono,
ácidos grasos y aminoácidos son convertidos en CO2 y H2O, el ciclo provee precursores
para varias vías biosintéticas. Por ejemplo, el -cetoglutarato y el oxaloacetato pueden
servir como precursores de los aminoácidos glutamato y aspartato por simple
transaminación. A través del glutamato y del aspartato, los carbonos del -cetoglutarato y
del oxaloacetato se utilizan para formar otros aminoácidos, así como nucleótidos de
purinas y pirimidinas. El oxaloacetato puede ser también precursor de la glucosa en la
gluconeogénesis. El succinil-CoA es un intermediario central en la síntesis del anillo de
porfirinas de los grupos hemo, transportadores de oxígeno (en hemoglobina y mioglobina)
y de electrones (en los citocromos).

18
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
Siendo como se dijo una vía anfibólica, una de las características del CAT es la
existencia de puntos de salida y entrada de intermediarios. En los puntos de salida,
denominados puntos de fuga, algunos de los intermediarios del ciclo pueden “salir” del
ciclo y actuar como sustratos de otras reacciones ajenas a éste. Si un intermediario “sale”
hacia otra vía en alguno de los puntos de fuga, es necesario que el nivel de intermediarios
se restaure para que el ciclo (y con ello la obtención de energía) no se detenga. Esto ocurre
por las reacciones anapleróticas o de relleno, a través de las cuales se aportan
intermediarios del CAT, lo que permite compensar la salida de intermediarios hacia otras
vías como la gluconeogénesis o la síntesis de ácidos grasos. Debe tenerse en cuenta que
para que una reacción pueda ser considerada reacción anaplerótica el aporte de
intermediarios del ciclo no debe ser a expensas del consumo de otros intermediarios. Por
ejemplo, el aporte de succinato por el catabolismo de los cuerpos cetónicos que consume
otro intermediario del ciclo (succinil-CoA) no se considera reacción anaplerótica.

El citrato, que es el primer producto del ciclo, es también el primer punto de fuga
dado que además de intermediario en el ciclo puede funcionar como fuente de carbonos
en otras vías metabólicas que ocurren en el citosol como la síntesis de ácidos grasos y
esteroles. NOTA: repasar lo visto en Metabolismo de lípidos 1.

El -cetoglutarato es otro punto de fuga del CAT porque puede condensarse con
amoníaco (o amonio) en presencia de NADH o NADPH y se sintetiza glutamato y NAD + o
NADP+. Esta reacción ocurre en las mitocondrias, y es catalizada por la enzima
glutamato-deshidrogenasa, una de las enzimas más importantes en el metabolismo de
aminoácidos.

19
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

GLUTAMATO DESHIDROGENASA

-cetoglutarato glutamato

El malato constituye otro punto de fuga, pues puede ser transportado al citosol,
donde genera oxaloacetato en la reacción catalizada por la enzima malato deshidrogenasa
citosólica. El oxaloacetato citosólico es un sustrato gluconeogénico.

El succinil-CoA es un punto de ramificación metabólica, porque este intermediario


puede salir del ciclo, constituyendo un punto de fuga, o entrar al ciclo, a través de una
reacción anaplerótica.

Como punto de fuga, su destino metabólico incluye su condensación con glicina para
formar el -aminolevulinato en la reacción catalizada por la -aminolevulinato sintasa (ALA-
sintasa), que constituye la reacción inicial de la síntesis de porfirinas. También el succinil-
CoA es convertido en succinato en la vía de utilización de cuerpos cetónicos.

δ-aminolevulinato sintasa
(ALA-sintasa)

20
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

A su vez, el succinil-CoA es producido como consecuencia del catabolismo de ciertos


aminoácidos. La mayor parte de los tejidos, incluidos cerebro, músculo esquelético y
corazón degradan aminoácidos como isoleucina metionina, treonina y valina a succinil-CoA.
En el hígado, el CTA es parte de la vía que convierte dichos aminoácidos en glucosa, y en
el músculo esquelético es parte de la vía que los convierte en glutamina.
También se produce succinil-CoA a partir del catabolismo de los ácidos grasos con
número de C impar, en donde en los pasos finales de su degradación se obtiene propionil-
CoA primero y metilmalonil-CoA después el cual será convertido en succinil-CoA (ver
reacciones de la β-oxidación).
Una de las principales reacciones anapleróticas es la conversión de piruvato y CO2
a oxaloacetato, catalizada por la piruvato carboxilasa. Esta enzima contiene biotina, que
en presencia de ATP y Mg2+ forma un intermediario covalente con el CO2 que se agrega
luego como grupo carboxilo al piruvato, para formar oxaloacetato. Las carboxilasas de otras
vías metabólicas también requieren biotina y su mecanismo de acción es similar. El acetil-
CoA es un efector alostérico positivo de la piruvato carboxilasa: cuando el acetil-CoA,
combustible del CTA, está presente en exceso, activa a la piruvato carboxilasa para
producir más oxaloacetato, permitiendo que el ciclo use más acetil-CoA en la reacción
catalizada por la citrato sintasa. La piruvato carboxilasa se encuentra en altas
concentraciones en el hígado y tejido nervioso, tejidos en los que ocurre un constante eflujo
de intermediarios. En el hígado, es parte de la vía gluconeogénica que permite convertir
alanina y lactato en glucosa.

La enzima glutamato deshidrogenasa, que ya hemos mencionado, cataliza la


conversión reversible de -cetoglutarato en glutamato, constituyendo un punto de fuga.
Siendo una reacción reversible, es también un buen ejemplo de reacción anaplerótica.

21
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022

Otra reacción que consume -cetoglutarato u oxaloacetato es la catalizada por la


glutamato-oxaloacetato transaminasa (GOT o ASAT). Esta reacción es reversible y en
ambos sentidos se obtiene un producto (oxaloacetato o -cetoglutarato) que pueden entrar
al ciclo, sin embargo, no se la considera una reacción anaplerótica ya que para producir
dichos productos utiliza como sustratos a intermediarios del ciclo. Es decir, si se considera
la reacción como se la presenta en el esquema, consume -cetoglutarato (que sale del
ciclo) y produce oxaloacetato (que alimenta al ciclo).
Otra reacción anaplerótica es la catalizada por la enzima málica (diferente de la
enzima málico (o malato) deshidrogenasa) que convierte el piruvato en malato, consume
NADPH y requiere del aporte de 1C que proviene de un CO2.

Sistemas de lanzaderas o mecanismos de oxidación del NADH citosólico

Como ya hemos mencionado, tanto las enzimas del CAT como la cadena de
transporte de electrones se localizan en la mitocondria. También son mitocondriales las
enzimas de la -oxidación y las de otras vías oxidativas. Ahora bien, en estas vías, cuando
se oxidan los sustratos, se reducen las coenzimas NAD+ y FAD. La cantidad de coenzimas
dentro de la mitocondria y en general dentro de la célula es muy baja, por lo tanto, para que
la vía metabólica pueda continuar funcionando es necesario que se produzca su
reoxidación. Las coenzimas se reoxidan cediendo sus electrones a la cadena de transporte
de electrones. Para las vías metabólicas intramitocondriales esto es bastante sencillo
porque las coenzimas se reducen y luego se reoxidan en la misma organela. Pero ¿qué
ocurre con las coenzimas reducidas en el citosol, por ejemplo, durante la glucólisis?
Un mecanismo de reoxidación del NADH citosólico consiste en el transporte de los
equivalentes de reducción a la mitocondria por las lanzaderas del glicerol-3-fosfato o del

22
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
malato-aspartato y finalmente al oxígeno a través de la cadena de transporte de electrones
(sistemas de lanzaderas).
La membrana mitocondrial interna es impermeable al NADH y no existen proteínas
que permitan su transporte. Los equivalentes de reducción (en forma de ion hidruro) se
transfieren por una reacción rédox citosólica a un compuesto que tiene un transportador en
la membrana mitocondrial interna. En ese paso inicial se regenera el NAD + en el citosol.
Los electrones se transfieren a la cadena de transporte de electrones donde se generan
aproximadamente 1,5 moles de ATP por mol de NADH transportado por la lanzadera del
glicerol-3-fosfato y 2,5 moles de ATP si la lanzadera es la del malato-aspartato.

Lanzadera del glicerol-3-fosfato

Es la lanzadera predominante en el músculo esquelético y en el cerebro. En el


citosol, los electrones se transfieren del NADH a la dihidroxiacetona fosfato formando el
glicerol-3-fosfato, en una reacción catalizada por la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa
citosólica. El glicerol-3-fosfato se transporta a la membrana mitocondrial interna donde
cede sus electrones a la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial que contiene
FAD, la que a su vez los cede a la coenzima Q en la cadena de transporte de electrones.
La dihidroxiacetona fosfato vuelve al citosol.
De esta forma, el único cambio neto que se produce luego de la actividad de esta
lanzadera es el intercambio de un NADH + H+ (coenzima reducida) del citosol por un FADH2
(coenzima reducida) en la mitocondria, ya que la dihidroxiacetona fosfato que se consumió
en la primera reacción (citosólica) se recupera en la segunda reacción (mitocondrial).

Lanzadera del malato-aspartato


Es una lanzadera más compleja que la anterior, pero funciona en forma similar. En
este caso, el NAD+ citosólico se regenera por la reducción del oxaloacetato a malato
catalizada por la enzima malato deshidrogenasa citosólica. El malato es traslocado por
una proteína transportadora (transporta malato y -cetoglutarato) a la matriz mitocondrial
donde se regenera el NADH en una reacción catalizada por la malato deshidrogenasa
mitocondrial. El oxaloacetato, que no puede atravesar la membrana mitocondrial interna
es convertido a aspartato en la mitocondria (en una reacción de transaminación con
glutamato).

23
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
El aspartato se trasloca (transportador de glutamato-aspartato) hacia el citosol donde
es transaminado nuevamente a oxaloacetato. Esta lanzadera es la más activa y funciona
en el hígado y en el corazón. Los tejidos con mitocondrias poseen ambos sistemas de
lanzaderas.
En este caso, el único cambio neto que se produce por la actividad de esta lanzadera
es el transporte (indirecto) de un NADH citosólico a la mitocondria, porque los demás
intermediarios se utilizan y se regeneran.

24
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
CUESTIONARIO DE CICLO DE KREBS

1) ¿La malato deshidrogenasa mitocondrial cataliza una reacción en la que, en


condiciones estándar, la concentración de sustratos es mayor que la de productos?
¿Produce un compuesto de alta energía? ¿Cataliza una reacción anaplerótica? ¿Utiliza
NADH como sustrato?
2) ¿Cuál de las enzimas del ciclo de Krebs (CAT) cataliza la síntesis de un compuesto de
alta energía?
3) Relacione con flechas los intermediarios (de la columna de la izquierda) con sus
posibles productos biosintéticos (columna de la derecha).
-cetoglutarato ninguno
succinil-CoA grupo hemo
cis-aconitato glutamato
piruvato ácidos grasos
citrato oxaloacetato
4) Con respecto a la enzima -cetoglutarato deshidrogenasa responda: ¿cataliza una
reacción en la que, en condiciones estándar, la concentración del producto es menor que
la del sustrato? ¿el producto de la reacción es sustrato de la fumarasa? ¿cataliza una
reacción anaplerótica? ¿utiliza pirofosfato de tiamina como cofactor?
5) Con respecto a la lanzadera del glicerol-3-fosfato responda: ¿en qué compartimiento
se reducen la dihidroxiacetona fosfato y el NAD+? ¿en la mitocondria se oxida el FAD y se
reduce el glicerol-3-P?
6) Indique la secuencia de eventos que ocurre en la reacción catalizada por la piruvato
deshidrogenasa, las coenzimas que intervienen y la composición del complejo enzimático.
¿De dónde proviene el sustrato?
7) Nombre los compuestos del ciclo de Krebs que tiene 4C, 5C y 6C.
8) Aunque el O2 no participa directamente en las reacciones del ciclo de Krebs, éste sólo
funciona en condiciones aeróbicas. ¿Por qué?
9) Con respecto a la actividad de enzima -cetoglutarato deshidrogenasa, responda: ¿en
qué dirección ocurrirá la reacción en condiciones estándar? ¿De qué reacción es sustrato
el producto de esta reacción? ¿Cataliza una reacción anaplerótica? ¿Utiliza pirofosfato de
tiamina como cofactor?
10) Describa la lanzadera de malato-aspartato e indique: ¿Cuál es su función? ¿Qué
procesos se producen en el citosol y cuáles en la mitocondria? ¿Cuál es el balance
energético?
11) ¿Cuál/es de las enzimas del ciclo de Krebs cataliza la transformación de un sustrato en
un producto con menor número de C?
12) ¿En cuál/es de las reacciones de oxidación del ciclo de Krebs NO se utiliza NAD+ como
sustrato?
13) Nombre 3 reacciones anapleróticas e indique su función. ¿Por qué no se considera la
reacción catalizada por la glutamato-oxaloacetato transaminasa como una reacción
anaplerótica?
14) Explique la regulación de la actividad del complejo de la piruvato deshidrogenasa
indicando el efecto de: a) relación de coenzimas NADH/NAD, b) relación ATP/ADP, c)
niveles de Ca2+, d) relación CoA-SH/acetil-CoA. Explique el efecto de la
fosforilación/desfosforilación en la actividad del complejo e indique las enzimas que lo
catalizan.
15) ¿Qué característica tiene la enzima que cataliza la síntesis de oxaloacetato del resto
de las enzimas del ciclo de Krebs?
16) Explique cómo se regula la actividad del CAT e indique las principales reacciones
regulables y los mecanismos de regulación involucrados.
17) Indique el balance energético de la oxidación de 1 mol de acetil-CoA en el CAT.

25
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
18) ¿Cuáles son las fuentes de acetil-CoA del CAT? Indique las vías metabólicas
involucradas.
19) Indique 3 compuestos que puedan sintetizarse a partir de intermediarios del CAT
(nombre los compuestos y los intermediarios).
20) ¿Se puede sintetizar glucosa a partir de acetil-CoA? ¿Por qué?

PREGUNTAS ADICIONALES DE CICLO DE KREBS, PUNTOS DE FUGA/REACCIONES


ANAPLERÓTICAS Y LANZADERAS.

1) Con respecto al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Por qué se considera que el ciclo de Krebs es anfibólico?
b) ¿Cuáles son los productos del ciclo de Krebs por cada mol de acetil-CoA oxidado?
c) Indique 2 reacciones anapleróticas nombrando sustratos, productos, enzima y cofactores.

2) Con respecto al complejo de la piruvato deshidrogenasa, responda las siguientes


preguntas.
a) Escriba la reacción enzimática global indicando sustratos, productos, enzimas y cofactores.
¿Dónde ocurre esta reacción enzimática?
b) Explique brevemente como está compuesto el complejo de la piruvato deshidrogenasa, que
reacciones cataliza cada componente y que coenzimas o grupos prostéticos participan.
c) Los alcohólicos pueden presentar déficit de tiamina generando la enfermedad de Beriberi y la
encefalopatía de Wernicke. ¿Como espera encontrar la actividad enzimática? Justifique su
respuesta.

3) Con respecto al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Qué enzimas catalizan las 3 etapas altamente exergónicas del ciclo?
b) ¿Qué enzima se encuentra localizada en la membrana mitocondrial interna? ¿Qué coenzima de
oxidorreducción utiliza?
c) ¿Qué grupo prostético requiere la piruvato carboxilasa y que función cumple?

4) Con respecto a las lanzaderas, responda las siguientes preguntas.


a) Explique brevemente cuál es su función.
b) Describa la lanzadera del glicerol-3-fosfato.
c) ¿En qué órganos predomina la lanzadera del malato-aspartato? ¿Cuántos moles de ATP se
generan por el transporte de equivalentes de reducción mediante esta lanzadera? Justifique.

5) El arsénico (As) es una sustancia tóxica, conocida desde la antigüedad. Se sabe que los
compuestos del As III pueden reaccionar con los grupos SH de moléculas orgánicas. En base
a esta información indique en el caso de una intoxicación con arsénico, responda las
siguientes preguntas.
a) ¿Cuál podría ser el mecanismo de acción del As a nivel de la reacción de la piruvato
deshidrogenasa? ¿Y su efecto?
b) ¿Cuál sería el mecanismo de acción del As a nivel del ciclo Krebs? ¿Y su efecto?
c) ¿Qué ocurriría con las coenzimas de oxidorreducción y el ATP?

6) Con respecto a los intermediarios del ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.
a) ¿Cuáles son sustratos gluconeogénicos?
b) ¿Cuáles son sustratos para la síntesis de ácidos grasos?
c) ¿Cuáles pueden convertirse directamente en aminoácidos?

7) ¿Qué entiende por regulación del ciclo de Krebs por nivel de sustrato y regulación por
niveles energéticos?

8) Con relación al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) Mencione dos intermediarios que sean a la vez puntos de fuga y productos de una reacción
anaplerótica. Justifique su respuesta.

26
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
b) ¿Cuál es la reacción enzimática que puede considerarse una reacción de fosforilación a nivel
de sustrato? ¿Qué enzima la cataliza?
c) ¿Cuáles son los productos de la oxidación de un mol de acetil-CoA en una vuelta del ciclo?

9) Con relación al ciclo de Krebs, responda las siguientes preguntas.


a) ¿Cuáles son las enzimas del ciclo de Krebs que catalizan reacciones de descarboxilación
oxidativa? Indique sustratos, enzimas y productos. Estas enzimas tienen en común dos reguladores,
¿cuáles son y cómo actúan?
b) Indique dos orígenes de la molécula de acetil-CoA en la mitocondria.
c) Indique dos reacciones anapleróticas.

10) Complete la siguiente tabla indicando sustratos, coenzimas, enzimas, productos y vía a
la que corresponde cada reacción.
Sustratos Enzima Productos Vía metabólica o tipo
de reacción
glutamato + NAD(P)+ reacción anaplerótica
acetil-CoA + CO2
+ NADH + H+
malato
deshidrogenasa
mitocondrial
oxaloacetato +
glutamato
glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa
citoplasmática
glicerol-3-fosfato
deshidrogenasa
mitocondrial
enzima málica
succinil-CoA +
NADH + H+
malato + NAD+ lanzadera del
malato/aspartato
isocitrato + NAD+

11) ¿Qué reacción del ciclo de Krebs NO produce NADH?


A. La conversión de succinato a fumarato.
B. La reacción donde se sintetiza succinil-CoA.
C. La conversión de malato a oxaloacetato.
D. La reacción donde el isocitrato se convierte en -cetoglutarato.

12) Con respecto al ciclo de Krebs, indique la reacción en la cual se genera un tioéster que
es un compuesto de alta energía.
A. -cetoglutarato deshidrogenasa
B. succinato deshidrogenasa
C. isocitrato deshidrogenasa
D. fumarasa

13) En el ciclo de Krebs, indique qué enzima cataliza una reacción de descarboxilación
oxidativa.
A. -cetoglutarato deshidrogenasa
B. succinato deshidrogenasa
C. succinil-CoA sintetasa
D. malato deshidrogenasa

27
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
14) Con respecto a la regulación del complejo de la piruvato deshidrogenasa (PDH), indique
la opción correcta.
A. El acetil-CoA y el NADH son moduladores alostéricos positivos de la piruvato deshidrogenasa
quinasa.
B. La inactivación del complejo es catalizada por una fosfoproteína fosfatasa que promueve la
desfosforilación del complejo.
C. Altas concentraciones de piruvato activan a la piruvato deshidrogenasa quinasa y el complejo
PDH tendrá su máxima actividad.
D. La activación del complejo es catalizada por una proteína quinasa dependiente de ATP.

15) Indique el compuesto que puede aportar directamente -cetoglutarato al ciclo de Krebs.
A. glutamato
B. glutamina
C. aspartato
D. alanina

16) ¿Cuál de las siguientes enzimas NO cataliza una reacción anaplerótica?


A. glutamato oxaloacetato transaminasa
B. enzima málica
C. glutamato deshidrogenasa
D. piruvato carboxilasa

17) Identifique una reacción anaplerótica.


A. La reacción catalizada por la piruvato carboxilasa.
B. La reacción catalizada por la piruvato deshidrogenasa.
C. La lanzadera del glicerol-3-P.
D. La reacción donde se sintetiza un precursor del hemo.

18) Indique la opción correcta con respecto al transporte de los equivalentes de reducción
del NADH generado en el citosol a la matriz mitocondrial.
A. Entra malato y glutamato y sale aspartato y -cetoglutarato de la mitocondria.
B. Entra malato y -cetoglutarato y sale oxaloacetato y glutamato de la mitocondria.
C. Entran solo oxaloacetato y malato a la mitocondria.
D. Salen solo aspartato y malato de la mitocondria.

19) La lanzadera del citrato puede considerarse …


A. un punto de fuga.
B. una reacción anaplerótica.
C. un mecanismo de transporte bidireccional entre citoplasma y mitocondria.
D. una reacción para reponer coenzimas reducidas.

20) Indique la opción correcta respecto a la lanzadera del glicerol-3-fosfato.


A. Se oxida el NADH citoplasmático reduciendo a la dihidroxiacetona fosfato (DHAP).
B. Se transfiere NADH del citoplasma a la mitocondria.
C. Se reduce NAD+ oxidando al glicerol-3-fosfato en el citoplasma.
D. Se oxida el NADH citoplasmático oxidando al glicerol-3-fosfato.

28
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
RESPUESTAS
1) a) Porque participa tanto de procesos catabólicos como anabólicos, ya que es la vía final de
degradación de glúcidos, lípidos y aminoácidos y también participa en la síntesis de moléculas
complejas a partir de moléculas simples.
b) 2 moles de CO2, 3 moles de NADH, 1 mol de FADH2, un mol de un nucleósido trifosfato (GTP o
ATP) y un mol de CoA.
c) piruvato carboxilasa
piruvato + HCO3- + ATP → oxaloacetato + ADP + Pi
PEP carboxiquinasa
fosfoenolpiruvato + CO2 + GDP → oxaloacetato + GTP
enzima málica
piruvato + HCO3- + NAD(P)H → malato + NAD(P)+
glutamato deshidrogenasa
glutamato + NAD(P)+ + H2O → -cetoglutarato + NH4+ + NAD(P)H + H+

propionil-CoA →→→→→ succinil-CoA (ácidos grasos de número impar de carbonos)

2)
Respuesta
a)

b) Está compuesto por tres actividades enzimáticas, denominadas: piruvato


deshidrogenasa propiamente dicha (E1), dihidrolipoil transacetilasa (E2) y dihidrolipoil
deshidrogenasa (E3). Cinco coenzimas o grupos prostéticos participan en la reacción del
piruvato deshidrogenasa: pirofosfato de tiamina, ácido lipoico, coenzima A, FAD y NAD+.
La E1 tiene covalentemente unido pirofosfato de tiamina, la E2 tiene covalentemente unido
ácido lipoico y la E3 tiene covalentemente unido FAD.
c) Disminuida, porque la piruvato deshidrogenasa (E1) para realizar la reacción necesita
tener presente en su sitio activo tiamina pirofosfato.

3) a) citrato sintasa, isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato deshidrogenasa.


b) La succinato deshidrogenasa. FAD.
c) Biotina. Forma un intermediario covalente con el CO2 que se agrega luego como grupo carboxilo
al piruvato, para formar oxaloacetato.

4) a) Su función es transportar NADH a través de la membrana mitocondrial interna porque es


impermeable al NADH y así llegar a la cadena de transporte de electrones.
b) En el citosol, los electrones se transfieren del NADH a la dihidroxiacetona fosfato formando el
glicerol-3-fosfato, en una reacción catalizada por la glicerol-3-fosfato deshidrogenasa citosólica. El
glicerol-3-fosfato se transporta a la membrana mitocondrial interna donde cede sus electrones a la
glicerol-3-fosfato deshidrogenasa mitocondrial que contiene FAD, la que a su vez los cede a la
coenzima Q en la cadena de transporte de electrones. La dihidroxiacetona fosfato vuelve al citosol.
c) En el hígado y en el corazón. 2,5 moles ATP porque genera NADH + H+ intramitocondrial.

29
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
5) a) Los compuestos de As III reaccionan con los SH del ácido lipoico del complejo de la PDH
ocasionando su inhibición de tipo no competitiva. El efecto es que el piruvato no puede convertirse
en acetil-CoA.
b) Los compuestos de As III reaccionan con los SH del complejo de la -cetoglutarato
deshidrogenasa, ocasionando su inhibición de tipo no competitiva. El efecto es que no puede
convertirse en succinil-CoA, por esta razón se frena el ciclo de Krebs.
c) No se producen coenzima reducidas que puedan luego acoplarse a la obtención de ATP.

6) a) oxaloacetato y malato
b) citrato
c) -cetoglutarato y oxaloacetato

7) La regulación por nivel de sustrato hace referencia a la cantidad de sustrato disponible para ser
oxidado en el ciclo de Krebs, esto implica el nivel de acetil-CoA y la enzima regulada en cuestión es
la citrato sintasa. La regulación por niveles energéticos se relaciona con la abundancia relativa de
NADH+H+/NAD+ y de ATP/ADP, cuando estas relaciones son altas, indica que el nivel energético
es alto y por ende el ciclo se frena a nivel de las enzimas isocitrato deshidrogenasa y -cetoglutarato
deshidrogenasa. Si dichas relaciones son bajas significa que el nivel energético de la célula es bajo
y en ese caso las enzimas mencionadas se verán estimuladas alostéricamente.

8) a) -cetoglutarato es el producto de la desaminación oxidativa del glutamato (glutamato


deshidrogenasa) y puede sintetizarse a partir de glutamato por acción de las transaminasas.
malato: es producto de la enzima málica y fuera de la mitocondria puede formar oxaloacetato
(malato deshidrogenasa).
succinil-CoA: se usa para la síntesis de porfirinas y es producto de la β-oxidación de ácidos grasos
de cadena impar (propionato).
b) succinil-CoA sintetasa o succinato tioquinasa
succinil-CoA + GDP + Pi → succinato + CoA + GTP
c) 2CO2 + 3NADH + 3H+ + FADH2 + GTP + CoA-SH

9) a) isocitrato deshidrogenasa.
isocitrato + NAD+ → -cetoglutarato + CO2 + NADH + H+
-cetoglutarato deshidrogenasa
-cetoglutarato + CoA + NAD+ → succinil-CoA + NADH + H+
ATP y NADH, son moduladores alostéricos negativos de ambas enzimas.
b) β-oxidación de ácidos grasos, piruvato deshidrogenasa, metabolismo de aminoácidos
ramificados (cetogénicos y/o mixtos) o activación de acetato por la acetato tioquinasa y ATP.
c) enzima málica
piruvato + CO2 + NAD(P)H + H+ → malato + NAD(P)+
glutamato deshidrogenasa
glutamato + NAD(P)+ → -cetoglutarato + NH4+ + NAD(P)H + H+
(Ácidos grasos de cadena impar) propionil-CoA →→→→→ succinil-CoA
piruvato carboxilasa
piruvato + ATP + HCO3- → oxaloacetato + ADP +Pi

30
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
10)
Respuesta
sustratos enzima productos vía metabólica o
tipo de reacción
glutamato + NAD(P)+ glutamato α- reacción anaplerótica
deshidrogenasa cetoglutarato +
NH4+ +
NAD(P)H + H+
piruvato + CoA + piruvato acetil-CoA + piruvato
NAD+ deshidrogenasa CO2 +NADH deshidrogenasa o
+H+ ninguna
malato + NAD+ malato oxalacetato + ciclo de Krebs
deshidrogenasa NADH + H+
mitocondrial
aspartato + transaminasa oxalacetato + transaminasa
α- cetoglutarato (GOT/ASAT) glutamato
dihidroxiacetona glicerol-3-fosfato glicerol-3- lanzadera del
fosfato (DHAP) + deshidrogenasa fosfato + glicerol-3-fosfato
NAD+ citoplasmática NADH + H+
glicerol-3-fosfato + glicerol-3-fosfato DHAP + lanzadera del
enzima-FAD deshidrogenasa enzima-FADH2 glicerol-3-fosfato
mitocondrial
piruvato + CO2 + enzima málica malato + reacción
NADPH + H+ NADP+ anaplerótica
α-cetoglutarato α- cetoglutarato succinil-CoA + ciclo de Krebs
+CoA + NAD+ deshidrogenasa NADH + H+
oxalacetato + NADH malato malato + NAD+ lanzadera del
+ H+ deshidrogenasa malato/aspartato
citoplasmática
isocitrato + NAD+ isocitrato α-
deshidrogenasa cetoglutarato + ciclo de Krebs
CO2 + NADH +
H+

11) (Ver figura con las reacciones del ciclo de Krebs en la clase correspondiente.)

12) (La conversión de -cetoglutarato a succinil-CoA es catalizada por el complejo multienzimático


de la -cetoglutarato deshidrogenasa. El succinil-CoA, es un ejemplo de tioéster rico en energía.

13) Ver la reacción catalizada por la -cetoglutarato DH en la clase correspondiente.)

14) (Ver la reacción catalizada por la -cetoglutarato deshidrogenasa en la clase correspondiente.)

15) (Ver figura de regulación de la actividad PDH en la clase correspondiente.)

16) (Ver la reacción catalizada por la glutamato deshidrogenasa en la clase correspondiente.)


(piruvato + HCO3- + ATP → oxaloacetato + ADP + Pi piruvato carboxilasa
piruvato + HCO3- + NAD(P)H +H+ → malato + NAD(P)+ enzima málica
glutamato + NAD+ + H2O → -cetoglutarato + NH4+ + NADH + H+ glutamato deshidrogenasa
Estas 3 reacciones son anapleróticas porque aportan intermediarios en el ciclo de Krebs. En cambio,
la reacción de la glutamato oxaloacetato transaminasa no se considera anaplerótica porque para
producir tanto oxaloacetato o -cetoglutarato utiliza intermediarios del ciclo de Krebs.
aspartato + -cetoglutarato→ oxaloacetato + glutamato)

17) (Una de las principales reacciones anapleróticas es la conversión de piruvato y CO 2 a


oxaloacetato, catalizada por la piruvato carboxilasa. Ver la reacción en la clase correspondiente.)

18) (Ver figura de la lanzadera de NADH en la clase correspondiente.)

19) (La lanzadera del citrato es un mecanismo para sacar citrato desde la mitocondria hacia el
citoplasma. Funciona de manera unidireccional, es decir el citrato solo se mueve desde la
mitocondria hacia el citoplasma. Esto constituye un punto de fuga del intermediario citrato que
ocurre cuando los niveles de ATP aumentan y actúa como modulador alostérico negativo frenando

31
DEPARTAMENTO DE BIOQUÍMICA HUMANA
CÁTEDRA 1 - QUÍMICA BIOLÓGICA - CICLO LECTIVO 2022
la reacción de la IDH, con el consecuente aumento de Isocitrato. Dado que la reacción de la
aconitasa es reversible, el isocitrato en exceso se convierte en citrato. Como la citrato sintasa es
irreversible por su elevado ∆G negativo, el único camino posible es la salida del citrato hacia el
citoplasma, clara señal de abundancia energética mitocondrial.)

20) (Ver figura de la lanzadera de glicerol-3-P en la clase correspondiente.)

32

También podría gustarte